Lipothrixviridae és una família de virus que infecten els organismes archaea.[1] Comparteixen característiques amb la família Rudiviridae i tots dos infecten archaea termofílics del regne Crenarchaeota.[2] Els Lipothrixviridae tenen embolcall.
Lipothrixviridae és una família de virus que infecten els organismes archaea. Comparteixen característiques amb la família Rudiviridae i tots dos infecten archaea termofílics del regne Crenarchaeota. Els Lipothrixviridae tenen embolcall.
Die Virusfamilie Lipothrixviridae (gr. λἷπος: Fett, θρίξ: Haar) umfasst drei Gattungen von Bakteriophagen mit linearem, doppelsträngigem DNA-Genom (dsDNA). Die Lipothrixviridae besitzen ein sehr langes, helikales Kapsid, das von einer sehr eng anliegenden Virushülle umgeben ist.
Die Viruspartikel (Virionen) der Lipothrixviridae haben je nach Virusart eine Dicke von 24 bis 38 nm im Durchmesser und eine Länge von 410 bis 2200 nm. Die Lipothrixviridae besitzen an ihren Enden komplexe, teilweise halbmondförmige Proteinstrukturen. Die Gattungen dieser fadenförmigen (filamentösen) Viren werden schon morphologisch anhand ihrer Flexibilität bzw. Biegsamkeit unterschieden: wenig flexible (Beta-) oder sehr flexible Filamente (Gamma-).
Das Genom innerhalb der Familie besteht aus einem einzigen DNA-Molekül mit Größen zwischen 15,9 und 56 kBp. Die Enden des Genoms sind gegenüber einem Abbau durch Exonukleasen äußerst stabil, was durch eine noch unbekannte chemische Modifikation verursacht wird.
Eine gewisse Verwandtschaft besitzt die Familie Lipothrixviridae zu den Rudiviridae, die jedoch keine Hülle besitzen. Die Vertreter beider Virusfamilien haben einen ähnlichen Genomaufbau, ein filamentöses Kapsid und infizieren extrem thermophile Archaeen der Abteilung Crenarchaeota, Die Wirte der Lipothrixviridae sind z. B. Sulfolobus islandicus ([en]); bei AFV-1 die extrem thermophilen Archaeen Acidianus hospitalis und Acidianus infernus ([en]), die vorwiegend an vulkanischen Quellen und Geysiren zu finden sind.
Aufgrund erweiterter Sequenzanalysen kann ein gemeinsamer evolutionärer Ursprung der beiden Familien Rudiviridae und Lipothrixviridae angenommen werden, weshalb sie seit 2012 zu einer neuen, gemeinsamen Ordnung Ligamenvirales zusammengefasst sind.
Der ehemals größte Vertreter, das Thermoproteus-tenax-Virus 1 (en. Thermoproteus tenax virus 1, TTV-1), mit 38×2200 nm eine der größten bekannten Virusspezies überhaupt, wurde inzwischen jedoch der Familie Tristromaviridae, Gattung Alphatristromavirus zugeschlagen. Zwischen dieser Spezies (TTV-1) und den Beta- oder Gammalipothrixviren bestehen keine Übereinstimmungen oder Ähnlichkeiten in der Genomsequenz, ihre Filamente sind nicht flexibel.
Systematik nach ICTV Stand Mitte März 2021, ergänzt um einige Vorschläge in doppelten Anführungszeichen (wo nicht anders angegeben nach NCBI):[2]
Die Virusfamilie Lipothrixviridae (gr. λἷπος: Fett, θρίξ: Haar) umfasst drei Gattungen von Bakteriophagen mit linearem, doppelsträngigem DNA-Genom (dsDNA). Die Lipothrixviridae besitzen ein sehr langes, helikales Kapsid, das von einer sehr eng anliegenden Virushülle umgeben ist.
Die Viruspartikel (Virionen) der Lipothrixviridae haben je nach Virusart eine Dicke von 24 bis 38 nm im Durchmesser und eine Länge von 410 bis 2200 nm. Die Lipothrixviridae besitzen an ihren Enden komplexe, teilweise halbmondförmige Proteinstrukturen. Die Gattungen dieser fadenförmigen (filamentösen) Viren werden schon morphologisch anhand ihrer Flexibilität bzw. Biegsamkeit unterschieden: wenig flexible (Beta-) oder sehr flexible Filamente (Gamma-).
