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Els fibrobàcters (Fibrobacter) són un petit gènere eubacterià que inclou els principals bacteris del rumen, que permeten la degradació de la cel·lulosa vegetal en els animals remugants. És l'únic gènere del seu fílum, Fibrobacteres. El gènere Fibrobacter fou separat del gènere Bacteroides el 1988.[1]
Filogenèticament, el grup més proper és el del gemmatimonadets (veure grup FCB), segons algunes anàlisis genòmics i l'ARNr 16S.
Els fibrobàcters (Fibrobacter) són un petit gènere eubacterià que inclou els principals bacteris del rumen, que permeten la degradació de la cel·lulosa vegetal en els animals remugants. És l'únic gènere del seu fílum, Fibrobacteres. El gènere Fibrobacter fou separat del gènere Bacteroides el 1988.
Filogenèticament, el grup més proper és el del gemmatimonadets (veure grup FCB), segons algunes anàlisis genòmics i l'ARNr 16S.
Fibrobacteres je nedávno identifikovaný malý kmen bakterií, jehož zástupci dříve náležely zejména do rodu Bacteroides (kmen Bacteroidetes). Fibrobacteres zahrnuje mnoho bakterií, vyskytujících se v bachoru přežvýkavců či v útrobách termitů. V obou případech se účastní trávení celulózy.
Fibrobacteres jsou zřejmě příbuzné s kmeny Chlorobi a Bacteroidetes.[1]
Typovým rodem je Fibrobacter.
V tomto článku byl použit překlad textu z článku Fibrobacteres na anglické Wikipedii.
Fibrobacteres je nedávno identifikovaný malý kmen bakterií, jehož zástupci dříve náležely zejména do rodu Bacteroides (kmen Bacteroidetes). Fibrobacteres zahrnuje mnoho bakterií, vyskytujících se v bachoru přežvýkavců či v útrobách termitů. V obou případech se účastní trávení celulózy.
Fibrobacteres jsou zřejmě příbuzné s kmeny Chlorobi a Bacteroidetes.
Typovým rodem je Fibrobacter.
Fibrobacteres es un phylo de Negibacteria.
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Ang Fibrobacteres ay isang uri ng phylum sa bakterya kahariang Protista. Hindi malaman kung saan ito maikakategorya, sa Gram-positive bacteria o Gram-negative bacteria.
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Fibrobacteres е мало бактериско колено кое вклучува многу видови бактерии кои живеат во бурагот (предниот желудник) на преживарите. Тие учествуваат во процесот на разложување на целулозата од растителниот материјал. Членовите на ова колено порано биле категоризирани во други колена, на пример, родот Fibrobacter (единствениот род на Fibrobacteres) бил отстранет од родот Bacteroides во 1988 година.[1]
Иако Fibrobacteres, кое се состои само од еден род Fibrobacter и два вида, моментално е признаено како посебно колено, филогенетските студии базирани на секвенци на протеините RpoC и гираза B, укажуваат на тоа дека видот Fibrobacter succinogenes е сроден со видовите на колената Bacteroidetes и Chlorobi.[2] Видовите од овие три колена се гранаат на иста позиција врз основа на CSIs (анг. conserved signature indels) во голем број на важни протеини.[3] Што е најважно, компаративни геномски студии откриле две CSIs (5-7 аминокиселини вметнати во RpoC протеини и 13-16 аминокиселини вметнати во серин хидроксиметилтрансфераза) и еден специфичен протеин (PG00081) кои уникатно се споделени од сите видови на овие три колена.[4] Овие резултати даваат убедливи докази дека видовите на трите колена имаат заеднички предок и предложено е тие да бидат групирани во суперколеното "FCB".
Моментално прифатената таксономија се заснова на Листата на имиња на прокариотите со евиденција во номенклатурата (анг. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature - LPSN),[5] Националниот центар за биотехнолошки информации (анг. National Center for Biotechnology Information - NCBI)[6] и 16S рРНК-базираното LTP ослободување 123 од Проектот "Животно дрво на сите видови" (анг. The All-Species Living Tree Project).[7]
Забелешки: ♠ Видови кои се наоѓаат во NCBI, но не се наведени во LSPN.
