ಶಿಲೀಂಧ್ರ ವು ಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜೀವಿಗಳ ಒಂದು ದೊಡ್ದ ಗುಂಪಿನ ಒಂದು ಸದಸ್ಯ ಜೀವಿಯಾಗಿದೆ. ಇದು ಯೀಸ್ಟ್‌ಗಳು (ಕಿಣ್ವ ಬೂಸ್ಟ್‌ಗಳು) ಮತ್ತು ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳಂತಹ ಸೂಕ್ಷಾಣುಜೀವಿಗಳು, ಹಾಗೆಯೇ ಹೆಚ್ಚು ಜನಪ್ರಿಯವಾದ ಅಣಬೆಗಳನ್ನೂ ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಈ ಜೀವಿಗಳು ಕಿಂಗ್ಡಮ್, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಎಂಬುದಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಇವು ಸಸ್ಯಗಳು, ಪ್ರಾಣಿಗಳು ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರೀಯಾಗಳಿಂದ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಕೋಶಗಳು ಸೆಲ್ಯುಲೋಸ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಸಸ್ಯಗಳ ಕೋಶದ ಗೋಡೆಗಳಂತಲ್ಲದೇ, ಕೈಟಿನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಕೋಶ ಗೋಡೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದು ಒಂದು ಪ್ರಮುಖವಾದ ಭಿನ್ನತೆಯಾಗಿದೆ. ಈ, ಮತ್ತು ಇತರ ಭಿನ್ನತೆಗಳು ತೋರಿಸುವುದೇನೆಂದರೆ, ಫಂಗಿಯು ಒಂದು ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಿಕನನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ (ಒಂದು ಮೊನೊಪೊಲಿಟಿಕ್ ಗುಂಪು ) ಯುಮೈಕೋಟಾ (ನಿಜವಾದ ಫಂಗಿ ) ಅಥವಾ ಯುಮೈಸೆಟ್ಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀವಿಗಳ ಒಂದು ಏಕೈಕ ಗುಂಪಿನಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಈ ಶಿಲೀಂಧ್ರದ ಗುಂಪು ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸದೃಶವಾದ ಲೋಳೆ ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳು (ಮೈಕ್ಸೋಮೈಸೆಟ್ಸ್) ಮತ್ತು ನೀರಿನ ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳಿಂದ (ಊಮೈಸೆಟ್ಸ್) ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರದ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕೆ ಮೀಸಲಿಡಲ್ಪಟ್ಟ ಜೀವವಿಜ್ಞಾನದ ಶಾಖೆಯು ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರ (ಮೈಕೊಲೊಜಿ) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಅದು ಅನೇಕ ವೇಳೆ ಸಸ್ಯಶಾಸ್ತ್ರದ ಒಂದು ಶಾಖೆ ಎಂಬುದಾಗಿ ಪರಿಗಣಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಸಸ್ಯಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಬಂಧಿತವಾಗಿವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಆನುವಂಶಿಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸಿವೆ.
ಜಗತ್ತಿನಾದ್ಯಂತ ಹೇರಳವಾಗಿರುವ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ತಮ್ಮ ವಿನ್ಯಾಸಗಳ ಸಣ್ಣ ಗಾತ್ರದ ಕಾರಣದಿಂದ ಮತ್ತು ಮಣ್ಣಿನಲ್ಲಿ ತಮ್ಮ ರಹಸ್ಯವಾದ ಜೀವನಶೈಲಿಗಳ ಕಾರಣದಿಂದ ನಿರ್ಜೀವ ವಸ್ತುಗಳ ಮೇಲೆ, ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳ, ಪ್ರಾಣಿಗಳ, ಅಥವಾ ಇತರ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಸಂಯುಕ್ತಜೀವಿಗಳಂತೆ ಅಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಅವುಗಳು ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳಾಗಿ ಅಥವಾ ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳಾಗಿ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಬದಲಾಗುತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಜೈವಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ವಿಘಟನೆಯಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪ್ರಮುಖವಾದ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಪೌಷ್ಟಿಕಗಳ ಸೈಕ್ಲಿಂಗ್ ಮತ್ತು ವಿನಿಮಯದಲ್ಲಿ ಮೂಲಭೂತವಾದ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಅವುಗಳು ದೀರ್ಘ ಕಾಲದಿಂದ ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳಂತೆ ಮತ್ತು ಗೆಡ್ಡೆ ಅಣಬೆಗಳಂತೆ ಆಹಾರದ ಒಂದು ನೇರವಾದ ಮೂಲವಾಗಿ ಬಳಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಬ್ರೆಡ್‌ಗೆ ಒಂದು ಲೀವನಿಂಗ್ ಅಂಶದಂತೆ, ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ಆಹಾರ ಉತ್ಪನ್ನಗಳ ಕಿಣ್ವನಕಾರಿ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಅಂದರೆ ವೈನ್, ಬಿಯರ್, ಮತ್ತು ಸೋಯಾ ಸಾಸ್‌ಗಳಂತಹ ಉತ್ಪನ್ನಗಳಲ್ಲಿ ಕಿಣ್ವನಕಾರಿಯಾಗಿ ಬಳಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ೧೯೪೦ ರ ದಶಕದ ನಂತರದಿಂದ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಆಂಟಿಬಯೋಟಿಕ್‌ಗಳ (ಪ್ರತಿಜೀವಕ) ಉತ್ಪಾದನೆಯಲ್ಲಿ, ಮತ್ತು, ತೀರಾ ಇತ್ತೀಚಿನಲ್ಲಿ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡಲ್ಪಟ್ಟ ಹಲವಾರು ಕಿಣ್ವಗಳು ಕೈಗಾರಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಡಿಟರ್ಜೆಂಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಅಲುಬುಗಳು ಮತ್ತು ಉಪದ್ರವಕಾರಿಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳೂ ಕೂಡ ಜೈವಿಕ ಘಟಕವಾಗಿ ಬಳಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಹಲವಾರು ಜಾತಿಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಕ್ಷಾರಾಭಗಳು (ಅಲ್ಕಾಲೊಯ್ಡ್) ಮತ್ತು ಪಾಲಿಕೆಟೈಡ್‌ಗಳಂತಹ ಶಿಲೀಂಧ್ರನಂಜು (ಮೈಕೊಟೊಕ್ಸಿನ್) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಜೈವಿಕಕ್ರಿಯಾಶೀಲ ಮಿಶ್ರಣಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳು ಮಾನವರನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಇತರ ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ ವಿಷಕಾರಿಯಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಜಾತಿಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು ಮನಃಪರಿಣಾಮಿ ಮಿಶ್ರಣಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಉಲ್ಲಾಸಕಾರಕವಾಗಿ ಸೇವಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ ಅಥವಾ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಆಧ್ಯಾತ್ಮಿಕ ಆಚರಣೆಗಳಲ್ಲಿ ಸೇವಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ತಯಾರಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ವಸ್ತುಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಕಟ್ಟಡಗಳನ್ನು ಮುರಿಯುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಮಾನವರ ಮತ್ತು ಇತರ ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಗಣನೀಯ ಪ್ರಮಾಣದ ರೋಗಕಾರಕಗಳಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ರೋಗಗಳ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ ಬೆಳೆಗಳ ನಾಶ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ರೈಸ್ ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ರೋಗ) ಅಥವಾ ಆಹಾರ ಕೆಡುವಿಕೆಗಳು ಮಾನವರ ಆಹಾರ ಉತ್ಪಾದನಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ಥಳೀಯ ಆರ್ಥಿಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳ ಮೇಲೆ ಬೃಹತ್ ಪ್ರಮಾಣದ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ.
ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಇದು ವಿಭಿನ್ನವಾದ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ, ಜೀವನ ಚಕ್ರದ ತಂತ್ರಗಾರಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ, ಮತ್ತು ಏಕೈಕ-ಕೋಶೀಯ ಜಲಜೀವಿ ಚಿಟ್ರಿಡ್‌ಗಳಿಂದ ದೊಡ್ಡ ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳವರೆಗಿನ ಮಾರ್ಫಿಲೊಜಿಗಳ ಜೊತೆಗೆ ವಿಷಗಳ ವಿಭಿನ್ನತೆಯ ಬೃಹತ್ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ನಿಜವಾದ ಜೈವಿಕವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಅತ್ಯಂತ ಚಿಕ್ಕದು ಎಂದು ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟಿರುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರವು ೧.೫ ಮಿಲಿಯನ್ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ, ಅದರಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು ೫% ಜಾತಿಗಳು ವಿಧ್ಯುಕ್ತವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ೧೮ ನೆಯ ಮತ್ತು ೧೯ ನೆಯ ಶತಮಾನದ ನಂತರದಿಂದ ಕಾರ್ಲ್ ಲಿನ್ನೌಸ್, ಕಿಸ್ಚಿಯನ್ ಹೆಂಡ್ರಿಕ್ ಪೆರ್ಸೂನ್, ಮತ್ತು ಎಲಿಯಾಸ್ ಮಗ್ನುಸ್ ಫ್ರೈಸ್‌ರ ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣದ ಕಾರ್ಯಗಳಿಂದ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗಲ್ಪಟ್ಟವು, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಅವರ ಮೊರ್ಫಿಲಿಜಿ (ಅಂದರೆ, ಬೀಜಕಗಳ ಬಣ್ಣಗಳು ಅಥವಾ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕೀಯ ಲಕ್ಷಣಗಳಂತಹ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು) ಅಥವಾ ಶರೀರವಿಜ್ಞಾನಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಅಣುಗಳ ಆನುವಂಶಿಕತೆಯಲ್ಲಿನ ಸಂಶೋಧನೆಗಳು ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣದಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುವ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ತೆರೆಯಿತು, ಅದು ಕೆಲವು ವೆಳೆ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಇತರ ಒಡಂಬಡಿಕೆಗಳ ಮೇಲೆ ಆಧಾರಿತವಾಗಿ ಐತಿಹಾಸಿಕ ಗುಂಪುಮಾಡುವಿಕೆಗೆ ಸವಾಲನ್ನು ಎಸೆಯಿತು. ನಂತರದ ದಶಕದಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಜಾತಿವಿಕಸನೀಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ವಿಂಗಡನೆಯನ್ನು ಪುನರ್‌ನಿರ್ಮಾಣ ಮಾಡಿತು, ಅದು ಒಂದು ಉಪಕಿಂಗ್‌ಡಮ್, ಏಳು ಫೈಲ, ಮತ್ತು ಹತ್ತು ಉಪಫೈಲಾ ಆಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿತು.
ಇಂಗ್ಲೀಷ್ ಶಬ್ದ ಫಂಗಸ್ ಇದು ನೇರವಾಗಿ ಲ್ಯಾಟಿನ್‌ನ ಫಂಗಸ್ (ಮಶ್ರೂಮ್) ಶಬ್ದದಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಈ ಶಬ್ದಗಳು ಹೊರೇಸ್ ಮತ್ತು ಪ್ಲಿನಿಯ ಬರಹಗಳಲ್ಲಿ ಕಾಣಬರುತ್ತದೆ..[೩] ಇದು ಬದಲಾಗಿ ಗ್ರೀಕ್ ಶಬ್ದ ಶ್ಪೊಂಗೋಸ್ ("ಸ್ಪೊಂಜ್") ಶಬ್ದದಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಅದು ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕೀಯ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು ಮತ್ತು ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳ ಮತ್ತು ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನಕ್ಕೆ ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ; ಇದರ ಮೂಲವು ಜರ್ಮನ್ ಶ್ಚ್ವಾಮ್ ("ಸ್ಪೊಂಜ್"), ಶ್ಚಿಮ್ಮೆಲ್ ("ಮೊಲ್ಡ್"), ಮತ್ತು ಫ್ರೆಂಚ್ ಚಾಂಪಿಗ್ನೊನ್ ಮತ್ತು ಸ್ಪ್ಯಾನಿಷ್ ಚಂಪಿನೊನ್ (ಇವೆರಡೂ "ಮಶ್ರೂಮ್" ಎಂಬ ಅರ್ಥವನ್ನು ನೀಡುತ್ತವೆ) ಮುಂತಾದ ಇತರ ಭಾಷೆಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಬಳಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ.[೪] ಗ್ರೀಕ್‌ನ ಮೈಕ್ಸ್ (ಮಶ್ರೂಮ್) ಮತ್ತು ಲೊಗೊಸ್ (ಸಂವಾದ) ಶಬ್ದಗಳಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟ ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರ ಎಂಬ ಶಬ್ದದ ಬಳಕೆಯು ಶಿಲೀಂಧ್ರದ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಅಧ್ಯಯನವನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ,[೫] ಇದು ೧೮೩೬ ರಲ್ಲಿ ಇಂಗ್ಲೀಷ್ ವಾಸ್ತವಿಕತಜ್ಞ ಮೈಲ್ಸ್ ಜೋಸೆಫ್ ಬೆರ್ಕ್ಲೇಯ್‌ನ ದ ಇಂಗ್ಲೀಷ್ ಫ್ಲೋರಾ ಆಫ್ ಸರ್ ಜೇಮ್ಸ್ ಎಡ್‌ವರ್ಡ್ ಸ್ಮಿತ್, ವೊಲ್ಯೂಮ್ ೫ ದ ಜೊತೆಗೆ ಆವಿಷ್ಕಾರಗೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟಿತು ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.[೪]
ಜಾತಿವಿಕಸನೀಯ ವಿಶ್ಲೆಷಣೆಗೆ ಅಣುಗಳ ವಿಧಾನಗಳ ಪರಿಚಯಕ್ಕೂ ಮುಂಚೆ, ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣ ಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಜೀವನಶೈಲಿಯಲ್ಲಿನ ಹೋಲಿಕೆಗಳ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳನ್ನು ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಸಸ್ಯದ ಸದಸ್ಯರುಗಳು ಎಂದು ಪರಿಗಣಿಸಿದ್ದರು: ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳು ಎರಡೂ ಕೂಡ ಪ್ರಮುಖವಾಗಿ ಅಚಲಗಳಾಗಿವೆ, ಮತ್ತು ಸಾಮಾನ್ಯ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ವಿಕಾಸದ ನಿವಾಸಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಾದೃಶ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ. ಸಸ್ಯಗಳಂತೆ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಅನೇಕ ವೇಳೆ ಮಣ್ಣಿನಲ್ಲಿ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳ ವಿಷಯದಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ವೇಳೆ ಜವುಗು ನೆಲದಂತಹ ಸಸ್ಯಕ್ಕೆ ಹೋಲುವ ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ಕಾಯಗಳಿಂದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಹೊಂದಬಹುದು. ಯಾವುದರಿಂದ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಒಂದು ಬಿಲಿಯನ್ ವರ್ಷಗಳಿಗೂ ಹಿಂದೆ ಉದ್ಭವಿಸಲ್ಪಟ್ಟವು ಎಂದು ತಿಳಿಯಲಾಗುತ್ತದೆಯೋ ಆ ಸಸ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿಗಳು ಈ ಎರಡರಿಂದಲೂ ವಿಭಿನ್ನವಾದ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾದ ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಎಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ.[೬][೭] ಕೆಲವು ರೂಪವಿಜ್ಞಾನಿಕ, ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ, ಮತ್ತು ಆನುವಂಶಿಕ ಲಕ್ಷಣಗಳು ಇತರ ಜೀವಿಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಹಾಗೆಯೇ ಇತರವುಗಳು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಗೆ ಏಕಮಾತ್ರವಾಗಿವೆ, ಅವುಗಳು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳನ್ನು ಇತರ ಕಿಂಗ್‌ಡಮ್‌ಗಳಿಂದ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿಸುತ್ತವೆ:
ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು:
ಅಪೂರ್ವ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು:
ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಹಲವಾರು ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿನ ಸೈಲೆಮ್ ಮತ್ತು ಫ್ಲೋಯೆಮ್‌ಗಳಂತಹ ನೀರು ಮತ್ತು ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ದೀರ್ಘ-ಅಂತರದ ಸಾಗಣೆಯ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಕೊರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಈ ಕೊರತೆಗಳನ್ನು ಇಲ್ಲವಾಗಿಸುವುದಕ್ಕಾಗಿ, ರಿಜೋಮೊರ್ಫ್‌ಗಳಿಂದ ಅರ್ಮಿಲ್ಲಾರಿಯಾ ದಂತಹ[೨೩] ಕೆಲವು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಒಂದಕ್ಕೊಂದು ಹೋಲುವಂತಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳ ಬೇರುಗಳಿಗೆ ಸರಿಸಮನಾದ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಸಸ್ಯಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಹಂಚಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ ಇನ್ನೊಂದು ಗುಣಲಕ್ಷಣವು ಸಸ್ಯಗಳ ಎಲೆಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುವ ಜೈವಿಕವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಅವುಗಳು ಮೆವಾಲೋನಿಕ್ ಆಮ್ಲ ಮತ್ತು ಪೈರೋಫಾಸ್ಪೇಟ್‌ಗಳನ್ನು ರಾಸಾಯನಿಕವನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸುವ ಬ್ಲಾಕ್‌ಗಳಾಗಿ ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.[೨೪] ಆದಾಗ್ಯೂ, ಸಸ್ಯಗಳು ತಮ್ಮ ಕ್ಲೋರೋಪ್ಲಾಸ್ಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚುವರಿ ಎಲೆಗಳ ಮಾರ್ಗಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ, ಒಂದು ವಿನ್ಯಾಸಾತ್ಮಕ ಶಿಲೀಂಧ್ರವು ಇದನ್ನು ಹೊಂದಿರುವುದಿಲ್ಲ.[೨೫] ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಸಸ್ಯಗಳಿಂದ ಮಾಡಲ್ಪಡುವ ಚಯಾಪಚಯಗಳಿಗೆ ವಿನ್ಯಾಸದಲ್ಲಿ ಸಮನಾಗಿರುವ ಅಥವಾ ಸದೃಸವಾಗಿರುವ ಹಲವಾರು ದ್ವಿತೀಯಕ ಚಯಾಪಚಯಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ.[೨೪] ಹೆಚ್ಚಿನ ಸಸ್ಯಗಳ ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಕಿಣ್ವಗಳು ಕ್ರಮಾಗತಿಯಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಇತರ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಲ್ಲಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುವ ಈ ಮಿಶ್ರಣಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿಮಾಡುತ್ತವೆ, ಅದು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾದ ಮೂಲಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಸೂಚಿಸುತ್ತದೆ.[೨೪][೨೬]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಒಂದು ಜಗತ್ತಿನಾದ್ಯಂತದ ವಿಂಗಡನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಮತ್ತು ಒಂದು ವ್ಯಾಪಕ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯ ಆವಾಸಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಯುತ್ತವೆ, ವ್ಯತಿರಿಕ್ತತೆಯ ವಾತಾವರಣಗಳಾದ ಮರುಭೂಮಿಗಳು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ಲವಣ ಸಾಂದ್ರತೆಗಳನ್ನು[೨೭] ಹೊಂದಿರುವ ಅಥವಾ ಆಯಾನೀಕರಣ ವಿಕಿರಣದ ಜೊತೆಗೆ,[೨೮] ಹಾಗೆಯೇ ಆಳವಾದ ಸಮುದ್ರ ಸಂಚಯಗಳಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಯುತ್ತವೆ.[೨೯] ಕೆಲವು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಆಕಾಶ ಯಾನದಲ್ಲಿ ಎದುರಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ತೀವ್ರವಾದ ಯುವಿ ಮತ್ತು ವಿಶ್ವ ವಿಕಿರಣದಲ್ಲಿ ಜೀವಿಸುತ್ತವೆ.[೩೦] ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಭೂಮಂಡಲದ ವಾತಾವರಣಗಳಲ್ಲಿ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದುತ್ತವೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಹಲವಾರು ಇತರ ಜಾತಿಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಚಿಟ್ರಿಡ್ ಫಂಗಸ್ ಬಾಟ್ರಾಕೊಕೈಟ್ರಿಯಮ್ ಡೆಂಡ್ರಾಬಾಟಿಡಿಸ್ ಇವು ಭಾಗಶಃ ಅಥವಾ ಪೂರ್ತಿಯಾಗಿ ಜಲೀಯ ಆವಾಸಸ್ಥಾನಗಳಲ್ಲಿ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದುತ್ತವೆ, ಒಂದು ಪರಾವಲಂಬಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರವು ಜಗತ್ತಿನಾದ್ಯಂತದ ಉಭಯಚರಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿನ ಅವನತಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಿದೆ. ಈ ಜೀವಿಯು ತನ್ನ ಜೀವನ ಚಕ್ರದ ಒಂದು ಭಾಗವನ್ನು ಒಂದು ಚಲನಶೀಲ ಚಲಜೀವಕಣ (ಶಿಲೀಂಧ್ರ, ಪಾಚಿ)ಯಾಗಿ ಕಳೆಯುತ್ತದೆ, ಇದು ನೀರಿನಲ್ಲಿ ಮುನ್ನುಗ್ಗುವುದಕ್ಕೆ ಸಹಾಯವಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಇದರ ಉಭಯಚರದ ಸಮೂಹಕ್ಕೆ ಪ್ರವೇಶ ಪಡೆಯುತ್ತದೆ.[೩೧] ಜಲೀಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಇತರ ಉದಾಹರಣೆಗಳು ಸಮುದ್ರದ ಜಲೋಷ್ಣೀಯ ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ವಾಸಿಸುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.[೩೨]