Das Genom innerhalb der Familie besteht aus einem einzigen DNA-Molekül mit Größen zwischen 15,9 und 56 kBp. Die Enden des Genoms sind gegenüber einem Abbau durch Exonukleasen äußerst stabil, was durch eine noch unbekannte chemische Modifikation verursacht wird.
Eine gewisse Verwandtschaft besitzt die Familie Lipothrixviridae zu den Rudiviridae, die jedoch keine Hülle besitzen. Die Vertreter beider Virusfamilien haben einen ähnlichen Genomaufbau, ein filamentöses Kapsid und infizieren extrem thermophile Archaeen der Abteilung Crenarchaeota, Die Wirte der Lipothrixviridae sind z. B. Sulfolobus islandicus ([en]); bei AFV-1 die extrem thermophilen Archaeen Acidianus hospitalis und Acidianus infernus ([en]), die vorwiegend an vulkanischen Quellen und Geysiren zu finden sind.
Aufgrund erweiterter Sequenzanalysen kann ein gemeinsamer evolutionärer Ursprung der beiden Familien Rudiviridae und Lipothrixviridae angenommen werden, weshalb sie seit 2012 zu einer neuen, gemeinsamen Ordnung Ligamenvirales zusammengefasst sind.
Der ehemals größte Vertreter, das Thermoproteus-tenax-Virus 1 (en. Thermoproteus tenax virus 1, TTV-1), mit 38×2200 nm eine der größten bekannten Virusspezies überhaupt, wurde inzwischen jedoch der Familie Tristromaviridae, Gattung Alphatristromavirus zugeschlagen. Zwischen dieser Spezies (TTV-1) und den Beta- oder Gammalipothrixviren bestehen keine Übereinstimmungen oder Ähnlichkeiten in der Genomsequenz, ihre Filamente sind nicht flexibel.
Lipothrixviridae is a family of viruses in the order Ligamenvirales. Thermophilic archaea in the phylum Thermoproteota serve as natural hosts. There are 11 species in this family, assigned to 4 genera. The genus [1][2][3][4][5]
The following genera and species are assigned to the family:[2]
The family consists of three genera: Alphalipothrixvirus, Betalipothrixvirus, and Deltalipothrixvirus. Captovirus used to be in this family as the genus Gammalipothrixvirus, but now it is the only genus in the family Ungulaviridae.[6][7] They are classified into genera based on their genomic properties and on the diversity of their terminal appendages, which are involved in host cell recognition. The originally proposed genus Alphalipothrixvirus was renamed Alphatristromavirus and moved to family Tristromaviridae.[8][9] In 2020, the genus Alphalipothrixvirus was recreated for classification of Sulfolobus filamentous virus 1[10] and Sulfolobales Beppu filamentous virus 2.[11]
In the genus Gammalipothrixvirus claw-like structures are found at either end of the virion.
Members of the Lipothrixviridae share structural and genomic characteristics with viruses from the Rudiviridae family, which contains non-enveloped rod-shaped viruses. Viruses from the two families have linear dsDNA genomes and share up to nine genes. In addition, the filamentous particles of rudiviruses and lipothrixviruses are built from structurally similar, homologous major capsid proteins. Due to these shared properties viruses from the two families are classified into an order Ligamenvirales.[12]
Members of the Ligamenvirales are structurally related to viruses of the family Tristromaviridae which, similar to lipothrixviruses, are enveloped and encode two paralogous major capsid proteins with the same fold as those of ligamenviruses.[13] Due to these structural similarities, order Ligamenvirales and family Tristromaviridae were proposed to be unified within a class 'Tokiviricetes' (toki means ‘thread’ in Georgian and viricetes is an official suffix for a virus class).[13]
The viruses are enveloped and filamentous. The capsid varies considerably in length – 410–1950 nanometers (nm) – and is 24–38 nm in diameter. The envelope has a monolayer structure and includes di-phytanyl tetraethers lipids.
From either end of the viron are protrusions extending from the core through the envelope. The capsid itself is elongated and exhibits helical symmetry. The core itself is helical.
