The species Lloviu cuevavirus (/ˈjɒvjuː ˌkwɛvəˈvaɪrəs/ YOV-ew KWEV-ə-VY-rəs) is the taxonomic home of a virus that forms filamentous virion, Lloviu virus (LLOV). The species is included in the genus Cuevavirus.[1][2] LLOV is a distant relative of the commonly known Ebola virus and Marburg virus.
The species Lloviu cuevavirus is a virological taxon (i.e. a man-made concept) included in the genus Cuevavirus, family Filoviridae, order Mononegavirales.[1] The species has a single virus member, Lloviu virus.[1] Lloviu virus is the sole member of the species Lloviu cuevavirus, which is included genus Cuevavirus, family Filoviridae, order Mononegavirales.[1][2] The name Lloviu virus is derived from Cueva del Lloviu (the name of a Spanish cave in which it was first discovered[1]) and the taxonomic suffix virus (which denotes a virus species).[1]
In 2010, the species and the genus cuevavirus were proposed as independent species and genus.[1] In July 2013, the species and the genus cuevavirus were ratified by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) to be included in its report, therefore the name is now to be italicized.[3]
A virus that fulfills the criteria for being a member of the genus "Cuevavirus" is a member of the species "Lloviu cuevavirus" if it has the properties of "cuevaviruses" (because there is currently only "cuevavirus" species) and if its genome differs from that of Lloviu virus (variant Bat86) by <30% at the nucleotide level.[1]
Lloviu virus (/ˈjɒvjuː/ YOV-yoo;[1] LLOV) is a virus distantly related to the well-known pathogens Ebola virus and Marburg virus.[1][2]
According to the rules for taxon naming established by the International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV), the name Lloviu virus is always to be capitalized (because "Lloviu" is a proper noun), but is never italicized, and may be abbreviated (with LLOV being the official abbreviation).
LLOV was discovered in 2011 in Schreibers's long-fingered bats (species Miniopterus schreibersii) that were found dead in Cueva del Lloviu in 2002, Asturias, Spain, as well as in caves in Spanish Cantabria and in caves in France and Portugal.[2] It has not yet been proven that the virus is the etiological agent of a novel bat disease, but healthy Schreibers' long-fingered bats were not found to contain traces of the viruses, thereby at least suggesting that the virus may be pathogenic for certain bats. Necropsies of dead bats did not reveal macroscopic pathology, but microscopic examination suggested viral pneumonia.[2] No information is available about whether or not LLOV infects humans.[4] However, Cueva del Lloviu is frequented by tourists and no human infections or disease has yet been observed, suggesting that it is possible that LLOV might be the second filovirus that is not pathogenic for humans (the first one being Reston virus (RESTV)).
Seroreactivity of additional Schreibers's long-fingered bats were reported from North Spain from 2015, suggesting the circulation of the virus among those bat colonies. However PCR positive animals were not found.[5]
Additional Schreibers's long-fingered bat die-off events were reported from Hungary in 2013, 2016 and 2017. The presence of LLOV was confirmed in bat carcasses from 2016, presenting hemorrhagic symptoms.[6] Updated genome data was obtained from the Hungarian samples in 2020, using the Nanopore sequencing technique.[7] The infectious virus was isolated from Schreibers's long-fingered bat in Hungary, making it only the third filovirus along with Marburg and Ravn viruses ever isolated from bats.[8]
Although LLOV was isolated in tissue culture, yet its genome has been determined in its entirety with exception of the 3' and 5' UTRs.[2][8] Like all mononegaviruses, LLOV virions contain a non-infectious, linear nonsegmented, single-stranded RNA genome of negative polarity that most likely possesses inverse-complementary 3' and 5' termini, does not possess a 5' cap, is not polyadenylated, and is not covalently linked to a protein.[9] The LLOV genome is probably approximately 19 kb long and contains seven genes in the order 3'-UTR-NP-VP35-VP40-GP-VP30-VP24-L-5'-UTR. In contrast to ebolaviruses and Marburgviruses, which synthesize seven mRNAs to express the seven structural proteins, LLOV seems to produce only six mRNAs, i.e. one mRNA (VP24/L) is thought to be bicistronic. LLOV genomic transcriptional termination sites are identical to those of ebolavirus genomes but different from those of Marburgvirus genomes. LLOV transcriptional initiation sites are unique.[2]
