nomes no trilho de navegação
Зелените несулфурни бактерии (Chloroflexia) се една од шестте класи на бактерии во коленото Chloroflexi, кои се исто така познати како филаментозни аноксигени фототрофи. Тие произведуваат енергија од светлината и се именувани според зелениот пигмент бактериохлорофил с кој се наоѓа во посебни фотосинтетски тела наречени хлорозоми.
Зелените несулфурни бактерии се обично филаментозни, и може да се движат со помош на бактериско лизгање. Тие се факултативни аероби, но не произведуваат кислород во процесот на фототрофија како цијанобактериите. Овие бактерии се фотохетеротрофи и не се вистински фотосинтетски бактерии.
Додека повеќето бактерии, во смисла на разновидност, се дидермални и се бојат Грам-негативно (со исклучок на Firmicutes, Actinobacteria и Deinococcus-Thermus, кои се Грам-позитивни), членовите на коленото Chloroflexi се монодермални и најчесто се бојат Грам-негативно.[1][2][3]
Класата Chloroflexia е група на длабоко разгранувачки фототрофни бактерии (со исклучок на видовите на Herpetosiphon и Kallotenue), која опфаќа три реда: Chloroflexales, Herpetosiphonales, и Kallotenuales.[4][5][6][7][8] Редовите Herpetosiphonales и Kallotenuales содржат по една фамилија и по еден род: Herpetosiphonaceae (Herpetosiphon) и Kallotenuaceae (Kallotenue), соодветно; додека Chloroflexales се филогенетски поразнообразни.
Компаративните геномски анализи неодамна ја имаат ажурирано таксономијата на класата Chloroflexia, делејќи го редот Chloroflexales во подредот Chloroflexineae кој ги содржи фамилиитеOscillachloridaceaeи Chloroflexaceae, и подредотRoseiflexineaeкој ја содржи фамилијатаRoseiflexaceae. Ревидираната таксономија беше заснована на идентификација на бројни CSIs (анг. сonserved signature inserts and deletions) кои претставуваат ефикасни молекуларни маркери за одредување на заедничко потекло.[9][10][11][12] Дополнителна поддршка за поделбата на Chloroflexales во двата подреда се разликите во физиолошките карактеристики, каде што секој подред има различен профил на каротеноиден, хинонски, и масно киселиниски состав.[13][14] Во прилог на демаркирање на таксономската припадност, CSIs може да играат улога во специфичните карактеристики на членовите во рамките на одреден таксон. На пример, сегмент од четири аминокиселини во ензимот пируват флаводоксин/фередоксин оксидоредуктаза, протеин кој игра важна улога во фотосинтетските организми, најден е исклучиво кај членовите на родот Chloroflexus, и се смета дека игра значајна функционална улога.[15][16] Со користењето на CSIs дополнителна истрага е направена за демаркација на филогенетската позиција на Chloroflexia во однос на соседните фотосинтетски групи како што е Cyanobacteria. [17] Најдено е дека Chloroflexia и Chlorobi споделуваат CSI, а се толкува дека настанал како резултат на хоризонтален трансфер на гени.[18]
Ова е моментално прифатената таксономија на зелените несулфурни бактерии:[19]
Дополнително, "Kouleothrix aurantiaca" и "Dehalobium chlorocoercia" не се целосно опишани.
Името "Chloroflexi" е неолатински множина од "Chloroflexus", што е името на првиот опишан род. Именката е комбинација од грчкиот збор chloros (χλωρός)[20] што значи "зеленикаво-жолт" и латинскиот flexus (од flecto)[21] што значи "виткање", со значење "зелено свиткување".[22] Името нема врска со хемискиот елемент хлор.
Зелените несулфурни бактерии (Chloroflexia) се една од шестте класи на бактерии во коленото Chloroflexi, кои се исто така познати како филаментозни аноксигени фототрофи. Тие произведуваат енергија од светлината и се именувани според зелениот пигмент бактериохлорофил с кој се наоѓа во посебни фотосинтетски тела наречени хлорозоми.
Зелените несулфурни бактерии се обично филаментозни, и може да се движат со помош на бактериско лизгање. Тие се факултативни аероби, но не произведуваат кислород во процесот на фототрофија како цијанобактериите. Овие бактерии се фотохетеротрофи и не се вистински фотосинтетски бактерии.
Додека повеќето бактерии, во смисла на разновидност, се дидермални и се бојат Грам-негативно (со исклучок на Firmicutes, Actinobacteria и Deinococcus-Thermus, кои се Грам-позитивни), членовите на коленото Chloroflexi се монодермални и најчесто се бојат Грам-негативно.