There are two major capsid proteins (MCP1 and MCP2). MCP1 and MCP2 form a heterodimer, which wraps around the linear dsDNA genome transforming it into A-form. Interaction between the genome and the MCPs leads to condensation of the genome into the virion superhelix.[10][14][15] Genomes are linear, up to 40 kb in length.[1]
Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by adsorption to the host cell. Acidianus filamentous virus 1 was found to bind to cellular pili-like appendages. DNA templated transcription is the method of transcription. Archaea serve as the natural host. Transmission routes are passive diffusion.[1]
Virion assembly and egress have been studied in the case of Sulfolobus islandicus filamentous virus (SIFV). The virions assemble inside the cell. Binding of the major capsid protein dimers to the linear dsDNA genome lead to the assembly of nucleocapsids, which are subsequently enveloped intracellularly through an unknown mechanism.[16] All lipothrixviruses are likely to be lytic viruses. In the case of betalipothrixviruses and deltalipothrixviruses, virions are released through pyramidal portals, referred to as virus-associated pyramids (VAPs). The VAPs of SIFV have a hexagonal base (i.e., constructed from six triangular facets).[16]
Lipothrixviridae is a family of viruses in the order Ligamenvirales. Thermophilic archaea in the phylum Thermoproteota serve as natural hosts. There are 11 species in this family, assigned to 4 genera. The genus
Lipothrixviridae es una familia de virus que infectan arqueas.[1] Poseen un genoma de ADN de cadena doble como ácido nucleico por lo que pertenecen al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. Incluye cuatro géneros y 11 especies.
Los virus de esta familia tienen cápsides con simetría filamentosa que varía considerablemente en longitud (410 a 1950 nanómetros (nm) y tiene un diámetro de 24 a 38 nm. Poseen una envoltura vírica que tiene una estructura de monocapa e incluye lípidos de tetraéteres de difitanilo. Los genomas son lineales, de hasta 40 kb de longitud y segmentación monopartita.[2]
Hay dos proteínas únicas en la cápside (MCP1 y MCP2). MCP1 y MCP2 forman un heterodímero, que envuelve el genoma lineal de dsDNA transformándolo en forma A. La interacción entre el genoma y las MCP conduce a la condensación del genoma en la superhélice del virión.[3]
La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante adsorción en la célula huésped.[2]
Los miembros de Lipothrixviridae comparten características estructurales y genómicas con los virus de la familia Rudiviridae, que contiene virus sin envoltura vírica en forma de bastón. Los virus de las dos familias tienen genomas de ADN bicatenario lineales y comparten hasta nueve genes únicos. Además, las partículas filamentosas de rudivirus y lipotrixvirus se forman de proteínas de la cápside homólogas y estructuralmente similares. Debido a estas propiedades compartidas, los virus de las dos familias se agruparon en el orden Ligamenvirales.[4][5]
Los miembros de los ligamenvirales están relacionados estructuralmente con virus de la familia Tristromaviridae que, al igual que los lipotrixvirus, poseen envoltura vírica y codifican la proteína principal SIRV2 homóloga a los ligamenvirales. Debido a estas similitudes estructurales, se propuso unificar el orden Ligamenvirales y la familia Tristromaviridae dentro del dominio Adnaviria.[6]
Datos: Q1468819
Especies: Lipothrixviridae
Lipothrixviridae es una familia de virus que infectan arqueas. Poseen un genoma de ADN de cadena doble como ácido nucleico por lo que pertenecen al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. Incluye cuatro géneros y 11 especies.
Lipothrixviridae is een familie virussen binnen de orde ligamenvirales. Er zijn momenteel 9 soorten, verdeeld in 4 geslachten bekend in deze familie.
Deze virussen zijn staafvormig en hebben een celenvelop, hun capside is tussen de 410 en 1950 nanometer lang en tussen de 24 en 38 nanometer breed; het bestaat uit twee eiwitten, nl. MCP1 en MCP2. Deze virussen hebben een dubbellagige structuur, bevatten glycolipiden en fosfolipiden. Zowel de capside als de kern hebben een helix-structuur.
Dit virus plant zich lytisch voort, toegang tot de gastheercel wordt behaald door adsorptie van de virale nucleïnezuren in de cel en dan start het zich te vermenigvuldigen wat zal zorgen tot de dood van de gastheercel.
De onderstaande geslachten worden onderscheiden:
Lipothrixviridae is een familie virussen binnen de orde ligamenvirales. Er zijn momenteel 9 soorten, verdeeld in 4 geslachten bekend in deze familie.
名稱來源：
Lipo(lip-脂肪)：根據希臘文，lipos(liposome脂質體)，脂肪(fat)
Thrix：根據希臘文，thrix，毛髮(hair)
一般宿主：古細菌
脂毛噬菌體科Lipothrixviridae
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