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Armatimonadetes

Armatimonadetes ( 因特語(國際輔助語言協會) )

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Armatimonadetes es un phylo de Negibacteria.

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आर्माटीमोनाडीटीस ( 印地語 )

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आर्माटीमोनाडीटीस (Armatimonadetes) ग्राम-ऋणात्मक बैक्टीरिया का एक जीववैज्ञानिक संघ है। इस संघ की परिभाषा 16S राइबोसोम आर०ऍन०ए० में उपस्थित जीन शृंखला के अधार पर की गई है। सन् 2011 में जापान में एक जलीय पौधे से इस संघ की सबसे पहली ज्ञात जाति का बैक्टीरीया मिला, जिसका नाम आर्माटीमोनास रोज़िया (Armatimonas rosea) रखा गया।[1][2]

इन्हें भी देखें

सन्दर्भ

  1. Tamaki, Hideyuki; Tanaka, Yasuhiro; Matsuzawa, Hiroaki; Muramatsu, Mizuho; Meng, Xian-Ying; Hanada, Satoshi; Mori, Kazuhiro; Kamagata, Yoichi (2010). "Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., a Gram-negative, aerobic, chemoheterotrophic bacterium of a novel bacterial phylum, Armatimonadetes phyl. nov., formally called the candidate phylum OP10". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 6): 1442–7. PMID 20622056. डीओआइ:10.1099/ijs.0.025643-0.
  2. Lee, Kevin C. Y.; Dunfield, Peter F.; Morgan, Xochitl C.; Crowe, Michelle A.; Houghton, Karen M.; Vyssotski, Mikhail; Ryan, Jason L. J.; Lagutin, Kirill; एवं अन्य (2010). "Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., an aerobic, pigmented, thermophilic microorganism of a novel bacterial class, Chthonomonadetes classis. nov., of the newly described phylum Armatimonadetes originally designated candidate division OP10". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 10): 2482–90. PMID 21097641. डीओआइ:10.1099/ijs.0.027235-0.
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आर्माटीमोनाडीटीस: Brief Summary ( 印地語 )

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आर्माटीमोनाडीटीस (Armatimonadetes) ग्राम-ऋणात्मक बैक्टीरिया का एक जीववैज्ञानिक संघ है। इस संघ की परिभाषा 16S राइबोसोम आर०ऍन०ए० में उपस्थित जीन शृंखला के अधार पर की गई है। सन् 2011 में जापान में एक जलीय पौधे से इस संघ की सबसे पहली ज्ञात जाति का बैक्टीरीया मिला, जिसका नाम आर्माटीमोनास रोज़िया (Armatimonas rosea) रखा गया।

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Armatimonadota ( 英語 )

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Armatimonadota is a phylum of gram-negative bacteria.

History

Armatimonadota was originally described solely on the basis of environmental 16S rRNA gene clone sequences, and was temporarily titled candidate phylum OP10. However, in 2011 a bacterial strain belonging to the phylum was isolated from an aquatic plant in Japan. The species was named Armatimonas rosea and was the first member of its phylum, genus, and species.[2]

Members

Armatimonas rosea, an aerobic chemoheterotrophic bacterium, strain YO-36T, was isolated from rhizoplane of an aquatic plant (a reed, Phragmites australis) inhabiting a freshwater lake in Japan.[2]

Chthonomonas calidirosea, an aerobic, saccharolytic, obligately thermophilic, motile, non-spore-forming bacterium, strain T49(T), was isolated from geothermally heated soil at Hell's Gate, Tikitere, New Zealand.[3]

Phylogeny

Taxonomy

The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[10] and National Center for Biotechnology Information (NCBI).[11]

