Thermus thermophilus ist ein gramnegatives Eubakterium und wird in vielen biotechnologischen Prozessen verwendet. Das optimale Wachstum liegt bei 49 bis 72 °C, das Bakterium ist somit sehr thermophil. Thermus thermophilus wurde in heißen Quellen in Japan gefunden und ist in mehrere Subtypen untergliedert. Am häufigsten befasst man sich mit den Subtypen HB8 und HB27, deren Genom 2004 entschlüsselt wurde.[1]
Aus Thermus thermophilus wird eine für die Polymerase-Kettenreaktion relevante thermostabile Polymerase (Tth) gewonnen. Sie katalysiert mit optimaler Aktivität bei 70 bis 80 °C. Das Enzym benötigt zweiwertige Ionen.
Thermus thermophilus ist ein gramnegatives Eubakterium und wird in vielen biotechnologischen Prozessen verwendet. Das optimale Wachstum liegt bei 49 bis 72 °C, das Bakterium ist somit sehr thermophil. Thermus thermophilus wurde in heißen Quellen in Japan gefunden und ist in mehrere Subtypen untergliedert. Am häufigsten befasst man sich mit den Subtypen HB8 und HB27, deren Genom 2004 entschlüsselt wurde.
Aus Thermus thermophilus wird eine für die Polymerase-Kettenreaktion relevante thermostabile Polymerase (Tth) gewonnen. Sie katalysiert mit optimaler Aktivität bei 70 bis 80 °C. Das Enzym benötigt zweiwertige Ionen.
Thermus thermophilus is a Gram-negative bacterium used in a range of biotechnological applications, including as a model organism for genetic manipulation, structural genomics, and systems biology. The bacterium is extremely thermophilic, with an optimal growth temperature of about 65 °C (149 °F). Thermus thermophilus was originally isolated from a thermal vent within a hot spring in Izu, Japan by Tairo Oshima and Kazutomo Imahori.[1] The organism has also been found to be important in the degradation of organic materials in the thermogenic phase of composting.[2] T. thermophilus is classified into several strains, of which HB8 and HB27 are the most commonly used in laboratory environments. Genome analyses of these strains were independently completed in 2004.[3]
Thermus thermophilus is a Gram-negative bacterium with an outer membrane that is composed of phospholipids and lipopolysaccharides. This bacterium also has a thin peptidoglycan (also known as murein) layer, in this layer there are 29 muropeptides which account for more than 85% of the total murein layer. The presence of Ala, Glu, Gly, Orn, N-acetyl glucosamine and N-acetylmuramic were found in the murein layer of this bacterium. Another unique feature of this murein layer is that the N-terminal Gly is substituted with phenylacetic acid. This is the first instance of phenylacetic acid found in the murein of bacterial cells. The composition and peptide cross-bridges found in this murein layer are typical of Gram-positive bacterium, but the amount, the degree of the cross-linkage and length of the glycan chain gives this bacterium its Gram-negative properties.[4]
Thermus thermophilus was originally found within a thermal vent in Japan. These bacteria can be found in a variety of geothermal environments. These Thermophiles require a more stringent DNA repair system, as DNA becomes unstable at high temperatures. The GC content of this bacterium is about 69%, this contributes to the thermostability of this bacterium's genome.[5]
The two most widely used strains in laboratory settings are HB27 and HB8. The strain HB27 is capable of living in an aerobic or anaerobic environment. It has a genome that consists of a main chromosome (1.89Mb long), as well as a megaplasmid, known as pTT27 (0.23Mb long).[6] The chromosome of HB27 contains 1,968 protein coding genes, with 20% of these genes having no known function. While the megaplasmid contains 230 protein coding genes, about 39% of these genes have no known function.[7]
The strain HB8 is also an aerobic organism and is a model organism for systems biology. It has a genome consisting of a plasmid, known as pTT8 (9.3kb long), that is coupled with a chromosome (1.85Mb), as well as a megaplasmid, also known as pTT27 (0.26Mb). This strain was found to be a polyploid organism, with a chromosome and megaplasmid copy number of about four to five.[6]
This organism has been advantageous for industrial biotechnological fields as it is an excellent source of enzymes, more specifically thermozymes. One of these enzymes being the Tth DNA polymerase (rTth to emphasize it being recombinant).
