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فيروسات خمرية

Totiviridae

Totiviridae ( الكتالونية )

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Totiviridae és una família de virus d’ARN bicatenari.

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Totiviridae: Brief Summary ( الكتالونية )

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Totiviridae ( الألمانية )

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Totiviridae ist eine Familie von RNA-Viren mit doppelsträngigem RNA-Genom.

Eigenschaften

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Schematischer Aufbau eines Vrions der Familie Totiviridae (Querschnitt und Seitenansicht)

Die Viruspartikel (Virionen) der Totiviridae besitzen ein ikosaedrisches Kapsid ohne Virushülle von etwa 36 bis 40 nm Durchmesser mit einer Triangulationszahl von eins an der inneren Kapsidschicht und dreizehn an der äußeren.[3]

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Genomkarte der Totiviridae

Die Genome der Totiviren lassen sich in zwei Typen einteilen: mit überlappenden Genen oder ohne Überlappung.[4] Das Genom besteht aus einer linearen doppelsträngigen RNA von 4,6 bis 6,7 kbp (Kilobasenpaaren) mit zwei offenen Leserastern (gag und pol), die unter der Kontrolle eines RNA-Pseudoknotens hergestellt werden.[4] Im ersten Typ werden die Proteine als Fusionsprotein aus beiden etwa 210 Basenpaare überlappenden Genen über eine + 1 oder - 1 Leserasterverschiebung hergestellt, während im zweiten Typ die Gene nicht überlappen und einzeln translatiert werden.[4] Das Gag-Protein ist das Kapsidprotein und das Pol-Protein ist eine RNA-Polymerase von etwa 190 Kilodalton.[3] Das Kapsid besteht aus dem Gag-Protein von etwa 100 Kilodalton, welches nach Acetylierung des N-Terminus zunächst asymmetrische Dimere bildet.[3][4] Die zusammengelagerten Kapsidproteine binden die RNA-abhängige RNA-Polymerase Pol, welche wiederum die RNA bindet, wodurch sich ein neugebildetes Virion zusammenfügt.[4] Manche Totiviren besitzen ein drittes offenes Leseraster. Totiviren sind vermutlich unabhängig von anderen RNA-Viren mit doppelsträngigem Genom aus RNA-Viren mit einzelsträngigem Genom positiver Polarität entstanden (s. u.).[3]

Systematik

Innere Systematik

Die folgende Gliederung in fünf Gattungen (Genera) und 28 Spezies der Totiviridae folgt den Vorgaben des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand März 2020:[1]

  • Familie Totiviridae
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Replikationszyklus von Saccharomyces cerevisiae virus L-A
  • Genus Totivirus
  • Spezies Saccharomyces cerevisiae virus L-A (Typus)
  • Spezies Saccharomyces cerevisiae virus LBCLa
  • Spezies Scheffersomyces segobiensis virus L
  • Spezies Tuber aestivum virus 1
  • Spezies Ustilago maydis virus H1
  • Spezies Xanthophyllomyces dendrorhous virus L1A
  • Spezies Xanthophyllomyces dendrorhous virus L1B
  • Spezies Trichomonas vaginalis virus 1 (Typus)
  • Spezies Trichomonas vaginalis virus 2
  • Spezies Trichomonas vaginalis virus 3
  • Spezies Trichomonas vaginalis virus 4
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Kryo-EM von HvV190S-Virionen
  • Spezies Aspergillus foetidus slow virus 1
  • Spezies Beauveria bassiana victorivirus 1
  • Spezies Chalara elegans RNA Virus 1
  • Spezies Coniothyrium minitans RNA virus
  • Spezies Epichloe festucae virus 1
  • Spezies Gremmeniella abietina RNA virus L1
  • Spezies Helicobasidium mompa totivirus 1-17
  • Spezies Helminthosporium victoriae virus 190S (HvV190S, Typus)
  • Spezies Magnaporthe oryzae virus 1
  • Spezies Magnaporthe oryzae virus 2
  • Spezies Rosellinia necatrix victorivirus 1
  • Spezies Sphaeropsis sapinea RNA virus 1
  • Spezies Sphaeropsis sapinea RNA virus 2
  • Spezies Tolypocladium cylindrosporum virus 1

Äußere Systematik

Koonin et al haben 2015 die Totiviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) einer von ihnen postulierten Supergruppe‚„Picornavirus-like superfamily“ zugeordnet.[5] Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch – wie die Birnaviridae – doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden. Dieser Vorschlag ist inzwischen abgelöst durch die Master species List #35 des ICTV vom März 2020[1] Eine Gegenüberstellung der Kladogramme findet sich bei Picornavirales §ICTV Master Species List #35.