The structure of LLOV virions has not yet been described. Like all other filoviruses, LLOV virions are expected to be filamentous particles that may appear in the shape of a shepherd's crook or in the shape of a "U" or a "6", and they may be coiled, toroid, or branched. Their diameter is expected to be 80 nm in width, but vary in length.[10] The LLOV genome suggests that LLOV particles consist of seven structural proteins. At the center would be the helical ribonucleocapsid, which would consist of the genomic RNA wrapped around a polymer of nucleoproteins (NP). Associated with the ribonucleoprotein would be the RNA-dependent RNA polymerase (L) with the polymerase cofactor (VP35) and a transcription activator (VP30). The ribonucleoprotein would be embedded in a matrix, formed by the major (VP40) and minor (VP24) matrix proteins. These particles would be surrounded by a lipid membrane derived from the host cell membrane. The membrane would anchor a glycoprotein (GP1,2) that projects 7 to 10 nm spikes away from its surface. While nearly identical to ebolavirions and marburgvirions in structure, lloviuvirions may be antigenically distinct from both (just as they are from each other).
The LLOV life cycle is hypothesized to begin with virion attachment to specific cell-surface receptors, followed by internalization, fusion of the virion envelope with endosomal membranes and the concomitant release of the virus nucleocapsid into the cytosol. LLOV glycoprotein (GP) is cleaved by endosomal cysteine proteases (cathepsins) and the cleaved glycoprotein interacts with the intracellular entry receptor, Niemann-Pick C1 (NPC1).[11] The virus RdRp would partially uncoat the nucleocapsid and transcribe the genes into positive-stranded mRNAs, which would then be translated into structural and nonstructural proteins. LLOV L would bind to a single promoter located at the 3' end of the genome. Transcription would either terminate after a gene or continue to the next gene downstream. This means that genes close to the 3' end of the genome would be transcribed in the greatest abundance, whereas those toward the 5' end would be least likely to be transcribed. The gene order would therefore be a simple but effective form of transcriptional regulation. The most abundant protein produced would be the nucleoprotein, whose concentration in the cell would determine when L switches from gene transcription to genome replication. Replication would result in full-length, positive-stranded antigenomes that would in turn be transcribed into negative-stranded virus progeny genome copies. Newly synthesized structural proteins and genomes would self-assemble and accumulate near the inside of the cell membrane. Virions would bud off from the cell, gaining their envelopes from the cellular membrane they bud from. The mature progeny particles would then infect other cells to repeat the cycle.[9]
{{cite journal}}: CS1 maint: uses authors parameter (link) The species Lloviu cuevavirus (/ˈjɒvjuː ˌkwɛvəˈvaɪrəs/ YOV-ew KWEV-ə-VY-rəs) is the taxonomic home of a virus that forms filamentous virion, Lloviu virus (LLOV). The species is included in the genus Cuevavirus. LLOV is a distant relative of the commonly known Ebola virus and Marburg virus.
Lloviu cuevavirus
Le virus Lloviu, ou Lloviu cuevavirus, est un filovirus apparenté au virus Ebola et au virus Marburg mais génétiquement distinct de ces derniers découvert en 2002 dans la Cueva del Lloviu à Villaviciosa dans les Asturies, en Espagne, chez Miniopterus schreibersii[2], une chauve-souris commune dans certaines régions d'Afrique à l'Australie en passant par l'Europe et l'Asie. Cette grotte étant fréquentée depuis longtemps par des touristes sans que des affections particulières aient été relevées, on estime que ce virus n'est pas pathogène pour l'homme.
Les virions du virus Lloviu n'ont pas encore été caractérisés mais on s'attend à ce qu'ils soient semblables à ceux du virus Ebola et du virus Marburg. Le génome du virus Lloviu est structuré comme celui du virus Ebola, avec notamment l'expression de quatre protéines différentes à partir du gène GP[3], contrairement au virus Marburg.
