金丝桃科(学名:Hypericaceae)是真双子叶植物金虎尾目的一科,约有11屬[1]。
本科过去在1982年的克朗奎斯特分类法中被归类为藤黄科(Clusiaceae)[2]。
1998年依分子学研究而建立的被子植物APG分类法将本科列为独立的科,并在随后的2003年APG II、2009年APG III与2016年APG IV中获得确认[3]。
现在已知川苔草科(Podostemaceae)是现存植物中与本科关系最密切的旁系群,其次为胡桐科(Calophyllaceae),然后才是泽茶科(Bonnetiaceae)与藤黄科 [4]。