Thermus is a genus of thermophilic bacteria. It is one of several bacteria belonging to the Deinococcota phylum. Thermus species can be distinguished from other genera in the family Thermaceae as well as all other bacteria by the presence of eight conserved signature indels (CSIs) found in proteins such as adenylate kinase and replicative DNA helicase as well as 14 conserved signature proteins (CSPs) that are exclusively shared by members of this genus.[1]
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [2] and the National Center for Biotechnology Information (NCBI).[3][4][5]
Unassigned species:[25]
Thermus is a genus of thermophilic bacteria. It is one of several bacteria belonging to the Deinococcota phylum. Thermus species can be distinguished from other genera in the family Thermaceae as well as all other bacteria by the presence of eight conserved signature indels (CSIs) found in proteins such as adenylate kinase and replicative DNA helicase as well as 14 conserved signature proteins (CSPs) that are exclusively shared by members of this genus.
Thermus es un género del filo Deinococcus-Thermus que es considerado la primera bacteria termófila descubierta y la más estudiada por su fácil cultivo,[1] además de tener gran importancia en Genética procariota, eucariota y viral debido al uso de la enzima termoestable Polimerasa Taq en la reacción en cadena de la polimerasa, lo que permite la duplicación del ADN a gran escala.
La importancia de estos organismos para el conocimiento de la vida termófila fue reafirmada recientemente por la secuenciación completa del genoma de Thermus thermophilus HB27, de gran importancia por su cualidad de ser transformables.[2]
El análisis del genoma ha revelado que estaría conformado por un cromosoma y un plásmido, y que presentaría vías potenciales para la síntesis de metabolitos secundarios isoprenoides y pigmentos carotenoides.[3]
Thermus es un género del filo Deinococcus-Thermus que es considerado la primera bacteria termófila descubierta y la más estudiada por su fácil cultivo, además de tener gran importancia en Genética procariota, eucariota y viral debido al uso de la enzima termoestable Polimerasa Taq en la reacción en cadena de la polimerasa, lo que permite la duplicación del ADN a gran escala.
La importancia de estos organismos para el conocimiento de la vida termófila fue reafirmada recientemente por la secuenciación completa del genoma de Thermus thermophilus HB27, de gran importancia por su cualidad de ser transformables.
El análisis del genoma ha revelado que estaría conformado por un cromosoma y un plásmido, y que presentaría vías potenciales para la síntesis de metabolitos secundarios isoprenoides y pigmentos carotenoides.
Thermus é un xénero de bacterias termófilas, que pertence ao grupo Deinococcus-Thermus. Entre as especies que inclúe salientan as seguintes:[1][2]
A taxonomía actualmente aceptada deste grupo está baseada na LPSN [4] e no NCBI[5] e a filoxenia está baseada en datos do ARNr 16S da LTP 115 do 'The All-Species Living Tree' Project [6]
?T. caliditerrae Ming et al. 2014
?T. caldophilus ♠ Taguchi et al. 1983
?T. eggertssonii ♠ Peters 2008
?T. kawarayensis ♠ Kurosawa et al. 2005
?T. murrieta ♠ Benner et al. 2006
?T. rehai ♠ Lin et al. 2002
?T. tengchongensis Yu et al. 2013
?T. yunnanensis ♠ Gong et al. 2005
T. oshimai Williams et al. 1996
T. filiformis Hudson et al. 1987
T. thermophilus (ex Oshima e Imahori 1974) Manaia et al. 1995
T. composti Vajna et al. 2012
T. antranikianii Chung et al. 2000
T. scotoductus Kristjansson et al. 1994
T. brockianus Williams et al. 1995
T. igniterrae Chung et al. 2000
T. aquaticus Brock e Freeze 1969 (type sp.)
T. arciformis Zhang et al. 2010
T. islandicus Bjornsdottir et al. 2009
Nota:
♠ Cepas que se atopan na lista do NCBI pero non na LPSN.
