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Tymovirales

Tymovirales ( allemand )

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Die Ordnung Tymovirales ist ein Taxon (Verwandtschaftsgruppe) von Viren mit einzelsträngigem RNA-Genom in positiv-Strang-Orientierung, das linear und nicht segmentiert ist. Ihre Vertreter sind überwiegend Pflanzenviren. Der Name für Ordnung ist von der Virusfamilie Tymoviridae und diese wiederum von ihrer Typspezies, dem Turnip yellow mosaic virus abgeleitet.

Beschreibung

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Schemazeichnung eines Partikel­fragments der Gat­tung Capillo­virus, Fam. Beta­flexi­viridae
Schemazeichnung eines Partikels der Fam. Tymo­viridae
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Genomkarte des Gelbe-Rüben-Mosaikvirus (TYMV)

Während die Virusteilchen (Virionen) der Vertreter der Familie Tymoviridae aus isometrischen, ikosaedrischen Kapsiden bestehen, findet man bei den anderen drei Familien filamentöse, helikale Kapsidsymmetrien. Aufgrund von Sequenzähnlichkeiten und ähnlichen Replikationsstrategien ist jedoch ein gemeinsamer evolutionärer Vorläufer für alle vier Familien anzunehmen, weshalb 2011 vom ICTV die neue Ordnung Tymovirales geschaffen wurde.

Systematik

Innere Systematik

Nach der offiziellen Virus-Taxonomie des ICTV, Stand November 2018, umfasst die Ordnung Tymovirales folgende Familien:

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EM-Aufnahme von ASPV-Virionen. Balken 100 nm
  • Spezies Apple stem pitting virus (ASPV, Typus)
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EM-Aufnahme von ASGV-Virionen. Balken 100 nm
  • Spezies Apple stem grooving virus (ASGV, Typus)
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EM-Aufnahme von CLBV-Virionen. Balken 200 nm
  • Spezies Citrus leaf blotch virus (CLBV, Typus)
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EM-Aufnahme von ACLSV-Virionen. Balken 100 nm
  • Spezies Apple chlorotic leaf spot virus (ACLSV, Typus)
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EM-Aufnahme von GVA-Virionen. Balken 100 nm
  • Spezies Cherry mottle leaf virus (CMLV)
  • Spezies Grapevine virus A (GVA, Typus)
  • Spezies Grapevine virus B (GVB)

Äußere Systematik

Koonin et al haben 2015 die Tymovirales taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[17] Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:[18]

Alphavirus-like superfamily

Tetraviridae“ (vom ICTV 2011 aufgeteilt)

Alphatetraviridae,[19] (mit Helicoverpa armigera stunt virus)


Carmotetraviridae[20] (mit Providence virus)


Permutotetraviridae[21] (mit Thosea asigna virus)


Vorlage:Klade/Wartung/3

?Birnaviridae (dsRNA)








Virgaviridae


Closteroviridae



Bromoviridae



Tymovirales (Ordnung)



Endornaviridae[22] (dsRNA, mit Oryza sativa alphaendornavirus)




Hepeviridae


Togaviridae (mit Alphavirus)


?Matonaviridae (mit Rötelnvirus — vom ICTV 2019 aus den Togaviridae ausgegliedert)


Vorlage:Klade/Wartung/3


?Nodaviridae[23] (mit Boolarravirus)



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Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch – wie die Birnaviridae – doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

ICTV Master Species List #35

Mit der neuen Master species List des ICTV, ratifiziert im März 2020, ergibt sich abweichend folgendes Bild:[1]

Orthornavirae Kitrinoviricota Alsuviricetes Tymovirales

Alphaflexiviridae (mit Lolavirus, Potexvirus)


Betaflexiviridae (mit Carlavirus)


Gammaflexiviridae


Deltaflexiviridae


Tymoviridae (mit Gelbe-Rüben-Mosaikvirus)


Vorlage:Klade/Wartung/3Vorlage:Klade/Wartung/4Vorlage:Klade/Wartung/5
Hepelivirales

Alphatetraviridae (mit Helicoverpa armigera stunt virus)


Benyviridae


Hepeviridae


Matonaviridae (mit Rötelnvirus)


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Martellivirales

Bromoviridae


Closteroviridae


Endornaviridae (dsRNA, mit Oryza sativa alphaendornavirus)


Kitaviridae


Mayoviridae


Togaviridae (mit Alphavirus)


Vorlage:Klade/Wartung/3Vorlage:Klade/Wartung/4Vorlage:Klade/Wartung/5Vorlage:Klade/Wartung/6
Vorlage:Klade/Wartung/3

FlasuviricetesAmarilloviralesFlaviviridae


Magsaviricetes
Nodamuvirales

Nodaviridae (mit Boolarravirus)


Sinhaliviridae



Tolucaviricetes
Tolivirales

Carmotetraviridae (mit Providence virus)