Notes

References

  1. ^ Oren A, Garrity GM (2021). "Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes". Int J Syst Evol Microbiol. 71 (10): 5056. doi:10.1099/ijsem.0.005056. PMID 34694987.
  2. ^ a b Tamaki, Hideyuki; Tanaka, Yasuhiro; Matsuzawa, Hiroaki; Muramatsu, Mizuho; Meng, Xian-Ying; Hanada, Satoshi; Mori, Kazuhiro; Kamagata, Yoichi (2010). "Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., a Gram-negative, aerobic, chemoheterotrophic bacterium of a novel bacterial phylum, Armatimonadetes phyl. nov., formally called the candidate phylum OP10". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 6): 1442–7. doi:10.1099/ijs.0.025643-0. PMID 20622056.
  3. ^ Lee, Kevin C. Y.; Dunfield, Peter F.; Morgan, Xochitl C.; Crowe, Michelle A.; Houghton, Karen M.; Vyssotski, Mikhail; Ryan, Jason L. J.; Lagutin, Kirill; et al. (2010). "Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., an aerobic, pigmented, thermophilic microorganism of a novel bacterial class, Chthonomonadetes classis. nov., of the newly described phylum Armatimonadetes originally designated candidate division OP10". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 10): 2482–90. doi:10.1099/ijs.0.027235-0. PMID 21097641.
  4. ^ "The LTP". Retrieved 23 February 2021.
  5. ^ "LTP_all tree in newick format". Retrieved 23 February 2021.
  6. ^ "LTP_12_2021 Release Notes" (PDF). Retrieved 23 February 2021.
  7. ^ "GTDB release 08-RS214". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2023.
  8. ^ "bac120_r214.sp_label". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2023.
  9. ^ "Taxon History". Genome Taxonomy Database. Retrieved 10 May 2023.
  10. ^ J.P. Euzéby. "Armatimonadetes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Archived from the original on 2011-06-13. Retrieved 2016-03-20.
  11. ^ Sayers; et al. "Armatimonadetes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2016-03-20.

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Armatimonadota: Brief Summary ( 英語 )

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Armatimonadota is a phylum of gram-negative bacteria.

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Armatimonadetes ( 西班牙、卡斯蒂利亞西班牙語 )

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Armatimonadetes o Armatimonadota es un filo[1][2]​ de bacterias Gram negativas aerobias quimioheterótrofas que fue provisionalmente denominado filo candidato OP10. Está conformado por las siguientes especies:

  • Armatimonas rosea: Bacteria mesófila, con temperatura óptima de 30-35ºC y de colonias rosadas.
  • Chthonomonas calidirosea: Bacteria termoacidófila, con temperatura óptima de 68ºC, pH 5,3, con movilidad y de colonias rosadas.
  • Fimbriimonas ginsengisoli: Bacilo mesófilo, con temperatura óptima de 30ºC, sin movilidad y de colonias marfil.

Filogenia

Armatimonadetes podría ser relacionado con Elusimicrobia dentro del clado Gracilicutes o con las bacterias grampositivas en el clado Terrabacteria.[3]​ Sus relaciones internas serían las siguientes:[4]

   

Fimbriimonas Im et al. 2012

     

Armatimonas Tamaki et al. 2011

   

Chthonomonas Lee et al. 2011

     

Referencias

  1. Donovan H. Parks, Maria Chuvochina, David W. Waite, Christian Rinke, Adam Skarshewski, Pierre-Alain Chaumeil, Philip Hugenholtz (2018). A proposal for a standardized bacterial taxonomy based on genome phylogeny. Biorxiv.
  2. Genome database. Armatimonadota.
  3. Hug, L. A. et al. 2016, A new view of the tree of life. Nature Microbiology, 1, 16048.
  4. All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 115 (full tree)". Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database
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Armatimonadetes: Brief Summary ( 西班牙、卡斯蒂利亞西班牙語 )

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Armatimonadetes o Armatimonadota es un filo​​ de bacterias Gram negativas aerobias quimioheterótrofas que fue provisionalmente denominado filo candidato OP10. Está conformado por las siguientes especies:

Armatimonas rosea: Bacteria mesófila, con temperatura óptima de 30-35ºC y de colonias rosadas. Chthonomonas calidirosea: Bacteria termoacidófila, con temperatura óptima de 68ºC, pH 5,3, con movilidad y de colonias rosadas. Fimbriimonas ginsengisoli: Bacilo mesófilo, con temperatura óptima de 30ºC, sin movilidad y de colonias marfil.
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Armatimonadetes ( 加利西亞語 )

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Armatimonadetes é un novo filo de bacterias, que era antes coñecido co nome de filo candidato OP10. O filo OP10 estaba composto só por secuencias clonadas de xenes de ARNr 16S de mostras ambientais, pero posteriormente foron descritas formalmente tres cepas para a súa validación como especies, e déuselle nome ao filo.

