الأسماء في صفحات التنقل
Els alfaproteobacteris (Alphaproteobacteria) és una classe dins els Proteobacteria.[1] Com tots els proteobacteris són gram-negatius. Alphaproteobacteria comprenen la majoria dels gèneres fototròfics, però també diversos gènres que metabolitzen compostos C1 (per exemple. Methylobacterium spp.), simbionts de les plantes (per exemple Rhizobium spp.) i d'animals, i un grup de patògens, els Rickettsiaceae. Es creu que els precursors dels mitocondris dels eucariotes s'han originat a partir de Rickettsia spp. Per les seves propietats simbiòtiques els científics sovint utilitzen els Alphaproteobacteria del gènere Agrobacterium per transferir ADN forà i tenen altres usos biotecnològics.[2] Els bacteris fototròfics anoxigènics aerobis (en anglès:Aerobic anoxygenic phototrophic bacteria) són alfaproteobacteris que estan àmpliament distribuïts en el plàncton.
Les famílies les quals la majoria pertanyen a l'ordre Rhizobiales, inclouen:
Els alfaproteobacteris (Alphaproteobacteria) és una classe dins els Proteobacteria. Com tots els proteobacteris són gram-negatius. Alphaproteobacteria comprenen la majoria dels gèneres fototròfics, però també diversos gènres que metabolitzen compostos C1 (per exemple. Methylobacterium spp.), simbionts de les plantes (per exemple Rhizobium spp.) i d'animals, i un grup de patògens, els Rickettsiaceae. Es creu que els precursors dels mitocondris dels eucariotes s'han originat a partir de Rickettsia spp. Per les seves propietats simbiòtiques els científics sovint utilitzen els Alphaproteobacteria del gènere Agrobacterium per transferir ADN forà i tenen altres usos biotecnològics. Els bacteris fototròfics anoxigènics aerobis (en anglès:Aerobic anoxygenic phototrophic bacteria) són alfaproteobacteris que estan àmpliament distribuïts en el plàncton.
Alphaproteobacteria je třída gramnegativních bakterií z kmene Proteobacteria, která zahrnuje jak fototrofní, tak heterotrofní druhy. Řada alfaproteobakterií žije v symbióze, například Rhizobium (hlízková bakterie), naopak mnohé druhy jsou patogenní rostlinám (Agrobacterium) a člověku (Rickettsia). Dle endosymbiotické teorie pochází mitochondrie eukaryotických organismů právě z endosymbiotických bakterií, příbuzných dnešním Alphaproteobacteria.
Alphaproteobacteria (auch α-Proteobacteria) bezeichnet eine Klasse im phylogenetischen System der Bakterien, das auf der Grundlage der Basensequenz der ribosomalen 16S-Ribonukleinsäure (16S-rRNA) aufgestellt wurde. Sie gehören zum Stamm (Phylum) der Proteobacteria,
Zu den Alphaproteobacteria gehören die Ordnungen[1]
sowie
und zahlreiche, bisher nicht sicher eingeordnete Isolate.
Wichtige Vertreter sind unter anderem in den Gattungen Rhodospirillum, Acetobacter, Rickettsia, Paracoccus, Zymomonas, Rhizobium, Bartonella, Brucella und Nitrobacter zu finden. Unter den Alphaproteobakterien kommen zahlreiche aquatisch lebende Arten vor. Hohe Anteile dieser Bakterien in Gewässerproben zeigen oft oligotrophe Verhältnisse an.
Stammbaum der Alphaproteobacteria auf Basis ribosomaler RNA (rRNA) MagnetococcidaeCaulobacterales, Rhodospirillales, Sphingomonadales,
Rhodobacteraceae, Rhizobiales, etc.
Untergruppen Ia (Pelagibacteraceae, mit Pelagibacter), Ib, II, IIIa, IIIb, IV und V
Die Rickettsiales werden dabei als ein Taxon verstanden, das die Anaplasmataceae, Ricketsiaceae und Midichloriaceae umfasst. Werden die Proto-Mitochondrien ebenfalls mit einbezogen, dann erscheinen im obigen Kladogramm die Rickettsiales als Schwestergruppe der Pelagibacterales (wären also der Zweig unterhalb dieser); vielleicht stellen letztere aber auch eine basale Untergruppe der Rickettsiales dar. Details zu den Caulobacteridae siehe Parvularcula bermudensis. Weitere hier nicht aufgeführte Taxa der Alphaproteobacteria sind (wo nicht eigens vermerkt gemäß List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[4] und National Center for Biotechnology Information (NCBI)[5] sowie der 16S-rRNA-basierten Phylogenie nach Release 106 des Projekts "The All-Species Living Tree"[6]) unter anderem:
Alphaproteobacteria (auch α-Proteobacteria) bezeichnet eine Klasse im phylogenetischen System der Bakterien, das auf der Grundlage der Basensequenz der ribosomalen 16S-Ribonukleinsäure (16S-rRNA) aufgestellt wurde. Sie gehören zum Stamm (Phylum) der Proteobacteria,
Ang Alphaproteobacteria ay isang klase sa Proteobacteria na kung saan kinabibilangan ng Enterobacteria.
