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Chryseobacterium ( الألمانية )

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Chryseobacterium ist eine Gattung von Bakterien. Der Gattungsname besteht aus dem lateinischen Wort bacterium und dem griechischen Wort chryseos, was so viel wie „golden“ bedeutet und auf die Farbe der einzelnen Kolonien deutet.

Merkmale

Die Zellen der verschiedenen Arten von Chryseobacterium sind meist ca. 0,5 µm breit, die Länge liegt meist im Bereich von 1 bis 3 µm[1]. Auch pleomorphe und filamentöse Formen treten auf. Endosporen werden nicht gebildet.

Die meisten Stämme wachsen optimal bei Temperaturen zwischen 15 bis 30 °C, pH-Werten von 6–8 und 0–1 % Natriumchlorid, einige tolerieren auch höhere NaCl-Gehalte (halotolerant).

Die Kolonien können, je nach Art, Farben von schwachen Gelb bis zu ausgeprägtem Orange aufweisen, was an Flexirubin-ähnlichen Pigmenten liegt. Die Bakterien sind unbeweglich, auch eine gleitende Bewegung, die bei vielen Arten der Familie Flavobacteriaceae beobachtet wird, tritt nicht auf.[1] Der Katalasetest und der Oxidase-Test verläuft positiv. Nitrat wird von den meisten Arten nicht zu Nitrit reduziert. Die meisten Arten sind aerob, einige Arten zeigen auch anaerobischen Stoffwechsel mit Nitrat als den terminalen Elektronenakzeptor. Hierzu zählen Chryseobacterium gleum und C. indologenes.[2][3] Menachinon-6 (MK-6) ist das dominierende Menachinon.[1] Die Unterart Chryseobacterium aquaticum subsp. greenlandense wurde im Gröndlandeis im Jahr 2010 in einer Tiefe von 3042 Meter gefunden.[4] Bei den Zellen handelt es sich um extrem kleine Stäbchen mit 0,6–1,2 µm Länge und Breiten zwischen 0,4 und 0,5 µm. Das Bakterium toleriert extrem niedrige Temperaturen, hohen Druck und zeigt nur unter geringen Sauerstoffgehalt (microaerophil) Wachstum. Aufgrund dessen ist das Bakterium auch für die Astrobiologie von Interesse, da z. B. auf dem Jupitermond Europa (Mond) unter einer mehreren Kilometer dicken Eisschicht ähnliche Bedingungen herrschen könnten. Zuerst wurde dem Bakterium eine eigene Art zugeschrieben und unter dem Namen Chryseobacterium greenlandenseis geführt. Aufgrund weiterer genetischer Untersuchungen wurde es im Jahr 2020 als Unterart zu Chryseobacterium aquaticum gestellt.[5]

Systematik

Die Gattung Chryseobacterium wurde aus sechs Arten der Gattung Flavobacterium im Jahr 1994 gegründet. Diese Arten unterscheiden sich klar von der Typusart Flavobacterium aquatile.[6] Es handelt sich um die Arten: Chryseobacterium balustinum, C. gleum, C. indologenes, C. indoltheticum, C. meningosepticum und C. scophthalmum. Als Typusart wurde Chryseobacterium gleum gewählt. Die Art Chryseobacterium meningosepticum (King 1959) Vandamme et al. 1994 wurde im Jahr 2005 zu der neu erstellten Gattung Elizabethkingia verschoben.[7]

Im Dezember 2021 waren über 100 Arten bekannt. Es folgt eine Auswahl der in der Gattung geführten Arten (Juli 2018):[8]

Medizin

Die Art Chryseobacterium indologenes kann im Krankenhaus über betroffene Inkubator-, Respirator-, Vernebler und Waschflüssigkeiten bereits erkrankte und somit immungeschwächte Menschen befallen. C. indologenes ist, wie auch die in früher der gleichen Gattung stehende Art Elizabethkingia meningoseptica, im Allgemeinen resistent gegen die in der Regel bei gramnegativen Bakterien genutzten Antibiotika (z. B. β-Lactame). Einsetzbar sind Trimethoprim-Sulfamethoxazol, Rifampicin und Gyrasehemmer.[9]

