dcsimg
Image of Picornavirus

Picornavirus

Picornaviridae

Picornavirus ( Catalan; Valencian )

provided by wikipedia CA

Un picornavirus és un virus que pertany a la família Picornaviridae. Els picornavirus són virus sense embolcall, amb ARN de banda positiva i una càpside icosaèdrica. El genoma de l'ARN és inusual perquè té una proteïna en el 5è extrem que es fa servir d'encebador per a la transcripció genètica per la polimerasa de l'ARN.

El nom deriva de pico-, que significa petit, i d'ARN referit al genoma de l'àcid ribonucleic, per tant "picornavirus" literalment significa petit virus d'ARN.

Els Picornavirus estan separats en 12 gèneres i inclouen importants patògens humans i de la resta dels animals.[1] Les malalties que causess són variades, anant des del refredat comú fins a la poliomielitis, o a infeccions cròniques en els animals de granja.

Classificació

Sota la classificació de Baltimore es troben en el grup IV.

Virus Ljungan Gèneres de picornavirus, Espècies i Serotips i Serotips gènere espècies (* significa espècie tipus) serotips Enterovirus Enterovirus boví 2 tipus: (BEV) 1-2 Enterovirus humà A 21 tipus, incloent-hi coxsackivirus A i enteroviruss Enterovirus humà B 59 tipus, incloent, coxsackivirus B viruses, echovirus, i virus vesiculars porcí Human enterovirus C * 19 tipus incloent poliovirus (PV) 1-3, alguns coxsackivirus A i enterovirus Enterovirus humà D 3 tipus: EV-68, EV-70, EV-94 Enterovirus B porcí 2 tipus: (PEV) 9-10 Enterovirus A dels simis 1 tipus: (SEV) A1 Rhinovirus humà A * 75 tipus Rhinovirus humà B 25 tipus Rhinovirus humà C 7+ tipus Cardiovirus Virus de l'Encephalomyocarditis * 1 tipus: (EMCV). Nota: els virus Columbia SK, Maus Elberfeld i Mengovirus són soques d’EMCV. Theilovirus 12 tipus:TMEV, VHEV, TRV, SAFV 1-9 Aphthovirus Virus de la glosopeda [2] * 7 tipus: O, A, C, Sud-àfrica (SAT 1, SAT 2, SAT 3) i Àsia 1 Virus de la rinitis equina 1 tipus: ERAV Rinitis B dels bovins 1 tipus: BRBV Hepatovirus Virus de l'Hepatitis A * 1 tipus: HAV Parechovirus Parecovirus humà * 14 tipus: (HPeV) 1-14 4 tipus: (LV) 1-4 Erbovirus Virus de la rinitis equina B * 3 tipus: (ERBV) 1-3 Kobuvirus Aichi virus * 1 tipus: Aichi virus (AiV) Kobovirus boví 1 tipus: (BKV) Teschovirus Teschovirus porcí * 11 serotips: (PTV) 1 a 11 Sapelovirus Sapelovirus porcí * (abans Enterovirus porcí A) 1 tipus: (PSV) (abans PEV-8) Sapelovirus dels simis 3 tipus: (SSV) 1-3 Sapelovirus de les aus 1 tipus: (ASV) Senecavirus Virus de la vall Seneca * 1 tipus: (SVV) Tremovirus Virus de l’encefalomielitis de les aus 1 tipus: (AEV) Avihepatovirus Virus de l’hepatitis A de l'ànec 3 tipus (DHAV) 1-3 Fonts:

Els enterovirus infecten el tracte entèric del cos, com queda reflectit en el seu nom. Els enterovirus repliquen a 37°C, mentre que els rinovirus creixen millor als 33°C de temperatura que hi ha al nas. Els enterovirus sobreviuen a les condicions àcides. En canvi, els rinovirus queden destruïts per les condicions àcides; per això la seva infecció queda restringida al nas i la gola.

Picornavirus de les plantes

Els virus de les plantes tenen una sèrie de propietats diferents de les que tenen els virus que infecten els animals. S’han classificat dins la família Secoviridae contenint la subfamília Comovirinae (gèneres Comovirus, Fabavirus i Nepovirus), i gèneres Sequivirus, Waikavirus, Cheravirus, Sadwavirus i Torradovirus (espècie tipus Tomato torrado virus).

Referències

  1. Mettenleiter TC and Sobrino F (editors).. Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press, 2008. [1] ISBN 978-1-904455-22-6.
  2. Martinez-Salas et al.. «Foot-and-Mouth Disease Virus». A: Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press, 2008. [2] ISBN 978-1-904455-22-6.

Enllaços externs

 src= A Wikimedia Commons hi ha contingut multimèdia relatiu a: Picornavirus Modifica l'enllaç a Wikidata
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autors i editors de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia CA

Picornavirus: Brief Summary ( Catalan; Valencian )

provided by wikipedia CA

Un picornavirus és un virus que pertany a la família Picornaviridae. Els picornavirus són virus sense embolcall, amb ARN de banda positiva i una càpside icosaèdrica. El genoma de l'ARN és inusual perquè té una proteïna en el 5è extrem que es fa servir d'encebador per a la transcripció genètica per la polimerasa de l'ARN.

El nom deriva de pico-, que significa petit, i d'ARN referit al genoma de l'àcid ribonucleic, per tant "picornavirus" literalment significa petit virus d'ARN.

Els Picornavirus estan separats en 12 gèneres i inclouen importants patògens humans i de la resta dels animals. Les malalties que causess són variades, anant des del refredat comú fins a la poliomielitis, o a infeccions cròniques en els animals de granja.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autors i editors de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia CA

Picornaviridae ( Czech )

provided by wikipedia CZ
ikona
Tento článek není dostatečně ozdrojován a může tedy obsahovat informace, které je třeba ověřit.
Jste-li s popisovaným předmětem seznámeni, pomozte doložit uvedená tvrzení doplněním referencí na věrohodné zdroje.

Picornaviridae je čeleď malých neobalených RNA virů, zahrnující několik významných rodů. Název čeledi je odvozen od slov pico (velmi malý) a RNA, tedy malé RNA viry.

Virologie

 src=
Příklad osmi vlákenného beta barelu.

Morfologie

Virion picornavirů se skládá z proteinů VP1, VP2, VP3 a VP4, který je ovšem schován uvnitř kapsidu. Triangulační číslo je proto rovno 3. VP1-3 nemají sekvenční homologii, naproti tomu mají stejnou topologii - osmi vlákenný antiparalelní beta barel (jinak také želé váleček nebo Švýcarský váleček). Tato struktura byla nalezena i v rostlinných virech, což poukazuje na to, že beta barel je jedna z možností, jak dovolit proteinu vytvořit sféru. Pětice proteinů VP1 tvoří pěticípou hvězdici, která je od proteinů VP2 a 3 oddělena prohlubní. Ne všechny picornaviry však tuto prohlubeň mají. Tato prohlubeň je zároveň moc úzká na to, aby vázala protilátky VP1 a VP3 tvoří v kapsidu síť, která je posilněna VP4, a která je esenciální pro stabilitu kapsidu. Stabilita proteinu je také posilněna přítomností zabalené RNA. Další element stabilizující celou strukturu je přítomnost lipidu sfingosinu v hydrofobní kapse kapsidu. Pro rozpad schránky se musí virus tohoto lipidu zbavit, což dokazují experimenty, kdy byl nahrazen lékem WIN, který je v hydrofobní kapse velice stabilní a nemůže být proto odstraněn, což vede k inhibici rozpadu schránky. Některé viry, například rhinoviry, však mají tuto schránku prázdnou. Na glycinu proteinu VP4 je kovalentně vázána kyselina myristová. Po navázání virionu na receptor je tato kyselina vystrčena ven.

Genom

Charakteristika

Genom picornavirů je jediná RNA s pozitivní polaritou o délce 7,1-8,9 kb, která je infekční (sama stačí k infikování hostitelské buňky). Je polyadenylovaný, avšak na jeho 5' konci není guaninová čepička. Namísto toho se zde nachází VPg, který je kovalentně spojen s RNA přes tyrosin. Na 5' konci se též nachází dlouhá (624-1199) nepřekládaná oblast, která obsahuje vnitřní ribozomální vstupní místo (IRES). těchto IRES je několik tříd, přičemž I-III je součástí genomu picornavirů. Třída IV je obsažena ve viru žloutenky typu C a V je v genomu Dicistroviridae Tato oblast obsahuje poly(C) sekvence, které jsou u různých druhů různě dlouhé. V případě cardiovirů se jedná o 80 až 250 nukleotidů dlouhý úsek, jehož délka koreluje s infekčností těchto virů. 3' koncová část je dlouhá 47 až 125 bází a rovněž obsahuje sekundární strukturu, v níž je pseudoknot, který zodpovídá za kontrolu RNA syntézy. Genom obsahuje pouze jeden ORF, kterým je translatován jediný dlouhý polypeptid, který je následně sestřižen virálními proteinázami. Tato strategie se vyskytuje u všech picornavirů.

Pokusy s převedením RNA do dsDNA ukázaly, že tato DNA vyžaduje menší koncentraci než RNA ke spuštění infekce.

Diverzita

Všechny RNA viry se ve svých hostitelích vyskytují v kvazidruzích, což je soubor podobných, ale ne zcela identických druhů. Je to způsobeno absencí kontrolní aktivity RNA polymerázy. Dochází tak zařazení jednoho chybného nukleotidu na 103 až 104 správně zařazených. Viry se tak nacházejí na prahu katastrofální chyby, kdy dojde k vyhlazení celé populace RNA virů. Studie naznačují, že každý nově replikovaný genom se liší dvěma nukleotidy od svého rodičovského. Liší-li se však v 15 nukleotidech (indukováno ribavirinem), sníží se infekčnost o pět řádů. Pokud se ovšem mutační rychlost sníží, mají viry problém s replikací v hostiteli. RNA viry se tedy nalézají mezi Scylou a Charibdou, kdy větší změny v jejich strategii může znamenat absolutní katastrofu.

Dalším způsobem, jak měnit svůj genom je rekombinace. Dochází k ní, je-li buňka napadena viry s dostatečně homologním genomem. Například frekvence rekombinace mezi dvěma genomy Polioviru sérotypu 1 je 100× větší než mezi genomy Polioviru 1 a 2.

Proteom

Proteiny picornavirů jsou translatovány jako jeden dlouhý polyprotein, který je následně autokataliticky rozštěpen proteinázami v tomto polyproteinu. Vznikají tak 3 proteiny, P1, P2 a P3, které jsou nadále štěpeny. Z P1 vznikají postupně V1, V3 a V0, z nějž následně vznikne V2 a V4. Toto štěpení probíhá až v uzavřeném kapsidu, má se tedy za to, že k rozštěpení dochází katalýzou RNA a konzervovaným histidinem v přechodu mezi V2 a V4. Z P2 vznikají proteiny 2A-C a z P3 proteiny 3A-3D.

2A

Protein 2A je nezbytný pro proteolitické štěpení polyproteinu a pro replikaci. Stimuluje syntézu negativního řetězce, ne však pozitivního řetězce. Není známo, jak toho tento protein docílí, je však možné, že proteoliticky upraví buněčný protein, který je nezbytný pro syntézu negativního řetězce. Štěpí eIF4G na eIF4GI a eIF4GII, Pabp a srdeční protein dystrofin. Jde o jeden z induktorů apoptózy.

2B

2B je malý hydrofobní protein nezbytný v prvních krocích syntézy RNA. Bývá nazýván jako viroporin, protože v membránách oligomerizuje a vytváří kanály, jejichž význam však dosud není objasněn. Inhibuje však sekreci proteinů v Golgiho aparátu a permeabilizuje membránu, což může hrát roli v uvolnění viru z buňky. Je také částečně zodpovědný za zvesikulování membrán, kde dochází k replikaci virů. Stejný efekt má však i protein 3A. Jde o jeden z inhibitorů apoptózy.

2C

Tento protein má silně konzervovaná místa pro navázání membrány, RNA a NTP, což naznačuje, že se skládá ze tří domén, kdy na N a C konci jsou alifatické alfa-helixy, které interagují s membránou a střední doménu vázající NTP. Izolace mutantů rezistentních vůči guanidin hydrochloridu, který blokuje virovou replikaci zabráněním iniciace syntézy negativního řetězce (nemá však vliv na iniciaci syntézy pozitivního řetězce nebo elongaci obou) inhibicí NTPázové aktivity ukázaly, že je za tuto rezistenci zodpovědný právě protein 2C. 2C má sekvenční homologii se známými helikázami, v čisté formě však tuto funkci nemá. Syntéza tohoto proteinu má za následek rozpad Golgiho aparátu a endoplasmatického retikula, čímž se zformují váčky, které jsou však nepodobné těm, na kterých probíhá virální replikace. Jde o jeden z induktorů apoptózy.

2BC

Většina 2BC, který je prekurzor 2B a 2C, zůstává během infekce nesestřižen, přičemž jeho přítomnost je nezbytná pro replikaci. Syntéza 2BC způsobí zvýšení permeability membrány mnohem více než přítomnost 2B, což vede k vytvoření vesikulů podobnějším těm replikačním více, než jaké vytváří 2C.

3A

Silně hydrofobní část C konce proteinu 3A zaručuje jak jemu, tak jeho prekurzoru 3AB asociaci s membránou. Změny v záběru hostitelů jsou vysvětleny změnami v 3A. 3A je homodimer, jehož potřeba dimerizovat není plně vysvětlena. Jde o jeden z inhibitorů apoptózy.

3B

Protein 3B, také známý jako VPg (viral protein, genus linked), slouží jako proteinový primer kovalentně spojený s polyU počátkem RNA přes tyrozin. Má délku 22-24 aminokyselin, zmíněný tyrozin je ale vždy 3 od N konce. Není důležitý pro infekčnost RNA, je však esenciální pro replikaci.

3AB

Tento protein slouží jako kotva v membráně pro první krok replikace. Čistý protein zesiluje účinky proteinu 3D, replikázy. Mutace v 3D v místech, kde dochází k interakci s 3AB naruší syntézu RNA. Komplex 3AB a 3CD se váže na 3'-terminální sekvenci RNA polioviru.

