Cytophaga hutchinsonii ist eine Art von Bakterien. Sie ist in der Lage, Cellulose als Nährstoff zu nutzen und ist somit wichtig für den Abbau von Pflanzenresten.
Die Zellen von Cytophaga hutchinsonii sind stäbchenförmig, 0,3–0,5 μm breit und 2–10 μm lang. Sporen werden nicht gebildet. Flagellen sind nicht vorhanden, allerdings zeigt C. hutchinsonii, wie viele andere Familienmitglieder der Cytophagaceae, eine schnelle Gleitbeweglichkeit ("gliding motility") über Oberflächen. Die Art bewegt sich hierbei wahrscheinlich nach dem gleichen Mechanismus wie Flavobacterium johnsoniae.[1] Hierdurch ist das Bakterium in der Lage, entlang unlöslichen Zellulosepartikeln zu wandern und sie enzymatisch angreifen. Dies kann den Zellen auch helfen, tief in die Zellulosematrix einzudringen.
Cytophaga hutchinsonii ist auf Sauerstoff angewiesen (aerob). Der Stoffwechselweg ist die Atmung mit Sauerstoff als endgültigem Elektronenakzeptor. Das Bakterium benötigt organische Substanzen zum Wachstum, es ist also chemo-organotroph.
Zur Züchtung von Reinkulturen kann man bei C. hutchinsonii Agar mit eingebetteten Cellulosefasern nutzen.[2] Das Bakterium hat eine stark begrenzte Auswahl an Substraten, die es für Wachstum nutzen kann. Neben Cellulose können die meisten Stämme noch Glukose und Cellobiose verwenden. Cellobiose ist ein Disaccharid und bildet sich auch natürlicherweise beim Zerfall von Cellulose. Teilweise müssen sich die Kulturen allerdings erst eine Zeitlang anpassen, um schließlich gutes Wachstum mit diesen löslichen Kohlenhydraten zu zeigen. Diese Anpassung beruht wahrscheinlich auf Mutationen.[1]
Agar, Chitin, Pektine oder Stärke werden nicht genutzt. Die optimale Wachstumstemperatur liegt bei 30 °C. Die Kolonien sind aufgrund des Farbstoffes Flexirubin leuchtend gelb gefärbt.[1] Der Oxidase-Test verläuft positiv, der Katalase-Test negativ oder nur schwach positiv. Der Gram-Test verläuft negativ.
Cytophaga hutchinsonii ist die Typusart der Gattung Cytophaga und wurde im Jahr 1929 von dem Mikrobiologen Sergei Nikolajewitsch Winogradski erstbeschrieben. Sie zählt zu der Familie der Cytophagaceae, die wiederum zu der Ordnung Cytophagales gestellt wird.
Da Cytophaga hutchinsonii in der Lage ist Cellulose von Pflanzenresten abzubauen ist es ein wichtiges Bodenbakterium. Andere für den Stoffabbau im Boden wichtige Bakterien sind z. B. Cytophaga aurantiaca und Arten von Sporocytophaga, Flexibacter und Flexithrix.[3]
Der Gattungsname Cytophaga ist abgeleitet von dem griechischen Wort cytos (Zelle) und dem griechischen Verb phagein (essen) und bezieht sich auf die Fähigkeit, die Zellwände von Pflanzen zu zersetzen. Der Artname C. hutchinsonii wurde zu Ehren des englischen Bakteriologen H. B. Hutchinson gewählt.
Cytophaga hutchinsonii ist eine Art von Bakterien. Sie ist in der Lage, Cellulose als Nährstoff zu nutzen und ist somit wichtig für den Abbau von Pflanzenresten.
Cytophaga hutchinsonii is a bacterial species in the genus Cytophaga. C. hutchinsonii is an aerobic, gram-negative, soil, microorganism that exhibits gliding motility, enabling it to move quickly over surfaces and is capable of cellulose degradation.[1]
Cytophaga hutchinsonii was first classified by Russian microbiologist Sergei Winogradsky in 1929.[2]
Winogradsky found several cellulose decomposers which were morphologically similar to Spirochaeta cytophaga, a bacterium discovered in 1919 by microbiologists Hutchinson and Clayton.[3] S. cytophaga is an aerobic cellulose degrading bacterial species found in soil environments. Winogradsky mistakenly classified Cytophaga hutchinsonii as identical to Spirochaeta cytophaga. The 5 species were classified in the novel genus Cytophaga.