Einzelnachweise

  1. a b c Michael Goodfellow u. a. (Hrsg.): Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. 2. Auflage, Band 5: The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes. Springer, New York 2012, ISBN 978-0-387-95042-6.
  2. B. Holmes, R. J. Owen, T. A. McMeekin: Genus Flavobacterium. In: Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. 1. Auflage, Band 1: Gram-negative Bacteria of general, medical, or industrial importance. Williams & Wilkins, Baltimore 1984, S. 353–361.
  3. B. Holmes u. a.: Flavobacterium gleum, a new species found in human clinical specimens. In: International Journal of Systematic Bacteriology, Band 34, 1984, Nr. 1, S. 21–25. doi:10.1099/00207713-34-1-21
  4. Jennifer Loveland-Curtze, Vanya Miteva, Jean Brenchley: Novel ultramicrobacterial isolates from a deep Greenland ice core represent a proposed new species, Chryseobacterium greenlandense sp. nov. In: Extremophiles. 14, 2010, S. 61–69, doi:10.1007/s00792-009-0287-6.
  5. García López et al.: Analysis of 1,000 Type-Strain Genomes Improves Taxonomic Classification of Bacteroidetes. In: Frontiers in Microbioly (2019). Ausgabe 10, S. 2083. doi:10.3389/fmicb.2019.02083
  6. P. Vandamme u. a.: New perspectives in the classification of the Flavobacteria: description of Chryseobacterium gen. nov., Bergeyella gen. nov., and Empedobacter nom. Rev. In: International Journal of Systematic Bacteriology, Band 44, Nr. 4, S. 827–831. doi:10.1099/00207713-44-4-827
  7. Kwang Kyu Kim, Myung Kyum Kim, Ju Hyoung Lim, Hye Yoon Park & Sung-Taik Lee: Transfer of Chryseobacterium meningosepticum and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and Elizabethkingia miricola comb. nov. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2005, Band 55, S. 1287–1293. doi:10.1099/ijs.0.63541-0
  8. Systematik nach: J.P. Euzéby: List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) -Chryseobacterium (Stand: 17. Juli 2018)
  9. Gholamreza Darai u. a.: Lexikon der Infektionskrankheiten des Menschen: Erreger, Symptome, Diagnose, Therapie und Prophylaxe. Springer, New York 2003, ISBN 978-3-540-44168-7.
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Chryseobacterium: Brief Summary ( الألمانية )

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Chryseobacterium ist eine Gattung von Bakterien. Der Gattungsname besteht aus dem lateinischen Wort bacterium und dem griechischen Wort chryseos, was so viel wie „golden“ bedeutet und auf die Farbe der einzelnen Kolonien deutet.

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Chryseobacterium ( الإنجليزية )

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Chryseobacterium is a genus of Gram-negative bacteria. Chryseobacterium species are chemoorganotrophic, rod shape gram-negative bacteria. Chryseobacterium form typical yellow-orange color colonies due to flexirubin-type pigment. The genus contains more than 100 described species from diverse habitats, including freshwater sources, soil, marine fish, and human hosts.[2]

History

The genus Chryseobacterium was originally created in 1994 by Vandamme et al.[3] for six bacterial taxa that, at that time, were classified as members of the genus Flavobacterium: F. balustinum, F. indologenes, F. gleum, F. meningosepticum, F. indoltheticum, and F. scophthalmum. In 2005 an additional genus, Elizabethkingia, was created for two species within the genus Chryseobacterium; namely, C. meningosepticum and C. miricola.[4] In 2002 standards and guidelines for description of novel taxa in the family of Flavobacteriaceae were published by Bernardet et al.[5] By 2006, the genus Chryseobacterium had expanded to 10 species, by 2014 more than 60 species[6] and currently more than 100.

