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Chitinophagaceae ( Alman )

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Die Chitinophagaceae sind eine Familie von Bakterien. Die Typusgattung ist Chitinophaga Sangkhobol und Skerman 1981. Sie zählen zu der Abteilung Bacteroidetes. Das Genom von Chitinophaga pinensis wurde 2010 komplett analysiert.[1]

Erscheinungsbild

Die Zellen sind Stäbchen mit abgerundeten Ecken. Teilweise werden Ruhestadien, sogenannte Mikrocysten gebildet. Einige Arten sind durch Gleiten beweglich. Der Gram-Test ist negativ. Die Kolonien sind gelb gefärbt.

Wachstum und Stoffwechsel

Die Arten sind aerob oder fakultativ anaerob. Der Stoffwechsel ist meist oxidativ (Atmung), bei einigen Arten kann er auch fermentativ sein. Sie enthalten das Menachinon Typ 7. Einige Arten können Chitin hydrolysieren, wie z. B. Chitinophaga pinensis, auch die Hydrolyse von Cellulose ist bei einigen Arten bekannt, z. B. Chitinophaga oryziterrae[2]

Vorkommen

Das Vorkommen der Arten ist vielseitig. So wurde z. B. die Art Chitinophaga skermanii vom Kot des Tausendfüßlers Arthrosphaera magna isoliert, Chitinophaga japonensis und Terrimonas von Böden. Chitinophaga arvensicola wurde vom Moos Sphagnum isoliert. Balneola wurde im Meerwasser gefunden[3].

Systematik

Die Familie der Chitinophagaceae wurde aufgrund von 16S-rRNA-Sequenzen 2011 beschrieben.[4] Es folgt eine Auswahl von Gattungen:[5]

Einzelnachweise

  1. Glavina Del Rio Tijana et al.: Complete genome sequence of Chitinophaga pinensis type strain (UQM 2034). In: Standards in Genomic Sciences. Band 2(1), 2010, S. 87–95.
  2. EJ. Chung, TS Park, CO Jeon, YR Chung: Chitinophaga oryziterrae sp. nov., isolated from the rhizosphere soil of rice (Oryza sativa L.).. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62, Nr. 12, Februar 2012, S. 3030 – 3035. doi:10.1099/ijs.0.036442-0.@1@2Vorlage:Toter Link/ijs.sgmjournals.org (Seite nicht mehr abrufbar, Suche in Webarchiven)  src= Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
  3. Laurent Urios, Hélène Agogué, Françoise Lesongeur, Erko Stackebrandt und Philippe Lebaron: Balneola vulgaris gen. nov., sp. nov., a member of the phylum Bacteroidetes from the north-western Mediterranean Sea. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 56, Nr. 8, August 2006, S. 1883 – 1887. doi:10.1099/ijs.0.64285-0.@1@2Vorlage:Toter Link/ijs.sgmjournals.org (Seite nicht mehr abrufbar, Suche in Webarchiven)  src= Info: Der Link wurde automatisch als defekt markiert. Bitte prüfe den Link gemäß Anleitung und entferne dann diesen Hinweis.
  4. P. Kämpfer, N. Lodders and E. Falsen: Hydrotalea flava gen. nov., sp. nov., a new member of the phylum Bacteroidetes and allocation of the genera Chitinophaga, Sediminibacterium, Lacibacter, Flavihumibacter, Flavisolibacter, Niabella, Niastella, Segetibacter, Parasegetibacter, Terrimonas, Ferruginibacter, Filimonas and Hydrotalea to the family Chitinophagaceae fam. nov.. In: International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 61, Nr. 3, April 2010, S. 518 – 523. doi:10.1099/ijs.0.023002-0.
  5. Systematik nach Euzéby: List of Prokaryotica: Chitinophagaceae (Stand: 28. November 2018)
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Chitinophagaceae: Brief Summary ( Alman )

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Die Chitinophagaceae sind eine Familie von Bakterien. Die Typusgattung ist Chitinophaga Sangkhobol und Skerman 1981. Sie zählen zu der Abteilung Bacteroidetes. Das Genom von Chitinophaga pinensis wurde 2010 komplett analysiert.

