Els Archaeorhizomyces, membres del Soil Clone Group 1, constitueixen una classe de fongs filamentosos de vida subterrània descoberta l'any 2011. El seu nom deriva del grec i significa antics fongs de les arrels. Es considera que té centenars d'espècies, que són molt comunes i que la seva distribució és cosmopolita. S'han trobat, actualment, aquests fongs en diferents ecosistemes com les pinedes de Suècia, herbassars de Califòrnia i boscos tropicals plujosos de Costa Rica i Austràlia.[2]
Són fongs amb miceli a diferència dels fongs de llevat. La mida comuna és 3-5 µm però n'hi ha fins a 10-15 µm. Creixen lentament en el laboratori.
El descobriment es va publicar en el número del 12 d'agost de la revista Science. Un equip de la Universitat d'Uppsala a Suècia ja feia 12 anys que agafava mostres de les arrels de les plantes fent recerca sobre els fongs simbiòtics micoriza. D'un cultiu de fongs de Nyänget prop d'Umeå es va aïllar una espècie, Archaeorhizomyces finlayi, de la punta de l'arrel d'un pi que estava colonitzat per micoriza.[3]
També han col·laborat en la recerca d'aquesta nova classe de fongs personal de la Universitat de Michigan, Imperial College de Londres i la Universitat d'Aberdeen a Escòcia.
Anna Rosling, Filipa Cox, Karelyn Cruz-Martinez, Katarina Ihrmark, Gwen-Aëlle Grelet, Björn D. Lindahl, Audrius Menkis, and Timothy Y. James Science 12 August 2011: 876-879. [DOI:10.1126/science.1206958]
Els Archaeorhizomyces, membres del Soil Clone Group 1, constitueixen una classe de fongs filamentosos de vida subterrània descoberta l'any 2011. El seu nom deriva del grec i significa antics fongs de les arrels. Es considera que té centenars d'espècies, que són molt comunes i que la seva distribució és cosmopolita. S'han trobat, actualment, aquests fongs en diferents ecosistemes com les pinedes de Suècia, herbassars de Califòrnia i boscos tropicals plujosos de Costa Rica i Austràlia.
Die Archaeorhizomycetes sind eine 2011 neu beschriebene Klasse der Schlauchpilze mit im Moment (Dezember 2014) zwei beschriebenen Arten (Archaeorhizomyces finlayi und Archaeorhizomyces borealis), aber mindestens 100 verschiedenen sogenannten „operational taxonomic units“ (OTUs).
Sie unterscheiden sich von der Schwesterklasse der Taphrinomycetes durch ihr Wachstum auf modifiziertem Melin Norkans Agar(MMN), und ihrer Vergesellschaftung mit den Wurzeln lebender Pflanzen. Molekulargenetisch wird die Klasse durch die (AACAAGTAG) Positionen der 60s Untereinheit und an der (T) Position der 40S Untereinheit relativ zu Saccharomyces cerevisiae unterschieden.
Die Gattung wird gekennzeichnet durch cremeweiße Kolonien auf MMN Agar, die langsam wachsen und federig wirken. Molekulargenetisch wird die Gattung durch die (A) Position der 5,8S rDNA und an der (GCATATCAATAAGGYGAGGA) Positionen der 40S Untereinheit, die Bindungsstelle des ITS4-Primers relativ zu Saccharomyces cerevisiae unterschieden.