As tres especies que comprende este filo son:

Filoxenia

A taxonomía aceptada actualmente deste filo está baseada na List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [3] e no National Center for Biotechnology Information (NCBI)[4] e a filoxenia está baseada no ARNr 16S LTP 115 de The All-Species Living Tree Project [5] Armatimonadetes estaría relacionado con Elusimicrobia.

   

Fimbriimonas ginsengisoli Im et al. 2012

     

Armatimonas rosea Tamaki et al. 2011

   

Chthonomonas calidirosea Lee et al. 2011

     

Notas

  1. Tamaki, Hideyuki; Tanaka, Yasuhiro; Matsuzawa, Hiroaki; Muramatsu, Mizuho; Meng, Xian-Ying; Hanada, Satoshi; Mori, Kazuhiro; Kamagata, Yoichi (2010). "Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., a Gram-negative, aerobic, chemoheterotrophic bacterium of a novel bacterial phylum, Armatimonadetes phyl. nov., formally called the candidate phylum OP10". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 61 (Pt 6): 1442–7. PMID 20622056. doi:10.1099/ijs.0.025643-0.
  2. Lee, Kevin C. Y.; Dunfield, Peter F.; Morgan, Xochitl C.; Crowe, Michelle A.; Houghton, Karen M.; Vyssotski, Mikhail; Ryan, Jason L. J.; Lagutin, Kirill; et al. (2010). "Chthonomonas calidirosea gen. nov., sp. nov., an aerobic, pigmented, thermophilic microorganism of a novel bacterial class, Chthonomonadetes classis. nov., of the newly described phylum Armatimonadetes originally designated candidate division OP10". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 61 (Pt 10): 2482–90. PMID 21097641. doi:10.1099/ijs.0.027235-0.
  3. J.P. Euzéby. "Armatimonadetes". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Arquivado dende o orixinal o 13 de xuño de 2011. Consultado o 2014-03-20.
  4. Sayers; et al. "Armatimonadetes". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado o 2014-03-20.
  5. All-Species Living Tree Project."16S rRNA-based LTP release 115 (full tree)" (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Consultado o 2014-03-20.
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Armatimonadetes: Brief Summary ( 加利西亞語 )

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Armatimonadetes é un novo filo de bacterias, que era antes coñecido co nome de filo candidato OP10. O filo OP10 estaba composto só por secuencias clonadas de xenes de ARNr 16S de mostras ambientais, pero posteriormente foron descritas formalmente tres cepas para a súa validación como especies, e déuselle nome ao filo.

As tres especies que comprende este filo son:

Armatimonas rosea, cepa YO-36T, unha bacteria aerobia quimioheterótrofa, illada do rizoplano do xunco Phragmites australis que vivía nun lago do Xapón. A súa temperatura óptima é de 30-35 °C e forma colonias rosas. Chthonomonas calidirosea, cepa T49(T), bacteria non formadora de esporas aerobia, sacarolítica, termófila obrigada (óptimo a 60 °C) e motil, que foi illada dun chan quentado xeotermicamente en Hell's Gate, Tikitere, Nova Zelandia. Ten un pH óptimo de 5,3, e forma colonias rosas. Fimbriimonas ginsengisoli, bacilo mesófilo, con temperatura óptima de 30 °C, sen mobilidade, que forma colonias cor marfil.
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Armatimonadetes ( 摩爾多瓦語 )

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Armatimonadetes este o încrengătură de bacterii Gram-negative. Denumirea provine de la prima specie descoperită din această încrengătură, Armatimonas rosea.[1]

Caracteristici

Note

  1. ^ Tamaki, Hideyuki; Tanaka, Yasuhiro; Matsuzawa, Hiroaki; Muramatsu, Mizuho; Meng, Xian-Ying; Hanada, Satoshi; Mori, Kazuhiro; Kamagata, Yoichi (2010). „Armatimonas rosea gen. nov., sp. nov., a Gram-negative, aerobic, chemoheterotrophic bacterium of a novel bacterial phylum, Armatimonadetes phyl. nov., formally called the candidate phylum OP10”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61 (Pt 6): 1442–7. doi:10.1099/ijs.0.025643-0. PMID 20622056.

