noms dans le fil d’Ariane
Els Negativicutes són una classe de bacteris firmicutes, els membres de la qual tenen una composició peculiar de la paret cel·lular i són de tinció gram negativa. La família Veillonellaceae, anteriorment coneguda com a Acidaminococcaceae,[1] va ser considerada membre de la classe Clostridia. El nom Selenobacteria també es refereix a alguns membres d'aquest grup.
Els membres d'aquesta família són anaerobis obligats i es troben en hàbitats com els rius, els llacs i les intestins dels vertebrats. El seu nom es refereix a la seva forma especial: Selene significa lluna, i musa significa banana.[2]
Succinispira mobilis Janssen and O'Farrell 1999
Acidaminococcus Rogosa 1969 emend. Jumas-Bilak et al. 2007
Phascolarctobacterium faecium Del Dot et al. 1994
Succiniclasticum ruminis van Gylswyk 1995
?Anaerospora hongkongensis ♠ Woo et al. 2005
?Desulfosporomusa polytropa ♠ Sass et al. 2004
?Psychrosinus fermentans ♠ Sattley et al. 2008
?Quinella ovalis ♪ Krumholz et al. 1993 (Quin’s Oval)
Veillonella Prévot 1933 emend. Mays et al. 1982
Megasphaera [incl. Anaeroglobus geminatus]
Negativicoccus succinicivorans Marchandin et al. 2010
Dialister [incl. Allisonella histaminiformans]
Anaeromusa acidaminophila Baena et al. 1999
Anaeroarcus burkinensis (Ouattara et al. 1992) Strömpl et al. 1999
Anaerosinus glycerini (Schauder and Schink 1996) Strömpl et al. 1999
Dendrosporobacter quercicolus (Stankewich et al. 1971) Strömpl et al. 2000
Propionispora Biebl et al. 2001
Sporolituus thermophilus Ogg and Patel 2009
Thermosinus carboxydivorans Sokolova et al. 2004
Acetonema longum Kane and Breznak 1992
Pelosinus fermentans Shelobolina et al. 2007
Sporotalea propionica Boga et al. 2007
Sporomusa Möller et al. 1985
Propionispira arboris Schink et al. 1983
Zymophilus Schleifer et al. 1990
Megamonas Shah and Collins 1983
Pectinatus Lee et al. 1978 emend. Juvonen and Suihko 2006
Selenomonas [incl. Schwartzia succinivorans, Centipeda periodontii, Anaerovibrio lipolyticus & Mitsuokella]
Els Negativicutes són una classe de bacteris firmicutes, els membres de la qual tenen una composició peculiar de la paret cel·lular i són de tinció gram negativa. La família Veillonellaceae, anteriorment coneguda com a Acidaminococcaceae, va ser considerada membre de la classe Clostridia. El nom Selenobacteria també es refereix a alguns membres d'aquest grup.
Els membres d'aquesta família són anaerobis obligats i es troben en hàbitats com els rius, els llacs i les intestins dels vertebrats. El seu nom es refereix a la seva forma especial: Selene significa lluna, i musa significa banana.
Negativicutes es un classe de Firmicutes.
The Negativicutes are a class of bacteria in the phylum Bacillota, whose members have a peculiar cell wall with a lipopolysaccharide outer membrane which stains gram-negative, unlike most other members of the Bacillota.[1] Although several neighbouring Clostridia species (firmicute bacteria) also stain gram-negative, the proteins responsible for the unusual diderm structure of the Negativicutes may have actually been laterally acquired from Pseudomonadota (formerly Proteobacteria).[1][2][3][4] Additional research is required to confirm the origin of the diderm cell envelope in the Negativicutes.
