불독박쥐는 불독박쥐속(Noctilio)에 속하는 박쥐의 총칭이다. 2종의 현존 종을 포함하고 있는 불독박쥐속은 불독박쥐과의 유일속이다. 큰불독박쥐와 작은불독박쥐의 2종으로 이루어져 있다.[1] 멕시코에서 아르헨티나, 그리고 카리브 해에 이르는 지역의 물가에서 주로 발견된다. 벌거숭이불독박쥐(Cheiromeles torquatus)는 이 과에 속하지 않고, 큰귀박쥐과(자유꼬리박쥐과)로 분류한다.
다음은 2002년 박쥐목의 계통 분류이다.[2]
박쥐목 큰귀박쥐과 넓은 의미의 애기박쥐과좁은 의미의 애기박쥐과