Die Virgaviridae sind eine Familie von einzelsträngigen RNA-Viren mit positiver Polarität. Ihre natürlichen Wirte sind Pflanzen.[3][4][5][6] Derzeit gibt es mindestens 59 Arten in dieser Familie, aufgeteilt in 7 Gattungen.[4][5][7] Der Name der Familie leitet sich von lateinisch virga ‚Stock, Stab‘,[8] auch ‚Stange‘, ab (da alle Viren in dieser Familie stab- oder stangenförmig sind).
Die Virusteilchen (Virionen) der Virgaviridae sind nicht umhüllt, ihre Geometrie ist starr stabförmig und sie haben eine mit helikale Symmetrie. Der Durchmesser liegt bei 20–25 nm,[4][5] Die Virionen haben einen zentralen „Kanal“. RNARNARNA Das Genom besteht aus einer linearen, einzelsträngigen Positiv-Sense-RNA[4][5] mit einer 3'-tRNA-ähnlichen Struktur und keinem Poly-A-Schwanz. Das Genom kann je nach Gattung in einem, zwei oder drei Segmenten vorliegen (mono-, bi- oder tripartit). Die Hüllproteine haben eine Größe von 19 bis 24 Kilodalton.[4][5]
Replikation der Virusteilchen ist cytoplasmatisch (d. h. sie findet im Zytoplasma statt) und folgt dem Replikationsmodell von Positivstrang-RNA-Viren. Ebenso ist die Transkriptionsmethode die übliche für Positivstrang-RNA-Viren. Die Übersetzung benutzt durch Leaky-Scanning (en) und Unterdrückung der Terminierung. [4][5]
Die natürlichen Wirte sind Pflanzen.[4][5]
Die innere Systematik der Virgaviridae ist nach dem International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand März 2019 wie folgt:[9]
Familie Virgaviridae
Koonin et al haben 2015 die Virgaviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[13] Schwestergruppe ist danach die Familie Closteroviridae. Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:[14]
„Alphavirus-like superfamily“Alphatetraviridae,[15] (mit Helicoverpa armigera stunt virus)
Carmotetraviridae[16] (mit Providence virus)
Permutotetraviridae[17] (mit Thosea asigna virus)
?Birnaviridae (dsRNA)
Tymovirales (Ordnung)
Endornaviridae[18] (dsRNA, mit Oryza sativa alphaendornavirus)
Togaviridae (mit Alphavirus)
?Matonaviridae (mit Rötelnvirus — vom ICTV 2019 aus den Togaviridae ausgegliedert)
?Nodaviridae[19] (mit Boolarravirus)
Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.
Obwohl ihre Mitglieder stäbchenförmig sind und Pflanzen infizieren gehört die Gattung Benyvirus nicht zu dieser Familie, sondern zu den Benyviridae; die Proteine der beiden Gruppen sind offenbar nur weitläufig verwandt.[20] Eine weitere verwandte Gattung ist vorschlagsgemäß Charavirus mit den Spezies Charavirus canadensis (CV-Can) und Charavirus australis (CV-Aus), diese Viren befallen Charophyten.[21]
Die Virgaviridae sind eine Familie von einzelsträngigen RNA-Viren mit positiver Polarität. Ihre natürlichen Wirte sind Pflanzen. Derzeit gibt es mindestens 59 Arten in dieser Familie, aufgeteilt in 7 Gattungen. Der Name der Familie leitet sich von lateinisch virga ‚Stock, Stab‘, auch ‚Stange‘, ab (da alle Viren in dieser Familie stab- oder stangenförmig sind).
Virgaviridae is a family of positive-strand RNA viruses. Plants serve as natural hosts.[1][2][3][4] The name of the family is derived from the Latin word virga (rod), as all viruses in this family are rod-shaped. There are currently 59 species in this family, divided among seven genera.[2][3][5]
Viruses in Virgaviridae are non-enveloped, with rigid helical rod geometries, and helical symmetry. The diameter is around 20-25 nm,[2][3] and virions have a central "canal." Genomes are linear, single-stranded, positive sense RNA[2][3] with a 3'-tRNA like structure and no polyA tail. They may be in one, two, or three segments, depending on the genus. Coat proteins are about 19–24 kiloDaltons.
Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the positive stranded RNA virus replication model. Positive stranded RNA virus transcription is the method of transcription. Translation takes place by leaky scanning, and suppression of termination. The virus exits the host cell by tripartite non-tubule guided viral movement, and monopartite non-tubule guided viral movement. Plants serve as the natural host.[2][3]
Viruses include in the family Virgaviridae are characterized by unique alpha-like replication proteins.
The following genera are recognized:
The genus Benyvirus, although its members are rod shaped and infect plants, is not included in this family as its proteins appear to be only very distantly related, but is instead included in the family Benyviridae.[6] Another related genus is Charavirus. Viruses of this genus infect charophyte algae.
Virgaviridae is a family of positive-strand RNA viruses. Plants serve as natural hosts. The name of the family is derived from the Latin word virga (rod), as all viruses in this family are rod-shaped. There are currently 59 species in this family, divided among seven genera.
