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Gracilicutes

Gracilicuts ( 加泰隆語 )

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Els gracilicuts (Gracilicutes) són un clade proposat per Cavalier-Smith amb la creença que comprèn els tàxons dels proteobacteris, els planctobacteris (que comprendria Chlamydiae i Planctomycetes), els esfingobacteris (que comprendria els bacteris verds del sofre i Bacteroidetes i les espiroquetes. És un clade de gramnegatius que es va separar dels altres bacteris just abans de la pèrdua evolutiva de la càpsula i just després de l'evolució dels flagels.

Seguidament hi ha el cladograma segons la hipòtesi de Cavalier-Smith:


UACU

Chlorobacteria




Hadobacteria




Cyanobacteria


Eurybacteria

Endobacteria


Actinobacteria Neomura

Archaea



Eukarya





Gracilicutes


Proteobacteria



Planctobacteria




Sphingobacteria




Spirochaetes







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Gracilicuts: Brief Summary ( 加泰隆語 )

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ヒュドロバクテリア ( 日語 )

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ヒュドロバクテリア EscherichiaColi NIAID.jpg 分類 ドメ
イン
: 真正細菌 Bacteria 階級なし : ヒュドロバクテリア Terrabacteria 学名 "Hydrobacteria"(Battistuzzi et al., 2004) 下位分類(上門&門)

ヒュドロバクテリアHydrobacteria)とは、真正細菌の系統についての仮説である。グラム陰性菌の中心的な系統で、実在するとすれば3000以上の種を含み[1]、記載されている真正細菌のおおよそ3割を占める。

ヒュドロバクテリアを提唱したBattistuzziらの説では、姉妹群であるテッラバクテリアグラム陽性菌+藍藻とその近縁群)が陸地を中心に発展してきたのに対し、ヒュロドバクテリアはおおよそ30億年前に水中を中心に進化したとしている[1]。乾燥土壌中での占有率は33%に過ぎないが、海中では90%近くに達する[1]。そのため古典ギリシア語で水を意味するὑδρο-(ヒュドロ-)+bacteriaでHydrobacteriaと名付けられた[1]

このクレードは、トーマス・キャバリエ=スミスの提唱するグラキリクテス下界(-げかい)と分類範囲がほぼ一致する(ただしグラキリクテス下界はアクウィフェクスを含む)[2]。ただし、キャバリエ=スミスは姉妹群として、グラム陽性菌+エウリバクテリア+ネオムラ古細菌+真核生物)の大系統を想定しており、出現時期もやや遅い[2]。こちらの命名は1990年頃にグラム陰性菌に対して使われていた門名の再利用であり、薄いか欠損したペプチドグリカン層を指して、ラテン語のgracil-isグラキリス(細い、貧弱な)+cutisクティス(皮膚)と命名したものである。

系統[編集]

LUCA 真正細菌

テルモトガ門




アクウィフェクス門






テッラバクテリア



ヒュドロバクテリア




フソバクテリウム門[3]






古細菌

エウリ古細菌上門



TACK上門




脚注[編集]

  1. ^ a b c d Battistuzzi FU, Hedges SB (February 2009). "A major clade of prokaryotes with ancient adaptations to life on land". Mol. Biol. Evol. 26 (2): 335–43.
  2. ^ a b Cavalier-Smith T (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biol. Direct 1: 19.
  3. ^ 提唱者らは、テッラバクテリアに含まれる可能性について言及している(Battistuzzi et al., 2009)


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ヒュドロバクテリア: Brief Summary ( 日語 )

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ヒュドロバクテリア(Hydrobacteria)とは、真正細菌の系統についての仮説である。グラム陰性菌の中心的な系統で、実在するとすれば3000以上の種を含み、記載されている真正細菌のおおよそ3割を占める。

ヒュドロバクテリアを提唱したBattistuzziらの説では、姉妹群であるテッラバクテリアグラム陽性菌+藍藻とその近縁群)が陸地を中心に発展してきたのに対し、ヒュロドバクテリアはおおよそ30億年前に水中を中心に進化したとしている。乾燥土壌中での占有率は33%に過ぎないが、海中では90%近くに達する。そのため古典ギリシア語で水を意味するὑδρο-(ヒュドロ-)+bacteriaでHydrobacteriaと名付けられた。

このクレードは、トーマス・キャバリエ=スミスの提唱するグラキリクテス下界(-げかい)と分類範囲がほぼ一致する(ただしグラキリクテス下界はアクウィフェクスを含む)。ただし、キャバリエ=スミスは姉妹群として、グラム陽性菌+エウリバクテリア+ネオムラ古細菌+真核生物)の大系統を想定しており、出現時期もやや遅い。こちらの命名は1990年頃にグラム陰性菌に対して使われていた門名の再利用であり、薄いか欠損したペプチドグリカン層を指して、ラテン語のgracil-isグラキリス(細い、貧弱な)+cutisクティス(皮膚)と命名したものである。

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