The Chloroflexia are a class of bacteria in the phylum Chloroflexota. Chloroflexia are typically filamentous, and can move about through bacterial gliding. It is named after the order Chloroflexales.[1]
The name "Chloroflexi" is a Neolatin plural of "Chloroflexus", which is the name of the first genus described. The noun is a combination of the Greek chloros (χλωρός)[2] meaning "greenish-yellow" and the Latin flexus (of flecto)[3] meaning "bent" to mean "a green bending".[4] The name is not due to chlorine, an element confirmed as such in 1810 by Sir Humphry Davy and named after its pale green colour.
The Chloroflexia class is a group of deep branching photosynthetic bacteria (with the exception of Herpetosiphon and Kallotenue species) that currently consist of three orders: Chloroflexales, Herpetosiphonales, and Kallotenuales.[1][5][6][7][8] The Herpetosiphonales and Kallotenuales each consist of a single genus within its own family, Herpetosiphonaceae (Herpetosiphon) and Kallotenuaceae (Kallotenue), respectively, whereas the Chloroflexales are more phylogenetically diverse.[1][5][7]
Members of the phylum Chloroflexota are monoderms and stain mostly Gram negative, whereas most bacteria species are diderms and stain Gram negative, with the Gram positive exceptions of the Bacillota (low GC Gram positives), Actinomycetota (high GC, Gram positives), and the Deinococcota (Gram positive, diderms with thick peptidoglycan).[9][10][11]
Comparative genomic analysis has recently refined the taxonomy of the class Chloroflexia, dividing the Chloroflexales into the suborder Chloroflexineae consisting of the families Oscillachloridaceae and Chloroflexaceae, and the suborder Roseiflexineae containing family Roseiflexaceae.[1] The revised taxonomy was based on the identification of a number of conserved signature indels (CSIs) which serve as highly reliable molecular markers of shared ancestry.[12][13][14][15]
Additional support for the division of the Chloroflexales into two suborders is the observed differences in physiological characteristics where each suborder is characterized by distinct carotenoids, quinones, and fatty acid profiles that are consistently absent in the other suborder.[1][16][17]
In addition to demarcating taxonomic ranks, CSIs may play a role in the unique characteristics of members within the clade: In particular, a four-amino-acid insert in the protein pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductase, a protein which plays important roles in photosynthetic organisms, has been found exclusively among all members in the genus Chloroflexus, and is thought to play an important functional role.[18][19]
Additional work has been done using CSIs to demarcate the phylogenetic position of Chloroflexia relative to other photosynthetic groups such as the Cyanobacteria.[20] Chloroflexia shares a number of CSIs with Chlorobiota in the chlorophyll-synthesizing proteins. As the two lineages are not otherwise closely related, the interpretation is that the CSIs are the result of a horizontal gene transfer event between the two. Chloroflexia in turn acquired these proteins by another HGT from a "Clade C" marine cyanobacteria.[21]
The currently accepted taxonomy is as follows:[1][5][28]
Class Chloroflexia Gupta et al. 2013
The Chloroflexia are a class of bacteria in the phylum Chloroflexota. Chloroflexia are typically filamentous, and can move about through bacterial gliding. It is named after the order Chloroflexales.
Chloroflexia o Chloroflexi, también llamadas bacterias verdes no del azufre, es la clase principal del filo homónimo Chloroflexi. Estas bacterias obtienen energía mediante fotosíntesis anoxigénica. Su denominación se debe a su pigmento verde (bacterioclorofila), que se encuentra asociado a los clorosomas. Son típicamente filamentosas, desplazándose por deslizamiento.
Obtienen energía mediante fotosíntesis. Su denominación se debe a su pigmento verde, que se encuentra generalmente asociado a estructuras membranosas internas llamadas clorosomas. Las bacterias de este grupo son aerobias facultativas, pero no producen oxígeno durante la fotosíntesis, pues contienen bacterioclorofila y realizan fotosíntesis anoxigénica. Su vía de fijación del carbono también difiere de la de otras bacterias fotosintéticas.
Si bien son principalmente fotosintéticas anoxigénicas, también hay especies aerobias quimioheterótrofas, anaerobias y termófilas.[1] Las Herpetosiphonales son no-fotosintéticas.
Datos: Q15732012
Especies: Chloroflexia
Chloroflexia o Chloroflexi, también llamadas bacterias verdes no del azufre, es la clase principal del filo homónimo Chloroflexi. Estas bacterias obtienen energía mediante fotosíntesis anoxigénica. Su denominación se debe a su pigmento verde (bacterioclorofila), que se encuentra asociado a los clorosomas. Son típicamente filamentosas, desplazándose por deslizamiento.