Коленото Fibrobacteres се смета дека е сродно со CFB [Cytophaga-Flavibacterium-Bacteroides]. Единствениот род во ова колено е Fibrobacter кој содржи видови од цревната микрофлора на цицачи како добитокот и свињите.[8] Двата опишани вида од овој род, Fibrobacter succinogenes и Fibrobacter intestinalis се важни членови на фибролитичките микробни заедници во цревата на цицачите.
Молекуларните докази засновани на гени на 16S рРНК изолирани од различни средини укажуваат на тоа дека ова колено е повеќе распространето отколку што порано се мислело.[9][10] Повеќето клонови изолирани од цицачите се групираат заедно со познатите изолати во Fibrobacteres потколено 1. Членовите на Fibrobacteres потколено 2, досега се пронајдени само во цревата на термитите[11] и во некои лебарки.[12] Доминантноста на Fibrobacteres потколено 2 во бактериските заедници кои разградуваат целулоза во цревата на термитот Nasutitermes corniger укажува на тоа дека тие играат важна улога во разградбата на растителниот материјал кај термитите.[13]
Fibrobacteres е мало бактериско колено кое вклучува многу видови бактерии кои живеат во бурагот (предниот желудник) на преживарите. Тие учествуваат во процесот на разложување на целулозата од растителниот материјал. Членовите на ова колено порано биле категоризирани во други колена, на пример, родот Fibrobacter (единствениот род на Fibrobacteres) бил отстранет од родот Bacteroides во 1988 година.
Ang Fibrobacteres ay isang uri ng phylum sa bakterya kahariang Protista. Hindi malaman kung saan ito maikakategorya, sa Gram-positive bacteria o Gram-negative bacteria.
Fibrobacterota is a small bacterial phylum which includes many of the major rumen bacteria, allowing for the degradation of plant-based cellulose in ruminant animals. Members of this phylum were categorized in other phyla. The genus Fibrobacter (the only genus of Fibrobacterota) was removed from the genus Bacteroides in 1988.[2]
Although Fibrobacterota, which consists of a single genus Fibrobacter containing two species, is currently recognized as a distinct phylum, phylogenetic studies based RpoC and Gyrase B protein sequences, indicate that Fibrobacter succinogenes is closely related to the species from the phyla Bacteroidetes and Chlorobi.[3] The species from these three phyla also branch in the same position based upon conserved signature indels in a number of important proteins.[4] Lastly and most importantly, comparative genomic studies have identified two conserved signature indels (a 5-7 amino acid insert in the RpoC protein and a 13-16 amino acid insertion in serine hydroxymethyltransferase) and one signature protein (PG00081) that are uniquely shared by all of the species from these three phyla.[5] All of these results provide compelling evidence that the species from these three phyla shared a common ancestor exclusive of all other bacteria and it has been proposed that they should all recognized as part of a single “FCB”superphylum.[3][5]
Phylogeny of Fibrobacterota.
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LSPN)[12] and the National Center for Biotechnology Information (NCBI).[13]
The phylum Fibrobacterota is considered to be closely related to the CFB [Cytophaga-Flavibacterium-Bacteroidota].[5] The only genus in this phylum is Fibrobacter that contains strains from the guts of many mammals including cattle and pigs.[14] The two described species in this genus namely, Fibrobacter succinogenes and Fibrobacter intestinalis are important members of fibrolytic communities in mammalian guts and have received a lot of attention in recent decades due to the long-standing interest microbes capable of degrading plant fiber.
Molecular evidence based on the amplification of 16rRNA genes from various environments suggest that the phylum is much more widespread than previously thought.[15][16] Most of the clones from mammalian environments group along with the known isolates in what has been called subphylum 1.[16] Members of subphylum 2 however, have so far been found only in the gut of termites.[16][17] and in some litter-feeding cockroaches.[18] The predominance of subphylum 2 in cellulolytic fibre-associated bacterial communities in hindguts of wood-feeding Nasutitermes corniger suggests that they play an important role in the breakdown of plant material in higher termites.[19]
Fibrobacterota is a small bacterial phylum which includes many of the major rumen bacteria, allowing for the degradation of plant-based cellulose in ruminant animals. Members of this phylum were categorized in other phyla. The genus Fibrobacter (the only genus of Fibrobacterota) was removed from the genus Bacteroides in 1988.
