Els bacteroidets (Bacteroidetes) són un filum d'eubacteris. Comprèn tres classes que estan molt esteses al medi ambient, incloent-hi el sòl, l'aigua marina i el tracte digestiu dels animals.
De llarg, l'ordre Bacteroidales són els més ben estudiats, incloent-hi el gènere Bacteroides (un organisme abundant als fems d'animals de sang calenta, incloent-hi els humans) i Porphyromonas, un grup d'organismes que viuen a la cavitat oral humana.
Els membres del gènere Bacteroides són patògens oportunistes. Els membres de les dues altres classes rarament són patògens pels humans.
A Wikimedia Commons hi ha contingut multimèdia relatiu a: BacteroïdetsBacteroidetes (či Bacteriodetes) je relativně početný kmen gramnegativních bakterií, do něhož patří tři třídy, Bacteroidetes, Flavobacteria a Sphingobacteria, z nichž nejvýznamnější je ta první.
Mnoho z Bacteroidetes (např. rod Bacteroides) je velmi hojnou součástí střevní mikroflóry člověka.[1] Některé se však mohou stát patogeny a způsobovat infekce, především Bacteroides fragilis.[2]
Zajímavostí je, že do tohoto kmene patří dvě obligátně endosymbiotické bakterie, Amoebophilus asiaticus (hostitelem jsou améby) a Cardinium hertigii (hostitelem jsou členovci).[3]
Bacteroidetes (či Bacteriodetes) je relativně početný kmen gramnegativních bakterií, do něhož patří tři třídy, Bacteroidetes, Flavobacteria a Sphingobacteria, z nichž nejvýznamnější je ta první.
Mnoho z Bacteroidetes (např. rod Bacteroides) je velmi hojnou součástí střevní mikroflóry člověka. Některé se však mohou stát patogeny a způsobovat infekce, především Bacteroides fragilis.
Zajímavostí je, že do tohoto kmene patří dvě obligátně endosymbiotické bakterie, Amoebophilus asiaticus (hostitelem jsou améby) a Cardinium hertigii (hostitelem jsou členovci).
Die Bacteroidetes (auch Bacteroidota) bilden einen eigenen Stamm (äquivalent: Abteilung, englisch division, lateinisch divisio, allgemein auch Phylum genannt) innerhalb der Domäne der Bakterien. In diesem Phylum findet sich eine breite Vielfalt von Stoffwechsel, Ökologie und Morphologie.
Der Gram-Test ist negativ. Die Zellen der meisten Arten sind stäbchenförmig und bilden keine Sporen. Es sind aerobe, also auf Sauerstoff angewiesene, wie auch anaerobe Vertreter vorhanden. Mehrere Arten, wie z. B. von der Klasse der Flavobakterien und Cytophagen, sind durch Gleitbewegungen motil (beweglich).
Innerhalb der Bacteroidetes sind auch einige für Tiere und Menschen krankheitserregende (pathogene) Arten vorhanden. In der Familie Flavobacteriaceae sind u. a. einige Arten für Vögel pathogen. Capnocytophaga gehört zu der normalen Bakterienflora des Menschen, kann aber unter bestimmten Umständen auch pathogen wirken. Auch Bacteroides fragilis und Bacteroides thetaiotaomicron sind opportunistische Krankheitserreger des Menschen. Für Fische sind z. B. Arten von Cytophaga pathogen.
Die Abteilung Bacteroidetes (alias Bacteroidota) enthält aufgrund von 16s-rRNA-Gensequenzen die Klassen Bacteroidia, Cytophagia, Flavobacteriia und Sphingobacteriia.
Die hier angegebene Systematik basiert mit Stand 11. März 2022 auf den folgenden Quellen:
Die GTDB versteht abweichend von LPSN und NCBI das Phylum Bacteroidota im weiteren Sinne, d. h. dem Umfang nach identisch mit der Bacteroidetes–Chlorobi-Gruppe (Bacteroidota–Chlorobiota); die in dieser Klade enthaltenen Phyla (entsprechend LPSN/NCBI) beinhalten (bis auf Bacteroidetes selbst) jeweils nur eine einzige Klasse und sind in der GTDB auf diese Rangstufe herabgestuft.[5]
Man beachte, dass unterschiedliche Taxa teilweise sehr ähnliche Namen haben, etwa ‚-bacteria‘ versus ‚-bacteriia‘, das doppelte ‚i‘ drückt im Allgemeinen eine Ähnlichkeit (sensu lato oder Schwestertaxon) aus. Die Systematik im Einzelnen:
Phylum Bacteroidetes Krieg et al. 2012 (L,N), mit Synonymen Bacteroidota Krieg et al. 2021 (L), „Sphingobacteria“ Cavalier-Smith 2002 (L)[6][7][S 1]
Unsichere Mitglieder:
Es sind aerobe (auf Sauerstoff angewiesene) wie auch anaerobe Vertreter vorhanden. Einige sind pathogen. Zu den anaeroben Bacteroidetes zählt z. B. die Gattung Bacteroides, die im menschlichen Darm die mit 1011 Zellen pro Gramm häufigsten Bakterien sind.[19] Die Klasse der Flavobacteriia enthält einige Kommensalen und opportunistisch pathogene Bakterien. Die Arten sind in verschiedenen Habitaten zu finden, z. B. im Boden, Süßwasser und Meerwasser, innerhalb von verschiedenen Arten von Fischen, Amphibien, Insekten, Weichtieren, Krebstieren und in Pflanzen. Arten von Blattabacterium (Familie Blattabacteriaceae) wurden in Termiten und Schaben gefunden. Auch die Mitglieder der Klasse Sphingobacteria besiedeln ein breites Spektrum von Habitaten, so z. B. Böden, Grund-, Frisch- und Meerwasser. Auch einige psychrophile (kälteliebende) Arten sind vorhanden, wie z. B. Flavobacterium psychrophilum und Psychroflexus. Beide Gattungen zählen zu der Familie Flavobacteriaceae.
Die Bacteroidetes (auch Bacteroidota) bilden einen eigenen Stamm (äquivalent: Abteilung, englisch division, lateinisch divisio, allgemein auch Phylum genannt) innerhalb der Domäne der Bakterien. In diesem Phylum findet sich eine breite Vielfalt von Stoffwechsel, Ökologie und Morphologie.
Bacteroidetes es un phylo de Negibacteria.