3C

Protein 3C je proteináza , která se sama vyštípe z P3, následně vyštěpuje další proteiny z polyproteinu. Její další funkcí je rozštěpení TFIID, TFIIC, TFIIIC, SL-1 (selectivity factor) a UBF (upstream binding factor) čímž dojde k inhibici transkripce všech tří eukaryotických polymeráz. k tomu však dochází v jádře buňky. 3C musí být pro svoji absenci NLS (jaderný lokalizační signál) do jádra přenesen společně s 3D, který tuto sekvenci má, v prekurzoru 3CD. Jde o jeden z induktorů apoptózy.

3D

Jedná se o RNA dependentní RNA polymerázu, která zahájí svoji aktivitu po rozštěpení prekurzoru 3CD. Jako většina takovýchto polymeráz, postrádá opravnou funkci, což vysvětluje obrovskou variabilitu RNA virů. Její sekvence je analogická ostatním polymerázám, ale pro svoji aktivitu vyžaduje EF-Tu, EF-Ts a ribozomální protein S1.

Životní cyklus

Receptory a koreceptory

Pro vstup do buněk slouží picornavirům IG-like receptory, jako CD55, jinak také známý jako PVR (poliovirus receptor) nebo ICAM-1 v případě rhinovirů. CD55 je zároveň s CD226 a CD96 součástí receptorů rozeznávaných NK-buňkami a slouží i jako receptor pro alphaherpesvirinae. Naproti tomu CD44 není virový receptor, ale protilátky vázající se na CD44 způsobí, že dojde ke stérickému zabránění polioviru na blízký CD55.

Některé viry vyžadují přítomnost koreceptorů. Například coxsackievir A21 vyžadují přítomnost jak CD55, tak ICAM-1. Role koreceptorů se dá vysvětlit na coxsackieviru B, který napadá polarizované epiteliální buňky skrze CAR (coxsackievirus and adenovirus receptor), který je však součástí těsných spojů buňky. Naváže se proto na CD55, čímž aktivuje Abl kinázu, která vede k Rac-dependentní aktinovému přeuspořádání, což vede k přesunu viru do těsných spojů, kde se naváže na CAR.

Jelikož RNA viry vytváří velké množství mutantů, mnohokrát pasážované druhy mohou za jistých podmínek vyměnit afinitu k jednomu receptoru za druhý, přičemž ztrácejí schopnost vázat původní.

Vstup do buňky

Po navázání na receptor dojde k řadě konformačních změn. Jedna z hypotéz vysvětluje vznik takzvané A částice. N konce VP1, které jsou normálně přítomny uvnitř kapsidu jsou vystrčeny do hostitelské membrány, přičemž pentamer VP1 vytvoří pór pro RNA, která tak může vniknout do buňky. Není známo, zda virus proniká plasmatickou membránou, nebo endozomem, protože látky blokující transport protonů do váčků nezpomalují replikaci na rozdíl od virů chřipky či Semliki Forest virus, stejně jako inhibice tvoření klatrinových váčků (výjimka je rhinovirus 16).

Například FMDV je však vybaven na vstup do buňky endozomální cestou. Navázání nenavozuje konformační změnu, avšak pentamer VP1 je obklopen histidinovými zbytky, jejichž pKa je 6,8. Když pH v endozomech klesna na 6,5, dojde z rozpadu kapsidu a vypuštění RNA.

Translace

Po vstupu viru do buňky dojde k odštěpení VPg buněčným odpojovacím enzymem. Poté se IRES naváže na 40S ribozomální podjednotku buďto přímo, anebo za pomocí buněčných komponent. Patří mezi ně eIF3, eIF4A, eIF4E a eIF4G. Po translaci 2A, který má proteázovou aktivitu je rozštěpen eIF4G s navázaným eIF4E, čímž dojde k zastavení translace buněčné mRNA, která vyžaduje oba tyto faktory díky jejich schopnosti rozeznat čepičku a vytvořit s ní iniciační komplex. Translace buněčné mRNA se snižuje, zatímco translace virové RNA se zvyšuje. Po vystřižení 3C z polyproteinu je zastavena i buněčná transkripce. Genomy některých virů obsahují vedoucí L sekvenci, která kóduje L protein, který má proteázovou aktivitu.

V průběhu infekce je zničen jako Golgiho aparát, tak endoplasmatické retikulum, aby byly vytvořeny váčky, na kterých probíhá replikace.

Replikace a translace na jednom vlákně nemůže probíhat souběžně. Zůstává však záhadou, jaký kontrolní mechanismus přepíná mezi translací a replikací. Nejnovější poznatky poukazují na hlavní úlohu replikázy. Někdy ovšem dojde ke kolizi, jak je doloženo díky mutantům, kteří ve svém genomu obsahují nukleotidů rRNA. při replikaci přeskočila replikáza na ribozom, kde část rRNA zkopírovala a poté přeskočila zpátky na templát.

Změny hostitelské buňky

jak bylo zmíněno dříve, dochází ke štěpení eIF4G. není to však jediná cesta, jak vyřadit translaci buněčné mRNA. Další způsob je defosforylace 4E-BP1, kdy tento protein projde konformační změnou dovolujícímu navázat se na eIF4E, čímž se mu zabrání v navázání na eIF4G. Po opětovné fosforylaci 4E-BP1 dojde ke zpětné konformační změně a eIF4F je opět uvolněn.

Dochází též k inhibici transportu proteinů do jádra. Při infekci je řada jaderných proteinů potřebných v cytoplasmě, a proto je potřeba tento dopravní systém vyřadit z činnosti.

Proteiny 2B, 2BC blokují Golgiho aparát a 3A blokuje ER, čímž kompletně blokují sekretorické dráhy, čímž se zabrání sekreci cytokinů a MHC.

Buňka po infekci začne projevovat známky cytopathického efektu. V mnoha případech je velmi podobný apoptóze (shromažďování chromatinu, změny permeability membrán, vysychání buňky atd.).

Odkazy

Literatura

Fields Virology 5th Edition

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedia autoři a editory
original
visit source
partner site
wikipedia CZ

Picornaviridae: Brief Summary ( Czech )

provided by wikipedia CZ
ikona Tento článek není dostatečně ozdrojován a může tedy obsahovat informace, které je třeba ověřit.
Jste-li s popisovaným předmětem seznámeni, pomozte doložit uvedená tvrzení doplněním referencí na věrohodné zdroje.

Picornaviridae je čeleď malých neobalených RNA virů, zahrnující několik významných rodů. Název čeledi je odvozen od slov pico (velmi malý) a RNA, tedy malé RNA viry.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedia autoři a editory
original
visit source
partner site
wikipedia CZ

Picornaviridae ( German )

provided by wikipedia DE

Die Familie der Picornaviren (Picornaviridae) umfasst unbehüllte Viren mit einer einzelsträngigen, linearen RNA mit positiver Polarität als Genom. Die Viren dieser Familie gehören mit einer Größe von 22 bis 30 nm zu den kleinsten Viren, was zur Namensgebung pico (lat. für sehr klein) und rna für das Genom führte.[2]

Picornaviren kommen bei einer Vielzahl von Wirbeltieren vor und verursachen sehr unterschiedliche Erkrankungen, z. B. eine harmlose Erkältung, Durchfallerkrankungen, Schleimhautentzündungen oder Infektionen des Zentralnervensystems. Die zahlreichen Arten der Picornaviren werden typischerweise in viele Subtypen unterteilt, da sie sich durch eine große Oberflächenvarianz und die damit einhergehende antigenetische Variabilität auszeichnen; bislang wurden ca. 370 Typen klassifiziert. Wichtige Vertreter der Picornaviridae sind beispielsweise beim Menschen das Hepatitis-A-Virus, in der Gattung Enterovirus das Poliovirus, die Rhinoviren (häufigste Erreger von Erkältungskrankheiten) und die Coxsackie-Viren, bei Tieren das Maul-und-Klauenseuche-Virus.

Morphologie

Die Virionen (Viruspartikel) der Picornaviridae haben eine runde Gestalt und sind etwa 22–30 nm im Durchmesser groß. Sie bestehen aus einem unbehüllten, ikosaedrischen Kapsid, das aus vier Virusproteinen VP1, VP2, VP3 und VP4 aufgebaut ist. Bei einigen Virusspezies ist noch ein Vorläuferprotein VP0 in geringen Mengen im Kapsid enthalten, aus dem während der Reifung der Partikel durch proteolytische Spaltung die Proteine VP2 und VP4 entstehen. Die vier Strukturproteine VP1-4 bilden zusammen ein Kapsomer, bei dem das VP4 die innere Kapsidseite auskleidet und über seine positiv geladenen Aminosäurereste mit der viralen RNA assoziiert ist. In einem Picornavirus-Kapsid lagern sich 60 Kapsomere zu einem Ikosaeder (T=1) zusammen. Die Oberfläche des Virions wird nur von den drei Proteinen VP1-3 gebildet, so dass nur diese für die antigenetischen Eigenschaften und die Einteilung in Serotypen verantwortlich sind.

Die Picornaviren sind aufgrund der Abwesenheit einer Virushülle sehr stabil gegenüber Alkoholen (Ethanol, 2-Propanol) und milden Detergenzien (Seife). Die Spezies der Gattungen Enterovirus und Hepatovirus sind darüber hinaus auch in Gegenwart starker Detergentien und längere Zeit bei pH-Werten unter 3,0 stabil, was ihnen eine außergewöhnliche Umweltresistenz verleiht. Aufgrund dieser Säurestabilität werden die Viren dieser beiden Gattungen auch durch das saure Milieu im Magen nicht inaktiviert;[2] daher geht der Infektionsweg dieser Viren überwiegend über den Verdauungstrakt, von dem aus sie auch weitere Zielorgane (ZNS, Lunge) erreichen können. Dafür sind Enteroviren empfindlich gegenüber Austrocknen sowie mäßigem Erhitzen (50 °C).[2] Alle anderen säurelabilen Picornaviren infizieren durch Tröpfchen- und Schmierinfektion bevorzugt den Nasen-Rachen-Raum. Rhinoviren sind empfindlicher; sie sind nur bei einem pH-Wert von 6,0-7,5 stabil und äußerst temperaturempfindlich.[2]

Das virale Genom besteht aus einer einzelsträngigen RNA mit positiver Polarität. Die Länge der RNA variiert zwischen den Gattungen von 7,2 (Rhinoviren) bis 8,5 (Aphthovirus) kB. Zwischen zwei nichtcodierenden Bereichen am 3'- und 5'-Ende liegt ein einziger offener Leserahmen (ORF) für ein virales Vorläufer-Polyprotein, das noch während der Translation in einzelne Virusproteine gespalten wird. Am 3'-Ende befindet sich ein für positivsträngige RNA-Viren typischer poly-A-Schwanz. Der RNA-Abschnitt am 5'-Ende vor dem Startcodon ist durch zahlreiche Basenpaarungen innerhalb des RNA-Moleküls zu einer komplexen Sekundärstruktur gefaltet, die funktionell die Aktivität einer IRES (internal ribosomal entry site) zeigt. Diese Struktur dient der Initiation der Translation an den Ribosomen und wurde erstmals bei Picornaviren beschrieben.

Systematik

Die folgende Systematik entspricht dem ICTV-Stand vom März 2020,[1][3] ergänzt um die vorgeschlagene Einteilung in sog. Supergruppen (im Rang von Unterfamilien) und weitere vorgeschlagene Gattungen (in Anführungszeichen).[4] Es ist nur eine Auswahl der Spezies angegeben. Im März 2021 hat das ICTV die Supergruppen als Unterfamilien anerkannt.[5]

  • Familie Picornaviridae
  • Unterfamilie Caphthovirinae (ehemals „Supergruppe 1“)
  • Spezies Cardiovirus A (mit Encephalomyocarditis virus = ECM-Virus, Mengovirus)
  • Spezies Cardiovirus B (mit Theiler's murine encephalomyeltits virus = TMEV, Theilovirus)
  • Spezies Cardiovirus C (mit Boone Cardiovirus = BCV)
  • Unterfamilie Kodimesavirinae (ehemals „Supergruppe 2“)
  • Spezies Gallivirus A (mit Truthahn-Gallivirus alias Turkey gallivirus)
  • Spezies „Hühner-Gallivirus 1“ alias „Chicken gallivirus 1[10]
  • Spezies „Gallivirus Pf-CHK1/GV
  • Spezies „Red-necked stint gallivirus
  • Genus Hemipivirus
  • Genus Kobuvirus[11][8]
  • Spezies Aichivirus A
  • Spezies Aichivirus B
  • Spezies Aichivirus C
  • Spezies Aichivirus D
  • Spezies Aichivirus E
  • Spezies Aichivirus F
  • Spezies Megrivirus A (mit Gänse-Megrivirus alias Goose megrivirus)
  • Spezies Megrivirus B (mit Picornavirus HK21)
  • Spezies Megrivirus C
  • Spezies Megrivirus D
  • Spezies Megrivirus E (mit Pinguin-Megrivirus alias Penguin megrivirus)
  • Spezies Truthahn-Hepatitis-Virus|Melegrivirus A alias Truthahn-Hepatitis-Virus (Turkey hepatitis virus 0091.1; Turkey hepatitis virus 2993D)
  • Spezies „Avocet megrivirus
  • Spezies „Hühner-Megrivirus“ (alias „Chicken megrivirus“)
  • Spezies „Enten-Megrivirus“ 8alias „Duck megrivirus“)
  • Spezies „Pacific black duck megrivirus
  • Spezies „Pink-eared duck megrivirus
  • Spezies „Red-capped plover megrivirus
  • Spezies „Truthahn-Megrivirus“ (alias „Turkey megrivirus“)
  • Genus Myrropivirus
  • Genus Oscivirus,[13]
  • Spezies Oscivirus A (mit Oscivirus A1, früher „Turdivirus 2“; Oscivirus A2, früher „Turdivirus 3“[10])
  • Genus Passerivirus[14]
  • Spezies Passerivirus A (mit Passerivirus A1, früher „Turdivirus 1[10])
  • Spezies Pygoscepivirus A, früher „Pingu picornavirus“ (gefunden bei Eselspinguinen (Pygoscelis papua)[10]
  • Spezies Rafivirus A (mit Tortoise Rafivirus A)[10]
  • Spezies Rafivirus B
  • Spezies Rafivirus C (mit Hainan gekko similignum picornavirus)
  • Spezies Rosavirus A (mit Rosavirus A1 mit Rosavirus M-7; Rosavirus A2)
  • Spezies Rosavirus B (mit Norway rat rosavirus)
  • Spezies Rosavirus C
  • Spezies Sakobuvirus A (mit Feline sakobuvirus A)
  • Spezies Salivirus A (mit Human klassevirus 1, Salivirus A SZ1, Salivirus CH, 1, Salivirus NG-F1, Salivirus NG-J1, Salivirus SH1)
  • Spezies Sicinivirus A (mit Sicinivirus Pf-CHK1/SiV)
  • Spezies Tropivirus A
  • Spezies Tropivirus B
  • Unterfamilie Ensavirinae (ehemals „Supergruppe 3“)
  • Unterfamilie Paavivirinae (ehemals „Supergruppe 4“)
  • Unterfamilie Heptrevirinae (ehemals „Supergruppe 5“)
  • „Supergruppe 6“ (noch ohne ICTV-anerkannten Familienstatus)
  • Spezies Harkavirus A
  • ohne zugeordnete Familie oder Supergruppe
  • Spezies Ampivirus A
  • Spezies Chironomus riparius virus 1
  • Spezies Hubei chipolycivirus
  • Spezies Hubei hupolycivirus
  • Spezies Formica exsecta virus 3
  • Spezies Lasius neglectus virus 1
  • Spezies Lasius neglectus virus 2
  • Spezies Lasius niger virus 1
  • Spezies Linepithema humile virus 2
  • Spezies Monomorium pharaonis virus 1
  • Spezies Monomorium pharaonis virus 2
  • Spezies Myrmica scabrinodis virus 1
  • Spezies Shuangao insect virus 8
  • Spezies Solenopsis invicta virus 2
  • Spezies Solenopsis invicta virus 4