Most members of this class are obligate anaerobes, and occur in habitats such as rivers, lakes, and the intestines of vertebrates. They range from spherical forms, such as Megasphaera and Veillonella, to curved rods, as typified by the selenomonads. Selenomonas has a characteristic crescent shape, with flagella inserted on the concave side, while Sporomusa is similar, but nonmotile. Their names refer to this distinctive morphology: selene means moon, and musa means banana.[5]
The class currently consists of 32 validly named genera across three orders and four families.[6][7] The orders Veillonellales and Acidaminococcales each contain a single family, Veillonellaceae and Acidaminococcaceae, respectively, while the order Selenomonadales contains two families, Selenomonadaceae and Sporomusaceae.[7]
Historically, the Negativicutes consisted of a single order, the Selenomonadales, and two families, Veillonellaceae and Acidaminococcaceae based on 16S rRNA gene sequence similarity.[8][5] However, these groupings did not include several members within the Negativicutes that branched outside of the two families. The current taxonomic view is inclusive of these members who have been validly assigned to the families Selenomonadaceae and Sporomusaceae within the emended Selenomonadales order.[7] Molecular markers in the form of conserved signature indels (CSIs) and proteins (CSPs) justify the present taxonomic divisions. These molecular markers are found at each taxonomic rank, and their distribution is in agreement with the observed phylogenetic branching.[9][10]
Many works have implicated that the Negativicutes should be reclassified as an order within the class Clostridia, based on close phylogenetic branching, and the observation that the spore-forming members of the Negativicutes share similar sporulation genes as the Clostridia, and that both stain gram-negative.[9][10] However, the heterogeneity of members within the Negativicutes, as well as the distribution of molecular signatures, supports the view that the Negativicutes are in fact an independent class within the Bacillota, with Clostridia as their closest phylogenetic neighbours.[5][10][11][12] Additionally, several CSIs and CSPs have been found to be uniquely shared among all Negativicutes, while no CSIs have been found to be shared by both Negativicutes and Clostridia.[7]
The currently accepted taxonomy is based on the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[13] and National Center for Biotechnology Information (NCBI)[14]
The Negativicutes are a class of bacteria in the phylum Bacillota, whose members have a peculiar cell wall with a lipopolysaccharide outer membrane which stains gram-negative, unlike most other members of the Bacillota. Although several neighbouring Clostridia species (firmicute bacteria) also stain gram-negative, the proteins responsible for the unusual diderm structure of the Negativicutes may have actually been laterally acquired from Pseudomonadota (formerly Proteobacteria). Additional research is required to confirm the origin of the diderm cell envelope in the Negativicutes.
Most members of this class are obligate anaerobes, and occur in habitats such as rivers, lakes, and the intestines of vertebrates. They range from spherical forms, such as Megasphaera and Veillonella, to curved rods, as typified by the selenomonads. Selenomonas has a characteristic crescent shape, with flagella inserted on the concave side, while Sporomusa is similar, but nonmotile. Their names refer to this distinctive morphology: selene means moon, and musa means banana.
Negativicutes es una clase inusual de bacterias. Fue agrupada hasta hace poco como familia con el nombre de Acidaminococcaceae dentro de Clostridia, su agrupación se justifica principalmente por estudios genéticos, que los colocan en Firmicutes. Apoyando esta clasificación, varias especies son capaces de formar endosporas. Sin embargo, se diferencian de la mayoría de los otros Firmicutes por ser Gram-negativos, pues la composición de su envoltura celular es peculiar.
Los miembros de esta familia son todos anaerobios obligados, y se encuentran en hábitats tales como ríos, lagos e intestinos de vertebrados. Se presentan en formas esféricas, tales como Megasphaera y Veillonella, o con forma de bacilos curvados, típicos de Selenomonas y Sporomusa. Selenomonas tiene forma de media luna característica, con los flagelos insertados en el lado cóncavo, mientras que Sporomusa es similar pero no móvil. Sus nombres se refieren a esta morfología distintiva: "selene" significa la luna y "musa" significa el plátano. El nombre de Selenobacteria también refiere a este grupo.
Datos: Q623144
Especies: Negativicutes
Negativicutes es una clase inusual de bacterias. Fue agrupada hasta hace poco como familia con el nombre de Acidaminococcaceae dentro de Clostridia, su agrupación se justifica principalmente por estudios genéticos, que los colocan en Firmicutes. Apoyando esta clasificación, varias especies son capaces de formar endosporas. Sin embargo, se diferencian de la mayoría de los otros Firmicutes por ser Gram-negativos, pues la composición de su envoltura celular es peculiar.
Los miembros de esta familia son todos anaerobios obligados, y se encuentran en hábitats tales como ríos, lagos e intestinos de vertebrados. Se presentan en formas esféricas, tales como Megasphaera y Veillonella, o con forma de bacilos curvados, típicos de Selenomonas y Sporomusa. Selenomonas tiene forma de media luna característica, con los flagelos insertados en el lado cóncavo, mientras que Sporomusa es similar pero no móvil. Sus nombres se refieren a esta morfología distintiva: "selene" significa la luna y "musa" significa el plátano. El nombre de Selenobacteria también refiere a este grupo.
