Waikavirus is a genus of viruses in the order Picornavirales, in the family Secoviridae. Plants, poaceae, cyperaceae, and gramineae serve as natural hosts. There are four species in this genus. Diseases associated with this genus include: MCDV: plant stunting and chlorotic striping of tertiary leaf veins in maize.[1][2]
The genus contains the following species:[2]
Viruses in Waikavirus are non-enveloped, with icosahedral geometries, and T=pseudo3 symmetry. The diameter is around 30 nm. Genomes are linear, around 12kb in length.[1]
Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the positive stranded RNA virus replication model. Positive stranded RNA virus transcription is the method of transcription. The virus exits the host cell by tubule-guided viral movement. Plants, poaceae, cyperaceae, and gramineae serve as the natural host. The virus is transmitted via a vector (insects). Transmission routes are vector and mechanical.[1]
Waikavirus is a genus of viruses in the order Picornavirales, in the family Secoviridae. Plants, poaceae, cyperaceae, and gramineae serve as natural hosts. There are four species in this genus. Diseases associated with this genus include: MCDV: plant stunting and chlorotic striping of tertiary leaf veins in maize.
Waikavirus est un genre de virus de la famille des Secoviridae, qui comprend quatre espèces acceptées par l'ICTV. Ce sont des virus à ARN linéaire à simple brin à polarité positive, rattachés au groupe IV de la classification Baltimore, qui infectent les plantes (phytovirus).
Ces virus ont une gamme d'hôtes restreinte qui se limite aux plantes monocotylédones des familles des Poaceae et Cyperaceae[2].
Ils ne sont pas transmis par inoculation de la sève. La transmission au champ se fait par l'intermédiaire d'insectes vecteurs (pucerons ou cicadelles) selon un mode semi-persistant. Une protéine auxiliaire codée par le virus est probablement nécessaire.
Certaines espèces du genre Waikavirus sont des virus auxiliaires pour la transmission par les insectes d'autres virus : c'est le cas de l'Anthriscus yellows virus dans le cas du Parsnip yellow fleck virus (PYFV, genre Sequivirus) et du Rice tungro spherical virus dans le cas du Rice tungro bacilliform virus (famille des Caulimoviridae) (ce complexe viral étant responsable de la maladie du tungro du riz)[3].
Le nom générique, « Waikavirus », est dérivé du dérivé du terme japonais « waika » (rabougrissement) utilisé pour décrire la maladie induite par le virus sphérique du tungro du riz (Rice tungro spherical virus)[1].
Les virions, non enveloppés, sont des particules à capside quasi-sphérique à symétrie icosaédrique (T=pseudo3) de 30 nm de diamètre[4].
Le génome, monopartite, est constitué d'une molécule d'ARN simple brin de polarité positive, linéaire, d'environ 12 kb. L'extrémité 5' a une protéine liée au génome (VPg). L'extrémité 3' présente une queue poly (A)[4].
Selon NCBI (1 février 2021)[5] :
Waikavirus est un genre de virus de la famille des Secoviridae, qui comprend quatre espèces acceptées par l'ICTV. Ce sont des virus à ARN linéaire à simple brin à polarité positive, rattachés au groupe IV de la classification Baltimore, qui infectent les plantes (phytovirus).
Ces virus ont une gamme d'hôtes restreinte qui se limite aux plantes monocotylédones des familles des Poaceae et Cyperaceae.
Ils ne sont pas transmis par inoculation de la sève. La transmission au champ se fait par l'intermédiaire d'insectes vecteurs (pucerons ou cicadelles) selon un mode semi-persistant. Une protéine auxiliaire codée par le virus est probablement nécessaire.
Certaines espèces du genre Waikavirus sont des virus auxiliaires pour la transmission par les insectes d'autres virus : c'est le cas de l'Anthriscus yellows virus dans le cas du Parsnip yellow fleck virus (PYFV, genre Sequivirus) et du Rice tungro spherical virus dans le cas du Rice tungro bacilliform virus (famille des Caulimoviridae) (ce complexe viral étant responsable de la maladie du tungro du riz).