In 1933, Polish microbiologist Helena Krzemieniewska identified differences in the life cycle between Spirochaeta cytophaga and Cytophaga hutchinsonii.[2] Spirochaeta cytophaga was renamed to Cytophaga myxococcoides.
Gliding motility, which is present throughout the Cytophaga-Flavobacteria group, is not well understood.[4] Motility does not involve flagella, and is characterized as a novel mechanism in the C-F group.[1] The C. hutchinsonii genome contains homologs to the Flavobacterium johnsoniae gliding genes (gld).[5] It is believed that gliding ability is tied to biopolymer degradation ability for many organisms in the Cytophaga-Flavobacteria group.[1]
Cytophaga hutchinsonii is capable of digesting crystalline cellulose to glucose in a contact dependent manner.[5] The cellulose degrading enzymes have been identified and have no known homologs.[5]
Cellulose is a linear highly ordered polysaccharide that forms long crystalline fibrils which are difficult to degrade, particularly within small bacterial cells due to their small size.[6] Most aerobic bacteria degrade cellulose with exoglucanases, endoglucanases, and β-glucosidases. Many contain cellulosomes, multienzyme structures that degrade cellulose on bacterial cell surfaces. C. hutchinsonii does not code for cellulosomes. Degradation most likely occurs in the bacterial periplasm.[6]
Cytophaga hutchinsonii encodes 9 speculated processive endo-β-1,4-glucanases belonging to GH5 and GH9, which are known glycoside hydrolase families.[5][6] Eight of the genes coding for endoglucanases are cel5A, cel5B, cel5C, cel9A, cel9B, cel9C, cel9E, and cel9F.[7] Cel5B and Cel9C are periplasmic endoglucanases, while Cel5A, Cel9A, Cel9B, Cel9D, and Cel9E are predicted to be secreted endoglucanases, which use a type IX secretion system to produce oligomers from amorphous cellulose (RAC).[7]
They also contain β-glucosidases (bgl), enzymes that hydrolyze the final step, turning cellobiose (a disaccharide) into glucose. β-glucosidases belong to GH3, another glycoside hydrolase family. C. hutchinsonii contains four β-glucosidases located in cellular periplasm, called BglA, BglB, BglC, and BglD.[6] BglB is the main β-glucosidase gene transcribed when cells are grown in glucose or cellobiose cultures. BglA is only transcribed when cells are grown in cellobiose culture (produced from cellulose degradation). BglA and BglB are essential β-glucosidases, and in mutant cells not expressing both proteins, cells are unable to degrade cellobiose. Unlike other β-glucosidases, BglA’s hydrolytic activity does not decrease with longer substrate chains like cyclodextrins (cellotriose and cellotetraose). This is likely due to larger active site with less substrate specificity, and BglA is able to cleave glucose units one by one in a non-processive manner, dissociating from substrate after each glucose is cleaved. BglA’s ability to cleave longer cellulose fragments likely plays a role in allowing C. hutchinsonii to degrade cellulose without cellobiohydrolases.
BglB on the other hand does not hydrolyze cellodextrins effectively. The processive endoglucanases, which can catalyze several enzymes before releasing the cellulose substrate, could play a role in allowing C. hutchinsonii to degrade without encoding separate cellobiohydrolases.[5] Additionally, adding degrading cellodextrins in the periplasm could increase efficiency by reducing loss of cellobiose to competing microorganisms.[7]
The cyclodextrin degrading B-glucosidases are of interest economically due to their lack of inhibition by glucose.[8]
Cytophaga hutchinsonii is a bacterial species in the genus Cytophaga. C. hutchinsonii is an aerobic, gram-negative, soil, microorganism that exhibits gliding motility, enabling it to move quickly over surfaces and is capable of cellulose degradation.