Lloviu cuevavirus
Le virus Lloviu, ou Lloviu cuevavirus, est un filovirus apparenté au virus Ebola et au virus Marburg mais génétiquement distinct de ces derniers découvert en 2002 dans la Cueva del Lloviu à Villaviciosa dans les Asturies, en Espagne, chez Miniopterus schreibersii, une chauve-souris commune dans certaines régions d'Afrique à l'Australie en passant par l'Europe et l'Asie. Cette grotte étant fréquentée depuis longtemps par des touristes sans que des affections particulières aient été relevées, on estime que ce virus n'est pas pathogène pour l'homme.
Les virions du virus Lloviu n'ont pas encore été caractérisés mais on s'attend à ce qu'ils soient semblables à ceux du virus Ebola et du virus Marburg. Le génome du virus Lloviu est structuré comme celui du virus Ebola, avec notamment l'expression de quatre protéines différentes à partir du gène GP, contrairement au virus Marburg.
Lloviu cuevavirus — вид негативно спрямованих одноланцюгових РНК-вірусів родини Філовіруси (Filoviridae).
Вперше вірус виявлений у 2002 році у мертвих довгокрилах звичайних у печері Cueva del Lloviu в Іспанії. Згодом виявлений також у кажанів з Португалії та Франції. Вірус може бути причиною пневмонії у рукокрилих. У 2011 році команда іспанських вчений запропонувала віднести вірус до нового виду та роду Lloviu cuevavirus у родині філовірусів, до якої належать смертельні для людей вірус Ебола та вірус Марбург. На відміну від них, Lloviu cuevavirus непатогенний для людини. У 2013 році Міжнародний комітет з таксономії вірусів затвердив валідним вид Lloviu cuevavirus.
Lloviu cuevavirus — вид негативно спрямованих одноланцюгових РНК-вірусів родини Філовіруси (Filoviridae).
Вперше вірус виявлений у 2002 році у мертвих довгокрилах звичайних у печері Cueva del Lloviu в Іспанії. Згодом виявлений також у кажанів з Португалії та Франції. Вірус може бути причиною пневмонії у рукокрилих. У 2011 році команда іспанських вчений запропонувала віднести вірус до нового виду та роду Lloviu cuevavirus у родині філовірусів, до якої належать смертельні для людей вірус Ебола та вірус Марбург. На відміну від них, Lloviu cuevavirus непатогенний для людини. У 2013 році Міжнародний комітет з таксономії вірусів затвердив валідним вид Lloviu cuevavirus.
Lloviu cuevavirus
Синонимы
Вирус Лловиу (англ. Lloviu cuevavirus) — вид вирусов из монотипного рода Cuevavirus семейства филовирусов (Filoviridae). Вирус получил своё имя по названию пещеры Куэва-дель-Льовью (Cueva del Lloviu), в которой был впервые обнаружен[2].
Впервые вирус был обнаружен в 2002 году у обыкновенных длиннокрылов, найденных мёртвыми в пещере Куэва-дель-Льовью, Астурия и в пещерах в Кантабрии в Испании, а также в пещерах во Франции и Португалии[3]. Еще не доказано, что вирус является возбудителем новой болезни летучих мышей, но у здоровых особей он не обнаружен. Таким образом, патогенность этого вируса для этих животных вполне возможна. Вскрытие мёртвых длиннокрылов не показало макроскопических патологий, но микроскопическое исследование выявило вирусную пневмонию[3]. Пещера Куэва-дель-Льовью часто посещается туристами, однако никакие связанные с этим человеческие инфекции или болезни не наблюдались. Предполагается, что Лловиу является вторым филовирусом, не патогенным для людей (первым является вирус Рестона (RESTV)).