Die Typusart Archaeorhizomyces finlayi bildet Kolonien auf dem MMN Medium mit nur wenigen Lufthyphen und einem fedrigen Rand und wurde von einer mykorrizierten Wurzelspitze aus einem gemischten Koniferenwald isoliert. Das Mycel besteht aus 1 bis 2 µm dünnen Hyphen mit einfachen porenlosen Septen. Im Alter werden 3 bis 6 µm große Chlamydosporen mit bis zu vier aufgerichteten Hyphen gebildet. Molekulargenetisch besitzt die Art folgenden ITS Eigenschaften: (TTTGGCGCCCGGTCTATGCC)
Die Archaeorhizomycetes leben an Pflanzenwurzeln und in der Rhizosphäre und sind kosmopolitisch verbreitet. Archaeorhizomyces finlayi wurde bisher aus Skandinavien und Nordamerika isoliert. Sie kommen vermutlich in vielen terrestrischen Ökosystemen vor. Über ihre Lebensweise ist noch sehr wenig bekannt. Anfangs wurde vermutet, dass sie den gesamten Kohlenstoff aus der Pflanzenwurzel beziehen. Sie bilden aber keine bekannte Mykorrhizastruktur aus. Zudem können sie auch auf Nährmedien mit Zellulose und Glucose als einziger C-Quelle wachsen. Dies weist darauf hin, dass sie zumindest an der Zersetzung organischer Substanz beteiligt sein können und nicht den gesamten Kohlenstoff von der Pflanze durch Symbiose beziehen.
Die Archaeorhizomycetes bilden eine Klasse innerhalb der Taphrinomycotina und stehen an der Basis des phylogenetischen Stammbaumes der Schlauchpilze. Sie wurden erst 2011 wissenschaftlich beschrieben. 2014 wurde eine zweite Art, Archaeorhizomyces borealis beschrieben.[1]
ἀρχαῖος archaios bedeutet alt, altertümlich, was sich auf die basale Stellung innerhalb der Schlauchpilze bezieht. ῥιζο rhiza bezieht sich auf Wurzel, und μύκης mýkēs heißt Pilz. Das Epitheton finlayi ehrt den schwedischen Mykologen Roger D. Finlay.
Die Archaeorhizomycetes sind eine 2011 neu beschriebene Klasse der Schlauchpilze mit im Moment (Dezember 2014) zwei beschriebenen Arten (Archaeorhizomyces finlayi und Archaeorhizomyces borealis), aber mindestens 100 verschiedenen sogenannten „operational taxonomic units“ (OTUs).
Archaeorhizomycetes is a class of fungi in the subdivision Taphrinomycotina of the Ascomycota. So far, the class has only one described order, Archaeorhizomycetales, family, Archaeorhizomycetaceae, and genus, Archaeorhizomyces. The class was first described by a team led by Anna Rosling in 2011. Species in the class are globally distributed, and grow in soil and around roots.[1][2] Specific known host trees of various Archaeorhizomyces species include hemlock, spruce, pine and heather, but other species colonise hardwoods generally.[1]
The precise ecological role of the taxa is uncertain. While originally found to be seasonal, suggesting it was dependent on carbon compounds from the roots, when grown in culture, Archaeorhizomyces finlayi, was shown to be able to grow using either glucose or cellulose as its sole source of carbon, suggesting "that it may be involved in decomposition and not require direct carbon transfer from the plant through symbiosis".[1] While the ecological role is not yet clear, preliminary tests suggest that the fungus is neither a pathogen nor an ectomycorrhizal symbiont.[3]
Prior to the description by Rosling and colleagues, Archaeorhizomycetes was referred to as Soil Clone Group 1 or SCGI after it was originally discovered tundra soils and reported in 2003 by Schadt et al.[4] The taxa were only known from ribosomal DNA sequencing but it had been found independently in ecological studies of soil in more than fifty cases worldwide using three different gene regions.[5] However, neither fruit bodies nor spores had been observed.[1]
The name Archaeorhizomyces comes from the Greek arkhaio-, meaning ancient, which is in reference to the basality of the fungus, rhiza, in reference to roots, and mykes, in reference to fungi. Archaeorhizomyces finlayi, (named in honour of Roger D. Finlay) was the first species described. It is known from Scandinavia and North America.[1] A second species Archaeorhizomyces borealis was described in 2014 together with an estimate that the class may consist of close to 500 species based on sequences available in public databases.[6]
Archaeorhizomycetes is a class of fungi in the subdivision Taphrinomycotina of the Ascomycota. So far, the class has only one described order, Archaeorhizomycetales, family, Archaeorhizomycetaceae, and genus, Archaeorhizomyces. The class was first described by a team led by Anna Rosling in 2011. Species in the class are globally distributed, and grow in soil and around roots. Specific known host trees of various Archaeorhizomyces species include hemlock, spruce, pine and heather, but other species colonise hardwoods generally.