Las fibrobacterias (Fibrobacteres) son un pequeño filo de bacterias que incluye muchas de las bacterias estomacales que permiten la degradación de la celulosa a los rumiantes. Proceden de otro filo; en concreto el género Fibrobacter que procede de la división del género Bacteroides en 1988.[1][2]
Filogenéticamente, el grupo más cercano es Gemmatimonadetes (ver grupo FCB), según algunos análisis genómicos y del ARNr 16S. Sin embargo otros análisis los excluyen.
Las fibrobacterias (Fibrobacteres) son un pequeño filo de bacterias que incluye muchas de las bacterias estomacales que permiten la degradación de la celulosa a los rumiantes. Proceden de otro filo; en concreto el género Fibrobacter que procede de la división del género Bacteroides en 1988.
Filogenéticamente, el grupo más cercano es Gemmatimonadetes (ver grupo FCB), según algunos análisis genómicos y del ARNr 16S. Sin embargo otros análisis los excluyen.
Fibrobacter bi espezie besterik ez dituen bakteria-generoa da, bakterio Gram negatiboz osatua. Bazilo itxura dute eta anaerobioak dira. Genero honetako bakterioek hausnarkarien errumenean bizi dira, eta animaliak jaten duen landareen zelulosa degradatzen dute.
Hasiera batean bakterio hauek Bacteroides generoan sailkatzen ziren, baina 1988an hortik atera eta genero berria sortu zuten mikrobiologoek: Fibrobacter.
Genero honetako bi espezieak Fibrobacter intestinalis eta Fibrobacter succinogenes dira (2014an). Hausnarkarien errumenez gain, beste animalien digestio-aparatuan ere daude, baita termitenean ere.
Fibrobacter bi espezie besterik ez dituen bakteria-generoa da, bakterio Gram negatiboz osatua. Bazilo itxura dute eta anaerobioak dira. Genero honetako bakterioek hausnarkarien errumenean bizi dira, eta animaliak jaten duen landareen zelulosa degradatzen dute.
Hasiera batean bakterio hauek Bacteroides generoan sailkatzen ziren, baina 1988an hortik atera eta genero berria sortu zuten mikrobiologoek: Fibrobacter.
Genero honetako bi espezieak Fibrobacter intestinalis eta Fibrobacter succinogenes dira (2014an). Hausnarkarien errumenez gain, beste animalien digestio-aparatuan ere daude, baita termitenean ere.
Les Fibrobacteres sont une petite division bactérienne qui comprend bon nombre des principales bactéries de la panse, ce qui permet la dégradation des organes cellulosiques chez les ruminants. Les membres de ce phylum ont été classés dans d'autres phyla ; précisément le genre Fibrobacter (le principal genre de Fibrobacteres) a été scindé du genre Bacteroides en 1988[1],[2].
Les Fibrobacteres sont une petite division bactérienne qui comprend bon nombre des principales bactéries de la panse, ce qui permet la dégradation des organes cellulosiques chez les ruminants. Les membres de ce phylum ont été classés dans d'autres phyla ; précisément le genre Fibrobacter (le principal genre de Fibrobacteres) a été scindé du genre Bacteroides en 1988,.
Os Fibrobacteres son un pequeno filo de bacterias no que se inclúen moitas das bacterias máis importantes do rume do aparato dixestivo de moitos herbívoros, que interveñen na degradación da celulosa das plantas das que se alimentan os animais ruminantes. Membros deste filo estaban situados noutros filos. O único xénero de Fibrobacteres é Fibrobacter, que foi separado do xénero Bacteroides en 1988, no que estivo clasificado.[1]
O filo Fibrobacteres considérase que está moi relacionado co grupo CFB [Cytophaga-Flavibacterium-Bacteroides].[3] O único xénero do filo, Fibrobacter, contén estirpes obtidas no tracto gastrointestinal de moitos mamíferos, como vacas e porcos.[4] Describíronse neste xénero dúas especies, que son: Fibrobacter succinogenes e Fibrobacter intestinalis, que recibiron moita atención nos últimos anos debido ao interese que hai en estudar os microbios que poden degradar a fibra vexetal.
