dcsimg

Flavobacterium ( Alman )

fornì da wikipedia DE
 src=
Kiemeninfektion beim Königslachs durch Flavobacterium columnare

Flavobacterium ist eine Gattung von Bakterien.

Merkmale

Die Bakterien-Gattung Flavobacterium umfasst gramnegative, aerob-mikroaerophile Stäbchen von 4 – 8 μm Länge. Sie enthält einige fischpathogene Arten, die früher den Gattungen Cytophaga und Flexibacter zugerechnet wurden. Die Kolonien sind gelb bis rotorange pigmentiert, daher der Name (lateinisch flavus ‚gelb‘). Flagellen sind nicht vorhanden. Allerdings können sich einige Arten "gleitend" fortbewegen (gliding motility). Ihr Indol-Test ist normalerweise positiv. Viele Arten der Gattung Flavobacterium weisen einen hohen bis überwiegenden Anteil an verzweigten Fettsäureketten in ihren Membranlipiden auf.[1] Flavobacterium kann Sphaeroplasten bilden. Hierbei verliert es einen Großteil der Mureinschicht der Zellwand, bleibt aber lebensfähig.[2]

Stoffwechsel

Alle Arten von Flavobacterium sind chemoorganoheterotroph. Die Mehrheit ist strikt aerob und der Stoffwechselweg ist die Atmung. Einige Arten, wie Flavobacterium hydatis, F. johnsoniae und F. succinicans, können auch anaerob, also unter Sauerstoffausschluss, wachsen.

Viele Arten können zusätzlich zur Atmung auch Nitrat zu Nitrit reduzieren, z. B. F. johnsoniae und F. columnare. Flavobacterium denitrificans reduziert Nitrat komplett zu molekularem Stickstoff (N2). Es wurde aus einem Darm eines Regenwurms isoliert. Neben N2 wird hierbei auch Distickstoffmonoxid (Lachgas, N2O), ein Treibhausgas freigesetzt.[3]

Viele Arten sind proteolytisch und zersetzen Proteine. Sie können somit Verfärbungen und Fäulnis bei verschiedenen Lebensmitteln hervorrufen. Hierzu zählen z. B. Eier, Milch, Geflügel und Fische.[4]

Arten

Es folgt eine Auswahl von Arten:

Literatur

  • Medizinische Mikrobiologie, Infektions- und Seuchenlehre von Rolle/Mayr, Enke Verlag Stuttgart (2007)
  • M J Pickett: Methods for identification of flavobacteria. In: J Clin Microbiol. 1989 October; 27(10): 2309–2315. PMC 267015 (freier Volltext)

Einzelnachweise

  1. T. Kaneda: Iso- and anteiso-fatty acids in bacteria: biosynthesis, function, and taxonomic significance. In: Microbiol. Rev. 55(2); June 1991: S. 288–302 PMID 1886522 (freier Volltextzugang)
  2. Michael Goodfellow u. a. (Hrsg.): Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. 2. Auflage, Band 5: The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes. Springer, New York 2012, ISBN 978-0-387-95042-6.
  3. M. A. Horn: Dechloromonas denitrificans sp. nov., Flavobacterium denitrificans sp. nov., Paenibacillus anaericanus sp. nov. and Paenibacillus terrae strain MH72, N2O-producing bacteria isolated from the gut of the earthworm Aporrectodea caliginosa. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 55, Nr. 3, 2005, , S. 1255–1265. doi:10.1099/ijs.0.63484-0. PMID 15879265.
  4. Gunther Müller: Grundlagen der Lebensmittelmikrobiologie, S. 53. Springer Verlag 1983. ISBN 978-3-642-97769-5 doi:10.1007/978-3-642-97768-8
 title=
licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autoren und Herausgeber von Wikipedia
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia DE

Flavobacterium: Brief Summary ( Alman )

fornì da wikipedia DE
 src= Kiemeninfektion beim Königslachs durch Flavobacterium columnare

Flavobacterium ist eine Gattung von Bakterien.

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autoren und Herausgeber von Wikipedia
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia DE

Flavobacterium ( Anglèis )

fornì da wikipedia EN

Flavobacterium is a genus of Gram-negative, nonmotile and motile, rod-shaped bacteria that consists of 130 recognized species.[1][2] Flavobacteria are found in soil and fresh water in a variety of environments. Several species are known to cause disease in freshwater fish.[3]

Flavobacterium psychrophilum causes the bacterial cold water disease on salmonids and the rainbow trout fry disease on rainbow trout. F. columnare causes the cotton-wool disease on freshwater fishes. F. branchiophilum causes the bacterial gill disease on trout. Another member of this genus, F. okeanokoites is the original source for the type IIs restriction endonuclease FokI, used in Zinc finger nucleases and TALENs.[4]

Nylon-eating bacteria are a strain of Flavobacterium that is capable of digesting certain by-products of nylon 6 manufacture.

Species who are a part of the genus Flavobacterium are most likely found scattered along in nature. These microbes are mostly found in aquatic ecosystems and wet areas with freshwater or seawater. The Flavobacterium species are in most if not all cases found in some type of hypersaline water which is very halotolerant of the Antarctic species of [F.] gondwanense and [F.] salegens Which are the most important members of Flavobacteriaceae.

