Die Redondoviren (wissenschaftlich Redondoviridae) sind eine Familie von Viren, die bei metagemomischen Untersuchungen von DNA-Sequenzen aus (hauptsächlich) menschlichen Proben gefunden wurden, insbesondere im Zusammenhang mit Periodontitis und in den Lungen von Intensivpflegepatienten. Die Struktur (Morphologie) dieser Viren ist noch unbekannt, die Existenz der Redondoviren gilt bisher einzig aufgrund der molekularbiologischen Daten (den so genannten Contigs) als gesichert. Die Entdeckung erfolgte, indem 2017 und 2019 die bronchoalveoläre Lavage von zwei Empfängern einer Spenderlunge nach viralen Genomen durchsucht wurde.
Die Redondoviren werden aufgrund ihrer Genomstruktur zu den sogenannten CRESS-DNA-Viren (offiziell Cressdnaviricota) gestellt.[2]
In der Familie Redondoviridae gibt es nur eine vom ICTV bestätigte Gattung, Torbevirus. Diese wird in zwei Arten (Spezies) unterteilt, Brisavirus und Vientovirus.[2][3] Auf der Grundlage der viralen Genomstruktur wurden jeweils mehrere Stämme vorgeschlagen.
Beide Gattungen – und auch die Familie – sind nach spanischen Begriffen benannt worden: spanisch redondo bedeutet rund, was auf die (vermutete) zirkuläre Struktur ihres Genoms hinweist; brisa und viento sind spanische Ausdrücke für Brise bzw. Wind – die Viren wurden schließlich in den Atemwegen von Patienten gefunden.[2] Der Name Redondoviridae wurde von Arwa Abbas et al. 2019 vorgeschlagen[4] und vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) 2020 mit der Master Species List 2019.v1 (#35) bestätigt.[1][2]
Die Bezeichnung Cressdnaviricota (bzw. CRESS-DNA-Viren) erklärt sich mit ihrer einem zirkulären Erbgut (c von englisch circular), der Tatsache, dass ein Rep-Protein (r) kodiert (e von en. encoding) wird, und der Einzelstrang-DNA (ss von en. single stranded).[3][5]
Es ist nicht bekannt, ob die Viren überhaupt eine Krankheit auslösen. Allein aufgrund der Metagenomik kann nicht ohne weiteres geschlossen werden, ob der Mensch selbst Wirt eines (nur durch ein Contig identifizierten) mutmaßlichen Virus ist, oder vielleicht ein (wie die Darmbakterien) mit dem Menschen vergesellschafteter Einzeller.[6][7][8][3]
Einige andere der CRESS-DNA-Viren sind bekannte Krankheitserreger, wie das Porcine circovirus 2.[9]
Es wurde berichtet, dass Redondoviridae mit Parodontitis in Verbindung stehen. In einer Studie sanken die Werte bei erfolgreicher Behandlung.[3] Eine starkes Auftreten von Redondoviridae-Genomen wurde auch bei einigen Patienten auf der Intensivstation festgestellt. Die Grundlage dieser Krankheitsassoziationen ist noch unklar.[2][3]
Das Genom der Redondoviridae ist zirkulär und wie bei anderen CRESS-DNA-Viren wahrscheinlich einzelsträngig. Es hat eine Größe von etwa 3,0 bis 3,1 kb (Kilobasen) und kodiert für folgende drei vermuteten Proteine:[3]
Die ORFs sind durch intergenische Regionen getrennt, zudem vermutet man wie bei CRESS-DNA-Viren üblich eine Haarnadelstruktur (en. stem loop), wo Rep ansetzt. Diese ist über ein konserviertes Nonanukleotid mit dem Genom-Ring verbunden.[3]
Von den Redondoviren ist nur die Gattung Torbevirus bekannt mit zwei Arten.[1]
Die Redondoviren (wissenschaftlich Redondoviridae) sind eine Familie von Viren, die bei metagemomischen Untersuchungen von DNA-Sequenzen aus (hauptsächlich) menschlichen Proben gefunden wurden, insbesondere im Zusammenhang mit Periodontitis und in den Lungen von Intensivpflegepatienten. Die Struktur (Morphologie) dieser Viren ist noch unbekannt, die Existenz der Redondoviren gilt bisher einzig aufgrund der molekularbiologischen Daten (den so genannten Contigs) als gesichert. Die Entdeckung erfolgte, indem 2017 und 2019 die bronchoalveoläre Lavage von zwei Empfängern einer Spenderlunge nach viralen Genomen durchsucht wurde.
Die Redondoviren werden aufgrund ihrer Genomstruktur zu den sogenannten CRESS-DNA-Viren (offiziell Cressdnaviricota) gestellt.