Einzelnachweise

  1. a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ICTV Master Species List 2018b v1 MSL #34, Feb. 2019
  3. a b c d D. M. Knipe, Peter M. Howley, D. E. Griffin, (Hrsg.): Fields Virology. 5. Auflage, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7.
  4. a b c d e M. A. Hartley, C. Ronet, H. Zangger, S. M. Beverley, N. Fasel: Leishmania RNA virus: when the host pays the toll. In: Frontiers in cellular and infection microbiology. Band 2, 2012, S. 99, . doi:10.3389/fcimb.2012.00099. PMID 22919688. PMC 3417650 (freier Volltext).
  5. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology vom Mai 2015; 479-480. 2–25, Epub 12. März 2015, PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806
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Totiviridae: Brief Summary ( الألمانية )

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Totiviridae ist eine Familie von RNA-Viren mit doppelsträngigem RNA-Genom.

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Totiviridae ( الإنجليزية )

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Totiviridae is a family of double-stranded RNA viruses. Giardia lamblia, leishmania, trichomonas vaginalis, and fungi serve as natural hosts. The name of the group derives from Latin toti which means undivided or whole. There are 28 species in this family, assigned to 5 genera.[1][2]

Structure

Viruses in the family Totiviridae are non-enveloped, double-stranded RNA viruses with icosahedral geometries, and T=2 symmetry. The virion consists of a single capsid protein and is about 40 nanometers in diameter.[1]

Genome

Genome of family Totiviridae

The genome is composed of a monopartite, linear double-stranded RNA molecule of 4.6–6.7 kilobases. It contains two overlapping open reading frames (ORF) – gag and pol – which respectively encode the capsid protein and the RNA-dependent RNA polymerase. Some totiviruses contain a third small potential ORF.[1]

Life cycle

Life cycle of S. cerevisiae virus L-A

Viral replication is cytoplasmic. Replication follows the double-stranded RNA virus replication model. Double-stranded RNA virus transcription is the method of transcription. Translation takes place by -1 ribosomal frameshifting, +1 ribosomal frameshifting, viral initiation, and RNA termination-reinitiation. The virus exits the host cell by cell-to-cell movement. Giardia lamblia protozoa, leishmania protozoa, protozoan trichomonas vaginalis, and fungi serve as the natural host.[1]

Taxonomy

The family Totiviridae has five genera:[2]

Examples

An example of fungal totivirus is the L-A helper virus, a cytoplasmic virus found primarily in Saccharomyces cerevisiae.[3]

References

  1. ^ a b c d "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  2. ^ a b "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 13 May 2021.
  3. ^ Rodríguez-Cousiño, Nieves; Esteban, Rosa (9 December 2016). "Analysis of L-A-2, the helper virus of K2 killer toxin-encoding M2 dsRNA, and of L-BC variants from wine yeast strain populations provides new insights into the relationship and evolution of dsRNA viruses of yeast" (PDF). Appl. Environ. Microbiol. 83 (4). doi:10.1128/AEM.02991-16. PMC 5288835. PMID 27940540 – via aem.asm.org.

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Totiviridae: Brief Summary ( الإنجليزية )

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Totiviridae is a family of double-stranded RNA viruses. Giardia lamblia, leishmania, trichomonas vaginalis, and fungi serve as natural hosts. The name of the group derives from Latin toti which means undivided or whole. There are 28 species in this family, assigned to 5 genera.