As Negativicutes son unha clase de bacterias Firmicutes, que teñen unha composición peculiar da súa parede celular que se tingue como gramnegativa, a pesar de que a maioría das Firmicutes son grampositivas. As familias Acidaminococcaceae e Veillonellaceae[1] eran antes consideradas membros da clase Clostridia. O nome Selenobacterias tamén se usa para referirse a algúns membros deste grupo. A descrición deste grupo foi emendada en 2010 e, xunto coas Acidaminococcaceae (familia nova), foi situada na orde Selenomonadales (ordo novus, que sería a única orde do grupo) na clase Negativicutes (classis novus) do filo Firmicutes.
Os membros desta familia son todos anaerobios obrigados, e aparecen en hábitats como ríos, lagos, e os intestinos de vertebrados. Poden ser desde esféricas, como Megasphaera e Veillonella, a bacilos curvados, como as selenomónadas. O xénero Selenomonas ten unha forma característica de crecente, con flaxelos inseridos no seu lado cóncavo, mentres que Sporomusa é similar pero non motil. Os seus nomes refírense a esta morfoloxía distintiva, xa que selene significa lúa, e musa significa banana.[2] Algúns membros do grupo poden formar endósporas.
A clasificación do grupo é complicada, porque un exame máis detallado de membros deste grupo indica que os membros deste clado (grupo Selenomonas-Megasphaera-Sporomusa) son en realidade Clostridia, o que poñería en cuestión o establecemento de Negativicutes coa súa definición actual.[3]
A taxonomía aceptada actualmente deste grupo está baseada na LPSN [4] e no NCBI[5] e foi elaborada baseándose en datos do ARNr 16S da LTP 111 do The All-Species Living Tree Project [6]
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AcidaminococcaceaeSuccinispira mobilis Janssen e O'Farrell 1999
Acidaminococcus Rogosa 1969 emend. Jumas-Bilak et al. 2007
Phascolarctobacterium faecium Del Dot et al. 1994 (type sp.)
Phascolarctobacterium succinatutens Watanabe et al. 2012
Succiniclasticum ruminis van Gylswyk 1995
Veillonellaceae?Anaerospora hongkongensis ♠ Woo et al. 2005
?Desulfosporomusa polytropa ♠ Sass et al. 2004
?Psychrosinus fermentans ♠ Sattley et al. 2008
?Quinella ovalis ♪ Krumholz et al. 1993 (Quin’s Oval)
Notas:
♠ Cepas que se encontran no NCBI, pero que non están listadas na LPSN
♪ Procariotas dos que non hai cultivos axénicos ou puros illados ou dispoñibles.
As Negativicutes son unha clase de bacterias Firmicutes, que teñen unha composición peculiar da súa parede celular que se tingue como gramnegativa, a pesar de que a maioría das Firmicutes son grampositivas. As familias Acidaminococcaceae e Veillonellaceae eran antes consideradas membros da clase Clostridia. O nome Selenobacterias tamén se usa para referirse a algúns membros deste grupo. A descrición deste grupo foi emendada en 2010 e, xunto coas Acidaminococcaceae (familia nova), foi situada na orde Selenomonadales (ordo novus, que sería a única orde do grupo) na clase Negativicutes (classis novus) do filo Firmicutes.
Os membros desta familia son todos anaerobios obrigados, e aparecen en hábitats como ríos, lagos, e os intestinos de vertebrados. Poden ser desde esféricas, como Megasphaera e Veillonella, a bacilos curvados, como as selenomónadas. O xénero Selenomonas ten unha forma característica de crecente, con flaxelos inseridos no seu lado cóncavo, mentres que Sporomusa é similar pero non motil. Os seus nomes refírense a esta morfoloxía distintiva, xa que selene significa lúa, e musa significa banana. Algúns membros do grupo poden formar endósporas.
A clasificación do grupo é complicada, porque un exame máis detallado de membros deste grupo indica que os membros deste clado (grupo Selenomonas-Megasphaera-Sporomusa) son en realidade Clostridia, o que poñería en cuestión o establecemento de Negativicutes coa súa definición actual.
As Negativicutes são uma classe de bactérias Firmicutes, que possuem uma composição peculiar da sua parede celular que se tinge como gram-negativa, ao contrário da maioria das Firmicutes que são gram-positivas. As famílias Acidaminococcaceae e Veillonellaceae eram antes consideradas membros da classe Clostridia.[1] O nome Selenobacteria também é utilizado para referir-se a alguns membros deste grupo. A descrição deste grupo foi emendada em 2010 e, juntamente com as Acidaminococcaceae (família nova), foi colocada na ordem Selenomonadales (ordo novus, que seria a única ordem do grupo) na classe Negativicutes (classis novus) do filo Firmicutes.