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Chitinophagaceae ( Anglèis )

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Chitinophagaceae is an aerobic or facultatively anaerobic and rod-shaped family of bacteria in the phylum Bacteroidota.[3][4][6][7][8]

Genera

Phylogeny

The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature[3] and the phylogeny is based on whole-genome sequences.[9][a]

Chitinophagia

Thermoflavifilum

Chitinophaga

Taibaiella

Arachidicoccus

Segetibacter

Parafilimonas

Hydrotalea

Filimonas

Sediminibacterium

Hydrobacter

Flavihumibacter

Niastella

Cnuella

Flavisolibacter

Terrimonas

Niabella

outgroup

Sphingobacteriia

Notes

  1. ^ Agriterribacter, Arvibacter, Aurantisolimonas, Compostibacter, Deminuibacter, Dinghuibacter, Edaphobaculum, Ferruginibacter, Flaviaesturariibacter, Flavipsychrobacter, Flavitalea, Gynurincola, Haoranjiania, Heliimonas, Lacibacter, Mucibacter, Nemorincola, Niveitalea, Panacibacter, Paracnuella, Paraflavitalea, Parapseudoflavitalea, Parasediminibacterium, Parasegetibacter, Phnomibacter, Pseudobacter, Pseudoflavitalea, Puia, and Rurimicrobium are not included in this phylogenetic tree.

References

  1. ^ Kämpfer P, Lodders N, Falsen E (2011). "Hydrotalea flava gen. nov., sp. nov., a new member of the phylum Bacteroidetes and allocation of the genera Chitinophaga, Sediminibacterium, Lacibacter, Flavihumibacter, Flavisolibacter, Niabella, Niastella, Segetibacter, Parasegetibacter, Terrimonas, Ferruginibacter, Filimonas and Hydrotalea to the family Chitinophagaceae fam. nov". Int J Syst Evol Microbiol. 61 (Pt 3): 518–523. doi:10.1099/ijs.0.023002-0. PMID 20382796.
  2. ^ Munoz R, Rossello-Mora R, Amann R (2016). "Corrigendum to "Revised phylogeny of Bacteroidetes and proposal of sixteen new taxa and two new combinations including Rhodothermaeota phyl. nov." [Syst. Appl. Microbiol. 39 (5) (2016) 281–296]". Syst Appl Microbiol. 39 (7): 491–492. doi:10.1016/j.syapm.2016.08.006. PMID 27639921.
  3. ^ a b c Euzéby JP, Parte AC. "Chitinophagales". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved June 25, 2021.
  4. ^ a b Parker, Charles Thomas; Taylor, Dorothea; Garrity, George M (8 October 2009). Parker, Charles Thomas; Garrity, George M (eds.). "Taxonomic Abstract for the families". NamesforLife, LLC. doi:10.1601/tx.14400. {{cite journal}}: Cite journal requires |journal= (help)
  5. ^ Munoz R, Rossello-Mora R, Amann R (2016). "Revised phylogeny of Bacteroidetes and proposal of sixteen new taxa and two new combinations including Rhodothermaeota phyl. nov". Syst Appl Microbiol. 39 (5): 281–296. doi:10.1016/j.syapm.2016.04.004. PMID 27287844.
  6. ^ "Chitinophagaceae". www.uniprot.org.
  7. ^ Krieg, Noel R.; Ludwig, Wolfgang; Whitman, William B.; Hedlund, Brian P.; Paster, Bruce J.; Staley, James T.; Ward, Naomi; Brown, Daniel (2011). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology: Volume 4: The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes. Springer Science & Business Media. ISBN 9780387685724.
  8. ^ Ralebitso-Senior, T. Komang (2018). Forensic Ecogenomics: The Application of Microbial Ecology Analyses in Forensic Contexts. Academic Press. ISBN 9780128096093.
  9. ^ García-López M, Meier-Kolthoff JP, Tindall BJ, Gronow S, Woyke T, Kyrpides NC, Hahnke RL, Göker M (2019). "Analysis of 1,000 Type-Strain Genomes Improves Taxonomic Classification of Bacteroidetes". Front Microbiol. 10: 2083. doi:10.3389/fmicb.2019.02083. PMC 6767994. PMID 31608019.
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Chitinophagaceae: Brief Summary ( Anglèis )

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Chitinophagaceae is an aerobic or facultatively anaerobic and rod-shaped family of bacteria in the phylum Bacteroidota.

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키티노파가과 ( Corean )

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키티노파가과(Chitinophagaceae)는 의간균문에 속하는 세균 과의 하나이다.[1] 키티노파가강(Chitinophagia)과 키티노파가목(Chitinophagales)의 유일한 과이다. 이전에 키티노파가목의 하위 과에 포함되었던 사프로스피라과는 현재 사프로스피라목으로 분류한다.

하위 속

각주

  1. Family Chitinophagaceae, 원핵생물명 목록(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, LPSN)
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