Potyviridae és una família de virus de les plantes. Pertanyen al tipus dels virus d’ARN monocatenari +. Formen unes inclusions cilíndriques dins les plantes hostes. Estan compostos d’una proteïna simple.
Basant-se en les seqüències d’aminoàcids de la seva proteïna els Potyiviridea actualment es divideixen en 6 gèneres. Tots ells excepte Bymovirus són monocatenaris.
El gènere més gran de la família Potyviridea[1] és Potyvirus que consta de més de 100 espècies conegudes. Els transmeten els pugons (àfids) però també ho poden ser mecànicament.
En el gènere Macluravirus també la transmissió la fan els pugons.
El gènere Ipomovirus el transmet la mosca blanca.
Tritimovirus i Rymovirus el transmeten els àcars eriòfids.[2])
El genoma de Bymovirus té dues partícules en lloc d'una sola i és transmés per un fong, Polymyxa graminis.
Potyviridae és una família de virus de les plantes. Pertanyen al tipus dels virus d’ARN monocatenari +. Formen unes inclusions cilíndriques dins les plantes hostes. Estan compostos d’una proteïna simple.
Basant-se en les seqüències d’aminoàcids de la seva proteïna els Potyiviridea actualment es divideixen en 6 gèneres. Tots ells excepte Bymovirus són monocatenaris.
Die Potyviridae sind eine Familie von RNA-Viren, die mehr als 30 % der bekannten Pflanzenviren stellen.[3][4] Einige Vertreter besitzen eine agrarwirtschaftliche Bedeutung als Pathogene von Nutzpflanzen. Der Name leitet sich vom Kartoffel-Virus Y (Potato virus Y) als der Typspezies der Familie ab.
Potyviridae besitzen ein RNA-Genom positiver Polarität, das in einem stabförmigen (filamentösen) Kapsid verpackt wird. Potyviridae erzeugen in der Wirtszelle aus einem Protein von etwa 70 Kilodalton zylindrische Einschlusskörperchen, die als pinwheels (engl. für ‚Windrad‘) bezeichnet werden.
Die Potyviren werden aufgrund der Homologie des Kapsidproteins in acht Gattungen (Genera) eingeteilt, von denen nur die Bymoviren ein doppelsträngiges Genom besitzen:[5] Die folgende Gliederung in Gattungen der Potyviridae folgt den Vorgaben des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand November 2018,[6] Als Beispiel angegeben ist jeweils die Typusspezies:
Die größte Gruppe der Potyviridae ist die Gattung Potyvirus, mit mehr als 100 Vertretern. Potyviren werden in der Natur durch Aphididae (Röhrenblattläuse) übertragen und besitzen eine Länge von 720 bis 850 nm. Die Macluraviren sind 650–675 nm lang und werden ebenfalls durch Aphididae übertragen. Die Pflanzenviren der Ipomoviren werden durch Weiße Fliegen übertragen und sind 750–950 nm lang. Tritimoviren und Rymoviren sind 680–750 nm lang und werden durch Wollgrasmilben übertragen. Rymoviren sind nah mit den Potyviren verwandt. Bymoviren produzieren Viruspartikel (Virionen) in zwei verschiedenen Größen und werden durch Polymyxa graminis übertragen.
Koonin et al. haben 2015 die Potyviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) einer von ihnen postulierten Supergruppe‚„Picornavirus-like superfamily“ zugeordnet.[9] Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch – wie die Birnaviridae – doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden. Dieser Vorschlag ist inzwischen abgelöst durch die Master species List #35 des ICTV vom März 2020[10] Eine Gegenüberstellung der Kladogramme findet sich bei Picornavirales §ICTV Master Species List #35.
Die Potyviridae sind eine Familie von RNA-Viren, die mehr als 30 % der bekannten Pflanzenviren stellen. Einige Vertreter besitzen eine agrarwirtschaftliche Bedeutung als Pathogene von Nutzpflanzen. Der Name leitet sich vom Kartoffel-Virus Y (Potato virus Y) als der Typspezies der Familie ab.