Ang lathalaing ito na tungkol sa Agham ay isang usbong. Makatutulong ka sa Wikipedia sa nito.
Alphaproteobacteria es un classe de Proteobacteria.
Алфа протеобактериите (Alphaproteobacteria) образуваат класа на протеобактерии.[1]
Тука припаѓаат најмногу фототрофни родови, но исто така и неколку родови кои метаболизираат С1-соединенија (на пример, Methylobacterium spp.), симбионти со растенија (како Rhizobium spp.) и животни, и една група на патогени − Rickettsiaceae. Се мисли дека прекурсорите на митохондриите од еукариотските клетки потекнуваат од родот Rickettsia spp. (видете ендосимбиотска теорија). Поради нивните симбиотски својства, научниците често ги користат алфа протеобактериите од родот Agrobacterium за пренос на туѓа ДНК во растителните геноми, но и при некои други биотехнолошки процеси.[2]
Повеќето фамилии од класата се дел од редот Rhizobiales. Тие се:
Алфа протеобактериите (Alphaproteobacteria) образуваат класа на протеобактерии.
Тука припаѓаат најмногу фототрофни родови, но исто така и неколку родови кои метаболизираат С1-соединенија (на пример, Methylobacterium spp.), симбионти со растенија (како Rhizobium spp.) и животни, и една група на патогени − Rickettsiaceae. Се мисли дека прекурсорите на митохондриите од еукариотските клетки потекнуваат од родот Rickettsia spp. (видете ендосимбиотска теорија). Поради нивните симбиотски својства, научниците често ги користат алфа протеобактериите од родот Agrobacterium за пренос на туѓа ДНК во растителните геноми, но и при некои други биотехнолошки процеси.
Alphaproteobacteria is a class of bacteria in the phylum Pseudomonadota (formerly Proteobacteria).[4] The Magnetococcales and Mariprofundales are considered basal or sister to the Alphaproteobacteria.[5][6] The Alphaproteobacteria are highly diverse and possess few commonalities, but nevertheless share a common ancestor. Like all Proteobacteria, its members are gram-negative and some of its intracellular parasitic members lack peptidoglycan and are consequently gram variable.[4][3]
The Alphaproteobacteria are a diverse taxon and comprises several phototrophic genera, several genera metabolising C1-compounds (e.g., Methylobacterium spp.), symbionts of plants (e.g., Rhizobium spp.), endosymbionts of arthropods (Wolbachia) and intracellular pathogens (e.g. Rickettsia). Moreover, the class is sister to the protomitochondrion, the bacterium that was engulfed by the eukaryotic ancestor and gave rise to the mitochondria, which are organelles in eukaryotic cells (See endosymbiotic theory).[1][7] A species of technological interest is Rhizobium radiobacter (formerly Agrobacterium tumefaciens): scientists often use this species to transfer foreign DNA into plant genomes.[8] Aerobic anoxygenic phototrophic bacteria, such as Pelagibacter ubique, are alphaproteobacteria that are a widely distributed and may constitute over 10% of the open ocean microbial community.
There is some disagreement on the phylogeny of the orders, especially for the location of the Pelagibacterales, but overall there is some consensus. The discord stems from the large difference in gene content (e.g. genome streamlining in Pelagibacter ubique) and the large difference in GC-content between members of several orders.[1] Specifically, Pelagibacterales, Rickettsiales and Holosporales contain species with AT-rich genomes. It has been argued that it could be a case of convergent evolution that would result in an artefactual clustering.[9][10][11] However, several studies disagree.[1][12][13][14]
Furthermore, it has been found that the GC-content of ribosomal RNA (the traditional phylogenetic marker for prokaryotes) little reflects the GC-content of the genome. One example of this atypical decorrelation of ribosomal GC-content with phylogeny is that members of the Holosporales have a much higher ribosomal GC-content than members of the Pelagibacterales and Rickettsiales, even though they are more closely related to species with high genomic GC-contents than to members of the latter two orders.[1]
The Class Alphaproteobacteria is divided into three subclasses Magnetococcidae, Rickettsidae and Caulobacteridae.[1] The basal group is Magnetococcidae, which is composed by a large diversity of magnetotactic bacteria, but only one is described, Magnetococcus marinus.[15] The Rickettsidae is composed of the intracellular Rickettsiales and the free-living Pelagibacterales. The Caulobacteridae is composed of the Holosporales, Rhodospirillales, Sphingomonadales, Rhodobacterales, Caulobacterales, Kiloniellales, Kordiimonadales, Parvularculales and Sneathiellales.
