En taxonomia, els euriarqueots (Euryarchaeota) són un filum d'arqueobacteris[1]
Els euriarqueots inclouen els metanògens, que produeixen metà i sovint viuen als intestins; els halobacteris, que sobreviuen a concentracions extremes de sal; i alguns aerobis i anaerobis extremament termòfils. Se'ls distingeix dels altres arqueobacteris principalment basant-se en seqüències d'ARN ribosòmic.
En taxonomia, els euriarqueots (Euryarchaeota) són un filum d'arqueobacteris
Els euriarqueots inclouen els metanògens, que produeixen metà i sovint viuen als intestins; els halobacteris, que sobreviuen a concentracions extremes de sal; i alguns aerobis i anaerobis extremament termòfils. Se'ls distingeix dels altres arqueobacteris principalment basant-se en seqüències d'ARN ribosòmic.
Euryarchaeota je kmen[2] archeí, poprvé popsaný jako říše Woesem, Kandlerem a Wheelisem roku 1990 v rámci vzniku nové domény Archaea.[3][pozn. 1] Název (eury) odkazuje na rozmanitost prostředí, v nichž žijí archea řazená do tohoto kmene,[5] a na různorodost jejich metabolických drah. Euryarchaeota jsou definovány svým speciálním typem archeálních ribozomů.[3] Právě na základě genů pro rRNA malé ribozomální podjednotky jsou tato archea jednoznačně určena.
Do Euryarchaeota patří pestré spektrum organismů. Významní jsou metanogeni, kteří produkují metan a mohou se vyskytovat v různých prostředích včetně střev, dále halobakterie (též Haloarchaea), které jsou schopné žít ve vysokých koncentracích solí (halofilové), a také někteří extrémně termofilní aerobové a anaerobové.
Buňky euryarchaeot mohou mít rozmanitý tvar, nejen koky a tyčinky, ale též různé nepravidelné koule, spirily, buňky ve tvaru lancetové břitvy nebo disku, trojúhelníky či čtverce. Mohou se barvit grampozitivně i gramnegativně.[5]
Taxonomie Národního střediska pro biotechnologické informace (NCBI)[1], taxonomické ranky dle LPSN[2] (* označuje jména, která dosud nebyla schválena validačními seznamy v časopisech International Journal of Systematic Bacteriology nebo International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology):
Euryarchaeota Garrity and Holt, 2002 (jako kmen) / Cavalier-Smith, 2002 (jako pododdělení)
V tomto článku byl použit překlad textu z článku Euryarchaeota na anglické Wikipedii.
Euryarchaeota je kmen archeí, poprvé popsaný jako říše Woesem, Kandlerem a Wheelisem roku 1990 v rámci vzniku nové domény Archaea. Název (eury) odkazuje na rozmanitost prostředí, v nichž žijí archea řazená do tohoto kmene, a na různorodost jejich metabolických drah. Euryarchaeota jsou definovány svým speciálním typem archeálních ribozomů. Právě na základě genů pro rRNA malé ribozomální podjednotky jsou tato archea jednoznačně určena.
Do Euryarchaeota patří pestré spektrum organismů. Významní jsou metanogeni, kteří produkují metan a mohou se vyskytovat v různých prostředích včetně střev, dále halobakterie (též Haloarchaea), které jsou schopné žít ve vysokých koncentracích solí (halofilové), a také někteří extrémně termofilní aerobové a anaerobové.
Buňky euryarchaeot mohou mít rozmanitý tvar, nejen koky a tyčinky, ale též různé nepravidelné koule, spirily, buňky ve tvaru lancetové břitvy nebo disku, trojúhelníky či čtverce. Mohou se barvit grampozitivně i gramnegativně.
Die Euryarchaeota (vom griechisch altgriechisch ευρύς eurys, englisch wide, broad bzw. euryos, ‚Vielfalt‘) sind eine Abteilung innerhalb der Archaeen (Archaea).
Kennzeichnend für die Euryarchaeota ist die Vielzahl von Gruppen, die als Extremophile an extrem ungünstige Lebensräume angepasst sind. Darunter fallen sowohl sehr hitzeliebende Archaea (Hyperthermophile), säureliebende (acidophile Thermoplasmates) als auch salzliebende Gruppen (Halophile)[1] – die auch Anaerobie betreiben können – und methanproduzierende (Methanogene). Eine weitere große Gruppe innerhalb der Euryarchaeota bilden die in Meer lebenden marinen Euryarchaeota.
Die gegenwärtig akzeptierte Nomenklatur basiert auf der List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[3] und vom National Center for Biotechnology Information (NCBI)[4], basierend auf Analyse der 16S rRNA.[5]
Kladogramm:
Euryarchaeota?Aciduliprofundum boonei ♠ Reysenbach et al. 2006
?Hadesarchaea ♠
?"Theionarchaea" ♠
Anmerkung:
♠ Taxon nur bei NCBI, nicht auf der LPSN. Die Hadesarchaea werden alternativ als eigenständiges Phylum Hadesarchaeota geführt.[10][11] Die Nanohaloarchaea werden alternativ als Nanohaloarchaeota der Archaeen-Supergruppe DPANN, einem Schwestertaxon der Euryarchaeota, zugeordnet.