Die Familie Picornaviridae teilt sehr viele Eigenschaften wie beispielsweise die Kapsidarchitektur, die Genomorganisation und phylogenetisch sehr ähnliche virale Proteine mit anderen Virusfamilien. Die Gesamtheit dieser ähnlichen Virusgruppen hat man als Picornavirus-Supergruppe bezeichnet. Aus dieser Gruppe ist inzwischen die Virusordnung Picornavirales der Picornaviridae hervorgegangen.[29][1]

Quellen

  1. a b c d e ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. a b c d Albert Heim: Picornaviren. In: Sebastian Suerbaum, Gerd-Dieter Burchard, Stefan H. E. Kaufmann, Thomas F. Schulz (Hrsg.): Medizinische Mikrobiologie und Infektiologie. Springer-Verlag, 2016, ISBN 978-3-662-48678-8, S. 457–458, doi:10.1007/978-3-662-48678-8_55.
  3. ViralZone: ICTV 2016 Master Species List #31 with Acronyms, (Excel XLSX), SIB Swiss Institute of Bioinformatics
  4. Genus supergroups, The Picornavirus Pages (2006–2019), The Pirbright Institute, UK
  5. ICTV: ICTV Master Species List 2021.v1, New MSL including all taxa updates since the 2020 release, March 2022 (MSL #37)
  6. SIB: Cardiovirus, auf: ViralZone
  7. NCBI: Cardiovirus (genus)
  8. a b c d e Eda Altan, Kristen Aiemjoy, Tung G. Phan, Xutao Deng, Solomon Aragie, Zerihun Tadesse, Kelly E. Callahan, Jeremy Keenan, Eric Delwart: Enteric virome of Ethiopian children participating in a clean water intervention trial, in: Plos One, 16. August 2018, doi:10.1371/journal.pone.0202054
  9. NCBI: Gallivirus (genus)
  10. a b c d e f William Marciel de Souza, Marcılio Jorge Fumagalli, Matheus Cavalheiro Martin, Jansen de Araujo, Maria Angela Orsi, Luiz Francisco Sanfilippo, Sejal Modha, Edison Luiz Durigon, Jose Luiz Proenca-Modena, Clarice Weis Arns, Pablo Ramiro Murcia, Luiz Tadeu Moraes Figueiredo: Pingu virus: A new picornavirus in penguins from Antarctica], in: Virus Evolution 5(2), 2019, doi:10.1093/ve/vez047
  11. NCBI: Kobuvirus (genus)
  12. NCBI: Megrivirus (genus)
  13. NCBI: Oscivirus (genus)
  14. NCBI: Passerivirus (genus)
  15. NCBI: Rafivirus (genus)
  16. NCBI: Rosavirus (genus)
  17. NCBI: Sakobuvirus (genus)
  18. NCBI: Salivirus (genus)
  19. NCBI: Sicinivirus (genus)
  20. SIB: Hepatovirus, auf: ViralZone
  21. a b c d e f g h i j k ICTV: Family - Picornaviridae (2012) und Picornaviridae (2011), Virus Taxonomy: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses
  22. a b c Nick J. Knowles: A Pan-Picornavirus RT-PCR: Identification of Novel Picornavirus Species, Institute for Animal Health (IAH), Pirbright Laboratory, Pirbright, Woking, Surrey, UK (undatiert)
  23. a b c d e f g h i j k l m n o p q r ABAS: TRBA 462 „Einstufung von Viren in Risikogruppen“, Technische Regeln für Biologische Arbeitsstoffe, Nr. 462, GMBl Nr. 15–20 vom 25. April 2012, letzte Änderung: 3. Juli 2018
  24. Thomas J. Divers et al.: New Parvovirus Associated with Serum Hepatitis in Horses after Inoculation of Common Biological Product. In: Emerging infectious diseases. Band 24, Nummer 2, 02 2018, S. 303–310, doi:10.3201/eid2402.171031, PMID 29350162, PMC 5782890 (freier Volltext).
  25. a b c d e f Avian PLV, auf: The Picornavirus Pages
  26. Sjaak de Wit, Carla Schrier, Gerdy Ten Dam, Yvonne Biermann, Ineke Verstegen, Frans Edens: Detection and characterisation of a new astrovirus in chicken and turkeys with enteric and locomotion disorders, in: Avian Pathology, Taylor & Francis, 2011, S. 1ff, doi:10.1080/03079457.2011.596813, hal-00720583 (Preprint)
  27. S. J. Anthony, J. A. St. Leger, E. Liang, A. L. Hicks, M. D. Sanchez-Leon, K. Jain, J. H. Lefkowitch, I. Navarrete-Macias, N. Knowles, T. Goldstein, K. Pugliares, H. S. Ip, T. Rowles, and W. I. Lipkina: Discovery of a Novel Hepatovirus (Phopivirus of Seals) Related to Human Hepatitis A Virus. In: mBio. Band 6, Nummer 4, August 2015, S. e01180-15, doi:10.1128/mBio.01180-15, PMID 26307166, PMC 4550696 (freier Volltext).
  28. Andi Krumbholz, Marco Groth, Jan Esefeld, Hans-Ulrich Peter, Roland Zell: Genome Sequence of a Novel Picorna-Like RNA Virus from Feces of the Antarctic Fur Seal (). In: Genome announcements. Band 5, Nummer 36, September 2017, S. , doi:10.1128/genomeA.01001-17, PMID 28883153, PMC 5589547 (freier Volltext).
  29. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology, Mai 2015; 479-480. 2–25, PMID 25771806, PMC 5898234 (freier Volltext).

Literatur

  • G. Stanway, F. Brown et al.: Picornaviridae. In: C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2005, S. 757–778
  • David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields' Virology, 4. Auflage, Philadelphia 2001
  • S. Mordow, D. Falke: Molekulare Virologie, Spektrum Akad. Verlag, Heidelberg, Berlin 1997

Weblinks

 title=
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autoren und Herausgeber von Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia DE

Picornaviridae: Brief Summary ( German )

provided by wikipedia DE

Die Familie der Picornaviren (Picornaviridae) umfasst unbehüllte Viren mit einer einzelsträngigen, linearen RNA mit positiver Polarität als Genom. Die Viren dieser Familie gehören mit einer Größe von 22 bis 30 nm zu den kleinsten Viren, was zur Namensgebung pico (lat. für sehr klein) und rna für das Genom führte.

Picornaviren kommen bei einer Vielzahl von Wirbeltieren vor und verursachen sehr unterschiedliche Erkrankungen, z. B. eine harmlose Erkältung, Durchfallerkrankungen, Schleimhautentzündungen oder Infektionen des Zentralnervensystems. Die zahlreichen Arten der Picornaviren werden typischerweise in viele Subtypen unterteilt, da sie sich durch eine große Oberflächenvarianz und die damit einhergehende antigenetische Variabilität auszeichnen; bislang wurden ca. 370 Typen klassifiziert. Wichtige Vertreter der Picornaviridae sind beispielsweise beim Menschen das Hepatitis-A-Virus, in der Gattung Enterovirus das Poliovirus, die Rhinoviren (häufigste Erreger von Erkältungskrankheiten) und die Coxsackie-Viren, bei Tieren das Maul-und-Klauenseuche-Virus.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autoren und Herausgeber von Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia DE

पिकोरनाविरिडाए ( Hindi )

provided by wikipedia emerging languages

पिकोरनाविरिडाए (Picornaviridae) वायरस का एक जीववैज्ञानिक कुल है। इसकी सदस्य जातियाँ कशेरुक प्राणियों (जैसे कि मानव) में संक्रमण (इन्फ़ेक्शन) करती हैं।[1][2][3][4]

इन्हें भी देखें

सन्दर्भ

  1. John B. Carter; Venetia A. Saunders (2007). Virology: Principles and applications. John Wiley & Sons. pp. 160–165.
  2. Zabel, P., Moerman, M., Lomonossoff, G., Shanks, M., & Beyreuther, K. (1984). Cowpea mosaic virus VPg: sequencing of radiochemically modified protein allows mapping of the gene on B RNA. The EMBO Journal, 3(7), 1629–1634. PMC 557569
  3. Acheson, Nicholas H (2011). Fundamentals of Molecular Virology,2e. John Wiley & Sons, Inc. ISBN 978-0470900598
  4. Daijogo, S., & Semler, B. L. (2011). 1 Mechanistic Intersections Between Picornavirus Translation and RNA Replication. Advances in virus research, 80, 1.
license
cc-by-sa-3.0
copyright
विकिपीडिया के लेखक और संपादक

पिकोरनाविरिडाए: Brief Summary ( Hindi )

provided by wikipedia emerging languages

पिकोरनाविरिडाए (Picornaviridae) वायरस का एक जीववैज्ञानिक कुल है। इसकी सदस्य जातियाँ कशेरुक प्राणियों (जैसे कि मानव) में संक्रमण (इन्फ़ेक्शन) करती हैं।

license
cc-by-sa-3.0
copyright
विकिपीडिया के लेखक और संपादक

Picornavirus

provided by wikipedia EN

Picornaviruses are a group of related nonenveloped RNA viruses which infect vertebrates including fish,[2] mammals, and birds. They are viruses that represent a large family of small, positive-sense, single-stranded RNA viruses with a 30 nm icosahedral capsid. The viruses in this family can cause a range of diseases including the common cold, poliomyelitis, meningitis, hepatitis, and paralysis.[3][4][5][6]

Picornaviruses constitute the family Picornaviridae, order Picornavirales, and realm Riboviria. There are 158 species in this family, assigned to 68 genera. Notable examples are genera Enterovirus (including Rhinovirus and Poliovirus), Aphthovirus, Cardiovirus, and Hepatovirus.[1][7]

Etymology

Look up picornavirus in Wiktionary, the free dictionary.

The name "picornavirus" has a dual etymology. Firstly, the name derives from picorna- which is an acronym for "poliovirus, insensitivity to ether, coxsackievirus, orphan virus, rhinovirus, and ribonucleic acid". Secondly, the name derives from pico-, which designates a very small unit of measurement (equivalent to 10−12), combined with rna to describe this group of very small RNA viruses.[8]

History

The first animal virus discovered (1897) was the foot-and-mouth disease virus (FMDV). It is the prototypic member of the genus Aphthovirus in the Picornaviridae family.[5] The plaque assay was developed using poliovirus; the discovery of viral replication in culture was also with poliovirus in 1949. This was the first time that infectious virus had been produced in cultured cells.[9] Polyprotein synthesis, internal ribosome entry sites, and uncapped mRNA were all discovered by studying poliovirus infected cells, and a poliovirus clone was the first infectious DNA clone made of an RNA virus in animals. Along with rhinovirus, poliovirus was the first animal virus to have its structure determined by x-ray crystallography. RNA dependent RNA polymerase was discovered in Mengovirus, a genus of picornaviruses.[10]

Virology

Structure

FMDV structural proteins VP1, VP2, VP3, and VP4 form the biological protomer and icosahedral capsid.

Picornaviruses are nonenveloped, with an icosahedral capsid.[4] The capsid is an arrangement of 60 protomers in a tightly packed icosahedral structure. Each protomer consists of four polypeptides known as VP (viral protein) 1, 2, 3 and 4. VP2 and VP4 polypeptides originate from one protomer known as VP0 that is cleaved to give the different capsid components. The icosahedral capsid is said to have a triangulation number of 3, this means that in the icosahedral structure each of the 60 triangles that make up the capsid are split into three little triangles with a subunit on the corner.

Many picornaviruses have a deep cleft formed by around each of the 12 vertices of icosahedrons. The outer surface of the capsid is composed of regions of VP1, VP2, and VP3. Around each of the vertices is a canyon lined with the C termini of VP1 and VP3. The interior surface of the capsid is composed of VP4 and the N termini of VP1. J. Esposito andr Freederick A. Murphy demonstrates cleft structure referred to as canyons, using X-ray crystallography and cryoelectron microscopy.[9]

Depending on the type and degree of dehydration, the viral particle is around 30–32 nm in diameter.[7] The viral genome is around 2500 nm in length, so it is tightly packaged within the capsid along with substances such as sodium ions to balance the negative charges on the RNA caused by the phosphate groups.