Bacteroidetes е колено составено од три големи класи на Грам-негативни, анаеробни или аеробни, стапчести бактерии кои не формираат ендоспори. Широко се распространети во животната средина, во почвата, водотеците, морската вода, како и во цревата и на кожата на животните. Bacteroidetes spp. се дел од нормален, здрав плацентален микробиом.[1][2]
Припадниците на класата Bacteroidia се најпознати, вклучувајќи го родот Bacteroides (честа бактерија во изметот на топлокрвните животни, вклучувајќи го и човекот), и Porphyromonas, група на бактерии кои ја населуваат човековата усна шуплина. Класата Bacteroidia порано се нарекувала Bacteroidetes; бидејки до неодамна беше единствената класа во коленото, но името и беше сменето во четвртиот том на Бергејовиот Прирачник за Систематска Бактериологија.[3]
Некои членови на родот Bacteroides се патогени опортунисти. Членовите на другите две класи ретко се патогени за луѓето.
Ова колено понекогаш се групира заедно со Chlorobi, Fibrobacteres, Gemmatimonadates, Caldithrix, и морска група А формирајќи ја FCB групата како суперколено.[4] Во алтернативнот систем на класификација предложен од Томас Кавалир-Смит, овој таксон преставува класа во коленото Sphingobacteria.
Компаративните геномски анализи доведоа до идентификација на 27 протеини кои се присутни во повеќето видови на коленото Bacteroidetes. Од нив, еден протеин е најден во сите секвенционирани видови на коленото Bacteroidetes, додека други два протеина се најдени во сите секвенционирани видови со исклучок на оние од родот Bacteroides. Отсуството на овие два протеина во овој род најверојатно се должи на селективено губење на гени. Освен тоа, утврдено е дека четири други протеини се присутни во сите видови на коленото Bacteroidetes освен во Cytophaga hutchinsonii, што повторно најверојатно се должи на селективен губиток на гени. Уште осум други протеини беа утврдени дека се присутни во сите секвенционирани Bacteroidetes видови освен во Salinibacter ruber. Отсуството на овие протеини може исто така да биде резултат на селективно губење на гени, или поради длабокото разгранување на S. ruber во филогенетските дрва што би значело дека гените за овие протеини еволуирале дури после дивергирањето на С. ruber. Исто така беше идентификуван CSI (анг. Conserved signature inserts and deletions) и претставува губиток на секвенца од три аминокиселини во ClpB шаперонот, а е присутен во сите видови на Bacteroidetes освен во S. ruber. Овој губиток исто така е најден во еден вид од коленото Chlorobi и една археа, што најверојатно е резултат на хоризонтален трансфер на гени. Овие 27 протеини и губитокот на секвенцата од три аминокиселини служат како специфични молекуларни маркери за коленото Bacteroidetes.
Видовите од колената Bacteroidetes и Chlorobi се разгрануваат многу блиску едни до други во филогенетските дрва, што укажува на блиска сродност. Со употреба на компаративни геномски анализи, беа идентификувани три протеина кои подеднакво ги споделуваат сите членови на колената Bacteroidetes и Chlorobi. Неколку CSIѕ уникатно споделувани само меѓу членовите на овие две колена исто така биле идентификувани. Присуството на овие молекуларни обележја е потврда за сродство.[5] Во дополнение, малубројното колено Fibrobacteres се теоризира дека има блиски филогенетски врски со двете колена. Филогенетските анализи засновани на голем број различни протеини дури го подржуваат постоењето на таксон од повисоко ниво кој ги опфаќа сите овие три колена. Овие колена исто така доследно се разгрануваат на иста позиција врз основа на CSIѕ во повеќе важни протеини.[6] Најважни од сите показатели за заедничко потекло се два CSIѕ (во RpoC протеинот и во ензимот серин хидроксиметилтрансфераза) и специфичниот протеин PG00081 кои исклучиво ги споделуваат видовите припадници од овие три колена. Сите овие резултати се убедливи докази дека сите три колена споделуваат заеднички предок, што доведе до предлогот тие да се обединат во едно заедничко суперколено со акроним "FCB".
Филогенијата на коленото е заоснована на анализа на нивната 16S рРНК.[7]
Cytophagaceae 2 [incl. Flexibacter species group 3]
Flammeovirgaceae 2 [incl. Ekhidna lutea]
Flammeovirgaceae 4 [Catalimonadaceae; Mooreiaceae]
Marinilabiliaceae 3 [incl. Cytophaga xylanolytica]
Моментално прифатената таксономија е заснована на Листата на имиња на прокариотите со евиденција во номенклатурата (анг. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature - LPSN)[8] и Националниот центар за биотехнолошки информации (анг. National Center for Biotechnology Information - NCBI).[9]
♠ Видови кои се наоѓаат во NCBI, но не се наведени во LPSN.
♪ Прокариоти каде што не се изолирани чисти култури или не се достапни.
Bacteroidetes е колено составено од три големи класи на Грам-негативни, анаеробни или аеробни, стапчести бактерии кои не формираат ендоспори. Широко се распространети во животната средина, во почвата, водотеците, морската вода, како и во цревата и на кожата на животните. Bacteroidetes spp. се дел од нормален, здрав плацентален микробиом.
Припадниците на класата Bacteroidia се најпознати, вклучувајќи го родот Bacteroides (честа бактерија во изметот на топлокрвните животни, вклучувајќи го и човекот), и Porphyromonas, група на бактерии кои ја населуваат човековата усна шуплина. Класата Bacteroidia порано се нарекувала Bacteroidetes; бидејки до неодамна беше единствената класа во коленото, но името и беше сменето во четвртиот том на Бергејовиот Прирачник за Систематска Бактериологија.
Некои членови на родот Bacteroides се патогени опортунисти. Членовите на другите две класи ретко се патогени за луѓето.
Ова колено понекогаш се групира заедно со Chlorobi, Fibrobacteres, Gemmatimonadates, Caldithrix, и морска група А формирајќи ја FCB групата како суперколено. Во алтернативнот систем на класификација предложен од Томас Кавалир-Смит, овој таксон преставува класа во коленото Sphingobacteria.