Comparative analyses of the sequenced genomes have also led to discovery of many conserved insertion-deletions (indels) in widely distributed proteins and whole proteins (i.e. signature proteins) that are distinctive characteristics of either all Alphaproteobacteria, or their different main orders (viz. Rhizobiales, Rhodobacterales, Rhodospirillales, Rickettsiales, Sphingomonadales and Caulobacterales) and families (viz. Rickettsiaceae, Anaplasmataceae, Rhodospirillaceae, Acetobacteraceae, Bradyrhiozobiaceae, Brucellaceae and Bartonellaceae).
These molecular signatures provide novel means for the circumscription of these taxonomic groups and for identification/assignment of new species into these groups.[16] Phylogenetic analyses and conserved indels in large numbers of other proteins provide evidence that Alphaproteobacteria have branched off later than most other phyla and Classes of Bacteria except Betaproteobacteria and Gammaproteobacteria.[17][18]
The phylogeny of Alphaproteobacteria has constantly been revisited and updated.[19][20] There are some debates for the inclusion of Magnetococcidae in Alphaproteobacteria. For example, an independent proteobacterial class (Etaproteobacteria) for Magnetococcidae has been proposed.[21][22] A recent phylogenomic study suggests the placement of the protomitochondrial clade between Magnetococcidae and all other alphaproteobacterial taxa,[5] which suggests an early divergence of the protomitochondrial lineage from the rest of alphaproteobacteria, except for Magnetococcidae. This phylogeny also suggests that the protomitochondrial lineage does not necessarily have a close relationship to Rickettsidae.
The following taxa have been assigned to the Alphaproteobacteria, but have not been assigned to one or more intervening taxonomic ranks:[23]
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN).[3] The phylogeny is based on whole-genome analysis.[6][a] Subclass names are based on Ferla et al. (2013).[1]
Rickettsiales (including mitochondria[1][27])
Caulobacteridae (outgroup)Although only a few studies have been reported on natural genetic transformation in the Alphaproteobacteria, this process has been described in Agrobacterium tumefaciens,[28] Methylobacterium organophilum,[29] and Bradyrhizobium japonicum.[30] Natural genetic transformation is a sexual process involving DNA transfer from one bacterial cell to another through the intervening medium, and the integration of the donor sequence into the recipient genome by homologous recombination.
Alphaproteobacteria is a class of bacteria in the phylum Pseudomonadota (formerly Proteobacteria). The Magnetococcales and Mariprofundales are considered basal or sister to the Alphaproteobacteria. The Alphaproteobacteria are highly diverse and possess few commonalities, but nevertheless share a common ancestor. Like all Proteobacteria, its members are gram-negative and some of its intracellular parasitic members lack peptidoglycan and are consequently gram variable.
Alphaproteobacteria[2] (también Alpha Proteobacteria o α-bacteria) son proteobacterias muy diversas que poseen algunas características comunes y comparten un ancestro común. Como la mayoría de las proteobacterias, son estructuralmente Gram negativas, pero algunos de sus miembros son parásitos intracelulares que carecen de peptidoglicano, por lo que su tinción Gram es variable.
Alphaproteobacteria es un grupo muy diverso:
Son bacterias púrpuras no del azufre, que poseen bacterioclorofila a o b y varios tipos de carotenoides, pigmentos que se localizan en la membrana citoplasmática y el sistema de membranas internas. Son fotótrofos cuyo metabolismo puede ser fotosintético anoxigénico o fotoorganoheterótrofo. Pueden ser de varios colores: beige, verde oliva, marrón, marrón-melocotón, marrón rojizo, rojo o rosa y tienen espectros de absorción característicos.[3]
Se sitúan en algunos órdenes como Rhodospirillales (por ejemplo Rhodospirillum, Rhodopila), Rhizobiales (como Rhodopseudomonas, Rhodomicrobium, Rhodobium) y Rhodobacterales (Rhodobacter).
Son quimiótrofos que dentro de su ciclo de vida habitan en el interior de células eucariotas huéspedes, ya sea como patógenos (p. ej. Rickettsia) o como endosimbiontes (p. ej. Wolbachia en artrópodos).
Un endosimbionte debió ser el ancestro de las mitocondrias, dentro del origen de los eucariontes, pues una proteobacteria alfa de tipo rickettsial -la protomitocondria-, debió ser engullida o haber parasitado la célula protoeucariota.
Hay especies de Rhizobium que viven en nódulos de las raíces de leguminosas en donde realizan la fijación de nitrógeno, con lo que la planta puede sintetizar compuestos como las proteínas.[4] Una especie de interés tecnológico es Rhizobium radiobacter (antes Agrobacterium tumefaciens), que a menudo utilizan los científicos para transferir ADN extraño en los genomas de plantas.
Los oligótrofos son los organismos quimiótrofos de vida libre que necesitan muy pocos nutrientes para subsistir como Caulobacter, lo que redunda en el éxito evolutivo de estas especies. Pelagibacter ubique es una proteobacteria alfa del picoplancton marino que está ampliamente distribuida y puede constituir más del 10% de la comunidad microbiana del océano abierto.
Las proteobacterias alfa están relacionadas con las beta y gamma dentro del clado denominado Rhodobacteria.