Legături externe

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Armatimonadetes: Brief Summary ( 摩爾多瓦語 )

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Armatimonadetes este o încrengătură de bacterii Gram-negative. Denumirea provine de la prima specie descoperită din această încrengătură, Armatimonas rosea.

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アルマティモナス門 ( 日語 )

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アルマティモナス門 分類 ドメ
イン
: 細菌 Bacteria : アルマティモナス門
Armatimonadetes 下位分類(綱)

アルマティモナス門(-もん、Armatimonadetes)は、2011年に提唱された真正細菌の門である。

ヨシ根圏から発見されたArmatimonas rosea(アルマティモナス・ロセア)が、既知の細菌門とは系統的に大きく異なることから2011年7月に提唱された。難未培養細菌とされていたOP10系統に属すとみられるが、A. roseaの培養自体はそれほど難しくない。また、2011年10月にはニュージーランドの地熱により加熱された土壌よりChthonomonas calidirosea(クトノモナス・カリディロセア)が発見され、Chthonomonadetes(クトノモナス綱)が、2012年にはチョウセンニンジンの畑からFimbriimonas ginsengisoli(フィンブリイモナス・ギンセンギソリ)が発見されフィンブリイモナス綱が記載された。この3種はグラム陰性の好気性細菌で、何れも化学合成従属栄養により増殖する。

参考文献[編集]

執筆の途中です この項目は、真正細菌(バクテリア)に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めていますPortal:生き物と自然ウィキプロジェクト 生物)。
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アルマティモナス門: Brief Summary ( 日語 )

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アルマティモナス門(-もん、Armatimonadetes)は、2011年に提唱された真正細菌の門である。

ヨシ根圏から発見されたArmatimonas rosea(アルマティモナス・ロセア)が、既知の細菌門とは系統的に大きく異なることから2011年7月に提唱された。難未培養細菌とされていたOP10系統に属すとみられるが、A. roseaの培養自体はそれほど難しくない。また、2011年10月にはニュージーランドの地熱により加熱された土壌よりChthonomonas calidirosea(クトノモナス・カリディロセア)が発見され、Chthonomonadetes(クトノモナス綱)が、2012年にはチョウセンニンジンの畑からFimbriimonas ginsengisoli(フィンブリイモナス・ギンセンギソリ)が発見されフィンブリイモナス綱が記載された。この3種はグラム陰性の好気性細菌で、何れも化学合成従属栄養により増殖する。

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아르마티모나스문 ( 韓語 )

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아르마티모나스문(Armatimonadetes)은 세균 문의 하나이다. 이전에 후보 문 OP10으로 알려졌다. 갈대의 근권(根圏)에서 발견되는 아르마티모나스 로세아 (Armatimonas rosea)가 기존의 세균 문과는 계통적으로 크게 다르기때문에 2011년 7월에 제안되었다. 배양이 어려운 세균으로 OP10 계통에 속한다고 알려졌지만, 아르마티모나스 로세아의 배양 자체는 그리 어렵지 않다.

2011년 10월에는 뉴질랜드의 토양에서 크토노모나스 칼리디로세아(Chthonomonas calidirosea)가 발견되어 크토노모나스강(Chthonomonadetes)이 명명되었고, 2012년에는 고려인삼 밭에서 핌브리모나스 긴센기솔리(Fimbriimonas ginsengisoli)가 발견되어 핌브리모나스강(Fimbriimonadia)이 기술되었다. 이 3종의 그람음성균은 호기성 세균으로 모두 화학 합성 종속 영양에 의해 증식한다.