Kladogramm der Euryarchaeota nach Spang et al. (2017)[8]
MSBL archaea (Mediterranean Sea Brine Lakes)[12][13]
MBGD archaea (Marine Benthic Group D, alias MG-III, Marine Group III)[14]
MG II (Marine Group II, alias Poseidoniia, s. u.)
ANME-1 (anaerobic methanotroph)[15]
Eine Reihe früher zu den Euryarchaeota gestellte Gruppen wurde nach neueren Erkenntnissen zum Archaeen-Superphylum DPANN verschoben:
Anmerkung: Klassifizierung mariner Archaeen
Marine Archaaen können wie folgt klassifiziert werden:[16][17][18][19][20]
Die Euryarchaeota (vom griechisch altgriechisch ευρύς eurys, englisch wide, broad bzw. euryos, ‚Vielfalt‘) sind eine Abteilung innerhalb der Archaeen (Archaea).
Kennzeichnend für die Euryarchaeota ist die Vielzahl von Gruppen, die als Extremophile an extrem ungünstige Lebensräume angepasst sind. Darunter fallen sowohl sehr hitzeliebende Archaea (Hyperthermophile), säureliebende (acidophile Thermoplasmates) als auch salzliebende Gruppen (Halophile) – die auch Anaerobie betreiben können – und methanproduzierende (Methanogene). Eine weitere große Gruppe innerhalb der Euryarchaeota bilden die in Meer lebenden marinen Euryarchaeota.
Euryarchaeota ya iku filum Archaea.[1] Euryarchaeota bisa urip ing lingkungan ekstrem.[1] Tuladha Euryarchaeota ya iku Archaea halofil ekstrem (haloarchaea), metanogen, lan pirang-pirang jinis archaea thermofilik lan asidofilik.[1] Haloarchaea bisa urip ing lingkungan kang duwé kadar uyah dhuwur.[1] Organisme kang kagolong ing golongan iki mbutuhkake paling ora 9& NaCl kanggo urip.[1] Kanggo urip optimale, mbutuhake 12-23% NaCl, nanging bisa urip nganti kadar NaCl 32%.[1] Salah siji golongan Euryarchaeota ya iku bakteri metanogen, ya iku mikroorganisme kang bisa mroduksi metana minangka pérangan integral saka metabolisme energine, asipat anaerob obligat.[1] Adhedhasar keragaman karakter dinding sel, metanogen kapérang dadi Methanobacterium, Methanosarcina, Methanocaldococcus, Methanoplanus, lan Methanospirillum.[1] Bakteri metanogen dhéwé bisa tinemu ing usus manungsa..[2]
Euryarchaeota ya iku filum Archaea. Euryarchaeota bisa urip ing lingkungan ekstrem. Tuladha Euryarchaeota ya iku Archaea halofil ekstrem (haloarchaea), metanogen, lan pirang-pirang jinis archaea thermofilik lan asidofilik. Haloarchaea bisa urip ing lingkungan kang duwé kadar uyah dhuwur. Organisme kang kagolong ing golongan iki mbutuhkake paling ora 9& NaCl kanggo urip. Kanggo urip optimale, mbutuhake 12-23% NaCl, nanging bisa urip nganti kadar NaCl 32%. Salah siji golongan Euryarchaeota ya iku bakteri metanogen, ya iku mikroorganisme kang bisa mroduksi metana minangka pérangan integral saka metabolisme energine, asipat anaerob obligat. Adhedhasar keragaman karakter dinding sel, metanogen kapérang dadi Methanobacterium, Methanosarcina, Methanocaldococcus, Methanoplanus, lan Methanospirillum. Bakteri metanogen dhéwé bisa tinemu ing usus manungsa..
Euryarchaeota (from Ancient Greek εὐρύς eurús, "broad, wide") is a phylum of archaea.[3] Euryarchaeota are highly diverse and include methanogens, which produce methane and are often found in intestines, halobacteria, which survive extreme concentrations of salt, and some extremely thermophilic aerobes and anaerobes, which generally live at temperatures between 41 and 122 °C. They are separated from the other archaeans based mainly on rRNA sequences and their unique DNA polymerase.[4]
The Euryarchaeota are diverse in appearance and metabolic properties. The phylum contains organisms of a variety of shapes, including both rods and cocci. Euryarchaeota may appear either gram-positive or gram-negative depending on whether pseudomurein is present in the cell wall.[5] Euryarchaeota also demonstrate diverse lifestyles, including methanogens, halophiles, sulfate-reducers, and extreme thermophiles in each.[5] Others live in the ocean, suspended with plankton and bacteria. Although these marine euryarchaeota are difficult to culture and study in a lab, genomic sequencing suggests that they are motile heterotrophs.[6]
Though it was previously thought that euryarchaeota only lived in extreme environments (in terms of temperature, salt content and/or pH), a paper by Korzhenkov et al published in January 2019 showed that euryarchaeota also live in moderate environments, such as low-temperature acidic environments. In some cases, euryarchaeota outnumbered the bacteria present.[7] Euryarchaeota have also been found in other moderate environments such as water springs, marshlands, soil and rhizospheres.[8] Some euryarchaeota are highly adaptable; an order called Halobacteriales are usually found in extremely salty and sulfur-rich environments but can also grow in salt concentrations as low as that of seawater 2.5%.[8] In rhizospheres, the presence of euryarchaeota seems to be dependent on that of mycorrhizal fungi; a higher fungal population was correlated with higher euryarchaeotal frequency and diversity, while absence of mycorrihizal fungi was correlated with absence of euryarchaeota.[8]
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[9] and National Center for Biotechnology Information (NCBI)[10]
A third phylogeny, 53 marker proteins based GTDB 08-RS214.[17][18][19]
Archaea "Hadarchaeota" Methanobacteriota_B[20][21] "Methanomada" "Hydrothermarchaeota" "Methanobacteriota" "Neoeuryarchaeota" "Thermoplasmatota""Izemarchaea" (MBG-D, E2)
"Poseidoniia" (MGII & MGIII)[22]
"Halobacteriota"Methanosarcinia_A
"Proteoarchaeota"Euryarchaeota (from Ancient Greek εὐρύς eurús, "broad, wide") is a phylum of archaea. Euryarchaeota are highly diverse and include methanogens, which produce methane and are often found in intestines, halobacteria, which survive extreme concentrations of salt, and some extremely thermophilic aerobes and anaerobes, which generally live at temperatures between 41 and 122 °C. They are separated from the other archaeans based mainly on rRNA sequences and their unique DNA polymerase.