The precise ecological role of the taxa is uncertain. While originally found to be seasonal, suggesting it was dependent on carbon compounds from the roots, when grown in culture, Archaeorhizomyces finlayi, was shown to be able to grow using either glucose or cellulose as its sole source of carbon, suggesting "that it may be involved in decomposition and not require direct carbon transfer from the plant through symbiosis". While the ecological role is not yet clear, preliminary tests suggest that the fungus is neither a pathogen nor an ectomycorrhizal symbiont.
Prior to the description by Rosling and colleagues, Archaeorhizomycetes was referred to as Soil Clone Group 1 or SCGI after it was originally discovered tundra soils and reported in 2003 by Schadt et al. The taxa were only known from ribosomal DNA sequencing but it had been found independently in ecological studies of soil in more than fifty cases worldwide using three different gene regions. However, neither fruit bodies nor spores had been observed.
The name Archaeorhizomyces comes from the Greek arkhaio-, meaning ancient, which is in reference to the basality of the fungus, rhiza, in reference to roots, and mykes, in reference to fungi. Archaeorhizomyces finlayi, (named in honour of Roger D. Finlay) was the first species described. It is known from Scandinavia and North America. A second species Archaeorhizomyces borealis was described in 2014 together with an estimate that the class may consist of close to 500 species based on sequences available in public databases.
Los arqueorizomicetos son una clase de hongos clasificados filogenéticamente dentro la subdivisión Taphrinomycotina perteneciente a la división Ascomycota del reino Fungi.
Esta clase fue descrita en 2011 por Rosling, A., Cox, F., Cruz-Martinez, K., Ihrmark, K., Grelet, G.-A., Lindahl, B. D., Menkis, A. & James, T. Y. en el artículo Archaeorhizomycetes: Unearthing an Ancient Class of Ubiquitous Soil Fungi de la revista Science vol 333.
Es una clase de hongos de la división Ascomycota que consta de un solo orden (Archaeorhizomycetales), una sola familia (Archaeorhizomycetaceae), un género (Archaeorhizomyces), y una especie descrita (Archaeorhizomyces finlayi), aunque ya es sabido que hay más especies.[1]
El nombre Archaeorhizomyces proviene del griego arkhaio- , que significa antiguo, que se refiere a la basalidad del hongo, rhiza, en referencia a las raíces, y mykes, en referencia a los hongos. Archaeorhizomyces finlayi , (nombrado en honor de Roger D. Finlay ) fue la primera especie descrita. Una segunda especie Archaeorhizomyces borealis se describió en 2014 junto con una estimación de que la clase puede consistir en cerca de 500 especies basadas en secuencias disponibles en bases de datos públicas.[2]
Antes de la descripción de Rosling y sus colegas, Archaeorhizomycetes se conocía como un grupo muy común y enigmático llamado Grupo de Clones del Suelo 1 o Soil Clone Group 1 (SCGI) después de que se descubriera originalmente en los suelos de tundra y se informara en 2003 por Schadt et al. Los taxones solo se conocían por secuenciación de ADN ribosómico, pero se había encontrado de forma independiente en estudios ecológicos del suelo y los hongos que habitan en él en más de cincuenta casos en todo el mundo utilizando tres regiones genéticas diferentes. Sin embargo, no se han observado cuerpos fructíferos ni esporas.[3]
Los primeros intentos para identificar y clasificar a esta especie basados en el locus ARNr de espaciador transcrito interno (ITS) no permitieron una clasificación filogenética, fue hasta que se secuenciaron fragmentos de locus ARNr más grandes que los aislamientos se redescubrieron como el grupo SCG1. La disponibilidad de cultivos permitió una evaluación grande y confiable de los multilocus filogenéticos con relaciones de vinculación inequívocas entre genes de ARNr y tres regiones de genes codificantes de proteínas. De esta manera se propuso la clase de los Archaeorhizomycetes, la cual es diagnosticable con secuencias de ARNr, dentro de la cual fue descrita la especie tipo Archaeorhizomyces finlayi. Hasta ahora, se han subestimado la cantidad de especies existentes dentro de esta clase, por lo que es un claro ejemplo de la diversidad ignorada dentro del reino Fungi.