Virgaviridae es una familia de virus de ARN monocatenario positivo que infectan plantas. Actualmente hay 59 especies en esta familia, divididas entre 7 géneros.[1] El nombre de la familia se deriva de la palabra latina virga (barra), ya que todos los virus de esta familia tienen forma de barra.[2] Incluye al primer virus descrito el "virus del mosaico del tabaco".
Los virus de esta familia no tienen la envoltura vírica y su forma tiene geometrías rígidas de varillas helicoidales y simetría helicoidal. El diámetro es de alrededor de 20-25 nm y los viriones tienen un "canal" central. Los genomas son de ARN lineal y pueden estar compuesto de tres segmentos. Las proteínas de la cápside son de aproximadamente 19-24 kiloDaltons. La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante penetración.[3][4][5]
Aunque los miembros del género Benyovirus tienen forma de barra e infectan plantas, no están incluidos en esta familia ya que sus proteínas parecen estar muy distantemente relacionadas con esta familia y por ello están incluidos en la familia Benyviridae. Otro género relacionado es el Charavirus que infecta las algas carófitas.[6]
Incluye los siguientes géneros:[2]
Datos: Q3560593
Multimedia:
Especies: Virgaviridae
Virgaviridae es una familia de virus de ARN monocatenario positivo que infectan plantas. Actualmente hay 59 especies en esta familia, divididas entre 7 géneros. El nombre de la familia se deriva de la palabra latina virga (barra), ya que todos los virus de esta familia tienen forma de barra. Incluye al primer virus descrito el "virus del mosaico del tabaco".
Los virus de esta familia no tienen la envoltura vírica y su forma tiene geometrías rígidas de varillas helicoidales y simetría helicoidal. El diámetro es de alrededor de 20-25 nm y los viriones tienen un "canal" central. Los genomas son de ARN lineal y pueden estar compuesto de tres segmentos. Las proteínas de la cápside son de aproximadamente 19-24 kiloDaltons. La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante penetración.
Aunque los miembros del género Benyovirus tienen forma de barra e infectan plantas, no están incluidos en esta familia ya que sus proteínas parecen estar muy distantemente relacionadas con esta familia y por ello están incluidos en la familia Benyviridae. Otro género relacionado es el Charavirus que infecta las algas carófitas.
Les Virgaviridae sont une famille de phytovirus à ARN à simple brin à polarité positive. Ces virus sont rattachés à la classe IV de la classification Baltimore.
Cette famille a été créée en 2008 pour regrouper six genres jusqu'alors non rattachés à une famille. Elle regroupe tous les virus de plantes en bâtonnets, à l'exception du genre Benyvirus dont les membres sont plus éloignés selon l'analyse phylogénétique de la polymérase, et différents par leur génome polyadénylé. Le nom de la famille est dérivé du latin virga, « baguette », en référence à la forme des particules virales[2].
Le génome est selon les genres mono-, bi- ou tripartite. Les virions sont constitués d'une capside non-enveloppée, en forme de bâtonnet à symétrie hélicoïdale, d'un diamètre de 20 nm environ.
La famille des Virgaviridae comprend les six genres suivants :
La transmission de ces virus se fait par diverses voies qui diffèrent selon les genres : par simple contact entre plantes, par inoculation mécanique (réalisée expérimentalement chez tous les genres), par des nématodes, par des champignons ou par les graines.
La famille a globalement une large gamme de plantes-hôtes mono- et dicotylédones, mais la gamme d'hôtes de chacun des virus est généralement assez restreinte.
Les Virgaviridae sont une famille de phytovirus à ARN à simple brin à polarité positive. Ces virus sont rattachés à la classe IV de la classification Baltimore.
Cette famille a été créée en 2008 pour regrouper six genres jusqu'alors non rattachés à une famille. Elle regroupe tous les virus de plantes en bâtonnets, à l'exception du genre Benyvirus dont les membres sont plus éloignés selon l'analyse phylogénétique de la polymérase, et différents par leur génome polyadénylé. Le nom de la famille est dérivé du latin virga, « baguette », en référence à la forme des particules virales.
Le génome est selon les genres mono-, bi- ou tripartite. Les virions sont constitués d'une capside non-enveloppée, en forme de bâtonnet à symétrie hélicoïdale, d'un diamètre de 20 nm environ.
La famille des Virgaviridae comprend les six genres suivants :
Furovirus ; espèce-type : virus de la mosaïque du blé Hordeivirus ; espèce-type : virus de la mosaïque striée de l'orge Pecluvirus ; espèce-type : virus du rabougrissement de l'arachide Pomovirus ; espèce-type : virus de la fasciation de la pomme de terre Tobamovirus ; espèce-type : virus de la mosaïque du tabac Tobravirus ; espèce-type : virus du rattle du tabacLa transmission de ces virus se fait par diverses voies qui diffèrent selon les genres : par simple contact entre plantes, par inoculation mécanique (réalisée expérimentalement chez tous les genres), par des nématodes, par des champignons ou par les graines.