In der Familie Redondoviridae gibt es nur eine vom ICTV bestätigte Gattung, Torbevirus. Diese wird in zwei Arten (Spezies) unterteilt, Brisavirus und Vientovirus. Auf der Grundlage der viralen Genomstruktur wurden jeweils mehrere Stämme vorgeschlagen.
Redondoviruses (members of the Redondoviridae) are a family of human-associated DNA viruses.[2] Their name derives from the inferred circular structure of the viral genome (“redondo” means round in Spanish). Redondoviruses have been identified in DNA sequence based surveys of samples from humans, primarily samples from the oral cavity and upper airway.[3][4][5]
Redondoviruses are assigned to a new family by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), the Redondoviridae.[1][5][6]
The family Redondoviridae is divided into two species, Brisavirus and Vientovirus.[1][5] The names derive from the words for breeze and wind in Spanish (“brisa” and “viento”), denoting the association with the human airway. Multiple strains have been proposed on the basis of viral genome structure.
The redondoviruses are members of the Circular Rep-Containing Single Stranded (CRESS) DNA Virus group.[7]
The redondovirus genome is circular, and by analogy to other CRESS viruses likely single stranded. Genomes range in size from about 3.0 to 3.1 kilobases. The genome encodes three inferred proteins:
Redondovirus genomes have been reported primarily from human samples surveyed using metagenomic DNA sequencing. They have been found primarily in oral and airway specimens.[4][5]In some human populations, oral samples can show up to 80% Redondovirus positivity.[10]
Analysis of a variety of human-derived sample types showed a strong positive correlation of Redondovirus DNA and DNA of the oral amoeba Entamoeba gingivalis. Follow up studies showed that a xenic culture containing Entamoeba gingivalis and feeder bacteria was also positive for redondovirus DNA and RNA. Analysis using intracellular cross linking (Hi-C) showed crosslinking of redondovirus DNA to Entamoeba DNA, supporting Entamoeba gingivalis as the host.[11][12]
It is unknown whether redondoviruses cause human disease. Some CRESS viruses are known pathogens, such as porcine circovirus type 2[13]
Redondoviruses have been reported associated with periodontitis. In one study, the levels fell with successful treatment.[5] Abundance of redondovirus genomes has also been found to be high in some intensive care unit patients, and in patients with severe COVID-19.[14] At present the basis of these disease associations is unclear.[1][5]
{{cite web}}: CS1 maint: multiple names: authors list (link) Redondoviruses (members of the Redondoviridae) are a family of human-associated DNA viruses. Their name derives from the inferred circular structure of the viral genome (“redondo” means round in Spanish). Redondoviruses have been identified in DNA sequence based surveys of samples from humans, primarily samples from the oral cavity and upper airway.
Redondoviridae genome map
Los redondovirus (miembros de Redondoviridae ) son una familia de virus de ADN asociados a humanos.[1] Su nombre deriva de la estructura circular inferida del genoma viral. Los redondovirus han sido identificados en estudios basados en la secuencia de ADN de muestras de seres humanos, principalmente muestras de la cavidad oral y de las vías respiratorias superiores.[2][3][4]
El Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) ha asignado los redondovirus a una nueva familia, los Redondovirus. [5] [4] [6]
La familia Redondoviridae se divide en dos especies, Brisavirus y Vientovirus.[5][4] Los nombres derivan de las palabras para brisa y viento en español ("brisa" y "viento"), denotando la asociación con las vías respiratorias humanas. Se han propuesto múltiples cepas sobre la base de la estructura del genoma viral.
Los redondovirus son miembros del grupo de los virus de ADN de cadena simple con contenido circular (CRESS). [7]
El genoma del redondovirus es circular y, por analogía con otros virus CRESS, es probable que sea monocatenario. Los genomas varían en tamaño desde aproximadamente 3,0 a 3,1 kilobases. El genoma codifica tres proteínas inferidas:
Los genomas de los redondovirus se han notificado principalmente a partir de muestras humanas estudiadas mediante la secuenciación del ADN metagenómico. Se han encontrado principalmente en muestras orales y de las vías respiratorias. [3] [4]
Se desconoce si los redondovirus causan enfermedades en humanos. Algunos virus CRESS son patógenos conocidos, como el circovirus porcino tipo 2 [10]
Los redondovirus se han asociado a la periodontitis. En un estudio, los niveles disminuyeron con el éxito del tratamiento.[4] También se ha descubierto que la abundancia de genomas de redondovirus es elevada en algunos pacientes de unidades de cuidados intensivos. En la actualidad, la base de estas asociaciones de enfermedades no está clara [5] [4]
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Datos: Q85796392
Los redondovirus (miembros de Redondoviridae ) son una familia de virus de ADN asociados a humanos. Su nombre deriva de la estructura circular inferida del genoma viral. Los redondovirus han sido identificados en estudios basados en la secuencia de ADN de muestras de seres humanos, principalmente muestras de la cavidad oral y de las vías respiratorias superiores.