Species

The genus Flavobacterium comprises the following species:

F. acidificum[1]
F. aciduliphilum[1]
F. acidurans[1]
F. agri[1]
F. agrisoli[1]
F. ahnfeltiae[1]
F. ajazii[1]
F. album[1]
F. algicola[1]
F. alkalisoli[1]
F. ammonificans[1]
F. ammoniigenes[1]
F. amnicola[1]
F.amnigenum[1]
F. anatoliense[1]
F. anhuiense[1]
F. antarcticum[1]
F. aquaticum[1]
F. akiainvivens
F. aquariorum[1]
F. aquatile
F. aquicola[1]
F. aquidurense[1]
Flavobacterium aquimarinumF. aquimarinum[1]
F. araucananum[1]
F. arcticum[1]
F. arsenatis[1]
F. arsenitoxidans[1]
F. aurantiibacter[1]
F. aureus
F. banpakuense[1]
F. baculatum[1]
F. beibuense[1]
F. bernardetii[1]
F. bizetiae[1]
F. bomense[1]
F. bomensis[1]
F. branchiarum[1]
F. branchiicola[1]
F. branchiophilum
F. breve
F. brevivitae[1]
F. buctense[1]
F. caeni[1]
F. caseinilyticum[1]
F. cauense[1]
F. cellulosilyticum[1]
F. ceti[1]
F. cerinum[1]
F. cheniae[1]
F. cheongpyeongense[1]
F. cheonanense[1]
F. cheonhonense[1]
F. chilense[1]
F. chryseum[1]
F. chungangense[1]
F. chungbukense[1]
F. chungnamense[1]
Flavobacterium circumlabensF. circumlabens[1]
F. collinsense[1]
F. collinsii[1]
F. columnare
F. compostarboris[1]
F. commune[1]
F. coralii[1]
F. covae[1]
F. crassostreae[1]
F. croceum[1]
F. crocinum[1]
F. cucumis[1]
F. cupreum[1]
F. cutihirudinis[1]
F. cyanobacteriorum[1]
F. daejeonense[1]
F. daemonensis[1]
F. dankookense[1]
F. dasani[1]
F. dauae[1]
F. davisii[1]
F. defluvii[1]
F. degerlache[1]
F. denitrificans
F. devorans[1]
F. difficile[1]
F. dispersum[1]
F. dongtanense[1]
F. eburneum[1]
F. endophyticum[1]
F. endoglycinae[1]
F. enshiense[1]
F. faecale[1]
F. ferrugineum[1]
F. filum[1]
F. flaviflagrans[1]
F. flevense
F. fluviale[1]
F. fluviatile[1]
F. fluvii[1]
F. fontis[1]
F. franklandianum[1]
F. frigidarium
F. frigidimaris[1]
F frigoris[1]
F. fryxellicola[1]
F. fulvum[1]
F. gelidilacus[1]
F. gawalongense[1]
F. gillisiae[1]
F. ginsengisoli[1]
F. ginsenosidimutans[1]
F. glaciei[1]
F. glycines[1]
F. granuli[1]
F. halmophilum[1]
F. hankyongi[1]
F. haoranii[1]
F. hauense[1]
F. hercynium[1]
F. hibernum[1]
F. hiemivividum[1]
F. humi[1]
F. humicola[1]
F. hydatis
F. hydrocarbonoxydans[1]
F. hydrophilum[1]
F. ichthyis[1]
F. indicum[1]
F. inkyongense[1]
F. inviolabile[1]
F. jejuense[1]
F. jocheonensis[1]
F. johnsoniae
F. jumunjinense[1]
F. kingsejongi[1]
F. knui[1]
F. koreense[1]
F. kyungheense[1]
F. lacicola[1]
F. lacunae[1]
F. lacus[1]
F. laiguense[1]
F. limicola[1]
F. limnosediminis[1]
F. lindanitolerans[1]
F. longum[1]
F. lotistagni[1]
F. luticocti[1]
F. lutivivi[1]
F. macrobrachii[1]
F. magnum[1]
F. maotaiense[1]
F. marinum[1]
F. maris[1]
F.microcysteis[1]
F. micromati[1]
F. mizutaii[1]
F. muglaense[1]
F. myungsuense[1]
F. multivorum
F. nackdongense[1]
F. naphthae[1]
F. nitratireducens[1]
F. nitrogenifigens[1]
F. niveum[1]
F. noncentrifugens[1]
F. notoginsengisoli[1]
F. oceanosedimentum[1]
F. omnivorum[1]
F. oncorhynchi[1]
F. okeanokoites
F. orientale[1]
F. oreochromis[1]
F. oryzae[1]
F. panici[1]
F. palustre[1]
F. paronense[1]
F. parvum[1]
F. pectinovorum
F. pedocola[1]
F. petrolei[1]
F. phocarum[1]
F. phragmitis[1]
F. phycosphaerae[1]
F. piscinae[1]
F. piscis[1]
F. plurextorum[1]
F. pokkalii[1]
F. ponti[1]
F. procerum[1]
F. profundi[1]
F. psychrolimnae[1]
F. psychrophilum
F. psychroterrae[1]
F. psychrotolerans[1]
F. qiangtangense[1]
F. rakeshii[1]
F. ranwuense[1]
F. reichenbachii[1]
F. resistens[1]
F restrictum[1]
F. rhamnosiphilum[1]
Flavobacterium riviphilumF. riviphilum[1]
F. rivuli[1]
F. saccharophilum
F. saliperosum[1]
F. salilacus[1]
F. salmonis[1]
F. sandaracinum[1]
F. sangjuense[1]
F. sasangense[1]
F. segetis[1]
F. sediminilitoris[1]
F. sediminis[1]
F. selenitireducens[1]
F. seoulense[1]
F. sharifuzzamanii[1]
F. silvaticum[1]
F. silvisoli[1]
F. sinopsychrotolerans[1]
F. soli[1]
F. solisilvae[1]
F. spartansii[1]
F. squillarum[1]
F. stagni[1]
F. suaedae[1]
F. subsaxonicum[1]
F. succinans
F. suncheonense[1]
F. supellecticarium[1]
F. suzhouense[1]
F. swingsii[1]
F. tagetis[1]
F. tangerina[1]
F. tangerinum[1]
F. tegetincola[1]
F. terrae[1]
F. terrigena[1]
F. terriphilum[1]
F. thermophilum[1]
F. tiangeerense[1]
F. tibetense[1]
F. tilapiae[1]
F. tistrianum[1]
F. tructae[1]
F. tyrosinilyticum[1]
F. ummariense[1]
F. undicola[1]
F. ureilyticum[1]
F. urocaniciphilum[1]
F. urumqiense[1]
F. verecundum[1]
F. vireti[1]
F. viscosum[1]
F. weaverense[1]
F. xanthum
F. xinjiangense[1]
F. xueshanense[1]
F. yanchengense[1]
F. yonginense[1]
F. zaozhuangense[1]
F. zepuense[1]
F. zettnowii[1]
F. zhairuonense[1]
F. zhairuonensis[1]