Las euriarqueotas (Euryarcheota) o euriotas[2] son un filo o recientemente un superfilo del dominio Archaea. Es uno de los dos grupos principales de arqueas y originalmente fue separado del otro grupo (Crenarchaeota) basándose en las secuencias del ARNr. Son procariontes simples y abarcan un conjunto amplio y diverso de microorganismos. Recientemente se propuso que Euryarchaeota debería considerarse un superfilo y que algunas de sus clases comprenderían filos separados por derecho propio, junto con otros filos arqueanos descubiertos recientemente.[3]
Podemos distinguir los siguientes grupos de euriarqueotas:
Estas arqueas pertenecen a las clase Haloarchaea. Viven en ambientes extremadamente salinos, lagos salados, piscinas de evaporación de agua del mar, depósitos subterráneos salinos, pero ahora también en las superficies de alimentos altamente salados como salazones de pescados y carnes. Otros organismos halófitos (hongos, camarones, etc) tienen concentraciones salinas citoplasmáticas normales, gastando energía permanentemente en llevar sal fuera de la célula y agua dentro. Estas archaea, pueden vivir a mayores concentraciones salinas y tienen la ventaja de tener la misma concentración salina dentro de las células que fuera. Por ello, para sobrevivir necesitan soluciones con un mínimo de sal del 9%, pero la mayoría de las especies prefieren el 12-23% y pueden sobrevivir con concentraciones del 32% de sal.
Las haloarqueas tienen la característica única de usar la luz como fuente de energía sin tener clorofila. Para ello poseen un pigmento llamado bacteriorodopsina (de funcionamiento similar a la rodopsina de la retina de los vertebrados) que le da un color púrpura a la membrana y que reacciona con la luz produciendo un gradiente de protones a lo largo de la membrana que les permite la síntesis de ATP. Comprende unos veinte géneros.
Este es un grupo extenso de arqueas que producen metano como parte de su metabolismo. Comprende las clases Methanobacteria, Methanococci, Methanomicrobia y Methanopyri. Se encuentran extensamente distribuidos en sedimentos, pantanos anóxicos, lagos, fuentes hidrotermales, aguas residuales y también en el rumen de mamíferos artiodáctilos, intestinos de perros y seres humanos y en el intestino posterior (o proctodeo) de insectos tales como termitas y cucarachas. En contraste con su gran diversidad filogenética, solo pueden usar unos pocos substratos simples, siendo la mayoría de ellos compuestos C1 como H2/CO2, metanoato, metanol o metilamina, aunque cualquier especie concreta solo es capaz de utilizar dos o tres de ellos. Algunos de ellos también son hipertermófilos o acidófilos. Comprende unos treinta géneros.
Es un pequeño grupo de organismos (clase Thermoplasmata) que contiene a los hiperacidófilos más extremos conocidos, Picrophilus, con un pH óptimo de 0,7, pudiendo crecer a -0,06 y morir a valores de pH mayores de 4,0. La mayoría son termófilos y viven en manantiales sulfurosos y pilas de carbón encendidas. Incluye los géneros Ferroplasma, Picrophilus y Thermoplasma.
Es un pequeño grupo de organismos que viven en ambientes extremadamente calientes como fuentes hidrotermales, sedimentos abisales calientes y depósitos de petróleo calientes. Comprende las clases Archaeoglobi y Thermococci, más algunos metanógenos y acidófilos. La temperatura óptima de crecimiento e superior a 80 °C, soportando Pyrococcus una temperatura máxima de 105 °C. La mayoría prefiere un pH neutro, aunque Thermococcus alcaliphilus tiene un pH óptimo 9,0 y un máximo de 10,5. Incluye los géneros Archaeoglobus, Ferroglobus, Geoglobus (clase Archaeoglobi), Palaeococcus, Pyrococcus y Thermococcus (clase Thermococci).