La clase Archaeorhizomyces ha sido puesta dentro de la subdivisión Taphrinomycotina por medio de análisis genéticos combinados y separados de dos de tres regiones de genes codificantes de proteínas. En todas las filogenias esta clase es parte de la subdivisión Taphrinomycotina, el cual está demostrado estadísticamente en varios estudios que es un grupo monofilético.[1]
La clase Archaeorhizomycetes está pensada a englobar cientos de especies que posiblemente dominen las comunidades fúngicas subterráneas, están universalmente presentes en raíces y Rizosferas, y aunque muestran especificidad de ecosistemas y una relación de huéspedes con las raíces, su lugar en el árbol de la vida fúngico, así como su nicho ecológico preciso y su ciclo de vida aún son inciertos. Las especies de la clase se distribuyen globalmente y crecen en el suelo y alrededor de las raíces. Los árboles hospedantes específicos conocidos de varias especies de Archaeorhizomyces incluyen la cicuta, abeto, pino y brezo, pero en general otras especies colonizan maderas duras.[1]
A. finlayi, la especie tipo de este grupo, es un hongo micelial de crecimiento lento con hifas delgadas (1 a 2 mm) y septos simples sin poros. La pared de la célula hifal tiene dos capas y aproximadamente 200 nm de grosor. En cultivos, las hifas están recubiertas por material extracelular y entrelazadas en estructuras indiferenciadas. Las células tienen un solo núcleo e incluso pueden llegar a tener más.
En un meta análisis de secuencias disponibles públicamente se distinguieron al menos 100 OTUs (Unidades Taxonómicas Operativas), algo así como un equivalente de especie, de Archaeorhizomycetes y se predijo una diversidad total que excede las 250 OTUs. Se confirmaron las observaciones previas de alta diversidad local con 12 o 20 OTUs por sitio.
El papel ecológico preciso de los taxones es incierto. Si bien originalmente se descubrió que era estacional, lo que sugiere que dependía de los compuestos de carbono de las raíces, cuando se cultivó se demostró que Archaeorhizomyces finlayi podía crecer utilizando glucosa o celulosa como su única fuente de carbono, lo que sugiere que puede participar en la descomposición y no requerir la transferencia directa de carbono de la planta a través de la simbiosis. Si bien el papel ecológico aún no está claro, las pruebas preliminares sugieren que el hongo no es un patógeno ni un simbionte ectomicorrícico.[4]
Los organismos distribuidos globalmente estaban asociados con ecosistemas y hábitats específicos. Las tres OTUs más muestreadas colonizan hábitats ectomicorrícicos típicos, como suelos y raíces de pinos y plantas ericales, las cuales tienen relaciones simbióticas con micorrizas. Aunque esto no quiere decir que los Archaeorhizomycetes formen estructuras micorrizales con las raíces de estos pinos. En cambio, han amplificado secuencias de distintos morfotipos ectomicorrícicos, donde en las semillas estériles de pinos el micelio de A. Finlayi se asocia con las raíces y muestra que comúnmente coexiste con otros hongos en las puntas de las raíces. Cuando son inoculados, no es posible notar alguna preferencia del crecimiento hacia las raíces principales, primarias o secundarias, y no altera la morfología de las puntas de las raíces. A pesar de una falta de estructuras micorrícicas o endofíticas, las semillas inoculadas se mantienen sanas por meses sin señales de patogenicidad fúngica. La especificidad huésped-planta y hábitat aparente demostrada por varias OTUs no es explicada necesariamente por una especificidad por la planta en sí, pero en su lugar puede reflejar una asociación con otros hongos que sí estén asociados a raíces.