बैक्टीरोइडिटीस (Bacteroidetes) बैक्टीरिया का एक जीववैज्ञानिक संघ है। यह वायुजीवी या अवायुजीवी होते हैं, लेकिन इसमें सम्मिलित सभी जातियाँ छड़ीनुमा आकृति के और ग्राम-ऋणात्मक हैं। बैक्टीरोइडिटीस पर्यावरण में हर स्थान पर बिखरे हुए पाए जाते हैं, मिट्टी में, सागर जल में और प्राणियों की आँतों व त्वचा में। यह बीजांडासन में भी अरोगजनक भूमिका में साधारण रूप से पाए जाते हैं।[1][2]
बैक्टीरोइडिटीस (Bacteroidetes) बैक्टीरिया का एक जीववैज्ञानिक संघ है। यह वायुजीवी या अवायुजीवी होते हैं, लेकिन इसमें सम्मिलित सभी जातियाँ छड़ीनुमा आकृति के और ग्राम-ऋणात्मक हैं। बैक्टीरोइडिटीस पर्यावरण में हर स्थान पर बिखरे हुए पाए जाते हैं, मिट्टी में, सागर जल में और प्राणियों की आँतों व त्वचा में। यह बीजांडासन में भी अरोगजनक भूमिका में साधारण रूप से पाए जाते हैं।
The phylum Bacteroidota (synonym Bacteroidetes) is composed of three large classes of Gram-negative, nonsporeforming, anaerobic or aerobic, and rod-shaped bacteria that are widely distributed in the environment, including in soil, sediments, and sea water, as well as in the guts and on the skin of animals.
Although some Bacteroides spp. can be opportunistic pathogens, many Bacteroidota are symbiotic species highly adjusted to the gastrointestinal tract. Bacteroides are highly abundant in intestines, reaching up to 1011 cells g−1 of intestinal material. They perform metabolic conversions that are essential for the host, such as degradation of proteins or complex sugar polymers. Bacteroidota colonize the gastrointestinal tract already in infants, as non-digestible oligosaccharides in mother milk support the growth of both Bacteroides and Bifidobacterium spp. Bacteroides spp. are selectively recognized by the immune system of the host through specific interactions.[4]
Bacteroides fragilis was the first Bacteroides species isolated in 1898 as a human pathogen linked to appendicitis among other clinical cases.[4] By far, the species in the class Bacteroidia are the most well-studied, including the genus Bacteroides (an abundant organism in the feces of warm-blooded animals including humans), and Porphyromonas, a group of organisms inhabiting the human oral cavity. The class Bacteroidia was formerly called Bacteroidetes; as it was until recently the only class in the phylum, the name was changed in the fourth volume of Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.[5]
For a long time, it was thought that the majority of Gram-negative gastrointestinal tract bacteria belonged to the genus Bacteroides, but in recent years many species of Bacteroides have undergone reclassification. Based on current classification, the majority of the gastrointestinal Bacteroidota species belong to the families Bacteroidaceae, Prevotellaceae, Rikenellaceae, and Porphyromonadaceae. [4] This phylum is sometimes grouped with Chlorobiota, Fibrobacterota, Gemmatimonadota, Calditrichota, and marine group A to form the FCB group or superphylum.[6] In the alternative classification system proposed by Cavalier-Smith, this taxon is instead a class in the phylum Sphingobacteria.
In the gastrointestinal microbiota Bacteroidota have a very broad metabolic potential and are regarded as one of the most stable part of gastrointestinal microflora. Reduced abundance of the Bacteroidota in some cases is associated with obesity. This bacterial group appears to be enriched in patients with irritable bowel syndrome[7] and involved in type 1 and type 2 diabetes.[4] Bacteroides spp. in contrast to Prevotella spp. were recently found to be enriched in the metagenomes of subjects with low gene richness that were associated with adiposity, insulin resistance and dyslipidaemia as well as an inflammatory phenotype. Bacteroidota species that belong to classes Flavobacteriales and Sphingobacteriales are typical soil bacteria and are only occasionally detected in the gastrointestinal tract, except Capnocytophaga spp. and Sphingobacterium spp. that can be detected in the human oral cavity.[4]
Bacteroidota are not limited to gut microbiota, they colonize a variety of habitats on Earth.[8] For example, Bacteroidota, together with "Pseudomonadota", "Bacillota", and "Actinomycetota", are also among the most abundant bacterial groups in rhizosphere.[9] They have been detected in soil samples from various locations, including cultivated fields, greenhouse soils and unexploited areas.[8] Bacteroidota also inhabit freshwater lakes, rivers, as well as oceans. They are increasingly recognized as an important compartment of the bacterioplankton in marine environments, especially in pelagic oceans.[8] Halophilic Bacteroidota genus Salinibacter inhabit hypersaline environments such as salt-saturated brines in hypersaline lakes. Salinibacter shares many properties with halophilic Archaea such as Halobacterium and Haloquadratum that inhabit the same environments. Phenotypically, Salinibacter is remarkably similar to Halobacterium and therefore for a long time remained unidentified.[10]
Gastrointestinal Bacteroidota species produce succinic acid, acetic acid, and in some cases propionic acid, as the major end-products. Species belonging to the genera Alistipes, Bacteroides, Parabacteroides, Prevotella, Paraprevotella, Alloprevotella, Barnesiella, and Tannerella are saccharolytic, while species belonging to Odoribacter and Porphyromonas are predominantly asaccharolytic. Some Bacteroides spp. and Prevotella spp. can degrade complex plant polysaccharides such as starch, cellulose, xylans, and pectins. The Bacteroidota species also play an important role in protein metabolism by proteolytic activity assigned to the proteases linked to the cell. Some "Bacteroides spp. have a potential to utilize urea as a nitrogen source. Other important functions of Bacteroides spp. include the deconjugation of bile acids and growth on mucus.[4] Many members of the Bacteroidota genera (Flexibacter, Cytophaga, Sporocytophaga and relatives) are coloured yellow-orange to pink-red due to the presence of pigments of the flexirubin group. In some Bacteroidota strains, flexirubins may be present together with carotenoid pigments. Carotenoid pigments are usually found in marine and halophilic members of the group, whereas flexirubin pigments are more frequent in clinical, freshwater or soil-colonizing representatives.[11]
Comparative genomic analysis has led to the identification of 27 proteins which are present in most species of the phylum Bacteroidota. Of these, one protein is found in all sequenced Bacteroidota species, while two other proteins are found in all sequenced species with the exception of those from the genus Bacteroides. The absence of these two proteins in this genus is likely due to selective gene loss.[6] Additionally, four proteins have been identified which are present in all Bacteroidota species except Cytophaga hutchinsonii; this is again likely due to selective gene loss. A further eight proteins have been identified which are present in all sequenced Bacteroidota genomes except Salinibacter ruber. The absence of these proteins may be due to selective gene loss, or because S. ruber branches very deeply, the genes for these proteins may have evolved after the divergence of S. ruber. A conserved signature indel has also been identified; this three-amino-acid deletion in ClpB chaperone is present in all species of the Bacteroidota phylum except S. ruber. This deletion is also found in one Chlorobiota species and one Archaeum species, which is likely due to horizontal gene transfer. These 27 proteins and the three-amino-acid deletion serve as molecular markers for the Bacteroidota.[6]
Species from the Bacteroidota and Chlorobiota phyla branch very closely together in phylogenetic trees, indicating a close relationship. Through the use of comparative genomic analysis, three proteins have been identified which are uniquely shared by virtually all members of the Bacteroidota and Chlorobiota phyla.[6] The sharing of these three proteins is significant because other than them, no proteins from either the Bacteroidota or Chlorobiota phyla are shared by any other groups of bacteria. Several conserved signature indels have also been identified which are uniquely shared by members of the phyla. The presence of these molecular signatures supports their close relationship.[6][12] Additionally, the phylum Fibrobacterota is indicated to be specifically related to these two phyla. A clade consisting of these three phyla is strongly supported by phylogenetic analyses based upon a number of different proteins[12] These phyla also branch in the same position based upon conserved signature indels in a number of important proteins.[13] Lastly and most importantly, two conserved signature indels (in the RpoC protein and in serine hydroxymethyltransferase) and one signature protein PG00081 have been identified that are uniquely shared by all of the species from these three phyla. All of these results provide compelling evidence that the species from these three phyla shared a common ancestor exclusive of all other bacteria, and it has been proposed that they should all recognized as part of a single "FCB" superphylum.[6][12]
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature[2]
The phylum Bacteroidota (synonym Bacteroidetes) is composed of three large classes of Gram-negative, nonsporeforming, anaerobic or aerobic, and rod-shaped bacteria that are widely distributed in the environment, including in soil, sediments, and sea water, as well as in the guts and on the skin of animals.