Los análisis de las secuencias de ARNr recogidas en el agua del mar sugieren que las archaea constituyen una parte importante del plancton oceánico. Estas secuencias genéticas se han clasificado en cuatro grupos, siendo los dos primeros los más ampliamente distribuidos. El grupo I se incluye en Crenarchaeota, mientras que los tres restantes se incluyen en Euryarchaeota. El grupo II es más abundante en las aguas superficiales y está periféricamente relacionado con Thermoplasmata. Los otros dos grupos parecen ser menos abundantes. El grupo III se ha encontrado en aguas por debajo de la zona fótica y también está relacionado con Thermoplasmata. El grupo IV fue descubierto por el Profesor Francisco Rodríguez-Valera y sus colaboradores de la Universidad Miguel Hernández (España). Parece que habitan en las aguas profundas del océano, pues nunca han sido detectados en la superficie y sí en las partes más profundas de la columna de agua.
El análisis filogenético proteico también sugiere que la metanogénesis es muy antigua, pues tendría casi 3500 millones de años, obteniéndose el siguiente cladograma:[4]
Una filogenia algo consesuada en el GTDB database y el Annotree es la siguiente:[5][6]
Archaea Proteoarchaeota Euryarchaeota Methanobacteriota Neoeuryarchaeota Thermoplasmatota HalobacteriotaOtros análisis filogenéticos han sugerido que las arqueas del clado DPANN también pertenecen a Euryarchaeota, estando el filo Nanohaloarchaeota totalmente separado del resto. El clado de DPANN sin Nanohaloarchaeota se ha nombrado "Micrarchaea". La siguiente filogenia resume esta propuesta:[7][8][9]
Archaea Proteoarchaeota Euryarchaeota Methanobacteriota "Micrarchaea" Neoeuryarchaeota Thermoplasmatota Halobacteriota|doi-access=
ignorado (ayuda) Las euriarqueotas (Euryarcheota) o euriotas son un filo o recientemente un superfilo del dominio Archaea. Es uno de los dos grupos principales de arqueas y originalmente fue separado del otro grupo (Crenarchaeota) basándose en las secuencias del ARNr. Son procariontes simples y abarcan un conjunto amplio y diverso de microorganismos. Recientemente se propuso que Euryarchaeota debería considerarse un superfilo y que algunas de sus clases comprenderían filos separados por derecho propio, junto con otros filos arqueanos descubiertos recientemente.
Euryarchaeota on arhede hõimkond.
Hõimkonda kuuluvad klassid Archaeoglobi, Halobacteria, Methanobacteria, Methanococci, Methanomicrobia, Methanopyri, Nanohaloarchaea, Thermococci ja Thermoplasmata.
Euryarchaeota on arhede hõimkond.
Hõimkonda kuuluvad klassid Archaeoglobi, Halobacteria, Methanobacteria, Methanococci, Methanomicrobia, Methanopyri, Nanohaloarchaea, Thermococci ja Thermoplasmata.
Les Euryarchaeota, ou euryarchéotes sont un embranchement (phylum) du règne des archées qui comprend notamment :
Selon NCBI (20 juillet 2017)[1] :
Selon ITIS (20 juillet 2017)[2] :
Selon Catalogue of Life (20 juillet 2017)[3] et World Register of Marine Species (20 juillet 2017)[4] :
Les Euryarchaeota, ou euryarchéotes sont un embranchement (phylum) du règne des archées qui comprend notamment :
tous les méthanogènes : Methanobacteria (méthanobactéries), Methanococci (méthanocoques), Methanomicrobia et Methanopyri, qui produisent du méthane CH4 par méthanogenèse et se rencontrent dans les environnements les plus variés allant des sédiments marins à la flore intestinale de nombreux animaux dont l'Homme ; les Halobacteria (halobactéries), qui sont halophiles et donc capables de se développer dans des eaux très salines ; certaines archées hyperthermophiles aérobies et anaérobies : Thermococcus (thermocoques), Thermoplasmata.Os euriarqueotas (Euryarchaeota) son un filo (e tamén un reino) de procariotas do dominio Archaea. É un dos grupos principais de arqueas e orixinalmente foi separado do grupo (Crenarchaeota) baseándose nas secuencias do ARNr. Son procariotas simples e abranguen un conxunto amplo e diverso de microorganismos, entre os que hai moitos extremófilos.[1][2]
Podemos distinguir os seguintes grupos de Euryarchaeota segundo a súa forma de vida:
Estes organismos (clase Halobacteria) viven en ambientes extremadamente salinos, lagos salgados, salinas, depósitos subterráneos salinos, e tamén se atopan nas superficies de alimentos moi salgados como peixes e carnes en salgadura. Outros organismos halófilos (fungos, camaróns etc) teñen concentracións salinas citoplasmáticas normais, e para mantelas deben gastar enerxía permanentemente para levaren o sal fóra da célula e a auga dentro. Estas Archaea, poden vivir a maiores concentracións salinas e teñen a vantaxe de ter a mesma concentración salina dentro das células ca fóra. Para sobreviviren necesitan solucións cun mínimo de sal do 9%, pero a maioría das especies prefiren concentracións do 12-23% e poden sobrevivir con concentracións do 32% de sal. Teñen a característica única de usar a luz como fonte de enerxía sen ter clorofila, xa que no seu lugar teñen un pigmento chamado bacteriorrodopsina (de funcionamiento similar ao pigmento da retina dos ollos) que lle dá á súa membrana unha cor púrpura, e que reacciona coa luz producindo un gradiente de protóns ao longo da membrana que lles permite a síntese de ATP. Comprende uns vinte xéneros.
