Secoviridae is a family of viruses in the order Picornavirales. Plants serve as natural hosts. There are 8 genera and 86 species in this family, one of which is unassigned to a genus.[1][2][3][4] The family was created in 2009 with the grouping of families Sequiviridae, now dissolved, and Comoviridae, now subfamily Comovirinae, along with the then unassigned genera Cheravirus, Sadwavirus, and Torradovirus.[4]
The family includes the following genera (-virinae denotes subfamily and -virus denotes genus):[4]
Lastly, one species is unassigned to a genus: Strawberry latent ringspot virus.
Viruses in Secoviridae are non-enveloped, with icosahedral geometries, and T=pseudo3 symmetry. The diameter is around 25-30 nm. Genomes are linear and segmented, bipartite, around 24-7kb in length.[1][2][3]
Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the positive stranded RNA virus replication model. Positive stranded RNA virus transcription is the method of transcription. The virus exits the host cell by tubule-guided viral movement. Plants serve as the natural host. Transmission routes are mechanical.[1][2][3]
The subfamily Comovirinae evolved ~1,000 years ago with extant species diversifying between 50 and 250 years ago.[5] This time period coincides with the intensification of agricultural practices in industrial societies.
The mutation rate has been estimated to be 9.29×10−3 to 2.74×10−3 subs/site/year.
Secoviridae is a family of viruses in the order Picornavirales. Plants serve as natural hosts. There are 8 genera and 86 species in this family, one of which is unassigned to a genus. The family was created in 2009 with the grouping of families Sequiviridae, now dissolved, and Comoviridae, now subfamily Comovirinae, along with the then unassigned genera Cheravirus, Sadwavirus, and Torradovirus.
Secoviridae es una familia de virus de ARN monocatenario positivo que infectan plantas y son importantes patógenos.[1][2][3]
Los miembros de la familia Secoviridae son virus sin envoltura vírica con genomas de ssARN lineal mono o bipartito (ARN-1 y ARN-2) de 9 a 13.7 kilobases en total y tienen un único conjunto de proteínas para la cápside de 52 a 60 kDa. Los viriones son icosaedricos. La replicación se produce en el retículo endoplasmático.[1][2][3]
El ARN viral no fraccionado es altamente infeccioso. En el caso de los virus con un genoma bipartito, ninguna de las especies de ARN puede infectar a las plantas de forma sistémica. El ARN-1 lleva toda la información requerida para la replicación y puede replicarse en células individuales en ausencia de ARN-2, aunque no se producen partículas virales (como se demostró para los comovirus y nepovirus).[1][2][3]
Las proteínas virales generalmente se expresan como poliproteínas grandes, que son escindidas por proteinasas similares a 3C. Cada ARN generalmente codifica una sola poliproteína. Una excepción notable es el ARN-2 de los torradovirus, que contiene dos ORF. Otra excepción es el ARN-2 de los comovirus. Aunque está presente un solo ORF grande, la iniciación interna en un segundo AUG permite la formación de dos poliproteínas distintas. En algunos casos, se encuentran regiones extensas de identidad de secuencia entre ARN-1 y ARN-2 en las regiones no traducidas.[2][3][4]
Incluye las siguientes subfamilias y géneros:[1]
Datos: Q3477217
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Especies: Secoviridae
Secoviridae es una familia de virus de ARN monocatenario positivo que infectan plantas y son importantes patógenos.
Los miembros de la familia Secoviridae son virus sin envoltura vírica con genomas de ssARN lineal mono o bipartito (ARN-1 y ARN-2) de 9 a 13.7 kilobases en total y tienen un único conjunto de proteínas para la cápside de 52 a 60 kDa. Los viriones son icosaedricos. La replicación se produce en el retículo endoplasmático.
El ARN viral no fraccionado es altamente infeccioso. En el caso de los virus con un genoma bipartito, ninguna de las especies de ARN puede infectar a las plantas de forma sistémica. El ARN-1 lleva toda la información requerida para la replicación y puede replicarse en células individuales en ausencia de ARN-2, aunque no se producen partículas virales (como se demostró para los comovirus y nepovirus).
Las proteínas virales generalmente se expresan como poliproteínas grandes, que son escindidas por proteinasas similares a 3C. Cada ARN generalmente codifica una sola poliproteína. Una excepción notable es el ARN-2 de los torradovirus, que contiene dos ORF. Otra excepción es el ARN-2 de los comovirus. Aunque está presente un solo ORF grande, la iniciación interna en un segundo AUG permite la formación de dos poliproteínas distintas. En algunos casos, se encuentran regiones extensas de identidad de secuencia entre ARN-1 y ARN-2 en las regiones no traducidas.
Les Secoviridae[3] sont une famille de virus qui comprend huit genres et 86 espèces. Ce sont des virus à ARN linéaire à simple brin à polarité positive, qui infectent les plantes (phytovirus). La famille est rattachée à la classe IV de la classification Baltimore.
Le génome, bipartite, comprend deux segments d'ARN linéaire, ARN-1 et ARN-2, longs de 6 à 8 kb et 4 à7 kb respectivement.
Les virions, non-enveloppés, sont constitués de capsides icosaédriques de 25 à 30 nm de diamètre.
Les Secoviridae sont transmis par différents vecteurs : soit des insectes (coléoptères, pucerons, aleurodes), soit par des nématodes (genres Charavirus, Nepovirus et Sadwavirus).
Selon NCBI (27 décembre 2020)[2]
La famille des Secoviridae comprend les genres suivants :
En outre l'espèce suivante n'est pas rattachée à un genre particulier :
Les Secoviridae sont une famille de virus qui comprend huit genres et 86 espèces. Ce sont des virus à ARN linéaire à simple brin à polarité positive, qui infectent les plantes (phytovirus). La famille est rattachée à la classe IV de la classification Baltimore.
Le génome, bipartite, comprend deux segments d'ARN linéaire, ARN-1 et ARN-2, longs de 6 à 8 kb et 4 à7 kb respectivement.
Les virions, non-enveloppés, sont constitués de capsides icosaédriques de 25 à 30 nm de diamètre.
Les Secoviridae sont transmis par différents vecteurs : soit des insectes (coléoptères, pucerons, aleurodes), soit par des nématodes (genres Charavirus, Nepovirus et Sadwavirus).
