Bacteroidetes es un phylo de Negibacteria.
Bacteroidetes е колено составено од три големи класи на Грам-негативни, анаеробни или аеробни, стапчести бактерии кои не формираат ендоспори. Широко се распространети во животната средина, во почвата, водотеците, морската вода, како и во цревата и на кожата на животните. Bacteroidetes spp. се дел од нормален, здрав плацентален микробиом.[1][2]
Припадниците на класата Bacteroidia се најпознати, вклучувајќи го родот Bacteroides (честа бактерија во изметот на топлокрвните животни, вклучувајќи го и човекот), и Porphyromonas, група на бактерии кои ја населуваат човековата усна шуплина. Класата Bacteroidia порано се нарекувала Bacteroidetes; бидејки до неодамна беше единствената класа во коленото, но името и беше сменето во четвртиот том на Бергејовиот Прирачник за Систематска Бактериологија.[3]
Некои членови на родот Bacteroides се патогени опортунисти. Членовите на другите две класи ретко се патогени за луѓето.
Ова колено понекогаш се групира заедно со Chlorobi, Fibrobacteres, Gemmatimonadates, Caldithrix, и морска група А формирајќи ја FCB групата како суперколено.[4] Во алтернативнот систем на класификација предложен од Томас Кавалир-Смит, овој таксон преставува класа во коленото Sphingobacteria.
Компаративните геномски анализи доведоа до идентификација на 27 протеини кои се присутни во повеќето видови на коленото Bacteroidetes. Од нив, еден протеин е најден во сите секвенционирани видови на коленото Bacteroidetes, додека други два протеина се најдени во сите секвенционирани видови со исклучок на оние од родот Bacteroides. Отсуството на овие два протеина во овој род најверојатно се должи на селективено губење на гени. Освен тоа, утврдено е дека четири други протеини се присутни во сите видови на коленото Bacteroidetes освен во Cytophaga hutchinsonii, што повторно најверојатно се должи на селективен губиток на гени. Уште осум други протеини беа утврдени дека се присутни во сите секвенционирани Bacteroidetes видови освен во Salinibacter ruber. Отсуството на овие протеини може исто така да биде резултат на селективно губење на гени, или поради длабокото разгранување на S. ruber во филогенетските дрва што би значело дека гените за овие протеини еволуирале дури после дивергирањето на С. ruber. Исто така беше идентификуван CSI (анг. Conserved signature inserts and deletions) и претставува губиток на секвенца од три аминокиселини во ClpB шаперонот, а е присутен во сите видови на Bacteroidetes освен во S. ruber. Овој губиток исто така е најден во еден вид од коленото Chlorobi и една археа, што најверојатно е резултат на хоризонтален трансфер на гени. Овие 27 протеини и губитокот на секвенцата од три аминокиселини служат како специфични молекуларни маркери за коленото Bacteroidetes.
Видовите од колената Bacteroidetes и Chlorobi се разгрануваат многу блиску едни до други во филогенетските дрва, што укажува на блиска сродност. Со употреба на компаративни геномски анализи, беа идентификувани три протеина кои подеднакво ги споделуваат сите членови на колената Bacteroidetes и Chlorobi. Неколку CSIѕ уникатно споделувани само меѓу членовите на овие две колена исто така биле идентификувани. Присуството на овие молекуларни обележја е потврда за сродство.[5] Во дополнение, малубројното колено Fibrobacteres се теоризира дека има блиски филогенетски врски со двете колена. Филогенетските анализи засновани на голем број различни протеини дури го подржуваат постоењето на таксон од повисоко ниво кој ги опфаќа сите овие три колена. Овие колена исто така доследно се разгрануваат на иста позиција врз основа на CSIѕ во повеќе важни протеини.[6] Најважни од сите показатели за заедничко потекло се два CSIѕ (во RpoC протеинот и во ензимот серин хидроксиметилтрансфераза) и специфичниот протеин PG00081 кои исклучиво ги споделуваат видовите припадници од овие три колена. Сите овие резултати се убедливи докази дека сите три колена споделуваат заеднички предок, што доведе до предлогот тие да се обединат во едно заедничко суперколено со акроним "FCB".
Филогенијата на коленото е заоснована на анализа на нивната 16S рРНК.[7]
Cytophagaceae 2 [incl. Flexibacter species group 3]
Flammeovirgaceae 2 [incl. Ekhidna lutea]
Flammeovirgaceae 4 [Catalimonadaceae; Mooreiaceae]
Marinilabiliaceae 3 [incl. Cytophaga xylanolytica]
Моментално прифатената таксономија е заснована на Листата на имиња на прокариотите со евиденција во номенклатурата (анг. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature - LPSN)[8] и Националниот центар за биотехнолошки информации (анг. National Center for Biotechnology Information - NCBI).[9]
♠ Видови кои се наоѓаат во NCBI, но не се наведени во LPSN.
♪ Прокариоти каде што не се изолирани чисти култури или не се достапни.
Bacteroidetes е колено составено од три големи класи на Грам-негативни, анаеробни или аеробни, стапчести бактерии кои не формираат ендоспори. Широко се распространети во животната средина, во почвата, водотеците, морската вода, како и во цревата и на кожата на животните. Bacteroidetes spp. се дел од нормален, здрав плацентален микробиом.
Припадниците на класата Bacteroidia се најпознати, вклучувајќи го родот Bacteroides (честа бактерија во изметот на топлокрвните животни, вклучувајќи го и човекот), и Porphyromonas, група на бактерии кои ја населуваат човековата усна шуплина. Класата Bacteroidia порано се нарекувала Bacteroidetes; бидејки до неодамна беше единствената класа во коленото, но името и беше сменето во четвртиот том на Бергејовиот Прирачник за Систематска Бактериологија.
Некои членови на родот Bacteroides се патогени опортунисти. Членовите на другите две класи ретко се патогени за луѓето.
Ова колено понекогаш се групира заедно со Chlorobi, Fibrobacteres, Gemmatimonadates, Caldithrix, и морска група А формирајќи ја FCB групата како суперколено. Во алтернативнот систем на класификација предложен од Томас Кавалир-Смит, овој таксон преставува класа во коленото Sphingobacteria.
बैक्टीरोइडिटीस (Bacteroidetes) बैक्टीरिया का एक जीववैज्ञानिक संघ है। यह वायुजीवी या अवायुजीवी होते हैं, लेकिन इसमें सम्मिलित सभी जातियाँ छड़ीनुमा आकृति के और ग्राम-ऋणात्मक हैं। बैक्टीरोइडिटीस पर्यावरण में हर स्थान पर बिखरे हुए पाए जाते हैं, मिट्टी में, सागर जल में और प्राणियों की आँतों व त्वचा में। यह बीजांडासन में भी अरोगजनक भूमिका में साधारण रूप से पाए जाते हैं।[1][2]
बैक्टीरोइडिटीस (Bacteroidetes) बैक्टीरिया का एक जीववैज्ञानिक संघ है। यह वायुजीवी या अवायुजीवी होते हैं, लेकिन इसमें सम्मिलित सभी जातियाँ छड़ीनुमा आकृति के और ग्राम-ऋणात्मक हैं। बैक्टीरोइडिटीस पर्यावरण में हर स्थान पर बिखरे हुए पाए जाते हैं, मिट्टी में, सागर जल में और प्राणियों की आँतों व त्वचा में। यह बीजांडासन में भी अरोगजनक भूमिका में साधारण रूप से पाए जाते हैं।