Although some Bacteroides spp. can be opportunistic pathogens, many Bacteroidota are symbiotic species highly adjusted to the gastrointestinal tract. Bacteroides are highly abundant in intestines, reaching up to 1011 cells g−1 of intestinal material. They perform metabolic conversions that are essential for the host, such as degradation of proteins or complex sugar polymers. Bacteroidota colonize the gastrointestinal tract already in infants, as non-digestible oligosaccharides in mother milk support the growth of both Bacteroides and Bifidobacterium spp. Bacteroides spp. are selectively recognized by the immune system of the host through specific interactions.
Bacteroidetes o Bacteroidota son un grupo grande de bacterias gramnegativas con amplia distribución en el medio ambiente, incluyendo el suelo, sedimentos, lagos, agua de mar y el tracto digestivo de los animales.
El grupo incluye seis clases. La clase Bacteroidia es con diferencia la más estudiada e incluye el género Bacteroides, un organismo abundante en las heces de animales de sangre caliente incluyendo los seres humanos, y Porphyromonas, un grupo de organismos que habita en la cavidad bucal humana. Los miembros del género Bacteroides son patógenos oportunistas. Las otras clases de Bacteroidetes raramente son patógenas para los seres humanos. Especies representativas de los órdenes Flavobacteriales, Sphingobacteriales y Cytophagales, son Flavobacterium mizutaii, Sphingobacterium antarcticum y Cytophaga columnaris respectivamente.
El investigador Jeffrey Gordon et al. descubrieron que los seres humanos y los ratones obesos tienen una flora intestinal con un porcentaje más bajo de bacterias Bacteroidetes y más alto de Firmicutes. Sin embargo, se desconoce si Bacteroidetes previene la obesidad o que simplemente esta flora intestinal es seleccionada por las condiciones intestinales de los no obesos.[3][4][5]
Varias proteínas son comunes de flavobacteriales y bacteroidales, indicando que estos órdenes comparten un común ancestro excluyendo otros bacteroidetes.[6] El ancestro común de Bacteroidetes parece haber sido un termófilo dada la posición basal de los cuatro grupos termófilos. Chlorobia que antiguamente se consideraba un filo independiente, adquirió la fotosíntesis de un antepasado compartido con los bacteroidetes tradicionales (no termófilos).
Una filogenia algo consensuada en el GTDB database y el Annotree es la siguiente:[7][8]
Bacteroidetes BacteroidiaBacteroidetes o Bacteroidota son un grupo grande de bacterias gramnegativas con amplia distribución en el medio ambiente, incluyendo el suelo, sedimentos, lagos, agua de mar y el tracto digestivo de los animales.
El grupo incluye seis clases. La clase Bacteroidia es con diferencia la más estudiada e incluye el género Bacteroides, un organismo abundante en las heces de animales de sangre caliente incluyendo los seres humanos, y Porphyromonas, un grupo de organismos que habita en la cavidad bucal humana. Los miembros del género Bacteroides son patógenos oportunistas. Las otras clases de Bacteroidetes raramente son patógenas para los seres humanos. Especies representativas de los órdenes Flavobacteriales, Sphingobacteriales y Cytophagales, son Flavobacterium mizutaii, Sphingobacterium antarcticum y Cytophaga columnaris respectivamente.
El investigador Jeffrey Gordon et al. descubrieron que los seres humanos y los ratones obesos tienen una flora intestinal con un porcentaje más bajo de bacterias Bacteroidetes y más alto de Firmicutes. Sin embargo, se desconoce si Bacteroidetes previene la obesidad o que simplemente esta flora intestinal es seleccionada por las condiciones intestinales de los no obesos.
Bacteroidetes on hõimkond anaeroobseid spoore mittemoodustavaid pulgakujulisi gramnegatiivseid baktereid, mis jagunevad kolme klassi (Bacteroidia, Flavobacteria ja Sphingobacteria).
Hõimkonnale on evolutsiooniliselt lähedased rohelised väävlibakterid.
Bacteroidetes on hõimkond anaeroobseid spoore mittemoodustavaid pulgakujulisi gramnegatiivseid baktereid, mis jagunevad kolme klassi (Bacteroidia, Flavobacteria ja Sphingobacteria).
Hõimkonnale on evolutsiooniliselt lähedased rohelised väävlibakterid.
Bacteroidetes est un phylum composé de trois grandes classes de bactéries qui sont largement répandues dans l'environnement, notamment dans le sol, dans les sédiments, l'eau de mer et dans les intestins d'animaux.
De loin, la classe des Bacteroidales est l'une des plus étudiées, notamment les genres Bacteroides (organismes abondants dans les selles des animaux à sang chaud, dont les humains) et Porphyromonas (un groupe d'organismes vivant dans la cavité buccale de l'Homme).
Les membres du genre Bacteroides sont des agents pathogènes opportunistes, rarement membres des deux autres classes de pathogènes pour l'Homme.