rTth DNA polymerase is a recombinant thermostable DNA polymerase derived from Thermus thermophilus HB8, with optimal activity at 70-80 °C, used in some PCR applications. The enzyme possesses efficient reverse transcriptase activity in the presence of manganese.[8] This enzyme is beneficial for amplification of GC-rich targets and for crude samples. It can be used in applications of PCR, RT-PCR and also primer extension.[9] This polymerase has been shown to be resistant to DNA polymerase inhibitors present in clinical samples, it also has the capacity to detect RNA in the presence of inhibitors. Under the presence of inhibitors, it was shown to detect this RNA at a comparable level with its capacity to detect DNA.[8]
Thermus thermophilus is a Gram-negative bacterium used in a range of biotechnological applications, including as a model organism for genetic manipulation, structural genomics, and systems biology. The bacterium is extremely thermophilic, with an optimal growth temperature of about 65 °C (149 °F). Thermus thermophilus was originally isolated from a thermal vent within a hot spring in Izu, Japan by Tairo Oshima and Kazutomo Imahori. The organism has also been found to be important in the degradation of organic materials in the thermogenic phase of composting. T. thermophilus is classified into several strains, of which HB8 and HB27 are the most commonly used in laboratory environments. Genome analyses of these strains were independently completed in 2004.
Thermus thermophilus es una bacteria gram negativa utilizada en una gran variedad de aplicaciones en biotecnología, incluyéndolo como organismo modelo en la manipulación genética, genómica estructural y biología de sistemas. La bacteria es un termófilo extremo, con una temperatura de crecimiento óptimo a una temperatura de unos 65 °C.Thermus thermophilus fue aislado originalmente en un ambiente de fumarolas hidrotermales en Japón por Tairo Oshima and Kazutomo Imahori.[1] También se ha visto que el organismo es importante en la degradación de materia orgánica en la fase termogénica del compostaje.[2] T. thermophilus se clasifica en varias cadenas, en las cuales HB8 y HB27 son las más comunes y el análisis de su genoma fue completado independientemente en 2004.[3]
Thermus thermophilus es una bacteria gram negativa utilizada en una gran variedad de aplicaciones en biotecnología, incluyéndolo como organismo modelo en la manipulación genética, genómica estructural y biología de sistemas. La bacteria es un termófilo extremo, con una temperatura de crecimiento óptimo a una temperatura de unos 65 °C.Thermus thermophilus fue aislado originalmente en un ambiente de fumarolas hidrotermales en Japón por Tairo Oshima and Kazutomo Imahori. También se ha visto que el organismo es importante en la degradación de materia orgánica en la fase termogénica del compostaje. T. thermophilus se clasifica en varias cadenas, en las cuales HB8 y HB27 son las más comunes y el análisis de su genoma fue completado independientemente en 2004.
Thermus thermophilus é unha especie de bacteria gramnegativa do filo Deinococcus-Thermus usada en diversas aplicacións biotecnolóxicas, como organismo modelo para a manipulación xenética, xenómica estrutural, e bioloxía de sistemas. É un bacilo aeróbico que contén un pigmento amarelo. A bacteria é extremadamente termófila, cunha temperatura óptima de crecemento duns 65 °C. T. thermophilus foi illada orixinalmente nunha fonte termal continental en Izu, Xapón por Tairo Oshima e Kazutomo Imahori. Inicialmente fora denominada Flavobacterium thermophilum e despois foi transferida ao xénero Thermus.[1] O organismo tamén é importante na degradación de materiais orgánicos na fase termoxénica da compostaxe.[2] Existen varias cepas de T. thermophilus, das cales as máis utilizadas nos laboratorios son a HB8 e a HB27. As análises xenómicas destas cepas completáronse independentemente en 2004.[3]
Thermus thermophilus é unha especie de bacteria gramnegativa do filo Deinococcus-Thermus usada en diversas aplicacións biotecnolóxicas, como organismo modelo para a manipulación xenética, xenómica estrutural, e bioloxía de sistemas. É un bacilo aeróbico que contén un pigmento amarelo. A bacteria é extremadamente termófila, cunha temperatura óptima de crecemento duns 65 °C. T. thermophilus foi illada orixinalmente nunha fonte termal continental en Izu, Xapón por Tairo Oshima e Kazutomo Imahori. Inicialmente fora denominada Flavobacterium thermophilum e despois foi transferida ao xénero Thermus. O organismo tamén é importante na degradación de materiais orgánicos na fase termoxénica da compostaxe. Existen varias cepas de T. thermophilus, das cales as máis utilizadas nos laboratorios son a HB8 e a HB27. As análises xenómicas destas cepas completáronse independentemente en 2004.