Thermus é un xénero de bacterias termófilas, que pertence ao grupo Deinococcus-Thermus. Entre as especies que inclúe salientan as seguintes:
Thermus aquaticus Brock & Freeze, 1969. A ADN polimerase (Taq polimerase) desta bacteria termófila é utilizada na técnica da PCR, xa que resiste moi ben as temperaturas utilizadas nese procedemento. Thermus thermophilus. Inicialmente chamouse Flavobacterium thermophilum. O seu encima rTth ADN polimerase úsase en certas aplicacións da PCR. Thermus antranikianii Chung, Rainey, Valente, Nobre, & da Costa, 2000 Thermus igniterrae Chung, Rainey, Valente, Nobre, & da Costa, 2000 Thermus tengchongensis Yu, Yao, Ming, Yin, Zhou, Liu, Tang & Li, 2013Thermus adalah genus dari bakteri termofilik. Thermus adalah salah satu bakteri yang termasuk dalam kelompok Deinococcus–Thermus. Genus ini mencakup spesies berikut:[1][2][3]
Taksonomi yang diterima saat ini berdasarkan List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) [17] dan National Center for Biotechnology Information (NCBI)[18] dan filogeninya berdasarkan LTP rilis 106 berbasis 16S rRNA oleh 'The All-Species Living Tree' Project.[19]
T. oshimai Williams et al. 1996
T. filiformis Hudson et al. 1987
T. thermophilus (ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995
T. composti Vajna et al. 2012
T. antranikianii Chung et al. 2000
T. scotoductus Kristjansson et al. 1994
T. caliditerrae Ming et al. 2014
T. tengchongensis Yu et al. 2013
T. brockianus Williams et al. 1995
T. igniterrae Chung et al. 2000
T. aquaticus Brock and Freeze 1969
T. arciformis Zhang et al. 2010
T. islandicus Bjornsdottir et al. 2009
Catatan:
* Strain yang ditemukan di National Center for Biotechnology Information (NCBI) tetapi tidak terdaftar di List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)
Thermus adalah genus dari bakteri termofilik. Thermus adalah salah satu bakteri yang termasuk dalam kelompok Deinococcus–Thermus. Genus ini mencakup spesies berikut:
"T. caldophilus" * Taguchi et al. 1983 "T. eggertssonii" * Peters 2008 "T. kawarayensis" * Kurosawa et al. 2005 "T. murrieta" * Benner et al. 2006 "T. nonproteolyticus" * 1992 "T. parvatiensis" * Dwivedi et al. 2015 "T. rehai" * Lin et al. 2002 "T. yunnanensis" * Gong et al. 2005 Thermus amyloliquefaciens Yu et al. 2015 Thermus antranikianii Chung, Rainey, Valente, Nobre, & da Costa, 2000 Thermus aquaticus Brock & Freeze, 1969 Thermus arciformis Zhang et al. 2010 Thermus brockianus Williams et al. 1995 Thermus caldifontis Khan et al. 2017 Thermus caliditerrae Ming et al. 2014 Thermus chliarophilus Tenreiro et al. 1995 Thermus composti Vajna et al. 2012 Thermus filiformis Hudson et al. 1987 Thermus igniterrae Chung, Rainey, Valente, Nobre, & da Costa, 2000 Thermus islandicus Bjornsdottir et al. 2009 Thermus oshimai Williams et al. 1996 Thermus tengchongensis Yu, Yao, Ming, Yin, Zhou, Liu, Tang & Li, 2013 Thermus thermophilus (ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995T. antranikianii
T. aquaticus
T. arciformis
T. brockianus
T. caliditerrae
T. chliarophilus
T. composti
T. filiformis
T. igniterrae
T. islandicus
T. oshimai
T. ruber
T. scotoductus
T. silvanus
T. thermophilus
T. thermophilus
テルムス属(Thermus)は、グラム陰性桿菌好気好熱性の真正細菌である。
Thermus属は0.5-0.8μmの桿菌である。通常は糖類、アミノ酸、有機酸などを吸収して好気・従属栄養的に増殖する。一部の種は硝酸塩又は亜硝酸塩を利用することで嫌気的にも増殖できる。至適増殖温度は65-75°C。中性からややアルカリ性を好む。非運動性。陸地海洋双方の熱水噴出孔、温泉、人工熱水環境など広い熱水環境に分布する。
1969年にイエローストーン国立公園から発見された、最初期に報告された高度好熱菌である。それまでは、発酵環境からGeobacillus stearothermophilus(限界生育温度65°C)が報告されていた程度だったが、最高80°Cで増殖できるT. aquaticusの発見はそれまでの常識を打ち破るものであった。その後も報告が続いており、2015年現在18種が登録されている[1]。
タイプ種はT. aquaticusである。T. aquaticusのDNAポリメラーゼはTaqポリメラーゼとして市販されており、幅広い用途で使用される。Taqはその後開発されたPfuポリメラーゼなどに比べれば正確性は低いが、当時使われていたクレノウ断片が各サーマルサイクルごとに失活してしまい都度追加しなければならないのに対し、Taqは熱安定性に優れるためその手間がかからず、ポリメラーゼ連鎖反応の効率を劇的に改善させた。この他、T. thermophilusは好熱細菌のモデル生物として活用されている。ゲノムサイズは200万~250万bp程度であり、7株について解析が完了している。