Geotrichum candidum is a fungus which is a member of the human microbiome, notably associated with skin, sputum, and faeces where it occurs in 25–30% of specimens.[1][2] It is common in soil and has been isolated from soil collected around the world, in all continents.[1]
G. candidum is the causative agent of the human disease geotrichosis, the plant disease sour rot which infects citrus fruits, tomatoes, carrots, and other vegetables.[3] It can affect harvested fruit of durians such as Durio graveolens.[4]
G. candidum is used widely in the production of certain dairy products including rind cheeses such as Camembert, Saint-Nectaire, Reblochon, and others. The fungus can also be found in a Nordic yogurt-like product known as viili where it is responsible for the product's velvety texture.[5]
In a 2001 study, G. candidum was found to consume the polycarbonate found in CDs.[6]
The genus Geotrichum was described by Johann Heinrich Friedrich Link in 1809 to accommodate the species G. candidum found on decaying leaves. Since then, over 130 taxa have been described in the genus, and hundreds of synonyms have been generated.[7] For example, G. candidum was misclassified as the Oidium lactis in much early literature.[8] Species of Geotrichum resemble the genera Trichosporon and Protendomycopsis; however, Geotrichum is of ascomycetous affiliation whereas the latter are members of the Basidiomycota. Species of Geotrichum are occasionally mistaken for fast growing members of the genus Dipodascus, which are characterized by irregularly branched, 10–14 μm wide hyphae and the production of single-spored asci. However, unlike Geotrichum, members of the genus Dipodascus lack dichotomous branching of the peripheral hyphae and their growth rates are generally less than 3 mm per day.[1]
Galactomyces candidus, formerly thought to be a distinct taxon, was found to be the sexual state of G. candidum using sequence-based methods[9][10] Geotrichum candidum in the broad sense comprises 3 clades, corresponding to the species G. candidum, G. clavatum and G. fici, all of which are thought to have pathogenic potential.[5][2][11] Species of Geotrichum can be differentiated by sequence analysis of the nuclear ribosomal large subunit (18S ribosomal RNA) or the internal transcribed spacer region of the nuclear ribosomal RNA gene.[9]
G. candidum colonies are thin, spreading, soft, creamy and white in the anamorph state.[12] The fungus G. candidum is characterized by hyphae that appear creeping, mostly submerged and septatee.[1][13] The hyphae colour appears to be hyaline or lightly pigmented.[14] When the hyphae becomes airborne it changes shape from arthroconidia to cylindrical or barrel-shaped or ellipsoidal.[1] Chlamydospores are subglobose, solitary, borne on undifferentiated hyphae.[1][13] Blastoconidia sometimes develop on hyphae laterally.[1] Conidia appear arthrosporous, terminal or intercalary, aerial on an agar surface. The conidia size ranges from 4.8 to 12.5 μm x 2.4–2.5 μm.
G. candidum is thought to be homothallic but most isolates are self-sterile.[1] Sexual reproduction was first observed in strains isolated from soils in Puerto Rico.[15] The fungus produces globose asci that contain a single, thick walled, uninucleated, globose to oval ascospore measuring 6–7 μm by 7–10 μm.[1] The ascospores have a smooth inner wall and a furrowed outer wall.[15] The septa are perforated by microspores, arranged in a ring structure. The colonies appear to be growing faster in the sexual stage than the asexual stage. Colonies grow at a rate of 5–7 mm daily at 24 °C (75 °F).[1]
Geotrichum candidum forms a fast growing colony that can grow to 5–6 cm diameter at 5 days on Sabouraud-glucose agar, wort agar and synthetic media. Microscopically, the growth is characterized by the production of dichotomously branched hyphae that resemble tuning forks along the colony margin. The condial chains become aerial, erect or decumbent and measure 6–12(−20) x 3–6(−9) μm. The fungus can grow on a variety of citrus fruits and cause Sour Rot. It tends to cause rotting in fruits that are stored at 0–5 °C (32–41 °F). The conidia are colourless and have a slimy coating.[16] G. candidum is also found occasionally in the human gut, feces, sputum and on skin. The fungus grows in soil, water, sewage, various plant substrates, baker's dough, husks of fermentation, bread, milk and milk products[1] The optimal temperature for growth is 25 °C (77 °F) with a pH range of 5.0–5.5.[8] The temperature range changes depending on the surface that the fungus grows on. For example, in plants the optimum temperature ranges from 25–27 °C (77–81 °F). In animals the optimum temperature ranges from 30–31 °C (86–88 °F).[17] The maximum temperature for growth is 35–38 °C (95–100 °F).[1][12] Fungal growth can be supported by D-glucose, D-mannose, D-xylose, L-sorbose, D-fructose, D-galactose, sucrose, D-mannitol, D-sorbital, ethanol and glycerol. Sporulation often requires a balance of carbon and nitrogen.[1]