Genome

Genome organization and proteins of enteroviruses and aphthoviruses

Picornaviruses are classed under Baltimore's viral classification system as group IV viruses, as they contain a single-stranded, positive-sense RNA genome. Their genome ranges between 6.7 and 10.1 (kilobases) in length.[7] Like most positive-sense RNA genomes, the genetic material alone is infectious; although substantially less virulent than if contained within the viral particle, the RNA can have increased infectivity when transfected into cells. The genome RNA is unusual because it has a protein on the 5' end that is used as a primer for transcription by RNA polymerase. This primer is called VPg genome, and it ranges between 2 and 3 kb. VPg contain tyrosine residue at the 3' end. Tyrosine as a –OH source for covalently linked to 5' end of RNA.[9][11]

The genome is not segmented and positive-sense (the same sense as mammalian mRNA, being read 5' to 3'). Unlike mammalian mRNA, picornaviruses do not have a 5' cap, but a virally encoded protein known as VPg. However, like mammalian mRNA, the genome does have a poly(A) tail at the 3' end. An untranslated region (UTR) is found at both ends of the picornavirus genome. The 5' UTR is usually longer, being around 500–1200 nucleotides (nt) in length, compared to that of the 3' UTR, which is around 30–650 nt. The 5' UTR is thought to be important in translation, and the 3' in negative-strand synthesis; however, the 5' end may also have a role to play in virulence of the virus. The rest of the genome encodes structural proteins at the 5' end and nonstructural proteins at the 3' end in a single polyprotein.

The polyprotein is organised as: L-1ABCD-2ABC-3ABCD with each letter representing a protein, but variations to this layout exist.

The 1A, 1B, 1C, and 1D proteins are the capsid proteins VP4, VP2, VP3, and VP1, respectively. Virus-coded proteases perform the cleavages, some of which are intramolecular. The polyprotein is first cut to yield P1, P2, and P3. P1 becomes myristylated at the N terminus before being cleaved to VP0, VP3, and VP1, the proteins that will form procapsids; VP0 will later be cleaved to produce VP2 and VP4. Other cleavage products include 3B (VPg), 2C (an ATPase), and 3D (the RNA polymerase).[9][12]

Replication

RNA elements

Genomic RNAs of picornaviruses possess multiple RNA elements, and they are required for both negative- and positive-strand RNA synthesis. The cis-acting replication element (CRE) is required for replication. The stem-loop-structure that contains the CRE is independent of position, but changes with location between virus types when it has been identified. Also, the 3' end elements of viral RNA are significant and efficient for RNA replication of picornaviruses. The 3' end of picornavirus contains poly(A) tract, which be required for infectivity. RNA synthesis, though, is hypothesized to occur in this region. The 3' end NCR of poliovirus is not necessary for negative-strand synthesis, but is important element for positive–strand synthesis. Additionally, the 5' end NCR that contains secondary structural elements is required for RNA replication and poliovirus translation initiation. Internal ribosome entry sites are RNA structures that allow cap-independent initiation of translation, and are able to initiate translation in the middle of a messenger RNA.[13]

Lifecycle

Picornavirus life cycle

The viral particle binds to cell surface receptors. Cell surface receptors are characterized for each serotype of picornaviruses. For example, poliovirus receptor is glycoprotein CD155, which is special receptor for human and some other primate species. For this reason, poliovirus could not be made in many laboratories until transgenic mice having a CD155 receptor on their cell surfaces were developed in the 1990s. These animals can be infected and used for studies of replication and pathogenesis.[9] Binding causes a conformational change in the viral capsid proteins, and myristic acid is released. The acid forms a pore in the cell membrane through which RNA is injected.[14]

Once inside the cell, the RNA uncoats and the (+) strand RNA genome is replicated through a double-stranded RNA intermediate that is formed using viral RNA-dependent RNA polymerase. Translation by host-cell ribosomes is not initiated by a 5' G cap as usual, but rather is initiated by an internal ribosome entry site. The viral life cycle is very rapid, with the whole process of replication being completed on average within 8 hours. As little as 30 minutes after initial infection, though, cell protein synthesis declines to almost zero output – essentially the macromolecular synthesis of cell proteins is shut off. Over the next 1–2 hours, a loss of margination of chromatin and homogeneity occurs in the nucleus, before the viral proteins start to be synthesized and a vacuole appears in the cytoplasm close to the nucleus that gradually starts to spread as the time after infection reaches around 3 hours. After this time, the cell plasma membrane becomes permeable; at 4–6 hours, the virus particles assemble, and can sometimes be seen in the cytoplasm. Around 8 hours, the cell is effectively dead, and lyses to release the viral particles.

Experimental data from single-step growth curve-like experiments have allowed observation of the replication of the picornaviruses in great detail. The whole of replication occurs within the host-cell cytoplasm and infection can even happen in cells that do not contain a nucleus (enucleated) and those treated with actinomycin D (this antibiotic would inhibit viral replication if this occurred in the nucleus.)

Translation takes place by -1 ribosomal frameshifting, viral initiation, and ribosomal skipping. The virus exits in host cell by lysis, and viroporins. Vertebrates serve as the natural hosts. Transmission routes are fecal-oral, contact, ingestion, and air-borne particles.[4]

Viral protein (VPg)

Picornaviruses have a viral protein (VPg) covalently linked to 5' end of their genomes instead of 7-methylguanosine cap like cellular mRNAs. Virus RNA polymerases use VPg as primer. VPg as primer uses both positive- and negative-strand RNA synthesis. Picornavirus replication is initiated by the uridylylation of VPg. It is uridylylated at the hydroxyl group of a tyrosine residue.[3] A VPg primer mechanism is used by the picornavirus (entero- aphtho-, and others), additional virus groups (poty-, como-, calici-, and others) and picornavirus-like (coronavirus, notavirus, etc.) supergroup of RNA viruses. The mechanism has been best studied for the enteroviruses (which include many human pathogens, such as poliovirus and coxsackie viruses), as well as for the aphthovirus, an animal pathogen causing foot-and-mouth disease.

In this group, primer-dependent RNA synthesis uses a small 22– to 25-amino acid-long viral protein linked to the VPg[15] to initiate polymerase activity, where the primer is covalently bound to the 5' end of the RNA template.[16] The uridylylation occurs at a tyrosine residue at the third position of the VPg. A CRE, which is a RNA stem loop structure, serves as a template for the uridylylation of VPg, resulting in the synthesis of VPgpUpUOH. Mutations within the CRE-RNA structure prevent VPg uridylylation, and mutations within the VPg sequence can severely diminish RdRp catalytic activity.[17] While the tyrosine hydroxyl of VPg can prime negative-strand RNA synthesis in a CRE- and VPgpUpUOH-independent manner, CRE-dependent VPgpUpUOH synthesis is absolutely required for positive-strand RNA synthesis. CRE-dependent VPg uridylylation lowers the K of UTP required for viral RNA replication and CRE-dependent VPgpUpUOH synthesis, and is required for efficient negative-strand RNA synthesis, especially when UTP concentrations are limiting.[18] The VPgpUpUOH primer is transferred to the 3’ end of the RNA template for elongation, which can continue by addition of nucleotide bases by RdRp. Partial crystal structures for VPgs of foot and mouth disease virus[19] and coxsackie virus B3[20] suggest that there may be two sites on the viral polymerase for the small VPgs of the picornaviruses. NMR solution structures of poliovirus VPg[21] and VPgpU[22] show that uridylylation stabilizes the structure of the VPg, which is otherwise quite flexible in solution. The second site may be used for uridylylation,v after which the VPgpU can initiate RNA synthesis. The VPg primers of caliciviruses, whose structures are only beginning to be revealed,[23] are much larger than those of the picornaviruses. Mechanisms for uridylylation and priming may be quite different in all of these groups.

VPg uridylylation may include the use of precursor proteins, allowing for the determination of a possible mechanism for the location of the diuridylylated, VPg-containing precursor at the 3' end of positive- or negative-strand RNA for production of full-length RNA. Determinants of VPg uridylylation efficiency suggest formation and/or collapse or release of the uridylylated product as the rate-limiting step in vitro depending upon the VPg donor employed.[24] Precursor proteins also have an effect on VPg-CRE specificity and stability.[25] The upper RNA stem loop, to which VPg binds, has a significant impact on both retention, and recruitment, of VPg and Pol. The stem loop of CRE will partially unwind, allowing the precursor components to bind and recruit VPg and Pol4. The CRE loop has a defined consensus sequence to which the initiation components bind, but no consensus sequence exists for the supporting stem, which suggests that only the structural stability of the CRE is important.[26]

Assembly and organization of the picornavirus VPg ribonucleoprotein complex

  1. Two 3CD (VPg complex) molecules bind to CRE with the 3C domains (VPg domain) contacting the upper stem and the 3D domains (VPg domain) contacting the lower stem.
  2. The 3C dimer opens the RNA stem by forming a more stable interaction with single strands forming the stem.
  3. 3Dpol is recruited to and retained in this complex by a physical interaction between the back-of-the-thumb subdomain of 3Dpol and a surface of one or both 3C subdomains of 3CD.

VPg may also play an important role in specific recognition of viral genome by movement proteins (MP), which are nonstructural proteins encoded by many, if not all, plant viruses to enable their movement from one infected cell to neighboring cells.[27] MP and VPg interact to provide specificity for the transport of viral RNA from cell to cell. To fulfill energy requirements, MP also interacts with P10, which is a cellular ATPase.

Diseases

Picornaviruses cause a range of diseases. Enteroviruses of the picornavirus family infect the enteric tract, which is reflected in their name. Rhinoviruses infect primarily the nose and the throat. Enteroviruses replicate at 37 °C, whereas rhinoviruses grow better at 33 °C, as this is the lower temperature of the nose. Enteroviruses are stable under acidic conditions, thus they are able to survive exposure to gastric acid. In contrast, rhinoviruses are acid-labile (inactivated or destroyed by low pH conditions), so rhinovirus infections are restricted to the nose and throat.

Taxonomy

These genera are recognized:[1]

See also

References

  1. ^ a b c "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 20 May 2021.
  2. ^ Altan E, Kubiski SV, Boros Á, Reuter G, Sadeghi M, Deng X, Creighton EK, Crim MJ, Delwart E (2019). "A highly divergent picornavirus infecting the Gut Epithelia of Zebrafish (Danio rerio) in research institutions worldwide". Zebrafish. 16 (3): 291–299. doi:10.1089/zeb.2018.1710. PMID 30939077. S2CID 92999901.
  3. ^ a b Ryu WS (2016). "Chapter 11 – Picornavirus". Molecular virology of human pathogenic viruses. Korea: Academic Press. pp. 153–64. doi:10.1016/b978-0-12-800838-6.00011-4. ISBN 978-0-12-800838-6.
  4. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  5. ^ a b Martinez-Salas E, Saiz M, Sobrino F (2008). "Foot-and-Mouth Disease Virus". In Mettenleiter TC, Sobrino F (eds.). Animal Viruses: Molecular Biology. Norfolk, UK: Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6.
  6. ^ Lau SK, Woo PC, Lai KK, Huang Y, Yip CC, Shek CT, Lee P, Lam CS, Chan KH, Yuen KY (September 2011). "Complete genome analysis of three novel picornaviruses from diverse bat species". Journal of Virology. 85 (17): 8819–28. doi:10.1128/JVI.02364-10. PMC 3165794. PMID 21697464.
  7. ^ a b c "Picornaviridae - Picornaviridae - Picornavirales". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Archived from the original on 21 September 2017. Retrieved 12 June 2020.
  8. ^ "Picornaviridae". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). October 2017. Archived from the original on 21 September 2017. Retrieved 5 February 2019.
  9. ^ a b c d e Carter JB, Saunders VA (2007). "Picornaviruses (and other plus-strand RNA viruses)". Virology: Principles and applications. Chichester, England: John Wiley & Sons. pp. 160–65. ISBN 978-0-470-02386-0.
  10. ^ Knipe DM, Howley P (2013). Fields Virology. Lippincott Williams & Wilkins. ISBN 978-1-4698-3066-7.
  11. ^ Zabel P, Moerman M, Lomonossoff G, Shanks M, Beyreuther K (July 1984). "Cowpea mosaic virus VPg: sequencing of radiochemically modified protein allows mapping of the gene on B RNA". The EMBO Journal. 3 (7): 1629–34. doi:10.1002/j.1460-2075.1984.tb02021.x. PMC 557569. PMID 16453534.
  12. ^ Acheson NH (2011). Fundamentals of Molecular Virology (2nd ed.). John Wiley & Sons, Inc. ISBN 978-0470900598.
  13. ^ Daijogo S, Semler BL (2011). "Mechanistic intersections between picornavirus translation and RNA replication". Advances in Virus Research. 80: 1–24. doi:10.1016/B978-0-12-385987-7.00001-4. ISBN 9780123859877. PMID 21762819.
  14. ^ "Pathology, Microbiology and Immunology - School of Medicine Columbia | University of South Carolina".
  15. ^ Flanegan JB, Baltimore D (September 1977). "Poliovirus-specific primer-dependent RNA polymerase able to copy poly(A)". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 74 (9): 3677–80. Bibcode:1977PNAS...74.3677F. doi:10.1073/pnas.74.9.3677. PMC 431685. PMID 198796.
  16. ^ Ambros V, Baltimore D (August 1978). "Protein is linked to the 5' end of poliovirus RNA by a phosphodiester linkage to tyrosine". The Journal of Biological Chemistry. 253 (15): 5263–66. doi:10.1016/S0021-9258(17)30361-7. PMID 209034.
  17. ^ Gu C, Zeng T, Li Y, Xu Z, Mo Z, Zheng C (October 2009). "Structure-function analysis of mutant RNA-dependent RNA polymerase complexes with VPg". Biochemistry. Biokhimiia. 74 (10): 1132–41. doi:10.1134/S0006297909100095. PMID 19916926. S2CID 24968119.
  18. ^ Steil BP, Barton DJ (October 2008). "Poliovirus cis-acting replication element-dependent VPg Uridylylation lowers the Km of the initiating nucleoside triphosphate for viral RNA replication". Journal of Virology. 82 (19): 9400–08. doi:10.1128/JVI.00427-08. PMC 2546976. PMID 18653453.
  19. ^ Ferrer-Orta C, Arias A, Agudo R, Pérez-Luque R, Escarmís C, Domingo E, Verdaguer N (February 2006). "The structure of a protein primer-polymerase complex in the initiation of genome replication". The EMBO Journal. 25 (4): 880–88. doi:10.1038/sj.emboj.7600971. PMC 1383552. PMID 16456546.
  20. ^ Gruez A, Selisko B, Roberts M, Bricogne G, Bussetta C, Jabafi I, et al. (October 2008). "The crystal structure of coxsackievirus B3 RNA-dependent RNA polymerase in complex with its protein primer VPg confirms the existence of a second VPg binding site on Picornaviridae polymerases". Journal of Virology. 82 (19): 9577–90. doi:10.1128/JVI.00631-08. PMC 2546979. PMID 18632861.
  21. ^ Schein CH, Oezguen N, Volk DE, Garimella R, Paul A, Braun W (July 2006). "NMR structure of the viral peptide linked to the genome (VPg) of poliovirus". Peptides. 27 (7): 1676–84. doi:10.1016/j.peptides.2006.01.018. PMC 1629084. PMID 16540201.
  22. ^ Schein CH, Oezguen N, van der Heden van Noort GJ, Filippov DV, Paul A, Kumar E, Braun W (August 2010). "NMR solution structure of poliovirus uridylyated peptide linked to the genome (VPgpU)". Peptides. 31 (8): 1441–48. doi:10.1016/j.peptides.2010.04.021. PMC 2905501. PMID 20441784.
  23. ^ Leen EN, Kwok KY, Birtley JR, Simpson PJ, Subba-Reddy CV, Chaudhry Y, et al. (May 2013). "Structures of the compact helical core domains of feline calicivirus and murine norovirus VPg proteins" (PDF). Journal of Virology. 87 (10): 5318–30. doi:10.1128/JVI.03151-12. PMC 3648151. PMID 23487472.
  24. ^ Pathak HB, Oh HS, Goodfellow IG, Arnold JJ, Cameron CE (November 2008). "Picornavirus genome replication: roles of precursor proteins and rate-limiting steps in oriI-dependent VPg uridylylation". The Journal of Biological Chemistry. 283 (45): 30677–88. doi:10.1074/jbc.M806101200. PMC 2576561. PMID 18779320.
  25. ^ Shen M, Wang Q, Yang Y, Pathak HB, Arnold JJ, Castro C, Lemon SM, Cameron CE (November 2007). "Human Rhinovirus Type 14 Gain-of-Function Mutants for oriI Utilization Define Residues of 3C(D) and 3Dpol That Contribute to Assembly and Stability of the Picornavirus VPg Uridylylation Complex". J. Virol. 81 (22): 12485–95. doi:10.1128/JVI.00972-07. PMC 2169002. PMID 17855535.
  26. ^ Yang Y, Rijnbrand R, McKnight KL, Wimmer E, Paul A, Martin A, Lemon SM (August 2002). "Sequence requirements for viral RNA replication and VPg uridylylation directed by the internal cis-acting replication element (CRE) of human rhinovirus type 14". Journal of Virology. 76 (15): 7485–94. doi:10.1128/JVI.76.15.7485-7494.2002. PMC 136355. PMID 12097561.
  27. ^ Roy Chowdhury S, Savithri HS (January 2011). Pfeffer S (ed.). "Interaction of Sesbania mosaic virus movement protein with VPg and P10: implication to specificity of genome recognition". PLOS ONE. 6 (1): e15609. Bibcode:2011PLoSO...615609R. doi:10.1371/journal.pone.0015609. PMC 3016346. PMID 21246040.
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedia authors and editors
original
visit source
partner site
wikipedia EN