Luteoviridae[24] (mit Blattrollvirus, Wasserrübenvergilbungsvirus und Gelbverzwergungsviren)


Tombusviridae


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Vorlage:Klade/Wartung/3Vorlage:Klade/Wartung/4
Orthornavirae
ohne Zuordnung

Birnaviridae (dsRNA)


Permutotetraviridae (mit Thosea asigna virus)




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Von den Kitrinoviricota sind nur die Klassen mit den bereits genannten Familien gelistet, zwei weitere dieser Familien bleiben mit diesem Stand innerhalb der Orthornavirae noch ohne Zuordnung. Die „Alphavirus-like superfamily“ deckt sich im Wesentlichen mit dem Phylum Kitrinoviricota.

Als mögliches weiteres Mitglied dieses Phylums könnte eine vorgeschlagene Familie um das Chronische Bienenlähmungsvirus (CBPV) infrage kommen, wenn die Nodaviridae und die Tombusviridae dessen nächste Verwandte sind, die Unterschiede aber eine eigene Familie rechtfertigen (siehe dort).

Quellen

  • A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (eds.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012, ISBN 978-0-12-384684-6, S. 901ff

Einzelnachweise

  1. a b c d ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ICTV Master Species List 2018b v1 MSL #34, Feb. 2019
  3. SIB: Alphaflexiviridae, auf: ViralZone
  4. SIB: Allexivirus, auf: ViralZone
  5. S. Majumder, M. Arya, R. P. Pant, V. K. Baranwal: Shallot virus X in Indian shallot, a new virus report for India, in: New Disease Reports (2007) 15, 52, ISSN 2044-0588
  6. SIB: Mandarivirus, auf: ViralZone
  7. SIB: Potexvirus, auf: ViralZone
  8. SIB: Betaflexiviridae, auf: ViralZone
  9. SIB: Carlavirus, auf: ViralZone
  10. SIB: Foveavirus, auf: ViralZone
  11. SIB: Capillovirus, auf: ViralZone
  12. SIB: Trichovirus, auf: ViralZone
  13. SIB: Vitivirus, auf: ViralZone
  14. SIB: Gammaflexiviridae, auf: ViralZone
  15. SIB: Deltaflexiviridae, auf: ViralZone
  16. SIB: Tymoviridae, auf: ViralZone
  17. In älteren Arbeiten findet sich (mit abweichender Phylogenie) auch die Bezeichnung ‚Sindbis-like supergroup‘, Sindbis-Virus ist eine Spezies in der Gattung Alphavirus, Familie Togaviridae. Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  18. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology vom Mai 2015; 479-480. 2–25, Epub 12. März 2015, PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806
  19. SIB: Alphatetraviridae, auf: ViralZone
  20. SIB: Carmotetraviridae, auf: ViralZone
  21. SIB: Permutotetraviridae, auf: ViralZone
  22. SIB: Endornaviridae, auf: ViralZone
  23. SIB: Nodaviridae, auf: ViralZone
  24. ICTV: ICTV Taxonomy history: Alfalfa enamovirus 1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
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Tymovirales: Brief Summary ( allemand )

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Die Ordnung Tymovirales ist ein Taxon (Verwandtschaftsgruppe) von Viren mit einzelsträngigem RNA-Genom in positiv-Strang-Orientierung, das linear und nicht segmentiert ist. Ihre Vertreter sind überwiegend Pflanzenviren. Der Name für Ordnung ist von der Virusfamilie Tymoviridae und diese wiederum von ihrer Typspezies, dem Turnip yellow mosaic virus abgeleitet.

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Tymovirales ( frison du nord )

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Taxonavigation

Hoodkategorii: Wiiren
Order: Tymovirales
Familiae: AlphaflexiviridaeBetaflexiviridaeDeltaflexiviridaeGammaflexiviridaeTymoviridae

Nööm

Tymovirales

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Tymovirales ( anglais )

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Tymovirales is an order of viruses with five families. The group consists of viruses which have positive-sense, single-stranded RNA genomes. Their genetic material is protected by a special coat protein.

Description

Tymoviruses are mainly plant pathogens first described in 2004.[1] They are characterised by similarities in their replication-associated polyproteins. These account for the majority of their genomic coding capacity. They are considered to form a group, phylogenetically, referred to as flexiviruses, with filamentous virions.[2]

References

  1. ^ Adams MJ, Antinow JF, Bar-Joseph M, Brunt AA, Candresse T, Foster GD, Martelli GP, Milne RG, Fauquet CM (2004). "The new plant family Flexiviridae and assessment of molecular criteria for species demarcation". Arch Virol. 149 (5): 1045–60. doi:10.1007/s00705-004-0304-0. PMID 15098118. S2CID 34493607.
  2. ^ King 2012.
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Tymovirales: Brief Summary ( anglais )

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Tymovirales is an order of viruses with five families. The group consists of viruses which have positive-sense, single-stranded RNA genomes. Their genetic material is protected by a special coat protein.