ಸುಮಾರು ೧೦೦,೦೦೦ ಜಾತಿಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣ ಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರಿಂದ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕವಾಗಿ ವರ್ಣಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ,[೩೩] ಆದರೆ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಕಿಂಗ್‌ಡಮ್‌ನ ಜಾಗತಿಕ ಜೈವಿಕವೈವಿಧ್ಯತೆಯು ಪೂರ್ತಿಯಾಗಿ ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟಿಲ್ಲ.[೩೪] ಆಯ್ಕೆಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟ ವಾತಾವರಣಗಳಲ್ಲಿ ಸಸ್ಯಗಳ ಜಾತಿಯ ಸಂಖ್ಯೆಗಳಿಗೆ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಜಾತಿಗಳ ಸಂಖ್ಯೆಗಳ ಅನುಪಾತದ ಅವಲೋಕನಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಕಿಂಗ್‌ಡಮ್‌ಗಳು ೧.೫ ಮಿಲಿಯನ್ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ.[೩೫] ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ, ಜಾತಿಗಳು ಹಲವಾರು ವಿಧದ ವಿಧಾನಗಳು ಮತ್ತು ವಿಷಯಗಳ ಮೂಲಕ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಬೀಜಕಗಳ ಗಾತ್ರ ಮತ್ತು ರೂಪಗಳು ಅಥವಾ ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ವಿನ್ಯಾಸಗಳಂತಹ ರೂಪವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಮೇಲೆ ಆಧಾರಿತವಾದ ವಿಂಗಡನೆಯು ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕವಾಗಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣದ ಮೇಲೆ ಪ್ರಾಬಲ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿತ್ತು.[೩೬] ಜಾತಿಗಳು ಕೆಲವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾದ ರಾಸಾಯನಿಕಗಳನ್ನು ಚಯಾಪಚಯ ಮಾಡುವುದಕ್ಕೆ ತಮ್ಮ ಸಾಮರ್ಥ್ಯದಂತಹ ಅಥವಾ ರಾಸಾಯನಿಕ ಪರೀಕ್ಷೆಗಳಿಗೆ ಅವುಗಳ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ಮುಂತಾದ ಅವುಗಳ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಮತ್ತು ಶರೀರವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಮೂಲಕವೂ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಜೀವವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಜಾತಿಗಳ ವಿಷಯವು ಸಂಯೋಗ ಹೊಂದುವುದಕ್ಕಿನ ಅವುಗಳ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳ ಮೇಲೆ ಆಧಾರಿತವಾಗಿ ವಿಂಗಡನೆ ಮಾಡಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡುವುದಕ್ಕೆ ಡಿಎನ್ಎ ಸಿಕ್ವೆನ್ಸಿಂಗ್ (ಕ್ರಮಾಗತಗೊಳಿಸುವಿಕೆ) ಮತ್ತು ಜಾತಿವಿಕಸನೀಯ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳಂತಹ ಅಣುಗಳ ಸಾಧನಗಳ ಅನ್ವಯಿಕೆಯು ವಿಘಟನೆಯನ್ನು ಬೃಹತ್ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿಸಿದೆ ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣ ಗುಂಪುಗಳ ಒಳಗೆ ಆನುವಂಶಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಅಂದಾಜುಗಳಿಗೆ ಶಕ್ತಿಯುಕ್ತತೆಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸಿದೆ.[೩೭]
ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಹೈಫೆಗಳಾಗಿ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದುತ್ತವೆ, ಅವು ವ್ಯಾಸದಲ್ಲಿ ಸಿಲಿಂಡರಾಕಾರದ, ದಾರದ-ತರಹದ ವಿನ್ಯಾಸ ೨–೧೦ µm ಮತ್ತು ಉದ್ದದಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಸೆಂಟಿಮೀಟರುಗಳವರೆಗೆ ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಹೈಫೆಗಳು ತಮ್ಮ ತುದಿಗಳಲ್ಲಿ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದುತ್ತವೆ; ಹೊಸ ಹೈಫೆಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತದಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಹೈಫಗಳಲ್ಲಿ ಬ್ರಾಂಚಿಂಗ್ (ಟಿಸಿಲೊಡೆಯುವುದು) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಮೂಲಕ ಹೊಸ ತುದಿಗಳ ಹೊರಬರುವಿಕೆಯ ಮೂಲಕ ವಿಶಿಷ್ಟವಾಗಿ ನಿರ್ಮಾಣವಾಗಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಅಥವಾ ಸಾಂದರ್ಭಿಕವಾಗಿ ಬೆಳೆಯುವ ಹೈಫೆಯ ತುದಿಗಳು ಎರಡು ಸಮಾನಂತರವಾಗಿ-ಬೆಳೆಯುವ ಹೈಫೆಗೆ ಬೆಳೆಯುವುದಕ್ಕೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ (ಕವಲೊಡೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ).[೩೮] ತುದಿಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಮತ್ತು ಟಿಸಿಲೊಡೆಯುವಿಕೆ/ಕವಲೊಡೆಯುವಿಕೆಗಳ ಸಂಯೋಜನವು ಹೈಫೆಯ ಒಂದು ಅಂತರ್‌ಸಂಬಂಧಿತ ಸಂಪರ್ಕಜಾಲ ಮೈಸೆಲಿಯಮ್ (ಕವಕಜಾಲ)ದ ಬೆಳವಣಿಗೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತದೆ.[೧೯] ಹೈಫೆಗಳು ವಿಭಜಿಸಿರುವಂತವಾಗಿರಬಹುದು ಅಥವಾ ಕೊನೊಸೈಟಿಕ್ ಆಗಿರಬಹುದು: ವಿಭಜಕ ಹೈಫೆಗಳು ಅಡ್ಡ ಗೋಡೆಗಳ ಮೂಲಕ ವಿಭಾಗಗಳಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ (ಆಂತರಿಕ ಕೋಶ ಗೋಡೆಗಳು, ಕೋಶೀಯ ವಿಭಜಕ, ಇವುಗಳು ಹೈಫಾಕ್ಕೆ ಅದರ ಆಕಾರವನ್ನು ನೀಡುತ್ತ ಕೋಶ ಗೋಡೆಯ ಬಲಭಾಗದ ಕೋನದಲ್ಲಿ ನಿರ್ಮಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುತ್ತದೆ), ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿ ವಿಭಾಗವು ಒಂದು ಅಥವಾ ಹೆಚ್ಚಿನ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ; ಕೊನೊಸೈಟಿಕ್ ಹೈಫೆಗಳು ವಿಭಾಗೀಕೃತಗೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟಿರುವುದಿಲ್ಲ.[೩೯] ವಿಭಜಕಗಳು ಸೈಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮ್, ಅಂಗಕಗಳು, ಮತ್ತು ಕೆಲವು ವೇಳೆ ಸಾಗಣೆಯಾಗುವುದಕ್ಕೆ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಗಳನ್ನು ಅನುಮತಿಸುವ ಸೂಕ್ಷ್ಮರಂಧ್ರಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ; ಒಂದು ಉದಾಹರಣೆಯೆಂದರೆ ಫೈಲಮ್ ಬೆಸಿಡಿಯೊಮೈಕೊಟಾದ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿನ ಡೊಲಿಪೋರ್ ನಡುತಡಿಕೆ.[೪೦] ಕೊಯಿನೊಸೈಟಿಕ್ ಹೈಫೆಗಳು ಮೂಲಭೂತವಾಗಿ ಬಹುವಿಧದ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯೇಟ್ ಸುಪರ್‌ಸೆಲ್‌ಗಳಾಗಿರುತ್ತವೆ.[೪೧]
ಹಲವಾರು ಜಾತಿಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಜೀವಿಸುತ್ತಿರುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ದೊಡ್ಡ ಗುಂಪುಗಳಿಂದ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಗೆ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಹೈಫಲ್ ವಿನ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಗೊಳಿಸಿವೆ; ಉದಾಹರಣೆಗಳು ಕೆಳಗಿನವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ - ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಫೈಲಾಗಳ ಸಸ್ಯ-ಪರಾವಲಂಬಿ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿನ ಹೊಸ್ಟೋರಿಯಾ, ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಮೂಲ (ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಬೇರು) ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಅರ್ಬ್ಯೂಸ್ಕ್ಯೂಲ್ಸ್, ಅವು ಪೋಷಕಾಂಶಗಳನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳುವುದಕ್ಕಾಗಿ ಸಮೂಹ ಕೋಶದೊಳಕ್ಕೆ ಪ್ರವೆಶವನ್ನು ಪಡೆಯುತ್ತವೆ.[೪೨] ಆದಾಗ್ಯೂ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಒಂದು ಏಕೈಕ ನಂತರದ ಕಶಾಂಗದ ಮೂಲಕ ವಿಶಾಲವಾಗಿ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ವರ್ಣಿಸಲ್ಪಡುವ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀವಿಗಳ ಬೆಳವಣಿಗಾತ್ಮಕ ಗುಂಪು ಒಪಿಸ್ತೋಕೊಂಟ್‌ಗಳು-ಎ ಆಗಿರುತ್ತವೆ - ಚಿಟ್ರಿಡ್‌ಗಳನ್ನು ಹೊರತುಪಡಿಸಿ ಎಲ್ಲಾ ಫೈಲಾಗಳು ತಮ್ಮ ತರುವಾಯದ ಕಶಾಂಗಗಳನ್ನು ಕಳೆದುಕೊಂಡಿವೆ.[೪೩] ಶಿಲಿಂಧ್ರಗಳು ಗ್ಲುಕನ್‌ಗಳ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, β-೧,೩-ಗ್ಲುಕನ್) ಜೊತೆಗೆ ಒಂದು ಕೋಶ ಗೋಡೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮತ್ತು ಇತರ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಘಟಕಗಳು, ಬಯೋಪಾಲಿಮರ್ ಕೈಟಿನ್ ಅನ್ನೂ ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಯುಕಾರ್ಯೋಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅಸಾಧಾರಣವಾಗಿವೆ.[೪೪]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಮೈಸಿಲಿಯಾವು ಬರಿಯ ಕಣ್ಣಿಗೆ ಗೋಚರವಾಗಬಹುದು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಹಲವಾರು ಮೇಲ್ಮೈಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಅಧಃಸ್ತರಗಳಲ್ಲಿ, ಅಂದರೆ ತೇವವಿರುವ ಗೋಡೆಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಹಾಳಾದ ಆಹಾರ ವಸ್ತುಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ, ಅದರಲ್ಲಿ ಅವುಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಮೋಲ್ಡ್‌ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದ ಪೆಟ್ರಿ ಡಿಶ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಘನರೂಪದ ಸಮುದ್ರಪಾಚಿಯ ಮೀಡಿಯಾದ ಮೇಲೆ ಬೆಳೆಯಲ್ಪಟ್ಟ ಮೈಸಿಲಿಯಾಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕೊಲೊನಿಗಳು ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಈ ಕೊಲೊನಿಗಳು ಬೆಳವಣಿಗೆ ಆಕಾರಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುತ್ತವೆ (ಬೀಜಕಗಳು ಅಥವಾ ವರ್ಣದ್ರವ್ಯಗಳ ಕ್ರಿಯೆಯ ಕಾರಣದಿಂದ) ಅವು ಜಾತಿಗಳ ಅಥವಾ ಗುಂಪುಗಳ ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ವಿಶ್ಲೇಷಣಾತ್ಮಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಾಗಿ ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೪೫] ಕೆಲವು ಸ್ವತಂತ್ರ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಕೊಲೊನಿಗಳು ಅರ್ಮಿಲ್ಲಾರಿಯಾ ಒಸ್ಟೋಯೀ ಯ ಒಂದು ಕ್ಲೋನಲ್ (ಅಬೀಜ ಸಂತಾನ) ಕೊಲೊನಿಯ ದೃಷ್ಟಾಂತದಲ್ಲಿ ಅಸಾಧಾರಣವಾದ ಆಯಾಮಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ವಯಸ್ಸನ್ನು ಮುಟ್ಟುತ್ತವೆ, ಅವು ಸುಮಾರು ೯,೦೦೦ ವರ್ಷಗಳ ವಯಸ್ಸಿನ ಅಂದಾಜಿನ ಜೊತೆಗೆ ೯೦೦ ಹೆಕ್ಟೇರ್‌ಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರದೇಶವನ್ನು ವ್ಯಾಪಿಸುತ್ತವೆ.[೪೬]
ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಲೈಂಗಿಕ ಮರುಸಂತಾನದಲ್ಲಿ ಬಹು ಮುಖ್ಯವಾದ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟೀಕೃತ ವಿನ್ಯಾಸವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ - ಅಪೋಥೆಸಿಯುಮ್ - ಇದು ಒಂದು ಕಪ್-ಆಕಾರದ ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ಕಾಯವಾಗಿದೆ, ಅದು ಬೀಜಕವನ್ನು-ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಕೋಶಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂದಿರುವ ಒಂದು ಅಂಗಾಂಶದ ಪದರ ಹೈಮೇನಿಯಮ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.[೪೭] ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸಿಟ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಕೆಲವು ಆಸ್ಕೋಮೈಸಿಟ್‌ಗಳ ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ಕಾಯಗಳು ಕೆಲವು ವೇಳೆ ತುಂಬಾ ದೊಡ್ಡದಾಗಿ ಬೆಳೆಯುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಅದರಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳು ಎಂದು ಜನಪ್ರಿಯವಾಗಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ.
ಹೈಫೆಯಾಗಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯು ಘನರೂಪದ ಮೇಲ್ಮೈಗಳಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಮೇಲ್ಮೈಗಳ ಮೇಲೆ ಅಥವಾ ಜಲೀಯ ವತಾವರಣಗಳಲ್ಲಿ ಏಕೈಕ ಕೋಶಗಳಾಗಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯು ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾದ ಹೊರತೆಗೆಯುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಈ ಬೆಳವಣಿಗೆ ವಿಧಗಳು ಗಾತ್ರದ ಅನುಪಾತಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದ ಮೆಲ್ಮೈ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ.[೪೮] ಹೈಫಗಳು, ಸಮರ್ಥ ಮೇಲ್ಮೈಗಳು, ಒಳನುಗ್ಗುವ ದ್ರವ್ಯಗಳು ಮತ್ತು ಜೀವಕೋಶಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಮೇಲೆ ನಿಶ್ಚಿತವಾಗಿ ಹೊಂದಿಕೊಂಡಿರುತ್ತದೆ.[೪೯] ಅವುಗಳು ವ್ಯಾಪಕವಾದ ಬೇಧಕ ಯಂತ್ರಗಳಂತಹ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ವಿನಿಯೋಗಿಸಬಲ್ಲವು; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸ್ಥಾಪಿಸಿದ ಪೆಥೋಜೆನ್ ಮೆಗ್ನಪೋರ್ಥ್ ಗ್ರೈಸಿಯ ಬಗೆಯ ರಚಿಸುವಿಕೆಯು ಅಪ್ಪ್ರೆಸ್ಸೊರಿಯಮ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಹೀಗೆ ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಅದು ನಿಧಾನ ರಂಧ್ರ ಸ್ಥಾಪಿತ ಜೀವಕೋಶಗಳಿಗೆ ಹೊರತೆಗೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ.[೫೦] ಅಪ್ರೆಸ್ಸೋರಿಯಮ್‍ನಿಂದ ನಿರ್ಮಾಣಗೊಂದ ಒತ್ತಡವು, ಸ್ಥಾಪಿತಗೊಂಡ ಬಾಹ್ಯ ತ್ವಚೆಯ ವಿರುದ್ಧ ನೇರವಾಗಿ 8 megapascals (1,200 psi)ಅತಿಕ್ರಮಿಸಬಲ್ಲವು.[೫೦] ತಂತುಗಳ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ನೆಮಟೋಡಸ್‍ ನ ಮೇಲ್ಮೈಗಳನ್ನು ಬೇಧಿಸಲು ಪಿಸಿಲೋಮೈಸಸ್ ಲಿಲಸಿನಸ್ ಸಮಾನ ಹೋಲಿಕೆಯ ರೂಪವನ್ನು ಉಪಯೋಗಿಸುತ್ತದೆ.[೫೧]
ಅಪ್ಪ್ರಸ್ಸೋರಿಯಮ್‍ನಿಂದ ವಿನಿಯೋಗಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಯಾಂತ್ರಿಕ ಒತ್ತಡವು ಶರೀರ ಶಾಸ್ತ್ರದ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳಿಂದ ನಿರ್ಮಿತಗೊಂಡಿರುವ ಅದು ಗ್ಲಿಸರೋಲ್ ನಂತಹ ಓಸ್ಮೊಲೈಟ್ಸ ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುವುದರಿಂದ ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶಗಳ ಟರ್ಗರನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ.[೫೨] ಮಾರ್ಪಾಲಜಿಯ ಹೊಂದಿಕಗಳಂತೆ ಇವುಗಳು ಸಮಗ್ರವಾದ ಸಣ್ಣ ಕಣಗಳಂತಹ ಪೊಲಿಸಚ್ಚರೈಡ್‍ಗಳು, ಪೌಷ್ಟಿಕಾಂಶಗಳು, ಕೊಬ್ಬುಗಳು ಮತ್ತು ಇತರ ಜೈವಿಕ ದ್ರವ್ಯಗಳು ವ್ಯವಸ್ಥಿತ ಸಂಗ್ರಹಕ್ಕೆ ರಹಸ್ಯ ವಾತಾವರಣದೊಳಗೆ ಜಲ ವಿಚ್ಛೇದನ ಉಂಟುಮಾಡುವ ಕಿಣ್ವಗಳಿಂದ ಪೂರೈಸಲ್ಪಟ್ಟು, ಅತಿ ಚಿಕ್ಕ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಕಣಗಳೊಂದಿಗೆ ಅವುಗಳು ನಂತರ ಪೌಷ್ಟಿಕಾಶದಂತೆ ಹೀರಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು.[೫೩][೫೪][೫೫] ನಾರು ಫಂಗಿಯ ಸಾಕಷ್ಟು ಪ್ರಮಾಣಗಳು ಧ್ರುವದ ಆಕಾರದಲ್ಲಿ ಅಂದರೆ ಒಂದೇ ದಿಕ್ಕಿನೊಳಗೆ ಚಾಚುವುದರಿಂದ- ಹೈಫಗಳ ತುದಿಯ (ಅಪೆಕ್ಸ್) ಮೇಲಿನ ದೀರ್ಘೀಕರಣದಿಂದ ಬೆಳೆಯುತ್ತದೆ.[೫೬] ಫಂಗಿಯ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಬದಲಿ ಮೂಲಗಳು ಅಧಿಕ ಚಾಚುವಿಕೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವಂತಹ (ಅಂದರೆ, ಹೈಫಗಳ ತುದಿಯ ಕೆಳಗಿರುವ ಭಾಗಗಳು ಉದ್ದದಲ್ಲಿ ಚಾಚುವುದರಿಂದ) ಕೆಲವು ಎಂಡೋಫಿಟಿಕ್ ಫಂಗಿಗಳ[೫೭] ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಅಣಬೆಗಳ ತೊಟ್ಟು ಮತ್ತು ಇತರ ಭಾಗಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಬಹಳವಾಗಿ ಚಾಚುವುದರಿಂದ ಬೆಳೆಯುತ್ತದೆ.[೫೮] ಫಂಗಿಯ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ದೈಹಿಕ ಮತ್ತು ಮರುಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುವ ಜೀವಕೋಶಗಳ ಬಹುಕೋಶೀಯ ರೂಪಗಳು ರಚಿತವಾಗಿರುವಂತೆ- ಪ್ರಾಣಿಗಳು ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ [೫೯] ಆ ಲಕ್ಷಣವು ಹೊರತೆಗೆಯಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ- ಲೈಂಗಿಕ ಸ್ಪೋರ್ಸ್‍ಗಳ ಪ್ರಸಾರಕ್ಕೆ ಹಣ್ಣಿನ ಮುಖ್ಯ ಭಾಗಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಮತ್ತು ದ್ರವ್ಯ ಕೊಲೊನೈಜೇಶನ್‍ಗಳಿಗೆ ಶರೀರ ಚಿತ್ರಗಳು ಮತ್ತು ಅಂತರ್ಜೀವಕೋಶಗಳ ಸಂವಹನಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡು ಹಲವಾರು ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತದೆ.[೬೦]
ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕವಾಗಿ, ಫಂಗಿಗಳು ಚಯಾಪಚಯಗಳಿಗೆ ಇತರ ಜೀವಿಗಳಿಂದ ಸ್ಥಿರಗೊಳಿಸಿದ ಕಾರ್ಬನ್ ಮೇಲೆ ಏಕಮಾತ್ರ ನಂಬಿಕೆಯ ಜೀವಿಗಳು, ಹೆಟರೊಟ್ರೊಫ್ಸ್‍ಗಳನ್ನು ಪರಿಗಣಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ. ಫಂಗಿಯ ಕ್ರಮವಾಗಿ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದಿದ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದ ಚಯಾಪಚಯ ಕೌಶಲ್ಯತೆಯು, ನೈಟ್ರೇಟ್, ಅಮೋನಿಯಾ, ಎಸಿಟೇಟ್, ಅಥವಾ ಎಥನೋಲ್‍ ಗಳಂತಹ ಸಾಮಾನ್ಯ ಸಂಯುಕ್ತಗಳನ್ನೊಳಗೊಂಡಂತೆ, ಅಂಗಾಂಗಗಳ ಮೇಲ್ಮೈಯ ಹೋಲಿಕೆ ಇಲ್ಲದ ಸಾಲುಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಗೆ ಉಪಯೋಗಿಸಲು ಅವುಗಳಿಗೆ ಅವಕಾಶ ನೀಡುತ್ತದೆ.[೬೧][೬೨] ಕೆಲವು ಭಾಗಗಳಿಗೆ ಇದು ವರ್ಣದ್ರವ್ಯಗಳ ಕಡುಗಂದು ಅಥವಾ ಕಪ್ಪು ವರ್ಣದ್ರವ್ಯವು ಗಮ್ಮಾ ವಿಕಿರಣಗಳಂತೆ, ಅಯಾನೀಕಾರಕ ವಿಕಿರಣಗಳಿಂದ ಶಕ್ತಿ ಸಾರತತ್ವವನ್ನು ಹೀರುವಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರವಹಿಸಬಹುದೆಂದು ತೋರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುತ್ತದೆ; ಹೇಗಾದರೂ, ಈ ರೇಡಿಯೋಟ್ರೋಫಿಕ್ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಮೂಲವು ಕೆಲವು ಭಾಗಗಳಿಗೆ ಮಾತ್ರ ವರ್ಣಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ, ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಮೇಲಿನ ಪರಿಣಾಮಗಳು ಸಣ್ಣ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿರುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಸಿದ್ಧಾಂತಗಳಿಗೆ ಆಧಾರವಾಗಿರುವ ಬಯೋಫಿಸಿಕಲ್ ಮತ್ತು ಬಯೋಕೆಮಿಕಲ್ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳು ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟಿಲ್ಲ.[೨೮] ಕಾಣಬಲ್ಲ ಬೆಳಕಿನ ಮೂಲಕ CO೨ ಸ್ಥಿರೀಕರಣಕ್ಕೆ ಈ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆ ಸಮಾನರೂಪತೆ ತಾಳುವುದೆಂದು, ಆದರೆ ಅಯಾನೀಕಾರಕ ವಿಕಿರಣಗಳ ಉಪಯೊಗಿಸುವಿಕೆಯ ಬದಲಾಗಿ ಶಕ್ತಿಯ ಮೂಲದಂತೆ ಎಂದು ಲೇಖಕರು ಊಹಿಸಿದ್ದಾರೆ.[೬೩]
ಶಿಲೀಂದ್ರಗಳ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಯು ಸಂಕೀರ್ಣವಾಗಿರುತ್ತದೆ, ಇದು ಜೀವನಶೈಲಿಯಲ್ಲಿ ಬದಲಾವಣೆಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಈ ಜೀವಿಗಳ ಕಿಂಗ್‌ಡಮ್‌ನ ಒಳಗೆ ತಳಿಗಳ ವಿಕಾಸವನ್ನು ಪ್ರತಿಫಲಿಸುತ್ತದೆ.[೬೪] ಎಲ್ಲಾ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಮೂರನೆಯ ಭಾಗದಷ್ಟು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ವಿಭಿನ್ನವಾದ ವಿಧಗಳ ಮೂಲಕ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆ ಮಾಡಲ್ಪಡುತ್ತವೆ ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಯು ಒಂದು ಜಾತಿಯ ಜೀವಿಗಳ ಜೀವನ ಚಕ್ರದಲ್ಲಿ ಎರಡು ಸರಿಯಾಗಿ-ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸಿದ ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ, ಅಂದರೆ ಟೆಲಿಯೋಮೊರ್ಫ್ ಮತ್ತು ಅನಾಮೊರ್ಫ್ ಹಂತಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ.[೬೫] ಆನುವಂಶಿಕವಾಗಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲ್ಪಟ್ಟ ಬೆಳವಣಿಗೆಯ ಹಂತದ ವಾತಾವರಣದ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳು ಲೈಂಗಿಕ ಅಥವಾ ಅಲೈಂಗಿಕ ಸಂತಾನೋತ್ಪಾದನೆಗೆ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ವಿನ್ಯಾಸಗಳ ನಿರ್ಮಾಣಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ. ಈ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು ಬೀಜಕಗಳನ್ನು ಅಥವಾ ಬೀಜಕಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಪ್ರೊಪಾಗ್ಯುಲ್‌ಗಳನ್ನು ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿ ವ್ಯಾಪಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ.