Picornavirus: Brief Summary

provided by wikipedia EN

Picornaviruses are a group of related nonenveloped RNA viruses which infect vertebrates including fish, mammals, and birds. They are viruses that represent a large family of small, positive-sense, single-stranded RNA viruses with a 30 nm icosahedral capsid. The viruses in this family can cause a range of diseases including the common cold, poliomyelitis, meningitis, hepatitis, and paralysis.

Picornaviruses constitute the family Picornaviridae, order Picornavirales, and realm Riboviria. There are 158 species in this family, assigned to 68 genera. Notable examples are genera Enterovirus (including Rhinovirus and Poliovirus), Aphthovirus, Cardiovirus, and Hepatovirus.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedia authors and editors
original
visit source
partner site
wikipedia EN

Picornaviridae ( Spanish; Castilian )

provided by wikipedia ES

Picornaviridae es una familia de virus infecciosos para animales. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. El genoma ARN es inusual porque tiene una proteína en el terminal 5' que se utiliza como iniciador de la transcripción por la ARN polimerasa. El nombre se deriva de "pico", que significa pequeño, con lo que "picornavirus" significa literalmente "virus ARN pequeños". Presentan una cápside carente de envoltura viral y estructuralmente definida por una simetría icosaédrica, de un tamaño de 22 a 30 nm; y por ensamblar los viriones maduros en el citoplasma como compartimento celular.[1]

Los picornavirus incluyen importantes patógenos para humanos y animales.[2]​ Las enfermedades que causa son variadas, como el resfriado común, poliomielitis e infecciones crónicas en el ganado. Dos categorías principales son los Enterovirus y Rhinovirus.

Los Enterovirus infectan al tracto entérico, mientras que los Rhinoviruses infectan principalmente nariz y garganta. Los primeros se replican a 37 °C, mientras que los segundos crecen mejor a 33 °C, ya que esta es la temperatura inferior de la nariz. Los Enterovirus son estables bajo condiciones ácidas y, por tanto, son capaces de sobrevivir a la exposición al ácido gástrico. Por el contrario, los Rhinoviruses son inestables al ácido y por esta razón se limitan a nariz y garganta.

Estructura

La cápside es un arreglo de 60 protómeros en una estructura icosaédrica altamente empaquetada. Cada protómetero consta de 4 polipéptidos denominados VP (proteínas virales) 1, 2, 3 y 4. Todos estos polipéptidos VP se originan a partir de un protómero denominado VP0 que se divide para dar lugar a los diferentes componentes de la cápside. La estructura icosaédrica tiene un número de triangulación 3 puesto que cada uno de los 60 triángulos que componen la cápside se construyen con 3 pequeños triángulos con una subunidad en la esquina.

Dependiendo del tipo y el grado de deshidratación de la partícula viral el diámetro mide alrededor de 27-30 nm de diámetro. El genoma viral tiene una longitud de alrededor de 2500 nm, por lo que podemos concluir que debe estar perfectamente embalado dentro de la cápside junto con sustancias tales como iones de sodio, a fin de cancelar las cargas negativas del ARN causadas por los grupos del fosfato. La enfermedades que causanla rubila

Genoma

Los picornavirus contienen un único filamento de ARN de sentido positivo de longitud comprendida entre 7,2 y 9,0 kb de longitud. Como la mayoría de los genomas de ARN de sentido positivo, el material genético por sí solo es infeccioso, aunque mucho menos virulento que si figura dentro de la partícula viral. El genoma es del mismo sentido que el ARNm de los mamíferos, siendo leído desde el extremo 5' al 3'. Al igual que estos, tiene una cola de poli A en el extremo 3'. Sin embargo, a diferencia del ARNm de los mamíferos, los picornavirus no tienen un cap en el extremo 5', sino una proteína codificada viralmente denominada VPg.

Hay una región no-traducible (UTR) en ambos extremos del genoma de los picornavirus. El UTR 5' es mayor, en torno al 600-1200 nucleótidos de longitud, en comparación con el UTR 3', que es de alrededor de 50-100. Se cree que el UTR 5' es importante en la traducción y el 3' la síntesis de la cadena negativa. Sin embargo, el extremo 5' puede también tener un papel en la virulencia del virus. El resto del genoma codifica proteínas estructurales en el extremo 5' y proteínas no estructurales en el extremo 3' en una única poliproteína.

Experimentos del tipo de curva de crecimiento de un solo paso, han permitido a los científicos ver la replicación de los picornaviruses en gran detalle. La replicación completa se produce en el citoplasma de la célula huésped y la infección puede ocurrir incluso en células que no contienen un núcleo (células anucleadas) y en las tratadas con actinomicina D (este antibiótico inhibe la replicación viral, si esta se produce en el núcleo).

Replicación

La partícula viral se une a los receptores de la superficie celular. Esto provoca un cambio conformacional en las proteínas de la cápside viral y se liberan ácidos mirísticos. Estos ácidos forman un poro en la membrana celular a través del cual se inyecta el ARN. Una vez dentro de la célula, el ARN se libera de la cubierta y la cadena positiva se replica a través de un ARN intermedio de doble cadena que se forma usando RDRP viral (ARN polimerasa dependiente del ARN). La traducción por los ribosomas de la célula huésped no es iniciada por un cap 5' G como es usual, sino que se inicia por un IRES (punto de entrada al interior de la ribosoma).

El ciclo de vida del virus es muy rápido con todo el proceso de replicación completado en una media de 8 horas. Sin embargo, sólo 30 minutos después de la infección inicial, la síntesis de proteínas celulares disminuye casi a cero, esto es, se "desconecta". En las próximas 1-2 horas hay una pérdida de marginación de cromatina y homogeneidad en el núcleo, antes de que las proteínas virales comiencen a ser sintetizadas y aparezca una vacuola cerca del núcleo que poco a poco comienza a extenderse cuando la infección llega a alrededor de 3 horas. Después de este tiempo, la membrana plasmática celular se vuelve permeable, y a las 4-6 horas las partículas del virus se ensamblan y pueden a veces verse en el citoplasma. En alrededor de 8 horas, la célula está efectivamente muerta y se lisa para liberar las partículas virales.

Géneros

Se han descrito los siguientes géneros:

Especies

Algunas especies de la familia se muestran en la siguiente tabla:

Picornaviridae. Géneros, Especies y Serotipos

Géneros

Especie (* = especie tipo)

Serotipos

Enterovirus (EV) Enterovirus bovino (BEV) BEV-1, BEV-2 Enterovirus humano A 17 serotipos incluyendo virus coxsackie A y enterovirus Enterovirus humano B 56 serotipos incluyendo enterovirus, virus coxsackie B, echovirus y virus de la enfermedad vesicular porcina Enterovirus humano C 13 serotipos incluyendo enterovirus y virus coxsackie A1 Enterovirus humano D EV-68, EV-70, EV-94 Poliovirus (PV) * PV-1 (cepa Mahoney), PV-2 (cepa Lansing), PV-3 (P3/Leon/37) Enterovirus porcino (PEV) A PEV-8 Enterovirus porcino B PEV-9, PEV-10 Enterovirus A del simio SEV-A1 Rhinovirus Rhinovirus humano A * 74 serotipos Rhinovirus humano B 25 serotipos Hepatovirus Virus de la hepatitis A * Virus de la hepatitis A humano, virus de la hepatitis A del simio Virus de a encefalomielitis aviar
Cardiovirus Virus de la encefalomiocarditis * Virus Columbia SK, virus Maus Elberfeld, Mengovirus Theilovirus Virus de la encefalomielitis murina de Theiler, virus de la encefalomielitis humana de Vilyuisk, virus de la encefalomielitis de la rata Aphthovirus Virus de la fiebre aftosa[3]​ *
Virus de la rinitis equina A (ERAV)
Parechovirus Parechovirus humano (HPeV) * HPeV-1, HPeV-2, HPeV-3 Virus Ljungan Parechovirus del roedor Erbovirus Virus de la rinitis equina B (ERBV) * ERBV-1, ERBV-2 Kobuvirus Virus Aichi *
Kobuvirus bovino
Teschovirus Teschovirus porcino *
Tremovirus Virus de la encefalomielitis aviar *

Fuentes

Referencias

  1. Prescott, L.M. (199). Microbiología. McGraw-Hill Interamericana de España, S.A.U. ISBN 84-486-0261-7.
  2. Mettenleiter TC and Sobrino F (editors). (2008). Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6 .
  3. Martinez-Salas et al (2008). «Foot-and-Mouth Disease Virus». Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6.

 title=
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autores y editores de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia ES

Picornaviridae: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

provided by wikipedia ES

Picornaviridae es una familia de virus infecciosos para animales. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. El genoma ARN es inusual porque tiene una proteína en el terminal 5' que se utiliza como iniciador de la transcripción por la ARN polimerasa. El nombre se deriva de "pico", que significa pequeño, con lo que "picornavirus" significa literalmente "virus ARN pequeños". Presentan una cápside carente de envoltura viral y estructuralmente definida por una simetría icosaédrica, de un tamaño de 22 a 30 nm; y por ensamblar los viriones maduros en el citoplasma como compartimento celular.​

Los picornavirus incluyen importantes patógenos para humanos y animales.​ Las enfermedades que causa son variadas, como el resfriado común, poliomielitis e infecciones crónicas en el ganado. Dos categorías principales son los Enterovirus y Rhinovirus.

Los Enterovirus infectan al tracto entérico, mientras que los Rhinoviruses infectan principalmente nariz y garganta. Los primeros se replican a 37 °C, mientras que los segundos crecen mejor a 33 °C, ya que esta es la temperatura inferior de la nariz. Los Enterovirus son estables bajo condiciones ácidas y, por tanto, son capaces de sobrevivir a la exposición al ácido gástrico. Por el contrario, los Rhinoviruses son inestables al ácido y por esta razón se limitan a nariz y garganta.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autores y editores de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia ES

Pikornabirus ( Basque )

provided by wikipedia EU
 src=
Pikornabirus bat: poliomelitisaren birusa, mikroskopio elektronikoan ikusita

Pikornabirusak Picornaviridae familian sailkatzen diren birusak dira, gizakia zein animaliak infektatzen dituztenak. Familia honetan 6 genero daude gaur egun (2009an): enterobirusak, errinobirusak, hepatobirusak, parekobirusak, kardiobirusak eta aftobirusak.

Haien izenak ("piko") txikiak direla adierazten du, birus hauek 25-30 bitarteko diametroa (nm-tan) baitute.

Material genetikoari dagokionez pikornabirusek harizpi bakarreko RNA dute (polaritate positibokoa), kapside ikosaedriko batez babestua. Kapside honek protomero izeneko azpiunitatez osatuta dago (60 protomerok osatzen dute), eta kanpotik ez du bilgarririk (birusak "biluziak" baitira).

Pikornabirusek animalia-birusen talde garrantzitsuenetariko bat osatzen dute. Bertan giza-patogeno asko daude: errinobirusak, esaterako, hotzeri edo katarro arruntaren eragileak dira; enterobirusak, aldiz, digestio-aparatuko gaitzak sorrarazten dituzte (tartean, poliomelitisa); hepatobirusen generoan A hepatitisaren eragilea dago; parekobirusek, azkenik, arnas traktuaren eta digestio-aparatuaren infekzioak sortzen dituzte.