References

  1. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq ar as at au av aw ax ay az ba bb bc bd be bf bg bh bi bj bk bl bm bn bo bp bq br bs bt bu bv bw bx by bz ca cb cc cd ce cf cg ch ci cj ck cl cm cn co cp cq cr cs ct cu cv cw cx cy cz da db dc dd de df dg dh di dj dk dl dm dn do dp dq dr ds dt du dv dw dx dy dz ea eb ec ed ee ef eg eh ei ej ek el em en eo ep eq er es et eu ev ew ex ey ez fa fb fc fd fe ff fg fh fi fj fk fl fm fn fo fp fq fr fs ft fu fv fw fx fy fz ga gb gc gd ge gf gg gh gi gj gk gl gm gn go gp gq gr gs gt gu gv gw gx gy gz ha hb hc hd he hf hg hh hi hj hk hl hm hn ho hp hq hr hs ht hu hv hw hx hy hz ia ib ic id ie if ig ih ii ij ik il im Parte, A.C. "Flavobacterium". LPSN.
  2. ^ Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd ed., vol. 1 (The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria) (D.R. Boone and R.W. Castenholz, eds.), Springer-Verlag, New York (2001). pp. 465-466.
  3. ^ Bernardet, J.-F.; Segers, P.; Vancanneyt, M.; Berthe, F.; Kersters, K.; Vandamme, P. (1 January 1996). "Cutting a Gordian Knot: Emended Classification and Description of the Genus Flavobacterium, Emended Description of the Family Flavobacteriaceae, and Proposal of Flaviobacterium hydatis nom. nov. (Basonym, Cytophaga aquatalis Strohl and Tait 1978)". International Journal of Systematic Bacteriology. 46 (1): 128–148. doi:10.1099/00207713-46-1-128.
  4. ^ Bitinaite, Jurate; Wah, David A.; Aggarwal, Aneel K.; Schildkraut, Ira (1 September 1998). "FokI dimerization is required for DNA cleavage". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 95 (18): 10570–10575. Bibcode:1998PNAS...9510570B. doi:10.1073/pnas.95.18.10570. PMC 27935. PMID 9724744.
licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Wikipedia authors and editors
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia EN

Flavobacterium: Brief Summary ( Anglèis )

fornì da wikipedia EN

Flavobacterium is a genus of Gram-negative, nonmotile and motile, rod-shaped bacteria that consists of 130 recognized species. Flavobacteria are found in soil and fresh water in a variety of environments. Several species are known to cause disease in freshwater fish.

Flavobacterium psychrophilum causes the bacterial cold water disease on salmonids and the rainbow trout fry disease on rainbow trout. F. columnare causes the cotton-wool disease on freshwater fishes. F. branchiophilum causes the bacterial gill disease on trout. Another member of this genus, F. okeanokoites is the original source for the type IIs restriction endonuclease FokI, used in Zinc finger nucleases and TALENs.

Nylon-eating bacteria are a strain of Flavobacterium that is capable of digesting certain by-products of nylon 6 manufacture.

Species who are a part of the genus Flavobacterium are most likely found scattered along in nature. These microbes are mostly found in aquatic ecosystems and wet areas with freshwater or seawater. The Flavobacterium species are in most if not all cases found in some type of hypersaline water which is very halotolerant of the Antarctic species of [F.] gondwanense and [F.] salegens Which are the most important members of Flavobacteriaceae.

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Wikipedia authors and editors
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia EN

Flavobacterium ( Spagneul; Castilian )

fornì da wikipedia ES

Flavobacterium es un género de bacterias perteneciente al grupo de las flavobacterias organotrofas. Se trata de bacilos aerobios, inmóviles. Gram negativos. Típicos de agua dulce y salada, alimentos, y plantas procesadoras. Es una especie comensal en ciertos animales acuáticos. Pigmentadas de color amarillo/naranja.

Existe asimismo alguna especie patógena oportunista de humanos y peces. Por ejemplo, Flavobacterium psychrophilum causa la enfermedad del agua fría.

Algunas especies o géneros relacionados tienen carácter psicrófilo.

Especies

 title=
licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autores y editores de Wikipedia
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia ES

Flavobacterium: Brief Summary ( Spagneul; Castilian )

fornì da wikipedia ES

Flavobacterium es un género de bacterias perteneciente al grupo de las flavobacterias organotrofas. Se trata de bacilos aerobios, inmóviles. Gram negativos. Típicos de agua dulce y salada, alimentos, y plantas procesadoras. Es una especie comensal en ciertos animales acuáticos. Pigmentadas de color amarillo/naranja.

Existe asimismo alguna especie patógena oportunista de humanos y peces. Por ejemplo, Flavobacterium psychrophilum causa la enfermedad del agua fría.

Algunas especies o géneros relacionados tienen carácter psicrófilo.

