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Dianthovirus ( الإنجليزية )

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Dianthovirus is a genus of viruses, in the family Tombusviridae. Dianthoviruses are plant viruses. There are three species in this genus. The virus probably has a worldwide distribution, and can be transmitted via nematodes, by mechanical inoculation, by grafting of plants and by contact between infected hosts with previously uninfected host.[1][2]

Taxonomy

The genus contains the following species:[2]

Structure

Viruses in Dianthovirus are non-enveloped, with icosahedral and spherical geometries, a “hexagonal” appearance, and T=3 symmetry. The diameter is around 28-34 nm. Genomes are linear and segmented, bipartite, around 11.3-1.4kb in length. The buoyant density in CsCl of virions is between 1.363 and 1.366 g cm-3. They have a sedimentation coefficient of 126-132-135 S20w. The pH of their isoelectric point is 4.5. The virions become inactive from about 80-90 °C and are inactive above those temperatures. They are viable in vitro for about 50–70 days. Treatment with ether either decreases or does not alter their infectivity. No lipids have so far been reported.[1]

Life cycle

Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the positive stranded RNA virus replication model. Positive stranded RNA virus transcription, using the premature termination model of subgenomic RNA transcription is the method of transcription. Translation takes place by -1 ribosomal frameshifting. The virus exits the host cell by tubule-guided viral movement. Plants serve as the natural host. Transmission routes are mechanical, seed borne, and contact.[1]

Genome

These viruses have segmented, bipartite genomes that are linear, positive-sense, single-stranded RNA (1). These genomes are about 5300 nucleotides in length (1). They have a methylated cap at the 5'-end whose sequence type is m7GpppA (1). The genome also codes for non-structural proteins as well as structural proteins (1). Three non-structural proteins have been found (1).

References

  1. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  2. ^ a b "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 16 May 2021.

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Dianthovirus: Brief Summary ( الإنجليزية )

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Dianthovirus is a genus of viruses, in the family Tombusviridae. Dianthoviruses are plant viruses. There are three species in this genus. The virus probably has a worldwide distribution, and can be transmitted via nematodes, by mechanical inoculation, by grafting of plants and by contact between infected hosts with previously uninfected host.

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Dianthovirus ( الفرنسية )

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Dianthovirus est un genre de virus appartenant à la famille des Tombusviridae, sous-famille des Regressovirinae, qui contient 3 espèces acceptées par l'ICTV. Ce sont des virus à ARN à simple brin de polarité positive (ARNmc), rattachés au groupe IV de la classification Baltimore. Ces virus infectent les plantes (phytovirus).

Dans la nature, les Dianthovirus ont une gamme d'hôtes naturels relativement modérée, limitée aux plantes dicotylédones. En revanche, la gamme d'hôtes expérimentaux comprend un large éventail d'espèces herbacées des familles Solanaceae, Fabaceae, Cucurbitaceae et Asteraceae. La plupart des plantes sont infectées localement (de manière non systémique)[3].

Ces virus d'origine tellurique sont facilement transmis dans le sol sans l'aide d'un vecteur biologique. Ils sont également facilement transmis par inoculation mécanique. Ils ne sont pas transmis par les graines, ni par les insectes, les nématodes ou les champignons du sol. Toutefois, on a signalé des cas de transmission du RCNMV (Red clover necrotic mosaic virus) par Olpidium.[3].

Étymologie

Le nom générique, « Dianthovirus », se réfère au nom générique, Dianthus, de l'œillet, hôte naturel de l'espèce-type, Carnation ringspot virus[4].

Structure

Les particules sont des virions non-enveloppés, parasphériques, à symétrie icosaédrique (T=3), d'environ 28 à 34 nm de diamètre. La capside est composée de 180 sous-unités protéiques, formées en 30 capsomères hexamériques. Les segments du génome sont encapsidés séparément dans différents types de particules[4].

Le génome, segmenté, bipartite (ARN1 et ARN2), est constitué d'ARN linéaire à simple brin de sens positif, dont la taille est d'environ 3,7 à 4,0 kbases pour l'ARN1 et de 1,3 à 1,4 kb pour l'ARN2[4].

Liste des espèces

Selon NCBI (17 janvier 2021)[5] :

Notes et références

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Dianthovirus: Brief Summary ( الفرنسية )

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Dianthovirus est un genre de virus appartenant à la famille des Tombusviridae, sous-famille des Regressovirinae, qui contient 3 espèces acceptées par l'ICTV. Ce sont des virus à ARN à simple brin de polarité positive (ARNmc), rattachés au groupe IV de la classification Baltimore. Ces virus infectent les plantes (phytovirus).

Dans la nature, les Dianthovirus ont une gamme d'hôtes naturels relativement modérée, limitée aux plantes dicotylédones. En revanche, la gamme d'hôtes expérimentaux comprend un large éventail d'espèces herbacées des familles Solanaceae, Fabaceae, Cucurbitaceae et Asteraceae. La plupart des plantes sont infectées localement (de manière non systémique).

Ces virus d'origine tellurique sont facilement transmis dans le sol sans l'aide d'un vecteur biologique. Ils sont également facilement transmis par inoculation mécanique. Ils ne sont pas transmis par les graines, ni par les insectes, les nématodes ou les champignons du sol. Toutefois, on a signalé des cas de transmission du RCNMV (Red clover necrotic mosaic virus) par Olpidium..

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