Este é un grupo extenso de arqueas que producen metano como parte do seu metabolismo. Comprende as clases Methanobacteria, Methanococci, Methanomicrobia e Methanopyri. Encóntranse amplamente distribuídas en sedimentos, pantanos anóxicos, lagos, fontes hidrotermais, augas residuais e tamén no rume de animais herbívoros, intestinos de cans e seres humanos e no tramo posterior do tubo dixestivo de insectos tales como térmites e carrachas. Malia a súa gran diversidade xenética, só poden usar uns poucos substratos simples, a maioría deles compostos C1 como H2/CO2, metanoato, metanol ou metilamina, aínda que unha especie determinada só pode utilizar dous ou tres deles. Algúns deles tamén son hipertermófilos ou acidófilos. Comprende uns trinta xéneros.
É un pequeno grupo de organismos (clase Thermoplasmata) que contén aos acidófilos máis extremos coñecidos, Picrophilus, cun pH óptimo de 0,7, que pode crecer a 0,06 e morrer a valores de pH menores de 4,0. A maioría son termófilos e viven en mananciais sulfurosos e mesmo en moreas de carbón encendidas. Inclúe os xéneros Ferroplasma, Picrophilus e Thermoplasma.
É un pequeno grupo de organismos que viven en ambientes extremadamente quentes como fontes hidrotermais, sedimentos abisais quentes e depósitos de petróleo quentes. Comprende as clases Archaeoglobi e Thermococci, e mais algúns metanóxenos e acidófilos. A temperatura óptima de crecemento é superior a 80 °C, e Pyrococcus soporta unha temperatura máxima de 105 °C. A maioría prefire un pH neutro, aínda que Thermococcus alcaliphilus ten un pH óptimo de 9,0 e un máximo de 10,5. Inclúe os xéneros Archaeoglobus, Ferroglobus, Geoglobus (clase Archaeoglobi), Palaeococcus, Pyrococcus e Thermococcus (clase Thermococci).
As análises das secuencias de ARNr recollidas en mostras de auga de mar suxiren que as Archaea constitúen unha parte importante do plancto oceánico. Estas secuencias xenéticas clasificáronse en catro grupos, os dous primeiros os máis amplamente distribuídos. Os grupos II, III e IV son Euryarchaeota (o grupo I son Crenarchaeota). O grupo II é máis abondoso nas augas superficiais e está perifericamente relacionado con Thermoplasmata. Os outros dous grupos parecen ser menos abondosos. O grupo III encóntrase en augas por debaixo da zona fótica e tamén está relacionado con Thermoplasmata. O grupo IV foi descuberto polo Profesor Francisco Rodriguez-Valera e os seus colaboradores da Universidade Miguel Hernández (España). Parece que habitan nas augas profundas do océano, porque nunca se detectaron na superficie e si nas partes máis profundas da columna de auga. O grupo parece relacionado con Halobacteria.
No cladograma móstrase a taxonomía actualmente aceptada do grupo baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) [3] e na base de datos do NCBI (National Center for Biotechnology Information) [4] e a filoxenia está baseada en datos do ARNr 16S do LTP 106 do Proxecto The All-Species Living Tree.[5]
?Aciduliprofundum boonei ♠ Reysenbach et al. 2006
?'Candidatus Micrarchaeum acidiphilum' Baker et al. 2010
?'Candidatus Parvarchaeum acidiphilum' Baker et al. 2010
Eurythermea NeobacteriaNotas:
♠ Cepas atopadas no NCBI pero non na LPSN.
Os euriarqueotas (Euryarchaeota) son un filo (e tamén un reino) de procariotas do dominio Archaea. É un dos grupos principais de arqueas e orixinalmente foi separado do grupo (Crenarchaeota) baseándose nas secuencias do ARNr. Son procariotas simples e abranguen un conxunto amplo e diverso de microorganismos, entre os que hai moitos extremófilos.