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autores y editores de Wikipedia
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia ES

Nailonia syövä bakteeri ( Finlandèis )

fornì da wikipedia FI

Nailonia syövä bakteeri on nailontehtaan jätevedestä vuonna 1975 löydetty bakteeri, joka kykenee syömään joitain nailonin valmistukseen liittyviä aineita. Näitä ovat esim. aminokaproiinihappo (6-aminoheksaolaatti). Nailonia syövä bakteeri on eräs flavobakteeri sp. K172:n kanta, jolla on nylonaaseiksi kutsuttuja entsyymejä.

Nailonia syövä bakteeri ja evoluutio

Nailon on synteettinen muovi, jonka valmistus alkoi 1935. Tämä loi uuden elinympäristön, jossa ei ollut kilpailua. Nailonia syövät bakteerit muodostuivat mutaation perusteella. Ne löysi geneetikko Susumu Ohno. Hänen mukaansa nailonaasi entsyymin mutaatio koitui kombinaatiosta geenin monistumisesta ja DNAn lukukehyksen muuttumisesta (en: Frame shift).[1]

Nailonia syövät bakteerit ovat hyvä esimerkki evoluutiosta, jossa laji saavuttaa kilpailuedun mutaatioiden ansiosta ja luonnonvalintata suosii näitä ominaisuuksia.

Lähteet

  • Kinoshita S, Kageyama S, Iba K, Yamada Y, Okada H: tilization of a cyclic dimer and linear oligomers of ε-aminocapronoic acid by Achromobacter guttatus K172. Agric. Biol. Chem., 1981, 116. vsk, s. 547–551. Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)
  • Yomo, T, Urabe, I, Okada, H: No stop codons in the antisense strands of the genes for nylon oligomer degradation.. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 1.5.1992, 89. vsk, nro 9, s. 3780-3784. PubMed:1570296. doi:10.1073/pnas.89.9.3780. Artikkelin verkkoversio Viitattu 28.5.2012. (englanniksi)
  • Prijambada, ID, Negoro, S, Yomo, T, Urabe, I: Emergence of nylon oligomer degradation enzymes in Pseudomonas aeruginosa PAO through experimental evolution.. Applied and environmental microbiology, 1995 May, 61. vsk, nro 5, s. 2020-2022. PubMed:7646041. Artikkelin verkkoversio (PDF, ilmainen artikkeli) Viitattu 28.5.2012. (englanniksi)

Viitteet

  1. Ohno, S: Birth of a unique enzyme from an alternative reading frame of the preexisted, internally repetitious coding sequence.. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 1984 Apr, 81. vsk, nro 8, s. 2421-2425. PubMed:6585807. Artikkelin verkkoversio (PDF, Free PMC Article) Viitattu 28.5.2012. (englanniksi)
Tämä biologiaan liittyvä artikkeli on tynkä. Voit auttaa Wikipediaa laajentamalla artikkelia.
licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Wikipedian tekijät ja toimittajat
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia FI

Nailonia syövä bakteeri: Brief Summary ( Finlandèis )

fornì da wikipedia FI

Nailonia syövä bakteeri on nailontehtaan jätevedestä vuonna 1975 löydetty bakteeri, joka kykenee syömään joitain nailonin valmistukseen liittyviä aineita. Näitä ovat esim. aminokaproiinihappo (6-aminoheksaolaatti). Nailonia syövä bakteeri on eräs flavobakteeri sp. K172:n kanta, jolla on nylonaaseiksi kutsuttuja entsyymejä.

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Wikipedian tekijät ja toimittajat
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia FI

Flavobacterium ( Fransèis )

fornì da wikipedia FR

Le genre Flavobacterium rassemble des bactéries en forme de bâtonnet, à coloration de gram négatif, non fermentantes et aérobies strict.

Les Flavobacterium sont des bactéries présentes dans le sol ou les eaux douces. Certaines espèces comme Flavobacterium psychrophilum sont pathogènes pour les poissons.

Le nom Flavobacterium vient du latin flavus, qui veut dire jaune. En effet, les premières bactéries du genre découvertes se multipliaient en créant des taches jaunes.

Une souche a développé la capacité de digérer des sous-produits du nylon.

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Auteurs et éditeurs de Wikipedia
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia FR

Flavobacterium ( Galissian )

fornì da wikipedia gl Galician

Flavobacterium é un xénero de bacterias gramnegativas, con forma de bacilo con especies móbiles e non móbiles, que consta de 130 especies recoñecidas (http://www.bacterio.net/flavobacterium.html),[1] e de 3 especies novas propostas (F. gondwanense,[2] F. salegens,[2] e F. scophthalmum[3]). As flavobacterias atópanse no solo e auga doce en diversos ambientes. Varias especies causan doenzas en peixes de auga doce.[4]

Flavobacterium psychrophilum causa doenzas na troita arco da vella e outros salmónidos. Flavobacterium columnare causa unha enfermidade en peixes de auga doce, como os siluriformes. Flavobacterium branchiophilum causa nas troitas unha enfermidade nas branquias.