(RLQ=window.RLQ||[]).push(function(){mw.log.warn("Gadget "ErrefAurrebista" was not loaded. Please migrate it to use ResourceLoader. See u003Chttps://eu.wikipedia.org/wiki/Berezi:Gadgetaku003E.");});
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipediako egileak eta editoreak
original
visit source
partner site
wikipedia EU

Pikornabirus: Brief Summary ( Basque )

provided by wikipedia EU
 src= Pikornabirus bat: poliomelitisaren birusa, mikroskopio elektronikoan ikusita

Pikornabirusak Picornaviridae familian sailkatzen diren birusak dira, gizakia zein animaliak infektatzen dituztenak. Familia honetan 6 genero daude gaur egun (2009an): enterobirusak, errinobirusak, hepatobirusak, parekobirusak, kardiobirusak eta aftobirusak.

Haien izenak ("piko") txikiak direla adierazten du, birus hauek 25-30 bitarteko diametroa (nm-tan) baitute.

Material genetikoari dagokionez pikornabirusek harizpi bakarreko RNA dute (polaritate positibokoa), kapside ikosaedriko batez babestua. Kapside honek protomero izeneko azpiunitatez osatuta dago (60 protomerok osatzen dute), eta kanpotik ez du bilgarririk (birusak "biluziak" baitira).

Pikornabirusek animalia-birusen talde garrantzitsuenetariko bat osatzen dute. Bertan giza-patogeno asko daude: errinobirusak, esaterako, hotzeri edo katarro arruntaren eragileak dira; enterobirusak, aldiz, digestio-aparatuko gaitzak sorrarazten dituzte (tartean, poliomelitisa); hepatobirusen generoan A hepatitisaren eragilea dago; parekobirusek, azkenik, arnas traktuaren eta digestio-aparatuaren infekzioak sortzen dituzte.

(RLQ=window.RLQ||[]).push(function(){mw.log.warn("Gadget "ErrefAurrebista" was not loaded. Please migrate it to use ResourceLoader. See u003Chttps://eu.wikipedia.org/wiki/Berezi:Gadgetaku003E.");});
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipediako egileak eta editoreak
original
visit source
partner site
wikipedia EU

Pikornavirukset ( Finnish )

provided by wikipedia FI

Pikornavirukset ovat hyvin pieniä vaipattomia, ikosahedraalisia eli 20-tahoisia viruksia, jotka kuuluvuat Picornaviridae -heimoon. Pikornaviruksien genomi muodostuu positiivisesta yksisäikeisestä RNA-molekyylistä, jonka vuoksi ne lisääntyvätkin solujen sytoplasmassa. Tunnettuja pikornaviruksia ovat muun muassa ihmisillä esiintyvät enterovirus, poliovirus ja hepatiitti A -virus. Eläinten viruksista tunnetuin pikornavirus on suu- ja sorkkatautia aiheuttava virus.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedian tekijät ja toimittajat
original
visit source
partner site
wikipedia FI

Pikornavirukset: Brief Summary ( Finnish )

provided by wikipedia FI

Pikornavirukset ovat hyvin pieniä vaipattomia, ikosahedraalisia eli 20-tahoisia viruksia, jotka kuuluvuat Picornaviridae -heimoon. Pikornaviruksien genomi muodostuu positiivisesta yksisäikeisestä RNA-molekyylistä, jonka vuoksi ne lisääntyvätkin solujen sytoplasmassa. Tunnettuja pikornaviruksia ovat muun muassa ihmisillä esiintyvät enterovirus, poliovirus ja hepatiitti A -virus. Eläinten viruksista tunnetuin pikornavirus on suu- ja sorkkatautia aiheuttava virus.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedian tekijät ja toimittajat
original
visit source
partner site
wikipedia FI

Picornaviridae ( French )

provided by wikipedia FR

Les Picornaviridae (Picornaviridés) sont une famille de virus à ARN de polarité positive, du groupe IV. Ce sont des virus de petite taille (20 à 30 nm), . Cette famille de virus comprend, entre autres :

Les picornavirus sont à l'origine du rhume banal et de certaines gastro-entérites, mais ils peuvent provoquer des maladies beaucoup plus graves comme la poliomyélite et des encéphalites dont des méningites.

Chaque année, plus d'un milliard de personnes sont infectées par un picornavirus.

Une étude récente[2] a démontrée que divers picornavirus; l'encephalomyocarditis virus (EMCV), le virus coxsackie B3 (CVB3), le poliovirus et l'enterovirus D68 utilisent une voie d'activation du cytosquelette d'actine incluant les protéines WASL, NCK1 et TNK2 pour infecter les cellules-hôtes.

Notes et références

  1. ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 1er février 2021
  2. Hongbing Jiang, Christian Leung, Stephen Tahan et David Wang, « Entry by multiple picornaviruses is dependent on a pathway that includes TNK2, WASL, and NCK1 », eLife, vol. 8,‎ 26 novembre 2019, e50276 (ISSN , DOI , lire en ligne, consulté le 19 novembre 2021)

Référence biologique

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Auteurs et éditeurs de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia FR

Picornaviridae: Brief Summary ( French )

provided by wikipedia FR

Les Picornaviridae (Picornaviridés) sont une famille de virus à ARN de polarité positive, du groupe IV. Ce sont des virus de petite taille (20 à 30 nm), . Cette famille de virus comprend, entre autres :

des entérovirus : poliovirus Coxsackie A virus(24 sous types) et Coxsackie B virus (6 sous types) Echovirus (Parechovirus) enterovirus des rhinovirus des hepatovirus (VHA)

Les picornavirus sont à l'origine du rhume banal et de certaines gastro-entérites, mais ils peuvent provoquer des maladies beaucoup plus graves comme la poliomyélite et des encéphalites dont des méningites.

Chaque année, plus d'un milliard de personnes sont infectées par un picornavirus.

Une étude récente a démontrée que divers picornavirus; l'encephalomyocarditis virus (EMCV), le virus coxsackie B3 (CVB3), le poliovirus et l'enterovirus D68 utilisent une voie d'activation du cytosquelette d'actine incluant les protéines WASL, NCK1 et TNK2 pour infecter les cellules-hôtes.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Auteurs et éditeurs de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia FR

Picornavirus ( Indonesian )

provided by wikipedia ID

Picornavirus adalah virus yang termasuk dalam famili Picornaviridae,[2] famili virus dalam ordo Picornavirales. Vertebrata, termasuk manusia, merupakan inang alami dari virus ini. Picornavirus adalah virus yang tidak berselubung yang mewakili famili besar dari virus yang kecil, sitoplasmik, dan memiliki untai RNA plus (~ 7.5kb) dengan kapsid ikosahedral 30 nm. Genomnya tidak memiliki membran lipid. Picornavirus ditemukan pada mamalia dan burung.[3] Saat ini ada 80 spesies dalam famili ini, dibagi ke dalam 35 genera.[2] Contoh penting adalah Enterovirus (mencakup Rhinovirus dan Poliovirus), Aphthovirus, Cardiovirus, dan Hepatovirus. Virus dalam famili ini dapat menyebabkan berbagai penyakit termasuk kelumpuhan, meningitis, hepatitis dan poliomielitis.[3][4][5][6][7] Picornavirus termasuk dalam kelas Baltimore IV. Genom picornavirus yang berupa RNA beruntai tunggal sense (+) berfungsi sebagai mRNA setelah masuk ke dalam sel dan semua mRNA virus yang disintesis memiliki polaritas genom. mRNA mengkodekan RNA polimerase tergantung RNA. Polimerase ini membuat untai minus komplementer dari RNA, kemudian menggunakannya sebagai templat untuk membuat lebih banyak untai plus. Jadi, ikhtisar langkah-langkah dalam replikasi picornavirus adalah: penempelan, entri, translasi, replikasi genom/transkripsi (satu proses yang sama), perakitan dan akhirnya virus keluar.[2][8]

Nama picornavirus memiliki etimologi ganda.[9] Pertama, picorna- adalah akronim untuk poliovirus, tidak sensitif (insensitivity) terhadap eter, coxsackievirus, orphan virus, rhinovirus, dan asam ribonukleat.[9] Kedua, pico-, artinya sangat kecil, digabungkan dengan RNA untuk mendeskripsikan virus RNA yang sangat kecil ini.[9]

Referensi

  1. ^ "Virus Taxonomy: 2018b Release" (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (dalam bahasa Inggris). March 2019. Diakses tanggal 16 March 2019.
  2. ^ a b c "ICTV Report Picornaviridae".
  3. ^ a b Ryu, W.S, 2016, Molecular Virology of Human Pathogenic Viruses, Academic Press, Korea, Page 153-164
  4. ^ "Viral Zone". ExPASy. Diakses tanggal 15 June 2015.
  5. ^ ICTV. "Virus Taxonomy: 2014 Release". Diakses tanggal 15 June 2015.
  6. ^ Mettenleiter TC and Sobrino F (editors). (2008). Animal Viruses: Molecular Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-22-6. [1].
  7. ^ Lau SK, Woo PC, Lai KK, Huang Y, Yip CC, Shek CT, Lee P, Lam CS, Chan KH, Yuen KY (2011) Complete genome analysis of three novel picornaviruses from diverse bat species. J Virol.
  8. ^ Carter, J., & Saunders, V. A. (2007). Virology: principles and applications. John Wiley & Sons
  9. ^ a b c "Picornaviridae" (html). International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (dalam bahasa Inggris). October 2017. Diakses tanggal 5 February 2019.

Bacaan lebih lanjut

Pranala luar

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Penulis dan editor Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia ID

Picornavirus: Brief Summary ( Indonesian )

provided by wikipedia ID

Picornavirus adalah virus yang termasuk dalam famili Picornaviridae, famili virus dalam ordo Picornavirales. Vertebrata, termasuk manusia, merupakan inang alami dari virus ini. Picornavirus adalah virus yang tidak berselubung yang mewakili famili besar dari virus yang kecil, sitoplasmik, dan memiliki untai RNA plus (~ 7.5kb) dengan kapsid ikosahedral 30 nm. Genomnya tidak memiliki membran lipid. Picornavirus ditemukan pada mamalia dan burung. Saat ini ada 80 spesies dalam famili ini, dibagi ke dalam 35 genera. Contoh penting adalah Enterovirus (mencakup Rhinovirus dan Poliovirus), Aphthovirus, Cardiovirus, dan Hepatovirus. Virus dalam famili ini dapat menyebabkan berbagai penyakit termasuk kelumpuhan, meningitis, hepatitis dan poliomielitis. Picornavirus termasuk dalam kelas Baltimore IV. Genom picornavirus yang berupa RNA beruntai tunggal sense (+) berfungsi sebagai mRNA setelah masuk ke dalam sel dan semua mRNA virus yang disintesis memiliki polaritas genom. mRNA mengkodekan RNA polimerase tergantung RNA. Polimerase ini membuat untai minus komplementer dari RNA, kemudian menggunakannya sebagai templat untuk membuat lebih banyak untai plus. Jadi, ikhtisar langkah-langkah dalam replikasi picornavirus adalah: penempelan, entri, translasi, replikasi genom/transkripsi (satu proses yang sama), perakitan dan akhirnya virus keluar.

Nama picornavirus memiliki etimologi ganda. Pertama, picorna- adalah akronim untuk poliovirus, tidak sensitif (insensitivity) terhadap eter, coxsackievirus, orphan virus, rhinovirus, dan asam ribonukleat. Kedua, pico-, artinya sangat kecil, digabungkan dengan RNA untuk mendeskripsikan virus RNA yang sangat kecil ini.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Penulis dan editor Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia ID

Picornaviridae ( Italian )

provided by wikipedia IT

Picornaviridae è un'ampia famiglia di virus di piccolissime dimensioni (25-30 nm) appartenenti all'ordine Picornavirales, in possesso di un genoma ad RNA a singolo filamento positivo, che presentano simmetria icosaedrica e sono privi di rivestimento lipidico.

Tassonomia

Struttura

Il nome "Picornaviridae" è derivato da pico che significa piccolo ed RNA con riferimento alla molecola costituente il loro genoma. I Picornaviridae hanno un diametro di 28-30 nm e un capside icosaedrico formato da 32 capsomeri, non possiedono pericapside. Ciascuno dei 12 pentameri è costituito da 5 protomeri a loro volta costituiti da quattro polipeptidi chiamati VP1, VP2, VP3 e VP4, di questi VP2 e VP4 sono i prodotti della proteolisi di VP0. La VP1 su ciascun protomero forma il centro di ciascun capsomero ed è circondata da una fessura di norma chiamata "canyon". Le altre tre proteine circondano il canyon e lo delimitano. I loro capsidi sono molto resistenti a condizioni ambientali estreme tipiche di alcune aree dell'apparato digerente, resistono ai detergenti, tuttavia sono sensibili al pH acido e ad alte temperature. Il loro genoma è costituito da una molecola di RNA di 7,2-8,5 Kb a polarità positiva subito disponibile per essere trascritta da una RNA-polimerasi codificata dal genoma del virus per poi essere tradotta sui ribosomi della cellula infettata. All'estremità 5' l'RNA è associato con la proteina VPg, mentre l'estremità 3' è poliadenilata. Il genoma codifica anche per una proteasi che scinde VP0 in VP2 e VP4.

La replicazione dei picornavirus dura circa 3-4 ore e ciascuna cellula infetta può produrre anche centomila virioni. Il legame di ciascun picornavirus con lo specifico recettore della cellula bersaglio si basa sulla conformazione del canyon che funge da sito di legame per il recettore. I rhinovirus e i coxsackie virus si legano spesso a ICAM-1 (Inter Cellular Adhesion Molecule-1), enterovirus, echovirus e altri coxsackie a CD55, i poliovirus a CD155. Il legame del canyon con il recettore determina il rilascio del polipeptide VP4 dal capside che in questo modo viene indebolito. Il genoma del virus associato a VPg esce tramite un canale presso uno dei vertici formati dalle VP1 e si dirige ai ribosomi dove può essere tradotto grazie al riconoscimento di un'ansa dell'RNA a filamento positivo che mima un mRNA. Alla fine della traduzione la proteina generata viene scissa proteoliticamente da una proteasi codificata dal genoma del virus. Il genoma si replica grazie alla RNA-polimerasi RNA-dipendente del virus che produce uno stampa di RNA a polarità negativa che successivamente viene trascritto nell'RNA a polarità positiva che costituisce il genoma del virus. La replicazione dell'RNA nelle cellule infette produce centinaia di migliaia di copie di genoma virale. Alcuni picornavirus sono in grado di codificare inibitori dei fattori coinvolti nella traduzione degli mRNA cellulari, altri codificano invece per proteasi che scindono le proteine ElF4-G che normalmente legano il cap all'estremità 5' degli mRNA della cellula, infine la sintesi proteica è pressoché bloccata dall'enorme quantità di mRNA virale che compete con quelli cellulari per il legame sui ribosomi. Le proteine del capside si assemblano dapprima a formare un procapside costituito dalle proteine strutturali VP0, VP1 e VP3, successivamente la proteasi virale scinde VP0 in VP2 e VP4 determinando il completamento del capside.