Euryarchaeota merupakan salah satu filum Archaea.[1] Euryarchaeota dapat hidup pada lingkungan ekstrem.[1] Contoh Euryarchaeota adalah Archaea halofil ekstrem (haloarchaea), metanogen, dan beberapa jenis archaea thermofilik dan asidofilik.[1] Haloarchaea dapat hidup di lingkungan berkadar garam tinggi.[1] Organisme yang tergolong dalam kelompok ini membutuhkan setidaknya 9& NaCl untuk tumbuh.[1] Untuk pertumbuhan optimalnya, membutuhkan 12-23% NaCl, tetapi dapat tumbuh sampai dengan kadar NaCl 32%.[1] Salah satu kelompok Euryarchaeota adalah bakteri metanogen, yaitu mikroorganisme yang dapat memproduksi metana sebagai bagian integral dari metabolisme energinya, bersifat anaerob obligat.[1] Berdasarkan keragaman karakter dinding selnya, metanogen terbagi atas Methanobacterium, Methanosarcina, Methanocaldococcus, Methanoplanus, dan Methanospirillum.[1] Bakteri metanogen sendiri dapat ditemui pada usus manusia..[2]
Euryarchaeota merupakan salah satu filum Archaea. Euryarchaeota dapat hidup pada lingkungan ekstrem. Contoh Euryarchaeota adalah Archaea halofil ekstrem (haloarchaea), metanogen, dan beberapa jenis archaea thermofilik dan asidofilik. Haloarchaea dapat hidup di lingkungan berkadar garam tinggi. Organisme yang tergolong dalam kelompok ini membutuhkan setidaknya 9& NaCl untuk tumbuh. Untuk pertumbuhan optimalnya, membutuhkan 12-23% NaCl, tetapi dapat tumbuh sampai dengan kadar NaCl 32%. Salah satu kelompok Euryarchaeota adalah bakteri metanogen, yaitu mikroorganisme yang dapat memproduksi metana sebagai bagian integral dari metabolisme energinya, bersifat anaerob obligat. Berdasarkan keragaman karakter dinding selnya, metanogen terbagi atas Methanobacterium, Methanosarcina, Methanocaldococcus, Methanoplanus, dan Methanospirillum. Bakteri metanogen sendiri dapat ditemui pada usus manusia..
Euryarchaeota er fylking innan forngerla. Á meðal þessara örvera eru t.d methanogens sem finnast oft í þörmum manna. Methanogens losa orku með því að tengja koltvísýring og vetni til að mynda metan. Euryarchaeota eru saltkærar og vaxa yfirleitt á söltum stöðum.
Euryarchaeota er fylking innan forngerla. Á meðal þessara örvera eru t.d methanogens sem finnast oft í þörmum manna. Methanogens losa orku með því að tengja koltvísýring og vetni til að mynda metan. Euryarchaeota eru saltkærar og vaxa yfirleitt á söltum stöðum.
Gli Euryarchaeota costituiscono il gruppo più grande appartenente al regno degli Archaea. Tra loro troviamo archebatteri che producono metano, organismi estremofili (come, ad esempio, alofili e ipertermofili), e organismi marini.
Gli Euryarchaeota metanogeni, strettamente anaerobi, si trovano in diversi ambienti anossici: sedimenti con scarsa ossigenazione, fonti geotermali ricche di idrogeno e anidride carbonica, ma anche nell'intestino animale. Tra i metanogeni c'è una grande variabilità sia morfologica che di temperature ottimali: molti sono mesofili, ma si trovano anche metanogeni termofili e psicrofili. Alcuni sono anche alofili.
Gli archebatteri, diversamente dai batteri, non hanno una parete basata sul peptidoglicano:
Gli archebatteri metanogeni, che nel loro metabolismo sfruttano il carbonio come accettore di elettroni, possono convertire in metano diversi substrati, riconducibili a tre gruppi, :
Alcuni Euryarchaeota vivono a temperature estremamente alte: Thermococcus vive a 70° - 90°, Pyrococcus a 70° - 106° (entrambi sono anaerobi obbligati); Methanophyrus, un metanogeno isolato da sedimenti vicino a bocche geotermali oceaniche, addirittura a una temperatura ottimale di 110 °C. Altri ipertermofili sono Archaeoglobus (utilizza il solfato al posto dell'ossigeno nella respirazione) e Ferroglobus (ossida il ferro per produrre energia).
Le proteine di questi archebatteri funzionano a temperature così alte, senza essere denaturate, grazie ad una composizione molto idrofobica (che ostacola la denaturazione), a numerose interazioni che irrigidiscono e stabilizzano la molecola (ponti disolfuro e ponti idrogeno), e alla presenza di stabilizzatori come sali, coenzimi o fosfati ciclici. Inoltre sono presenti, nei termosomi, particolari proteine (le Chaperonine) che si occupano di recuperare altre proteine parzialmente denaturate.
Per stabilizzare il DNA alle alte temperature agiscono altre molecole:
Gli Euryarchaeota costituiscono il gruppo più grande appartenente al regno degli Archaea. Tra loro troviamo archebatteri che producono metano, organismi estremofili (come, ad esempio, alofili e ipertermofili), e organismi marini.
Euryarchaeota (ex verbo Graeco 'lata vetusta qualitas') in taxinomia microorganismorum sunt Archaeorum phylum,[1][2][3] quod comprehendit methanogena (methanum gignentia, saepe in intestinis animalium inventa), halobacteria (quae extremas salis concentrationes[4] superant), et aliquos organismos aerobios et anaerobios summe thermophiliacos. Omnes ab aliis archaeanis praecipue secundum sequentias rRNA distinguuntur.
Euryarchaeota (ex verbo Graeco 'lata vetusta qualitas') in taxinomia microorganismorum sunt Archaeorum phylum, quod comprehendit methanogena (methanum gignentia, saepe in intestinis animalium inventa), halobacteria (quae extremas salis concentrationes superant), et aliquos organismos aerobios et anaerobios summe thermophiliacos. Omnes ab aliis archaeanis praecipue secundum sequentias rRNA distinguuntur.