போட்டிவிரிடீ (Potyviridae) என்பன செடிகொடிகளைத் தாக்கும் தீநுண்மங்கள். இவை வளையக்கூடிய இழைபோன்ற கோல்வடிவத் நுண்ணுருவ தீநுண்மங்கள் (flexuous filamentous rod-shaped particles). இவற்றின் மரபணுத் தொகுதியம் (genome) ஒற்றை ஆர்.என்.ஏ நேர்வகை ஆர்.என்.ஏ-க்களால் சூழப்பட்டவை. இவையும் காப்ஃசிட் (capsid) எனப்படும் ஒற்றை தீநுண்மத்தால் குறியூட்டிய (encoded) புரதத்தால் ஆன புற உறையால் சூழப்படவை. இவையெல்லாம் உருளை வடிவ புதைவுகள் (cylindrical inclusions) (‘pinwheels’ அல்லது முள்ளுருளி) எனப்படும் தீநுண்மப் புதைவுகளை ஏற்படுத்தத் தூண்டுகின்றன. இவை 70 கிலோடால்ட்டன் (kDa)அளவு கொண்ட, ஒற்றை தீநுண்ம மரபணு தொகுதியத்தியத்தில் இருந்து பெற்ற ஒற்றைப் புரதப் பொருளாகும்
மூடுபடலப் புரதத்தில் உள்ள அமினோக் காடிகளின் வரிசையைப் பொருத்து, போட்டிவிரிடீ குடும்பம் ஆறு பேரினங்களாக பகுக்கப்படுகின்றது. பைமோவைரசு என்னும் தீநுண்மம் தவிர மற்றவை எல்லாம் ஒற்றை இழை நுண்மங்கள். ஆறு பேரினங்களாவன:
போட்டிவிரிடீ குடும்பத்துள் பெரிய பேரினம்[1] போட்டிவைரசுகள் (போட்டி தீநுண்மங்கள்). இந்த பேரினத்தில் 100 உக்கும் கூடுதலானவை உள்ளன. இத்தீநுண்மங்கள் 720-850 நானோமீட்டர் நீளமுடையவை, இவை அபிடுகள் (aphids)வழி கடத்தப்படுகின்றன.
மக்ளராவைரசு என்னும் பேரினத்தில் உள்ள தீநுண்மங்கள் 650-675 நாமீ நீளம் கொண்டவை. இவையும் அபிடுகள் வழி கடத்தப்படுகின்றன.
ஐப்பொமோவைரசு என்னும் நீதுண்மம், வெள்ளை ஈ (whiteflies) என்பனவற்றால் கடத்தப்படுகின்றன. இவை பெரும்பாலும் 750-950 நாமீ நீளம் உடையவை.
டிரைட்டிமோவைரசு (Tritimovirus), ரைமோவைரசு (Rymovirus) ஆகியவை 680-750 நாமீ நீளம் உடையவை. இவை எரியோஃவைடிட் மைட் உயிரினங்கள் (eriophydid mites) வழி கடத்தப்படுகின்றன.[2])
பைமோவைரசு (Bymovirus) மரபணு தொகுதியத்தில் இரண்டு நுண்மங்கள் உள்ளன (250, 550 நாமீ). இவை கைட்ரிட் காளான் (chytrid fungus)(Polymyxa graminis) வழி கடத்தப்படுகின்றன.
போட்டிவிரிடீ (Potyviridae) என்பன செடிகொடிகளைத் தாக்கும் தீநுண்மங்கள். இவை வளையக்கூடிய இழைபோன்ற கோல்வடிவத் நுண்ணுருவ தீநுண்மங்கள் (flexuous filamentous rod-shaped particles). இவற்றின் மரபணுத் தொகுதியம் (genome) ஒற்றை ஆர்.என்.ஏ நேர்வகை ஆர்.என்.ஏ-க்களால் சூழப்பட்டவை. இவையும் காப்ஃசிட் (capsid) எனப்படும் ஒற்றை தீநுண்மத்தால் குறியூட்டிய (encoded) புரதத்தால் ஆன புற உறையால் சூழப்படவை. இவையெல்லாம் உருளை வடிவ புதைவுகள் (cylindrical inclusions) (‘pinwheels’ அல்லது முள்ளுருளி) எனப்படும் தீநுண்மப் புதைவுகளை ஏற்படுத்தத் தூண்டுகின்றன. இவை 70 கிலோடால்ட்டன் (kDa)அளவு கொண்ட, ஒற்றை தீநுண்ம மரபணு தொகுதியத்தியத்தில் இருந்து பெற்ற ஒற்றைப் புரதப் பொருளாகும்