Obtienen energía mediante fotosíntesis. Su denominación se debe a su pigmento verde, que se encuentra generalmente asociado a estructuras membranosas internas llamadas clorosomas. Las bacterias de este grupo son aerobias facultativas, pero no producen oxígeno durante la fotosíntesis, pues contienen bacterioclorofila y realizan fotosíntesis anoxigénica. Su vía de fijación del carbono también difiere de la de otras bacterias fotosintéticas.
Si bien son principalmente fotosintéticas anoxigénicas, también hay especies aerobias quimioheterótrofas, anaerobias y termófilas. Las Herpetosiphonales son no-fotosintéticas.
Chloroflexi là một trong sáu lớp vi khuẩn trong ngành Chloroflexi, được gọi là vi khuẩn lục không lưu huỳnh dạng sợi. Chúng sản xuất năng lượng từ ánh sáng và được đặt tên theo sắc tố màu xanh lục của chúng, thường được tìm thấy trong các cơ quan quang hợp gọi là chlorosome.
Chloroflexi thường có dạng sợi và có thể di chuyển thông qua cái gọi là trượt vi khuẩn. Chúng là hiếu khí tùy ý, nhưng không sản xuất oxy trong quá trình sản xuất năng lượng từ ánh sáng, hoặc quang dưỡng. Ngoài ra Chloroflexi có một phương pháp quang dưỡng khác biệt so với vi khuẩn quang hợp thật sự.
Trong khi hầu hết các vi khuẩn, theo quan điểm về tính đa dạng, là hai lớp vỏ và nhuộm Gram âm ngoại trừ Firmicutes (Gram dương GC thấp), Actinobacteria (Gram dương GC cao) và Deinococcus-Thermus (Gram dương, nhưng hai lớp vỏ với peptidoglycan dày), thì các thành viên của ngành Chloroflexi là một lớp vỏ và nhuộm chủ yếu là Gram âm.[1]
Phân tích bộ gen học so sánh đã trau chuốt lại phân loại của lớp Chloroflexi, chia bộ Chloroflexales thành phân bộ Chloroflexineae bao gồm họ Oscillachloridaceae và họ Chloroflexaceae, và phân bộ Roseiflexineae chứa họ Roseiflexaceae.[2] Phân loại sửa đổi lại dựa trên sự nhận dạng của một số các chèn xóa ký số bảo tồn (CSI) phục vụ như các dấu hiệu phân tử rất đáng tin cậy của tổ tiên chia sẻ.[3][4][5] Các phân tích so sánh của bộ gen Chloroflexi đã xác định được 5 CSI trong các protein quan trọng khác nhau, như GroES và Tryptophan synthase, được chia sẻ duy nhất bởi tất cả các loài/chủng đã lập trình tự của lớp Chloroflexi, nhưng không tìm thấy ở bất kỳ loài/chủng vi khuẩn nào khác.[2] 9 CSI khác đã được nhận dạng trong một số protein, bao gồm các protein quan trọng liên quan tới quang hợp như Magiê chelatase, là đặc thù cho tất cả hay phần lớn các loài của bộ Chloroflexales.[2] Trong Chloroflexales, 3 CSI đặc trưng cho Chloroflexaceae, 4 CSI đặc trưng cho Roseiflexaceae, và 7 CSI đặc trưng cho phân bộ Chloroflexineae, bao gồm Chloroflexaceae và Oscillochloridaceae cũng đã được nhận dạng trong các protein khác nhau.[2] Hai trong các CSI tìm thấy duy nhất ở họ Chloroflexaceae, một đoạn chèn 4 aa trong protein pyruvate flavodoxin/ferredoxin oxidoreductaza (PFOR) và một đoạn chèn 2 aa trong protein magiê-protoporphyrin IX monomethyl ester cyclase (ACSF), nằm trong các protein đóng vai trò quan trọng trong quá trình quang hợp và chỉ được tìm thấy ở các sinh vật quang hợp.[2][6]
Phân loại hiện tại được chấp nhận là như sau:[2][7]
Ngoài ra, còn có "Kouleothrix aurantiaca" và "Dehalobium chlorocoercia" nhưng vẫn chưa được mô tả đầy đủ.