Le chercheur Jeffrey Gordon et ses collègues ont constaté que la flore intestinale des humains obèses possède un pourcentage plus faible de bactéries du phylum Bacteroidetes. Toutefois, ils ne savent pas si les Bacteroidetes peuvent prévenir l'obésité ou si cette flore intestinale n'est pas simplement préférée par l'intestin chez les personnes non obèses[1],[2],[3].
Selon Catalogue of Life (10 juin 2020)[4] :
Bacteroidetes est un phylum composé de trois grandes classes de bactéries qui sont largement répandues dans l'environnement, notamment dans le sol, dans les sédiments, l'eau de mer et dans les intestins d'animaux.
De loin, la classe des Bacteroidales est l'une des plus étudiées, notamment les genres Bacteroides (organismes abondants dans les selles des animaux à sang chaud, dont les humains) et Porphyromonas (un groupe d'organismes vivant dans la cavité buccale de l'Homme).
Les membres du genre Bacteroides sont des agents pathogènes opportunistes, rarement membres des deux autres classes de pathogènes pour l'Homme.
Le chercheur Jeffrey Gordon et ses collègues ont constaté que la flore intestinale des humains obèses possède un pourcentage plus faible de bactéries du phylum Bacteroidetes. Toutefois, ils ne savent pas si les Bacteroidetes peuvent prévenir l'obésité ou si cette flore intestinale n'est pas simplement préférée par l'intestin chez les personnes non obèses,,.
Tá an fíleam Bacteroidetes comhdhéanta de trí aicmí de bhaictéir atá dáilte go forleathan ins an timpeallacht, mar aon le an ithir, an dríodar, an sáile agus potóga ainmhithe.
Go mór fada, is ar an aicme Bacteroidales atá an staidéar is mó déanta, mar aon leis an ghéineas Bacteroides (orgánach atá flúirseach i bhfaecas ainmhithe aonteasach agus daoine san áireamh), agus Porphyromonas, grúpa orgánach a chónaíonn i mbéalchuas an duine. Is baictéir phataigineacha bhrabúsacha iad baill den ghéineas Bacteroides. is annamh a mbíonn baill an dhá aicme eile pataigineach do dhaoine.
As Bacteroidetes ou bacterioidetas son un filo de bacterias composto por tres grandes clases de bacterias gramnegativas, non formadoras de esporas, anaeróbicas, e con forma de bacilos, que están amplamente distribuídas no ambiente, e que aarecen no solo, sedimentos, mares e nos intestinos e pel dos animais.
Con diferenza, a clase Bacteroidia é a mellor estudada deste filo, e inclúe os xéneros Bacteroides (un organismo abundante nas feces dos animais de sangue quente, incluídos os humanos), e Porphyromonas, que habitan na cavidade bucal humana. A clase actual Bacteroidia antes foi chamada formalmente Bacteroidetes xa que ata hai pouco era a única clase do filo (nese caso coinciden os nomes do filo e a clase), pero o nome foi cambiado no cuarto volume do Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.[1]
Membros do xénero Bacteroides son patóxenos oportunistas. Os membros das outras dúas clases raramente son patóxenos para os humanos.
O investigador Jeffrey Gordon e os seus colegas descubriron que os homes e os rtos obesos tiñan unha flora intestinal cunha baixa porcentaxe de Bacteroidetes e relativamente maior cantidade de bacterias do grupo Firmicutes. Porén, non están seguros se os Bacteroidetes preveñen a obesidade ou se esta flora intestinal é simplemente seleccionada preferencialmente nas condicións intestinais dos que non están obesos.[2][3][4]
Este filo agrúpase ás veces con Chlorobi, Fibrobacteres, Gemmatimonadetes, Caldithrix e o grupo mariño A para formar o grupo FCB ou superfilo. Na clasificación alternativa proposta por Cavalier-Smith, este taxon é unha clase do filo Sphingobacteria.
No cladograma móstrase a toxonomía actualmente aceptada do grupo baseada na LPSN (List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature) [5] e no NCBI (National Center for Biotechnology Information) [6] e a filoxenia está baseada en datos do ARNr 16S do LTP 106 do Proxecto The All-Species Living Tree.[7]
?Bifissio spartinae ♠ Xin & Zhou 2001
?‘Candidatus Amoebophilus asiaticus’Horn et al. 2001
?‘Candidatus Cardinium hertigii’ Zchori-Fein et al. 2004
?‘Candidatus Paenicardinium endonii’ Noel and Atibalentja 2006
?Toxothrix trichogenes ♪ (Cholodny 1924) Beger 1953
?Venteria marina ♠ Bae 2005
CytophagalesReichenbachiella Nedashkovskaya et al. 2005 emend. Cha et al. 2011
Flammeovirgaceae 2 [incl. Ekhidna lutea]
Marivirga Nedashkovskaya et al. 2010
Cyclobacteriaceae [incl. Rhodonellum psychrophilum]
Flavobacteriales?'Candidatus Sulcia muelleri' Moran et al. 2005
?'Candidatus Uzinura diaspidicola' Gruwell et al. 2007
?Schleiferia thermophila Albuquerque et al. 2011 {Schleiferiaceae}
Bacteroidales?‘Candidatus Armantifilum devescovinae’ Desai et al. 2010
?‘Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae’
?‘Candidatus Symbiothrix dinenymphae’ Hongoh et al. 2007
?‘Candidatus Vestibaculum illigatum’ Stingl et al. 2004
?Marinilabilia salmonicolor (Veldkamp 1961) Nakagawa e Yamasato 1996 emend. Suzuki et al. 1999
?Sunxiuqinia elliptica Qu et al. 2011
Meniscus glaucopis Irgens 1977
Prolixibacter bellariavorans Holmes et al. 2007
Cytophaga fermentans Bachmann 1955
Marinifilum fragile Na et al. 2009
Alkaliflexus imshenetskii Zhilina et al. 2005
Anaerophaga thermohalophila Denger et al. 2002
Bacteroidaceae [incl. Prevotellaceae]
Notas
♠ Liñaxes atopadas no NCBI pero non na LPSN.
♪ Procariotas dos que non hai cultivos puros (axénicos) illados ou dispoñibles, porque non se poden cultivar ou duran pouco.
As Bacteroidetes ou bacterioidetas son un filo de bacterias composto por tres grandes clases de bacterias gramnegativas, non formadoras de esporas, anaeróbicas, e con forma de bacilos, que están amplamente distribuídas no ambiente, e que aarecen no solo, sedimentos, mares e nos intestinos e pel dos animais.
