Amalgaviridae is a family of double-stranded RNA viruses. Member viruses infect plants and are transmitted vertically via seeds.[1] The name derives from amalgam (blend, mix) which refers to amalgaviruses possessing characteristics of both partitiviruses and totiviruses.[1][2] There are ten species in the family.[3]
Amalgavirus genomes are monopartite and about 3.5 kilobases in length.[2][4] They have two partially overlapping open reading frames which encode the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) and a putative capsid protein.[2][5]
It has been suggested that amalgaviruses have evolved via recombination between viruses with double-stranded and negative-strand RNA genomes.[6] Phylogenetic analysis indicates that the amalgavirus RdRp forms a sister clade to the corresponding RdRp protein of partitiviruses (Partitiviridae) which have segmented (bipartite) dsRNA genomes and infect plants, fungi and protists.[1][2][4][6] By contrast, the putative capsid protein of amalgaviruses is homologous to the nucleocapsid proteins of negative-strand RNA viruses of the genera Phlebovirus (Bunyaviridae) and Tenuivirus.[6]
The family Amalgaviridae has two genera and ten species:[3]
Amalgaviridae is a family of double-stranded RNA viruses. Member viruses infect plants and are transmitted vertically via seeds. The name derives from amalgam (blend, mix) which refers to amalgaviruses possessing characteristics of both partitiviruses and totiviruses. There are ten species in the family.
Amalgaviridae es una familia de virus de ARN bicatenario que infectan plantas y hongos. En las plantas se transmiten verticalmente a través de las semillas. La familia contiene dos géneros y diez especies.[1]
Los genomas de los amalgavirus son monopartitos y tienen una longitud de aproximadamente 3,5 kilobases. Tienen dos marcos de lectura abiertos parcialmente superpuestos que codifican la ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRP) y una supuesta proteína de la cápside. Están compuestos por una nucleocápside similar a la de los Phlebovirus y Tenuivirus, sin envoltura vírica. La replicación viral se produce en el núcleo.[2][3]
Se ha sugerido que los amalgavirus se originaron mediante un evento de recombinación genética entre virus de ARN bicatenario y virus de ARN monocatenario negativo. Los análisis filogenéticos indican que la RdRP de los amalgavirus forma un grupo hermano de las RdRP de los partitivirus (Partitiviridae) e hipovirus (Hypoviridae) que tienen genomas de ARN bicatenario segmentados (bipartitos) y que infectan plantas, hongos y protistas. Por el contrario, las supuestas proteínas de la cápside de los amalgavirus es homóloga a las proteínas de las nucleocápsides de los virus de ARN monocatenario negativo de los géneros Phlebovirus y Tenuivirus (Phenuiviridae).[4]
Contiene los siguientes géneros y especies:[1]
El género Amalgavirus infecta plantas, mientras que Zybavirus infecta hongos.
Amalgaviridae es una familia de virus de ARN bicatenario que infectan plantas y hongos. En las plantas se transmiten verticalmente a través de las semillas. La familia contiene dos géneros y diez especies.
Les Amalgaviridae sont une famille de virus de l'ordre des Durnavirales qui comprend deux genres et dix espèces. Ce sont des virus à ARN à double brin, rattachés au groupe III de la classification Baltimore, qui infectent principalement les plantes (phytovirus), une espèce infectant des champignons (mycovirus).
Le nom de famille « Amalgaviridae » dérive du terme « amalgame », en référence au mélange d'homologies avec les Totiviridae et les Partitiviridae qui caractérise la famille des Amalgaviridae[3], suivi du suffixe -viridae qui caractérise les noms de familles de virus.
Les virus de la famille des Amalgaviridae ont un génome monopartite d'environ 3,5 kilobases[4],[5]. Il présente deux cadres de lecture ouverts qui se chevauchent partiellement et codent l' ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) et une protéine de capside supposée[4],[6].
Selon ICTV[7] :
Les Amalgaviridae sont une famille de virus de l'ordre des Durnavirales qui comprend deux genres et dix espèces. Ce sont des virus à ARN à double brin, rattachés au groupe III de la classification Baltimore, qui infectent principalement les plantes (phytovirus), une espèce infectant des champignons (mycovirus).