ಸಸ್ಯೀಯ ಬೀಜಕಗಳ ಮೂಲಕ (ಕೊನಿಡಿಯಾ) ಅಥವಾ ಕವಕ ಜಾಲದ ವಿಭಜನೆಯ ಮೂಲಕ ಅಲೈಂಗಿಕ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಯು ಸಾಮಾನ್ಯ ಸಂಗತಿಯಾಗಿದೆ; ಇದು ಒಂದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ನೆಲೆಗೆ ಅಳವಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಅಬೀಜ ಸಂತಾನದ ಸಂಖ್ಯೆಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಲೈಂಗಿಕ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ವೇಗದಲ್ಲಿ ಪ್ರಸರಣವನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ.[೬೬] "ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಇಂಪರ್ಫೆಕ್ಟಿ" (ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾದ ಅಥವಾ ಲೈಂಗಿಕ ಹಂತದ ಕೊರತೆಯಿರುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು) ಅಥವಾ ಡ್ಯುಟೆರೋಮೈಕೋಟಾ ಇದು ಆಚರಣೀಯ ಲೈಂಗಿಕ ಚಕ್ರದ ಕೊರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಎಲ್ಲಾ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ.[೬೭]
ಅರೆವಿದಳನದ ಜೊತೆಗಿನ ಲೈಂಗಿಕ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಯು ಎಲ್ಲಾ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಫೈಲಾಗಳಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿದೆ (ಗ್ಲೊಮೆರೊಮೈಕೋಟಾವು ಇದಕ್ಕೆ ಒಂದು ಅಪವಾದವಾಗಿದೆ).[೬೮] ಇದು ಪ್ರಾಣಿಗಳಲ್ಲಿನ ಅಥವಾ ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿನ ಲೈಂಗಿಕ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಯಿಂದ ಹಲವಾರು ಸಂಗತಿಗಳಲ್ಲಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿದೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಗುಂಪುಗಳ ನಡುವೆಯೂ ಕೂಡ ಭಿನ್ನತೆಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿವೆ ಮತ್ತು ಅವುಗಳು ಲೈಂಗಿಕ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು ಮತ್ತು ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಗಳಲ್ಲಿನ ರೂಪವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಭಿನ್ನತೆಗಳ ಮೂಲಕ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ವಿಂಗಡನೆ ಮಾಡಲು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೬೯][೭೦] ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಗಳ ನಡುವಣ ಸಂಯೋಗದ ಪ್ರಯೋಗಗಳು ಜೈವಿಕ ಜಾತಿ ವಿಷಯದ ಮೇಲೆ ಆಧಾರಿತವಾಗಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಕಂಡುಹಿಡಿಯಬಹುದು.[೭೦] ಪ್ರಮುಖವಾದ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಗುಂಪು ಮಾಡುವಿಕೆಯು ಪ್ರಾಥಮಿಕವಾಗಿ ಅವುಗಳ ಲೈಂಗಿಕ ರಚನೆಗಳು ಮತ್ತು ಬೀಜಕಗಳ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನದ ಮೇಲೆ ಆಧಾರಿತವಾಗಿ ನಿರೂಪಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿತು; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಬೀಜಕಗಳನ್ನು-ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ರಚನೆಗಳು, ಆಸ್ಕಿ ಮತ್ತು ಬೇಸಿಡಿಯಾಗಳು ಅನುಕ್ರಮವಾಗಿ ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್ಸ್ ಮತ್ತು ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್ಸ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುವಲ್ಲಿ ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಕೆಲವು ಜಾತಿಗಳು ವಿರುದ್ಧವಾದ ಸಂಯೋಗ ಜಾತಿಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಮಾತ್ರ ಸಂಯೋಗಕ್ಕೆ ಅನುಮತಿಸುತ್ತವೆ, ಹಾಗೆಯೇ ಇತರ ಜಾತಿಗಳು ಯಾವುದೇ ಇತರ ಜಾತಿ ಅಥವಾ ತನ್ನಷ್ಟಕ್ಕೇ ಸಂಯೋಗ ಹೊಂದಬಹುದು ಮತ್ತು ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಯನ್ನು ಮಾಡಬಹುದಾಗಿದೆ. ಮೊದಲಿನ ಸಂಯೋಗ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಜಾತಿಗಳು ಹೆಟರೋಥಲ್ಲಿಕ್, ಮತ್ತು ಎರಡನೆಯದು ಹೊಮೋಥೆಲ್ಲಿಕ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೭೧]
ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ತಮ್ಮ ಜೀವನ ಚಕ್ರದಲ್ಲಿ ಹ್ಯಾಪ್ಲಾಯ್ಡ್ (ಅಗುಣಿತ) ಮತ್ತು ಡಿಪ್ಲಾಯ್ಡ್ (ಜೋಡಿ ವರ್ಣತಂತುವಿನ) ಈ ಎರಡು ಹಂತಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಲೈಂಗಿಕವಾಗಿ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆ ಮಾಡುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿ, ಸಮರ್ಥವಾದ ವೈಯುಕ್ತಿಕ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಒಂದು ಅಂತರ್‌ಸಂಬಂಧಿತ ಸಂಪರ್ಕಜಾಲಕ್ಕೆ ತಮ್ಮ ಹೈಫೆಗಳನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುವ ಮೂಲಕ ಸಂಯೋಗ ಹೊಂದುತ್ತವೆ; ಅನಸ್ಟೊಮೊಸಿಸ್ (ಅಡ್ಡಸೇರುವಿಕೆ) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯು ಲೈಂಗಿಕ ಚಕ್ರದ ಪ್ರಾರಂಭಿಸುವಿಕೆಗೆ ಅವಶ್ಯಕವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್ಸ್ ಮತ್ತು ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್ಸ್‌ಗಳು ಒಂದು ಡೈಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಂತವನ್ನು ಹಾದುಹೋಗುತ್ತವೆ, ಅದರಲ್ಲಿ ಎರಡು ಪೋಷಕರಿಂದ ಆನುವಂಶಿಕವಾಗಿ ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯು ಕೋಶಗಳ ಸಂಯೋಗದ ಮರುಕ್ಷಣದಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಗ ಹೊಂದಲ್ಪಡುವುದಿಲ್ಲ, ಆದರೆ ಹೈಫಲ್ ಕೋಶಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರತ್ಯೇಕವಾಗಿ ಇರಲ್ಪಡುತ್ತವೆ (ಹೆಟೆರೋಕಾರ್ಯೋಸಿಸ್ ಅನ್ನು ನೋಡಿ).[೭೨]
ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ, ಮೇಲ್ಮೈಯ (ಬೀಜಕವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಅಂಗಾಂಶದ ಮೇಲ್ಮೈ) ಡೈಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹೈಫೆಯು ಒಂದು ಗುಣಲಕ್ಷಣದಿಂದ ಹೈಫಲ್ ನಡುತಡಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ಚಾಚ ಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಕೋಶ ವಿಭಜನೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಚಾಚಿಕೆಗಳ ನಿರ್ಮಾಣವು ಹೊಸದಾಗಿ ವಿಭಜನೆಗೊಂಡ ನ್ಯೂಕ್ಲಿಗಳನ್ನು ತುದಿಯ ಮತ್ತು ತಳದ ಹೈಫಲ್ ವಿಭಾಗಗಳಿಗೆ ಸರಿಯಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸುವುದಕ್ಕೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ನಂತರದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಆಸ್ಕಸ್ (ಆಸ್ಕಿ ಶಬ್ದದ ಬಹುವಚನ) ನಿರ್ಮಾಣವಾಗಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಅದರಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯೋಗ್ಯಾಮಿ (ನ್ಯೂಕ್ಲಿಯರ್ ಸಂಯೋಜನ) ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ. ಆಸ್ಕಿಗಳು ಒಂದು ಆಸ್ಕೋಕಾರ್ಪ್ ಅಥವಾ ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ಕಾಯದಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜನಗೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟಿರುತ್ತವೆ. ಆಸ್ಕಿಯಲ್ಲಿ ಕಾರ್ಯೋಗ್ಯಾಮಿಯು ಅರೆವಿದಳನ ಮತ್ತು ಆಸ್ಕೋಸ್ಪೋರ್‌ನ ಉತ್ಪಾದನೆಯ ಮರುಕ್ಷಣದಲ್ಲಿ ಸಂಭವಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಪ್ರಸರಣದ ನಂತರ, ಆಸ್ಕೋಸ್ಪೋರ್‌ಗಳು ಕುಡಿಯೊಡೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಒಂದು ಹೊಸ ಹ್ಯಾಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಕವಕಜಾಲವು ನಿರ್ಮಾಣವಾಗುತ್ತದೆ.[೭೩]
ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಲೈಂಗಿಕ ಪುನರುತ್ಪಾದನೆಯು ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳ ಲೈಂಗಿಕ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಗೆ ಸದೃಶವಾಗಿದೆ. ಸಮರ್ಥವಾದ ಹ್ಯಾಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಹೈಫೆಯು ಒಂದು ಡೈಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಕವಕಜಾಲವನ್ನು ಉತ್ಪಾದನೆ ಮಾಡುವುದಕ್ಕಾಗಿ ಸಂಯೋಜನಗೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಡೈಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಂತವು ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ತುಂಬಾ ವಿಸ್ತಾರವಾಗಿದೆ, ಅನೇಕ ವೇಳೆ ಸಸ್ಯೀಯವಾಗಿ ಬೆಳೆಯುವ ಕವಕಜಾಲಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಕೂಡ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುತ್ತದೆ. ಕ್ಲಾಂಪ್ ಕನೆಕ್ಷನ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಅಂಗರಚನಾ ವಿನ್ಯಾಸವು ಪ್ರತಿ ಹೈಫಲ್ ಚಾಚಿಕೆಯ ಮೇಲೆ ನಿರ್ಮಾಣವಾಗಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿನ ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸದೃಶವಾಗಿರುವ ಮೇಲ್ಮೈಗಳ ಜೊತೆಯಂತೆ, ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಕ್ಲಾಂಪ್ ಕನೆಕ್ಷನ್ ಇದು ಕೋಶ ವಿಭಜನೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಡೈಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಹಂತವನ್ನು ಪ್ರತಿ ಹೈಫಲ್ ವಿಭಾಗದಲ್ಲಿ ತಳೀಯವಾಗಿ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿರುವ ಎರಡು ನ್ಯೂಕ್ಲಿಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಸರಿಯಾಗಿ ನಿರ್ವಹಿಸುವುದಕ್ಕೆ ನಿಯಂತ್ರಿತ ವರ್ಗಾವಣೆಗೆಗೆ ಅವಶ್ಯಕವಾಗುತ್ತದೆ.[೭೪] ಒಂದು ಬೇಸಿಡಿಯೋಕಾರ್ಪ್ ನಿರ್ಮಾಣವಾಗಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಅದರಲ್ಲಿ ಬೇಸಿಡಿಯಾ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಕ್ಲಬ್-ತರಹದ ರಚನೆಗಳು ಕಾರ್ಯೋಗ್ಯಾಮಿ ಮತ್ತು ಅರೆವಿದಳನದ ನಂತರ ಹ್ಯಾಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಬೇಸಿಡಿಯೋಸ್ಪೋರ್‌ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ.[೭೫] ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟಿರುವ ಬೇಸಿಡಿಯೋಕಾರ್ಪ್‌ಗಳೆಂದರೆ ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳು, ಆದರೆ ಅವುಗಳು ಕೂಡ ಇತರ ವಿಧಗಳನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳಬಹುದಾಗಿದೆ (ಮೊರ್ಫೊಲೊಜಿ (ರೂಪವಿಜ್ಞಾನ) ವಿಭಾಗವನ್ನು ನೋಡಿ).
ಗ್ಲೊಮೆರೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ (ಮೊದಲಿಗೆ ಜಿಗೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತಿದ್ದವು), ಎರಡು ಸ್ವತಂತ್ರ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಹ್ಯಾಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಹೈಫೆಗಳು ಒಂದು ಗ್ಯಾಮೆಟಾಂಜಿಯಮ್ (ಗಮೀಟುಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುವ ಅಂಗ) ಎಂಬ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಕೋಶ ರಚನೆಯನ್ನು ನಿರ್ಮಿಸುತ್ತದೆ, ಅದು ಒಂದು ಫಲವತ್ತಾದ ಗ್ಯಾಮೀಟ್ ಅನ್ನು-ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುವ ಅಂಗವಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತದೆ. ಗ್ಯಾಮೆಟಾಂಜಿಯಮ್ ಇದು ಒಂದು ಜಿಗೋಸ್ಪೋರ್‌ನಲ್ಲಿ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದುತ್ತದೆ, ಜಿಗೋಸ್ಪೋರ್ ಇದು ಗ್ಯಾಮೀಟ್‌ಗಳ ಸಂಯೋಜನದ ಮೂಲಕ ನಿರ್ಮಣವಾಗಲ್ಪಟ್ಟ ಒಂದು ದಪ್ಪನೆಯ-ಗೋಡೆಯ ಬೀಜಕವಾಗಿದೆ. ಜಿಗೋಸ್ಪೋರ್ ಮೊಳಕೆಯೊಡೆಯಲ್ಪಟ್ಟಾಗ, ಅದು ಅರೆವಿದಳನದ ಕ್ರಿಯೆಗೆ ಸಾಗುತ್ತದೆ ಮತ್ತು ಹೊಸ ಹ್ಯಾಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಹೈಫೆಯನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಡುತ್ತದೆ, ಅದು ನಂತರದಲ್ಲಿ ಅಲೈಂಗಿಕ ಸ್ಪೊರಾಂಜಿಯೋಸ್ಪೋರ್ ಅನ್ನು ನಿರ್ಮಾಣ ಮಾಡುತ್ತದೆ. ಈ ಸ್ಪೊರಾಂಜಿಯೋಸ್ಪೋರ್‌ಗಳು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳನ್ನು ವೇಗವಾಗಿ ಪ್ರಸರಣಗೊಳ್ಳುವುದಕ್ಕೆ ಮತ್ತು ಹೊಸದಾದ ತಳೀಯವಾಗಿ ಸದೃಶವಾದ ಹ್ಯಾಪ್ಲಾಯ್ಡ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಕವಕಜಾಲದಲ್ಲಿ ಮೊಳಕೆಯೊಡೆಯುವುದಕ್ಕೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತವೆ.[೭೬]
ಅಲೈಂಗಿಕ ಮತ್ತು ಲೈಂಗಿಕ ಎರಡೂ ಬೀಜಕಗಳು ಅಥವಾ ಸ್ಪೊರಾಂಜಿಯೋಸ್ಪೋರ್‌ಗಳು ಅನೇಕ ವೇಳೆ ತಮ್ಮ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಯ ವಿನ್ಯಾಸಗಳಿಂದ ಶಕ್ತಿಯುತವಾದ ಸಂಯೋಜನೆಯ ಮೂಲಕ ಕ್ರಿಯಾಶೀಲವಾಗಿ ಪ್ರಸರಣಗೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಈ ವಿಸರ್ಜನವು ಮರುಉತ್ಪಾದನಾ ವಿನ್ಯಾಸಗಳಿಂದ ಬೀಜಕಗಳ ಹೊರಹೋಗುವಿಕೆಯನ್ನು ಅನುಮತಿಸುತ್ತದೆ ಹಾಗೆಯೇ ಗಾಳಿಯ ಮೂಲಕ ದೀರ್ಘ ದೂರದವರೆಗೆ ಸಾಗುತ್ತದೆ.
ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಯಾಂತ್ರಿಕ ಮತ್ತು ಜೀವವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಯಾಂತ್ರಿಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳು, ಹಾಗೆಯೇ ಬೀಜಕ ಮೇಲ್ಮೈ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು (ಹೈಡ್ರೋಫೋಬಿನ್‌ಗಳಂತಹ) ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾದ ಬೀಜಕ ವಿಸರ್ಜನಕ್ಕೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತವೆ.[೭೭] ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಕೆಲವು ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಬೀಜಕವನ್ನು-ಹೊಂದಿರುವ ಕೋಶಗಳ ವಿನ್ಯಾಸವು ಕೋಶದ ಗಾತ್ರದ ಮೇಲೆ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಬೀರುವ ದ್ರವ್ಯಗಳಾಗಿ ನಿರ್ಮಾಣ ಮಾಡಲ್ಪಟ್ಟಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಸ್ರವಿಕೆಗಳ ಸಮತೋಲನವು ಗಾಳಿಯಲ್ಲಿ ಬೀಜಕಗಳ ಸಿಡಿಯುವ ವಿಸರ್ಜನೆಯನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ.[೭೮] ಬ್ಯಾಲ್ಲಿಸ್ಟೋಸ್ಪೋರ್‌ ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಏಕೈಕ ಬೀಜಕಗಳ ಬಲವಂತವಾದ ವಿಸರ್ಜನೆಯು ನೀರಿನ ಸಣ್ಣ ಬಿಂದುಗಳ (ಬುಲ್ಲರ‍್ನ ಬಿಂದು) ನಿರ್ಮಾಣವನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ, ಅದು ಬೀಜಕಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಸಂಪರ್ಕಕ್ಕೆ ಬರಲ್ಪಟ್ಟಾಗ ೧೦,೦೦೦ g ಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚಿನ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ವೇಗವರ್ಧನೆಯ ಜೊತೆಗೆ ತನ್ನ ಚಿಮ್ಮುವಿಕೆಯ ವಿಸರ್ಜನೆಯನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತದೆ;[೭೯] ಅದರ ಅಂತಿಮ ಫಲಿತಾಂಶವೇನೆಂದರೆ ಬೀಜಕವು ೦.೦೧–೦.೦೨ cm ನಲ್ಲಿ ವಿಸರ್ಜನಗೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಗಾಳಿಯ ಕೆಳಗೆ ಗಿಲ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಅಥವಾ ಸೂಕ್ಷ್ಮರಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಬೀಳುವುದಕ್ಕೆ ಬೇಕಾಗಿರುವಷ್ಟು ಅಂತರವನ್ನು ಕಲ್ಪಿಸುತ್ತದೆ.[೮೦] ಪಫ್‌ಬಾಲ್‌ಗಳಂತಹ ಇತರ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಬೀಜಕಗಳ ಬಿಡುಗಡೆಗೆ ಒಂದು ಪರ್ಯಾಯವಾದ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳು ಬಾಹಿಕ ಯಾಂತ್ರಿಕ ಬಲಗಳ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಪಕ್ಷಿಗಳ ಗೂಡಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಕಪ್-ಆಕಾರದ ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ಕಾಯಗಳಿಂದ ಬೀಜಕಗಳನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡುವುದಕ್ಕೆ ಬೀಳುತ್ತಿರುವ ನೀರಿನ ಬಿಂದುವಿನ ಬಲವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.[೮೧] ಮತ್ತೊಂದು ತಂತ್ರಗಾರಿಕೆಯು ಸ್ಟಿಂಕೊರ್ನ್ಸ್ ಎಂಬ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ, ಇವುಗಳು ಉಲ್ಲಾಸಮಯ ಬಣ್ಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮತ್ತು ತಮ್ಮ ಬೀಜಕಗಳನ್ನು ಬಿಡುಗಡೆ ಮಾಡುವುದಕ್ಕಾಗಿ ಕೀಟಗಳನ್ನು ಆಕರ್ಷಿಸುವ ಕೊಳೆತ ವಾಸನೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಒಂದು ಗುಂಪಾಗಿವೆ.[೮೨]
ಅರೆವಿದಳನದ ಜೊತೆಗಿನ ನಿಯಮಿತವಾದ ಲೈಂಗಿಕ ಮರುಉತ್ಪಾದನೆಯ ಹೊರತಾಗಿ, ಕೆಲವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಪೆನಿಸಿಲ್ಲಿಯಮ್ ಮತ್ತು ಆಸ್ಪರ್ಜಿಲ್ಲಸ್ ಜಾತಿಯಲ್ಲಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಶಿಲಿಂಧ್ರಗಳ ಕೋಶಗಳ ಹೈಫೆ ಮತ್ತು ಪ್ಲಾಸ್ಮೋಗ್ಯಾಮಿಗಳ ನಡುವಣ ಅನಸ್ಟೋಮೊಸಿಸ್ ಮೂಲಕ ಪ್ರಾರಂಭಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಪ್ಯಾರಾಸೆಕ್ಷುವಲ್ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳ ಮೂಲಕ ಆನುವಂಶಿಕ ದ್ರವ್ಯಗಳನ್ನು ಪರಸ್ಪರ ವಿನಿಮಯ ಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಬಹುದು.[೮೩] ಪ್ಯಾರಾಸೆಕ್ಷುವಲ್ ಘಟನೆಗಳ ಪುನರಾವರ್ತನೆ ಮತ್ತು ಸಂಬಂಧಿತ ಮಹತ್ವವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾಗಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಇತರ ಲೈಂಗಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗಿಂತ ಕೆಳ ಮಟ್ಟದಲ್ಲಿರಬಹುದು. ಇದು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಜಾತಿಗಳ ಜೀವಿಗಳ ಹೈಬ್ರಿಡೈಸೇಷನ್‌ನಲ್ಲಿ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸಬಹುದು[೮೪] ಮತ್ತು ಇತರ ಜಾತಿಗಳ ನಡುವೆ ಹೈಬ್ರಿಡೈಸೇಷನ್‌‌ಗೆ ಅವಶ್ಯಕವಾಗಿರಬಹುದು, ಅದು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ವಿಕಾಸದಲ್ಲಿನ ಪ್ರಮುಖವಾದ ಘಟನೆಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಸಂಬಂಧಿತವಾಗಿದೆ.[೮೫]
ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತವಾಗಿ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಮುಂಚಿನ ಜೀವ್ಯವಶೇಷದ ಮಾಹಿತಿಯು ಕಡಿಮೆ ಪ್ರಮಾಣದ್ದಾಗಿದೆ. ಜೀವ್ಯವಶೇಷಗಳ ನಡುವಿನ ಕೆಳ-ಪ್ರಾತಿನಿಧಿಕತೆಗೆ ಸಹಾಯ ಮಾಡುವ ಸಂಗತಿಗಳು ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ಕಾಯಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ, ಅವು ಮೃದುವಾದ, ಮಾಂಸದಿಂದ ಕೂಡಿದ, ಮತ್ತು ಸುಲಭವಾಗಿ ವಿಘಟನೆ ಹೊಂದಬಲ್ಲ ಅಂಗಾಂಶಗಳು ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ವಿನ್ಯಾಸಗಳ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕೀಯ ಆಯಾಮಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ, ಅವು ಆದ್ದರಿಂದ ಸುಲಭವಾಗಿ ಗೋಚರವಾಗುವುದಿಲ್ಲ. ಶಿಲಿಂಧ್ರಗಳ ಜೀವ್ಯವಶೇಷಗಳು ಇತರ ಮೈಕ್ರೋಬ್‌ಗಳಿಂದ (ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿ) ಬೇರ್ಪಡಿಸುವುದಕ್ಕೆ ಕಷ್ಟಕರವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಅವುಗಳು ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿರುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಜೊತೆ ಸಂಯೋಜನ ಹೊಂದಿದಾಗ ಸುಲಭವಾಗಿ ಕಂಡುಹಿಡಿಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೮೬] ಅನೇಕ ವೇಳೆ ಪರ್ಮಿನರಲೈಸ್ ಮಾಡಲ್ಪಟ್ಟ ಸಸ್ಯ ಅಥವಾ ಪ್ರಾಣಿ ಸಮೂಹದಿಂದ ಪುನಃಸ್ಥಿತಿಗೆ ಬರಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಈ ಮಾದರಿಗಳು ದಟ್ಟ-ವಿಭಾಗ ತಯಾರಿಗಳನ್ನು ಮಾಡುವುದರ ಮೂಲಕ ಕಡಿಮೆ ಪ್ರಮಾಣದ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕ ಅಥವಾ ಸಂವಹನ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋನ್ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕದ ಜೊತೆಗೆ ಪರೀಕ್ಷಿಸುವ ಮೂಲಕ ವಿಶಿಷ್ಟವಾಗಿ ಅಧ್ಯಯನ ಮಾಡಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೮೭] ಸಂಕೋಚನ ಜೀವ್ಯವಶೇಷಗಳು ಸುತ್ತುವರಿಯಲ್ಪಟ್ಟ ವಿಕಾಸಗಳನ್ನು ಆಮ್ಲದ ಜೊತೆಗೆ ವಿಘಟಿಸುವ ಮೂಲಕ ಅಭ್ಯಸಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ನಂತರ ಬೆಳಕನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಅಥವಾ ಸ್ಕ್ಯಾನಿಂಗ್ ಎಲೆಕ್ಟ್ರೋನ್ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಮೇಲ್ಮೈಯ ವಿವರಗಳನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.[೮೮]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮೊದಲಿನ ಜೀವ್ಯವಶೇಷಗಳು ಜೀವ ಪ್ರಾರಂಭಿಕ ಕಾಲದವುಗಳಾಗಿವೆ, ಸುಮಾರು ೧,೪೩೦ million years ago (Ma); ಈ ಬಹುಕೋಶೀಯ ಜಲತಳ ಜೀವಿಗಳು ಸೆಪ್ಟಾದ ಜೊತೆಗೆ ಕಶಾಂಗ ವಿನ್ಯಾಸಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಮತ್ತು ಬೇರೆ ಶಾಖೆಯೊಂದಿಗೆ ಕೂಡಿಕೊಳ್ಳುವಿಕೆಯ ಸಾಮರ್ಥ್ಯವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ.[೮೯] ತೀರಾ ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಧ್ಯಯನಗಳು (೨೦೦೯) ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಜೀವಿಗಳ ಪ್ರಚಲಿತತೆಯು ಸುಮಾರು ೭೬೦–೧೦೬೦ Ma ದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದಿತು ಎಂಬುದಾಗಿ ಸನಿಹವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿತವಾದ ಗುಂಪುಗಳಲ್ಲಿ ವಿಕಾಸದ ಪ್ರಮಾಣದ ಹೋಲಿಕೆಯ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ಕಂಡುಹಿಡಿದವು.