Con diferenza, a clase Bacteroidia é a mellor estudada deste filo, e inclúe os xéneros Bacteroides (un organismo abundante nas feces dos animais de sangue quente, incluídos os humanos), e Porphyromonas, que habitan na cavidade bucal humana. A clase actual Bacteroidia antes foi chamada formalmente Bacteroidetes xa que ata hai pouco era a única clase do filo (nese caso coinciden os nomes do filo e a clase), pero o nome foi cambiado no cuarto volume do Bergey's Manual of Systematic Bacteriology.
Membros do xénero Bacteroides son patóxenos oportunistas. Os membros das outras dúas clases raramente son patóxenos para os humanos.
O investigador Jeffrey Gordon e os seus colegas descubriron que os homes e os rtos obesos tiñan unha flora intestinal cunha baixa porcentaxe de Bacteroidetes e relativamente maior cantidade de bacterias do grupo Firmicutes. Porén, non están seguros se os Bacteroidetes preveñen a obesidade ou se esta flora intestinal é simplemente seleccionada preferencialmente nas condicións intestinais dos que non están obesos.
Este filo agrúpase ás veces con Chlorobi, Fibrobacteres, Gemmatimonadetes, Caldithrix e o grupo mariño A para formar o grupo FCB ou superfilo. Na clasificación alternativa proposta por Cavalier-Smith, este taxon é unha clase do filo Sphingobacteria.
Filum Bacteroidetes tersusun atas tiga kelas besar bakteri yang tersebar di berbagai lingkungan, termasuk dalam tanah, dalam sediments, air laut dan di dalam perut hewan dan rayap.
Anggota genus Bacteroides kadang-kadang patogen dan anggota kedua kelas lainnya jarang bersifat patogen pada manusia.
Artikel bertopik bakteri ini adalah sebuah rintisan. Anda dapat membantu Wikipedia dengan mengembangkannya.Flokkurinn Bacteroidetes samanstendur af þremur stórum ættum Gram-neikvæðum bakteríum, ekki-sporamyndandi, loftháðum eða ekki loftháðum, og staflaga gerlum sem eru útbreiddir í umhverfinu, þar á meðal í jarðvegi, sjó og í og á dýrum.
Núverandi viðurkennd flokkun, byggð á List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature[1] og National Center for Biotechnology Information (NCBI)[2] og phylogeny er byggð á 16S rRNA-based LTP release 111 by 'The All-Species Living Tree' Project.[3]
?Bifissio spartinae ♠ Xin & Zhou 2001
?‘Candidatus Amoebophilus asiaticus’Horn et al. 2001
?‘Candidatus Cardinium hertigii’ Zchori-Fein et al. 2004
?‘Candidatus Paenicardinium endonii’ Noel og Atibalentja 2006
?Toxothrix trichogenes ♪ (Cholodny 1924) Beger 1953
?Venteria marina ♠ Bae 2005
CytophagalesBacteroidetes Order III ''incertae sedis'' [meðt. Flexibacter species group 2]
Microscilla clade [meðt. Flexibacter species group 3]
Flammeovirgaceae 2 [meðt. Ekhidna lutea]
Fulvivirga-Reichenbachiella clade
Cesiribacter-Marivirga clade
Cyclobacteriaceae [meðt. Litoribacter ruber & Rhodonellum psychrophilum]
Sphingobacteriaceae [meðt. Flavobacterium mizutaii]
Cryomorphaceae 1 [meðt. Schleiferia thermophila]
Flavobacteriales?'Candidatus Sulcia muelleri' Moran et al. 2005
?'Candidatus Uzinura diaspidicola' Gruwell et al. 2007
Bacteroidales?‘Candidatus Armantifilum devescovinae’ Desai et al. 2010
?‘Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae’
?‘Candidatus Symbiothrix dinenymphae’ Hongoh et al. 2007
?‘Candidatus Vestibaculum illigatum’ Stingl et al. 2004
Cytophaga fermentans Bachmann 1955
Marinifilum fragile Na et al. 2009
Sunxiuqinia elliptica Qu et al. 2011
Meniscus glaucopis Irgens 1977
Prolixibacter bellariavorans Holmes et al. 2007
Alkaliflexus imshenetskii Zhilina et al. 2005
Marinilabiliaceae 2 [meðt. Cytophaga xylanolytica]
Bacteroidaceae [meðt. Prevotellaceae]
Athugasemdir
♠ "Strains" sem fundin voru hjá National Center for Biotechnology Information, en voru ekki skráð hjá LPSN
♪ Prokaryotes þar sem engin hrein (axenic) ræktun var einangruð eða fáanleg, þ. e. ill- eða ó-ræktanleg.
Flokkurinn Bacteroidetes samanstendur af þremur stórum ættum Gram-neikvæðum bakteríum, ekki-sporamyndandi, loftháðum eða ekki loftháðum, og staflaga gerlum sem eru útbreiddir í umhverfinu, þar á meðal í jarðvegi, sjó og í og á dýrum.
Bacteroidetes – bakterijų (Bacteria) karalystės bakterijų tipas.
Šio tipo bakterijų yra dirvožemyje, nuosėdinėse uolienose, jūros vandenyje bei gyvūnų žarnynuose.
Sudaro trys plačiai aplinkoje paplitusios klasės:
Bacteroidetes – bakterijų (Bacteria) karalystės bakterijų tipas.
Šio tipo bakterijų yra dirvožemyje, nuosėdinėse uolienose, jūros vandenyje bei gyvūnų žarnynuose.
Bacteroidetes er en rekke som er sammensatt av tre store klasser av bakterier som lever i forskjellig miljø. Dette inkluderer jord, i avleiringer, sjøvann og i tarmsystemet hos dyr.
Så langt er Bacteroidetes den klassen som er best beskrevet, inkludert slekten Bacteroides og Porphyromonas.
Bacteroidetes er en rekke som er sammensatt av tre store klasser av bakterier som lever i forskjellig miljø. Dette inkluderer jord, i avleiringer, sjøvann og i tarmsystemet hos dyr.
Så langt er Bacteroidetes den klassen som er best beskrevet, inkludert slekten Bacteroides og Porphyromonas.
Bacteroidetes é um filo do reino Bacteria que engloba três grandes grupos, divididos em três classes, cada uma com uma única ordem
A classes de Bacteroidetes são todas relacionadas pela similaridade na composição de seus ribosomas. São bactérias vetoras de doenças diversas, como a colite, enterecolite, diverticulite. Que apesar de apresentarem certa similaridade em sua característica patogênica, causam males diferentes.