சைட்டோமெகலோவைரசு என்பதில் உள்ள காப்ஃசிட் (capsid) எனப்படும் தீநுண்மப் புரத உறையைப் படத்தில் காணலாம். சிவப்பு நிறத்தில் கோடுகளாக காட்டப்பட்டுளவை மரபணுத் தொகுதியம். சூழ்ந்துள்ள உறை காப்ஃசிட்மூடுபடலப் புரதத்தில் உள்ள அமினோக் காடிகளின் வரிசையைப் பொருத்து, போட்டிவிரிடீ குடும்பம் ஆறு பேரினங்களாக பகுக்கப்படுகின்றது. பைமோவைரசு என்னும் தீநுண்மம் தவிர மற்றவை எல்லாம் ஒற்றை இழை நுண்மங்கள். ஆறு பேரினங்களாவன:
பேரினம் Potyvirus; மாதிரி இனம்: உருளைக்கிழங்கு தீநுண்மம் ஒய்(Potato virus Y) பேரினம் Rymovirus; மாதிரி இனம்: ரைகிராசு மொசெயிக் தீநுண்மம் (Ryegrass mosaic virus) பேரினம் Bymovirus; மாதிரி இனம்: பார்லி மஞ்சள் மொசெயிக் தீநுண்மம்(Barley yellow mosaic virus) பேரினம் Macluravirus; மாதிரி இனம்: மக்ளரா மொசெயிக் தீநுண்மம் (Mclura mosaic virus) பேரினம் Ipomovirus; மாதிரி இனம்: சக்கரைவள்ளிக் கிழங்கு புள்ளிநோய்த் தீநுண்மம் (Sweet potato mild mottle virus) பேரினம் Tritimovirus; மாதிரி இனம்: கோதுமை வரி மொசெயிக் தீநுண்மம் (Wheat streak mosaic virus)போட்டிவிரிடீ குடும்பத்துள் பெரிய பேரினம் போட்டிவைரசுகள் (போட்டி தீநுண்மங்கள்). இந்த பேரினத்தில் 100 உக்கும் கூடுதலானவை உள்ளன. இத்தீநுண்மங்கள் 720-850 நானோமீட்டர் நீளமுடையவை, இவை அபிடுகள் (aphids)வழி கடத்தப்படுகின்றன.
மக்ளராவைரசு என்னும் பேரினத்தில் உள்ள தீநுண்மங்கள் 650-675 நாமீ நீளம் கொண்டவை. இவையும் அபிடுகள் வழி கடத்தப்படுகின்றன.
ஐப்பொமோவைரசு என்னும் நீதுண்மம், வெள்ளை ஈ (whiteflies) என்பனவற்றால் கடத்தப்படுகின்றன. இவை பெரும்பாலும் 750-950 நாமீ நீளம் உடையவை.
டிரைட்டிமோவைரசு (Tritimovirus), ரைமோவைரசு (Rymovirus) ஆகியவை 680-750 நாமீ நீளம் உடையவை. இவை எரியோஃவைடிட் மைட் உயிரினங்கள் (eriophydid mites) வழி கடத்தப்படுகின்றன.)
பைமோவைரசு (Bymovirus) மரபணு தொகுதியத்தில் இரண்டு நுண்மங்கள் உள்ளன (250, 550 நாமீ). இவை கைட்ரிட் காளான் (chytrid fungus)(Polymyxa graminis) வழி கடத்தப்படுகின்றன.
Potyviridae is a family of positive-strand RNA viruses that encompasses more than 30% of known plant viruses,[1][2] many of which are of great agricultural significance. The family has 12 genera and 235 species, three of which are unassigned to a genus.[3][4][5][6]
Potyvirid virions are nonenveloped, flexuous filamentous, rod-shaped particles. The diameter is around 11–20 nm, with a length of 650–950 nm.[4][5]
Genomes are linear and usually nonsegmented, around 8–12kb in length,[4][5] consisting of positive-sense RNA, which is surrounded by a protein coat made up of a single viral encoded protein called a capsid. All induce the formation of virus inclusion bodies called cylindrical inclusions (‘pinwheels’) in their hosts. These consist of a single protein (about 70 kDa) made in their hosts from a single viral genome product.
