ユニコンタ(Unikonta)は、トーマス・キャバリエ=スミスが提唱している真核生物の下のタクソンである[1][2]。
アメーボゾア、オピストコンタ[3][4]、そして恐らくはアプソゾア門[5]を含む。
この分類には、単一の鞭毛を持つものや繊毛を持たないアメーバが含まれる。2本の鞭毛を持つことが多い真核生物の他の分類は、バイコンタと呼ばれる。バイコンタには、アーケプラスチダ、エクスカバータ、リザリア、クロムアルベオラータが含まれる。
ユニコンタでは、バイコンタで見られない3遺伝子融合を持つ。3つの遺伝子の融合遺伝子は、ピリミジンヌクレオチド合成遺伝子であるカルバモイルリン酸シンターゼ、ジヒドロオロターゼ、アスパラギン酸カルバモイルトランスフェラーゼをコードする。これは、非常に珍しい融合であると考えられ、オピストコンタとアメーボゾアが共通の祖先を持つことを示唆する。
キャバリエ=スミス[1]はもともと、ユニコンタは1つの鞭毛と1つの基底小体を受け継いできたと主張していたが、鞭毛を持ったオピストコンタやアメーボゾアは、実際はバイコンタに典型的な2個の基底小体を持っている。このような対の配列は、動物細胞の中心小体でも見られる。ユニコンタの全ての共通の祖先は、グループの名前とは異なり、恐らく2つの基底小体を持っていたと考えられている。