Thermus thermophilus è un batterio termofilo isolato per la prima volta da una bocca termica all'interno di una sorgente termale a Izu, Giappone da Tairo Oshima e Kazutomo Imahori.[1]
Thermus thermophilus è un batterio termofilo isolato per la prima volta da una bocca termica all'interno di una sorgente termale a Izu, Giappone da Tairo Oshima e Kazutomo Imahori.
Thermus thermophilus – Gram-ujemna eubakteria będąca organizmem skrajnie termofilnym (optymalna temperatura wzrostu to 65 °C). Używana jako organizm modelowy w biotechnologii, biologii molekularnej, inżynierii genetycznej i pokrewnych naukach, a także jako źródło termostabilnych enzymów i innych substancji biologicznych.
Po raz pierwszy odkryta i wyizolowana z gorących źródeł w Japonii przez Tairo Oshime i Kazutomo Imahoriego[1].
Wyróżnia się kilka szczepów T. thermophilus; najpowszechniej używanymi są szczepy HB8 i HB27, których genomy zostały niezależnie zsekwencjonowane w 2004 roku[2].
Z tego organizmu pochodzi używany w nauce enzym – polimeraza DNA rTh (a także zbliżona do niej polimeraza DNA Tth) – rekombinowana, termostabilna polimeraza DNA. Jej temperaturowe optimum aktywności wynosi 70-80 °C. Używana w niektórych reakcjach PCR[3]. W obecności jonów manganu posiada także aktywność odwrotnej transkryptazy[4], co pozwala na przeprowadzenie reakcji syntezy DNA na matrycy RNA (odwrotna transkrypcja), a następnie powielenie powstałego produktu w rekacji PCR (po usunięciu jonów manganu za pomocą czynnika chelatującego), przy pomocy jednego enzymu i mieszaniny reakcyjnej[5].
Ekstrakty (wyciągi, enzymy) z Thermus thermophilus (na etykietach produktów najczęściej jako Thermus thermophilus ferment) są także dodatkami do niektórych kosmetyków, w których mają pełnić rolę antyoksydantów[6] potencjalnie aktywowanych cieplnie (np. podczas mycia, masażu etc.)[7].
Thermus thermophilus – Gram-ujemna eubakteria będąca organizmem skrajnie termofilnym (optymalna temperatura wzrostu to 65 °C). Używana jako organizm modelowy w biotechnologii, biologii molekularnej, inżynierii genetycznej i pokrewnych naukach, a także jako źródło termostabilnych enzymów i innych substancji biologicznych.
Po raz pierwszy odkryta i wyizolowana z gorących źródeł w Japonii przez Tairo Oshime i Kazutomo Imahoriego.
Wyróżnia się kilka szczepów T. thermophilus; najpowszechniej używanymi są szczepy HB8 i HB27, których genomy zostały niezależnie zsekwencjonowane w 2004 roku.
Z tego organizmu pochodzi używany w nauce enzym – polimeraza DNA rTh (a także zbliżona do niej polimeraza DNA Tth) – rekombinowana, termostabilna polimeraza DNA. Jej temperaturowe optimum aktywności wynosi 70-80 °C. Używana w niektórych reakcjach PCR. W obecności jonów manganu posiada także aktywność odwrotnej transkryptazy, co pozwala na przeprowadzenie reakcji syntezy DNA na matrycy RNA (odwrotna transkrypcja), a następnie powielenie powstałego produktu w rekacji PCR (po usunięciu jonów manganu za pomocą czynnika chelatującego), przy pomocy jednego enzymu i mieszaniny reakcyjnej.
Ekstrakty (wyciągi, enzymy) z Thermus thermophilus (na etykietach produktów najczęściej jako Thermus thermophilus ferment) są także dodatkami do niektórych kosmetyków, w których mają pełnić rolę antyoksydantów potencjalnie aktywowanych cieplnie (np. podczas mycia, masażu etc.).