Member viruses encode large polypeptides that are cleaved into mature proteins. In 5'–3' order these proteins are
There may be some variation in the number of the proteins depending on the genera and species.[7] For instance some genera lack P1, some virus of the genus Ipomovirus lack HC and have a P1 tandem. Pretty interesting sweet potato potyviral ORF (PISPO), alkylation B (AlkB), and inosine triphosphate pyrophosphatase (known as ITPase or HAM1) are protein domains identified in atypical members.[7][8]
Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration. Replication follows the positive-stranded RNA virus replication model. Positive-stranded RNA virus transcription is the method of transcription. Translation takes place by −1 ribosomal frameshifting. The virus exits the host cell by tubule-guided viral movement.[4][5] Plants serve as the natural host. The virus is transmitted via a vector (often an insect or mite). Transmission routes are vector and mechanical.[4][5]
Potyvirus is the largest genus in the family, with 183 known species.[9] These viruses are 720–850 nm in length and are transmitted by aphids. They can also be easily transmitted by mechanical means. These viruses shared a common ancestry 6,600 years ago[10] and are transmitted by over 200 species of aphids.
The species in the genus Macluravirus are 650–675 nm in length and are also transmitted by aphids. The plant viruses in the genus Ipomovirus are transmitted by whiteflies and they are 750–950 nm long. Tritimovirus and the Rymovirus viruses are 680–750 nm long and are transmitted by eriophydid mites. (The rymoviruses are closely related to the potyviruses and may eventually be merged with the potyviruses.[11]) The Bymovirus genome consists of two particles instead of one (275 and 550 nm) and these viruses are transmitted by the chytrid fungus, Polymyxa graminis.
The following genera are recognized:[6]
The following species are unassigned to a genus:[6]
Potyviridae is a family of positive-strand RNA viruses that encompasses more than 30% of known plant viruses, many of which are of great agricultural significance. The family has 12 genera and 235 species, three of which are unassigned to a genus.
Potyviridae es una familia de virus que infectan plantas. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. Comprende más del 30% de los virus de plantas y muchos de los cuales son de gran importancia agrícola ya que pueden dañar los cultivos. Actualmente, 228 especies se incluyen en esta familia, divididas en 12 géneros con tres especies sin asignar.[1][2][3][4]
Los viriones de la familia Potyviridae tienen geometrías en forma de varilla. El diámetro es de alrededor de 12 a 15 nm, con una longitud de 200 a 300 nm.[3][4][5]
Los genomas son lineales y generalmente no segmentados, de alrededor de 8-12 kb de longitud, que consisten en ARN monocatenario de sentido positivo, que está rodeado por una cubierta proteica formada por una única proteína codificada por virus llamada cápside. Todos inducen la formación de cuerpos de inclusión de virus llamados inclusiones cilíndricas ('molinetes') en sus huéspedes. Estos consisten en una sola proteína (aproximadamente 70 kDa ) producida en sus huéspedes a partir de un solo producto del genoma viral.[3][4][5]
La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante penetración. La replicación sigue el modelo de replicación de los virus de ARN de cadena positiva. La transcripción de los virus de ARN de cadena positiva es el método de transcripción. La traducción se realiza mediante un desplazamiento del marco ribosómico -1. El virus sale de la célula huésped mediante un movimiento viral guiado por túbulos. Las plantas sirven como hospedadores naturales. Los virus se transmite a través de un vector (a menudo un insecto o un ácaro). Las rutas de transmisión son vectoriales y mecánicas.[3][4][5]
Potyvirus es el género más grande de la familia, con 183 especies conocidas. Estos virus tienen entre 720 y 850 nm de longitud y son transmitidos por pulgones. También se pueden transmitir fácilmente por medios mecánicos. Estos virus compartieron una ascendencia común hace 6.600 años y son transmitidos por más de 200 especies de pulgones.[6][7]
Las especies del género Macluravirus miden entre 650 y 675 nm de longitud y también son transmitidas por pulgones. Los virus de las plantas del género Ipomovirus son transmitidos por moscas blancas y tienen una longitud de 750 a 950 nm. Los virus tritimovirus y rimovirus tienen una longitud de 680 a 750 nm y son transmitidos por ácaros eriofididos . (Los rimovirus están estrechamente relacionados con los potyvirus y eventualmente pueden fusionarse con los potivirus. El genoma de Bymovirus consta de dos partículas en lugar de una (275 y 550 nm) y estos virus son transmitidos por el hongo quitridio, Polymyxa graminis.[8]
Potyviridae esta estrechamente emparentado con Astroviridae una familia que infecta vertebrados entre ellos el ser humano. Estas dos familias son reunidas en la clase Stelpaviricetes.[5]
Se han descrito los siguientes géneros:[5]
Las siguientes especies no están asignadas a ningún género:[5]
Potyviridae es una familia de virus que infectan plantas. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. Comprende más del 30% de los virus de plantas y muchos de los cuales son de gran importancia agrícola ya que pueden dañar los cultivos. Actualmente, 228 especies se incluyen en esta familia, divididas en 12 géneros con tres especies sin asignar.