Ecology

Chryseobacterium spp. were recovered from soils, plant roots, flowers, decaying plant material and maple sap. Some plant-associated Chryseobacterium strains are able to inhibit plant pathogenic fungi. Chryseobacterium spp. were also recovered from freshwater creeks, lakes, their sediments, water cooling systems, drinking water, lactic acid beverages, beer bottling plants, bioreactor sludge, polluted soil, marine sediment and permafrost.[6] Chryseobacterium spp. are associated with a multitude of animals - they have been detected in the midgut of mosquitos, within cockroach guts, millipede feces, and penguin guano, gut homogenates of freshwater copepods, bird feathers, cow's milk, raw meats and chicken. Chryseobacterium spp. were recovered from the mucus of apparently healthy fish, however sometimes they are considered as a spoilage organism.[6] Three novel cold-tolerant species of Chryseobacterium, C. oranimense C. haifense, and C. bovis, have been detected in raw milk in Israel.[7]

Pathogenesis

The most pathogenic Flavobacterium spp., Chryseobacterium meningosepticum, which caused numerous infections, was reclassified to the genus Elizabethkingia.[4] Chryseobacterium indologenes although ubiquitous in nature, mainly found in soil and water, is an uncommon human pathogen. However, in rare cases it can cause serious infections, particularly among the immunocompromised.[8] Most of the time infections are hospital acquired, often associated with immunosuppression or indwelling catheters. It has been reported as the causative agent in bacteremia, peritonitis, pneumonia, empyema, pyelonephritis, cystitis, meningitis and central venous catheter-associated infections. The numbers of reported C. indologenes infections are increasing. The majority of reported infections have been from Taiwan and only about 10% have been outside of Asia. A few reports have come from Australia, India, Europe and the USA.[8] C. indologenes is also pathogenic to the soft tick, whereas other Chryseobacterium spp. were recovered from diseased turtles, frogs and fish, in particularly C. scophthalmum, C. joostei, C. piscicola, C. chaponense, C. viscerum and C. oncorhynchi, C. aahli, C. hominis, C. shigense as well as C. indologenes which is associated with human diseases.[6]

Certain Chryseobacterium species were reported as having unusual matrix digesting properties, being able to degrade most difficult collagenous matrices, such as feathers or exoskeletons. These properties are likely mediated through the action of specific chitinases and collagenase-like metalloproteases. Some of the species, such as Chryseobacterium nematophagum were shown to be able to infect, kill and ultimately consume all nematode tissues, including the normally highly insoluble cuticular exoskeleton.[9] Chitinase, gelatinase and collagenase metalloprotease activities have been linked to Chryseobacterium gliding motility exerted through type IX secretion systems. Indeed, some of these enzymes possess C-terminal type IX secretion signals.[10] Chryseobacterium themselves have neither collagen nor chitin proteins or structures. Chryseobacterium species belong to the Bacteriodetes phylum, members of which are being increasingly describes as having unusually linked motility and secretory system.[9][10]

Botulinum neurotoxin-like (BoNT-like) toxins were detected in the genome of Chryseobacterium piperi str. CTM and they present a highly divergent group of BoNT-like toxins. One of the predicted C. piperi BoNT-like toxins induced necrotic cell death in human kidney cells, but was not found to cleave common SNARE substrates of BoNTs.[11]

Antibiotic resistance

Chryseobacterium spp. are inherently resistant to a wide spectrum of antibiotics, including tetracyclines, erythromycin, linezolid, polymyxins, aminoglycosides, chloramphenicol, and many beta-lactams, while also being intermediately sensitive to vancomycin and clindamycin and vary in their sensitivity to trimethoprim-sulfamethoxazole.[6]

Species

Species include:[1]