분류

  • 아르마티모나스문 (Armatimonadetes)
    • 핌브리모나스강 (Fimbriimonadia)
      • 핌브리모나스목 (Fimbriimonadales)
        • 핌브리모나스과 (Fimbriimonadaceae)
          • 핌브리모나스속 (Fimbriimonas)[1] Im et al. 2006
            • 핌브리모나스 긴센기솔리 (Fimbriimonas ginsengisoli) Im et al. 2006
    • 아르마티모나스강 (Armatimonadia) Tamaki et al. 2011
      • 아르마티모나스목 (Armatimonadales) Tamaki et al. 2011
        • 아르마티모나스과 (Armatimonadaceae) Tamaki et al. 2011
          • 아르마티모나스속 (Armatimonas) Tamaki et al. 2011
            • 아르마티모나스 로세아 (Armatimonas rosea) Tamaki et al. 2011
    • 크토노모나스강 (Chthonomonadetes) Lee et al. 2011
      • 크토노모나스목 (Chthonomonadales) Lee et al. 2011
        • 크토노모나스과 (Chthonomonadaceae) Lee et al. 2011
          • 크토노모나스속 (Chthonomonas) Lee et al. 2011
            • 크토노모나스 칼리디로세아 (Chthonomonas calidirosea)Lee et al. 2011

계통 분류

아래 분류는 원핵생물명 목록(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, LPSN)과[2][3] "현존하는 모든 생물 종의 계통수 프로젝트"(The All-Species Living Tree Project)의 16S rRNA 계통발생학 연구를 기초로 작성했다.[4][5]

   

? Fimbriimonas ginsengisoli[1] Im et al. 2006

   

Armatimonas rosea Tamaki et al. 2011

   

Chthonomonas calidirosea Lee et al. 2011

   

각주

  1. 미국 국립생물공학정보센터(NCBI, National Center for Biotechnology Information) 정보에서는 발견되지만, 원핵생물명 목록(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, LPSN)에서는 보이지 않는다.
  2. 원핵생물명 목록(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, LPSN) 참조. J.P. Euzéby. “Deferribacteres”. 2013년 1월 27일에 원본 문서에서 보존된 문서. 2011년 11월 17일에 확인함.에서 데이터 추출
  3. 미국 국립생물공학정보센터(NCBI, National Center for Biotechnology Information)의 아르마티모나스문(Armatimonadetes) 정보 참조 Sayers; 외. “Armatimonadetes”. 미국 국립생물공학정보센터. 2011년 6월 5일에 확인함.
  4. "현존하는 모든 생물 종의 계통수 프로젝트"(The All-Species Living Tree Project) 정보(참조. “16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)” (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. 2012년 5월 7일에 원본 문서 (PDF)에서 보존된 문서. 2011년 11월 17일에 확인함.
  5. “16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)” (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. 2012년 5월 7일에 원본 문서 (PDF)에서 보존된 문서. 2011년 11월 17일에 확인함.
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아르마티모나스문: Brief Summary ( 韓語 )

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아르마티모나스문(Armatimonadetes)은 세균 문의 하나이다. 이전에 후보 문 OP10으로 알려졌다. 갈대의 근권(根圏)에서 발견되는 아르마티모나스 로세아 (Armatimonas rosea)가 기존의 세균 문과는 계통적으로 크게 다르기때문에 2011년 7월에 제안되었다. 배양이 어려운 세균으로 OP10 계통에 속한다고 알려졌지만, 아르마티모나스 로세아의 배양 자체는 그리 어렵지 않다.

2011년 10월에는 뉴질랜드의 토양에서 크토노모나스 칼리디로세아(Chthonomonas calidirosea)가 발견되어 크토노모나스강(Chthonomonadetes)이 명명되었고, 2012년에는 고려인삼 밭에서 핌브리모나스 긴센기솔리(Fimbriimonas ginsengisoli)가 발견되어 핌브리모나스강(Fimbriimonadia)이 기술되었다. 이 3종의 그람음성균은 호기성 세균으로 모두 화학 합성 종속 영양에 의해 증식한다.

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