El análisis del ARNr 16S de los subgrupos ha dado el siguiente resultado[5] (los grupos parafiléticos van entre comillas):
Alphaproteobacteria
Datos: Q306579
Multimedia:
Especies: Alphaproteobacteria
Alphaproteobacteria (también Alpha Proteobacteria o α-bacteria) son proteobacterias muy diversas que poseen algunas características comunes y comparten un ancestro común. Como la mayoría de las proteobacterias, son estructuralmente Gram negativas, pero algunos de sus miembros son parásitos intracelulares que carecen de peptidoglicano, por lo que su tinción Gram es variable.
Alfaproteobakterid on gramnegatiivsete bakterite klass.
Alfaproteobakterite klassi klassifitseeritakse järgmised bakterite seltsid[1]:
Osad autorid liigitavad alfaproteobakterite klassi veel ka mitmed mujal klassifitseerimata bakterite seltsid.
Alfaproteobakterid on gramnegatiivsete bakterite klass.
Les Alphaproteobacteria (Alphaprotéobactéries) sont une classe de bactéries qui constitue l'un des cinq groupes du phylum des Protéobactéries.
Ils comprennent :
Certaines de ces bactéries sont pathogènes, et/ou peuvent être très résistantes à la chaleur (certaines souches se reproduisent dans des biofilms à une température optimale de 45 à 54 °C et ont développé des résistances aux biocides. De telles résistances ont été par exemple observées dans les papeteries, et plus précisément dans les machines à papier[1]).
Les Alphaproteobacteria (Alphaprotéobactéries) sont une classe de bactéries qui constitue l'un des cinq groupes du phylum des Protéobactéries.
Ils comprennent :
les Caulobacterales — par exemple Caulobacter crescentus les Holosporales les Kiloniellale les Kopriimonadales les Kordiimonadales les Magnetococcales les Micropepsales les Parvularculales les Pelagibacterales les Rhizobiales — par exemple le genre Rhizobium les Rhodobacterales les Rhodospirillales, comprenant notamment les bactéries acétiques les Rickettsiales — par exemple Rickettsia les Sneathiellales les Sphingomonadales — par exemple SphingomonasCertaines de ces bactéries sont pathogènes, et/ou peuvent être très résistantes à la chaleur (certaines souches se reproduisent dans des biofilms à une température optimale de 45 à 54 °C et ont développé des résistances aux biocides. De telles résistances ont été par exemple observées dans les papeteries, et plus précisément dans les machines à papier).
As alfaproteobacterias [1] ou Alphaproteobacteria (ás veces escrito alfa-proteobacterias[1]) son un tipo de bacterias gramnegativas que forman unha clase do filo Proteobacteria.[2]
As Alphaproteobacteria comprenden maioritariamente xéneros fotótrofos, pero tamén varios xéneros que metabolizan compostos dun só carbono (por exemplo, Methylobacterium spp.), simbiontes de plantas (por exemplos, Rhizobium spp.) e animais, e un grupo de patóxenos, as Rickettsiaceae. Ademais, os precursores das mitocondrias das células eucarióticas pénsase que se orixinaron a partir de Rickettsia spp. (ver teoría endosimbiótica). Debido ás súas propiedades simbióticas, os investigadores usan frecuentemente as Alphaproteobacteria do xénero Agrobacterium nas técnicas de transferencia de xenes alleos a xenomas de plantas, e teñen tamén moitas outras aplicacións biotecnolóxicas.[3] As bacterias fotótrofas anoxixénicas aeróbicas son alfaproteobacterias, e son unha parte do plancto mariño de ampla distribución, que poden chegar a supoñer o 10% de toda a comunidade microbiana de alta mar.