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Totiviridae ( الإسبانية، القشتالية )

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Totiviridae es una familia de virus que infectan protozoos y microhongos. Poseen un genoma con ARN de cadena doble como ácido nucleico, por lo que pertenecen al Grupo III de la Clasificación de Baltimore. Incluye cinco géneros y 28 especies.[1][2]

Taxonomía

Se han descrito los siguientes géneros:[1]

Descripción

Los virus de la familia Totiviridae son virus de ARN bicatenario que tienen una cápside con geometrías icosaédricas y simetría T = 2. El virión consta de una sola proteína de la cápside y tiene unos 40 nanómetros de diámetro.[1][2]

El genoma está compuesto por una molécula lineal de ARN de 4,6 a 6,7 kilobases. Contiene 2 marcos de lectura abiertos (ORF) superpuestos: gag y pol, que codifican respectivamente las proteínas de la cápside y la ARN polimerasa dependiente de ARN. Algunos totivirus contienen un tercer marco de lectura abierto potencial pequeño.[1][2]

La replicación viral se produce en el citoplasma. La replicación sigue el modelo de replicación de los virus ARN bicatenario. La transcripción de virus de ARN bicatenario es el método de transcripción. La traducción tiene lugar por cambio de marco de ribosoma -1, cambio de marco de marco ribosómico +1, iniciación viral y terminación-reinicio del ARN. El virus sale de la célula huésped por movimiento de célula a célula. Los protozoos y los microhongos sirven como huéspedes naturales.[1][2]

Un ejemplo de totivirus fúngico es el virus auxiliar LA, un virus citoplasmático que se encuentra principalmente en la levadura Saccharomyces cerevisiae.[3]

Referencias

  1. a b c d e ICTV. «Virus Taxonomy: 2014 Release». Consultado el 15 de junio de 2015.
  2. a b c d «Viral Zone». ExPASy. Consultado el 15 de junio de 2015.
  3. https://aem.asm.org/content/aem/early/2016/12/05/AEM.02991-16.full.pdf
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Totiviridae: Brief Summary ( الإسبانية، القشتالية )

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Totiviridae es una familia de virus que infectan protozoos y microhongos. Poseen un genoma con ARN de cadena doble como ácido nucleico, por lo que pertenecen al Grupo III de la Clasificación de Baltimore. Incluye cinco géneros y 28 especies.​​

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Totiviridae ( الروسية )

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Порядок: incertae sedis
Семейство: Totiviridae
Международное научное название

Totiviridae

Группа по Балтимору

III: дцРНК-вирусы

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Систематика
на Викивидах
Commons-logo.svg
Изображения
на Викискладе
NCBI 11006EOL 8063

Totiviridae (лат.) — семейство РНК-вирусов, инфицирующих грибы и протисты. Содержат линейную двухцепочечную РНК длиной 4,6—6,7 kb.

По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на май 2016 г. в семейство включают 5 родов[2]:

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Totiviridae: Brief Summary ( الروسية )

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Totiviridae (лат.) — семейство РНК-вирусов, инфицирующих грибы и протисты. Содержат линейную двухцепочечную РНК длиной 4,6—6,7 kb.

По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на май 2016 г. в семейство включают 5 родов:

Род Giardiavirus (1 вид) Giardia lamblia virus Род Leishmaniavirus (2 вида) Типовой вид Leishmania RNA virus 1 Род Totivirus (7 видов) Типовой вид Saccharomyces cerevisiae virus L-A Род Trichomonasvirus (4 вида) Типовой вид Trichomonas vaginalis virus 1 Род Victorivirus (14 видов) Типовой вид Helminthosporium victoriae virus 190S
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整體病毒科 ( الصينية )

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整體病毒科 病毒分类 族: Group III (dsRNA) : 整體病毒屬
梨形鞭毛蟲病毒屬
利什曼原蟲病毒屬

整體病毒科Totiviridae(全病毒科)

分類

  • 整體病毒屬 (Totivirus,全病毒屬)
  • 梨形鞭毛蟲病毒屬(Giardiavirus,梨形病毒屬)
  • 利什曼原蟲病毒屬(Leishmaniavirus)
Marburg virus.jpg 這是與病毒相關的小作品。你可以通过编辑或修订扩充其内容。
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整體病毒科: Brief Summary ( الصينية )

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整體病毒科Totiviridae(全病毒科)

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