A especie tipo do xénero é Flavobacterium aquatile (Frankland and Frankland 1889) Bergey et al. 1923. O nome do xénero significa "bacteria amarela".[5]

Notas

  1. D.R. Boone and R.W. Castenholz, ed. (2001). Bergey's manual of systematic bacteriology. 1. The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria (2nd ed.). New York: Springer. pp. 465–466. ISBN 0387987711. OCLC 45951601.
  2. 2,0 2,1 Dobson; Colwell, RR; McMeekin, TA; Franzmann, PD; et al. (Jan 1993). "Direct sequencing of the polymerase chain reaction-amplified 16S rRNA gene of Flavobacterium gondwanense sp. nov. and Flavobacterium salegens sp nov., two new species from a hypersaline antarctic lake". Int J Syst Bacteriol 43 (1): 77–83. PMID 7678983. doi:10.1099/00207713-43-1-77.
  3. Mudarris; Austin, B.; Segers, P.; Vancanneyt, M.; Hoste, B.; Bernardet, J. F.; et al. (Jan 1993). "Flavobacterium scophthalmum sp. nov., a pathogen of turbot (Scophthalmus maximus L.)". Int J Syst Bacteriol 44 (1): 77–83. PMID 8068540. doi:10.1099/00207713-44-3-447.
  4. Bernardet; et al. (Jul 1994). "Cutting a Gordian Knot: Emended Classification and Description of the Genus Flavobacterium, Emended Description of the Family Flavobacteriaceae, and Proposal of Flavobacterium hydatis nom. nov. (Basonym, Cytophaga aquatalis Strohl and Tait 1978)". Int J Syst Bacteriol 46 (3): 447–53. doi:10.1099/00207713-46-1-128.
  5. LPSN Flavobacterium
licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autores e editores de Wikipedia

Flavobacterium: Brief Summary ( Galissian )

fornì da wikipedia gl Galician

Flavobacterium é un xénero de bacterias gramnegativas, con forma de bacilo con especies móbiles e non móbiles, que consta de 130 especies recoñecidas (http://www.bacterio.net/flavobacterium.html), e de 3 especies novas propostas (F. gondwanense, F. salegens, e F. scophthalmum). As flavobacterias atópanse no solo e auga doce en diversos ambientes. Varias especies causan doenzas en peixes de auga doce.

Flavobacterium psychrophilum causa doenzas na troita arco da vella e outros salmónidos. Flavobacterium columnare causa unha enfermidade en peixes de auga doce, como os siluriformes. Flavobacterium branchiophilum causa nas troitas unha enfermidade nas branquias.

A especie tipo do xénero é Flavobacterium aquatile (Frankland and Frankland 1889) Bergey et al. 1923. O nome do xénero significa "bacteria amarela".

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autores e editores de Wikipedia

Bakterie nylonożerne ( polonèis )

fornì da wikipedia POL

Bakterie nylonożerne – popularna nazwa szczepu KI72 Gram-ujemnych bakterii z rodzaju Flavobacterium, zdolnego do trawienia produktów ubocznych wytwarzania nylonu-6 za pomocą enzymów określanych jako nylonazy.

Odkrycie

W 1975 r. grupa japońskich naukowców odkryła szczep Flavobacterium żyjący w odpadkach zakładu produkującego nylon, zdolny do metabolizowania konkretnych produktów ubocznych wytwarzania nylonu-6, np. dimeru liniowego kwasu 6-aminoheksanowego. Substancje te nie są produkowane w wyniku procesów naturalnych, i są degradowane jedynie przez kilka organizmów[1]. Dalsze badania wykazały, że bakterie te używają trzech enzymów, które nie działają na żadne związki inne niż produkty uboczne wytwarzania nylonu: hydrolaza cyklicznego dimeru kwasu 6-aminoheksanowego, hydrolaza dimeru kwasu 6-aminoheksanowego i hydrolaza oligomeru kwasu 6-aminoheksanowego[2].

Późniejsze badania

Odkrycie doprowadziło do postawienia przez genetyka Susumu Ohno hipotezy, że gen kodujący jeden z odkrytych enzymów (hydrolazę kwasu 6-aminoheksanowego), znajdujący się na plazmidzie pOAD2, powstał z nałożenia się duplikacji genu z mutacją przesuwającą ramkę odczytu[3]. Ohno zasugerował, że wiele unikalnych genów wyewoluowało w ten sposób.

Seiji Negoro i współpracownicy z Uniwersytetu w Hyogo w Japonii zasugerowali w 2007 r., że w procesie powstawania tego enzymu nie doszło przesunięcia ramki odczytu[4]. Znanych jest wiele genów, które wyewoluowały przez nałożenie duplikacji genu i przesunięcia ramki odczytu przynajmniej w obrębie części genu. Badanie z 2006 r. wykazało 470 takich przykładów u człowieka[5].

Naukowcom udało się otrzymać w laboratorium szczep NK87 pałeczki ropy błękitnej (Pseudomonas aeruginosa[2]) zdolny do trawienia tych samych produktów ubocznych wytwarzania nylonu przez umieszczenie bakterii w izolowanym środowisku zawierającym te związki chemiczne jako jedyne źródło węgla i azotu. Szczep NK87 nie wytwarzał jednak takich samych enzymów jak oryginalny szczep KI72 z rodzaju Flavobacterium[6].

Inni naukowcy sklonowali gen kodujący wspomniane enzymy w plazmidzie do szczepu E. coli, co zaindukowało u docelowej bakterii zdolność trawienia produktów ubocznych wytwarzania nylonu[7].

Rola w nauczaniu o ewolucji

Naukowcy są zgodni, że zdolność syntezowania nylonaz najprawdopodobniej rozwinęła się w wyniku pojedynczej mutacji, która utrwaliła się, gdyż poprawiła zdolność przetrwania bakterii. Uważa się to za dobry przykład ewolucji przez mutację i naturalną selekcję, który zaobserwowano w trakcie jej przebiegu[8][9][10][11].