A clase Alphaproteobacteria comprende dez ordes, que son: Magnetococcales, Rhodobacterales, Rhodospirillales, Rickettsiales, Sphingomonadales, Caulobacterales, Kiloniellales, Kordiimonadales, Parvularculales e Sneathiellales.[4][5] Nas árbores filoxenéticas baseadas en secuencias concatenadas de grandes conxuntos de datos de proteínas, as especies destes ordes das que xa se secuenciou o xenoma ramifícanse na seguinte orde, desde a rama máis antiga á máis recente: Magnetococcales-Rickettsiales-Rhodospirillales-Sphingomonadales-Rhodobacterales-(Caulobacterales-Parvularculales)- Rhizobiales.,[6][7][8] As análises comparativas dos xenomas secuenciados levaron á descuberta de moitas mutacións por insercións e delecións (indeis) conservados en proteínas amplamente distribuídas e nas proteínas completas (é dicir, proteínas "sinatura"), que son características distintivas ou ben de todas as Alphaproteobacteria, ou ben das súas ordes principais (Rhizobiales, Rhodobacterales, Rhodospirillales, Rickettsiales, Sphingomonadales e Caulobacterales) e familias (Rickettsiaceae, Anaplasmataceae, Rhodospirillaceae, Acetobacteraceae, Bradyrhiozobiaceae, Brucellaceae e Bartonellaceae). Estas sinaturas moleculares proporcionan novos métodos para clasificar estes grupos taxonómicos e para a identificación e asignación de novas especies a cada un dos grupos.[6][9] Análises filoxenéticas e indeis conservados en gran cantidade doutras proteínas fornecen evidencias de que as Alphaproteobacteria se ramificaron antes ca moitos outros filos e clases de bacterias, agás as Betaproteobacteria e Gammaproteobacteria.[10][11]
A filoxenia aceptada actualmente deste grupo está baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) [5] e na base de datos taxonómicos do NCBI (National Center for Biotechnology Information) [12] e a filoxenia está baseada nos datos do ARNr 16S da LTP 106 do Proxecto The All-Species Living Tree [13]
?Aquaspirillum polymorphum ♠ (Williams e Rittenberg 1957) Hylemon et al. 1973
?Furvibacter ♠ Lee et al. 2007
?Kopriimonas byunsanensis ♠ Kwon et al. 2005
?Magnetococcus marinus Bazylinski et al. 2012 (en prensa)
?Micavibrio aeruginosavorus ♠ Lambina et al. 1983
?Polymorphum gilvum ♠ Cai 2010
?Reyranella massiliensis Pagnier et al. 2011
?Subaequorebacter tamlense ♠ Lee 2006
?Vibrio adaptatus Muir et al. 1990
?Vibrio cyclosites Muir et al. 1990
Defluviicoccus vanus Maszenan et al. 2005
Elioraea tepidiphila Albuquerque et al. 2008
Rickettsiales [incluídas Mitocondrias]
Sphingomonadaceae [incluídas Erythrobacteraceae, Caulobacter leidyi, Asticcacaulis]
Rhodothalassium salexigens (Drews 1982) Imhoff et al. 1998
Rhodospirillaceae 1 [incl. Roseospirillum parvum, Kiloniella laminariae, Terasakiella pusilla]
Rhizobiales [incluídas Caulobacteraceae, Rhodobacteraceae, Parvularcula & Streptomyces longisporoflavus]
Notas:
♠ Cepas que se atopan no NCBI, pero non na LPSN.
As alfaproteobacterias ou Alphaproteobacteria (ás veces escrito alfa-proteobacterias) son un tipo de bacterias gramnegativas que forman unha clase do filo Proteobacteria.
Alfa proteobacteria – proteobakterijų (Proteobacteria) tipo bakterijų klasė.
Alfa proteobacteria – proteobakterijų (Proteobacteria) tipo bakterijų klasė.
Alphaproteobacteria is een klasse van bacteriën, behorende tot de Proteobacteria. De meesten zijn grampositief maar bij sommige parasitaire bacteriën ontbreekt Peptidoglycaan en zijn ze bijgevolg gramvariabel.
Hieronder volgen enkele belangrijke orden, families en geslachten van de Alphaproteobacteria:
Alphaproteobacteria is een klasse van bacteriën, behorende tot de Proteobacteria. De meesten zijn grampositief maar bij sommige parasitaire bacteriën ontbreekt Peptidoglycaan en zijn ze bijgevolg gramvariabel.
Alphaproteobacteria (do grego alpha, primeira letra do alfabeto grego; + Proteus, deus do oceano capaz de mudar de forma; + bakterion, pequeno bastão; + ia, sufixo que indica classe) é uma classe de bactérias gram-negativas do filo Proteobacteria. A classe é baseada na análise filogenética de seqüências de 16S rRNA, e todos os membros são relacionados com a ordem-tipo Caulobacterales.[1]
Nove ordens são reconhecidamente válidas,[1][2][3][4] e duas, "Kopriimonadales"[5] e "Parvularculales"[6] não estão validadas.
Alphaproteobacteria (do grego alpha, primeira letra do alfabeto grego; + Proteus, deus do oceano capaz de mudar de forma; + bakterion, pequeno bastão; + ia, sufixo que indica classe) é uma classe de bactérias gram-negativas do filo Proteobacteria. A classe é baseada na análise filogenética de seqüências de 16S rRNA, e todos os membros são relacionados com a ordem-tipo Caulobacterales.
Alphaproteobacteria je trieda gramnegatívnych baktérií z kmeňa Proteobacteria, ktorá zahŕňa tak fototrofné, ako aj heterotrofné druhy. Veľa Alphaproteobakcteria žije v symbióze, napríklad Rhizobium, naopak mnohé druhy sú patogénne rastlinám (Agrobacterium) a človeku (Rickettsia). Podľa endosymbiotickej teórie pochádza mitochondria eukaryotických organizmov práve z endosymbiotických baktérií, príbuzných dnešným Alphaproteobacteria.
Alphaproteobacteria zahŕňa tieto rady[1]
Tento článok je čiastočný alebo úplný preklad článku Alphaproteobacteria na českej Wikipédii.