Probas moleculares baseadas na amplificación dos xenes do ARNr 16S de mostras tomadas de varios ambientes suxiren que o filo está moito máis amplamente distribuído do que se pensaba anteriormente.[5][6] A maioría dos clons procedentes de ambientes mamíferos agrúpanse xunto cos clons illados xa coñecidos no chamado subfilo 1 de Fibrobacteres.[6] Ademais, membros de Fibrobacteres do subfilo 2 foron atopados no aparato dixestivo das térmites.[6] Debido á falta de representantes cultivados do subfilo 2, aínda non está claro a función que exercen no aparato dixestivo das térmites.
Os Fibrobacteres son un pequeno filo de bacterias no que se inclúen moitas das bacterias máis importantes do rume do aparato dixestivo de moitos herbívoros, que interveñen na degradación da celulosa das plantas das que se alimentan os animais ruminantes. Membros deste filo estaban situados noutros filos. O único xénero de Fibrobacteres é Fibrobacter, que foi separado do xénero Bacteroides en 1988, no que estivo clasificado.
Fibrobacteres er en liten rekke innen bakteriene som inkluderer majoriteten av bakteriene i magesekken hos drøvtyggere. Dette muliggjør nedbryting av plantebasert cellulose. Medlemmer av denne rekken var kategorisert i en annen rekke i 1988, under Bacteroidetes, men har nå fått sin egen.[1]
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Fibrobacteres é um pequeno filo bacteriano, que inclui muitas das principais bactérias do rúmen, permitindo a degradação de material celulósico em animais ruminantes. Os membros deste filo foram categorizados noutro filo, especificamente o gênero Fibrobacter (o principal gênero de Fibrobacteres) foi dividido do gênero Bacteroides, em 1988.[1]
O filo Fibrobacteres compreende atualmente um gênero formal, Fibrobacter, e duas espécies cultivadas, Fibrobacter succinogenes e Fibrobacter intestinalis, que são reconhecidas como importantes degradadores bacterianos de material lignocelulósico no intestino herbívoro. Historicamente, acreditava-se que os membros do gênero Fibrobacter ocupavam apenas tratos intestinais de mamíferos. No entanto, recentes abordagens moleculares direcionadas ao gene 165 do RNAr demonstraram que novos centros de variação dentro do gênero Fibrobacter estão presentes em aterros sanitários e em lagos de água doce, e sua abundância relativa sugere um papel potencial na degradação da celulose além do intestino herbívoro.
O gênero Fibrobacter contém anaeróbios obrigatórios fermentativos gram-negativos. Entretanto, ao contrário da maioria das Fusobacteria e Synegistetes, as espécies de Fibrobacter são incapazes de fermentar proteínas ou aminoácidos, e se especializaram na fermentação da celulose. No rúmem, a celulose é a principal fonte de energia, e neste ambiente ela possibilita o crescimento não apenas das bactérias celulolíticas, como Fibrobacter, mas de muitos outros anaeróbios não celulolíticos que utilizam a glicose liberada durante a degradação da celulose.
Além disso, um novo subfilo dentro dos Fibrobacteres foi detectado no intestino de cupins que se alimentam de madeira, e análises proteômicas confirmaram seu envolvimento na hidrólise da celulose. A seqüência do genoma da cepa S85 do F. succinogenes sugeriu recentemente que dentro desse grupo de organismos uma "terceira" forma de atacar a forma mais abundante de carbono orgânico na biosfera, a celulose, evoluiu. Esta observação não só tem significado evolutivo, mas a eficiência superior da hidrólise de celulose anaeróbica por Fibrobacter spp., Em comparação com outras bactérias do rúmen celulolítico que tipicamente utilizam complexos enzimáticos ligados à membrana (celulossomas), pode ser explicada por este novo sistema de celulase. Existem poucos filos bacterianos com importância funcional potencial para os quais existe uma escassez de dados fenotípicos e funcionais.