La famille a globalement une large gamme de plantes-hôtes mono- et dicotylédones, mais la gamme d'hôtes de chacun des virus est généralement assez restreinte.
Virgaviridae è una famiglia di virus a ssRNA positivo dell'ordine Martellivirales. Comprende virus che infettano le piante, tra cui il primo virus scoperto, il virus del mosaico del tabacco. La famiglia fu istituita nel 2007 a seguito di indagini di filogenetica molecolare.
Il virione, privo del peplos, è a forma di asta (da cui l'etimologia del nome della famiglia, dal latino virga, "verga"), a simmetria elicoidale con un canale assiale.[1] Ha un diametro di 20-25 nm, il passo misura circa 2,5 nm e la lunghezza varia in base al genere.[2][1] Il capside è costituito da copie multiple di una proteina di 17-24 kDa, a seconda del virus, detta CP[2] e, nei generi Furovirus e Pomovirus, è presente all'estremità del virione un'ulteriore proteina derivante dal readthrough ribosomiale del codone di stop del gene che codifica la proteina del capside, chiamata CP-RT.[3]
Il genoma è composto da singoli filamenti di RNA positivi, di numero variabile a seconda del genere. All'estremità 5' è presente un cappuccio m7GpppG e l'estremità 3', priva di una coda poliadenilata, assume la forma di un tRNA che lega la tirosina, la valina e l'istidina rispettivamente nei generi Hordeivirus, Pomovirus e Tobamovirus. Nel genere Tobravirus non lega nessun aminoacido. L'ORF di dimensioni maggiori codifica per una proteina di replicazione avente i domini della metiltransferasi, dell'elicasi. La RNA replicasi è espressa tramite readthrough come porzione C-terminale di tale proteina, fuorché in Hordeivirus, che presentano il dominio della RNA replicasi su un'altra molecola di RNA. A seconda del genere, il genoma codifica per le proteine di movimento (MP) della superfamiglia "30K" o per proteine TGB (triple gene block). L'organizzazione del genoma è diversa in base al genere.[4][5][2]
La famiglia è stata istituita nel 2007 e comprendeva al tempo 6 generi (Furovirus, Hordeivirus, Pecluvirus, Pomovirus, Tobamovirus e Tobravirus) aventi le seguenti caratteristiche in comune:[6]
Koonin e Dolja nel 1993 eseguirono ricerche filogenetiche analizzando la RNA polimerasi RNA-dipendente (RdRp) e ottennero il supergruppo 3 RdRp che comprendeva tre linee filetiche, tra cui "Tobamo" che conteneva a sua volta, oltre ai 6 generi sopra descritti, anche Idaeovirus, Bromoviridae e Closteroviridae. Analisi più recenti sulla RdRp, sui tre domini fusi metiltransferasi-elicasi-RdRp e sull'intera proteina di replicazione confermano questa suddivisione, escludendo il genere Benyvirus il quale, benché condivida alcune caratteristiche su citate, è più lontano filogeneticamente, oltre a essere dotato di una coda poli-A e la sua polimerasi è ottenuta per proteolisi post-traduzionale.[6]
L'analisi delle proteine di replicazione, che costituiscono buona parte dei genomi, offre il miglior albero filogenetico della famiglia, ma anche gli altri geni permettono di correlare i generi.[6]
Nel 2015 è stato aggiunto alla famiglia un nuovo genere, Goravirus, contenente 2 specie, che mostra maggiore affinità con Pecluvirus e Hordeivirus come hanno mostrato analisi filogenetiche e delle proteine che comunque, anche data la bassa percentuale di sequenze aminoacidiche in comune e la diversa organizzazione del genoma, hanno avvalorato la creazione di un nuovo genere.[8]
Virgaviridae è una famiglia di virus a ssRNA positivo dell'ordine Martellivirales. Comprende virus che infettano le piante, tra cui il primo virus scoperto, il virus del mosaico del tabacco. La famiglia fu istituita nel 2007 a seguito di indagini di filogenetica molecolare.
Virgaviridae
Группа по БалтиморуIV: (+)оцРНК-вирусы
Виргавирусы[2] (лат. Virgaviridae, от лат. virga — палка) — семейство палочковидных РНК-содержащих вирусов растений. Широко известный вирус табачной мозаики относится именно к этому семейству.
Капсид вируса представляет собой спираль, состоящую из 130 витков с шагом спирали 23 Å. Спираль сформирована из 2130 идентичных молекул белка (мономеров), содержащих по 158 аминокислотных остатков. Генетическим материалом вируса табачной мозаики является одноцепочечная (+)РНК. Молекула РНК глубоко погружена в белок и повторяет шаг белковой спирали.
По данным Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV), на март 2017 года в семейство включают 7 родов[3]:
Виргавирусы (лат. Virgaviridae, от лат. virga — палка) — семейство палочковидных РНК-содержащих вирусов растений. Широко известный вирус табачной мозаики относится именно к этому семейству.