Alphaproteobacteria je trieda gramnegatívnych baktérií z kmeňa Proteobacteria, ktorá zahŕňa tak fototrofné, ako aj heterotrofné druhy. Veľa Alphaproteobakcteria žije v symbióze, napríklad Rhizobium, naopak mnohé druhy sú patogénne rastlinám (Agrobacterium) a človeku (Rickettsia). Podľa endosymbiotickej teórie pochádza mitochondria eukaryotických organizmov práve z endosymbiotických baktérií, príbuzných dnešným Alphaproteobacteria.
Alphaproteobacteria zahŕňa tieto rady
Caulobacterales Henrici & Johnson 1935 Kordiimonadales Kwon et al. 2005 „Parvularculales“ Rhizobiales Kuykendall 2006 Rhodobacterales Garrity et al. 2006 Rhodospirillales Pfennig & Trüper 1971 Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939 Sneathiellales Kurahashi et al. 2008 Sphingomonadales Yabuuchi & Kosako 2006Альфа-протеобактерії (α Proteobacteria) — клас бактерій типу протеобектерій.
Ці бактерії складають важливу групу, що значно вплинула на багато аспектів розвитку життя на Землі. Зараз вже доказано походження мітохондрій від α-протеобактерій через ендосимбіотичний захват клітинами стародівніх еукаріотів. Існує гіпотеза походження самих еукаріотичних клітин в результаті злиття або тривалого симбіозу між α-протеобактерією і археєю. Симбіоз між α-протеобактеріями (багатьма видами родини Rhizobiaceae) і бульбашками коріння рослин грає центральну роль в процесі фіксації атмосферного азоту рослинами. Крім того, багато видів α-протеобактерій (Rickettsiales, Brucella, Bartonella) є важливими патогенами людини і тварин.
α-протеобактерії проявляють значне різноманіття своїх морфологічних та метаболічних характеристик, сама група визначена засновуючись виключно на молекулярному аналізі своїх 16S рРНК. Крім спільного положення на молекулярних філогенетичних деревах, невідомо жодної надійної фенотипічної або молекулярної характиристики, яка би унікально визнчала цих бактерій. Проте, визначена деяка кількість генів та інших маркерів геномної послідовності, що унікально вказують на цю підгрупу та підтверджують висновки, зровлені на основі аналізу рРНК.
Альфа-протеобактерії (α Proteobacteria) — клас бактерій типу протеобектерій.
Ці бактерії складають важливу групу, що значно вплинула на багато аспектів розвитку життя на Землі. Зараз вже доказано походження мітохондрій від α-протеобактерій через ендосимбіотичний захват клітинами стародівніх еукаріотів. Існує гіпотеза походження самих еукаріотичних клітин в результаті злиття або тривалого симбіозу між α-протеобактерією і археєю. Симбіоз між α-протеобактеріями (багатьма видами родини Rhizobiaceae) і бульбашками коріння рослин грає центральну роль в процесі фіксації атмосферного азоту рослинами. Крім того, багато видів α-протеобактерій (Rickettsiales, Brucella, Bartonella) є важливими патогенами людини і тварин.
α-протеобактерії проявляють значне різноманіття своїх морфологічних та метаболічних характеристик, сама група визначена засновуючись виключно на молекулярному аналізі своїх 16S рРНК. Крім спільного положення на молекулярних філогенетичних деревах, невідомо жодної надійної фенотипічної або молекулярної характиристики, яка би унікально визнчала цих бактерій. Проте, визначена деяка кількість генів та інших маркерів геномної послідовності, що унікально вказують на цю підгрупу та підтверджують висновки, зровлені на основі аналізу рРНК.