Tên gọi "Chloroflexi" là một danh cách tân Latin số nhiều giống đực của "Chloroflexus", là tên gọi của chi đầu tiên được mô tả. Danh từ này là sự kết hợp của tính từ trong tiếng Hy Lạp đực: chloros, cái: chlora, trung: chloron (χλωρός, χλωρά, χλωρόν)[8] nghĩa là "màu vàng ánh lục" và phân từ hoàn thành thụ động giống đực trong tiếng Latin flexus (của flectō)[9] nghĩa là "uốn" để nói tới "một vật màu xanh lá cây uốn cong".[10] Vì thế cần lưu ý rằng từ nguyên này không phải là do clo, một nguyên tố (không khí axit muriatic mất phogiston) đã được Tôn ông Davy khẳng định như vậy vào năm 1810 và đặt tên theo màu xanh lá cây nhạt của nó.
Chloroflexi là một trong sáu lớp vi khuẩn trong ngành Chloroflexi, được gọi là vi khuẩn lục không lưu huỳnh dạng sợi. Chúng sản xuất năng lượng từ ánh sáng và được đặt tên theo sắc tố màu xanh lục của chúng, thường được tìm thấy trong các cơ quan quang hợp gọi là chlorosome.
Chloroflexi thường có dạng sợi và có thể di chuyển thông qua cái gọi là trượt vi khuẩn. Chúng là hiếu khí tùy ý, nhưng không sản xuất oxy trong quá trình sản xuất năng lượng từ ánh sáng, hoặc quang dưỡng. Ngoài ra Chloroflexi có một phương pháp quang dưỡng khác biệt so với vi khuẩn quang hợp thật sự.
Trong khi hầu hết các vi khuẩn, theo quan điểm về tính đa dạng, là hai lớp vỏ và nhuộm Gram âm ngoại trừ Firmicutes (Gram dương GC thấp), Actinobacteria (Gram dương GC cao) và Deinococcus-Thermus (Gram dương, nhưng hai lớp vỏ với peptidoglycan dày), thì các thành viên của ngành Chloroflexi là một lớp vỏ và nhuộm chủ yếu là Gram âm.
Chloroflexia Gupta et al. 2013
Chloroflexia (лат.) — класс фотосинтетических аноксигенных грамотрицательных бактерий. Относятся к так называемым нитчатым аноксигенным фототрофам, ранее назывались зелёными несерными бактериями. Характерной особенностью является наличие особых структур в клетке, отвечающих за фотосинтез — хлоросом. Первый представитель таксона был описан Пирсоном (Pierson B. K.) и Кастенхольцем (Castenholz R. W.) в 1974 году[1] как Chloroflexus aurantiacus.
Все представители таксона имеют нитчатое строение, являются миксотрофами и факультативными анаэробами, фиксируют углерод в результате особого 3-гидроксипропионатного цикла. Подвижны, движение осуществляется по т. н. «скользящему» механизму.
Все организмы этой группы не окрашиваются по Граму, однако такой результат часто противоречит микроскопическим и биохимическим исследованиям. Так, некоторые Oscillochloridaceae окрашиваются грамположительно или грамвариабельно в зависимости от условий. Согласно последним молекулярно-биологическим исследованиям, все представители типа Chloroflexi могут оказаться монодермными микроорганизмами, поскольку в секвенированных геномах их представителей отсутствуют белки, ответственные за синтез типичных липидов внешней мембраны, а также белки, ответственные за её биогенез. Подобные выводы подтверждаются результатами электронной микроскопии многих представителей этого класса. Полагают, что необычное окрашивание может быть связано с атипичной структурой пептидогликана и покрывающего его S-слоя. Однако, клеточная стенка большинства представителей этого отдела всё ещё остаются не исследованной и не охарактеризованной при помощи электронной микроскопии, поэтому вопрос о строении клеточной стенки этих бактерий остаётся открытым[2].
До 2013 года научное название класса было Chloroflexi. На июль 2018 года в класс входят следующие таксоны до рода включительно[3]:
Отдел «Chloroflexi»
Chloroflexia (лат.) — класс фотосинтетических аноксигенных грамотрицательных бактерий. Относятся к так называемым нитчатым аноксигенным фототрофам, ранее назывались зелёными несерными бактериями. Характерной особенностью является наличие особых структур в клетке, отвечающих за фотосинтез — хлоросом. Первый представитель таксона был описан Пирсоном (Pierson B. K.) и Кастенхольцем (Castenholz R. W.) в 1974 году как Chloroflexus aurantiacus.
녹만균강(Chloroflexi)은 녹만균문에 속하는 세균 강이다.[1][2] 사상(絲狀)의 군체를 형성, 활주 운동하는 세균으로 구성된 분류군이다. 녹색비황세균(綠色非黃細菌, 영어: green nonsulfur bacteria)이라고도 한다.