G. candidum is extremely common in soil and has been isolated from substrates in Canada, United States, Britain, Germany, Austria, India, South Africa, Japan, Brazil and Peru.[1] It is also found as a causal agent in sour rot in citrus fruits— a soft rot associated with the emission of a fruity odour.[18] The fungus is also known as a post-harvest spoilage agent of muskmelon, squash and cucumber. It plays a role in tomato fruit rot when it is stored at 0–5 °C (32–41 °F).[1]
It is a naturally occurring colonist of certain dairy products particularly cheeses and is sometime used to inoculate wash-rind and bloomy rind cheeses.[8][9][19]
G. candidum can be used commercially to inoculate wash-rinds and bloomy rind cheeses.[8][9][19] Cultures can be added to milk, brine or sprayed onto cheese surface. The optimum pH range for growth on cheese ranges from 4.4 to 6.7. The fungus colonizes nearly the entire surface of the cheese during the early stages of ripening. It is found on soft cheeses like Camembert cheese and semi-hard cheese Saint-Nectaire and Reblochon.[8] For the Camembert cheese the fungi grows on the outside of the cheese forming a rind.[19] The fungus is responsible for the uniform, white, velvety coat on Saint-Marcellin cheese.[8] Lipases and proteases from G. candidum release fatty acids and peptides that provide the cheese with distinctive flavors. G. candidum reduces the bitterness in Camembert cheese through the activity of the aminopeptidases that hydrolyze low molecular weight hydrophobic peptides. Aminopeptidases also contributes an aroma in traditional Norman Camembert. The fungus also neutralizes the curd by catabolizing lactic acid produced by bacteria. G. candidum prepares the cheese for colonization of other acid sensitive bacteria such as Brevibacterium. The fungus inhibits growth of the bacteria Listeria monocytogenes.[20] Commercial strains of G. candidum are available for cheese ripening.[8]
Geotrichum candidum is a fungus which is a member of the human microbiome, notably associated with skin, sputum, and faeces where it occurs in 25–30% of specimens. It is common in soil and has been isolated from soil collected around the world, in all continents.
G. candidum is the causative agent of the human disease geotrichosis, the plant disease sour rot which infects citrus fruits, tomatoes, carrots, and other vegetables. It can affect harvested fruit of durians such as Durio graveolens.
G. candidum is used widely in the production of certain dairy products including rind cheeses such as Camembert, Saint-Nectaire, Reblochon, and others. The fungus can also be found in a Nordic yogurt-like product known as viili where it is responsible for the product's velvety texture.
In a 2001 study, G. candidum was found to consume the polycarbonate found in CDs.
Geotrichum candidum es un hongo presente en el microbioma humano, especialmente asociado a la piel, mucosas y heces.[1][2] Es un organismo común del suelo y ha sido aislado de muestras de todos los continentes.[1]
G. candidum es el agente causante de la enfermedad humana geotrichosis y de la enfermedad de la pudrición ácida en plantas como cítricos, tomates o zanahorias.[3] También puede afectar a los frutos del durio.[4]
G. candidum es ampliamente utilizado en la producción de productos lácteos como los quesos Camembert, Santo-Nectaire o Reblochon. El hongo también se puede encontrar en el yogur nórdico llamado viili, siendo responsable de su textura.[5]
En un estudio del 2001 se encontró que G. candidum era capaz de consumir el policarbonato encontrado en CD.[6]
Geotrichum candidum es un hongo presente en el microbioma humano, especialmente asociado a la piel, mucosas y heces. Es un organismo común del suelo y ha sido aislado de muestras de todos los continentes.
G. candidum es el agente causante de la enfermedad humana geotrichosis y de la enfermedad de la pudrición ácida en plantas como cítricos, tomates o zanahorias. También puede afectar a los frutos del durio.