Outras sobrevivem em áreas termais nas profundezas do mar da Islândia, algumas vivem no solo, produzindo húmus, nas águas, ajudando a decomposição de elementos orgânicos.
Bacteroidetes é um filo do reino Bacteria que engloba três grandes grupos, divididos em três classes, cada uma com uma única ordem
Bacteroides Flavobactérias SphingobacteriasA classes de Bacteroidetes são todas relacionadas pela similaridade na composição de seus ribosomas. São bactérias vetoras de doenças diversas, como a colite, enterecolite, diverticulite. Que apesar de apresentarem certa similaridade em sua característica patogênica, causam males diferentes.
Outras sobrevivem em áreas termais nas profundezas do mar da Islândia, algumas vivem no solo, produzindo húmus, nas águas, ajudando a decomposição de elementos orgânicos.
Bacteroidetes este o încrengătură de bacterii Gram-negative. Speciile din acest filum sunt nesporulate, anaerobe sau aerobe, și prezintă formă de bacil. Sunt larg răspândite în mediul natural, inclusiv în sol, sedimente și apa de mare, dar se regăsesc și în interiorul sau la suprafața animalelor. Bacteroidetes spp. face parte, de exemplu, din microbiomul normal al placentei.[1][2]
Cele mai cunoscute specii sunt cele din clasa Bacteroidia, care include și genurile Bacteroides (reprezentanții acestui gen se regăsesc în excrementele animalelor cu sânge cald) și Porphyromonas (speciile regăsindu-se în cavitatea bucală).
Bacteroidetes este o încrengătură de bacterii Gram-negative. Speciile din acest filum sunt nesporulate, anaerobe sau aerobe, și prezintă formă de bacil. Sunt larg răspândite în mediul natural, inclusiv în sol, sedimente și apa de mare, dar se regăsesc și în interiorul sau la suprafața animalelor. Bacteroidetes spp. face parte, de exemplu, din microbiomul normal al placentei.
Cele mai cunoscute specii sunt cele din clasa Bacteroidia, care include și genurile Bacteroides (reprezentanții acestui gen se regăsesc în excrementele animalelor cu sânge cald) și Porphyromonas (speciile regăsindu-se în cavitatea bucală).
Bacteroidetes Krieg et al. 2012
Классы[1]Bacteroidetes (лат.) — тип грамотрицательных неспорообразующих анаэробных палочковидных бактерий, широко распространённых в окружающей среде, включая почву, ил, морскую воду, а также желудочно-кишечный тракт и кожу животных.
На настоящий момент наиболее изучены бактерии, принадлежащие к классу Bacteroidia, включающему род Bacteroides (организмы, многочисленные в экскрементах теплокровных животных, включая человека) и Porphyromonas (организмы, обитающие в ротовой полости человека).
Бактерии, входящие в род Bacteroides, являются оппортунистическими патогенами. Члены двух других классов редко являются причиной заболевания у человека.
Тип Bacteroidetes иногда группируют вместе с Chlorobi, Fibrobacteres, Gemmatimonadates, Caldithrix и Морской группой A в группу FCB или надтип[2]. По альтернативной системе классификации, предложенной Кавалир-Смитом, этот таксон помещается в класс типа Sphingobacteria.
Виды типов Bacteroidetes и Chlorobi располагаются очень близко на филогенетических деревьях, указывая на близкое родство. Используя сравнительный генетический анализ, были определены три белка, которые имеются только у типов Bacteroidetes и Chlorobi[2]. Также были обнаружены консервативные таксонспецифичные инделы, подтверждающие общее происхождение этих двух типов[2][3]. В дополнение к этому, было показано, что тип Fibrobacteres является родственным данным двум типам. Существование клады, состоящей из этих трёх типов хорошо подтверждается филогенетическим анализом, основанном на последовательности нескольких различных белков[3]. Эти типы ответвляются от филогенетического дерева примерно в одной и той же позиции[4]. И, наконец, наиболее весомыми доводами в пользу родственных связей являются два консервативных таксонспецифичных индела: в RpoC (бета-субъединице РНК полимеразы) и серин гидроксиметилтрансферазе, а также один специфичный белок PG00081, которые разделяют все бактерии из этих трёх типов[2][3].
На май 2015 года в тип Bacteroidetes включают следующие таксоны до семейства включительно[1]:
Сравнительный генетический анализ привёл к идентификации 27 белков, присутствующих у большинства организмов типа Bacteroidetes. Из них один белок был найден во всех секвестрированных геномах, в то время как ещё два — во всех, кроме бактерий рода Bacteroides. Отсутствие этих двух белков в данном роде скорее всего является результатом селективной потери[2]. Кроме того, были найдены ещё четыре белка, присутствующие во всех видах Bacteroidetes кроме Cytophaga hutchinsonii (опять-таки благодаря выборочной потере генов). Ещё восемь белков присутствуют во всех секвестрированных геномах sequenced Bacteroidetes кроме Salinibacter ruber. Отсутствие этих белков может быть связано либо, опять-таки, с выборочной потерей, либо, поскольку S. ruber ответвляется от остального родословного дерева группы очень рано, эти белки могли появиться уже после отделения S. ruber. Был также найден консервативный таксонспецифичный индел (вставка или делеция) («сonserved signature indel», CSIs) для этой группы бактерий: делеция трёх аминокислот в шапероне ClpB присутствует во всех видах типа Bacteroidetes, кроме S. ruber. Эта делеция также найдена в одном из видов Chlorobi и одном виде архей, по всей видимости попав туда в результате горизонтального переноса генов. Эти 27 белков и делеция трёх аминокислот служат молекулярными маркерами для Bacteroidetes[2].
Принятая на сегодняшний день таксономия основана на List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature[5] и данным Национального центра биотехнологической информации (NCBI)[6]. Филогения основана на анализе последовательностей 16S рРНК в 'The All-Species Living Tree' Project[7].