Embora Fibrobacteres, que consiste em um único gênero Fibrobacter contendo duas espécies, seja atualmente reconhecido como filo distinto, estudos filogenéticos baseados em sequências de proteína RpoC e Gyrase B, indicam que o Fibrobacter succinogenes está intimamente relacionado com as espécies dos filos Bacteroidetes e Chlorobi. As espécies desses três filos também se ramificam na mesma posição, com base em marcadores conservados em várias proteínas importantes. Por último e mais importante, estudos genômicos comparativos identificaram dois indels de assinatura conservada (uma inserção de 5-7 aminoácidos na proteína RpoC e uma inserção de 13-16 aminoácidos na serina hidroximetiltransferase) e uma proteína de assinatura (PG00081) que são compartilhadas exclusivamente por todas as espécies desses três filos. Todos esses resultados fornecem evidências convincentes de que as espécies desses três filos compartilhavam um ancestral comum exclusivo de todas as outras bactérias e foi proposto que todas elas deveriam ser reconhecidas como parte de um único superphylum “FCB”.
Considera-se que o filo Fibrobacteres está intimamente relacionado com o CFB [Cytophaga-Flavibacterium-Bacteroides]. O único gênero neste filo é o Fibrobacter, que contém cepas dos intestinos de muitos mamíferos, incluindo bovinos e suínos. As duas espécies descritas neste gênero nomeadamente Fibrobacter succinogenes e Fibrobacter intestinalis são membros importantes de comunidades fibrolíticas em tripas de mamíferos e têm recebido muita atenção nas últimas décadas devido aos micróbios de interesse de longa data capazes de degradar a fibra vegetal.
Evidências moleculares baseadas na amplificação de genes 16 RNAr de vários ambientes sugerem que o filo é muito mais difundido do que se pensava anteriormente. A maioria dos clones de ambientes mamíferos se agrupa junto com os isolados conhecidos no que tem sido chamado de Fibrobacteres subphylum. Membros do subfilo Fibrobacteres, no entanto, até agora foram encontrados apenas no intestino de cupins e em algumas baratas alimentadas com lixo. O predomínio de Fibrobacteres subfilo 2 em comunidades bacterianas associadas a fibras celulolíticas em restos de alimentação de madeira Nasutitermes corniger sugere que elas desempenham um papel importante na decomposição de material vegetal em cupins mais elevados.
Fibrobacter succinogenes é uma espécie de bactéria celulolítica do gênero Fibrobacter. Está presente no rúmen do gado. Os beta-glucanos são o seu substrato preferido no rúmen e os seus produtos após a digestão incluem formiato, acetato e succinato. O Fibrobacter succinogenes forma sulcos extensos característicos na celulose cristalina e é também prontamente destacado do seu substrato durante a preparação da amostra.
2. Gupta, R. S. (2004). "The phylogeny and signature sequences characteristics of Fibrobacteres, Chlorobi, and Bacteroidetes". Critical Reviews in Microbiology. 30 (2): 123–140. doi:10.1080/10408410490435133. PMID 15239383.
3. cDonald, JE; Lockhart, RJ; Cox, MJ; Allison, HE; McCarthy, AJ (2008). "Detection of novel Fibrobacter populations in landfill sites and determination of their relative abundance via quantitative PCR". Environmental Microbiology. 10 (5): 1310–1319. doi:10.1111/j.1462-2920.2007.01544.x. PMID 18266756
4. Palmquist, D.L. (1995). "Digestibility of cotton lint fiber and whole oilseeds by ruminal microorganisms". Animal Feed Science and Technology. 56 (3–4): 231–42. doi:10.1016/0377-8401(95)00830-6
5. Griffiths E, Gupta RS (September 2001). "The use of signature sequences in different proteins to determine the relative branching order of bacterial divisions: evidence that Fibrobacter diverged at a similar time to Chlamydia and the Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides division". Microbiology. 147 (Pt 9): 2611–22. doi:10.1099/00221287-147-9-2611
6. MADIGAN, Michael T. et al. Microbiologia de Brock. 14ª edição. Porto Alegre: Artmed, 2016.
7. RANSOM-JONES, Emma; et al. The Fibrobacteres: an Important Phylum of Cellulose-Degrading Bacteria. Microbial Ecology, 2012.