G. candidum es ampliamente utilizado en la producción de productos lácteos como los quesos Camembert, Santo-Nectaire o Reblochon. El hongo también se puede encontrar en el yogur nórdico llamado viili, siendo responsable de su textura.
En un estudio del 2001 se encontró que G. candidum era capaz de consumir el policarbonato encontrado en CD.
Geotrichum candidum est une espèce du genre Geotrichum.
Ce fungi fait partie du microbiome humain, notamment associé à la peau, aux expectorations et aux matières fécales, où il est présent dans 25-30% des échantillons[1]. Il est courant dans les sols et a été isolé des sols collectés dans le monde entier, sur tous les continents[1].
Geotrichum candidum est l’agent responsable de la géotrichose chez l'homme[2], ainsi que de la pourriture aigre, une maladie chez les plantes qui infecte les agrumes, les tomates, les carottes et d’autres légumes[3]. Il peut affecter les fruits cultivés de Durio tels que Durio graveolens[4].
G. candidum est largement utilisé dans la production de certains produits laitiers, y compris les fromages à croûte tels que le camembert, le saint-nectaire, le reblochon, etc[5]. Le champignon peut également être trouvé dans le viili, où il est responsable de la texture veloutée du produit.
Dans une étude de 2001, on constate que G. candidum consomme le polycarbonate trouvé dans des CD[6].
Les colonies de Geotrichum candidum sont minces, étalées, molles, crémeuses et blanches à l'état anamorphe. Le champignon est caractérisé par des hyphes qui apparaissent rampants, principalement immergés et en septate[1]. La couleur des hyphes semble être hyaline ou légèrement pigmentée. Lorsque les hyphes deviennent aéroportés, leur forme devient arthroconidie, en forme de tonneau ou ellipsoïdale[1]. Les chlamydospores sont sous-globales, solitaires, sur des hyphes indifférenciés[1]. Les blastoconidies se développent parfois sur les hyphes latéralement[1]. Les conidies apparaissent arthrosporeuses, terminales ou intercalaires, aériennes à la surface de la gélose. La taille des conidies varie de 4,8 à 12,5 µm x 2,4 à 2,5 µm.
On pense que G. candidum est homothallique mais la plupart des isolats sont autostériles[1]. La reproduction sexuée est observée pour la première fois dans des souches isolées de sols à Porto Rico. Le champignon produit des asques globuleux contenant une seule et même ascospore ovoïde, globuleuse à ovale, à parois épaisses et non épaissies, mesurant 6 à 7 μm sur 7 à 10 μm. Les ascospores ont une paroi intérieure lisse et une paroi extérieure sillonnée. Les septa sont perforés par des microspores, disposés dans une structure en anneau. Les colonies semblent se développer plus rapidement dans la phase sexuelle que dans la phase asexuée. Les colonies se développent à une vitesse de 5 à 7 mm par jour à 24 °C.
Geotrichum candidum forme une colonie à croissance rapide pouvant atteindre 5 à 6 cm de diamètre en 5 jours sur de la gélose de Sabouraud, de la gélose de moût et des milieux synthétiques. Au microscope, la croissance est caractérisée par la production d'hyphes ramifiés de manière dichotomique qui ressemblent à des diapasons d'accord le long du bord de la colonie. Les chaînes condiales deviennent aériennes, érigées ou décombantes et mesurent 6–12(–20) x 3–6(–9) μm. Le champignon peut pousser sur une variété d’agrumes et causer la pourriture aigre. Il a tendance à provoquer la pourriture des fruits stockés à une température comprise entre 0 et 5 °C. Les conidies sont incolores et ont un revêtement visqueux. G. candidum est également présent occasionnellement dans les intestins, les selles, les expectorations et la peau. Le champignon se développe dans le sol, l'eau, les eaux usées, divers substrats végétaux, la pâte de boulanger, les enveloppes de fermentation, le pain, le lait et les produits laitiers. La température optimale de croissance est de 25 °C avec un pH de 5,0–5,5[7]. La plage de température change en fonction de la surface sur laquelle le champignon se développe. Par exemple, chez les plantes, la température optimale se situe entre 25 et 27 °C. Chez les animaux, la température optimale se situe entre 30 et 31 °C. La température maximale de croissance est de 35 à 38 °C. La croissance fongique peut être favorisée par le D-glucose, le D-mannose, le D-xylose, le L-sorbose, le D-fructose, le D-galactose, le saccharose, le D-mannitol, le sorbitol, l'éthanol et le glycérol. La sporulation nécessite souvent un équilibre de carbone et d'azote[1].