Euryarcheota – archėjų (Archaea) domeno organizmų tipas.
Tai daugiausiai metanogenai ir ekstremalūs halofilai. Metanogenai – obligatiniai, ypatingai griežti anaerobai. Halofilai – obligatiniai aerobai.
Šis tipas pasižymi fiziologine įvairove.
Euryarcheota – archėjų (Archaea) domeno organizmų tipas.
Tai daugiausiai metanogenai ir ekstremalūs halofilai. Metanogenai – obligatiniai, ypatingai griežti anaerobai. Halofilai – obligatiniai aerobai.
Šis tipas pasižymi fiziologine įvairove.
De Euryarchaeota (soms Methanobacteraeota genoemd) zijn een stam van de Archaea.
Onder de Euryarchaeota vallen onder andere methanogenen, thermofielen en Halobacteriën. Ze worden onderscheiden van andere Archaea door hun rRNA.
Methanogenen zijn organismen die bepaalde organische stoffen omzetten in methaan als bijproduct van het metabolisme. Deze archaea leven in de ingewanden van sommige dieren en dragen bij aan het methaangehalte in winden.[1] Thermofielen zijn archaea die kunnen leven onder omstandigheden van een hogere temperatuur dan vergelijkbare groepen, tot wel 121°C.[2]
De huidige fylogenie wordt gebaseerd op de List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) en de National Center for Biotechnology Information (NCBI).
?Aciduliprofundum boonei Reysenbach et al. 2006
De Euryarchaeota worden in de volgende groepen ingedeeld:[3]
De Euryarchaeota (soms Methanobacteraeota genoemd) zijn een stam van de Archaea.
Onder de Euryarchaeota vallen onder andere methanogenen, thermofielen en Halobacteriën. Ze worden onderscheiden van andere Archaea door hun rRNA.
Methanogenen zijn organismen die bepaalde organische stoffen omzetten in methaan als bijproduct van het metabolisme. Deze archaea leven in de ingewanden van sommige dieren en dragen bij aan het methaangehalte in winden. Thermofielen zijn archaea die kunnen leven onder omstandigheden van een hogere temperatuur dan vergelijkbare groepen, tot wel 121°C.
Euryarchaeota é um filo do domínio Archaea. Inclui formas termofílicas aeróbicas e anaeróbicas, metanogênicas e halofílicas. Difere das outras arquéias principalmente pela seqüência de RNA ribossômico.
Euryarchaeota é um filo do domínio Archaea. Inclui formas termofílicas aeróbicas e anaeróbicas, metanogênicas e halofílicas. Difere das outras arquéias principalmente pela seqüência de RNA ribossômico.
Euryarchaeota är namnet på både ett rike[1] och fylum av arkéer.
Euryarchaeota, Archaea üst alemine ait bir şube. Bu grup metanogenleri, halo bakterileri, bazı ekstrem termofilik aerobları ve ekstrem termofilik anaerobları içermektedir. Metanogenler metan üreten archaeonlar olup çoğu bağırsaklarda bulunmaktadır. Halobacteria sınıfına ait türler ekstrem tuz konsantrasyonlarında yaşayan archaeonlardır. Bu archaeonlar diğerlerinden rRNA sekans benzerlik ve farklılıklarına bakılarak ayrılmıştır.
Euryarchaeota, Archaea üst alemine ait bir şube. Bu grup metanogenleri, halo bakterileri, bazı ekstrem termofilik aerobları ve ekstrem termofilik anaerobları içermektedir. Metanogenler metan üreten archaeonlar olup çoğu bağırsaklarda bulunmaktadır. Halobacteria sınıfına ait türler ekstrem tuz konsantrasyonlarında yaşayan archaeonlardır. Bu archaeonlar diğerlerinden rRNA sekans benzerlik ve farklılıklarına bakılarak ayrılmıştır.
Евріархеоти (лат. Euryarchaeota) — тип археїв.
До евріархеотів належать метаноутворюючі археї (наприклад, Methanobacterium palustre), екстремальні галофіли (наприклад, Halobacterium salinarum) і деякі екстремальні термофіли (наприклад, Thermoplasma acidophilum). Їх відділяють від інших археїв, спираючись на послідовностях рРНК.
Сучасна прийнята таксономія базується на даних List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[1][2] і Національного центру біотехнологічної інформації (англ. National Center for Biotechnology Information (NCBI))[3] , а також дослідженнях 16s рРНК, реліз 106 'The All-Species Living Tree' Project[4][5].
?Aciduliprofundum boonei ♠ Reysenbach et al. 2006
?'Candidatus Micrarchaeum acidiphilum' Baker et al. 2010
?'Candidatus Parvarchaeum acidiphilum' Baker et al. 2010
♠ — штам є в NCBI, але відсутній в LPSN;
Candidatus — таксон, що, можливо, займає дане положення
Евріархеоти (лат. Euryarchaeota) — тип археїв.
До евріархеотів належать метаноутворюючі археї (наприклад, Methanobacterium palustre), екстремальні галофіли (наприклад, Halobacterium salinarum) і деякі екстремальні термофіли (наприклад, Thermoplasma acidophilum). Їх відділяють від інших археїв, спираючись на послідовностях рРНК.