LLOV до сих пор не выделен в культуре тканей или в организмах, но его геном был прочтён в полном объеме за исключением 3'- и 5'-НТО[3]. Как все Mononegavirales, вирус содержит неинфекционный линейный несегментированный одноцепочечный РНК-геном отрицательной полярности, который, скорее всего, обладает обратно-дополнительными 3' и 5' окончаниями, не обладает кэп-структурой, не полиаденилирован и ковалентно не связан с белком[4]. Размер генома — приблизительно 19 кб; он содержит семь генов в порядке 3'-UTR-NP-VP35-VP40-GP-VP30-VP24-L-5'-UTR. В отличие от Ebolavirus и вируса Марбург, которые синтезируют семь мРНК для семи структурных белков, вирус Лловиу производит только шесть мРНК, то есть одна мРНК (VP24/L) является бицистроном. Геномные участки инициации транскрипции вируса Лловиу идентичны таковым эболавируса, но отличаются от таковых марбургского вируса. Участки терминации транскрипции у вируса Лловиу уникальны[3].
Структура вирионов LLOV до сих пор не описана. Предполагается, что как и у других филовирусов, LLOV-вирионы представляют собой нитевидные частицы в форме крюка, «U» или «6» или могут быть свёрнуты в кольцо, тороид или развёрнуты. Их диаметр — 80 нм, но есть различия по длине[5]. Геном вируса позволяет предположить, что LLOV-частицы состоят из семи структурных белков. В центре, вероятно, расположен закрученный рибонуклеокапсид, который состоит из геномной РНК, обернутой вокруг полимера нуклеопротеидов (NP). Вероятно, есть связанная с рибонуклеопротеином РНК-зависимая РНК-полимераза (L) с кофактором полимеразы (VP35) и активатором транскрипции (VP30). Рибонуклеопротеин встроен в матрицу, сформированную главным (VP40) и второстепенным (VP24) матричными белками. Частицы окружены липидной мембраной, полученной из мембраны клетки-хозяина. Мембрана удерживает гликопротеин (GP1,2), который выступает на 7—10 нм от её поверхности. Хоть по структуре вирус Лловиу почти идентичен эболавирусу и марбургскому вирусу, он может антигенно отличаться от обоих (так же, как они друг от друга).
Предположительно, жизненный цикл LLOV начинается с прикрепления вириона к определенным рецепторам поверхности клеток с последующей интернализацией, слиянием вириона с эндосомой и сопутствующим выпуском нуклеокапсида вируса в цитозоль. Гликопротеин (GP) расщепляется эндосомными цистеиновыми протеазами (катепсины), и далее расщепленный гликопротеин взаимодействует с внутриклеточным входным рецептором Niemann-Pick C1 (NPC1)[6]. Вирусная РНК-зависимая РНК-полимераза (L) частично открывает нуклеокапсид и транскрибирует гены в положительные мРНК, на которых синтезируются структурные и неструктурные белки. РНК-полимераза (L) связывается с единственным промотором, расположенным на 3'-конце генома. После транскрибирования гена транскрипция может как продолжиться, так и прекратиться. Это означает, что гены, расположенные близко к 3'-концу генома, транскрибируются чаще, тогда как те, что находятся ближе к 5'-концу, транскрибируются с меньшей вероятностью. Таким образом, порядок генов — это простой, но эффективный способ регуляции транскрипции. В результате самым обильным вырабатываемым белком будет нуклеопротеин. Его концентрация в клетке будет определять, когда L перейдет от транскрипции генов к репликации генома. Репликация даст положительные антигеномы полной длины, которые будут в свою очередь транскрибированы в отрицательные копии генома новых вирионов. Синтезируемые структурные белки и нуклеиновые кислоты самостоятельно собираются и накапливаются около внутренней части клеточной мембраны. Зрелые вирионы отпочковываются от клетки, захватывая участки клеточной мембраны в качестве оболочки. Теперь они готовы заражать новые клетки и повторить цикл[4].
Вирус Лловиу (англ. Lloviu cuevavirus) — вид вирусов из монотипного рода Cuevavirus семейства филовирусов (Filoviridae). Вирус получил своё имя по названию пещеры Куэва-дель-Льовью (Cueva del Lloviu), в которой был впервые обнаружен.
