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Nodaviridae ( catalan ; valencien )

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Nodaviridae és una família de virus del tipus virus d’ARN monocatenari +. El seu genoma és linear i el virus està sense embolcallar.


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Nodaviridae: Brief Summary ( catalan ; valencien )

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Nodaviridae és una família de virus del tipus virus d’ARN monocatenari +. El seu genoma és linear i el virus està sense embolcallar.


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Nodaviridae ( allemand )

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Nodaviridae ist die Bezeichnung einer Familie unbehüllter Einzelstrang-RNA-Viren von positiver Polarität.[2] Als natürliche Wirte dienen sowohl Wirbeltiere als auch Wirbellose. Zu den Krankheiten, die mit Viren dieser Familie in Verbindung gebracht werden, gehören virale Enzephalopathie und Retinopathie bei Fischen. Es gibt derzeit (Stand März 2021) in der Familie neun vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Spezies (Arten), die sich auf zwei Gattungen verteilen.[3][4]

Etymologie

Der Name der Familie leitet sich ab von dem japanischen Dorf Nodamura in der Präfektur Iwate, wo das Nodamuravirus erstmals aus Mücken der Spezies Culex tritaeniorhynchus [en] isoliert wurde.

Beschreibung

Aufbau

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Leeres Kapsid von GNNV (Seitenansicht und Querschnitt)
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Schemazeichnung eines Virions der Nodaviridae (Seitenansicht und Querschnitt). Modifiziert nach SIB ViralZone.[4]
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Trimer des Kapsidproteins (CP) von Nodamuravirus

Das Virus ist nicht umhüllt und hat ein ikosaedrisches Kapsid (Triangulationszahl T=3) mit einem Durchmesser von 29 bis 35 nm. Das Kapsid ist aus 32 Kapsomeren aufgebaut.[3]

Genom

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Genomkarte der Nodaviridae
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Genom von Flock House virus und funktionelle Karte des Replicase-Proteins A.
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Genomkarte von „Macrobrachium rosenbergii nodavirus“ (MrNV)

Das Genom ist segmentiert: es besteht aus zwei Segmenten, ist also bipartit. Beide Segmente sind lineare Einzelstrang-RNA positiver Polarität. Ihre Länge beträgt 3,1 kb (Kilobasen) bei Segment RNA1 und 1,4 kb bei RNA2. Das 5'-Ende hat ein methyliertes Cap, das 3'-Ende ist nicht polyadenyliert.[3][4]

RNA1 kodiert ein Protein, das mehrere funktionelle Domänen besitzt:

  1. mitochondriales Targeting (eine Art Adressaufkleber)
  2. Transmembrandomäne (um durch die Membran der Mitochondrien durchgelassen zu werden)
  3. RNA-abhängige RNA-Polymerase (RdRp)
  4. eine selbst-interagierende Domäne (englisch self-interaction domain)
  5. RNA-Capping (RNA-Schutzdomäne)

Zusätzlich kodiert RNA1 mir ORF 1b für eine subgenomische RNA3 (Länge 0,4 kb), die für das Protein B2, einen RNA-Silencing-Inhibitor, kodiert.[3]

RNA2 kodiert für einen viralen Kapsidprotein-Vorläufer mit Bezeichnung Protein α. Dieser Vorläufer wird der während der Virusassemblierung an einer konservierten Asn/Ala-Stelle in zwei reife Proteine, das β-Protein (mit 38 kDa – Kilodalton) und das γ-Protein (5 kDa) zerschnitten (auto-cleaved).[3]

Reproduktionszyklus

Die Virus-Replikation erfolgt im Cytoplasma. Der Eintritt in die Wirtszelle erfolgt durch Penetration. Die Replikation folgt dem Modell der für Einzelstrang-RNA-Viren positiver Polarität.[3][4]

Als natürliche Wirte dienen Wirbeltiere und Wirbellose. Die Viruspartikel werden durch Kontakt und Kontamination übertragen.[3][4]

Pathologie

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Vakuolen in der Netzhaut einer mit Bettanodavirus (NNV) infizierten Larve eines australischen Barsches (Percalates novemaculeata).

Zu den Anzeichen einer viralen Nervennekrose verursacht durch Viren der Gattung Bettanodavirus gehören: abnormales Verhalten wie Lethargie, Anorexie, Spiralschwimmen und Veränderung der Pigmentierung. Die Sterblichkeit der betroffenen Populationen kann bis zu 100 % betragen.[5] Mikroskopische Läsionen befinden sich meist im Gehirn, in der Netzhaut und im Rückenmark, wo Nekrosen der Neuronen und das Runde leere Räume, Vakuolen genannt, sind häufig mit der Krankheit assoziiert.