See also

References

  1. ^ a b Euzéby JP, Parte AC. "Chryseobacterium". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved June 29, 2021.
  2. ^ Matu A, Lum Nde A, Oosthuizen L, Hitzeroth A, Badenhorst M, Duba L, Gidaga M, Klinck J, Kriek IM, Lekoma PJ, Nel L, Dos Ramos SM, Rossouw J, Salomane N, Segone N, Serobe S, Tiyani T, Hugo CJ, Newman JD (January 2019). "Chryseobacterium Type Strains". Microbiology Resource Announcements. 8 (1): e01518–18. doi:10.1128/MRA.01518-18. PMC 6318376. PMID 30637405.
  3. ^ Vandamme P, Bernardet JF, Segers P, Kersters K, Holmes B (1994-10-01). "NOTES: New Perspectives in the Classification of the Flavobacteria: Description of Chryseobacterium gen. nov., Bergeyella gen. nov., and Empedobacter nom. rev". International Journal of Systematic Bacteriology. 44 (4): 827–831. doi:10.1099/00207713-44-4-827. ISSN 0020-7713.
  4. ^ a b Kim KK, Kim MK, Lim JH, Park HY, Lee ST (May 2005). "Transfer of Chryseobacterium meningosepticum and Chryseobacterium miricola to Elizabethkingia gen. nov. as Elizabethkingia meningoseptica comb. nov. and Elizabethkingia miricola comb. nov". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 55 (Pt 3): 1287–93. doi:10.1099/ijs.0.63541-0. PMID 15879269.
  5. ^ Bernardet JF, Nakagawa Y, Holmes B, et al. (Subcommittee on the taxonomy of Flavobacterium and Cytophaga-like bacteria of the International Committee on Systematics of Prokaryotes) (May 2002). "Proposed minimal standards for describing new taxa of the family Flavobacteriaceae and emended description of the family". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (Pt 3): 1049–70. doi:10.1099/00207713-52-3-1049. PMID 12054224.
  6. ^ a b c d e Loch TP, Faisal M (May 2015). "Emerging flavobacterial infections in fish: A review". Journal of Advanced Research. 6 (3): 283–300. doi:10.1016/j.jare.2014.10.009. PMC 4522593. PMID 26257926.
  7. ^ Hantsis-Zacharov E, Shakéd T, Senderovich Y, Halpern M (November 2008). "Chryseobacterium oranimense sp. nov., a psychrotolerant, proteolytic and lipolytic bacterium isolated from raw cow's milk". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 58 (Pt 11): 2635–9. doi:10.1099/ijs.0.65819-0. PMID 18984706.
  8. ^ a b Mukerji R, Kakarala R, Smith SJ, Kusz HG (April 2016). "Chryseobacterium indologenes: an emerging infection in the USA". BMJ Case Reports. 2016: bcr2016214486. doi:10.1136/bcr-2016-214486. PMC 4840731. PMID 27053540.
  9. ^ a b Page AP, Roberts M, Félix MA, Pickard D, Page A, Weir W (February 2019). "The golden death bacillus Chryseobacterium nematophagum is a novel matrix digesting pathogen of nematodes". BMC Biology. 17 (1): 10. doi:10.1186/s12915-019-0632-x. PMC 6394051. PMID 30813925.
  10. ^ a b McBride MJ, Zhu Y (January 2013). "Gliding motility and Por secretion system genes are widespread among members of the phylum bacteroidetes". Journal of Bacteriology. 195 (2): 270–8. doi:10.1128/JB.01962-12. PMC 3553832. PMID 23123910.
  11. ^ Mansfield MJ, Doxey AC (June 2018). "Genomic insights into the evolution and ecology of botulinum neurotoxins". Pathogens and Disease. 76 (4). doi:10.1093/femspd/fty040. PMID 29684130.
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Chryseobacterium: Brief Summary ( الإنجليزية )

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Chryseobacterium is a genus of Gram-negative bacteria. Chryseobacterium species are chemoorganotrophic, rod shape gram-negative bacteria. Chryseobacterium form typical yellow-orange color colonies due to flexirubin-type pigment. The genus contains more than 100 described species from diverse habitats, including freshwater sources, soil, marine fish, and human hosts.

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Chryseobacterium ( الإسبانية، القشتالية )

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Chryseobacterium es un género de bacterias que en medio sólido producen colonias color amarillo debido a la producción de pigmentos tipo flexirrubina.[1]

Generalmente tienen forma de bastón, miden 0.5 μm de ancho y 1-3 μm de largo, aunque se han encontrado especies que miden 0.2-0.4 µm y 0.4-0.7 µm de largo.[2]​ Son Gram negativas, no producen esporas y no tienen motilidad. Son aerobios obligados y quimioorganotrofos. Son catalasa y oxidasa positivas, y no reducen nitrito o nitrato.[1][2]​ La mayoría de las especies ambientales crecen adecuadamente a 30 °C, sin embargo, también existen algunas psicrotolerantes como: C. joostei, C. vrystaatense, C. daecheongense, etc. Las especies que se han aislado de ambientes hospitalarios crecen adecuadamente a 30-37 °C.