Os membros desta família são todos anaeróbios obrigados, e aparecem em habitats como rios, lagos e intestinos de articulados. A sua forma pode variar desde esféricas, como Megasphaera e Veillonella, a bacilos curvados, como as selenomónadas. O género Selenomonas tem uma forma característica curva, com flagelos inseridos no seu lado côncavo, enquanto que a Sporomusa é semelhante, mas não móvel. Os seus nomes referem-se a esta morfologia distintiva, uma vez que selene significa lua, e musa significa banana.[2] Alguns membros do grupo podem formar endósporos.
A classificação do grupo é complicada, porque um exame mais detalhado de membros deste grupo indica que os membros deste clado (grupo Selenomonas-Megasphaera-Sporomusa) são na realidade Clostridia, o que poria em causa o estabelecimento da classe Negativicutes com a sua definição actual.[3]
A taxonomia aceite actualmente deste grupo basea-se na LPSN[4] e no NCBI[5] e foi elaborada baseando-se em dados do ARNr de 16S da LTP 111 do The All-Species Living Tree Project[6]
Succinispira mobilis Janssen e O'Farrell 1999
Acidaminococcus Rogosa 1969 emend. Jumas-Bilak et al. 2007
Phascolarctobacterium faecium Del Dot et al. 1994 (type sp.)
Phascolarctobacterium succinatutens Watanabe et al. 2012
Succiniclasticum ruminis van Gylswyk 1995
?Anaerospora hongkongensis ♠ Woo et al. 2005
?Desulfosporomusa polytropa ♠ Sass et al. 2004
?Psychrosinus fermentans ♠ Sattley et al. 2008
?Quinella ovalis ♪ Krumholz et al. 1993 (Quin’s Oval)
?Sporotalea colonica ♠ Ezaki et al. 2008
Sporomusa Möller et al. 1985
Sporolituus thermophilus Ogg e Patel 2009
Thermosinus carboxydivorans Sokolova et al. 2004
Veillonella Prévot 1933 emend. Mays et al. 1982
Megasphaera [incl. Anaeroglobus geminatus]
Negativicoccus succinicivorans Marchandin et al. 2010
Dialister [incl. Allisonella histaminiformans]
Anaeromusa acidaminophila Baena et al. 1999
Anaeroarcus burkinensis (Ouattara et al. 1992) Strömpl et al. 1999
Acetonema longum Kane e Breznak 1992
Pelosinus Shelobolina et al. 2007
Propionispora Biebl et al. 2001
Dendrosporobacter quercicolus (Stankewich et al. 1971) Strömpl et al. 2000
Anaerosinus glycerini (Schauder e Schink 1996) Strömpl et al. 1999
Propionispira arboris Schink et al. 1983
Zymophilus Schleifer et al. 1990
Megamonas Shah e Collins 1983
Pectinatus Lee et al. 1978 emend. Juvonen e Suihko 2006
Anaerovibrio lipolyticus Hungate 1966
Selenomonas [incl. Schwartzia succinivorans, Centipeda periodontii & Mitsuokella]
Notas:
♠ Cepas que se encontram no NCBI, mas que não estão listadas na LPSN
♪ Procariotas em que não existem cultivos axénicos (puros) isolados ou disponíveis.
As Negativicutes são uma classe de bactérias Firmicutes, que possuem uma composição peculiar da sua parede celular que se tinge como gram-negativa, ao contrário da maioria das Firmicutes que são gram-positivas. As famílias Acidaminococcaceae e Veillonellaceae eram antes consideradas membros da classe Clostridia. O nome Selenobacteria também é utilizado para referir-se a alguns membros deste grupo. A descrição deste grupo foi emendada em 2010 e, juntamente com as Acidaminococcaceae (família nova), foi colocada na ordem Selenomonadales (ordo novus, que seria a única ordem do grupo) na classe Negativicutes (classis novus) do filo Firmicutes.
Os membros desta família são todos anaeróbios obrigados, e aparecem em habitats como rios, lagos e intestinos de articulados. A sua forma pode variar desde esféricas, como Megasphaera e Veillonella, a bacilos curvados, como as selenomónadas. O género Selenomonas tem uma forma característica curva, com flagelos inseridos no seu lado côncavo, enquanto que a Sporomusa é semelhante, mas não móvel. Os seus nomes referem-se a esta morfologia distintiva, uma vez que selene significa lua, e musa significa banana. Alguns membros do grupo podem formar endósporos.
A classificação do grupo é complicada, porque um exame mais detalhado de membros deste grupo indica que os membros deste clado (grupo Selenomonas-Megasphaera-Sporomusa) são na realidade Clostridia, o que poria em causa o estabelecimento da classe Negativicutes com a sua definição actual.