Systematik

Die Mitglieder der Gattung Alphanodavirus wurden ursprünglich aus Insekten isoliert, während die der Gattung Betanodavirus aus Fischen isoliert wurden. Eine kleine Anzahl von Nodoviridae scheint aber außerhalb einer dieser beiden Kladen zu liegen.[3] Das Flock House Virus (FHV) das inzwischen am besten untersuchte Mitglied der Familie, dennoch bleibt Nodamuravirus die Typusspezies der Gattung Alphanodavirus. Nach ICTV setzt sich die Familie wie folgt zusammen (ergänzt um einige Vorschläge nach NCBI):[3]

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Koloriertes Röntgenbeugungsbild eines Nodamuravirus-Partikels

Familie: Nodaviridae

  • Gattung: Alphanodavirus[6]
  • Stamm: Drosophila melanogaster American nodavirus (ANV) SW-2009a
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EM-Aufnahmen von Virionen des Grouper nervous necrosis virus (GNNV)
  • Gattung: Betanodavirus (alias Nervous necrosis virus, NNV)[12][13]
  • Spezies Barfin flounder nervous necrosis virus (BFNNV)
  • Spezies Redspotted grouper nervous necrosis virus (alias Grouper nervous necrosis virus) de: Zackenbarsch-Nervennekrose-Virus (RGNNV bzw. GNNV)
  • Spezies: Striped jack nervous necrosis virus (SJNNV, Typus)
  • Spezies: Tiger puffer nervous necrosis virus (TPNNV)
  • vorgeschlagene Spezies siehe NCBI[14]

Einzelnachweise

  1. a b c d e ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. A. S. Sahul Hameed, A. S. Ninawe, T. Nakai, S. C. Chi, K. L. Johnson, Consortium ICTV Report: ICTV Virus Taxonomy Profile: Nodaviridae.. In: The Journal of General Virology. 100, Nr. 1, Januar 2019, S. 3–4. doi:10.1099/jgv.0.001170. PMID 30431412.
  3. a b c d e f g h i ICTV Report Nodaviridae.
  4. a b c d e Viral Zone. Expasy.
  5. Misao Arimoto, Jun Sato, Keigo Maruyama, Gen Mimura, Iwao Furusawa: Effect of chemical and physical treatments on the inactivation of striped jack nervous necrosis virus (SJNNV). In: Aquaculture. 143, Nr. 1, 1996, S. 15–22. doi:10.1016/0044-8486(96)01261-6.
  6. SIB: Alphanodavirus. Auf: ViralZone.
  7. Nuruddin Unchwaniwala, Hong Zhan, Janice Pennington, Mark Horswill, Johan A. den Boon, Paul Ahlquist: Subdomain cryo-EM structure of nodaviral replication protein A crown complex provides mechanistic insights into RNA genome replication. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. 20. Juli 2020, doi:10.1073/pnas.2006165117, PMID 32690711 (pnas.org [PDF]).
  8. NCBI: Flock House virus (species)
  9. Batsal Devkota et al.: Structural and electrostatic characterization of pariacoto virus: implications for viral assembly, in: Biopolymers 91(7), Juli 2009, S. 530–538, doi:10.1002/bip.21168
  10. NCBI: Alphanodavirus HB-2007/CHN (species)
  11. NCBI: Newington virus (species)
  12. SIB: Betanodavirus. Auf: ViralZone.
  13. Charlotte Axén, Niccolò Vendramin, Anna Toffan: Outbreak of Mortality Associated with Acipenser Iridovirus European (AcIV-E) Detection in Siberian Sturgeon (Acipenser baerii) Farmed in Sweden , in: MDPI Fishes 2018, Band 3, Nr. 4, Special Issue: Viral Diseases of Fish and Shellfish, 42, 16. Oktober 2018, doi:10.3390/fishes3040042
  14. NCBI: unclassified Betanodavirus (list)
  15. Carl J. Franz, Hilary Renshaw, Lise Frezal, Yanfang Jiang, Marie-Anne Félix, David Wang: Orsay, Santeuil and Le Blanc viruses primarily infect intestinal cells in Caenorhabditis nematodes. In: Virology, Band 448, 5. Januar 2014, S. 255–264; doi:10.1016/j.virol.2013.09.024, PMID 24314656, Epub 1. November 2013.
  16. NCBI Taxonomy Browser: Orsay virus (species, equivalent: Orsay nodavirus).
  17. Orsay virus. Auf: Virus-Host DB.
  18. Hongbing Jiang, Carl J. Franz, Guang Wu, Hilary Renshaw, Guoyan Zhao, Andrew E. Firth, David Wang: Orsay virus utilizes ribosomal frameshifting to express a novel protein that is incorporated into virions. In: Virology, Band 450–451, Nr. 100, 2. Februar 2014, S. 213–221; doi:10.1016/j.virol.2013.12.016, PMC 3969245 (freier Volltext), PMID 24503084.
  19. NCBI Taxonomy Browser: Santeuil nodavirus (species).
  20. NCBI Taxonomy Browser: Le Blanc nodavirus (species).
  21. Carl J. Franz, Guoyan Zhao, Marie-Anne Félix, David Wang: Complete Genome Sequence of Le Blanc Virus, a Third Caenorhabditis Nematode-Infecting Virus. In: Journal of Virology, Band 86, Br. 21, 6. Oktober 2012; doi:10.1128/JVI.02025-12, PMID 23043172, PMC 3486331 (freier Volltext). American Society for Microbiology Journals.
  22. D. Qian et al.: Extra small virus-like particles (XSV) and nodavirus associated with whitish muscle disease in the giant freshwater prawn, Macrobrachium rosenbergii. In: Journal of Fish Diseases. Band 26, Nr. 9, September 2003, S. 521–527, PMID 14575370, doi:10.1046/j.1365-2761.2003.00486.x
  23. J.Widada, S. Widada, J. R. Bonami: Characteristics of the monocistronic genome of extra small virus, a virus-like particle associated with Macrobrachium rosenbergii nodavirus: possible candidate for a new species of satellite virus. In: Journal of General Virology. Band 85, Nr. 3, März 2004, S. 643–646, PMID 14993649, doi:10.1099/vir.0.79777-0
  24. NCBI Taxonomy Browser:Macrobrachium rosenbergii nodavirus (species).
  25. SIB: Macronovirus. Auf: ViralZone.
  26. NCBI Taxonomy Browser: unclassified Nodaviridae (Liste).
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Nodaviridae: Brief Summary ( allemand )