Les Potyviridae sont une famille de virus, la seule de l'ordre des Patatavirales. Elle comprend 12 genres et 228 espèces (dont trois espèces non affectées à un genre). Ce sont des virus à ARN à simple brin de polarité positive (ARNmc), rattachés au groupe IV de la classification Baltimore. C'est la plus importante famille de virus de plantes (phytovirus) dont elle regroupe plus de 30 % des espèces. Les virions sont en forme de bâtonnets filamenteux et flexueux à symétrie hélicoïdale. Leur génome, constitué d'ARN, est monopartite (à l'exception du genre Bymovirus au génome bipartite)[3].
Tous les virus de cette famille induisent la formation de corps d'inclusion cylindriques dans les cellules de leurs hôtes[4]. Ces corps d'inclusion sont composés d'une seule protéine (70 kDa).
Selon NCBI (16 janvier 2021)[5] :
(l'espèce-type de chaque genre est indiquée entre parenthèses.)
Le genre le plus important de la famille des Potyviridae est celui des Potyvirus[7]. Ce genre compte 183 espèces acceptées par l'ICTV. Ces virus ont 720 à 850 nm de long et sont transmis par des pucerons. Il se transmettent aussi par inoculation mécanique.
Les virus du genre Macluravirus ont 650 à 675 nm de long et sont également transmis par des pucerons.
Les virus du genre Ipomovirus ont 750 à 950 nm de long et sont transmis par des aleurodes.
Les virus des genres Tritimovirus et Rymovirus ont 680 à 750 nm de long et sont transmis par des acariens de la famille des Eriophyidae[8]. (Le genre Rymovirus est très proche du genre Potyvirus et pourrait être fusionné avec ce dernier[7]).
Les virus du genre Bymovirus ont un génome constitué de deux particules au lieu d'une (de 275 et 550 nm) et sont transmis par un champignon chytride, Polymyxa graminis.
Les Potyviridae sont une famille de virus, la seule de l'ordre des Patatavirales. Elle comprend 12 genres et 228 espèces (dont trois espèces non affectées à un genre). Ce sont des virus à ARN à simple brin de polarité positive (ARNmc), rattachés au groupe IV de la classification Baltimore. C'est la plus importante famille de virus de plantes (phytovirus) dont elle regroupe plus de 30 % des espèces. Les virions sont en forme de bâtonnets filamenteux et flexueux à symétrie hélicoïdale. Leur génome, constitué d'ARN, est monopartite (à l'exception du genre Bymovirus au génome bipartite).
Tous les virus de cette famille induisent la formation de corps d'inclusion cylindriques dans les cellules de leurs hôtes. Ces corps d'inclusion sont composés d'une seule protéine (70 kDa).
Віріони мають форму звивистої нитки довжиною 680–900 нм, діаметр 12-15 нм. Трансляційно-ротаційна (спіральна) симетрія, крок спіралі 3,4 нм. Зовнішня ліпідна оболонка відсутня.
Плавуча густина віріону CsCl = 1.31 г/см3. Коефіцієнт седиментації S = 137-160S.
Геном становить 5% маси віріону. Тип нуклеїнової кислоти: одноланцюгова, лінійна, сенс(+) РНК. Довжина геному 8500-10000 нуклеотидів. Розмір геному 9.3-10.8 kb. До 5’-кінця ковалентно приєднаний білок VPg, а 3’-кінець поліаденільований (20-160 аденозинових залишків). Одна ORF, кодує суцільний поліпротеїн, що потім розрізається протеазою.
Білки становлять 95% від маси віріону. З геномної (+)РНК транслюється поліпротеїн, який розрізається вірусними протеазами на 10 функціональних білків (у порядку з N- до C-кінця поліпротеїну):
Ліпіди і вуглеводи не виявлені.
Антигенною детермінантою є епітоп капсидного білка (СР), за рахунок чого може виявлятись за допомогою ІФА.
Віруси викликають утворення цитоплазматичних білкових включень у вигляді циліндричних тілець. В основному ці включення формуються білком СІ, інколи агрегацією білка HC- pro; можливі включення у ядрі, що формуються комплексом білків NIa та NIb. Представники Potyviridae уражують види більш ніж 30 родин рослин, серед яких багато цінних овочевих та плодових культур.
Шляхи передачі: тлею (неперсистентно), кліщами, грибками.
馬鈴薯Y病毒科(Potyviridae)