8. J.P. Euzéby. "Fibrobacteres". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature(LPSN). Retrieved 2016-06-05.
9. Sayers; et al. "Fibrobacteres". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-06-05.
10. Qi, M. and Nelson, K.E. and Daugherty, S.C. and Nelson, W.C. and Hance, I.R. and Morrison, M. and Forsberg, C.W. (2005). "Novel molecular features of the fibrolytic intestinal bacterium Fibrobacter intestinalis not shared with Fibrobacter succinogenes as determined by suppressive subtractive hybridization". Journal of Bacteriology. 187 (11): 3739–3751. doi:10.1128/jb.187.11.3739-3751.2005. PMC 1112041
11. Mikaelyan, A.; Strassert, J.; Tokuda, G.; Brune, A. (2014). "The fibre-associated cellulolytic bacterial community in the hindgut of wood-feeding higher termites (Nasutitermes spp.)". Environmental Microbiology. 16 (9): 2711–2722. doi:10.1111/1462-2920.12425
12. Holt JG (editor) (1994). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology 9th ed. [S.l.]: Williams & Wilkins. ISBN 0-683-00603-7
Fibrobacteres é um pequeno filo bacteriano, que inclui muitas das principais bactérias do rúmen, permitindo a degradação de material celulósico em animais ruminantes. Os membros deste filo foram categorizados noutro filo, especificamente o gênero Fibrobacter (o principal gênero de Fibrobacteres) foi dividido do gênero Bacteroides, em 1988.
O filo Fibrobacteres compreende atualmente um gênero formal, Fibrobacter, e duas espécies cultivadas, Fibrobacter succinogenes e Fibrobacter intestinalis, que são reconhecidas como importantes degradadores bacterianos de material lignocelulósico no intestino herbívoro. Historicamente, acreditava-se que os membros do gênero Fibrobacter ocupavam apenas tratos intestinais de mamíferos. No entanto, recentes abordagens moleculares direcionadas ao gene 165 do RNAr demonstraram que novos centros de variação dentro do gênero Fibrobacter estão presentes em aterros sanitários e em lagos de água doce, e sua abundância relativa sugere um papel potencial na degradação da celulose além do intestino herbívoro.
O gênero Fibrobacter contém anaeróbios obrigatórios fermentativos gram-negativos. Entretanto, ao contrário da maioria das Fusobacteria e Synegistetes, as espécies de Fibrobacter são incapazes de fermentar proteínas ou aminoácidos, e se especializaram na fermentação da celulose. No rúmem, a celulose é a principal fonte de energia, e neste ambiente ela possibilita o crescimento não apenas das bactérias celulolíticas, como Fibrobacter, mas de muitos outros anaeróbios não celulolíticos que utilizam a glicose liberada durante a degradação da celulose.
Além disso, um novo subfilo dentro dos Fibrobacteres foi detectado no intestino de cupins que se alimentam de madeira, e análises proteômicas confirmaram seu envolvimento na hidrólise da celulose. A seqüência do genoma da cepa S85 do F. succinogenes sugeriu recentemente que dentro desse grupo de organismos uma "terceira" forma de atacar a forma mais abundante de carbono orgânico na biosfera, a celulose, evoluiu. Esta observação não só tem significado evolutivo, mas a eficiência superior da hidrólise de celulose anaeróbica por Fibrobacter spp., Em comparação com outras bactérias do rúmen celulolítico que tipicamente utilizam complexos enzimáticos ligados à membrana (celulossomas), pode ser explicada por este novo sistema de celulase. Existem poucos filos bacterianos com importância funcional potencial para os quais existe uma escassez de dados fenotípicos e funcionais.
纖維桿菌門（Fibrobacteres）是一類革蘭氏陰性細菌，只包括纖維桿菌屬（Fibrobacter）一個屬。
纖維桿菌屬生活在反芻動物的瘤胃中，在其細胞周質中有纖維素酶可以分解纖維素使動物能夠吸收。
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피브로박테르균류(-菌類)는 피브로박테르균문(Fibrobacteres) 또는 섬유균문 또는 섬유간균문[1]에 속하는 작은 세균 문의 하나이다. 이 세균의 대부분은 반추 동물의 반추 위에서 섬유소를 분해하는 세균이다. 다른 세균 문(의간균문)으로 분류해 왔으나, 1988년 의간균속(Bacteroides)에서 분리되었다.[2]