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Nodaviridae ist die Bezeichnung einer Familie unbehüllter Einzelstrang-RNA-Viren von positiver Polarität. Als natürliche Wirte dienen sowohl Wirbeltiere als auch Wirbellose. Zu den Krankheiten, die mit Viren dieser Familie in Verbindung gebracht werden, gehören virale Enzephalopathie und Retinopathie bei Fischen. Es gibt derzeit (Stand März 2021) in der Familie neun vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Spezies (Arten), die sich auf zwei Gattungen verteilen.

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Nodaviridae ( anglais )

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Nodaviridae is a family of nonenveloped positive-strand RNA viruses.[1] Vertebrates and invertebrates serve as natural hosts. Diseases associated with this family include: viral encephalopathy and retinopathy in fish. There are nine species in the family, assigned to two genera.[2][3]

History

The name of the family is derived from the Japanese village of Nodamura, Iwate Prefecture where Nodamura virus was first isolated from Culex tritaeniorhynchus mosquitoes.

Virology

Structure

The virus is not enveloped and has an icosahedral capsid (triangulation number = 3) ranging from 29 to 35 nm in diameter. The capsid is constructed of 32 capsomers.[2]

Genome

Flock House virus genome and functional map of replicase protein A.

The genome is linear, positive sense, bipartite (composed of two segments – RNA1 and RNA2) single stranded RNA consisting of 4500 nucleotides with a 5’ terminal methylated cap and a non-polyadenylated 3’ terminal.[2]

RNA1, which is ~3.1 kilobases in length, encodes a protein that has multiple functional domains: a mitochondrial targeting domain, a transmembrane domain, an RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) domain, a self-interaction domain and an RNA capping domain. In addition, RNA1 encodes a subgenomic RNA3 that encodes protein B2, an RNA silencing inhibitor.[2]

RNA2 encodes protein α, a viral capsid protein precursor, which is auto-cleaved into two mature proteins, a 38 kDa β protein and a 5 kDa γ protein, at a conserved Asn/Ala site during virus assembly.[2]

Life cycle

Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the positive stranded RNA virus replication model. Positive stranded RNA virus transcription, using the internal initiation model of subgenomic RNA transcription is the method of transcription. Vertebrates and invertebrates serve as the natural host. Transmission routes are contact and contamination.[2][3]

Taxonomy

The members of the genus Alphanodavirus were originally isolated from insects while those of the genus Betanodavirus were isolated from fish. A small number of nodoviruses seem to lie outside either of these clades.[2] Flock house virus (FHV) is the best studied of the nodaviruses.[2] There are nine species in this family, assigned to two genera:[2]

References

  1. ^ Sahul Hameed, AS; Ninawe, AS; Nakai, T; Chi, SC; Johnson, KL; ICTV Report, Consortium (January 2019). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Nodaviridae". The Journal of General Virology. 100 (1): 3–4. doi:10.1099/jgv.0.001170. PMID 30431412.
  2. ^ a b c d e f g h i "ICTV Report Nodaviridae".
  3. ^ a b "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.

