螺旋藻屬（學名：Spirulina），是藍藻綱的一個屬。
本屬物種舊屬顫藻目顫藻屬，後來獨立出來成為螺旋藻屬，但仍屬顫藻目； 2014年，螺旋藻屬與Glaucospira（Lagerheim 1892）及Halospirulina（Nübel et al. 2000） 再從顫藻目獨立出來，成立獨自的螺旋藻目，三個屬皆於螺旋藻科[1]。
本屬物種過往曾包括商用的兩種螺旋藻，現已被劃入節螺藻屬（Arthrospira）。 節螺藻屬物種只是外形與本屬物種類似，但根據分子生物學的分析，其類囊體（thylakoid）並非位於周邊而是不規則的，所以屬於顫藻目而不是螺旋藻目[1]。
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