Trong hệ thống phân loại của vi sinh vật, Euryarchaeota là một ngành của Archaea.[1][2][3]
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Trong hệ thống phân loại của vi sinh vật, Euryarchaeota là một ngành của Archaea.
Euryarchaeota Woese et al. 1990
СинонимыЭвриархеоты[3] (лат. Euryarchaeota) — тип архей.
К эвриархеотам относят метанообразующие археи (например, Methanobacterium palustre), экстремальные галофилы (например, Halobacterium salinarum) и некоторые экстремальные термофилы (например, Thermoplasma acidophilum). Их отделяют от других архей, основываясь на последовательностях рРНК.
Современная классификация базируется на данных List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature[en] (LPSN)[2], а также Национального центра биотехнологической информации (NCBI)[4]. Более детальные взаимоотношения таксонов показаны в исследованиях 16s рРНК, релиз 106 'The All-Species Living Tree' Project[5]:
EuryarchaeotaЭвриархеоты (лат. Euryarchaeota) — тип архей.
К эвриархеотам относят метанообразующие археи (например, Methanobacterium palustre), экстремальные галофилы (например, Halobacterium salinarum) и некоторые экстремальные термофилы (например, Thermoplasma acidophilum). Их отделяют от других архей, основываясь на последовательностях рРНК.
廣古菌門(學名Euryarchaeota)包含了古菌中的大多數種類,包括了經常能在動物腸道中發現的產甲烷菌(英语:Methanogen)、在極高鹽濃度下生活的鹽桿菌、一些超嗜熱的好氧和厭氧菌,也有海洋類群。在16S rRNA系統發育樹上,它們組成一個單系群。
廣古菌門(學名Euryarchaeota)包含了古菌中的大多數種類,包括了經常能在動物腸道中發現的產甲烷菌(英语:Methanogen)、在極高鹽濃度下生活的鹽桿菌、一些超嗜熱的好氧和厭氧菌,也有海洋類群。在16S rRNA系統發育樹上,它們組成一個單系群。
目、科については本文参照
ユリアーキオータ門(Euryarchaeota、ユーリ古細菌、エウリ古細菌、ユリアーキア/Euryarchaea)は、メタン菌や高度好塩菌を中心とした古細菌の分類群である。この他にも超好熱菌や好熱好酸菌、硫酸還元菌、嫌気的メタン酸化菌など多様な生物が含まれており、既知の古細菌の8割以上が分類される。下位分類としては7綱が記載され、原核生物の門としては最大の多様性を持つ。
1984年にレイクが古細菌界として定義したものである[1]。1990年にカール・ウーズが16SrRNA配列に従いユーリ古細菌界として再定義した。他の古細菌グループとは基本的に16S rRNA系統解析によって区別されており、形態・細胞表層構造、代謝系は非常に多様である。幅広い極限環境に適応していることから、ギリシャ語のευρυς(ラテン文字:eurys;エウリュス、意味:広い)にちなんで命名された。
16S rRNA系統解析により定義された門であり、共通する性質は乏しい。クレン古細菌との比較では、やや真正細菌寄りの細胞骨格や細胞分裂機構を持っている。ESCRT複合体の代わりにZリング関連タンパク質(FtsZ、Minなど)があり、MreBを持つものも多い。転写関連遺伝子(RpoG、Rpc34、Elf1)やリボソームタンパク質(S25e、S30e、L13e、L38e)のいくつかを保有しないことも特徴である。
メタン菌の系統が多く、主要8綱のうち4綱がメタン菌のみから構成され、1綱がメタン菌を1部含み、1綱がメタン菌ではないもののメタン生成経路を備えている。高度好塩菌もメタノミクロビウム綱の姉妹群とされる。メタン菌は全てこのユーリ古細菌に含まれる。
この他にメタン酸化古細菌(ANME-1、ANME-2。おそらくメタノミクロビウム綱に近縁)を代表とした未培養系統が多数残されている。
ユリアーキオータ門(Euryarchaeota、ユーリ古細菌、エウリ古細菌、ユリアーキア/Euryarchaea)は、メタン菌や高度好塩菌を中心とした古細菌の分類群である。この他にも超好熱菌や好熱好酸菌、硫酸還元菌、嫌気的メタン酸化菌など多様な生物が含まれており、既知の古細菌の8割以上が分類される。下位分類としては7綱が記載され、原核生物の門としては最大の多様性を持つ。
1984年にレイクが古細菌界として定義したものである。1990年にカール・ウーズが16SrRNA配列に従いユーリ古細菌界として再定義した。他の古細菌グループとは基本的に16S rRNA系統解析によって区別されており、形態・細胞表層構造、代謝系は非常に多様である。幅広い極限環境に適応していることから、ギリシャ語のευρυς(ラテン文字:eurys;エウリュス、意味:広い)にちなんで命名された。
에우리고균은 고균에 속하는 분류군의 하나이다.[2] 에우리고균은 장에 서식하며 메탄을 만들어내는 메테인 생성균과 염분이 많은 곳에서 서식하는 할로박테리아가 포함된다. 여기에 속하는 생물은 다른 고균과 달리 rRNA 배열이 다르다.