α-變形菌（Alphaproteobacteria）是變形菌門（Proteobacteria）下的一個纲[3]。此綱的成員變異性極大，且共通點極少，但他們確實系出同源。α-變形菌大多都是革兰氏阴性菌，而有些包內寄生的物種缺少肽聚醣，而造成革蘭氏染色變異。[3][4]
α-變形菌包含多種細菌，其中包含光自營細菌、植物共生菌（如根瘤菌）、內共生細菌（如Wolbachia），和胞內寄生細菌（如立克次體）。
此外，本綱還包含已滅絕的Proto-mitochondrion（英语：Proto-mitochondrion）。真核生物的祖先攝入了此種細菌，進行內共生作用，成為後來的粒線體[2]。還有一種生物技術上很喜歡使用的農桿菌（Rhizobium radiobacter）也是本綱成員，科學家常常使用本物種來將外來DNA導入植物基因體中。[5]另外，一些光自營生物像是遍在遠洋桿菌（Pelagibacter ubique）也屬於此綱，α-變形菌的微生物可能佔了海洋微生物的10%左右。
關於本綱所屬的目，有人反對現行的分類法，尤其是Pelagibacterales（英语：Pelagibacterales）的地位，但大體上大家還是普遍接受。細菌的分類學一直是分類學家相當頭痛的問題，因為細菌的基因會彼此互相交流，且基因歧異度相當高（像是遍在遠洋桿菌由於他的寄生行為，就會精簡化他的基因體）。在某些目中，其成員的GC含量變異也大的誇張[2]。舉個例子，像是Pelagibacterales、立克次體目（Rickettsiales）和Holosporales三者的基因體都含有高AT含量，有人認為那其實是趨同演化所導致的假象[6][7][8]，而反對方也有他們自己的論述[2][9][10][11]。後來有人發現用以判斷分類依據的rRNA中，GC含量好像好像不太會受基因體變異影響。因此，rRNA中GC含量較高的 Holosporales 就被和低GC含量的Pelagibacterales和立克次體目分開了[2]。
α-變形菌綱下有三個亞綱Magnetococcidae、立克次體亞綱（Rickettsidae）和柄桿菌亞綱（Caulobacteridae）[2]。基群為Magnetococcidae，此類別包含了許多趋磁细菌（由於趨磁細菌為多系群，因此只有部分包含於α-變形菌之下）[12]立克次體亞綱則由細胞內寄生的立克次體目（Rickettsiales），以及可以在胞外單獨生存的Pelagibacterales。柄桿菌亞綱則由Holosporales、紅螺旋菌目（Rhodospirillales）、鞘脂單胞菌目（Sphingomonadales）、紅細菌目（ Rhodobacterales）、柄桿菌目（Caulobacterales）、Kiloniellales、Kordiimonadales、短小盒菌目（Parvularculales），和Sneathiellales。
以下表格是根據美国国家生物技术信息中心（NCBI）[4][13] 而樹狀圖則是根據'The All-Species Living Tree' Project（英语：'The All-Species Living Tree' Project）所提供的16s rRNA分析結果[14]
?Aquaspirillum polymorphum ♠ (Williams and Rittenberg 1957) Hylemon et al. 1973
?Furvibacter ♠ Lee et al. 2007
?Kopriimonas byunsanensis ♠ Kwon et al. 2005
?Magnetococcus marinus Bazylinski et al. 2012 (in press)
?Micavibrio aeruginosavorus ♠ Lambina et al. 1983
?Polymorphum gilvum ♠ Cai 2010
?Reyranella massiliensis Pagnier et al. 2011
?Subaequorebacter tamlense ♠ Lee 2006
?Vibrio adaptatus Muir et al. 1990
?Vibrio cyclosites Muir et al. 1990
紅螺菌科 Rhodospirillaceae 2
紅螺菌科 Rhodospirillaceae 3
紅螺菌科 Rhodospirillaceae 4
Defluviicoccus vanus Maszenan et al. 2005
Elioraea tepidiphila Albuquerque et al. 2008
Sphingomonadaceae （包含Erythrobacteraceae, Caulobacter leidyi, Asticcacaulis）
Rhodothalassium salexigens (Drews 1982) Imhoff et al. 1998
紅螺菌科 1 [包含Roseospirillum parvum, Kiloniella laminariae, Terasakiella pusilla]
根瘤菌目 [包含Caulobacteraceae, Rhodobacteraceae, Parvularcula & Streptomyces longisporoflavus]
|publisher= (帮助) |date=中的日期值 (帮助) |date=中的日期值 (帮助) 引文格式1维护：PMC格式 (link) |publisher= (帮助) 引文格式1维护：显式使用等标签 (link) |publisher= (帮助)
α-變形菌（Alphaproteobacteria）是變形菌門（Proteobacteria）下的一個纲。此綱的成員變異性極大，且共通點極少，但他們確實系出同源。α-變形菌大多都是革兰氏阴性菌，而有些包內寄生的物種缺少肽聚醣，而造成革蘭氏染色變異。
アルファプロテオバクテリア綱（Alphaproteobacteria）とは真性細菌のプロテオバクテリア門の綱の一つ[3] 。綱内の細菌はすべて同じ祖先から派生したが、非常に多様で、共通の性質が殆どない場合が多い。グラム陰性であるが、細胞内寄生種はプロテオグリカンを持たず、したがってグラム染色試験での結果は陽性になることもある。[4]