Patogenesi

Alcuni genere dei Picornaviridae sono in grado di infettare gli esseri umani (Cardiovirus, Enterovirus, Hepatovirus, Parechovirus e Kobuvirus)[2], altri gli altri animali (Aphtovirus, Erbovirus, Teschovirus). Per esempio, il genere Enterovirus è costituito da numerosi sierotipi fra i quali si ricordano i poliovirus, il virus dell'epatite virale A e i Rhinovirus, agenti virali in grado di provocare manifestazioni infettive nelle prime vie aeree (raffreddore comune). Gli Enterovirus si replicano a una temperatura ottimale di 37 °C contro i 33 °C (temperatura minore nelle cavità nasali), invece, ottimali per i Rhinovirus. Gli Enterovirus presentano acido-resistenza, sopravvivendo al passaggio nello stomaco, mentre i Rhinovirus, all'opposto sono acido-labili, vedendo in questo il motivo del loro confinamento nelle prime vie aeree.

Note

  1. ^ Martinez-Salas et al., Foot-and-Mouth Disease Virus, in Animal virus: Molecular Biology, Caister Academic Press, 2008, ISBN 978-1-904455-22-6.
  2. ^ Guido Antonelli e Massimo Clementi, Virologia Medica, Seconda Edizione, 2012.

Bibliografia

  • G. Stanway, F. Brown et al.: «Picornaviridae». In: C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London: San Diego, 2005, pp. 757–778
  • Patrick R. Murray, Microbiologia medica, Roma, EMSI, 2008, ISBN 978-88-86669-56-6.
  • Richard Hunt, «Picornaviruses». In:Microbiology and Immunology On-line, Virology, capp. X-XII, University of South Carolina School of Medicine, 2010 (on-line)

 title=
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autori e redattori di Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia IT

Picornaviridae: Brief Summary ( Italian )

provided by wikipedia IT

Picornaviridae è un'ampia famiglia di virus di piccolissime dimensioni (25-30 nm) appartenenti all'ordine Picornavirales, in possesso di un genoma ad RNA a singolo filamento positivo, che presentano simmetria icosaedrica e sono privi di rivestimento lipidico.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autori e redattori di Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia IT

Picornavirus ( Dutch; Flemish )

provided by wikipedia NL

Een picornavirus is een RNA-virus zonder lipide-enveloppe.

Tot de picornavirussen worden onder meer gerekend:

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedia-auteurs en -editors
original
visit source
partner site
wikipedia NL

Picornavirus: Brief Summary ( Dutch; Flemish )

provided by wikipedia NL

Een picornavirus is een RNA-virus zonder lipide-enveloppe.

Tot de picornavirussen worden onder meer gerekend:

rinovirus (verkoudheid) polio ECHO-virus hepatitis A-virus coxsackievirus A en B
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedia-auteurs en -editors
original
visit source
partner site
wikipedia NL

Pikornawirusy ( Polish )

provided by wikipedia POL
 src=
Pikornawirus – Hepatitis A virus (HAV)

Pikornawirusy (łac. Picornaviridae, z gr. pico – bardzo mały (wirus RNA)) – rodzina wirusów, charakteryzujących się następującymi cechami:

  • Symetria: ikosaedralna
  • Otoczka lipidowa: brak
  • Kwas nukleinowy: ssRNA(+), ok. 7,5 tys. par zasad
  • Replikacja: cytoplazma
  • Peptydy i białka: najpierw powstaje pojedyncza poliproteina, która jest z kolei rozcinana na białka kapsydu i poszczególne enzymy niezbędne do rozwoju wirusa
  • Wielkość: 27–30 nm średnicy
  • Gospodarz: kręgowce
  • Cechy dodatkowe: jedna z najliczniejszych rodzin wirusów, wykazujących jedne z najmniejszych rozmiarów oraz powodujących bardzo szeroki zakres chorób, obejmujących wiele narządów.

Podział systematyczny pikornawirusów przedstawia się następująco:

Spośród chorób wywoływanych przez pikornawirusy, największe znaczenie mają:

  • różnego rodzaju przeziębienia – wywoływane są przez rinowirusy, które charakteryzują się występowaniem znacznej ilości serotypów i dlatego nie można wyprodukować przeciwko nim szczepionki
  • poliomyelitis, czyli nagminne porażenie dziecięce – wywoływane jest przez wirusa polio i jeszcze w XX wieku stuleciu stanowiło poważny problem medyczny (do czasu wynalezienia szczepionki)
  • choroby układu pokarmowego i nerwowego, skóry i błon śluzowych – wywoływane są przez enterowirusy
  • wirusowe zapalenie wątroby typu A – wywoływane jest przez HAV i należy do tzw. „chorób brudnych rąk”
  • pryszczyca – choroba wywoływana przez FMDV, która może w pewnych przypadkach wystąpić także u ludzi jako zoonoza

Zobacz też

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autorzy i redaktorzy Wikipedii
original
visit source
partner site
wikipedia POL

Pikornawirusy: Brief Summary ( Polish )

provided by wikipedia POL
 src= Pikornawirus – Hepatitis A virus (HAV)

Pikornawirusy (łac. Picornaviridae, z gr. pico – bardzo mały (wirus RNA)) – rodzina wirusów, charakteryzujących się następującymi cechami:

Symetria: ikosaedralna Otoczka lipidowa: brak Kwas nukleinowy: ssRNA(+), ok. 7,5 tys. par zasad Replikacja: cytoplazma Peptydy i białka: najpierw powstaje pojedyncza poliproteina, która jest z kolei rozcinana na białka kapsydu i poszczególne enzymy niezbędne do rozwoju wirusa Wielkość: 27–30 nm średnicy Gospodarz: kręgowce Cechy dodatkowe: jedna z najliczniejszych rodzin wirusów, wykazujących jedne z najmniejszych rozmiarów oraz powodujących bardzo szeroki zakres chorób, obejmujących wiele narządów.

Podział systematyczny pikornawirusów przedstawia się następująco:

Rodzina: Picornaviridae (Pikornawirusy) Rodzaj: Enterovirus ludzkie enterowirusy (wirusy Coxsackie) Poliovirus, zwyczajowo wirus polio, poliowirus Rodzaj: Rhinvirus (Rinowirusy) Human rhinovirus A (HRV-A) Human rhinovirus B (HRV-B) Rodzaj: Hepatovirus Hepatitis A virus (HAV), zwyczajowo wirus zapalenia wątroby typu A Rodzaj: Cardiovirus Rodzaj: Aphthovirus Foot-and-mouth disease virus (FMDV) – wirus pryszczycy Rodzaj: Parechovirus

Spośród chorób wywoływanych przez pikornawirusy, największe znaczenie mają:

różnego rodzaju przeziębienia – wywoływane są przez rinowirusy, które charakteryzują się występowaniem znacznej ilości serotypów i dlatego nie można wyprodukować przeciwko nim szczepionki poliomyelitis, czyli nagminne porażenie dziecięce – wywoływane jest przez wirusa polio i jeszcze w XX wieku stuleciu stanowiło poważny problem medyczny (do czasu wynalezienia szczepionki) choroby układu pokarmowego i nerwowego, skóry i błon śluzowych – wywoływane są przez enterowirusy wirusowe zapalenie wątroby typu A – wywoływane jest przez HAV i należy do tzw. „chorób brudnych rąk” pryszczyca – choroba wywoływana przez FMDV, która może w pewnych przypadkach wystąpić także u ludzi jako zoonoza
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autorzy i redaktorzy Wikipedii
original
visit source
partner site
wikipedia POL

Picornaviridae ( Portuguese )

provided by wikipedia PT

Os picornavírus (família: Picornaviridae[1]) são pequenos vírus(+)ss RNA icosaédricos, sendo o mais conhecido rinovírus que em seres humanos causa o resfriado comum. A característica mais comum entre todos os membros de picornavírus são: (i) a presença três capsídeos com proteínas Beta Barril cujo genoma se comporta como um mensageiro policistrônico[2]; (ii) tradução mediada por poliproteínas extensas processadas e codificadas por proteases de cisteínas do hospedeiro[3]; e (iii) replicação RNA-polimerase dependente.

A família Picornaviridae inclui 47 gêneros contendo 110 famílias, porém muitos desses vírus requer classificação. Picornavírus causam infecções subclínicas em humanos e animais ou condições vão desde a um leve resfriado até cardiopatias, hepatopatias e neuropatias severas, incluindo óbtidos. Podem ser detetados através do método PCR em secreções humanas, principalmente a de indivíduos infectados e com produção aumentada de secreções em vias aéreas. Crucialmente, oferecem uma vasta capacidade de variação genética caracterizada por mutação e recombinação.

O mecanismo de transmissão primária dessa família ocorre por via fecal-oral e respiratória, sendo que partículas suspensas de secreções em aerossóis são as principais formas de transmissão.

Os picornavírus tem sido essenciais para o desenvolvimento da Virologia[4].

Géneros

Abaixo estão listadas os gêneros que compõem a família Picornaviridae:[5]

Existem também cinco novos géneros propostos:[6]

Referências

  1. «Picornaviridae - Picornaviridae - Picornavirales». International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) (em inglês). Consultado em 30 de janeiro de 2020
  2. http://www.ufrgs.br/labvir/material/poligrafo1.pdf
  3. Kräusslich, H. G.; Nicklin, M. J.; Lee, C. K.; Wimmer, E. (janeiro de 1988). «Polyprotein processing in picornavirus replication». Biochimie. 70 (1): 119–130. ISSN 0300-9084. PMID 2840974. doi:10.1016/0300-9084(88)90166-6
  4. Cifuente, Javier Orlando; Moratorio, Gonzalo (2019). «Evolutionary and Structural Overview of Human Picornavirus Capsid Antibody Evasion». Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (em English). 9. ISSN 2235-2988. doi:10.3389/fcimb.2019.00283
  5. Knowles, N.J., Hovi, T, Hyypiä, T., King, A.M.Q., Lindberg, A.M., Pallansch, M.A., Palmenberg, A.C., Simmonds, P., Skern, T., Stanway, G., Yamashita, T. and Zell, R. (2012). Picornaviridae. In: Virus Taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses: Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Ed: King, A.M.Q., Adams, M.J., Carstens, E.B. and Lefkowitz, E.J. San Diego: Elsevier, pp 855-880.
  6. picornaviridae.com
 title=
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autores e editores de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia PT

Picornaviridae: Brief Summary ( Portuguese )

provided by wikipedia PT

Os picornavírus (família: Picornaviridae) são pequenos vírus(+)ss RNA icosaédricos, sendo o mais conhecido rinovírus que em seres humanos causa o resfriado comum. A característica mais comum entre todos os membros de picornavírus são: (i) a presença três capsídeos com proteínas Beta Barril cujo genoma se comporta como um mensageiro policistrônico; (ii) tradução mediada por poliproteínas extensas processadas e codificadas por proteases de cisteínas do hospedeiro; e (iii) replicação RNA-polimerase dependente.

A família Picornaviridae inclui 47 gêneros contendo 110 famílias, porém muitos desses vírus requer classificação. Picornavírus causam infecções subclínicas em humanos e animais ou condições vão desde a um leve resfriado até cardiopatias, hepatopatias e neuropatias severas, incluindo óbtidos. Podem ser detetados através do método PCR em secreções humanas, principalmente a de indivíduos infectados e com produção aumentada de secreções em vias aéreas. Crucialmente, oferecem uma vasta capacidade de variação genética caracterizada por mutação e recombinação.

O mecanismo de transmissão primária dessa família ocorre por via fecal-oral e respiratória, sendo que partículas suspensas de secreções em aerossóis são as principais formas de transmissão.

Os picornavírus tem sido essenciais para o desenvolvimento da Virologia.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Autores e editores de Wikipedia
original
visit source
partner site
wikipedia PT

Picornavirus ( Swedish )

provided by wikipedia SV

Picornavirus är en familj av enkelsträngade RNA-virus. Det är en av de största virusfamiljerna och inkluderar bland annat viruset som orsakar förkylning. Även viruset som orsakar Hepatit A hör till familjen picornavirus.[1]

Referenser

  1. ^ ”Virus Taxonomy: 2015 Release”. International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). http://ictvonline.org/virusTaxonomy.asp. Läst 19 augusti 2016.
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedia författare och redaktörer
original
visit source
partner site
wikipedia SV

Picornavirus: Brief Summary ( Swedish )

provided by wikipedia SV

Picornavirus är en familj av enkelsträngade RNA-virus. Det är en av de största virusfamiljerna och inkluderar bland annat viruset som orsakar förkylning. Även viruset som orsakar Hepatit A hör till familjen picornavirus.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Wikipedia författare och redaktörer
original
visit source
partner site
wikipedia SV

Пікорнавірус ( Ukrainian )

provided by wikipedia UK

Вірологія

Пікорнавіруси класифікуються за системою класифікації вірусів Балтімора як група IV вірусів, оскільки вони містять одноланцюгову, + РНК з геномом 7,2 - 9,0 тис. основ завдовжки. Як і в більшості вірусів з + РНК геномом , сам генетичний матеріал є досить заразним, хоча й істотно менш вірулентними, ніж вірусна частка, інфекційність РНК зростає при потраплянні в клітини.

Структура

Капсид складається з 60 протомерів, щільно упакованих в структуру ікосаедричної форми. Кожен протомер складається з 4 поліпептидів відомих як VP(вірусний протеїн) 1 , 2 , 3 і 4. VP2 і VP4 поліпептиди походять від одного протомера, відомого як VP0, що розщеплюється, даючи початок різним компонентам капсида. В ікосаедричній структурі 60 трикутників, що утворюють капсид, розділений на 3 маленьких трикутника з субодиницями на вершинах. Залежно від типу та ступеню зневоднення вірусні частинки мають близько 27-30 нм в діаметрі. Геном становить близько 2500 нм в довжину, тому ми можемо зробити висновок, що він має бути щільно упакованим в капсид разом з речовинами, такими як іони натрію для того, щоб звести нанівець негативний заряд на РНК, викликаний фосфатними групами.