[೯೦] ಪೇಲಿಯೋಜೊಯಿಕ್ ಕಾಲದ (೫೪೨–೨೫೧ Ma) ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಜಲೀಯ ಜೀವಿಗಳಾಗಿವೆ ಎಂಬಂತೆ ಕಂಡುಬರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಪ್ರಚಲಿತದಲ್ಲಿರುವ ಕಶಾಂಗಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಬೀಜಕಗಳಲ್ಲಿನ ಕೈಟ್ರಿಡ್‌ಗಳಿಗೆ ಸದೃಶವಾಗಿರುತ್ತವೆ.[೯೧] ಒಂದು ಜಲೀಯ ಜೀವಿಯಿಂದ ಒಂದು ಭೂಮಂಡಲದ ಜೀವನ ಶೈಲಿಯ ವಿಕಾಸವಾದದ ಅಳವಡಿಕೆಯು ಪೋಷಕಂಶಗಳನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳುವುದಕ್ಕಾಗಿ ಪರಾವಲಂಬಿಕೆ, ಸಪ್ರೋಬಿಸಮ್, ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲ ಮತ್ತು ಲೈಕೆನೈಸೇಷನ್‌ಗಳಂತಹ ವಿಘಟನಾತ್ಮಕ ಸಂಬಂಧಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ತಂತ್ರಗಾರಿಕೆಗಳ ವೈವಿಧ್ಯೀಕರಣವನ್ನು ಅವಶ್ಯಕವಾಗಿಸಿತು.[೯೨] ಇತ್ತೀಚಿನ (೨೦೦೯) ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಹೇಳುವುದೇನೆಂದರೆ ಆಸ್ಕೋಮೈಕೋಟಾದ ಪೂರ್ವಿಕ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಸ್ಥಿತಿಯು ಸಪ್ರೋಬಿಸಮ್ ಆಗಿತ್ತು, ಮತ್ತು ಸ್ವತಂತ್ರವಾದ ಲೈಕೆನೈಸೇಷನ್ ಘಟನೆಗಳು ಹಲವಾರು ಬಾರಿ ಸಂಭವಿಸಿವೆ.[೯೩]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ಕ್ಯಾಂಬ್ರಿಯನ್ (೫೪೨–೪೮೮.೩ Ma) ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಸಸ್ಯಗಳು ಜೀವತಳೆಯುವುದಕ್ಕೂ ಮುಂಚೆ ಭೂಮಿಯಲ್ಲಿ ಸ್ಥಾಪಿತವಾಗಲ್ಪಟ್ಟವು.[೯೪] ವಿಸ್ಕೋನ್ಸಿನ್‌ನ (೪೬೦ Ma) ಆರ್ಡೋವಿಷಿಯನ್ ಕಾಲದಿಂದ ಸಂಪಾದಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಜೀವ್ಯವಶೇಷಗಳಾದ ಹೈಫೆಗಳು ಮತ್ತು ಬೀಜಕಗಳು ಆಧುನಿಕ-ದಿನದ ಗ್ಲೊಮೆರೆಲ್‌ಗಳನ್ನು ಹೋಲುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಸಂಪತ್ತುಗಳು ನಾಳೀಯ-ಅಲ್ಲದ ಪಾಚಿಯಂತಹ-ಗಿಡಗಳನ್ನು ಮಾತ್ರ ಒಳಗೊಂಡಿದ್ದ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವದಲ್ಲಿತ್ತು.[೯೫] ಪ್ರೊಟೊಟ್ಯಾಕ್ಸಿಟ್‌ಗಳು, ಬಹುಶಃ ಒಂದು ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಅಥವಾ ಕಲ್ಲುಹೂವು ಆಗಿದ್ದ ಇದು ಸೈಲೂರಿಯನ್ ಅವಧಿಯ ಕೊನೆಯಲ್ಲಿದ್ದ ಅತ್ಯಂತ ಉದ್ದದ ಜೀವಿಗಳಾಗಿದ್ದವು. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಜೀವ್ಯವಶೇಷಗಳು ಡಿವೋನಿಯನ್ ಅವಧಿಯ ಪ್ರಾರಂಭದವರೆಗೆ (೪೧೬–೩೫೯.೨ Ma) ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿರಲಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ನಿರ್ವಿವಾದವಾಗಿರಲಿಲ್ಲ, ಆ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅವುಗಳು ರಿನಿ ಚೆರ್ಟ್‌ನಲ್ಲಿ ಹೇರಳವಾಗಿದ್ದವು, ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಜಿಗೋಮೈಕೋಟಾ ಮತ್ತು ಕೈಟ್ರಿಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾ ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿ ಹೇರಳವಾಗಿದ್ದವು.[೯೪][೯೬][೯೭] ಅದೇ ಸಮಯದಲ್ಲಿ, ಸರಿಸುಮಾರಾಗಿ ೪೦೦ Ma, ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟಾ ಮತ್ತು ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾಗಳು ಭಿನ್ನವಾಗಲ್ಪಟ್ಟವು,[೯೮] ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಎಲ್ಲಾ ಆಧುನಿಕ ಜಾತಿಗಳು ಕಾರ್ಬಿನೋಫೆರಸ್‌ನ (ಪೆನ್ನಿಸಿಲ್ವೇನಿಯನ್, ೩೧೮.೧–೨೯೯ Ma) ಕೊನೆಯಲ್ಲಿ ಅಸ್ತಿತ್ವಕ್ಕೆ ಬಂದವು.[೯೯]
ಕಲ್ಲುಹೂವುಗಳ-ತರಹದ ಜೀವ್ಯವಶೇಷಗಳು ದಕ್ಷಿಣ ಚೀನಾದಲ್ಲಿ ಡೌಶಾಂಟೋ ನಿರ್ಮಾಣದಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು ೬೩೫–೫೫೧ Ma ದಿನಾಂಕದ ಹಿಂದೆ ಕಂಡುಬಂದವು.[೧೦೦] ಕಲ್ಲುಹೂವುಗಳು ಮೊದಲಿನ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳ ಒಂದು ಘಟಕವಾಗಿತ್ತು, ಮತ್ತು ಅತ್ಯಂತ ಹಳೆಯದಾದ ಭೂಮಂಡಲದ ಜೀವ್ಯವಶೇಷದ ಅಂದಾಜು ಮಾದಲಾದ ವರ್ಷವು ೪೦೦ Ma ಆಗಿತ್ತು;[೧೦೧] ಈ ದಿನಾಂಕವು ಅತ್ಯಂತ ಹಳೆಯದು ಎಂದು ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟ ರಿನಿ ಚೆರ್ಟ್‌ನಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದ ಪಾಲಿಯೋಪೈರೆನೊಮೈಸೀಟ್ಸ್ ಜಾತಿಯ ಒಂದು ಸ್ಪೊರೊಕಾರ್ಪ್ ಜೀವ್ಯವಶೇಷದ ವರ್ಷಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿತವಾಗಿತ್ತು.[೧೦೨] ಅತ್ಯಂತ ಹಳೆಯದಾದ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕೀಯ ಲಕ್ಷಣದ ಜೊತೆಗಿನ ಆಧುನಿಕ-ದಿನಕ್ಕೆ ಸದೃಸವಾಗಿರುವ ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳ ಜೀವ್ಯವಶೇಷಗಳೆಂದರೆ ಪಾಲಯಿನ್ಸಿಸ್ಟ್ರಸ್ , ಪೆನ್ಸಿಲ್ವೇನಿಯನ್‌ದಿಂದ ಒಂದು ಜರೀಗಿಡದ ಜೊತೆಗೆ ಪರ್ಮಿಲರೈಸ್ ಆಗಿ ಕಂಡುಬಂದಿದೆ.[೧೦೩] ಜೀವ್ಯವಶೇಷದಲ್ಲಿನ ವಿರಳವಾದ ದಾಖಲೆಗಳೆಂದರೆ ಹೊಮೊಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್ಸ್‌ಗಳು (ಒಂದು ಟ್ಯಾಕ್ಸನ್ ಇದು ಅಗಾರಿಕೋಮೈಸೀಟ್ಸ್‌ನ ಮಶ್ರೂಮ್-ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುವ ಜಾತಿಗಳಿಗೆ ಸರಿಸಮಾನವಾಗಿದೆ). ಎರಡು ಪಳೆಯುಳಿಕೆಗಳಾಗಿ-ಸಂರಕ್ಷಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಮಾದರಿಗಳು ತೋರ್ಪಡಿಸುವುದೇನೆಂದರೆ ಮೊದಲಿಗೆ ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟ ಮಶ್ರೂಮ್-ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು (ಅಪ್ರಚಲಿತ ಜಾತಿಗಳಾದ ಆರ್ಕಿಯೋಮರಸ್ಮಿಯಸ್ ಲೆಗ್ಲೆಟ್ಟಿ ) ಕ್ರಿಟೀಷಿಯಸ್ ಅವಧಿಯಲ್ಲಿ, ೯೦ Ma ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದವು.[೧೦೪][೧೦೫]
ಪರ್ಮಿಯನ್-ಟ್ರಯಾಸಿಕ್ ಎಕ್ಸ್ಟಿಂಕ್ಷನ್ ಘಟನೆಯ ಸ್ವಲ್ಪ ಸಮಯದ ನಂತರ (೨೫೧.೪ Ma), ಒಂದು ಶಿಲೀಂಧ್ರದ ಶಲಾಕೆಯು (ಇದು ಮೂಲಭೂತವಾಗಿ ನೀರಿನ ಸಂಚಯದಲ್ಲಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಬೀಜಕಗಳ ಒಂದು ಅಪಾರವಾದ ವಿಪುಲತೆಯಲ್ಲಿ ಇವೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗಿದೆ) ನಿರ್ಮಾಣವಾಗಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಸೂಚಿಸುವುದೇನೆಂದರೆ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಆ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಬಲವಾದ ಜೀವಿ ವಿಧಗಳಾಗಿದ್ದವು, ಅವು ಆ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ದೊರಕುತ್ತಿದ್ದ ಜೀವ್ಯವಶೇಷಗಳ ದಾಖಲೆಗಳ ಸರಿಸುಮಾರು ೧೦೦% ಜೀವಿಗಳನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುತ್ತಿದ್ದವು.[೧೦೬] ಆದಾಗ್ಯೂ, ಆಲ್ಗಲ್ ಜಾತಿಗಳ ಮೂಲಕ ನಿರ್ಮಾಣವಾಗಲ್ಪಟ್ಟ ಬೀಜಕಗಳಿಗೆ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಶಿಲಿಂಧ್ರಗಳ ಬೀಜಕಗಳ ಅನುಪಾತವು ಕಂಡುಹಿಡಿಯುವುದಕ್ಕೆ ಅಸಾಧ್ಯವಾಗಿದೆ,[೧೦೭] ಶಲಾಕೆಗಳು ಜಗತ್ತಿನಾದ್ಯಂತ ಕಂಡುಬರುವುದಿಲ್ಲ,[೧೦೮][೧೦೯] ಮತ್ತು ಇತರ ಹಲವಾರು ಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಇದು ಪರ್ಮಿಯನ್-ಟ್ರಯಸಿಕ್ ಮಿತಿಯೊಳಗಡೆ ಬರುವುದಿಲ್ಲ.[೧೧೦]
ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕವಾಗಿ ಹಲವಾರು ಸಸ್ಯಶಾಸ್ತ್ರ ಅಧ್ಯಯನದಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಪುಸ್ತಕಗಳಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜಿಸಲ್ಪಟಿದ್ದರೂ ಕೂಡ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತದಲ್ಲಿ ಸಸ್ಯಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಬಂಧಿತವಾಗಿವೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಮತ್ತು ಅವುಗಳು ಒಪಿಸ್ಟೋಕೊಂಟ್‌ನ ಮೊನೊಫೈಲೆಟಿಕ್ ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿ ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೧೧೧] ಅಣುಗಳ ಜಾತಿವಿಕಾಸವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡ ಒಂದು ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಶಿಲಿಂಧ್ರಗಳ ಒಂದು ಮೊನೊಫೈಲೆಟಿಕ್ ಮೂಲವನ್ನು ಬೆಂಬಲಿಸುತ್ತವೆ.[೩೭] ಪ್ರಮುಖವಾಗಿ ಡಿಎನ್ಎ ಹೋಲಿಕೆಗಳ ಮೇಲೆ ಆಧಾರಿತವಾದ ಇತ್ತೀಚಿನ ಸಂಶೋಧನೆಗಳ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ವರ್ಗೀಕರಣವು ಒಂದು ಸ್ಥಿರವಾದ ಹೊರಹೊಮ್ಮುವಿಕೆಯ ಒಂದು ಸ್ಥಿತಿಯಲ್ಲಿದೆ. ಪ್ರಸ್ತುತದ ಈ ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು ಅನೇಕ ವೇಳೆ ಹಳೆಯದಾದ ಮತ್ತು ಕೆಲವು ವೇಳೆ ರೂಪವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾದ ಕಡಿಮೆ ಭೇದಾತ್ಮಕ ವಿಧಾನಗಳು ಮತ್ತು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕ ಸಂಯೋಗಗಳಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟ ಜೈವಿಕ ಜಾತಿಗಳ ಅಂಶಗಳ ಮೇಲೆ ಆಧಾರಿತವಾದ ವಿಂಗಡನೆಗಳು ಅನೂರ್ಜಿತಗೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೧೧೨]
ಹೆಚ್ಚಿನ ವರ್ಗೀಕರಣದ ಮಟ್ಟಗಳಲ್ಲಿ ಯಾವುದೇ ರೀತಿಯಾದ ಉತ್ಕೃಷ್ಟವಾದ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಅಳವಡಿಸಿಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಿಲ್ಲ ಮತ್ತು ಅಲ್ಲಿ ಜಾತಿಗಳು ಮೇಲೆ ಹೋದಂತೆಲ್ಲಾ ಪ್ರತಿ ಹಂತದಲ್ಲಿಯೂ ಕೂಡ ಪುನರಾವರ್ತಿತವಾದ ಹೆಸರು ಬದಲಾವಣೆ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಗಳು ಪ್ರಚಲಿತದಲ್ಲಿವೆ. ಸಂಶೋಧಕರುಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರಯತ್ನಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತದಲ್ಲಿ ಒಂದು ಏಕೀಕೃತ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ಸ್ಥಿರವಾದ ನಾಮಕರಣ ಪೃವೃತ್ತಿಗಳ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಸ್ಥಿರೀಕರಿಸುವ ಮತ್ತು ಪ್ರೋತ್ಸಾಹಿಸುವ ಪೃವೃತ್ತಿಗಳು ಪ್ರಚಲಿತಕ್ಕೆ ಬರುತ್ತಿವೆ.[೩೭][೧೧೩] ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಜಾತಿಗಳೂ ಕೂಡ ಅವುಗಳ ಜೀವನ ಚಕ್ರ ಮತ್ತು ಪುನರುತ್ಪಾದನೆಯ ವಿಧಾನ (ಲೈಂಗಿಕ ಅಥವಾ ಅಲೈಂಗಿಕ) ಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ಬಹುವಿಧದ ವೈಜ್ಞಾನಿಕ ಹೆಸರುಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರಬಹುದು. ಇಂಡೆಕ್ಸ್ ಫಂಗೋರಮ್ ಮತ್ತು ಐಟಿಐಎಸ್ ವೆಬ್ ಸೈಟ್‌ಗಳು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಜಾತಿಗಳ ಪ್ರಸ್ತುತದ ಹೆಸರುಗಳ ಯಾದಿಯನ್ನು ಪ್ರಕಟಪಡಿಸುತ್ತವೆ (ಹಳೆಯ ಸಮಾನಾರ್ಥಕ ಪದಗಳ ಉಲ್ಲೆಖವನ್ನೂ ಕೂಡ ಪ್ರಸ್ತುತಪಡಿಸುತ್ತವೆ).
ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ೨೦೦೭ ರ ವಿಂಗಡನೆಯು ಹಲವಾರು ಡಜನ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಮತ್ತು ಇತರ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಜೀವಿವರ್ಗೀಕರಣಶಾಸ್ತ್ರಗಳ ಮೇಲಿನ ಕಾರ್ಯಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡ ಒಂದು ಹೆಚ್ಚಿನ-ಪ್ರಮಾಣದ ಸಂಘಟಿತ ಸಂಶೋಧನೆಯ ಪರಿಣಾಮವಾಗಿದೆ.[೩೭] ಇದು ಏಳು ಫೈಲಾಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸುತ್ತದೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಎರಡು - ಆಸ್ಕೋಮೈಕೊಟಾ ಮತ್ತು ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾ- ಇವುಗಳು ಉಪಕಿಂಗ್‌ಡಮ್ ಡೈಕಾರ್ಯಾವನ್ನು ಪ್ರತಿನಿಧಿಸುವ ಒಂದು ವಿಭಗವಾಗಿದೆ. ಈ ಕೆಳಗಿನ ಕ್ಲ್ಯಾಡೋಗ್ರಾಮ್ (ಜಾತಿವಿಕಾಸದ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ವಿವರಿಸಲು ಬಳಸುವ ಒಂದು ಮರದ ಚಿತ್ರ) ಪ್ರಮುಖ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಟಾಕ್ಸಾ ಮತ್ತು ಒಪಿಸ್ಟೋಕೊಂಟ್ ಮತ್ತು ಯುನಿಕೊಂಟ್ ಜೀವಿಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಅವುಗಳ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಚಿತ್ರಿಸುತ್ತವೆ. ಈ ಮರದ ಚಿತ್ರದಲ್ಲಿ ವಿಭಾಗಗಳ (ಶಾಖೆಗಳ) ಉದ್ದವು ಬೆಳವಣಿಗಾತ್ಮಕ ಅಂತರಗಳಿಗೆ ಪ್ರಮಾಣಾನುಗುಣವಾಗಿಲ್ಲ.
ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಪ್ರಮುಖ ಫೈಲಾಗಳು (ಕೆಲವು ವೇಳೆ ವಿಭಾಗಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ) ಮುಖ್ಯವಾಗಿ ಅವುಗಳ ಲೈಂಗಿಕ ಪುನರುತ್ಪಾದನೆಯ ವಿನ್ಯಾಸಗಳ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳ ಆಧಾರದ ಮೇಲೆ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಪ್ರಸ್ತುತದಲ್ಲಿ, ಏಳು ಫೈಲಾಗಳು ಇವೆ ಎಂದು ಭಾವಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ: ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೋರಿಡಿಯಾ, ಕೈಟ್ರಿಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾ, ಬ್ಲಾಸ್ಟೋಕ್ಲಾಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾ, ನಿಯೋಕಾಲ್ಲಿಮಸ್ಟಿಗೋಮೈಕೋಟಾ, ಗ್ಲೋಮೆರೋಮೈಕೋಟಾ, ಆಸ್ಕೋಮೈಕೋಟಾ, ಮತ್ತು ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾ.[೩೭]
ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೋರಿಡಿಯಾ, ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಮತ್ತು ಪ್ರೋಟಿಸ್ಟ್ (ಏಕಕೋಶ ಜೀವಿ) ಏಕಕೋಶೀಯ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತ ಕಾಲದವಾಗಿವೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಎಂಡೋಬಯೋಟಿಕ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಂದ (ಇತರ ಜಾತಿಗಳ ಅಂಗಾಂಶದೊಳಗಡೆಯಲ್ಲಿ ಜೀವಿಸುವ ಜೀವಿ) ವಿಕಾಸಗೊಳ್ಲಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಜಾತಿವಿಕಾಸದ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು ವಿವರಿಸುತ್ತವೆ.[೯೧][೧೧೪] ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾಗಳು ನಿಜವಾದ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಸಹೋದರಿ ಗುಂಪುಗಳಾಗಿವೆ, ಅಂದರೆ, ಅವುಗಳು ಪರಸ್ಪರರ ವಿಕಾಸದ ಸಂಬಂಧಿಗಳಾಗಿವೆ ಎಂಬುದಾಗಿ ೨೦೦೬ ರ ಒಂದು ಅಧ್ಯಯನವು ತೀರ್ಮಾನಿಸಿತು.[೧೧೫] ಈ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಅವರ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ವಿಂಗಡನೆಯ ಜೊತೆಗೆ ಸಂಘರ್ಷವನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುವುದಿಲ್ಲ ಎಂದು ಹಿಬ್ಬೆಟ್ ಮತ್ತು ಕೊಲೀಗ್ಸ್ ಸೂಚಿಸಿದರು, ಮತ್ತು ಆದಾಗ್ಯೂ ಮೈಕ್ರೋಸ್ಪೊರಿಡಿಯಾಗಳು ಫೈಲಮ್ ಸ್ಥಿತಿಗೆ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದಿದರೂ ಕೂಡ, ಈ ಗುಂಪಿನೊಳಗೆ ವಿಕಾಸಾತ್ಮಕ ಸಂಬಂಧಗಳನ್ನು ಸ್ಪಷ್ಟೀಕರಿಸುವ ಸಲುವಾಗಿ ಇನ್ನೂ ಹೆಚ್ಚಿನ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಅವಶ್ಯಕವಾಗಿದೆ ಎಂದು ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟಿತು.[೩೭]
ಕೈಟ್ರಿಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾಗಳು ಕೈಟ್ರಿಡ್‌ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಈ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಜಗತ್ತಿನಾದ್ಯಂತ ವಿಭಾಗಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಕೈಟ್ರಿಡ್‌ಗಳು ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣ ಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರನ್ನು ತಮ್ಮನ್ನು ಪ್ರೋಟಿಸ್ಟ್ (ಏಕಕೋಶ ಜೀವಿ)ಗಳು ಎಂದು ವಿಂಗಡನೆ ಮಾಡುವಂತೆ ಮಾಡುವ ಏಕೈಕ ಕಶಾಂಗವನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಜಲೀಯ ಹಂತಗಳ (ಪದರಗಳ) ಮೂಲಕ ಕ್ರಿಯಾಶೀಲ ಚಲನೆಗಳನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುವುದಕ್ಕೆ ಸಮರ್ಥವಾಗಿರುವ ಚಲಜೀವಕಣಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ರೈಬೋಸೋಮ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಆರ್‌ಆರ್‌ಎನ್‌ಎ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟ ಅಣುಗಳ ಜಾತಿವಿಕಾಸವಾದಗಳು ಸೂಚಿಸುವುದೇನೆಂದರೆ, ಕೈಟ್ರಿಡ್‌ಗಳು ಇತರ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಫೈಲಾಗಳಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟ ಮೂಲಭೂತ ಗುಂಪುಗಳಾಗಿವೆ, ಇವುಗಳು ಪ್ಯಾರಾಫಿಲಿ ಅಥವಾ ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ಪಾಲಿಫಿಲಿಗಳ ಸೂಚ್ಯ ಸಾಕ್ಷ್ಯಗಳ ಜೊತೆಗಿನ ನಾಲ್ಕು ಪ್ರಮುಖವಾದ ಏಕಮೂಲ ವರ್ಗಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿವೆ.[೯೧]
ಬ್ಲಾಸ್ಟೋಕ್ಲಾಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾಗಳು ಮೊದಲಿಗೆ ಕೈಟ್ರೀಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾ ಗುಂಪಿನ ಒಂದು ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣದ ಒಂದು ಏಕಮೂಲ ವರ್ಗ ಎಂಬುದಾಗಿ ಪರಿಗಣಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದ್ದವು. ಇತ್ತೀಚಿನ ಅಣುಗಳ ಮಾಹಿತಿ ಮತ್ತು ಅಲ್ಟ್ರಾವಿನ್ಯಾಸೀಯ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು, ಆದಾಗ್ಯೂ, ಬ್ಲಾಸ್ಟೋಕ್ಲಾಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾ ಅನ್ನು ಜೈಗೋಮೈಕೋಟಾ, ಗ್ಲೋಮೆರೋಮೈಕೋಟ, ಮತ್ತು ಡೈಕಾರ್ಯಾ (ಆಸ್ಕೋಮೈಕೋಟ ಮತ್ತು ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾ) ಇವುಗಳಿಗೆ ಒಂದು ಸಹೋದರಿ ಏಕಮೂಲ ವರ್ಗವಾಗಿ ಭಾವಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಬ್ಲಾಸ್ಟೋಕ್ಲಾಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾಗಳು ವಿಘಟನೆಯಾಗಬಲ್ಲ ಜೈವಿಕ ವಸ್ತುವಿನಿಂದ ಆಹಾರವನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಸಪ್ರೋಟ್ರೋಫ್‌ಗಳಾಗಿವೆ, ಮತ್ತು ಅವು ಎಲ್ಲಾ ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಗುಂಪುಗಳ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳಾಗಿವೆ. ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಯುಗ್ಮಜೀಯ ಅರೆವಿದಳನವನ್ನು ಪ್ರದರ್ಶಿಸುವ ಅವುಗಳ ಸನಿಹದ ಸಂಬಂಧಿತಗಳಾದ ಕೈಟ್ರಿಡ್‌ಗಳಂತೆ ಅಲ್ಲದೇ, ಬ್ಲಾಸ್ಟೋಕ್ಲಾಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾಗಳು ಸ್ಪೋರಿಕ್ ಅರೆವಿದಳನಕ್ಕೆ ಮೊರೆಹೋಗುತ್ತವೆ.[೯೧]
ನಿಯೋಕಾಲ್ಲಿಮಸ್ಟಿಗೋಮೈಕೋಟಾಗಳು ಮೊದಲಿಗೆ ಫೈಲಮ್ ಕೈಟ್ರಿಡೊಮೈಕೋಟಾದ ಗುಂಪಿಗೆ ಸೇರಲ್ಪಟ್ಟಿದ್ದವು. ಈ ಸಣ್ಣ ಫೈಲಮ್‌ನ ಸದಸ್ಯರುಗಳು ಆನರೋಬಿಕ್ ಜೀವಿಗಳಾಗಿವೆ, ಇವುಗಳು ದೊಡ್ಡದಾದ ಸಸ್ಯಾಹಾರಿ ಸಸ್ತನಿಗಳ ಪಚನ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಸಂಭಾವ್ಯವಾಗಿ ಇತರ ಭೂಮಂಡಲದ ಮತ್ತು ಜಲೀಯ ವಾತಾವರಣಗಳಲ್ಲಿ ಜೀವಿಸುತ್ತವೆ. ಅವುಗಳು ಮೈಟೋಕಾಂಡ್ರಿಯಾದ ಕೊರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ, ಆದರೆ ಮೈಟೋಕಾಂಡ್ರಿಯಲ್ ಮೂಲಗಳ ಹೈಡ್ರೋಜೆನೋಸೋಮ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ. ಸಂಬಂಧಿತ ಕೈಟ್ರಿಡ್‌ಗಳಂತೆ, ನಿಯೋಕಾಲ್ಲಿಮಸ್ಟಿಗೋಮೈಕೋಟಾಗಳು ಭವಿಷ್ಯದ ಪೀಳಿಗೆಯ ಯುನೈಫ್ಲಾಜೆಲೇಟ್ ಅಥವಾ ಪಾಲಿಫ್ಲಾಜೆಲೇಟ್‌ಗಳ ಚಲಜೀವಕಣಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ.[೩೭]
ಗ್ಲೋಮೆರೋಮೈಕೋಟಾ ಗುಂಪಿನ ಸದಸ್ಯರುಗಳು ಅರ್ಬ್ಯುಸ್ಕುಲರ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದನೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ, ಇದು ಒಂದು ವಿಧದ ಸಂಯುಕ್ತಜೀವನವಾಗಿದೆ, ಅಲ್ಲಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಹೈಫೆಯು ಸಸ್ಯದ ಬೇರಿನ ಕೋಶಗಳನ್ನು ಅತಿಕ್ರಮಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಎರಡೂ ಜಾತಿಗಳು ಪರಿಣಾಮವಾಗಿ ಹೆಚ್ಚಿದ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಪೂರೈಕೆಯಿಂದ ಪ್ರಯೋಜನವನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಎಲ್ಲಾ ಪ್ರಚಲಿತದಲ್ಲಿರುವ ಗ್ಲೋಮೆರೋಮೈಕೋಟಾ ಜಾತಿಗಳು ಅಲೈಂಗಿಕವಾಗಿ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ.[೬೮] ಗ್ಲೋಮೆರೋಮೈಕೋಟಾ ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳ ನಡುವಣ ಸಹಜೀವನದ ಸಂಘಟನೆಯು ಸುಮಾರು ೪೦೦ ಮಿಲಿಯನ್ ವರ್ಷಗಳಿಗಿಂತ ಹಿಂದಿನದಾಗಿದೆ.[೧೧೬] ಜಿಗೋಮೈಕೋಟಾದ ಮೊದಲ ಭಾಗ (ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ’ಸಕ್ಕರೆ’ ಮತ್ತು ’ಪಿನ್’ ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ), ಗ್ಲೊಮೆರೋಮೈಕೋಟಾಗಳು ೨೦೦೧ ರಲ್ಲಿ ಫೈಲಮ್ ಸ್ಥಿತಿಗೆ ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದಲ್ಪಟ್ಟವು ಮತ್ತು ಪ್ರಸ್ತುತದಲ್ಲಿ ಹಳೆಯದಾದ ಫಲಮ್ ಜಿಗೊಮೈಕೋಟಾಕ್ಕೆ ಬದಲಾಯಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ.[೧೧೭] ಜಿಗೋಮೈಕೋಟಾ ಗುಂಪಿನಲ್ಲಿ ಇರುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಪ್ರಸ್ತುತದಲ್ಲಿ ಗ್ಲೊಮೆರೊಮೈಕೋಟಾ ಗುಂಪಿಗೆ ಪುನಃ ಸೇರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಅಥವಾ ಉಪಫೈಲಾ ಇನ್‌ಸರ್ಟೇಟ್ ಸೆಡಿಸ್ ಮ್ಯುಕೋರೊಮೈಕೋಟಿನಾ, ಕಿಕ್ಸೆಲ್ಲೊಮೈಕೊಟಿನಾ, ಜೂಪಾಗೋಮೈಕೊಟಿನಾ, ಮತ್ತು ಎಂಟೊಮೊಪ್ಥೊರೊಮೈಕೊಟಿನಾಗಳಿಗೆ ಪುನಃ ಸೇರಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ.[೩೭] ಜಿಗೋಮೈಕೋಟಾದಲ್ಲಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಕೆಲವು ಸರಿಯಾಗಿ-ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟ ಉದಾಹರಣೆಗಳು ಈ ಕೆಳಗಿನವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ - ಕಪ್ಪು ಬ್ರೆಡ್ ಮೋಲ್ಡ್ (ರಿಜೋಪಸ್ ಸ್ಟೊಲಿನಿಫೆರ್ ), ಮತ್ತು ಪಿಲೊಬೊಲುಸ್ ಜಾತಿಗಳು -ಇವುಗಳು ಗಾಳಿಯ ಮೂಲಕ ಹಲವಾರು ಮೀಟರ್‌ಗಳವರೆಗೆ ಬೀಜಕಗಳನ್ನು ವಿಸರ್ಜಿಸುತ್ತವೆ.[೧೧೮] ವೈದ್ಯಕೀಯವಾಗಿ ಪ್ರಸ್ತುತವಾದ ಜಾತಿಗಳು ಮ್ಯುಕರ್ , ರಿಜೋಮ್ಯುಕರ್ , ಮತ್ತು ರಿಜೋಪಸ್ ಮುಂತಾದವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.