アルファプロテオバクテリア綱は非常に多様な生物群である。ある属は光栄養細菌であり、その一部はC1化合物を代謝する(例:Methylobacterium spp.)。またある属は植物共生細菌であり(例: Rhizobium spp.)、ある属は節足動物の内生菌であり(Wolbachia属)、ある属は細胞内侵襲性の感染菌である(例: Rickettsia属)。すでに絶滅したが、アルファプロテオバクテリア綱の細菌にはかつて真核生物の細胞に侵入して現在のミトコンドリアとなったプロトミトコンドリアがいた（細胞内共生説）[2] 。Rhizobium radiobacter (過去のAgrobacterium tumefaciens)は植物細胞に外来DNAを転移させるために用いられる[5] 。Pelagibacter ubiqueといった好気性の非酸素光栄養細菌はアルファプロテオバクテリア綱であり、外洋の微生物コミュニティの10%以上を構成すると考えられている海中プランクトンである。
Pelagibacter属、Pelagibacter ubiqueは他の属と遺伝子の数やGC含量が大きく異なり、系統図上の位置について議論がある 。Pelagibacterales属、Rickettsiales属およびHolosporales属のゲノムは特にATリッチである。ATリッチはまた人為的なクラスター化を可能にし、収束進化の結果である可能性がある[6][7][8] 。反論もある[9][10][11]。これに対し、これら属種についてリボソームRNAのGC含量が同定され、この議論が今後決着する可能性がある。リボソームRNAのGC含量は伝統的な系統学的特徴の標識であり、ゲノムのGC含量への反映が小さいためである。例えば、Holosporales属の種のゲノムのGC含量はPelagibacterales属とRickettsiales属のそれと同様に小さいが、リボソームRNAのGC含量は2属と比べて非常に高い。したがって、Holosporales属は後者の2属よりもゲノム高GC含量の種とより関連が深い。
アルファプロテオバクテリア綱には3つの亜綱（Magnetococcidae亜綱、Rickettsidae亜綱およびCaulobacteridae亜綱）がある。このうち、系統発生が古いのはMagnetococcidae亜綱であり、走磁性細菌のMagnetococcus marinusが属している[12] 。Rickettsidae亜綱は細胞内生息細菌のRickettsiales目と自由生活細菌のPelagibacterales目を有する。Caulobacteridae亜綱には9目が属している（Holosporales、Rhodospirillales、Sphingomonadales、 Rhodobacterales, Caulobacterales、Kiloniellales、Kordiimonadales、Parvularculales、Sneathiellales）。
アルファプロテオバクテリア綱の6つの目（Rhizobiales、Rhodobacterales、Rhodospirillales、Rickettsiales、SphingomonadalesおよびCaulobacterales）と7つの科（Rickettsiaceae、Anaplasmataceae、Rhodospirillaceae、Acetobacteraceae、Bradyrhiozobiaceae、BrucellaceaeおよびBartonellaceae）を区別する特徴の一つに、総タンパク質や、一般的に広く分布するタンパク質の保存インデルがある。インデルの比較・解析はアルファプロテオバクテリア綱の種の同定や新種の分類に役立つ [13] 。アルファプロテオバクテリア綱は、ベータプロテオバクテリア綱とガンマプロテオバクテリア綱を除く他の真性細菌の門と綱よりも遅く系統分岐した。[14][15]
アルファプロテオバクテリア綱の系統発生図は「原核生物の名前のリストと命名法の提案」(LPSN) と米国立生物工学情報センター(NCBI)[16] と、国際学術団体The All-Species Living Tree Project（LTP）が発行する「the phylogeny is based on 16S rRNA-based LTP release 106」から提供されている。 [17]
(*)
Defluviicoccus vanus Maszenan et al. 2005
Elioraea tepidiphila Albuquerque et al. 2008
Rickettsiales目 [incl. ミトコンドリア]
Sphingomonadaceae科 [incl. Erythrobacteraceae科, Caulobacter leidyi, Asticcacaulis属]
Rhodothalassium salexigens (Drews 1982) Imhoff et al. 1998
Rhodospirillaceae科 1 [incl. Roseospirillum parvum, Kiloniella laminariae, Terasakiella pusilla]
Rhizobiales目 [incl. Caulobacteraceae科, Rhodobacteraceae科, Parvularcula属]
♠ NCBIで登録されているがLSPNで表記されていない。
アルファプロテオバクテリア綱の自然遺伝子形質転換の過程についてはAgrobacterium tumefaciens[18] 、Methylobacterium organophilum[19] 、およびBradyrhizobium japonicum[20] で明らかになっている。形質転換はDNAをある細胞から別の細胞に移動させる過程であり、相同組換えによって供給DNAは受容ゲノムに組み込まれる。
アルファプロテオバクテリア綱（Alphaproteobacteria）とは真性細菌のプロテオバクテリア門の綱の一つ 。綱内の細菌はすべて同じ祖先から派生したが、非常に多様で、共通の性質が殆どない場合が多い。グラム陰性であるが、細胞内寄生種はプロテオグリカンを持たず、したがってグラム染色試験での結果は陽性になることもある。
알파프로테오박테리아(Alphaproteobacteria)는 프로테오박테리아문의 알파프로테오박테리아강에 속하는 세균의 총칭이다.[1][2] 모든 프로테오박테리아들처럼 그람음성균이다..
2013년 펄라 등(Ferla et al.)의 연구에 기반한 알파프로테오박테리아의 계통 분류는 다음과 같다.[3]
알파프로테오박테리아마그네토코쿠스아강
카울로박테리아아강Rhodospirillales, Sphingomonadales, Rhodobacteraceae, Rhizobiales
Holosporales
리케차아강 Pelagibacterales PelagibacteraceaePelagibacter
기타
Proto-mitochondria
아나플라스마과Ehrlichia
Wolbachia
Neorickettsia
MidichloriaceaeMidichloria
리케차과