?Bifissio spartinae ♠ Xin & Zhou 2001
?‘Candidatus Amoebophilus asiaticus’Horn et al. 2001
?‘Candidatus Cardinium hertigii’ Zchori-Fein et al. 2004
?‘Candidatus Paenicardinium endonii’ Noel and Atibalentja 2006
?Toxothrix trichogenes ♪ (Cholodny 1924) Beger 1953
?Venteria marina ♠ Bae 2005
Bacteroidetes Order III incertae sedis [incl. Flexibacter species group 2]
Microscilla clade [incl. Flexibacter species group 3]
Flammeovirgaceae 2 [incl. Ekhidna lutea]
Fulvivirga-Reichenbachiella clade
Cesiribacter-Marivirga clade
Cyclobacteriaceae [incl. Litoribacter ruber & Rhodonellum psychrophilum]
Sphingobacteriaceae [incl. Flavobacterium mizutaii]
Cryomorphaceae 1 [incl. Schleiferia thermophila]
?‘Candidatus Sulcia muelleri’ Moran et al. 2005
?‘Candidatus Uzinura diaspidicola’ Gruwell et al. 2007
?‘Candidatus Armantifilum devescovinae’ Desai et al. 2010
?‘Candidatus Azobacteroides pseudotrichonymphae’
?‘Candidatus Symbiothrix dinenymphae’ Hongoh et al. 2007
?‘Candidatus Vestibaculum illigatum’ Stingl et al. 2004
Cytophaga fermentans Bachmann 1955
Marinifilum fragile Na et al. 2009
Sunxiuqinia elliptica Qu et al. 2011
Meniscus glaucopis Irgens 1977
Prolixibacter bellariavorans Holmes et al. 2007
Alkaliflexus imshenetskii Zhilina et al. 2005
Marinilabiliaceae 2 [incl. Cytophaga xylanolytica]
Bacteroidaceae [incl. Prevotellaceae]
Примечания к кладограмме:
♠ Штаммы найдены в Национальном центре биотехнологической информации, но не указаны в List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature
♪ Прокариоты, у которых не выделены чистые культуры, т. e. не культивированы или не могут быть поддержаны в культуре более чем несколько пересевов
Bacteroidetes (лат.) — тип грамотрицательных неспорообразующих анаэробных палочковидных бактерий, широко распространённых в окружающей среде, включая почву, ил, морскую воду, а также желудочно-кишечный тракт и кожу животных.
На настоящий момент наиболее изучены бактерии, принадлежащие к классу Bacteroidia, включающему род Bacteroides (организмы, многочисленные в экскрементах теплокровных животных, включая человека) и Porphyromonas (организмы, обитающие в ротовой полости человека).
Бактерии, входящие в род Bacteroides, являются оппортунистическими патогенами. Члены двух других классов редко являются причиной заболевания у человека.
擬桿菌門(Bacteroidetes)包括三大類細菌,即擬桿菌綱、黃桿菌綱、鞘脂桿菌綱。它們的相似性體現在核糖體16S RNA。
很多擬桿菌綱的細菌種類生活在人或者動物的腸道中,有些時候成爲病原菌。在糞便中,以細胞數目計,擬桿菌屬(Bacteroides)是主要微生物種類。
黃桿菌綱主要存在於水生環境中,也會在食物中存在。多數黃桿菌綱細菌對人無害,但腦膜膿毒性金黃桿菌(Chryseobacterium meningosepticum)可引起新生兒腦膜炎。黃桿菌綱還有一些嗜冷類群。
鞘脂桿菌綱重要類群爲噬胞菌屬(Cytophaga),在海洋細菌中佔有較大比例,可以降解纖維素。
擬桿菌門(Bacteroidetes)包括三大類細菌,即擬桿菌綱、黃桿菌綱、鞘脂桿菌綱。它們的相似性體現在核糖體16S RNA。
很多擬桿菌綱的細菌種類生活在人或者動物的腸道中,有些時候成爲病原菌。在糞便中,以細胞數目計,擬桿菌屬(Bacteroides)是主要微生物種類。
黃桿菌綱主要存在於水生環境中,也會在食物中存在。多數黃桿菌綱細菌對人無害,但腦膜膿毒性金黃桿菌(Chryseobacterium meningosepticum)可引起新生兒腦膜炎。黃桿菌綱還有一些嗜冷類群。
バクテロイデス門(-もん、Bacteroidetes)は、グラム陰性の細菌グループで、真正細菌の門の1つ。Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroidetes (CFB) グループとも呼ばれる。腸内細菌叢の主要な構成菌であり、海洋を中心とした水系、土壌などにも広く分布する。系統的に近縁なクロロビウム門と合わせ、Bacteroidetes/Chlorobi グループ(FCB群)と呼ばれることがある。
バクテロイデス門は、真正細菌としてはやや大きめの門であり、プロテオバクテリア門に次いで一般的なグラム陰性菌になる。バクテロイデス綱、フラボバクテリア綱、スフィンゴバクテリア綱の3綱に分類される場合が多い。2008年現在、3つの綱の合計で約60の属が含まれている。
多くは桿菌またはらせん菌の形をとり、タンパク質や糖類を基質にして従属栄養的に増殖する。細胞膜にスフィンゴ脂質を含むという特徴がある。バクテロイデス綱は嫌気性で、多くの動物の消化器官に分布し、ヒトの腸内細菌の中でも最も大きなグループを占めている。人に対して病原性を持つ種は少ないが、日和見感染症を引き起こすことがある。一方、フラボバクテリア綱、スフィンゴバクテリア綱は好気性菌が多く、水系、土壌から分離されることが多い。多くの種が黄色色素を産生する。
バクテロイデス門(-もん、Bacteroidetes)は、グラム陰性の細菌グループで、真正細菌の門の1つ。Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroidetes (CFB) グループとも呼ばれる。腸内細菌叢の主要な構成菌であり、海洋を中心とした水系、土壌などにも広く分布する。系統的に近縁なクロロビウム門と合わせ、Bacteroidetes/Chlorobi グループ(FCB群)と呼ばれることがある。
バクテロイデス門は、真正細菌としてはやや大きめの門であり、プロテオバクテリア門に次いで一般的なグラム陰性菌になる。バクテロイデス綱、フラボバクテリア綱、スフィンゴバクテリア綱の3綱に分類される場合が多い。2008年現在、3つの綱の合計で約60の属が含まれている。
多くは桿菌またはらせん菌の形をとり、タンパク質や糖類を基質にして従属栄養的に増殖する。細胞膜にスフィンゴ脂質を含むという特徴がある。バクテロイデス綱は嫌気性で、多くの動物の消化器官に分布し、ヒトの腸内細菌の中でも最も大きなグループを占めている。人に対して病原性を持つ種は少ないが、日和見感染症を引き起こすことがある。一方、フラボバクテリア綱、スフィンゴバクテリア綱は好気性菌が多く、水系、土壌から分離されることが多い。多くの種が黄色色素を産生する。
의간균류는 의간균문(Bacteroidetes)에 속하는 세균 문의 하나이다. 3개의 큰 세균 강으로 구성되어 있으며 토양과 침전물, 해수, 동물의 내장과 피부를 포함한 환경에 널리 분포한다.