ಆಸ್ಕೋಮೈಕೋಟಾ ಇದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸ್ಯಾಕ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಅಥವಾ ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಇದು ಯುಮೈಕೋಟದಲ್ಲಿ ಅತ್ಯಂತ ದೊಡದಾದ ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣದ ಗುಂಪನ್ನು ಸಂಯೋಜಿಸುತ್ತದೆ.[೩೬] ಈ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಆಸ್ಕೋಸ್ಪೋರ್‌ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಅರೆವಿದಳನ ಬೀಜಕಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳು ಆಸ್ಕಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ಕೋಶದ-ತರಹದ ವಿನ್ಯಾಸದ ಜೊತೆಗೆ ಸಂಯೋಜಿತಗೊಂಡಿರಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಈ ಫೈಲಮ್ ಮೊರೆಲ್‌ಗಳು (ಖಾದ್ಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು), ಕೆಲವು ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಗೆಡ್ಡೆ ಅಣಬೆಗಳು, ಏಕೈಕ-ಕೋಶೀಯ ಯೀಸ್ಟ್‌ಗಳು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಸ್ಯಾಕ್ಕೊರೊಮೈಸೀಸ್ , ಕ್ಲುಯ್ವೆರೋಮೈಸೀಸ್ , ಪಿಚಿಯಾ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಂಡಿಡಾ ಗಳ ಜಾತಿಗಳು), ಮತ್ತು ಸಪ್ರೋಟ್ರೊಫ್‌ಗಳು, ಪರಾವಲಂಬಿಗಳು, ಮತ್ತು ವಿಘಟನೆ ಹೊಂದಬಲ್ಲ ಸಂಯುಕ್ತಜೀವಿಗಳಂತೆ ಜೀವಿಸುತ್ತಿರುವ ಹಲವಾರು ತಂತುಗಳುಳ್ಳ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಮುಂತಾದವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ತಂತುಗಳುಳ್ಳ ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳ ಪ್ರಮುಖವಾದ ಮತ್ತು ಅತ್ಯಂತ ಮುಖ್ಯ ಜಾತಿಗಳು ಆಸ್ಪೆರ್ಜಿಲಸ್ , ಪೆನ್ಸಿಲ್ಲಿಯಮ್ , ಫ್ಯುಸಾರಿಯಮ್ , ಮತ್ತು ಕ್ಲಾವಿಸೆಪ್ಸ್ ಮುಂತಾದವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ. ಹಲವಾರು ಆಸ್ಕೊಮೈಸೀಟ್ ಜಾತಿಗಳು ಮಾತ್ರ ಅಲೈಂಗಿಕ ಪುನರುತ್ಪಾದನೆಯ ಮೊರೆ ಹೋಗಿರುವುದನ್ನು ವೀಕ್ಷಿಸಲಾಗಿದೆ (ಅವು ವಿಕೃತ ರೂಪಾಂತರದ ಜಾತಿಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ), ಆದರೆ ಅಣುಗಳ ಮಾಹಿತಿಗಳ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯು ಅನೇಕ ವೇಳೆ ಆಸ್ಕೋಮೈಕೋಟಾದಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಸಂಬಂಧಿತವಾದ ಟೆಲಿಯೋಮೊರ್ಫ್‌ಗಳನ್ನು ಗುರುತಿಸಿದೆ.[೧೧೯] ಕೋಶದ-ತರಹದ ಆಸ್ಕಸ್‌ನ ಒಳಗೆ ಅರೆವಿದಳನದ ಉತ್ಪನ್ನಗಳು ಉಳಿದುಕೊಂಡಿರುವ ಕಾರಣ, ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳು ತಳಿವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಆನುವಂಶಿಕತೆಗಳ (ಅಂದರೆ ನ್ಯುರೊಸ್ಪೊರಾ ಕ್ರಾಸಾ ) ವಿವರಣಾತ್ಮಕ ಮೂಲತತ್ವಗಳನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡಿವೆ.[೧೨೦]
ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಕೋಟಾದ ಸದಸ್ಯರುಗಳು, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಕ್ಲಬ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಅಥವಾ ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳು ಬೇಸಿಡಿಯಾ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಕ್ಲಬ್-ತರಹದ ಕಾಂಡಗಳ ಮೇಲೆ ಬೇಸಿಡಿಯೋಸ್ಪೋರ್‌ಗಳು ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಮಿಯೋಸ್ಪೋರ್‌ಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯವಾದ ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳು ಈ ಗುಂಪಿಗೆ ಸೇರಲ್ಪಡುತ್ತವೆ, ಹಾಗೆಯೇ ಬೀಜಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ರೋಗಕಾರಕಗಳಾದ ರಸ್ಟ್ (ಬೂಸ್ಟ್) ಮತ್ತು ಕಾಡಿಗೆ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಕೂಡ ಈ ಗುಂಪಿಗೆ ಸೇರುತ್ತವೆ. ಇತರ ಪ್ರಮುಖವಾದ ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳು ಮುಸುಕಿನ ಜೋಳದ ರೋಗಕಾರಕ ಯುಸ್ಟಿಲಾಗೋ ಮೈಡಿಸ್ ,[೧೨೧] ಮಾಲಾಸ್ಸೆಜಿಯಾ ಜಾತಿಯ ಮಾನವ ರಕ್ಷಣಾ ಜಾತಿಗಳು,[೧೨೨] ಮತ್ತು ಅವಕಾಶ ಗ್ರಾಹಕ ಮಾನವ ರೋಗಕಾರಕ ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕೊಕಸ್ ನಿಯೋಫೊರ್ಮನ್ಸ್‌ ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.[೧೨೩]
ರೂಪವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಜೀವನ ಶೈಲಿಗಳಲ್ಲಿನ ಸಾದೃಶ್ಯತೆಗಳ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ, ಲೋಳೆ ಜೀವಿಗಳು (ಮೈಕ್ಸೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳು) ಮತ್ತು ನೀರು ಜೀವಿಗಳು (ಓಮಿಸೈಟ್‌ಗಳು) ಮೊದಲಿಗೆ ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದ್ದವು. ನಿಜವಾದ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಂತಲ್ಲದೇ ಈ ಜೀವಿಗಳ ಕೋಶ ಗೋಡೆಗಳು ಸೆಲ್ಯುಲೋಸ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಕೈಟಿನ್‌ನ ಕೊರತೆಯನ್ನು ಅನುಭವಿಸುತ್ತವೆ. ಲೋಳೆ ಜೀವಿಗಳು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಂತೆ ಏಕಪಾರ್ಶ್ವಕವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಅಮೀಬೊಜೊವಾದಲ್ಲಿ ಸಂಯೋಜಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿರುತ್ತವೆ. ನೀರು ಜೀವಿಗಳು ಜೋಡಿ ವರ್ಣತಂತುವಿನ ದ್ವಿಪಾರ್ಶ್ವಕಗಳಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಕ್ರೊಮಾಲ್ವೆಲೇಟ್ ಕಿಂಗ್‌ಡಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಗುಂಪುಗೂಡಲ್ಪಟ್ಟಿರುತ್ತವೆ. ನೀರು ಜೀವಿಗಳು ಅಥವಾ ಲೋಳೆ ಜೀವಿಗಳು ಯಾವೊಂದೂ ಕೂಡ ನಿಜವಾದ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಗೆ ಸನಿಹವಾಗಿ ಸಂಬಂಧಿತವಾಗಿಲ್ಲ, ಮತ್ತು, ಆದ್ದರಿಂದ, ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣಶಾಸ್ತ್ರಜ್ಞರು ಅವುಗಳನ್ನು ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಗೆ ಸೇರಿಸುವುದಿಲ್ಲ. ಓಮಿಸೈಟ್‌ಗಳ ಮತ್ತು ಮೈಕ್ಸೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಈಗಲೂ ಕೂಡ ಅನೇಕ ವೇಳೆ ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರ ಅಧ್ಯಯನ ಪುಸ್ತಕಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಸಂಶೋಧನಾ ಸಾಹಿತ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೧೨೪]
ನ್ಯೂಕ್ಲಿಅರಿಡ್‌ಗಳು, ಪ್ರಸ್ತುತದಲ್ಲಿ ಕೊನೊಜೋವಾದಲ್ಲಿ ಗುಂಪುಗೂಡಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಇದು ಯುಮೈಸೀಟ್ ಕ್ಲೇಡ್‌ನ ಒಂದು ಸಹೋದರಿ ಗುಂಪಾಗಿರಬಹುದು, ಮತ್ತು ಹಾಗಾಗಿ ವಿಸ್ತೃತವಾದ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಕಿಂಗ್‌ಡಮ್‌ನಲ್ಲಿ ಒಳಗೊಳ್ಳಲ್ಪಡಬಹುದು.[೧೨೫]
ಆದಾಗ್ಯೂ ಅನೇಕ ವೇಳೆ ಅಪ್ರಜ್ಞಾಪೂರ್ವಕವಾಗಿ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಭೂಮಿಯ ಮೇಲಿನ ಪ್ರತಿ ವಾತಾವರಣದಲ್ಲಿಯೂ ಸಂಭವಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚಿನ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ಅತಿ ಮುಖ್ಯವಾದ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾಗಳ ಜೊತೆಗೆ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಭೂಮಂಡಲದ (ಮತ್ತು ಕೆಲವು ನೀರಿನ) ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖವಾದ ವಿಭಜಕಗಳಾಗಿವೆ, ಮತ್ತು ಆದ್ದರಿಂದ ಜೈವಿಕ ಭೂರಾಸಾಯನಿಕ ಚಕ್ರಗಳಲ್ಲಿ[೧೨೬] ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ಆಹಾರ ವೆಬ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ನಿರ್ಣಯಾತ್ಮಕ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ವಿಭಜಕಗಳಾಗಿ ಅವುಗಳು ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಸೈಕ್ಲಿಂಗ್‌ನಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ, ಪ್ರಮುಖವಾಗಿ ಸಪ್ರೋಟ್ರೋಫ್‌ಗಳು ಮತ್ತು ಸಂಯುಕ್ತಜೀವಿಗಳು ಜೈವಿಕ ವಸ್ತುಗಳನ್ನು ಅಜೈವಿಕ ಅಣುಗಳಾಗಿ ವಿಭಜಿಸುತ್ತವೆ, ಅವು ನಂತರ ಸಸ್ಯಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಇತರ ಜೀವಿಗಳಲ್ಲಿ ಸಂವರ್ಧನ ಚಯಾಪಚಯ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮಾರ್ಗದಲ್ಲಿ ಪುನಃ-ಪ್ರವೇಶಪಡೆಯುತ್ತವೆ.[೧೨೭][೧೨೮]
ಹಲವಾರು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಿಂಗ್ಡಮ್ಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಆದರೆ ಎಲ್ಲಾ ಕಿಂಗ್ಡಮ್ಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಅಲ್ಲದ ಪ್ರಮುಖವಾದ ಸಂಯುಕ್ತಜೀವನದ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ.[೧೨೯][೧೩೦][೧೩೧] ಈ ಪರಸ್ಪರ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಸ್ವಭಾವದಲ್ಲಿ ಪರಸ್ಪರ ವಲಂಬಿತವಾಗಿರುತ್ತವೆ ಅಥವಾ ಪ್ರತಿವರ್ತಿಗಳಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಅಥವಾ ಸಹಜೀವಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ದೃಷ್ಟಾಂತದಲ್ಲಿ ಸಮೂಹಗಳಿಗೆ ಸ್ಪಷ್ಟ ಉಪಯೋಗಕರವಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ ಅಥವಾ ಅಪಾಯಕಾರಿಯಾಗಿರುವುದಿಲ್ಲ.[೧೩೨][೧೩೩][೧೩೪]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲ l ಸಸ್ಯಗಳ ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ನಡುವಣ ಸಂಯುಕ್ತಜೀವನವು ಹೆಚ್ಚು ಸರಿಯಾಗಿ ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟ ಸಸ್ಯ-ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಸಹಜೀವನವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಸಸ್ಯದ ಬೆಳವಣಿಗೆಯಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳ ನಿರಂತರತೆಯಲ್ಲಿ ಗಣನಿಯ ಮಹತ್ವವನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಂಡಿದೆ; ಎಲ್ಲಾ ಸಸ್ಯಗಳ ಜಾತಿಗಳ ೯೦% ಜಾತಿಗಳು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿವೆ ಮತ್ತು ಅವು ತಮ್ಮ ಉಳಿವಿಗೋಸ್ಕರ ಈ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಆಧರಿಸಿವೆ.[೧೩೫]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲ ಸಹಜೀವನವು ಕನಿಷ್ಠಪಕ್ಷ ೪೦೦ ಮಿಲಿಯನ್ ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದಿನ ತಾರೀಖಿನಷ್ಟು ಹಳೆಯದಾಗಿದೆ.[೧೧೬] ಇದು ಅನೇಕೆ ವೆಳೆ ಸಸ್ಯಗಳ ಅಜೈವಿಕ ಮಿಶ್ರಣಗಳ, ಅಂದರೆ ಈ ರೀತಿಯ ಮೂಲ ಸಸ್ಯ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಕಡಿಮೆ ಸಾಂದ್ರತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ಮಣ್ಣಿನಿಂದ ನೈಟ್ರೇಟ್ ಮತ್ತು ಫಾಸ್ಪೇಟ್ ಹೀರಿಕೆಯನ್ನು ಹೆಚ್ಚಿಸುತ್ತದೆ.[೧೨೭][೧೩೬] ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಸಹವರ್ತಿಗಳು ಕಾರ್ಬೋಹೈಡ್ರೇಟ್‌ಗಳ ಮತ್ತು ಇತರ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಸಸ್ಯದಿಂದ-ಸಸ್ಯಕ್ಕೆ ವರ್ಗಾವಣೆಯಲ್ಲಿಯೂ ಕೂಡ ಮಧ್ಯವರ್ತಿಗಳಾಗಿ ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಅಂತಹ ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲ ಸಮುದಾಯಗಳು "ಸಾಮಾನ್ಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲ ಸಂಪರ್ಕಜಾಲಗಳು" ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೧೩೭] ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲದ ಒಂದು ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ದೃಷ್ಟಾಂತವೆಂದರೆ ಮೈಕೋ-ಹೆಟೆರೋಟ್ರೋಫಿ, ಅಂದರೆ ಸಸ್ಯವು ತನ್ನ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಸಹವರ್ತಿಯ ಮೂಲಕ ಅದರ ಎಲ್ಲ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವ ಮೂಲಕ ಸಸ್ಯವು ಶಿಲೀಂಧ್ರವನ್ನು ಪರಾವಲಂಬನವಾಗಿಸುತ್ತದೆ.[೧೩೮] ಕೆಲವು ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಜಾತಿಗಳು ಬೇರುಗಳು, ಕಾಂಡಗಳು, ಮತ್ತು ಎಲೆಗಳ ಒಳಗೆ ಅಂಗಾಂಶಗಳನ್ನು ಇರಿಸಿಕೊಂಡಿರುತ್ತವೆ, ಅಂತಹ ದೃಷ್ಟಾಂತಗಳಲ್ಲಿ ಅವೆಲ್ಲವೂ ಅಂತಸ್ಸಸ್ಯಗಳು (ಎಂಡೋಫೈಟ್‌ಗಳು) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೧೩೯] ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲಕ್ಕೆ ಸಾದೃಶ್ಯವಾಗಿ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಮೂಲಕ ಅಂತಸ್ಸಸ್ಯ ಕೊಲೊನೈಸೇಷನ್ ಇದು ಎರಡೂ ಸಹಜೀವಿಗಳಿಗೆ ಉಪಯೋಗಕರವಾಗಿರುತ್ತದೆ; ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಹುಲ್ಲುಗಳ ಅಂತಸ್ಸಸ್ಯಗಳು ಸಸ್ಯಾಹಾರಿಗಳಿಗೆ ಮತ್ತು ಇತರ ವಾತಾವರಣದ ಒತ್ತಡಗಳಿಗೆ ಅವುಗಳ ಸಮೂಹ ವರ್ಧಿತ ಪ್ರತಿರೋಧಕತೆಯನ್ನು ಹಂಚುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಅದಕ್ಕೆ ಬದಲಾಗಿ ಸಸ್ಯದಿಂದ ಆಹಾರ ಮತ್ತು ವಸತಿಯನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.[೧೪೦]
ಕಲ್ಲುಹೂವುಗಳು (ಲೈಕನ್) ಆಲ್ಗೆ ಅಥವಾ ಸೈನೋಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ (ಕಲ್ಲುಹೂವುಗಳ ಪರಿಭಾಷೆಯಲ್ಲಿ "ಫೋಟೋಬಿಯೊಂಟ್ಸ್" ಎಂದು ಉಲ್ಲೇಖಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿದೆ) ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ (ಹೆಚ್ಚು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಆಸ್ಕೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳ ಹೆಚ್ಚಿನ ಜಾತಿಗಳು ಮತ್ತು ಬೇಸಿಡಿಯೋಮೈಸೀಟ್‌ಗಳ ಕೆಲವು ಜಾತಿಗಳು) ನಡುವಣ ಸಂಯುಕ್ತಜೀವಿಗಳ ಸಂಬಂಧದ ಮೂಲಕ ನಿರ್ಮಾಣವಾಗಲ್ಪಡುತ್ತವೆ, ಅದರಲ್ಲಿಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಂದ ನಿರ್ಮಾಣವಾಗಲ್ಪಟ್ಟ ಒಂದು ಅಂಗಾಶದಲ್ಲಿ ಸ್ವತಂತ್ರ ಫೋಟೋಬಿಯಂಟ್ ಕೋಶಗಳು ಸಂಯೋಜನಗೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತವೆ.[೧೪೧] ಕಲ್ಲುಹೂವುಗಳು ಎಲ್ಲಾ ಭೂಪ್ರದೇಶಗಳಲ್ಲಿಯೂ ಪ್ರತಿ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಲ್ಲಿಯೂ ಸಂಭವಿಸುತ್ತದೆ, ಇದು ಮಣ್ಣಿನ ನಿರ್ಮಾಣದಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ಶ್ರೇಣಿಯಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ,[೧೪೨] ಮತ್ತು ಧ್ರುವ ಪ್ರದೇಶ, ಉನ್ನತ ಪರ್ವತ ಪ್ರದೇಶ, ಮತ್ತು ಸ್ವಲ್ಪ ಮಳೆ ಬೀಳುವ ಮರುಭೂಮಿ ಪ್ರದೇಶಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ತೀವ್ರವಾದ ವಾತಾವರಣಗಳಲ್ಲಿನ ಪ್ರಬಲವಾದ ಜೀವಿಗಳ ವಿಧಗಳಾಗಿವೆ.[೧೪೩] ಅವುಗಳು ಬರಿಯ ಮಣ್ಣು, ಕಲ್ಲುಗಳು, ಮರದ ತೊಗಟೆ, ಹಲಗೆ, ಶೀತವಲಯದ ವರಟೆ ಮತ್ತು ಎಲೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಆಶ್ರಯ ನೀಡಲಾಗದ ಮೇಲ್ಮೈಗಳಲ್ಲಿ ಬೆಳೆಯುವುದಕ್ಕೆ ಸಮರ್ಥವಾಗಿರುತ್ತವೆ.[೧೪೪] ಶಿಲೀಂಧ್ರಮೂಲಗಳಲ್ಲಿರುವಂತೆ, ಫೋಟೋಬಿಯಂಟ್‌ಗಳು ದ್ಯುತಿಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮೂಲಕ ಸಕ್ಕರೆಯನ್ನು ಮತ್ತು ಇತರ ಕಾರ್ಬೋಹೈಡ್ರೇಟ್‌ಗಳನ್ನು (ಶರ್ಕರ ಪದಾರ್ಥ) ನೀಡುತ್ತವೆ, ಹಾಗೆಯೇ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಲವಣಗಳು ಮತ್ತು ನೀರನ್ನು ದೊರಕುವಂತೆ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಎರಡೂ ಸಂಯುಕ್ತ ಜೀವಿಗಳ ಕ್ರಿಯೆಗಳು ಎಷ್ಟು ಸಮರ್ಪಕವಾಗಿ ಸಂಯೋಜನಗೊಳ್ಳಲ್ಪಟ್ಟಿವೆಯೆಂದರೆ ಅವು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಒಂದೇ ಏಕೈಕ ಜೀವಿಯಂತೆ ಕಾರ್ಯ ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ; ಹೆಚ್ಚಿನ ದೃಷ್ಟಾಂತಗಳಲ್ಲಿ ಫಲಿತಾಂಶವಾಗಿ ಕಂಡುಬರುವ ಜೀವಿಯು ವೈಯುಕ್ತಿಕ ಅಂಶಗಳಿಂದ ಬಹಳವಾಗಿ ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಲೈಕೆನೈಸೇಷನ್ (ಕಲ್ಲು ಹೂವು ಮಾಡುವ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆ) ಇದು ಪೋಷಣೆಯ ಒಂದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾದ ವಿಧಾನವಾಗಿದೆ; ೧೭,೫೦೦ ಮತ್ತು ೨೦,೦೦೦ ನಡುವೆ ವರ್ಣಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು ೨೦% ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಕಲ್ಲುಹೂವುಗಳಾಗಿ ಪರಿವರ್ತಿತವಾಗಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ.[೧೪೫] ಹೆಚ್ಚಿನ ಕಲ್ಲುಹೂವುಗಳಿಗೆ ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿರುವ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು ಈ ಕೆಳಗಿನವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ - ದ್ಯುತಿಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಕ್ರಿಯೆಯ ಮೂಲಕ ಜೈವಿಕ ಇಂಗಾಲವನ್ನು ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳುವುದು, ನಿಧಾನ ಬೆಳವಣಿಗೆ, ಸಣ್ಣ ಗಾತ್ರ, ದೀರ್ಘ ಜೀವಿತಾವಧಿ, ದೀರ್ಘ-ಕಾಲದವರೆಗೆ ಇರುವ (ಋತುಕಾಲಿಕ) ಸಸ್ಯೀಯ ಪುನರುತ್ಪಾದನಾ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು, ಲವಣಗಳ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಗಾಳಿಯಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗಲ್ಪಟ್ಟ ಮೂಲಗಳಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಅದೇ ರೀತಿಯ ಆವಾಸಸ್ಥನದಲ್ಲಿರುವ ಇತರ ದ್ಯುತಿಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಕ್ರಿಯೆ ನಡೆಸುವ ಜೀವಿಗಳಿಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚಿನ ಮಟ್ಟದ ನಿರ್ಜಲೀಕರಣದ ಪ್ರತಿರೋಧತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ.[೧೪೬]