Przypisy

  1. Kinoshita, S., Kageyama, S., Iba, K., Yamada, Y. and Okada, H.. Utilization of a cyclic dimer and linear oligomers of e-aminocaproic acid by Achromobacter guttatus. „Agricultural & Biological Chemistry”. 39 (6), s. 1219−1223, 1975. DOI: 10.1271/bbb1961.39.1219. ISSN 0002-1369 (ang.).
  2. a b Negoro S.. Biodegradation of nylon oligomers.. „Applied microbiology and biotechnology”. 54 (4), s. 461-466, 2000. DOI: 10.1007/s002530000434. PMID: 11092619.
  3. Ohno S. Birth of a unique enzyme from an alternative reading frame of the preexisted, internally repetitious coding sequence. „Proc Natl Acad Sci USA.”. 81 (8), s. 2421–2425, 1984. DOI: 10.1073/pnas.81.8.2421. PMID: 6585807 (ang.).
  4. Negoro S, Ohki T, Shibata N, et al.. Nylon-oligomer degrading enzyme/substrate complex: catalytic mechanism of 6-aminohexanoate-dimer hydrolase. „J. Mol. Biol.”. 370 (1), s. 142–156, 2007. DOI: 10.1016/j.jmb.2007.04.043. PMID: 17512009 (ang.).
  5. Okamura K, Feuk L, Marquès-Bonet T, Navarro A, Scherer SW. Frequent appearance of novel protein-coding sequences by frameshift translation. „Genomics”. 88 (6), s. 690–7, grudzień 2006. DOI: 10.1016/j.ygeno.2006.06.009. PMID: 16890400 (ang.).
  6. Prijambada ID, Negoro S, Yomo T, Urabe I. Emergence of nylon oligomer degradation enzymes in Pseudomonas aeruginosa PAO through experimental evolution. „Appl. Environ. Microbiol.”. 61 (5), s. 2020–2022, 1995. PMID: 7646041 (ang.).
  7. Negoro S, Taniguchi T, Kanaoka M, Kimura H, Okada H. Plasmid-determined enzymatic degradation of nylon oligomers. „J. Bacteriol.”. 155 (1), s. 22–31, 1983. PMID: 6305910 (ang.).
  8. Thwaites WM. New Proteins Without God's Help. „Creation Evolution Journal”. 5 (2), s. 1–3, 1985. National Center for Science Education (NCSE) (ang.).
  9. Evolution and Information: the Nylon Bug!. New Mexicans for Science and Reason. [dostęp 2013-11-05].
  10. Ker Than: Why scientists dismiss 'intelligent design'. NBC News, 2005-09-23. [dostęp 2013-11-05].
  11. Miller, Kenneth R.: Only a Theory: Evolution and the Battle for America's Soul. Viking Adult, 2008, s. 80-82. ISBN 978-0-670-01883-3. (ang.)

Bibliografia

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autorzy i redaktorzy Wikipedii
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia POL

Bakterie nylonożerne: Brief Summary ( polonèis )

fornì da wikipedia POL

Bakterie nylonożerne – popularna nazwa szczepu KI72 Gram-ujemnych bakterii z rodzaju Flavobacterium, zdolnego do trawienia produktów ubocznych wytwarzania nylonu-6 za pomocą enzymów określanych jako nylonazy.

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autorzy i redaktorzy Wikipedii
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia POL

Flavobacterium ( portughèis )

fornì da wikipedia PT

Flavobacterium é um género de bactérias Gram-negativas, não-móveis e móveis, em forma de bacilo, que consiste de dez espécies reconhecidas e três espécies novas propostas (F. gondwanense,[1] F. salegens[1] e F. scophthalmum[2]). As flavobactérias são encontrados no solo e na água fresca, numa grande variedade de ambientes. Muitas espécies são conhecidas por causar doenças em peixes de água doce.[3]

Flavobacterium psychrophilum provoca doenças na truta-arco-íris e outros salmonídeos. Flavobacterium columnare provoca uma doença em peixes de água doce, como os siluriformes. Flavobacterium branchiophilum provoca uma doença nas brânquias em trutas.

A espécie tipo do género é Flavobacterium aquatile (Frankland e Frankland 1889) Bergey et al. 1923. O nome do género significa "bactéria amarela".[4]

Referências

  1. a b Dobson; Colwell, RR; McMeekin, TA; Franzmann, PD; et al. (janeiro de 1993). «Direct sequencing of the polymerase chain reaction-amplified 16S rRNA gene of Flavobacterium gondwanense sp. nov. and Flavobacterium salegens sp nov., two new species from a hypersaline antarctic lake». Int J Syst Bacteriol. 43 (1): 77–83. PMID 7678983. doi:10.1099/00207713-43-1-77
  2. Mudarris; Austin, B.; Segers, P.; Vancanneyt, M.; Hoste, B.; Bernardet, J. F.; et al. (janeiro de 1993). «Flavobacterium scophthalmum sp. nov., a pathogen of turbot (Scophthalmus maximus L.)». Int J Syst Bacteriol. 44 (1): 77–83. PMID 8068540. doi:10.1099/00207713-44-3-447
  3. Bernardet; et al. (julho de 1994). «Cutting a Gordian Knot: Emended Classification and Description of the Genus Flavobacterium, Emended Description of the Family Flavobacteriaceae, and Proposal of Flavobacterium hydatis nom. nov. (Basonym, Cytophaga aquatalis Strohl and Tait 1978)». Int J Syst Bacteriol. 46 (3): 447–53. doi:10.1099/00207713-46-1-128
  4. LPSN Flavobacterium
 title=
licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autores e editores de Wikipedia
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia PT

Flavobacterium: Brief Summary ( portughèis )

fornì da wikipedia PT

Flavobacterium é um género de bactérias Gram-negativas, não-móveis e móveis, em forma de bacilo, que consiste de dez espécies reconhecidas e três espécies novas propostas (F. gondwanense, F. salegens e F. scophthalmum). As flavobactérias são encontrados no solo e na água fresca, numa grande variedade de ambientes. Muitas espécies são conhecidas por causar doenças em peixes de água doce.

Flavobacterium psychrophilum provoca doenças na truta-arco-íris e outros salmonídeos. Flavobacterium columnare provoca uma doença em peixes de água doce, como os siluriformes. Flavobacterium branchiophilum provoca uma doença nas brânquias em trutas.