Thermus thermophilus é uma eubactéria Gram negativa usada em uma larga variedade de aplicações biotecnológicas, sendo usada inclusive como modelo para manipulações genéticas, genômica estrutural e biologia sistêmica. A bactéria é extremamente termofílica, com uma temperatura ótima de crescimento ao redor dos 65ºC. A Thermus thermophilus foi isolada pela primeira vez no respiradouro de um gêiser em Izu, no Japão, por Tairo Oshima e Katuzomo Imahori. [1]Esse organismo exerce um papel importante na degradação de materiais orgânicos durante as fases termogênicas da compostagem[2] e foi classificado em diversas cepas, entre as quais a HB8 e a HB27 são as mais usadas em laboratórios. A análise do genoma dessas cepas foi terminada em 2004.[3]
Thermus thermophilus é uma eubactéria Gram negativa usada em uma larga variedade de aplicações biotecnológicas, sendo usada inclusive como modelo para manipulações genéticas, genômica estrutural e biologia sistêmica. A bactéria é extremamente termofílica, com uma temperatura ótima de crescimento ao redor dos 65ºC. A Thermus thermophilus foi isolada pela primeira vez no respiradouro de um gêiser em Izu, no Japão, por Tairo Oshima e Katuzomo Imahori. Esse organismo exerce um papel importante na degradação de materiais orgânicos durante as fases termogênicas da compostagem e foi classificado em diversas cepas, entre as quais a HB8 e a HB27 são as mais usadas em laboratórios. A análise do genoma dessas cepas foi terminada em 2004.
Thermus thermophilus (ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995
Thermus thermophilus (лат.) — вид грамотрицательных бактерий, представители которого широко используются в биотехнологии как модельный организм для генной инженерии, структурной геномики и системной биологии, а также в молекулярной биологии для определения структуры таких многих важных биомолекул, таких как рибосомы или комплекс I. Эта бактерия — экстремальный термофил с оптимальной температурой для роста в 65 °C. Thermus thermophilus был впервые выделен Таиро Ошимой и Кацутомо Имахори из геотермального источника в городе Изу, Япония[1]. Позже было обнаружено, что этот организм играет важную роль в разложении органических веществ во время термогенной фазы образования компоста[2]. Вид подразделяют на несколько штаммов, из которых HB8 и HB27 наиболее часто используются для работы в лаборатории. Анализ генома этих штаммов был независимо сделан в 2004 году[3].
rTth ДНК полимераза — рекомбинантная термостабильная ДНК полимераза из Thermus thermophilus с температурным оптимумом 70—80 °C. Она используется при постановке некоторых видов ПЦР. В присутствии марганца фермент приобретает сильно выраженную активность обратной транскриптазы.
Thermus thermophilus (лат.) — вид грамотрицательных бактерий, представители которого широко используются в биотехнологии как модельный организм для генной инженерии, структурной геномики и системной биологии, а также в молекулярной биологии для определения структуры таких многих важных биомолекул, таких как рибосомы или комплекс I. Эта бактерия — экстремальный термофил с оптимальной температурой для роста в 65 °C. Thermus thermophilus был впервые выделен Таиро Ошимой и Кацутомо Имахори из геотермального источника в городе Изу, Япония. Позже было обнаружено, что этот организм играет важную роль в разложении органических веществ во время термогенной фазы образования компоста. Вид подразделяют на несколько штаммов, из которых HB8 и HB27 наиболее часто используются для работы в лаборатории. Анализ генома этих штаммов был независимо сделан в 2004 году.
サーマス・サーモフィルス(Thermus thermophilus)はグラム陰性の好気性真正細菌である。約75℃に至適生育温度をもち、高度好熱菌に分類される。また、遺伝子操作系が確立されているなどバイオテクノロジーにも応用範囲が広く、遺伝情報学やシステム生物学のモデル生物になっている。サーマス・サーモフィルスの株の中ではHB8株とHB27株が最も有名で、双方とも2004年にゲノムの全塩基配列の解読が完了している。サーマス・サーモフィルスは日本の伊豆の峰温泉にある噴気孔から最初に発見・単離された。
サーマス・サーモフィルス(Thermus thermophilus)はグラム陰性の好気性真正細菌である。約75℃に至適生育温度をもち、高度好熱菌に分類される。また、遺伝子操作系が確立されているなどバイオテクノロジーにも応用範囲が広く、遺伝情報学やシステム生物学のモデル生物になっている。サーマス・サーモフィルスの株の中ではHB8株とHB27株が最も有名で、双方とも2004年にゲノムの全塩基配列の解読が完了している。サーマス・サーモフィルスは日本の伊豆の峰温泉にある噴気孔から最初に発見・単離された。