ಹಲವಾರು ಕೀಟಗಳು ಕೂಡ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಪರಸ್ಪರ ಅವಲಂಬನಾವಾದಿಯಾದ ಸಂಬಂಧವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ. ಇರುವೆಗಳ ಹಲವಾರು ಗುಂಪುಗಳು ಏಗರಿಕೆಲಿಸ್‌ನ ಅನುಕ್ರಮದಲ್ಲಿ ತಮ್ಮ ಆಹಾರದ ಪ್ರಾಥಮಿಕ ಮೂಲವಾಗಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳನ್ನು ವಿಕಾಸಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ, ಹಾಗೆಯೇ ಆಂಬ್ರೋಸಿಯಾ ಬೀಟೆಲ್‌ಗಳು ಮರಗಳ ತೊಗಟೆಗಳಲ್ಲಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಹಲವಾರು ಜಾತಿಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳನ್ನು ಆ ಕೀಟಗಳು ಆವರಿಸಿಕೊಂಡಿರುತ್ತವೆ.[೧೪೭] ಅದೇ ರೀತಿಯಾಗಿ, ಹಲವಾರು ಮರ ಕಣಜ ಜಾತಿಯ ಹೆಣ್ಣು ಹುಳುಗಳು (ಸೈರೆಕ್ಸ್ ಜಾತಿ) ವುಡ್-ರೋಟಿಂಗ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಾದ ಅಮಿಲೋಸ್ಟೆರಿಯಮ್ ಅರೆಲ್ಯಾಟಮ್‌ ಗಳ ಬೀಜಕಗಳ ಜೊತೆಗೆ ಪೈನ್ ಮರಗಳ ಬಿಳಿಪಟ್ಟೆಗಳ ಒಳಗೆ ತಮ್ಮ ಮೊಟ್ಟೆಗಳನ್ನು ಸೇರಿಸುತ್ತವೆ; ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯು ಕಣಜಗಳ ಸಮೂಹಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಗೆ ಸಮನಾದ ಪೋಷಕಾಂಶಗಳ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳನ್ನು ಒದಗಿಸುತ್ತವೆ.[೧೪೮] ಆಫ್ರಿಕಾದ ಸವನ್ನಾ ಹುಲ್ಲುಗಾವಲಿನಲ್ಲಿರುವ ಗೆದ್ದಲುಗಳು ಕೂಡ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಗೆ ಮತ್ತು ಕ್ಯಾಂಡಿಡಾ ಜಾತಿಯ ಯೀಸ್ಟ್‌ಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಗೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ,[೧೪೯] ಮತ್ತು ಲಾಕೆನ್ಸಿ ಯು ನ್ಯೂರಾಪ್ಟರಾಗಳು, ಬೀಟೆಲ್‌ಗಳು, ಮತ್ತು ಜಿರಳೆಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ವಿಸ್ತೃತ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯ ಕೀಟಗಳ ಅಂತರ್ಭಾಗಗಳ ಆವಾಸಸ್ಥಾನವಾಗಿದೆ; ಆದರೆ ಈ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಅವುಗಳ ಸಮೂಹಕ್ಕೆ ಉಪಯೋಗಕರವಾಗಿವೆಯೇ ಅಥವಾ ಇಲ್ಲವೇ ಎಂಬುದು ತಿಳಿದು ಬಂದಿಲ್ಲ.[೧೫೦]
ಹಲವಾರು ಸಸ್ಯಗಳು, ಪ್ರಾಣಿಗಳು (ಮಾನವರನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ), ಮತ್ತು ಇತರ ಶಿಲಿಂಧ್ರಗಳ ಮೇಲೆ ಅವಲಂಬಿತವಾಗಿರುವ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಹಲವಾರು ಬೇಸಾಯ ಮಾಡಲ್ಪಟ್ಟ ಸಸ್ಯಗಳ ಅಪಾಯಕಾರಿಯಾದ ರೋಗಕಾರಕಗಳು ಕೃಷಿಗೆ ಮತ್ತು ಅರಣ್ಯಪ್ರದೇಶಗಳಿಗೆ ತೀವ್ರವಾದ ಹಾನಿ ಮತ್ತು ನಷ್ಟಗಳನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ, ಇವುಗಳು ರೈಸ್ ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಮ್ಯಾಗ್ನಪೋರ್ತ್ ಒರೈಜ್ ,[೧೫೧] ಒಫಿಸ್ತೋಮಾ ಉಲ್ಮಿ ಮತ್ತು ಒಫಿಸ್ತೋಮಾ ನೊವೊ-ಉಲ್ಮಿ ಗಳಂತಹ ಮರಗಳ ರೋಗಕಾರಕಗಳು ಡಚ್ ಎಲ್ಮ್ ರೋಗ,[೧೫೨] ಮತ್ತು ಕ್ರೈಫೋನೆಕ್ಟೀರಿಯಾ ಪ್ಯಾರಸಿಟಿಕಾ ಗಳನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ, ಇವು ಚೆಸ್ಟ್‌ನಟ್ ಮರದ ರೋಗಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗುತ್ತವೆ,[೧೫೩] ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳ ರೋಗಕಾರಕಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಫುಸಾರಿಯಮ್ , ಉಸ್ಟಿಲಾಗೊ , ಆಲ್ಟರ್ನಾರಿಯಾ , ಮತ್ತು ಕೊಕ್ಲಿಯೋಬೊಲಸ್ ಮುಂತಾದವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.[೧೩೩] ಪೈಸಿಲೋಮೈಸಿಸ್ ಲಿಲಾಸಿನಸ್‌ ಗಳಂತಹ ಕೆಲವು ಮಾಂಸಾಹಾರಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ನೆಮಟೋಡ್ ಜಾತಿಗಳ ಪರಭಕ್ಷಕಗಳಾಗಿವೆ, ಅವು ಬಂಧಿಸುವ ವಲಯಗಳು ಅಥವಾ ಅಂಟಿಕೊಳ್ಳುವ ಜಾಲಗಳಂತಹ ವಿಶಿಷ್ಟವಾದ ವಿನ್ಯಾಸಗಳ ಒಂದು ವ್ಯೂಹವನ್ನು ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಆಹಾರವನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳುತ್ತವೆ.[೧೫೪]
ಕೆಲವು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಮಾನವರಲ್ಲಿ ಅಪಾಯಕಾರಿ ರೋಗಗಳನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ರೋಗಗಳು ಚಿಕಿತ್ಸೆಯನ್ನು ಪಡೆದುಕೊಳ್ಳದೇ ಹೋದ ಪಕ್ಷದಲ್ಲಿ ಮಾರಣಾಂತಿಕವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಈ ರೋಗಗಳು ಆಸ್ಪೆರ್ಜಿಲ್ಲೋಸಸ್ (ತೀವ್ರವಾದ ಉಸಿರಾಟದ ರೋಗ), ಕ್ಯಾಂಡಿಡೋಸಸ್, ಕೊಸಿಡಿಯೋಡೋಮೈಕೋಸಿಸ್, ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕೋಕೊಸಿಸ್, ಹಿಸ್ಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮೋಸಿಸ್, ಮೈಸಿಟೊಮಾಗಳು, ಮತ್ತು ಪ್ಯಾರಾಕೊಕಿಡಿಯೋಡೊಮೈಕೋಸಿಸ್ ಮುಂತಾದವುಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಅದಕ್ಕೂ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ, ಇಮ್ಯುನೋ-ಡೆಫಿಷಿಯನ್ಸಿಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ ವ್ಯಕ್ತಿಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಈ ರೋಗಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತಾರೆ ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ, ಆ ರೋಗಗಳೆಂದರೆ ಆಸ್ಪೆರ್ಜಿಲಸ್ , ಕ್ಯಾಂಡಿಡಾ , ಕ್ರಿಪ್ಟೋಕೊಕಸ್ ,[೧೩೪][೧೫೫][೧೫೬] ಹಿಸ್ಟೋಪ್ಲಾಸ್ಮಾ ,[೧೫೭] ಮತ್ತು ನ್ಯುಮೋಸಿಸ್ಟಿಸ್ ಇತ್ಯಾದಿ.[೧೫೭] ಇತರ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು, ಡೆರ್ಮಾಟೋಫಿಟಿಕ್ ಮತ್ತು ಕೆರಾಟಿನೋಫಿಲಿಕ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಕಣ್ಣುಗಳು, ಉಗುರುಗಳು, ಕೂದಲು, ಮತ್ತು ಪ್ರಮುಖವಾಗಿ ಚರ್ಮಕ್ಕೆ ಹಾನಿಯನ್ನುಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಗಜಕರ್ಣ ಮತ್ತು ಅತ್ಲೆಟ್ಸ್ ಫೂಟ್‌ಗಳಂತಹ ಸ್ಥಳೀಯ ಸೋಂಕುಗಳನ್ನು ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ.[೧೫೮] ಶಿಲೀಂಧ್ರದ ಬೀಜಕಗಳೂ ಕೂಡ ಅಲರ್ಜಿಗಳಿಗೆ ಒಂದು ಕಾರಣವಾಗಿರುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಭಿನ್ನವಾದ ವರ್ಗೀಕರಣದ ಗುಂಪುಗಳ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಅಲರ್ಜಿಯ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯೆಗಳಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು.[೧೫೯]
ಆಹಾರದ ತಯಾರಿಕೆ ಅಥವಾ ಸಂರಕ್ಷಣೆ ಹಾಗೂ ಇತರ ಬಳಕೆಗಳಿಗೆ ಮಾನವನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಬಳಕೆಯು ವಿಶಿಷ್ಟವಾಗಿದೆ ಹಾಗೂ ದೀರ್ಘ ಇತಿಹಾಸ ಹೊಂದಿದೆ. ಅಣಬೆ ವ್ಯವಸಾಯ ಹಾಗೂ ಅಣಬೆ ಸಂಗ್ರಹಣೆ ಹಲವು ದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ದೊಡ್ಡ ಉದ್ಯಮಗಳಾಗಿವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಐತಿಹಾಸಿಕ ಬಳಕೆಗಳ ಹಾಗೂ ಸಾಮಾಜಿಕ ಪ್ರಭಾವದ ಅಧ್ಯಯನವು ಇಥ್ನೊಮೈಕೊಲೊಜಿ ಎಂದು ಪ್ರಚಲಿತವಾಗಿದೆ. ಸೂಕ್ಷ್ಮಜೀವಿಯಿಲ್ಲದ ಅಥವಾ ಇತರ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ಚಟುವಟಿಕೆಗಳೊಂದಿಗೆ ಅಪಾರ ಶ್ರೇಣಿಯ ನೈಜ್ಯ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿಸುವ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಈ ಗುಂಪಿಗೆ ಇರುವ ಕಾರಣ, ಇದರ ಹಲವು ತಳಿಗಳನ್ನು ದೀರ್ಘ ಕಾಲದಿಂದ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ ಅಥವಾ ಪ್ರತಿಜೀವಾಣುಗಳ, ವಿಟೆಮಿನ್‌ಗಳ, ಹಾಗೂ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್-ವಿರೋಧಕ ಉದ್ಯಮಗಳ ಹಾಗೂ ಕೊಬ್ಬು-ಕಡಿಮೆಗೊಳಿಸುವ ಔಷಧಿಗಳ ಉತ್ಪತ್ತಿಗೆ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಗೊಳಿಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ. ಅತಿ ಇತ್ತೀಚೆಗೆ, ಶಿಲೀಂಧ್ರದ ತಳಿಗಳ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್‌ನ ಪದ್ಧತಿಗಳನ್ನು ಅಭಿವೃದ್ಧಿಗೊಳಿಸಲಾಗಿದೆ,[೧೬೦] ಇದು ಶಿಲೀಂಧ್ರ ತಳಿಗಳ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯ ಎಂಜಿನಿಯರಿಂಗ್ ಸಾಧ್ಯವಾಗಿಸುತ್ತದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಹುದುಗು ತಳಿಗಳ ತಳಿ ಪರಿವರ್ತನೆ[೧೬೧] - ದೊಡ್ಡ ಹುದುಗೆಬ್ಬಿಸುವ ಪಾತ್ರೆಗಳಲ್ಲಿ ಇವುಗಳನ್ನು ವೇಗದ ಗತಿಯಲ್ಲಿ ವೃದ್ಧಿಸುವುದು ಸುಲಭ - ಇದರಿಂದ ಔಷಧಿ ಉತ್ಪಾದನೆಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚು ದಾರಿಗಳು ತೆರೆದಿವೆ ಹಾಗೂ ಈ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆ ಸಮರ್ಥವಾಗಿ ಜೀವಿಗಳಿಂದ ಮಾಡಲಾದ ಮೂಲ ಉತ್ಪಾದನೆಗಿಂತ ಹೆಚ್ಚು ದಕ್ಷ.[೧೬೨]
ಔಷಧ ಶಾಸ್ತ್ರದ ಸಕ್ರಿಯ ಔಷಧಿಗಳ ಪ್ರಮುಖ ಮೂಲಗಳಾದ ಮೆಟಾಬಲಿಸಮ್ ಕ್ರಿಯೆಯ ಉತ್ಪನ್ನಗಳು ಹಲವು ತಳಿಗಳಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುತ್ತದೆ. ನಿರ್ಧಿಷ್ಟವಾಗಿ ಪ್ರತಿಜೀವಾಣುಗಳು ಪ್ರಮುಖ, ಚಿಕ್ಕ ಪೆಪ್ಟೈಡ್ಸ್‌ಗಳಿಂದ ಸಂಯೋಜಿತಗೊಂಡ β-ಲ್ಯಾಕ್ಟಂ ಪ್ರತಿಜೀವಾಣುಗಳ ಗುಂಪಿಗೆ ಸ್ವರೂಪದಲ್ಲಿ ಸಂಬಂಧಿತ ಪೆನಿಸಿಲಿನ್ ಅನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿದೆ.
ಪೆನ್ಸಿಲಿನ್ G ಯಂತಹ (ಪೆನ್ಸಿಲಿಯಂ ಕ್ರೈಸೊಜಿನಂ ಯಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾದ) ನೈಸರ್ಗಿಕವಾಗಿ ದೊರಕುವ ಪೆನ್ಸಿಲಿನ್ಸ್‌ಗೆ ತುಲನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಕಿರಿದಾದ ವೈವಿಧ್ಯದ ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ಚಟುವಟಿಕೆ ಇದ್ದರೂ ಸಹ, ವಿಶಾಲ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯ ಇತರ ಪೆನ್ಸಿಲಿನ್‌ಗಳನ್ನು ಕೂಡ ನೈಜ್ಯ ಪೆನ್ಸಿಲಿನ್‌ಗಳ ರಾಸಾಯನಿಕ ಪರಿವರ್ತನೆಯಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಸಬಹುದು. ಆಧುನಿಕ ಪೆನ್ಸಿಲಿನ್‌ಗಳು ಭಾಗಷಃ ಸಂಯೋಜಿತ ಸಂಯುಕ್ತಗಳು, ಇವುಗಳನ್ನು ಆರಂಭದಲ್ಲಿ ಹುದುಗೆಬ್ಬಿಸುವ ಸಂಸ್ಕೃತಿಯಿಂದ ಪಡೆಯಬಹುದು, ಆದರೆ ಕೆಲವು ನಿರ್ಧಿಷ್ಟ ಇಚ್ಛಿತ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳಿಗಾಗಿ ಸ್ವರೂಪದಲ್ಲಿ ಮಾರ್ಪಡಿಸಲಾಗಿರುತ್ತದೆ.[೧೬೩] ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿಯಾಗುವ ಇತರ ಪ್ರತಿಜೀವಾಣುಗಳು: ಸಿಕ್ಲೊಸ್ಪೊರಿನ್, ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಶರೀರದ ಭಾಗವನ್ನು ಒಬ್ಬರಿಂದ ಇನ್ನೊಬ್ಬರಿಗೆ ವರ್ಗಾಯಿಸುವ ಶಸ್ತ್ರಚಿಕಿತ್ಸೆಯ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಪ್ರತಿರಕ್ಷಿತ ನಿರೋಧಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ; ಹಾಗೂ ಫುಸಿಡಿಕ್ ಆಮ್ಲಜನಕ, ಮೆಥಿಸಿಲಿನ್‌ಯಿಂದ ಸೊಂಕನ್ನು ತಡೆಯಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ - ಪ್ರತಿರೋಧಕ ಸ್ಟ್ಯಾಫೈಲೊಕೊಕಸ್ ಒರಿಯಸ್ ಸೂಕ್ಷ್ಮಕ್ರಿಮಿ.[೧೬೪] ಈ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳನ್ನು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾದಿಂದ ಬರುವ ರೋಗಗಳ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗೆ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಟುಬರ್ಕುಲೊಸಿಸ್, ಸಿಫಿಲಿಸ್, ಲೆಪ್ರೊಸಿ,ಮತ್ತು ಇತರೆ ಕೆಲವು ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳನ್ನು ಇಪ್ಪತ್ತನೇಯ ಶತಮಾನದ ಆರಂಭಲ್ಲಿ ಬಳಸಲು ಶುರುವಾಯಿತು, ಮತ್ತು ಪ್ರತಿ-ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಲ್ ಕಿಮೋಥೆರಫಿಯಲ್ಲಿ ಇಂದಿಗೂ ಪ್ರಮುಖವಾದ ಭಾಗವಾಗಿದೆ. ಶೀಲಿಂಧ್ರ ಅಥವಾ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯ ಗುಂಪುಗಳ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳು ನಿಸರ್ಗದಲ್ಲಿ ಪ್ರಮುಖವಾಗಿ ಎರಡು ರೀತಿಯಲ್ಲಿ ಕಾಣಿಸಿಕೊಳ್ಳುತ್ತದೆ: ಜೀವಿಗಳು ಹೆಚ್ಚಿರುವ ವಾತಾವರಣದಲ್ಲಿ ಇತರೆ ಸೂಕ್ಷ್ಮಾಣು ಜೀವಿಗಳ ಜೊತೆಯ ಸ್ಪರ್ಧೆಯ ವಿರುದ್ಧ ರಾಸಾಯನಿಕ ರಕ್ಷಕವಾಗಿ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುತ್ತವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ರೈಜಿಸ್ಪಿಯರ್, ಮತ್ತು ಕಡಿಮೆ ಸಂಖ್ಯೆಯಲ್ಲಿದ್ದಾಗ ಜೀವಿಗಳ ನಡುವಿನ -ಅಥವಾ ಒಳಗಡೆಯ ಸಂಕೇತಕ್ಕೆ ಕೊರಮ್ ಸಂವೇದಕ ಅಣುವಾಗಿ ಪ್ರತಿಕ್ರಿಯಿಸುತ್ತವೆ.[೧೬೫]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಂದ ಇತರೆ ಔಷಧಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಪಿನಿಸಿಲಿಯಂ ಗ್ರಿಸಿಯೊಫೌಲ್ವನ್‌ ನಿಂದ ಗ್ರಿಸಿಯೊಫೌಲ್ವಿನ್ ಪ್ರತ್ಯೇಕಿಸುವಿಕೆ ಕೂಡ ಒಳಗೊಂಡಿದೆ, ಇದನ್ನು ಶೀಲಿಂಧ್ರ ಸೋಂಕಿಗೆ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ,[೧೬೬] ಮತ್ತು ಸ್ಯಾಟಿನ್ಸ್ (ಎಚ್‌ಎಂಜಿ-ಕೊಎ ರೆಡುಕ್ಟೇಸ್ ಪ್ರತಿರೋಧಕಗಳು), ಕೊಲೆಸ್ಟ್ರಾಲ್ ಸಂಶ್ಲೇಷಣೆ ಪ್ರತಿರೋಧಕ್ಕೆ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಶೀಲಿಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿರುವ ಸ್ಟ್ಯಾಟಿನ್‌ಗಳ ಉದಾಹರಣೆಗಳು; ಪೆನಿಸಿಲಿಯಂ ಸಿಟ್ರಿನಮ್‌ ನಿಂದ ಮೆವಾಸ್ಟ್ಯಾಟಿನ್ ಮತ್ತು ಆ‍ಯ್‌ಸ್ಪೆರ್ಜಿಲ್ಲಸ್ ಟರೆಯಸ್‌ ನಿಂದ ಲೊವಾಸ್ಟ್ಯಾಟಿನ್ ಮತ್ತು ಒಯ್ಸ್ಟರ್ ಮಶ್ರೂಮ್.[೧೬೭]
ಬೇಕರ್ಸ್ ಯೀಸ್ಟ್ ಅಥವಾ ಸಚರೊಮೈಸಸ್ ಸೆರೆವಿಜಿಐ , ಒಂದು ಏಕ-ಕೋಶಿಯ ಶೀಲಿಂಧ್ರ, ಇದನ್ನು ಬ್ರೆಡ್ ಮತ್ತು ಇತರ ಗೋಧಿ ಆಧಾರಿತ ಉತ್ಪನ್ನಗಳಾದ ಪಿಜ್ಜಾ ಡೌ ಮತ್ತು ಕಣಕದ ಖ್ಯಾದಗಳನ್ನು ತಯಾರಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.[೧೬೮] ಯೀಸ್ಟ್ ಗುಂಪಿನ ಸ್ಯಾಚರೋಮೈಸಸ್‌ ಗಳನ್ನು ಹುದುಗುಬರಿಸುವ ಮೂಲಕ ಮದ್ಯಸಾರ ಪಾನೀಯಗಳನ್ನು ತಯಾರಿಸಲು ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.[೧೬೯] ಶೋಯು (ಸೋಯಾ ಸಾಸ್) ಮತ್ತು ಜಪಾನರ ಅಕ್ಕಿ ಮದ್ಯ (ಸೇಕ್) ಹುಳಿಬರಿಸಲು ಮತ್ತು ಮಿಸೊ[೧೭೦] ತಯಾರಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಶೋಯು ಕೋಜಿ ಬೂಸ್ಟ್ (ಆ‍ಯ್‌ಸ್ಪೆರ್ಜಿಲಸ್ ಆರಿಜೆಇ ) ಒಂದು ಪ್ರಮುಖ ಪದಾರ್ಥ, ರೈಸೊಫಸ್ ಜೀವಿಗಳನ್ನು ಟೆಂಪೆಚ್ ತಯಾರಿಸುವಾಗ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.[೧೭೧] ಈ ಶೀಲಿಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಮನೆಯಲ್ಲಿಯೇ ಬೆಳೆಸುವ ಜೀವಿಗಳು, ಇವುಗಳು ಯಾವುದೇ ತರಹದ ಹಾನಿಕಾರಕ ಮೈಕೊಟಾಕ್ಸಿನ್ಸ್ (ಕೆಳಗೆ ನೋಡಿ) ಉತ್ಪಾದಿಸದೇ ಆಹಾರವನ್ನು ಹುದುಗು ಬರಿಸುವ ಅವುಗಳ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಕ್ಕೆ ತಕ್ಕಂತೆ ಆಯ್ಕೆ ಮಾಡಿ ಬೆಳೆಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಇವು ಆಸ್ಪರ್‌ಗಿಲ್ಲಿಯ ಅತ್ಯಂತ ಸಮೀಪದ ವರ್ಗದಿಂದ ಬೆಳೆಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಕ್ವೊರ್ನ್, ಮಾಂಸಕ್ಕೆ ಪರ್ಯಾಯವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಇದನ್ನು, ಫಸೆರಿಯಂ ವೆನೆನತಮಂ ನಿಂದ ತಯಾರಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ.[೧೭೨]
ಕೆಲವೊಂದು ಅಣಬೆಗಳನ್ನು ನಾಟಿ ಔಷಧದ ಚಿಕಿತ್ಸೆಯಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಚೈನಾ ಔಷಧದಲ್ಲಿ. ಪ್ರಾಚೀನ ಕಾಲದಲ್ಲಿ ಅಗಾರಿಕಸ್ ಬ್ಲಾಜೆಯ್ ,[೧೭೩][೧೭೪] ಗ್ಯಾನೊಡರ್ಮಾ ಲುಸಿಡಂ ,[೧೭೫] ಮತ್ತು ಕಾರ್ದಿಸೆಪ್ಸ್ ಸಿನೆನ್ಸಿಸ್ ಎಂಬ ಅಣಬೆಗಳನ್ನು ಔಷಧಕ್ಕಾಗಿ ಬಳಸಿದ್ದರು.[೧೭೬] ಇಂತಹ ಕೆಲವು ಶೀಲಿಂಧ್ರಗಳು ಮತ್ತು ಇತರೆ ಕೆಲವು ಶೀಲಿಂಧ್ರಗಳು ಸಂಯುಕ್ತಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿಮಾಡಿ ವೈರಸ್[೧೭೭][೧೭೮] ಮತ್ತು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಕೋಶಗಳ ವಿರುದ್ಧ ಜೈವಿಕ ಪ್ರತಿಬಂಧಕಗಳಾಗಿ ಪರಿಣಾಮ ಉಂಟುಮಾಡುತ್ತವೆ ಎಂದು ಸಂಶೋಧನೆಗಳು ಕಂಡುಹಿಡಿದಿವೆ.[೧೭೩][೧೭೯] ಪಾಲಿಸೆಚರೈಡ್-ಕೆ,ಎರ್ಗೊಟಾಮೈನ್,ಮತ್ತು ಬೀಟಾ-ಲ್ಯಾಕ್ಟಮ್ ಪ್ರತಿಜೀವಕಗಳಂತಹ ನಿರ್ದಿಷ್ಟವಾದ ಚಯಾಪಚಯ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಚಿಕಿತ್ಸಕ ಔಷಧದಲ್ಲಿ ನಿರಂತರವಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ. ಶೀಟಾಕೆ ಅಣಬೆಯು ಲೆಂಟಿನನ್‌ನ ಮೂಲವಾಗಿದೆ, ಇದನ್ನು ಜಪಾನ್ ಒಳಗೊಂಡತೆ ಹಲವಾರು ದೇಶಗಳಲ್ಲಿ ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗಾಗಿ, ಚಿಕಿತ್ಸಕ ಔಷಧವಾಗಿ ಬಳಸಲು ಅನುಮತಿಸಿವೆ.[೧೮೦][೧೮೧] ಜಪಾನ್ ಮತ್ತು ಯೂರೋಪಿನಲ್ಲಿ,ಪಾಲಿಸೆಚರೈಡ್-ಕೆ (ಬ್ರ್ಯಾಂಡ್ ನೇಮ್ ಕ್ರೆಸ್ಟಿನ್), ಟ್ರಾಮೆಟ್ಸ್ ವೆಸಿಕಲರ್‌ ದಿಂದ ರಾಸಾಯನಿಕವನ್ನು ಪಡೆಯಲಾಗುತ್ತದೆ,ಇದನ್ನು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಚಿಕಿತ್ಸೆಗೆ ನೆರವಾಗಲು ಅನುಮತಿಸಲಾಗಿದೆ.