Geotrichum candidum est extrêmement commun dans les sols et a été isolé de substrats au Canada, aux États-Unis, en Grande-Bretagne, en Allemagne, en Autriche, en Inde, en Afrique du Sud, au Japon, au Brésil et au Pérou[1]. On le trouve également en tant qu'agent causal dans la pourriture acide des agrumes, une pourriture molle associée à l'émission d'une odeur fruitée. Le champignon est également connu comme agent de dégradation après récolte du melon, des courges et des concombres. Il joue un rôle dans la pourriture des fruits de la tomate quand il est conservé à une température de 0 à 5 °C.
G. candidum peut être utilisé dans le commerce pour ensemencer des fromages à croûte fleurie[7]. Les cultures peuvent être ajoutées au lait, à la saumure ou pulvérisées sur la surface du fromage. La plage de pH optimale pour la croissance sur le fromage varie de 4,4 à 6,7. Le champignon colonise presque toute la surface du fromage au début de sa maturation. On le trouve sur les fromages à pâte molle comme le camembert et les fromages à pâte mi-dure tels que le saint-nectaire et le reblochon. Pour le camembert, les champignons se développent à l'extérieur du fromage, formant une croûte. Le champignon est responsable de la couche uniforme, blanche et veloutée du saint-marcellin. Les lipases et les protéases de G. candidum libèrent des acides gras et des peptides qui confèrent au fromage des arômes distinctifs. G. candidum réduit l'amertume du camembert grâce à l'activité des aminopeptidases qui hydrolysent des peptides hydrophobes de faible poids moléculaire. Les aminopeptidases contribuent également à l'arôme du camembert normand traditionnel. Le champignon neutralise également le caillé en catabolisant l'acide lactique produit par les bactéries. G. candidum prépare le fromage à la colonisation d'autres bactéries sensibles aux acides, telles que Brevibacterium. Le champignon inhibe la croissance de la bactérie Listeria monocytogenes. Des souches commerciales de G. candidum sont disponibles pour l'affinage du fromage[7].
Geotrichum candidum est une espèce du genre Geotrichum.
Ce fungi fait partie du microbiome humain, notamment associé à la peau, aux expectorations et aux matières fécales, où il est présent dans 25-30% des échantillons. Il est courant dans les sols et a été isolé des sols collectés dans le monde entier, sur tous les continents.
Geotrichum candidum est l’agent responsable de la géotrichose chez l'homme, ainsi que de la pourriture aigre, une maladie chez les plantes qui infecte les agrumes, les tomates, les carottes et d’autres légumes. Il peut affecter les fruits cultivés de Durio tels que Durio graveolens.
G. candidum est largement utilisé dans la production de certains produits laitiers, y compris les fromages à croûte tels que le camembert, le saint-nectaire, le reblochon, etc. Le champignon peut également être trouvé dans le viili, où il est responsable de la texture veloutée du produit.
Dans une étude de 2001, on constate que G. candidum consomme le polycarbonate trouvé dans des CD.
Geotrichum candidum je grzib[34], co go ôpisoł Link 1809. Geotrichum candidum nŏleży do zorty Geotrichum i familije Dipodascaceae.[35][36] Żŏdne podgatōnki niy sōm wymianowane we Catalogue of Life.[35]
Geotrichum candidum je grzib, co go ôpisoł Link 1809. Geotrichum candidum nŏleży do zorty Geotrichum i familije Dipodascaceae. Żŏdne podgatōnki niy sōm wymianowane we Catalogue of Life.
Oospora humi je grzib[2], co go nojprzōd ôpisoł P. Mazé, a terŏźnõ nazwã doł mu Christine Marie Berkhout 1923. Oospora humi nŏleży do zorty Oospora i familije Erysiphaceae.[3][4] Żŏdne podgatōnki niy sōm wymianowane we Catalogue of Life.[3]
Oospora humi je grzib, co go nojprzōd ôpisoł P. Mazé, a terŏźnõ nazwã doł mu Christine Marie Berkhout 1923. Oospora humi nŏleży do zorty Oospora i familije Erysiphaceae. Żŏdne podgatōnki niy sōm wymianowane we Catalogue of Life.