Datos: Q15634529
Especies: Archaeorhizomycetes
Los arqueorizomicetos son una clase de hongos clasificados filogenéticamente dentro la subdivisión Taphrinomycotina perteneciente a la división Ascomycota del reino Fungi.
Archaeorhizomycetes Rosling and T. James è una classe del phylum Ascomycota comprendente funghi terricoli noti soltanto attraverso il sequenziamento molecolare. Al momento comprende un solo ordine, Archaeorhizomycetales Rosling and T. James, con una sola famiglia Archaeorhizomycetaceae Rosling and T. James il solo genere Archaeorhizomyces Rosling and T. James[1]. Specie descritte: 2, identificate esclusivamente su base molecolare.
Identificati in tutti i continenti e in una grande varietà di ecosistemi terrestri, questi funghi sono stati segnalati prevalentemente per terreni ricchi di radici, dove rappresentano una delle componenti biotiche più importanti, oltre che su legno marcescente ed altre fonti di carbonio complesse [2]. Il ruolo ecologico dei funghi appartenenti a questa classe, sicuramente implicati nel ciclo del carbonio, non è noto: analisi sperimentali suggeriscono che l'interazione con le piante non sia ne di tipo mutualistico ne di tipo patogeno[2].
Archaeorhizomycetes Rosling and T. James è una classe del phylum Ascomycota comprendente funghi terricoli noti soltanto attraverso il sequenziamento molecolare. Al momento comprende un solo ordine, Archaeorhizomycetales Rosling and T. James, con una sola famiglia Archaeorhizomycetaceae Rosling and T. James il solo genere Archaeorhizomyces Rosling and T. James. Specie descritte: 2, identificate esclusivamente su base molecolare.
Identificati in tutti i continenti e in una grande varietà di ecosistemi terrestri, questi funghi sono stati segnalati prevalentemente per terreni ricchi di radici, dove rappresentano una delle componenti biotiche più importanti, oltre che su legno marcescente ed altre fonti di carbonio complesse . Il ruolo ecologico dei funghi appartenenti a questa classe, sicuramente implicati nel ciclo del carbonio, non è noto: analisi sperimentali suggeriscono che l'interazione con le piante non sia ne di tipo mutualistico ne di tipo patogeno.
Archaeorhizomycetes Rosling & T.Y. James – klasa grzybów z gromady workowców (Ascomycota)[1].
Klasę Archaeorhizomycetes utworzyli Anna Rosling i Timotchy James w 2011 r. Jest to takson monotypowy, do którego należy tylko jeden rodzaj[2]:
Archaeorhizomyces é um gênero de fungo descrito em 2011 que pertence a uma família, ordem e classe monotípicas, respectivamente Archaeorhizomycetaceae, Archaeorhizomycetales e Archaeorhizomycetes.[1] Uma única espécie foi descrita para este gênero, Archaeorhizomyces finlayi, entretanto, muitas outras espécies são conhecidas.
Archaeorhizomyces é um gênero de fungo descrito em 2011 que pertence a uma família, ordem e classe monotípicas, respectivamente Archaeorhizomycetaceae, Archaeorhizomycetales e Archaeorhizomycetes. Uma única espécie foi descrita para este gênero, Archaeorhizomyces finlayi, entretanto, muitas outras espécies são conhecidas.