ತಿನ್ನಲು ಯೋಗ್ಯವಾದ ಅಣಬೆಯನ್ನು ಶಿಲೀಂದ್ರಗಳಿಗೆ ಉತ್ತಮ ಉದಾಹರಣೆಯಾಗಿ ಹೇಳಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹಲವಾರು ವರ್ಗಗಳನ್ನು ವಾಣಿಜ್ಯಿಕವಾಗಿ ಬೆಳೆಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ ಇನ್ನುಳಿದವನ್ನು ಕಾಡು ಉತ್ಪನ್ನವಾಗಿ ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಅಗ್ಯಾರಿಕಸ್ ಬಿಸ್ಪೋರಸ್‌ , ಮೊಗ್ಗಿನಣಬೆ ಎಂದು ಮಾರಾಟ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದನ್ನು ಇನ್ನೂ ಸಣ್ಣದಿರುವಾಗಲೇ ಅಥವಾ ದೊಡ್ಡದಾಗಿ ಬೆಳೆದ ನಂತರ ಮಾರಾಟ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇದು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ತಿನ್ನಲು ಬಳಸುವ ಅಣಬೆಯ ವರ್ಗವಾಗಿದೆ. ಇದನ್ನು ಸಾಲಡ್‌, ಸೂಪ್ ಮತ್ತು ಇನ್ನೂ ಅನೇಕ ತಿನಿಸುಗಳ ತಯಾರಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹಲವಾರು ಏಷಿಯನ್ ಶಿಲೀಂದ್ರಗಳು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಜನಪ್ರಿಯತೆಯನ್ನು ಹೊಂದಿದ್ದು ಪಶ್ಚಿಮದಲ್ಲಿ ಇದನ್ನು ಬೆಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಇವುಗಳು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ತರಕಾರಿ ಅಂಗಡಿಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಮಾರುಕಟ್ಟೆಯಲ್ಲಿ ಲಭ್ಯ. ಇವುಗಳ ಜೊತೆಗೆ ವೊಲ್ವೊಲ್ವಾಸಿರಿಯೆಲ್ಲಾ ವ್ವೊಲ್ವಾಸಿಯಾ , ಆಯ್‍ಸ್ಟರ್‌ ಅಣಬೆಗಳಾದ ಪ್ಲ್ಯೂರೊಟಸ್ ಆಸ್ಟ್ರಿಯಾಟಸ್‌ , ಲೆಂಟಿನ್ಯೂಲಾ ಎಡೊಡ್ಸ್ ಮತ್ತು ಎನೊಕಿಟೇಕ್, ಫ್ಲಾಮ್ಯೂಲಿನಾ ಮುಂತಾದವುಗಳನ್ನು ಈ ಪ್ರಕಾರದಲ್ಲಿ ಸೇರಿಸಬಹುದಾಗಿದೆ.[೧೮೨]
ಇವಲ್ಲದೆ ಇನ್ನೂ ಹಲವಾರು ಅಣಬೆ ವರ್ಗಗಳನ್ನು ಕಾಡಿನ ಉತ್ಪನ್ನವಾಗಿ ಪಡೆಯಲಾಗುತ್ತಿದ್ದು ಇದನ್ನು ವೈಯುಕ್ತಿಕ ಬಳಕೆಗಾಗಿ ಮತ್ತು ವಾಣಿಜ್ಯಿಕ ಮಾರಾಟಕ್ಕಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಹಾಲು ಅಣಬೆ, ಮುತ್ತಿನಣಬೆ, ಚಾಂಟೆರೆಲ್ಲಾ, ಟ್ರಫಲ್ಸ್, ಕಪ್ಪು ಅಣಬೆಗಳು ಮತ್ತು ಪೊರ್ಸಿನಿ ಅಣಬೆ ಗಳು, ಬೊಲೆಟಸ್ ಎಡ್ಯೂಲಿಸ್ (ರಾಜ ಅಣಬೆಗಳು ಎಂದೂ ಕೂಡ ಪರಿಚಿತ) ಮುಂತಾದವುಗಳು ಮಾರುಕಟ್ಟೆಯಲ್ಲಿ ಹೆಚ್ಚಿನ ಬೆಲೆಗೆ ಮಾರಾಟವಾಗುತ್ತವೆ. ಇವುಗಳನ್ನು ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ವಿಶೇಷ ತಿನಿಸುಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ.[೧೮೩]
ಕೆಲವು ಪ್ರಕಾರದ ಬೆಣ್ಣೆಗೆ ಚೀನಿಯರು ವಿಶೇಷವಾದ ಅಣಬೆಗಳನ್ನು ಹಾಕಿ ತಯಾರಿಸಿದ ಮೊಸರನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ. ಇದರಿಂದ ಬೆಣ್ಣೆಗೆ ವಿಶೇಷವಾದ ಸುವಾಸನೆ ಮತ್ತು ರುಚಿ ಪ್ರಾಪ್ತವಾಗುತ್ತದೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ ನೀಲಿ ಬಣ್ಣದ ಬೆಣ್ಣೆಯನ್ನೊಳಗೊಂಡ ಸ್ಟಿಲ್ಟೋನ್ ಅಥವಾ ರಾಕ್‌ಫೋರ್ಟ್‌ ಇದನ್ನು ಪೆನ್ಸಿಲಿಯಮ್ ರಾಕ್‌ಪೋರ್ಟ್‌ ಬಳಸಿ ಮಾಡಲಾಗಿರುತ್ತದೆ.[೧೮೪] ಬೆಣ್ಣೆ ತಯಾರಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುವ ಮೋಲ್ಡ್‌ಗಳು ವಿಷಕಾರಕಗಳಲ್ಲದವುಗಳಾಗಿದ್ದು ಇವುಗಳನ್ನು ಮನುಷ್ಯರು ಬಳಕೆ ಮಾಡಬಹುದಾಗಿದೆ; ಅದೇನೆ ಇದ್ದರೂ ಮೈಕೊಟಾಕ್ಸಿನ್ಗಳು (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಅಫ್ಲಾಟಾಕ್ಸಿನ್‌, ರಫ್‌‍ಫೋರ್ಟೈನ್‌ ಸಿ, ಪ್ಯಾಟುಲಿನ್ ಅಥವಾ ಇತರೆ) ಬೆಣ್ಣೆಯನ್ನು ಶೇಖರಣೆ ಮಾಡುವ ಸಂದರ್ಭದಲ್ಲಿ ಅದರ ಮೇಲೆ ಬೆಳೆಯ ಬಹುದಾಗಿದೆ.[೧೮೫]
ಹಲವಾರು ಅಣಬೆ ಪಂಗಡಗಳು ಮಾನವರಿಗೆ ವಿಷಕಾರಕಗಳಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಇದು ಸಣ್ಣ ಪ್ರಮಾಣದ ಅಜೀರ್ಣ ಸಮಸ್ಯೆ ಅಥವಾ ಅಲರ್ಜಿ ಪರಿಣಾಮ ಹಾಗೂ ಭ್ರಾಂತು ಉಂಟುಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ದೇಹದ ಅವಯವಗಳಿಗೆ ಹಾನಿ ಉಂಟುಮಾಡುವ ಮೂಲಕ ಸಾವಿಗೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದಾಗಿದೆ. ಭೀಕರ ಪರಿಣಾಮ ಉಂಟುಮಾಡುವ ಅಣಬೆಯ ಪ್ರಕಾರಗಳಲ್ಲಿ ಕೊನೊಸೈಬ್‌ , ಗ್ಯಾಲರಿನಾ , ಲೆಪಿಯೋಟಾ ಮತ್ತು ಅಪಖ್ಯಾತಿ ಹೊಂದಿರುವ ಅಮ್ಯಾನಿಟಾ ವರ್ಗಗಳು ಸೇರುತ್ತವೆ.[೧೮೬] ಇನ್ನುಳಿದ ಕೆಲವು ಸುಂದರ ಆದರೆ ಭೀಕರ ಪರಿಣಾಮ ಉಂಟುಮಾಡುವ ಅಣಬೆಗಳಲ್ಲಿ ಎ.ವಿರೋಸಾ ಮತ್ತು ಸಾವಿನ ಟೊಪ್ಪಿ ಎಂದೇ ಖ್ಯಾತವಾದ ಎ.ಪ್ಯಾಲೊಡೈಸ್ ಇವು ಸಾಮಾನ್ಯವಾಗಿ ಸಾವು ಉಂಟುಮಾಡುವ ಇತರೆ ಕೆಲವು ಅಣಬೆಯ ಪ್ರಕಾರಗಳಾಗಿವೆ.[೧೮೭] ಇದಕ್ಕೆ ತದ್ವಿರುದ್ಧವಾಗಿ (ಗೈರೊಮಿಟ್ರಾ ಎಸ್ಕ್ಯುಲೆಂಟಾ ) ಇದು ಬೇಯಿಸಿದಾದ ತಿನ್ನಲು ಅತ್ಯಂತ ಪ್ರಶಸ್ತವಾಗಿದ್ದು ಹಸಿಯಾಗಿ ತಿಂದಾಗ ತುಂಬಾ ವಿಷಕಾರಿಯಾಗಿ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ.[೧೮೮] ಟ್ರೈಕೊಲೊಮಾ ಎಕ್ವೆಸ್ಟ್ರೆ ಇದು ದೇಹದ ಮಾಂಸ ಸ್ನಾಯುಗಳಿಗೆ ತೀವೃತರವಾದ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುತ್ತದೆ ಎಂಬುದು ತಿಳಿಯುವವರೆಗೆ ಇನ್ನು ತಿನ್ನಲು ಉಪಯುಕ್ತವಾದುದು ಎಂದು ಪರಿಗಣಿಸಲಾಗಿತ್ತು.[೧೮೯] ಫ್ಲೈ ಅಗ್ಯಾರಿಕ್‌ ಅಣಬೆಗಳಾದ ಅಮ್ಯಾನಿಟಾ ಮಸ್ಕಾರಿಯಾ ಇದು ಸಣ್ಣ ಪ್ರಮಾಣದ ವ್ಯತಿರಿಕ್ತ ಪ್ರಭಾವ ಬೀರುವಂತಹದ್ದಾಗಿದ್ದು ಇದರಲ್ಲಿಯ ಭ್ರಾಂತಿಕಾರಕ ಗುಣದಿಂದಾಗಿ ಇದನ್ನು ಔಷಧಿ ತಯಾರಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತದೆ. ಐತಿಹಾಸಿಕವಾಗಿ, ಫ್ಲೈ ಅಗ್ಯಾರಿಕ್‌ ಅಣಬೆಯನ್ನು ಹಲವಾರು ಜನರು ಯುರೋಪ್ ಮತ್ತು ಏಷಿಯಾದಲ್ಲಿ ಇದನ್ನು ಸಾಂಸ್ಕೃತಿಕ ಸಂಪ್ರದಾಯವಾದ ಶಮಾನಿಕ್‌ ಎಂಬ ಆಚರಣೆಯಲ್ಲಿ ಈಶಾನ್ಯ ಸೈಬಿರಿಯಾದ ಕೊರ್ಯೊಕ್‌ ಜನರು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ.[೧೯೦]
ಸರಿಯಾದ ತರಬೇತಿ ಹಾಗೂ ಜ್ಞಾನ ಇಲ್ಲದೆ ತಿನ್ನಲು ಯೋಗ್ಯವಾದ ಅಣಬೆಯನ್ನು ಗುರುತಿಸುವುದು ಕಷ್ಟಸಾಧ್ಯ. ಆದ್ದರಿಂದ ಕಾಡು ಅಣಬೆಯನ್ನು ತಿನ್ನಲು ಬಳಸುವುದು ಸೂಕ್ತವಲ್ಲ ಎಂಬುದನ್ನು ಹೇಳಲಾಗುತ್ತದೆ.[೧೯೧][೧೯೨]
ಕೃಷಿಯಲ್ಲಿ, ಪೋಷಕಾಹಾರ ಮತ್ತು ಸ್ಥಳಗಳಿಗಾಗಿ ರೋಗಕಾರಕ ಸೂಕ್ಷ್ಮಾಣುಜೀವಿಗಳೊಂದಿಗೆ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಕ್ರಿಯಾಶೀಲವಾಗಿ ಸ್ಪರ್ಧಿಸಿದರೇ ಉಪಯೋಗವಾಗಬಹುದು ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರಿಯಾ ಅಥವಾ ಇತರೆ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಅಥವಾ ಈ ಪೆಥೊಜೆನ್ಸ್‌ಗಳ ಪರಾವಲಂಬಿಗಳಾಗಿದ್ದರೇ ಸ್ಪರ್ಧಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಹೊರಗಿಡುವ ತತ್ವದ ಮೂಲಕ ಹೋರಾಡುತ್ತವೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಕೆಲವು ಗುಂಪುಗಳು ಸಸ್ಯಗಳ ರೋಗಕಾರಕಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಹತ್ತಿಕ್ಕಲು ಅಥವಾ ದಮನಮಾಡಲು ಬಳಸಬಹುದು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಕ್ರಿಮಿಗಳು, ಮೈಟ್‌ಗಳು, ಕಳೆಗಳು, ನೆಮಟೋಡ್‍ಗಳು ಮತ್ತು ಇತರೆ ಕೆಲವು ಶೀಲಿಂಧ್ರಗಳು ಪ್ರಮುಖ ಬೆಳೆಗಳ ಸಸ್ಯಗಳ ರೋಗಕ್ಕೆ ಕಾರಣವಾಗಬಹುದು.[೧೯೩] ಇದು ಈ ಕೃಷಿ ಕೀಟಗಳ ಜೈವಿಕ ನಿಯಂತ್ರಣದಲ್ಲಿ ಈ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳನ್ನು ಪ್ರಾಯೋಗಿಕವಾಗಿ ಬಳಕೆ ಮಾಡಲು ತುಂಬಾ ಬಲವಾದ ಆಸಕ್ತಿಯನ್ನುಂಟುಮಾಡಿದೆ. ಎಂಟಮೊಪೆತೊಜೆನಿಕ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಜೈವಿಕ ಕ್ರೀಮಿನಾಶಕ ಔಷಧವಾಗಿ ಬಳಸಬಹುದು, ಇವುಗಳು ಕ್ರಿಯಾಶೀಲವಾಗಿ ಕೀಟಗಳನ್ನು ಕೊಲ್ಲಬಹುದು.[೧೯೪] ಜೈವಿಕ ಕೀಟನಾಶಕವಾಗಿ ಬಳಸುವ ಔಷಧಗಳು ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಬೋವೆರಿಯಾ ಬ್ಯಾಸಿಯಾನಾ , ಮೆಥಾರಿಜಿಯಮ್ ಆ‍ಯ್‌ನಿಸೊಪ್ಲಿಯಾ , ಹಿರ್ಸುಟೆಲ್ಲಾ spp,ಪಿಸಲೊಮೈಸೀಸ್ spp, ಮತ್ತು ವೆಟ್ರಿಸಿಲಿಯಂ ಲೆಕಾನಿ [೧೯೫][೧೯೬]. ಹುಲ್ಲಿನ ಎಂಡೊಫೆಟಿಕ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ನಿಯೋಟೈಫಾಡಿಯಂ ಗುಂಪಿಗೆ ಸೇರಿವೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಎನ್. ಕೊಯಿನೊಫಿಯಾಲಂ , ಅಕಶೇರುಕ ಮತ್ತು ಕಶೇರುಕ ಸಸ್ಯಹಾರಿ ವಲಯದೊಳಗೆ ಕ್ಷಾರಾಭ (ಆಲ್ಕೋಲೈಡ್ಸ್) ಉತ್ಪಾದಿಸಿ ವಿಷಕಾರಿಯಾಗುತ್ತವೆ. ಈ ಕ್ಷಾರಾಭಗಳು ಸಸ್ಯಹಾರಿಗಳಿಂದ ಹುಲ್ಲನ್ನು ಸಂರಕ್ಷಿಸುತ್ತವೆ, ಆದರೆ ಹಲವಾರು ಎಂಡೊಪೈಟ್ ಕ್ಷಾರಾಭಗಳು ಹುಲ್ಲು ತಿನ್ನುವ ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಆಕಳು ಮತ್ತು ಆಡುಗಳಿಗೆ ವಿಷವಾಗಬಹುದು.[೧೯೭] ಹುಲ್ಲುಗಾವಲು ಅಥವಾ ಹೈಬ್ರಿಡ್ ಮೇವಿನ ಹುಲ್ಲುಗಳು ನಿಯೋಟೈಪೊಡಿಯಂ ಎಂಡೊಪೈಟ್ಸ್‌ನಿಂದ ಸೋಂಕು ಉಂಟಾಗುವುದು,ಇದನ್ನು ಒಂದು ಹುಲ್ಲು ಬೆಳೆಸುವ ಯೋಜನೆಯಲ್ಲಿ ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ; ಶೀಲಿಂಧ್ರ ತಳಿಗಳನ್ನು ಕೇವಲ ಕ್ಷಾರಾಭ ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ಮಾತ್ರ ಆರಿಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತದೆ ಜಾನುವಾರುಗಳಿಗೆ ಹಾನಿಕಾರಕವಾಗಿಲ್ಲದಿದ್ದಾಗ ಸಸ್ಯಾಹಾರಿ ಕೀಟಗಳ ರೋಗನಿರೋಧಕ ಹೆಚ್ಚುತ್ತದೆ.[೧೯೮]
ಕೆಲವೊಂದು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು, ಪ್ರಮುಖವಾಗಿ "ಬಿಳಿ ಬೇರು" ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು, ಕೀಟನಾಶಕಗಳು, ಸಸ್ಯನಾಶಕಗಳು, ಪೆಂಟಾಕ್ಲೋರೊಫೆನಾಲ್, ಕ್ರಿಯೊಸೋಟ್, ಕೋಲ್ ಟಾರ್‌ಗಳನ್ನು ನಾಶ ಪಡಿಸಬಹುದು, ಮತ್ತು ಅಧಿಕ ಇಂಧನವನ್ನು ಕಾರ್ಬನ್ ಡೈಯಾಕ್ಸೈಡ್‌, ನೀರು, ಮತ್ತು ಮೂಲಾಂಶವಾಗಿ ಪರಿವರ್ತನೆಗೊಳಿಸುತ್ತವೆ.[೧೯೯] ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಯೂರೇನಿಯಂಆಕ್ಸೈಡ್‌ಗಳನ್ನು ಜೈವಿಕ ಖನೀಜಿಕರಣ ಮಾಡುವಂತೆ ಕಾಣುತ್ತದೆ. ಇವು ವಿಕೀರಣದಿಂದ ಹಾನಿಗೊಳಗಾದ ಪ್ರಭಾವಕ್ಕೆ ಒಳಗಾದ ಪ್ರದೇಶದಲ್ಲಿಯ ಜೈವಿಕ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ತೊಡಗುತ್ತವೆ.[೨೦೦][೨೦೧][೨೦೨]
ಸಂಶೋಧಕರು ಶೀಲಿಂಧ್ರಗಳನ್ನು ಮಾದರಿ ಜೀವಿಗಳಾಗಿ ಬಳಸಿಕೊಂಡು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದಲ್ಲಿ ಹಲವಾರು ಪ್ರಮುಖ ಸಂಶೋಧನೆಗಳನ್ನು ಮಾಡಿದ್ದಾರೆ, ಅಂದರೆ, ಪ್ರಯೋಗಾಲಯದಲ್ಲಿ ಶೀಲಿಂಧ್ರಗಳು ಬೆಳವಣಿಗೆ ಹೊಂದುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಲೈಂಗಿಕ ಕೂಡುವಿಕೆಯಿಂದ ಶೀಘ್ರವಾಗಿ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ. ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ಒಂದು ಜೀನು-ಒಂದು ಕಿಣ್ವ ಸಿದ್ಧಾಂತ ಸೂತ್ರ ರಚಿಸಿ ವಿಜ್ಞಾನಿಗಳು ಬ್ರೆಡ್ ಬೂಷ್ಟ್ ನ್ಯೂರೊಸ್ಪೋರಾ ಕ್ರಾಸ್ಸಾ ಬಳಸಿಕೊಂಡು ತಮ್ಮ ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಸಿದ್ಧಾಂತದಲ್ಲಿ ಪರೀಕ್ಷಿಸಿದ್ದಾರೆ.[೨೦೩] ಇತರೆ ಪ್ರಮುಖ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಾದ ಆ‍ಯ್‌ಸ್ಪರ್‌ಜಿಲಸ್ ನಿಡುಲನ್ಸ್ ಮತ್ತು ಹುದುಗುಗಳು, ಸಚರೊಮೈಸಸ್ ಸೆರೆವಿಜಿಐ ಮತ್ತು ಸ್ಕಿಜೊಸ್ಯಾಚರೊಮೈಸಸ್ ಪೋಮ್ಬಿ , ಇವುಗಳನ್ನು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಕೋಶ ಜೀವವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಆನುವಂಶಿಕತೆಯಲ್ಲಿ ಅವುಗಳ ಜೀವನ ಚಕ್ರದ ಚಟುವಟಿಕೆ, ವರ್ಣಗ್ರಾಹಿ ರಚನೆ ಮತ್ತು ಜೀನ್ ಚಟುವಟಿಕೆಯನ್ನು ಪರೀಕ್ಷಿಸಲು ಧೀರ್ಘಕಾಲದಿಂದ ಬಳಸಲಾಗುತ್ತಿದೆ. ಇತರೆ ಶೀಲಿಂಧ್ರ ಮಾದರಿಗಳು ಇತ್ತೀಚೆಗೆ ಕಾಣಿಸಿಕೊಂಡಿವೆ, ಸಸ್ಯ ರೋಗ ಲಕ್ಷಣ ಶಾಸ್ತ್ರ, ಮತ್ತು ಔದ್ಯೋಗಿಕ ಬಳಕೆಗಳಂತಹ ಕೆಲವು ನಿರ್ದಿಷ್ಟ ಜೀವ ವೈಧ್ಯಕೀಯ ಪ್ರಶ್ನೆಗಳಿಗೆ ಉತ್ತರ ಸಿಕ್ಕಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಕ್ಯಾಂಡಿಡಾ ಆಲ್ಬಿಕನ್ಸ್ , ಎ ಡೆಮೊರ್ಪಿಕ್, ಸಮಯಾನುವರ್ತಿಯ ಮಾನವ ರೋಗಕಾರಕಗಳು,[೨೦೪] ಮ್ಯಾಗ್ನಾಪೋರ್ಥೆ ಗ್ರಿಸೆಯಾ , ಸಸ್ಯ ರೋಗಕಾರಕ,[೨೦೫] ಮತ್ತು ಪಿಚಿಯಾ ಪಾಸ್ಟೋರಿಸ್ , ಈಸ್ಟನ್ನು ಯುಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಎಕ್ಸ್‌ಪ್ರೆಶನ್‌ಗೆ ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತಿದೆ.[೨೦೬]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳನ್ನು ಕೈಗಾರಿಕಾ ರಾಸಾಯನಿಕಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸಲು ವ್ಯಾಪಕವಾಗಿ ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತ್ತಿದೆ, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಸಿಟ್ರಿಕ್, ಗ್ಲುಕೊನಿಕ್, ಲ್ಯಾಕ್ಟಿಕ್, ಮತ್ತು ಮ್ಯಾಲಿಕ್ ಆ‍ಯ್‌ಸಿಡ್ಸ್,[೨೦೭] ಮತ್ತು ಕೈಗಾರಿಕಾ ಕಿಣ್ವಗಳು, ಉದಾಹರಣೆಗೆ ಲೈಪೆಸಿಸ್‌ನ್ನು ಜೈವಿಕ ಮಾರ್ಜಕಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಸುತ್ತಾರೆ,[೨೦೮] ಸೆಲ್ಯುಲಾಸಸ್‌ನ್ನು ಸೆಲ್ಯುಲೊಸಿಕ್ ಎಥೆನಾಲ್ ಮತ್ತು [೨೦೯] ಸ್ಟೋನ್‌ವಾಶ್ಡ್ ಜೀನ್ಸ್,[೨೧೦] ಮತ್ತು ಎಮಿಲೇಸಸ್ [೨೧೧] ಇನ್‌ವರ್ಟೇಸಸ್, ಪ್ರೋಟೀಸಸ್, ಮತ್ತು ಕ್ಸಿಲಾನಾಸಸ್ ತಯಾರಿಸಲು ಬಳಸುತ್ತಾರೆ.[೨೧೨] ಸಿಲೊಸೈಬಿನ್ ಮಶ್ರೂಮ್ ಗಳಲ್ಲಿ (ಇದನ್ನು ಸ್ಥಳೀಯವಾಗಿ ಮ್ಯಾಜಿಕ್ ಮಶ್ರೂಮ್ ಎಂದು ತಿಳಿಯಲಾಗಿದೆ) ಹಲವಾರು ವರ್ಗಗಳನ್ನು ಅವುಗಳ ಭ್ರಮಾಕಾರಕ ಗುಣದಿಂದಾಗಿ ಪಾರಂಪರಿಕವಾಗಿ ಮತ್ತು ವೈಜ್ಞಾನಿಕವಾಗಿ ವೈದ್ಯಕೀಯ ಉಪಯೋಗ ಮಾಡಲಾಗುತ್ತದೆ.