A espécie tipo do género é Flavobacterium aquatile (Frankland e Frankland 1889) Bergey et al. 1923. O nome do género significa "bactéria amarela".

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Autores e editores de Wikipedia
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia PT

Flavo bakterisi ( turch )

fornì da wikipedia TR

Flavo bakterisi (Flavobacterium), Danimarkalı bakteriyolog Hans Christian Gram'ın ismiyle tanımlanan Gram negatif bakterisinin bir cinsi olup hareketli ve hareketsiz olabildikleri gibi çubuksu bir forma sahiptirler. Bu bakterilerin bilinen 10 farklı türü olup[1] kısa bir süre önce önerilen F. gondwanense,[2] F. salegens[2] ve F. scophthalmum[3] bakterileri de bu guruba dahil edilmişlerdir. Flavo bakterileri tatlı su veya toprak gibi farklı ortamlarda yaşarlar. Bazı flavor bakteri türlerinin tatlı su balıklarında hastalıklara neden olduğu bilinmektedir.[4]

Flavobacterium psychrophilum alabalıkgillerde bakteriyel soğuk su sendromuna ve gökkuşağı alabalıklarında da yavru gökkuşağı alabalık sendromuna yol açar. Flavobacterium columnare tatlı su balıklarında hidrofil pamuk sendromuna yol açarken Flavobacterium branchiophilum da alabalıklarda bakteriyel Gill hastalığına yol açar.

Türleri

Ayrıca bakınız

Kaynakça

  1. ^ Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd ed., vol. 1 (The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria) (D.R. Boone and R.W. Castenholz, eds.), Springer-Verlag, New York (2001). pp. 465-466.
  2. ^ a b Dobson; Colwell, RR; McMeekin, TA; Franzmann, PD; ve diğerleri. (1993 Jan). "Direct sequencing of the polymerase chain reaction-amplified 16S rRNA gene of Flavobacterium gondwanense sp. nov. and Flavobacterium salegens sp nov., two new species from a hypersaline antarctic lake". Int J Syst Bacteriol. 43 (1), s. 77–83. doi:10.1099/00207713-43-1-77. PMID 7678983. Tarih değerini gözden geçirin: |year= (yardım)KB1 bakım: Diğerlerinin yanlış kullanımı (link)
  3. ^ Mudarris; Colwell, RR; McMeekin, TA; Franzmann, PD; ve diğerleri. (1993 Jan). "Flavobacterium scophthalmum sp. nov., a pathogen of turbot (Scophthalmus maximus L.)". Int J Syst Bacteriol. 44 (1), s. 77–83. doi:10.1099/00207713-43-1-77. PMID 7678983. Tarih değerini gözden geçirin: |year= (yardım)KB1 bakım: Diğerlerinin yanlış kullanımı (link)
  4. ^ Bernardet; Austin, B; Segers, P; Vancanneyt, M; Hoste, B; Bernardet, JF; ve diğerleri. (1994 Jul). "Cutting a Gordian Knot: Emended Classification and Description of the Genus Flavobacterium, Emended Description of the Family Flavobacteriaceae, and Proposal of Flavobacterium hydatis nom. nov. (Basonym, Cytophaga aquatalis Strohl and Tait 1978)". Int J Syst Bacteriol. 46 (3), s. 447–53. PMID 8068540. Tarih değerini gözden geçirin: |year= (yardım)KB1 bakım: Diğerlerinin yanlış kullanımı (link)
Stub icon Bakteri ile ilgili bu madde bir taslaktır. Madde içeriğini geliştirerek Vikipedi'ye katkıda bulunabilirsiniz.
licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Wikipedia yazarları ve editörleri
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia TR

Flavo bakterisi: Brief Summary ( turch )

fornì da wikipedia TR

Flavo bakterisi (Flavobacterium), Danimarkalı bakteriyolog Hans Christian Gram'ın ismiyle tanımlanan Gram negatif bakterisinin bir cinsi olup hareketli ve hareketsiz olabildikleri gibi çubuksu bir forma sahiptirler. Bu bakterilerin bilinen 10 farklı türü olup kısa bir süre önce önerilen F. gondwanense, F. salegens ve F. scophthalmum bakterileri de bu guruba dahil edilmişlerdir. Flavo bakterileri tatlı su veya toprak gibi farklı ortamlarda yaşarlar. Bazı flavor bakteri türlerinin tatlı su balıklarında hastalıklara neden olduğu bilinmektedir.

Flavobacterium psychrophilum alabalıkgillerde bakteriyel soğuk su sendromuna ve gökkuşağı alabalıklarında da yavru gökkuşağı alabalık sendromuna yol açar. Flavobacterium columnare tatlı su balıklarında hidrofil pamuk sendromuna yol açarken Flavobacterium branchiophilum da alabalıklarda bakteriyel Gill hastalığına yol açar.

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Wikipedia yazarları ve editörleri
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia TR

Naylonla beslenen bakteri ( turch )

fornì da wikipedia TR

Naylonla beslenen bakteriler Flavobacterium cinsinin naylon 6'nın belirli yan ürünlerini sindirebilen bir türüdür. Flavobakterilerin bu türü, Sp. K172, naylon yiyen bakteri olarak bilinir ve insan yapımı molekülleri sindirebilen enzimlere de genel olarak naylonaz adı verilir.