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Nodaviridae: Brief Summary ( anglais )

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Nodaviridae is a family of nonenveloped positive-strand RNA viruses. Vertebrates and invertebrates serve as natural hosts. Diseases associated with this family include: viral encephalopathy and retinopathy in fish. There are nine species in the family, assigned to two genera.

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Nodaviridae ( espagnol ; castillan )

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Nodaviridae es una familia de virus que infectan animales. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. Actualmente hay nueve especies en esta familia, divididas en 2 géneros. Las enfermedades asociadas con esta familia incluyen: encefalopatía viral y retinopatía en peces.[1]

El nombre de la familia se deriva del pueblo japonés Nodamura de la prefectura de Iwate, donde se aisló por primera vez el virus Nodamura de los mosquitos Culex tritaeniorhynchus.[1]

Descripción

Los virus de esta familia tienen cápsides con geometrías icosaédricas y simetría T= 3. El diámetro es de 29 a 35 nm. La cápside está compuesta por 32 capsómeros. No poseen envoltura vírica.[2][3]

El genoma es lineal y de ARN monocatenario positivo con segmentación bipartita (compuesto de dos segmentos, ARN1 y ARN2). El ARN contiene una secuencia de 4500 nucleótidos con una tapa metilada 5 'terminal y una terminal 3' no poliadenilada.[2][3]

El ARN1, que tiene ~ 3,1 kilobases de longitud, codifica una proteína que tiene múltiples dominios funcionales: un dominio de direccionamiento mitocondrial, un dominio transmembrana, un dominio de ARN polimerasa dependiente de ARN (RdRp), un dominio de auto-interacción y un dominio de protección de ARN. Además, el ARN1 codifica un ARN3 subgenómico que codifica la proteína B2, un inhibidor del silenciamiento del ARN. El ARN2 codifica la proteína α, un precursor de la proteína de la cápside viral, que se auto-escinde en dos proteínas maduras, una proteína β de 38 kDa y una proteína γ de 5 kDa, en un sitio Asn / Ala conservado durante el ensamblaje del virus.[2][3]

La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante la penetración en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de replicación de los virus de ARN de cadena positiva. La transcripción de los virus de ARN de cadena positiva, se realiza utilizando el modelo de iniciación interno de la transcripción de ARN subgenómico que es el método de transcripción. Los animales sirven como hospedadores naturales. Las rutas de transmisión son el contacto y la contaminación.[2][3]

Taxonomía

Incluye los siguientes géneros:[2]

Referencias

  1. a b «ICTV Report Nodaviridae».
  2. a b c d e Sahul Hameed, AS; Ninawe, AS; Nakai, T; Chi, SC; Johnson, KL; ICTV Report, Consortium (January 2019). «ICTV Virus Taxonomy Profile: Nodaviridae.». The Journal of General Virology 100 (1): 3-4. PMID 30431412. doi:10.1099/jgv.0.001170.
  3. a b c d «Viral Zone». ExPASy. Consultado el 15 de junio de 2015.
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Nodaviridae: Brief Summary ( espagnol ; castillan )

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Nodaviridae es una familia de virus que infectan animales. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. Actualmente hay nueve especies en esta familia, divididas en 2 géneros. Las enfermedades asociadas con esta familia incluyen: encefalopatía viral y retinopatía en peces.​

El nombre de la familia se deriva del pueblo japonés Nodamura de la prefectura de Iwate, donde se aisló por primera vez el virus Nodamura de los mosquitos Culex tritaeniorhynchus.​

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Nodaviride ( roumain ; moldave )

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Nodaviridele (Nodaviridae) sunt o familie de virusuri cu genom ARN monocatenar liniar cu sens + care cuprinde două genuri: Alphanodavirus, virusuri izolate numai la insecte și Betanodavirus, virusuri izolate la pești marini juvenili la care provoacă o necroza nervoasă virală sau o encefalopatie și retinopatie virală.

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Nodaviride: Brief Summary ( roumain ; moldave )

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Nodaviridele (Nodaviridae) sunt o familie de virusuri cu genom ARN monocatenar liniar cu sens + care cuprinde două genuri: Alphanodavirus, virusuri izolate numai la insecte și Betanodavirus, virusuri izolate la pești marini juvenili la care provoacă o necroza nervoasă virală sau o encefalopatie și retinopatie virală.

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野田病毒科 ( chinois )

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野田病毒科 病毒分类 族: Group IV (+) ssRNA : α野田病毒屬
β野田病毒屬

野田病毒科(Nodaviridae)

分類

  • α野田病毒屬(Alphanodavirus) - 代表種:野田病毒(Nodamura virus)
  • β野田病毒屬(Betanodavirus) - 代表種:條紋梭魚神經壞死症病毒(Striped jack nervous necrosis virus)
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野田病毒科: Brief Summary ( chinois )

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野田病毒科(Nodaviridae)

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