古根菌綱（學名：Archaeorhizomycetes）是子囊菌門外囊菌亞門下的一個綱，發表於2011年，其下只有一個單型目古根菌目（Archaeorhizomycetales）、一個單型科古根菌科（Archaeorhizomycetaceae）與一個單型屬古根菌屬（Archaeorhizomyces），目前只有兩種物種被發表。古根菌綱下的物種廣泛分佈於全球，除南極洲外在各大洲皆有分布[1]，生長於土壤中植物根部的附近。[2][3]
古根菌綱的學名Archaeorhizomycetes源自於希臘文的Αρχαίο（arkhaio，意為古老，指古根菌綱在子囊菌門的演化樹中，屬於相對較早分支的演化支）與ῤίζα（rhiza，意為根）兩詞[2]。
在古根菌綱發表之前，已有超過50篇研究分析土壤中微生物的DNA樣本時發現了本綱物種的存在，並稱之為「土壤菌株1」（Soil Clone Group 1）。2011年的研究透過rDNA序列的定序，發現這個演化支的真菌屬於外囊菌亞門，且是包含裂殖酵母綱與肺孢子菌綱的演化支之姊妹群[2]。古根菌綱真菌的菌絲體生長緩慢，其菌絲具有兩層細胞壁，表面有一些分泌物，直徑1-2微米，且可能會形成直徑3-6微米的厚垣孢子[2]。本綱物種雖常出現在植物根部，但沒有證據顯示它們可以與植物形成菌根，也沒有證據表明它們是植物病原菌，因此其出現於根部可能是與其他種形成菌根的真菌互動，而非與植物互動所致，且因其可於僅含葡萄糖或僅含纖維素的培養基生長，也可能屬於不直接依賴植物供給有機物的腐生菌[2]，因其生態地位不甚明朗，發現者之一的密西根大學真菌學家提姆西‧詹姆士（Timothy James）稱其為「一種有點無趣的真菌」[4]。古根菌綱的真菌在苔原的生長有季節性，在夏天大量生長，其他季節則闕如[2]。
古根菌綱下第一個發表的物種是與本綱一起發表的Archaeorhizomyces finlayi（英语：Archaeorhizomyces finlayi），其種小名為表彰瑞典農業科學大學的真菌學家Roger D. Finlay對根際生態學的研究貢獻。2014年，發現古根菌綱的研究團隊又發表了本綱的第二個物種Archaeorhizomyces borealis，並根據公開資料庫中的DNA序列資料，估計本綱可能有超過500種未被描述的物種，[5]且這篇研究也做出了外囊菌亞門新的演化樹，其中古根菌綱與粒毛盤菌綱互為姊妹群，兩者皆是外囊菌亞門演化上最早分支的類群[5]。
古根菌綱（學名：Archaeorhizomycetes）是子囊菌門外囊菌亞門下的一個綱，發表於2011年，其下只有一個單型目古根菌目（Archaeorhizomycetales）、一個單型科古根菌科（Archaeorhizomycetaceae）與一個單型屬古根菌屬（Archaeorhizomyces），目前只有兩種物種被發表。古根菌綱下的物種廣泛分佈於全球，除南極洲外在各大洲皆有分布，生長於土壤中植物根部的附近。
고생자낭균속(Archaeorhizomyces)은 외자낭균아문에 속하는 자낭균류 속의 하나이다. 고생자낭균강 (Archaeorhizomycetes), 고생자낭균목(Archaeorhizomycetales), 고생자낭균과(Archaeorhizomycetaceae)의 유일속이다. 이 균류 강은 안나 조슬링(Anna Rosling)이 2011년에 처음 기술했다. 전 세계에 분포하며, 토양과 뿌리 주변에서 발견된다.[1][2]
고생자낭균속(Archaeorhizomyces)은 외자낭균아문에 속하는 자낭균류 속의 하나이다. 고생자낭균강 (Archaeorhizomycetes), 고생자낭균목(Archaeorhizomycetales), 고생자낭균과(Archaeorhizomycetaceae)의 유일속이다. 이 균류 강은 안나 조슬링(Anna Rosling)이 2011년에 처음 기술했다. 전 세계에 분포하며, 토양과 뿌리 주변에서 발견된다.