Keşif

1975'te bir grup Japon bilim insanı, bir naylon fabrikasının atık sularında yaşayan ve naylon 6'nın bazı yan ürünlerini parçalayabilen bir flavobakteri türü keşfettiler. Bu yan ürünlerin arasında 6-aminohekzanoatın lineer dimeri de bulunmaktadır ki bu ürünün naylonun keşif yılı olan 1935'ten önce varolduğuna dair hiçbir bulgu yoktur. Daha detaylı araştırmalar bu enzime başka hiçbir flavobakteri türünde (hatta hiçbir bakteri türünde) rastlanmadığını, bu enzimin de başka hiçbir madde üzerinde etkili olmadığını göstermiştir.

İleri çalışmalar

Bu bulgular genetikçi Susumu Ohno'yu enzimlerden birinin, 6-aminohekzanoik asit hidrolazın, geninin bir çerçeve kayması mutasyonu ve bir duplikasyonun kombinasyonu sonucu oluştuğunu düşünmeye itti. Ohno birçok yeni genin bu şekilde olduğunu belirtti.

Japonya'daki Hyogo Üniversitesi'nden Seiji Negoro'nun önderliğindeki bir takımın çalışmaları sonucunda 6-aminohekzanoik asit hidrolazın evriminde çerçeve kayması mutasyonunun etkili olmadığını gösterdi. Ama başka birçok duplikasyon ve çerçeve kayması mutasyonuyla oluşmuş gen bulundu. 2006 yılındaki bir çalışmada yalnızca insanda bunun 407 örneği olduğu gösterildi.

Bilim insanları laboratuvarda başka besin maddelerinden mahrum bırakarak Pseudomonas aeruginosa türü bakterileri de aynı naylon yan ürünlerini parçalayacak şekilde evrilmeye zorladılar. P. aeruginosa türü bakterinin Flavobacterium türü bakteriyle aynı enzimi kullanmadığı da tespit edildi. Bilim insanları bu enzim genini plazmid yardımıyla başka bir bakteri türü olan E. coli'ye aktarmayı başardılar.

Evrimsel öğretide yeri

Bilimsel ortak kanıya göre naylonaz enzimi tek adımlık bir mutasyon sonucu oluştu ve bakterinin ortama uyumunu sağladığı için de varlığını sürdürebildi. Bu durum doğal seçilim ve mutasyon yoluyla evrimin bir kanıtı olarak gösterilmektedir.

Stub icon Bakteri ile ilgili bu madde bir taslaktır. Madde içeriğini geliştirerek Vikipedi'ye katkıda bulunabilirsiniz.
licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Wikipedia yazarları ve editörleri
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia TR

Naylonla beslenen bakteri: Brief Summary ( turch )

fornì da wikipedia TR

Naylonla beslenen bakteriler Flavobacterium cinsinin naylon 6'nın belirli yan ürünlerini sindirebilen bir türüdür. Flavobakterilerin bu türü, Sp. K172, naylon yiyen bakteri olarak bilinir ve insan yapımı molekülleri sindirebilen enzimlere de genel olarak naylonaz adı verilir.

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Wikipedia yazarları ve editörleri
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia TR

Flavobacterium ( ucrain )

fornì da wikipedia UK

Опис і значення

Flavobacteria — група бактерій-коменсалів і факультативних патогенів. Flavobacterium psychrophilum викликає хворобу печінки веселкової форелі і бактерійну хворобу холодної води. Flavobacteriaграм-негативні паличковидні аероби, 2-5 мкм завдовжки, 0,3-0,5 мкм у діаметрі, з огнутими або загостреними кінцями, формують жовті (від кремових до помаранчевих) колонії на агарі, споживають кілька полісахарідів, але не целюлозу, G+C вміст 32-37%, широко розповсюджуються в ґрунті та прісноводих середовищах.

Структура генома

Зараз геноми Flavobacterium не відомі, але два проекти знаходяться в роботі. Один Flavobacterium sp. MED217, другий — Flavobacterium psychrophilum. Проте, проводилися мутаційні дослідження щоб краще зрозуміти генетичну систему бактеріального ковзання Flavobacterium johnsoniae. Було знайдено шість генів необхідних для роботи цього механізму, gldA, gldB, gldD, gldF, gldG і ftsX. Мутанти gldH мали дефекти у пересуванні та формували колонії, що нерозгортаються.

Структура клітини і метаболізм

Flavobacterium johnsoniae дуже швидко рухаються за допомогою бактеріального ковзання, використовуючи невідомий механізм. Індивідуальні клітини можуть рухатися зі швидкостю до 10 мкм на сек (McBride 2003).

Екологія

Flavobacteria — звичайно коменсали, які живуть в ґрунті і прісній воді, деякі види — факультативні патогени. Вони можуть бути знайдені у воді і ґрунті в багатьох областях по всьому світу.

Патологія

Файл:Flavo fish.jpg
Веселкова форель заражена Flavobacterium psychrophilum. [1]

Flavobacterium psychrophilum викликає небезпечну хворобу у риб, особливо у веселковій форелі (Oncorhynchus mykiss), яку вирощують на рибних фермах всюди у світі. Хвороба може передаватися через воду і безпосередньо при контакті з хворими рибами. За минулі десять років в багатьох частинах в Європі, хвороби веселкової форелі викликані F. psychrophilum стали найсерйознішими бактерійними рибними хворобами. Хоча ці хвороба можуть бути вилікувані антимікробними ліками або хімічними лікувальними ваннами, загалом такі ліки не використовуються по причині шкідливого впливу на довкілля. Зараз, дослідники намагаються створити вакцину проти F. psychromphilum, яка не буде мати такого шкідливого впливу на довкілля. Нещодавно з'явився новий шлях виявити хворобу через процес ланцюгової полімеразної реакції (PCR) на області 16S-23S рРНК F. psychrophilum.

Посилання

licensa
cc-by-sa-3.0
drit d'autor
Автори та редактори Вікіпедії
original
visité la sorgiss
sit compagn
wikipedia UK