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Tymovirales ( espagnol ; castillan )

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Tymovirales es un orden de virus que infectan plantas, hongos y protistas.[1]​ Presentan un genoma de ARN monocatenario de sentido positivo, por lo que se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. Su material genético está protegido por una capa de proteínas específica y la replicación del genoma se realiza sin ADN intermedario. Se considera que filogenéticamente forman un grupo por similitudes en sus poliproteínas asociadas a la replicación, que representan la mayor parte de su capacidad de codificación genómica. Se conocen como flexivirus pues sus viriones son filamentosos.

Referencias

  1. Adams MJ, Antinow JF, Bar-Joseph M, Brunt AA, Candresse T, Foster GD, Martelli GP, Milne RG, Fauquet CM (2004). «The new plant family Flexiviridae and assessment of molecular criteria for species demarcation». Arch Virol 149 (5): 1045-60. PMID 15098118. doi:10.1007/s00705-004-0304-0.
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Tymovirales: Brief Summary ( espagnol ; castillan )

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Tymovirales es un orden de virus que infectan plantas, hongos y protistas.​ Presentan un genoma de ARN monocatenario de sentido positivo, por lo que se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. Su material genético está protegido por una capa de proteínas específica y la replicación del genoma se realiza sin ADN intermedario. Se considera que filogenéticamente forman un grupo por similitudes en sus poliproteínas asociadas a la replicación, que representan la mayor parte de su capacidad de codificación genómica. Se conocen como flexivirus pues sus viriones son filamentosos.

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Tymovirales ( italien )

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Tymovirales è un ordine di virus proposto nel 2007 e ufficialmente approvato dall'International Committee on Taxonomy of Viruses nel 2009[1]. Possiedono un genoma ad RNA a singolo filamento a senso positivo, di conseguenza fanno parte del gruppo IV secondo la classificazione di Baltimore.

I virus appartenenti a quest'ordine hanno come ospite le piante.

I Tymovirales hanno capside non rivestito filamentoso e flessibile con lunghezza tra i 400 e i 1000 nm e diametro di 12-13 nm (flexiviridae) o isometrico a simmetria icosaedrica con diametro intorno ai 30 nm (tymoviridae), e possiedono tutti una poliproteina di replicazione alpha-like.

Classificazione

L'ordine Tymovirales è diviso in cinque famiglie.[2]

Note

  1. ^ (EN) ICTV Official Taxonomy: Updates since the 8th Report, su talk.ictvonline.org. URL consultato il 20 maggio 2011.
  2. ^ Virus Taxonomy: 2019 Release in ICTV

Bibliografia

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Tymovirales: Brief Summary ( italien )

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Tymovirales è un ordine di virus proposto nel 2007 e ufficialmente approvato dall'International Committee on Taxonomy of Viruses nel 2009. Possiedono un genoma ad RNA a singolo filamento a senso positivo, di conseguenza fanno parte del gruppo IV secondo la classificazione di Baltimore.

I virus appartenenti a quest'ordine hanno come ospite le piante.

I Tymovirales hanno capside non rivestito filamentoso e flessibile con lunghezza tra i 400 e i 1000 nm e diametro di 12-13 nm (flexiviridae) o isometrico a simmetria icosaedrica con diametro intorno ai 30 nm (tymoviridae), e possiedono tutti una poliproteina di replicazione alpha-like.

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Tymovirales ( portugais )

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Tymovirales (tymo, sigla para "turnip yellow mosaic virus" + do latim: virales, relativo a vírus) é uma ordem de vírus segundo a classificação taxonômica da ICTV.[1] Na classificação de Baltimore as famílias desta ordem pertencem a classe IV: (+)ssRNA virus. Compreende vírus RNA de cadeia simples não envelopados isométricos.[2]

Referências

  1. International Committee on Taxonomy of Virus (2009). «Virus Taxonomy 2009». Consultado em 29 de janeiro de 2010
  2. Fauquet, C.M.; Mayo, M.A; Maniloff, J.; Desselberger, U.; Ball, L.A. (editores) (2005). Virus Taxonomy: Classification and Nomenclature of Viruses. [S.l.]: Elsevier Academic Press. ISBN 0-12-249951-4
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Tymovirales: Brief Summary ( portugais )

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Tymovirales (tymo, sigla para "turnip yellow mosaic virus" + do latim: virales, relativo a vírus) é uma ordem de vírus segundo a classificação taxonômica da ICTV. Na classificação de Baltimore as famílias desta ordem pertencem a classe IV: (+)ssRNA virus. Compreende vírus RNA de cadeia simples não envelopados isométricos.

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