Геном

Сам геном - несегментована + РНК (така ж, як мРНК ссавців і читається 5' до 3'). На відміну від ссавців мРНК пікорнавірусів не мають 5' кепу, але натомість до 5' кінця приєднаний вірусом білок, відомий як VPg. Як і мРНК ссавців, геном має полі(А) хвіст на 3'- кінці. Окрім цього, Існує нетранскрипційна область (UTR) на обох кінцях геному пікорнавірусів. 5' UTR, як правило, довший, складаючи близько 500-1200 нуклеотидів в довжину, в порівнянні з 3 ' UTR, що складає лише 30-650 нуклеотидів . Вважається, що 5' UTR важлива в трансляції, а 3' - в зворотньому синтезі синтезу ланцюга, хоча 5' кінець також може також грати роль в проявах вірулентності вірусу. Інша частина генома кодує структурні білки на 5'-кінці і неструктурні білки на 3'-кінці у вигляді єдиного супербілка.

Білки пікорнавірусів

Білки в супербілку організовані таким чином: L-1ABCD-2ABC-3ABCD де кожна літера представляє білок, однак, існують варіації цієї схеми.

Геном пікорнавірусів кодує близько десятка білків забезпечують реплікацію вірусної РНК, перепрограмування клітини, збірку зрілих віріонів. Кодує область геному досить умовно ділять на три ділянки: P1 - кодує структурні білки VP1, VP2, VP3, VP4, з яких будується вірусна частка. P2 і P3 - кодують білки, необхідні для перепрограмування клітини і реплікації :

  • L - лідерний білок, негомологічний у представників різних родів, ряду пікорнавірусів відсутня. У афтовірусов він є протеазою, що відщеплює себе від супербілка, у кардіо- і тешовірусов позбавлений ензимної активності .
  • 2А - негомологічний у представників різних родів пікорнавірусів. Наприклад, у афто - і кардіовірусів - це пептид , який викликає котрансляційний розрив у білкових ланцюгах супербілка, який синтезується, а в ентеро- і риновірусів - серинова протеаза.
  • 2B і 3A - невеликі гідрофобні білки, які беруть участь у змінах мембран клітини, викликаних пікорнавірусами.
  • 2С - цей білок має гомологію з хеліказамиами, входить до складу пікорнавірусного реплікативного комплексу .
  • 3B - це VPg, білок прикріпляється до 5'- кінця вірусної РНК.
  • 3С - цистеїновая протеаза, розрізає супербілок.
  • 3D - РНК- полімераза, фермант синтезу вірусної РНК.

Відтворення

Вірусна частка зв'язується з рецепторами клітинної поверхні. Це викликає конформаційні зміни в вірусних білків капсида, звільняючи міристинову кислоту. Вона утворює пори в клітинній мембрані, через яку впорскується РНК. Потрапивши всередину клітини, РНК "роздягається" і (+) нитки РНК-геному реплікується через дволанцюговий проміжний РНК продукт, який утворюється за участі вірусної РЗРП (РНК-залежної РНК-полімерази).

Трансляція рибосомами клітин-господарів не ініціюється 5' кепом, як зазвичай, а натомість ініціюється входження РНК в сайт зчитування рибосом. Вірусний життєвий цикл відбувається дуже швидко і з усім процесом реплікації триває в середньому 8 годин. Проте всього за 30 хвилин після зараження, синтез білка клітин знижується до майже нульового рівня - макромолекулярний синтез клітинних білків відключається. Протягом наступних 1-2 годин спостерігається втрата межі між еу- та гетерохроматином в ядрі. Як час після зараження сягає близько 3 годин вірусні білки починають синтезуватись і в цитоплазмі близько до ядра з'являється вакуоля, якій вони поступово накопичуються. Після закінчення цього часу плазматичної мембрани клітини стає проникною, через 4-6 годин вірусні частки самозбираються і іноді їх можна побачити в цитоплазмі. Приблизно за 8 годин клітина гине і розпадається, випускаючи вірусні частки.

Деякі дані вказують що пікорнавіруси можуть розмножуватись в клітинах без ядра, оскільки вони не містять ДНК і не потребують ферментів транскрипції. Ефективними препаратами проти таких вірусів є такі, що блокують синтез білка клітиною.

Джерела

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Автори та редактори Вікіпедії
original
visit source
partner site
wikipedia UK

Пикорнавирусы ( Russian )

provided by wikipedia русскую Википедию
 src=
Общая схема строения геномной РНК (A) и процессинга полипротеина пикорнавирусов (B)

Геномная РНК пикорнавирусов содержит в большинстве случаев одну открытую рамку считывания под контролем IRES — участка внутренней посадки рибосомы. Трансляция вирусной РНК приводит к образованию гигантского белка-предшественника, который ещё до завершения синтеза нарезается вирусными протеазами, с образованием зрелых вирусных белков. К 5'-концу вирусной РНК ковалентно прикреплён маленький белок — VPg (от англ. viral protein genome linked, вирусный белок, соединенный с геномом). 3'-конец полиаденилирован (содержит несколько десятков остатков аденина, подобно клеточным мРНК). На 5'- и 3'-концах вирусной РНК располагаются так называемые цис-репликативные элементы (OriL и OriR, соответственно — от англ. origin — начало, Left — левый, Right — правый) — последовательности, необходимые для репликации генома.

Белки пикорнавирусов

Геном пикорнавирусов кодирует около десятка белков, обеспечивающих репликацию вирусной РНК, перепрограммирование клетки, сборку зрелых вирионов. Кодирующую область генома довольно условно делят на три участка: P1 — кодирует структурные белки VP1, VP2, VP3, VP4, из которых строится вирусная частица. P2 и P3 — кодируют белки, необходимые для перепрограммирования клетки и репликации:

  • 2А — негомологичен у представителей разных родов пикорнавирусов. Например, у афто- и кардиовирусов — это пептид, который вызывает ко-трансляционный разрыв в синтезируемой белковой цепи полипротеина, а у энтеро- и риновирусов — сериновая протеаза.
  • 2B и 3A — небольшие гидрофобные белки, принимающие участие в вызываемом пикорнавирусами изменении мембран клетки.
  • 2С — этот белок имеет гомологию с хеликазами, входит в состав пикорнавирусного репликативного комплекса.
  • 3B — это VPg, белок прикрепляющийся к 5'-концу вирусной РНК.
  • 3С — цистеиновая протеаза, разрезающая полипротеин[3].
  • 3D — РНК-полимераза, белок синтезирующий вирусную РНК.
  • L — лидерный белок также негомологичен у представителей разных родов, у ряда пикорнавирусов отсутствует. У афтовирусов он является протеазой, отщепляющей себя от полипротеина, у кардиовирусов и Teschovirus лишен энзиматической активности.

Классификация

По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на март 2017 г. в семейство включают 35 родов[4]:

Примечания

  1. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV).
  2. Атлас по медицинской микробиологии, вирусологии и иммунологии : Учебное пособие для студентов медицинских вузов / Под ред. А. А. Воробьева, А. С. Быкова. — М. : Медицинское информационное агентство, 2003. — С. 117. — ISBN 5-89481-136-8.
  3. Malcolm B. A. The picornaviral 3C proteinases: cysteine nucleophiles in serine proteinase folds. : [англ.] // Protein Sci. — 1995. — Vol. 4, no. 8 (August). — P. 1439—1445.
  4. Таксономия вирусов (англ.) на сайте Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV). (Проверено 23 марта 2017).
  5. Сергеев, Непоклонов, Алипер, 2007, с. 452.
  6. Сергеев, Непоклонов, Алипер, 2007, с. 461.
  7. Сергеев, Непоклонов, Алипер, 2007, с. 457.
  8. 1 2 Сергеев, Непоклонов, Алипер, 2007, с. 448.
license
cc-by-sa-3.0
copyright
Авторы и редакторы Википедии

Пикорнавирусы: Brief Summary ( Russian )

provided by wikipedia русскую Википедию
 src= Общая схема строения геномной РНК (A) и процессинга полипротеина пикорнавирусов (B)

Геномная РНК пикорнавирусов содержит в большинстве случаев одну открытую рамку считывания под контролем IRES — участка внутренней посадки рибосомы. Трансляция вирусной РНК приводит к образованию гигантского белка-предшественника, который ещё до завершения синтеза нарезается вирусными протеазами, с образованием зрелых вирусных белков. К 5'-концу вирусной РНК ковалентно прикреплён маленький белок — VPg (от англ. viral protein genome linked, вирусный белок, соединенный с геномом). 3'-конец полиаденилирован (содержит несколько десятков остатков аденина, подобно клеточным мРНК). На 5'- и 3'-концах вирусной РНК располагаются так называемые цис-репликативные элементы (OriL и OriR, соответственно — от англ. origin — начало, Left — левый, Right — правый) — последовательности, необходимые для репликации генома.

license
cc-by-sa-3.0
copyright
Авторы и редакторы Википедии

微小核糖核酸病毒科 ( Chinese )

provided by wikipedia 中文维基百科
微小核糖核酸病毒科 病毒分类 族: Group IV (+) ssRNA : Enterovirus
Rhinovirus
Hepatovirus
Cardiovirus
Apthovirus
Parechovirus
Erbovirus
Kobuvirus
Teschovirus

微小核糖核酸病毒科(picornaviridae)是沒有套膜、正股RNA、正20面體蛋白殼體的病毒,它的基因體在5'端有一個蛋白是用來當作RNA複製的primer,它的命名pico代表小,rna代表著核醣核酸,故Picornavirus的意思即微小的RNA病毒。微小病毒科根據巴爾的摩分類法歸類為第四綱,基因體大小從7.2kb至9.0kb。微小病毒科的mRNA在5'端並沒有CAP而是一種蛋白質稱為VPg,3'端一樣具有poly A tail,基因體兩端均有UTR(un-translated region,非轉譯區)。
微小病毒科可分為九屬,最常見的為腸病毒屬(Enteroviruses)及鼻病毒屬(Rhinoviruses)。腸病毒主要感染消化系統,可以忍耐低pH值的環境;鼻病毒則感染呼吸道。常見的病源體還有腸病毒70型、克沙奇病毒、A型肝炎、手足口病病毒等。

分類

  • 腸道病毒屬(Enterovirus)-代表種:小兒麻痺症病毒/脊髓灰質炎病毒(Poliovirus)
  • 鼻病毒屬(Rhinovirus)-代表種:人類鼻病毒A(Human rhinovirus A)
  • 肝病毒屬(Hepatovirus)-代表種:肝炎A型病毒(Hepatitis A virus, HAV)
  • 心病毒屬(Cardiovirus)-代表種:腦心肌炎病毒(Encephalomyocarditis virus)
  • 鵝口瘡病毒屬(Aphthovirus)-代表種:口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus)
  • 副腸內細胞病變人類孤兒病毒屬/副腸孤病毒屬(Parechovirus)-代表種:人類副腸內細胞病變人類孤兒病毒/人副腸孤病毒(Human parechovirus)

參考文獻

license
cc-by-sa-3.0
copyright
维基百科作者和编辑

微小核糖核酸病毒科: Brief Summary ( Chinese )

provided by wikipedia 中文维基百科

微小核糖核酸病毒科(picornaviridae)是沒有套膜、正股RNA、正20面體蛋白殼體的病毒,它的基因體在5'端有一個蛋白是用來當作RNA複製的primer,它的命名pico代表小,rna代表著核醣核酸,故Picornavirus的意思即微小的RNA病毒。微小病毒科根據巴爾的摩分類法歸類為第四綱,基因體大小從7.2kb至9.0kb。微小病毒科的mRNA在5'端並沒有CAP而是一種蛋白質稱為VPg,3'端一樣具有poly A tail,基因體兩端均有UTR(un-translated region,非轉譯區)。
微小病毒科可分為九屬,最常見的為腸病毒屬(Enteroviruses)及鼻病毒屬(Rhinoviruses)。腸病毒主要感染消化系統,可以忍耐低pH值的環境;鼻病毒則感染呼吸道。常見的病源體還有腸病毒70型、克沙奇病毒、A型肝炎、手足口病病毒等。

license
cc-by-sa-3.0
copyright
维基百科作者和编辑

ピコルナウイルス科 ( Japanese )

provided by wikipedia 日本語
ピコルナウイルス科 分類(ウイルス) : 第4群(1本鎖RNA +鎖) : ピコルナウイルス目 Picornavirales : ピコルナウイルス科 Picobirnaviridae

ピコルナウイルス科(Family Picornaviridae)とはRNAウイルスの科の一つ。

性状[編集]

本科に属するウイルスは、一本のプラス鎖RNAゲノムとして持つRNAウイルスである。小さなRNA(pico-rna)を持つという意味で名付けられた。エンベロープを持たず、直径22-30nm、正20面体のカプシドを持つ。エーテルには耐性であり、酸(pH3.0以下)でも安定である。ウイルスの増殖は細胞質内で行われる。

分類[編集]

関連項目[編集]

ウイルスの分類(ボルティモア分類) DNA
I: 2本鎖DNAウイルス (dsDNA) カウドウイルス目 ヘルペスウイルス目 Ligamenvirales 未分類
II: 1本鎖DNAウイルス (ssDNA) RNA
III: 2本鎖RNAウイルス (dsRNA)
IV: 1本鎖RNA+鎖 ((+)ssRNA) ニドウイルス目 ピコルナウイルス目 ティモウイルス目 未分類
V:1本鎖RNA-鎖 ((−)ssRNA) モノネガウイルス目 未分類 逆転写
VI: 1本鎖RNA逆転写ウイルス(ssRNA-RT)
VII: 2本鎖DNA逆転写ウイルス (dsDNA-RT) 執筆の途中です この項目は、医学に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めていますプロジェクト:医学Portal:医学と医療)。 執筆の途中です この項目は、生物学に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めていますプロジェクト:生命科学Portal:生物学)。
 title=
license
cc-by-sa-3.0
copyright
ウィキペディアの著者と編集者
original
visit source
partner site
wikipedia 日本語

ピコルナウイルス科: Brief Summary ( Japanese )

provided by wikipedia 日本語

ピコルナウイルス科(Family Picornaviridae)とはRNAウイルスの科の一つ。

license
cc-by-sa-3.0
copyright
ウィキペディアの著者と編集者
original
visit source
partner site
wikipedia 日本語