Hábitat

La mayoría de las especies de Chryseobacterium se han aislado de suelo y ambientes marinos, siendo el primero en donde se encuentran mayormente.[2]​ Las especies que se han encontrado en rizosfera son: C. formosense, Chryseobacterium soldanellicola y Chryseobacterium taeanense.[2][3]​ Nuevas especies de Chryseobacterium se han encontrado en rizosferas de plantas de arenales: Chryseobacterium elymi sp. nov., Chryseobacterium hagamense sp. nov., Chryseobacterium lathyri sp. nov. Y Chryseobacterium rhizosphaerae sp. nov.[4]​ También algunas especies se han encontrado en los hospitales, incluso en las superficies de tubos y catéteres de pacientes. Chryseobacterium no es comensal normal del microbioma humano.[2]

Patogenicidad y resistencia a antibióticos

Las especies más relevantes clínicamente son Chryseobacterium indologenes y Chryseobacterium gleum por su relación con bacteremias.[2]​ También se han aislado especies de medios acuáticos, incluso algunas son patógenas para los peces.[5]

La mayoría de las especies del género Chryseobacterium son resistentes a una gran variedad de antimicrobianos.[1]​ Las especies C. indologenes y C. gleum son capaces de sintetizar β-lactamasas, las cuales les dan resistencia a antibióticos como las cefalosporinas.[2]​ También se ha reportado que algunas especies pueden ser resistentes a tetraciclinas, eritromicina y linezolid y pueden tener sensibilidad a clindamicina y vancomicina.[2]

Referencias

  1. a b c VANDAMME, P.; BERNARDET, J.-F.; SEGERS, P.; KERSTERS, K.; HOLMES, B. (1994). «NOTES: New Perspectives in the Classification of the Flavobacteria: Description of Chryseobacterium gen. nov., Bergeyella gen. nov., and Empedobacter nom. rev.». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 44 (4): 827-831. ISSN 1466-5026. doi:10.1099/00207713-44-4-827. Consultado el 10 de octubre de 2019.
  2. a b c d e f g h Bernardet, Jean-François; Hugo, Celia J.; Bruun, Brita (2015). Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria (en inglés). American Cancer Society. pp. 1-35. ISBN 9781118960608. doi:10.1002/9781118960608.gbm00301. Consultado el 10 de octubre de 2019.
  3. Kämpfer, Peter; McInroy, John A.; Glaeser, Stefanie P. (1 de febrero de 2015). «Chryseobacterium rhizoplanae sp. nov., isolated from the rhizoplane environment». Antonie van Leeuwenhoek (en inglés) 107 (2): 533-538. ISSN 1572-9699. doi:10.1007/s10482-014-0349-3. Consultado el 10 de octubre de 2019.
  4. Cho, Sung-Heun; Lee, Kang Seon; Shin, Dong-Sung; Han, Ji-Hye; Park, Ki Seok; Lee, Cheon Hee; Park, Kwan Ha; Kim, Seung Bum (1 de abril de 2010). «Four new species of Chryseobacterium from the rhizosphere of coastal sand dune plants, Chryseobacterium elymi sp. nov., Chryseobacterium hagamense sp. nov., Chryseobacterium lathyri sp. nov. and Chryseobacterium rhizosphaerae sp. nov.». Systematic and Applied Microbiology 33 (3): 122-127. ISSN 0723-2020. doi:10.1016/j.syapm.2009.12.004. Consultado el 10 de octubre de 2019.
  5. Bernardet, Jean-François; Hugo, Celia; Bruun, Brita (2006). The Prokaryotes. Springer New York. pp. 638-676. ISBN 9780387254975. Consultado el 10 de octubre de 2019.
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Chryseobacterium: Brief Summary ( الإسبانية، القشتالية )

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Chryseobacterium es un género de bacterias que en medio sólido producen colonias color amarillo debido a la producción de pigmentos tipo flexirrubina.​

Generalmente tienen forma de bastón, miden 0.5 μm de ancho y 1-3 μm de largo, aunque se han encontrado especies que miden 0.2-0.4 µm y 0.4-0.7 µm de largo.​ Son Gram negativas, no producen esporas y no tienen motilidad. Son aerobios obligados y quimioorganotrofos. Son catalasa y oxidasa positivas, y no reducen nitrito o nitrato.​​ La mayoría de las especies ambientales crecen adecuadamente a 30 °C, sin embargo, también existen algunas psicrotolerantes como: C. joostei, C. vrystaatense, C. daecheongense, etc. Las especies que se han aislado de ambientes hospitalarios crecen adecuadamente a 30-37 °C.

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