ಅನೇಕ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಜೈವಿಕವಾಗಿ ಕ್ರಿಯಾಶೀಲವಾಗಿರುವ ಮಿಶ್ರಣಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳಲ್ಲಿ ಕೆಲವು ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳಿಗೆ ವಿಷಕಾರಿ(ಟಾಕ್ಸಿಕ್)ಯಾಗಿದೆ, ಹೀಗಾಗಿ ಅವನ್ನು ಮೈಕೊಟಾಕ್ಸಿನ್ಗಳು ಎನ್ನುವರು. ಮಾನವನಿಗೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ ಹಳಸಿದ ಆಹಾರದಲ್ಲಿನ ಬೂಷ್ಟು ಮತ್ತು ವಿಷಕಾರೀ ಅಣಬೆಗಳು ಮೈಕೊಟಾಕ್ಸಿನ್‌ಗಳಾಗಿವೆ. ಇದರಲ್ಲಿ ಕುಖ್ಯಾತವಾದವೆಂದರೆ ಮಾರಕವಾದ ಕೆಲವು ಅಮನಿಟ ಅಣಬೆಯಲ್ಲಿನ ಅಮಟಾಕ್ಸಿನ್‌ಗಳು, ಮತ್ತು ಎರ್ಗಾಟ್ ಶಿಲೀಂದ್ರಗಳ ಸ್ಕ್ಲೆರೊಶಿಯ‌ಗಳೊಂದಿಗೆ ಬೆರೆತ ರೈ ಅಥವಾ ಏಕದಳ ಧಾನ್ಯಗಳನ್ನು ತಿಂದ ಜನರಲ್ಲಿ ಬರುವ, ಬಹಳ ಕಾಲದವರೆಗೆ ಉಳಿಯುವ ಗಂಬೀರ ಸಾಂಕ್ರಾಮಿಕ ರೋಗವಾದ ಎರ್ಗಾಟಿಸಮ್‌ನ ಎರ್ಗಾಟ್ ಆಲ್ಕಾಲಾಯ್ಡ್‌ಗಳು (ಸೈಂಟ್ ಆಂಥೋನೀಸ್ ಫೈರ್), ಕ್ಲಾವಿಸೆಪ್ಸ್ ಪುರ್ಪುರೆಯ .[೨೧೩] ಬೇರೆ ಗಮನಾರ್ಹವಾದ ಸಣ್ಣ ಪ್ರಮಾಣದ ವಿಷಕಾರಕಗಳಾದ ಅಫ್ಲಾಟಾಕ್ಸಿನ್‌ ಹಾಗೂ ಯಕೃತ್‌ಗೆ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ವಿಷ ಮತ್ತು ಆಸ್ಪೆರ್ಜಿಲ್ಲಸ್ ಜಾತಿಗಳ ಹೆಚ್ಚು ಕ್ಯಾನ್ಸರ್ ಕಾರಕವಾದ ಚಯಾಪಚಯಗಳನ್ನು ಹುಟ್ಟುಹಾಕುತ್ತದೆ. ಈ ರೀತಿಯ ವರ್ಗಗಳು ಮನುಷ್ಯರು ಸೇವಿಸುವ ಕಾಳು ಹಾಗೂ ಬೀಜಗಳ ಒಳಗೆ ಬೆಳೆಯುವ ಅಫ್ಲಾಟಾಕ್ಸಿನ್‌ಗಳು, ಒಕ್ರಟಾಕ್ಸಿನ್‌ಗಳು, ಪಟುಲಿನ್, ಮತ್ತು ಟ್ರಿಕೊಥೆಸಿನ್‌ಗಳು( ಉದಾಹರಣೆಗೆ: T-೨ ಮೈಕೊಟಾಕ್ಸಿನ್) ಮತ್ತು ಮಾನವನ ಆರೋಗ್ಯದ ಪೂರೈಕೆ ಅಥವಾ ಜಾನುವಾರುಗಳ ಮೇಲೆ ಮಹತ್ತರ ಪರಿಣಾಮ ಬೀರುವ ಫುಮೊನಿಸಿನ್‌ಗಳಾಗಿವೆ.[೨೧೪]
ಮೈಕೊಟಾಕ್ಸಿನ್ಗಳು ಎರಡನೆಯ ಚಾಯಾಪಚಯ ಕ್ರಿಯೆಯ ಉತ್ಪನ್ನಗಳಾಗಿವೆ (ನೈಸರ್ಗಿಕ ಉತ್ಪನ್ನಗಳು), ಮತ್ತು ಮೈಕೊಟಾಕ್ಸಿನ್‌ಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಲ್ಲಿನ ಇತರ ನೈಸರ್ಗಿಕವಾದ ಉತ್ಪನ್ನಗಳನ್ನು ಉತ್ಪಾದಿಸುವ ಉದ್ದೇಶದಿಂದ ಇರುವ ಜೈವಿಕರಾಸಾಯನಿಕಗಳ ಅಸ್ತಿತ್ವದ ಸಂಶೋಧನೆಯನ್ನು ಸ್ಥಾಪಿಸಲಾಗಿದೆ.[೨೧೫] ಮೈಕೊಟಾಕ್ಸಿನ್ಗಳು ಶರೀರದ ಹೊಂದಿಕೆಯ ಮೂಲಕ ದೈಹಿಕ ಕ್ಷಮತೆಯನ್ನೊದಗಿಸುತ್ತದೆ, ಇನ್ನಿತರ ಸೂಕ್ಷ್ಮಾಣು ಜೀವಿಗಳು ಮತ್ತು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳೊಂದಿಗೆ ಸ್ಪರ್ಧೆ, ಮತ್ತು ಕ್ಷಯವಾಗುವುದರಿಂದ ರಕ್ಷಿಸುತ್ತದೆ (ಫಂಗೈವರಿ)[೨೧೬][೨೧೭]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರವು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರದ ಒಂದು ವಿಭಾಗವಾಗಿದ್ದು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಕ್ರಮಬದ್ಧವಾದ ಅಧ್ಯಯನವಾಗಿದೆ, ಇದು ಅವುಗಳ ವಂಶವಾಹಿ ಮತ್ತು ಜೀವರಾಸಾಯನಿಕ ಗುಣಗಳು, ಟಾಕ್ಸೊನಮಿ, ಅವುಗಳ ಮಾನವನ ಔಷಧದ ಮೂಲವಾಗಿ ಬಳಕೆ, ಆಹಾರ, ಮತ್ತು ಧಾರ್ಮಿಕ ಉದ್ಧೇಶಗಳಿಗಾಗಿ ಬಳಸುವ ಸೈಕೊಟ್ರೋಫಿಕ್ ವಸ್ತುಗಳನ್ನು, ಅಲ್ಲದೆ ವಿಷಕಾರಿ ಅಥವಾ ಸೋಂಕುಕಾರಿಯಾದ ಹಾನಿಕಾರಕಗಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಫೈಟೊಫಾಲಜಿ ಕ್ಷೇತ್ರವು ಸಸ್ಯರೋಗಗಳ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದುದಾಗಿದೆ, ಏಕೆಂದರೆ ಹೆಚ್ಚಿನ ರೋಗಕಾರಕಗಳು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಾಗಿವೆ.[೨೧೮]
ಪ್ರಾಚೀನ ಇತಿಹಾಸದಿಂದಲೂ ಮಾನವ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳನ್ನು ಬಳಸುತ್ತಾ ಬಂದಿದ್ದಾನೆ; ಓಟ್ಜಿ ದ ಐನ್‌ಮ್ಯಾನ್ , ೫,೩೦೦ ವರ್ಷಗಳ ಹಿಂದೆ ಸಂರಕ್ಷಿಸಿಡಲಾದ ನಿಯೊಲಿಥಿಕ್ ಮನುಷ್ಯನು ಆಸ್ಟ್ರಿಯಾದ ಹುಲ್ಲುಗಾವಲುಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬಂದ ಹೆಪ್ಪುಗಟ್ಟಿದ ರಕ್ಷಿತ ಶವವಾಗಿದೆ, ಎರಡು ಪಂಗಡದ ಪಾಲಿಪೋರ್ ಅಣಬೆಗಳನ್ನು ಜ್ವಲನ ಪದಾರ್ಥವಾದ ಫೊಮ್ಸ್ ಫೊಮೆಟಾರಿಯಸ್‌ ಆಗಿ ಬಳಸಿಕೊಳ್ಳಲಾಗುತಿತ್ತು ಅಥವಾ ಪಿಪ್ಟೊಪೊರಸ್ ಬೆಟುಲಿನುಸ್ ಔಷದೀಯ ಉದ್ಧೇಶಗಳಿಗಾಗಿ ಬಳಸಲಾಗುತಿತ್ತು.[೨೧೯] ಮಿಲಿಯನ್ ವರ್ಷಗಳಿಂದಲೂ ಆದಿಮಾನವರು ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳೆಂದು ಗೊತ್ತಿಲ್ಲದೆಯೂ ಆಹಾರದ ಮೂಲವಾಗಿ ಅಂದರೆ ಬ್ರೆಡ್ ಮತ್ತು ಪಾನೀಯಗಳ ಹುದುಗುವಿಕೆಯಲ್ಲಿ ಬಳಸುತ್ತಿದ್ದರು. ರೋಗಕಾರಕ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಂದಾಗಿ ಬೆಳೆಗಳು ನಾಶವಾದುದಕ್ಕೆ ಕೆಲವು ಹಳೆಯ ದಾಖಲೆಗಳು ದೊರೆಯುತ್ತದೆ.[೨೨೦]
ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರವು ಹೊಸದಾಗಿದ್ದು ೧೬ನೇ ಶತಮಾನದ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕದ ಅಭಿವೃದ್ದಿಯಿಂದ ಕ್ರಮಬದ್ಧವಾಯಿತು. ೧೫೮೮ರಲ್ಲಿ ಶಿಲೀಧ್ರದ ಬೀಜಕಣವನ್ನು ಮೊದಲು ಗಿಯಾಂಬಾಟಿಸ್ಟ ಡೆಲ್ಲ ಪೊರ್ಟ ಗಮನಿಸಿದನು, ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರದ ಅಭಿವೃದ್ಧಿಯಲ್ಲಿ ನೊವ ಪ್ಲಾಟರಮ್ ಜೆನೆರ ದ ಸಂತಾನೋತ್ಪತ್ತಿಯ ಕಾರ್ಯದ ಪಿಯರ್ ಆಟೊನಿಯೊ ಮಿಚೇಲಿಯ ಪ್ರಕಟಣೆಯನ್ನು ೧೭೨೯ರಲ್ಲಿ ಮಾಡಿದನು.[೨೨೧] ಮಿಚೇಲಿ ಪಂಗಡಳನ್ನಷ್ಟೇ ಅಲ್ಲದೆ ಅವುಗಳ ಸರಿಯಾದ ಸ್ಥಿತಿಗಳನ್ನು, ಅವುಗಳು ತಮ್ಮದೇ ಗುಂಪಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಬೆಳವಣಿಗೆಯನ್ನು ಪ್ರಚೋದಿಸುತ್ತವೆ ಎಂಬುದನ್ನೂ ಗಮನಿಸಿದನು.[೨೨೨] ಕಾರ್ಲ್ ಲಿನೆಯಸ್ ತನ್ನ ಸ್ಪೀಶಿಸ್ ಪ್ಲಾಟರಮ್ ನಲ್ಲಿ (೧೭೫೩) ಬಯೊನಾಮಿಯಲ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ಹೆಸರಿಡುವ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯ ವ್ಯಾಪಕ ಬಳಕೆಯನ್ನು ಪರಿಚಯಿಸಿದನು, ಡಚ್‌ನವನಾದ ಕ್ರಿಶ್ಚಿಯನ್ ಹೆಂಡ್ರಿಕ್ ಪರ್ಸೂನ್ (೧೭೬೧–೧೮೩೬) ಅಣಬೆಗಳ ಮೊದಲ ವರ್ಗೀಕರಣವನ್ನು ಅಧುನಿಕ ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರದ ಸ್ಥಾಪಕನೆನ್ನುವಷ್ಟು ಖಚಿತವಾಗಿ ಮಾಡಿದ್ದಾನೆ. ನಂತರ, ಬೀಜಕಣದ ಬಣ್ನವನ್ನು ಮತ್ತು ಅನೇಕ ಸೂಕ್ಷ್ಮ ಗುಣಗಳನ್ನು, ಪ್ರಸು ಟಾಕ್ಸೊನೊಮಿಸ್ಟ್‌ಗಳು ಬಳಸುವ ವಿಧಾನವನ್ನು ಬಳಸಿ ಇಲಿಯಾಸ್ ಮಾಗ್ನುಸ್ ಫ್ರೈಸ್ (೧೭೯೪–೧೮೭೮) ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ವರ್ಗೀಕರಣವನ್ನು ಇನ್ನಷ್ಟು ವಿಸ್ತರಿಸಿದನು. ಇನ್ನಿತರ ಮೊದಲಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರದ ಸಂಶೋಧಕರೆಂದರೆ ೧೭ನೇ–೧೯ನೇ ಮತ್ತು ಆರಂಭದ ೨೦ನೇ ಶತಮಾನದವರೆಂದರೆ ಮೈಲ್ಸ್ ಜೊಸೆಫ್ ಬಾರ್ಕ್ಲೀ, ಆಗಸ್ಟ್ ಕಾರ್ಲ್ ಜೊಸೆಫ್ ಕಾರ್ಡ, ಆ‍ಯ್‌೦ಟನ್ ಡಿ ಬರಿ, ಸಹೋದರರಾದ ಲೂಯಿಸ್ ರೆನಿ and ಚಾರ್ಲೆಸ್ ಟುಲಸ್ನೆ, ಆರ್ಥರ್ ಹೆಚ್. ಆರ್. ಬುಲ್ಲರ್, ಕರ್ಟಿಸ್ ಜಿ. ಲಾಯ್ಡ್, ಮತ್ತು ಪಿಯರ್ ಆಡ್ರೆಯ ಸಕಾರ್ಡೊ. ೨೦ನೇ ಶತಮಾನದ ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರದ ಆಧುನೀಕರಣವು ಜೀವರಾಸಾಯನ ಶಾಸ್ತ್ರ, ತಳಿವಿಜ್ಞಾನಗಳ, ಅಣು ಜೀವಶಾಸ್ತ್ರ, ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನದ ಮುಂದುವರೆದ ಭಾಗವಾಗಿದೆ. ಡಿಎನ್ಎ ಅನುಕ್ರಮ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಗಳು ಮತ್ತು ಪೈಲೊಜೆನೆಟಿಕ್ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಗಳು ಶೀಲಿಂಧ್ರಗಳ ಸಂಬಂಧಗಳು ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ವೈವಿಧ್ಯತೆಗೆ ಒಂದು ಹೊಸ ದೃಷ್ಟಿಕೋನ ಒದಗಿಸಿ, ಶೀಲಿಂಧ್ರ ಟ್ಯಾಕ್ಸಾನೊಮಿ‌ಯಲ್ಲಿನ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಮಾರ್ಪಲಾಜಿ ಆಧಾರಿತ ವರ್ಗೀಕರಣಕ್ಕೆ ಸವಾಲೆಸೆದಿದೆ.[೨೨೩]
![(6aR,9R)-N-((2R,5S,10aS,10bS)-5-benzyl-10b-hydroxy-2-methyl-3,6-dioxooctahydro-2H-oxazolo[3,2-a] pyrrolo[2,1-c]pyrazin-2-yl)-7-methyl-4,6,6a,7,8,9-hexahydroindolo[4,3-fg] quinoline-9-carboxamide](http://kn.wikipedia.org/wiki/%E0%B2%9A%E0%B2%BF%E0%B2%A4%E0%B3%8D%E0%B2%B0:Ergotamine3.png)
|access-date= requires |url= (help) |author= (help) |doi= value (help).CS1 maint: multiple names: authors list (link) |isbn= value: invalid character (help). Check date values in: |year= (help) |doi= value (help). PMID ೧೨೩೨೫೧೨೭ Check |pmid= value (help). |doi= value (help). PMID ೧೯೧೫೪೩೭೬ Check |pmid= value (help). |doi= value (help). PMC ೧೪೬೨೯೭೩ Check |pmc= value (help). PMID ೧೬೬೨೮೨೧೭ Check |pmid= value (help).CS1 maint: multiple names: authors list (link) |doi= value (help). PMID ೧೬೯೫೦೦೯೮ Check |pmid= value (help). Check date values in: |year= (help) |doi= value (help). PMID ೧೬೪೫೭೩೫೫ Check |pmid= value (help).CS1 maint: multiple names: authors list (link) |unused_data= ignored (help) |author= (help) |author= (help)CS1 maint: multiple names: authors list (link) |doi= value (help). PMC ೧೬೧೮೮೮೬ Check |pmc= value (help). PMID ೧೭೧೪೮೩೬೪ Check |pmid= value (help). |access-date= requires |url= (help) |author= (help)CS1 maint: multiple names: authors list (link) ಶಿಲೀಂಧ್ರ ವು ಕಾರ್ಯೋಟಿಕ್ ಜೀವಿಗಳ ಒಂದು ದೊಡ್ದ ಗುಂಪಿನ ಒಂದು ಸದಸ್ಯ ಜೀವಿಯಾಗಿದೆ. ಇದು ಯೀಸ್ಟ್‌ಗಳು (ಕಿಣ್ವ ಬೂಸ್ಟ್‌ಗಳು) ಮತ್ತು ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳಂತಹ ಸೂಕ್ಷಾಣುಜೀವಿಗಳು, ಹಾಗೆಯೇ ಹೆಚ್ಚು ಜನಪ್ರಿಯವಾದ ಅಣಬೆಗಳನ್ನೂ ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಈ ಜೀವಿಗಳು ಕಿಂಗ್ಡಮ್, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಎಂಬುದಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಇವು ಸಸ್ಯಗಳು, ಪ್ರಾಣಿಗಳು ಮತ್ತು ಬ್ಯಾಕ್ಟೀರೀಯಾಗಳಿಂದ ವಿಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಕೋಶಗಳು ಸೆಲ್ಯುಲೋಸ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಸಸ್ಯಗಳ ಕೋಶದ ಗೋಡೆಗಳಂತಲ್ಲದೇ, ಕೈಟಿನ್‌ಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುವ ಕೋಶ ಗೋಡೆಗಳನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ ಎಂಬುದು ಒಂದು ಪ್ರಮುಖವಾದ ಭಿನ್ನತೆಯಾಗಿದೆ. ಈ, ಮತ್ತು ಇತರ ಭಿನ್ನತೆಗಳು ತೋರಿಸುವುದೇನೆಂದರೆ, ಫಂಗಿಯು ಒಂದು ಸಾಮಾನ್ಯ ಪೂರ್ವಿಕನನ್ನು ಹೊಂದಿರುವ (ಒಂದು ಮೊನೊಪೊಲಿಟಿಕ್ ಗುಂಪು ) ಯುಮೈಕೋಟಾ (ನಿಜವಾದ ಫಂಗಿ ) ಅಥವಾ ಯುಮೈಸೆಟ್ಸ್ ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಸಂಬಂಧಿತ ಜೀವಿಗಳ ಒಂದು ಏಕೈಕ ಗುಂಪಿನಿಂದ ತೆಗೆದುಕೊಳ್ಳಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ಈ ಶಿಲೀಂಧ್ರದ ಗುಂಪು ರಚನಾತ್ಮಕವಾಗಿ ಸದೃಶವಾದ ಲೋಳೆ ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳು (ಮೈಕ್ಸೋಮೈಸೆಟ್ಸ್) ಮತ್ತು ನೀರಿನ ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳಿಂದ (ಊಮೈಸೆಟ್ಸ್) ಭಿನ್ನವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರದ ಅಧ್ಯಯನಕ್ಕೆ ಮೀಸಲಿಡಲ್ಪಟ್ಟ ಜೀವವಿಜ್ಞಾನದ ಶಾಖೆಯು ಶಿಲೀಂಧ್ರಶಾಸ್ತ್ರ (ಮೈಕೊಲೊಜಿ) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಅದು ಅನೇಕ ವೇಳೆ ಸಸ್ಯಶಾಸ್ತ್ರದ ಒಂದು ಶಾಖೆ ಎಂಬುದಾಗಿ ಪರಿಗಣಿಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ, ಆದಾಗ್ಯೂ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಸಸ್ಯಕ್ಕಿಂತ ಹೆಚ್ಚಾಗಿ ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ ಹೆಚ್ಚು ಸಂಬಂಧಿತವಾಗಿವೆ ಎಂಬುದನ್ನು ಆನುವಂಶಿಕ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ತೋರಿಸಿವೆ.
ಜಗತ್ತಿನಾದ್ಯಂತ ಹೇರಳವಾಗಿರುವ, ಹೆಚ್ಚಿನ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ತಮ್ಮ ವಿನ್ಯಾಸಗಳ ಸಣ್ಣ ಗಾತ್ರದ ಕಾರಣದಿಂದ ಮತ್ತು ಮಣ್ಣಿನಲ್ಲಿ ತಮ್ಮ ರಹಸ್ಯವಾದ ಜೀವನಶೈಲಿಗಳ ಕಾರಣದಿಂದ ನಿರ್ಜೀವ ವಸ್ತುಗಳ ಮೇಲೆ, ಮತ್ತು ಸಸ್ಯಗಳ, ಪ್ರಾಣಿಗಳ, ಅಥವಾ ಇತರ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಸಂಯುಕ್ತಜೀವಿಗಳಂತೆ ಅಸ್ಪಷ್ಟವಾಗಿರುತ್ತವೆ. ಅವುಗಳು ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ಸಮಯದಲ್ಲಿ ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳಾಗಿ ಅಥವಾ ಮೊಲ್ಡ್‌ಗಳಾಗಿ ಗಮನಾರ್ಹವಾಗಿ ಬದಲಾಗುತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಜೈವಿಕ ವಸ್ತುಗಳ ವಿಘಟನೆಯಲ್ಲಿ ಒಂದು ಪ್ರಮುಖವಾದ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಪೌಷ್ಟಿಕಗಳ ಸೈಕ್ಲಿಂಗ್ ಮತ್ತು ವಿನಿಮಯದಲ್ಲಿ ಮೂಲಭೂತವಾದ ಪಾತ್ರವನ್ನು ನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತವೆ. ಅವುಗಳು ದೀರ್ಘ ಕಾಲದಿಂದ ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳಂತೆ ಮತ್ತು ಗೆಡ್ಡೆ ಅಣಬೆಗಳಂತೆ ಆಹಾರದ ಒಂದು ನೇರವಾದ ಮೂಲವಾಗಿ ಬಳಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ, ಬ್ರೆಡ್‌ಗೆ ಒಂದು ಲೀವನಿಂಗ್ ಅಂಶದಂತೆ, ಮತ್ತು ಹಲವಾರು ಆಹಾರ ಉತ್ಪನ್ನಗಳ ಕಿಣ್ವನಕಾರಿ ಪ್ರಕ್ರಿಯೆಯಲ್ಲಿ ಅಂದರೆ ವೈನ್, ಬಿಯರ್, ಮತ್ತು ಸೋಯಾ ಸಾಸ್‌ಗಳಂತಹ ಉತ್ಪನ್ನಗಳಲ್ಲಿ ಕಿಣ್ವನಕಾರಿಯಾಗಿ ಬಳಸಲ್ಪಡುತ್ತದೆ. ೧೯೪೦ ರ ದಶಕದ ನಂತರದಿಂದ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಆಂಟಿಬಯೋಟಿಕ್‌ಗಳ (ಪ್ರತಿಜೀವಕ) ಉತ್ಪಾದನೆಯಲ್ಲಿ, ಮತ್ತು, ತೀರಾ ಇತ್ತೀಚಿನಲ್ಲಿ, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳಿಂದ ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡಲ್ಪಟ್ಟ ಹಲವಾರು ಕಿಣ್ವಗಳು ಕೈಗಾರಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ ಮತ್ತು ಡಿಟರ್ಜೆಂಟ್‌ಗಳಲ್ಲಿ ಬಳಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಅಲುಬುಗಳು ಮತ್ತು ಉಪದ್ರವಕಾರಿಗಳನ್ನು ನಿಯಂತ್ರಿಸುವಲ್ಲಿ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳೂ ಕೂಡ ಜೈವಿಕ ಘಟಕವಾಗಿ ಬಳಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಹಲವಾರು ಜಾತಿಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಕ್ಷಾರಾಭಗಳು (ಅಲ್ಕಾಲೊಯ್ಡ್) ಮತ್ತು ಪಾಲಿಕೆಟೈಡ್‌ಗಳಂತಹ ಶಿಲೀಂಧ್ರನಂಜು (ಮೈಕೊಟೊಕ್ಸಿನ್) ಎಂದು ಕರೆಯಲ್ಪಡುವ ಜೈವಿಕಕ್ರಿಯಾಶೀಲ ಮಿಶ್ರಣಗಳನ್ನು ಉತ್ಪತ್ತಿ ಮಾಡುತ್ತವೆ, ಅವುಗಳು ಮಾನವರನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಂತೆ ಇತರ ಪ್ರಾಣಿಗಳಿಗೆ ವಿಷಕಾರಿಯಾಗಿರುತ್ತದೆ. ಕೆಲವು ಜಾತಿಯ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ಫ್ರುಟಿಂಗ್ ವಿನ್ಯಾಸಗಳು ಮನಃಪರಿಣಾಮಿ ಮಿಶ್ರಣಗಳನ್ನು ಒಳಗೊಂಡಿರುತ್ತವೆ ಮತ್ತು ಉಲ್ಲಾಸಕಾರಕವಾಗಿ ಸೇವಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ ಅಥವಾ ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ಆಧ್ಯಾತ್ಮಿಕ ಆಚರಣೆಗಳಲ್ಲಿ ಸೇವಿಸಲ್ಪಡುತ್ತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ತಯಾರಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ವಸ್ತುಗಳನ್ನು ಮತ್ತು ಕಟ್ಟಡಗಳನ್ನು ಮುರಿಯುತ್ತವೆ, ಮತ್ತು ಮಾನವರ ಮತ್ತು ಇತರ ಪ್ರಾಣಿಗಳ ಗಣನೀಯ ಪ್ರಮಾಣದ ರೋಗಕಾರಕಗಳಾಗಿ ಬದಲಾಗುತ್ತವೆ. ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ರೋಗಗಳ ಕಾರಣದಿಂದಾಗಿ ಬೆಳೆಗಳ ನಾಶ (ಉದಾಹರಣೆಗೆ, ರೈಸ್ ಬ್ಲಾಸ್ಟ್ ರೋಗ) ಅಥವಾ ಆಹಾರ ಕೆಡುವಿಕೆಗಳು ಮಾನವರ ಆಹಾರ ಉತ್ಪಾದನಗಳು ಮತ್ತು ಸ್ಥಳೀಯ ಆರ್ಥಿಕ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳ ಮೇಲೆ ಬೃಹತ್ ಪ್ರಮಾಣದ ಪರಿಣಾಮವನ್ನು ಹೊಂದಿರುತ್ತವೆ.
ಶಿಲೀಂಧ್ರ ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಇದು ವಿಭಿನ್ನವಾದ ಪರಿಸರ ವ್ಯವಸ್ಥೆಗಳಲ್ಲಿ, ಜೀವನ ಚಕ್ರದ ತಂತ್ರಗಾರಿಕೆಗಳಲ್ಲಿ, ಮತ್ತು ಏಕೈಕ-ಕೋಶೀಯ ಜಲಜೀವಿ ಚಿಟ್ರಿಡ್‌ಗಳಿಂದ ದೊಡ್ಡ ಮಶ್ರೂಮ್‌ಗಳವರೆಗಿನ ಮಾರ್ಫಿಲೊಜಿಗಳ ಜೊತೆಗೆ ವಿಷಗಳ ವಿಭಿನ್ನತೆಯ ಬೃಹತ್ ಪ್ರಮಾಣವನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುತ್ತದೆ. ಆದಾಗ್ಯೂ, ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ನಿಜವಾದ ಜೈವಿಕವೈವಿಧ್ಯತೆಯ ಅತ್ಯಂತ ಚಿಕ್ಕದು ಎಂದು ತಿಳಿಯಲ್ಪಟ್ಟಿರುವ ಶಿಲೀಂಧ್ರವು ೧.೫ ಮಿಲಿಯನ್ ಜಾತಿಗಳಲ್ಲಿ ಕಂಡುಬರುತ್ತದೆ ಎಂದು ಅಂದಾಜಿಸಲಾಗಿದೆ, ಅದರಲ್ಲಿ ಸುಮಾರು ೫% ಜಾತಿಗಳು ವಿಧ್ಯುಕ್ತವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ೧೮ ನೆಯ ಮತ್ತು ೧೯ ನೆಯ ಶತಮಾನದ ನಂತರದಿಂದ ಕಾರ್ಲ್ ಲಿನ್ನೌಸ್, ಕಿಸ್ಚಿಯನ್ ಹೆಂಡ್ರಿಕ್ ಪೆರ್ಸೂನ್, ಮತ್ತು ಎಲಿಯಾಸ್ ಮಗ್ನುಸ್ ಫ್ರೈಸ್‌ರ ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣದ ಕಾರ್ಯಗಳಿಂದ ಪ್ರಾರಂಭವಾಗಲ್ಪಟ್ಟವು, ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳು ಅವರ ಮೊರ್ಫಿಲಿಜಿ (ಅಂದರೆ, ಬೀಜಕಗಳ ಬಣ್ಣಗಳು ಅಥವಾ ಸೂಕ್ಷ್ಮದರ್ಶಕೀಯ ಲಕ್ಷಣಗಳಂತಹ ಗುಣಲಕ್ಷಣಗಳು) ಅಥವಾ ಶರೀರವಿಜ್ಞಾನಗಳಿಗೆ ಅನುಗುಣವಾಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿವೆ. ಅಣುಗಳ ಆನುವಂಶಿಕತೆಯಲ್ಲಿನ ಸಂಶೋಧನೆಗಳು ಜೀವವರ್ಗೀಕರಣದಲ್ಲಿ ಡಿಎನ್ಎ ವಿಶ್ಲೇಷಣೆಯನ್ನು ಒಳಗೊಳ್ಳುವ ಮಾರ್ಗವನ್ನು ತೆರೆಯಿತು, ಅದು ಕೆಲವು ವೆಳೆ ರೂಪವಿಜ್ಞಾನ ಮತ್ತು ಇತರ ಒಡಂಬಡಿಕೆಗಳ ಮೇಲೆ ಆಧಾರಿತವಾಗಿ ಐತಿಹಾಸಿಕ ಗುಂಪುಮಾಡುವಿಕೆಗೆ ಸವಾಲನ್ನು ಎಸೆಯಿತು. ನಂತರದ ದಶಕದಲ್ಲಿ ಪ್ರಕಟಿಸಲ್ಪಟ್ಟ ಜಾತಿವಿಕಸನೀಯ ಅಧ್ಯಯನಗಳು ಕಿಂಗ್ಡಮ್ ಶಿಲೀಂಧ್ರಗಳ ವಿಂಗಡನೆಯನ್ನು ಪುನರ್‌ನಿರ್ಮಾಣ ಮಾಡಿತು, ಅದು ಒಂದು ಉಪಕಿಂಗ್‌ಡಮ್, ಏಳು ಫೈಲ, ಮತ್ತು ಹತ್ತು ಉಪಫೈಲಾ ಆಗಿ ವಿಂಗಡಿಸಲ್ಪಟ್ಟಿತು.
