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Tectiviridae ( valencia )

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Tectiviridae és una família de virus que dins la classificació de Baltimore es troba en la classe 1. Infecten bacteris gramnegatius

Els càpsides no estan embolcallats i tenen un diàmetre de 63 nm amb estructura icosaèdrica.

Referències

  • ICTVdB - The Universal Virus Database ICTVdB Management (2006). 00.068. Tectiviridae. In: ICTVdB - The Universal Virus Database, version 3. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA
  • Virus Taxonomy: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses

H.V. Van Regenmortel, D.H.L. Bishop, M. H. Van Regenmortel, Claude M. Fauquet (Eds)

Enllaços externs

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Tectiviridae: Brief Summary ( valencia )

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Tectiviridae és una família de virus que dins la classificació de Baltimore es troba en la classe 1. Infecten bacteris gramnegatius

Els càpsides no estan embolcallats i tenen un diàmetre de 63 nm amb estructura icosaèdrica.

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Tectiviridae ( saksa )

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Die Virusfamilie Tectiviridae (lat. tectus: bedeckt) umfasst nur drei Gattungen Alphatectivirus, Betatectivirus und Gammatectivirus – die frühere Gattung Tectivirus wurde vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) inzwischen aufgespalten.[2] Die Wirte der Tectiviridae sind Bakterien, was sie als Bakteriophagen klassifiziert.

Morphologie

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Schemazeichnung eines Textiviridae-Virions, Querschnitt und Außenansicht,[3]

Die Viruspartikel (Virionen) bei den Tectividiae besitzen ein unbehülltes ikosaedrisches Kapsid mit einem Durchmesser von 66 nm. Dieses Kapsid besteht aus 240 Kapsomeren; die jeweils aus Trimeren des Kapsidproteins P3 bestehen. Das Kapsid besitzt an den Ikosaeder-Ecken jeweils einen fiberartigen Fortsatz (spike, Peplomer) von etwa 20 nm Länge, das aus zwei Proteinen (P2 und P5) aufgebaut und an der Basis an einem Pentonprotein verankert ist.

Innerhalb des Kapsids befindet sich ein Lipidmembran-Bläschen, das aus Virusproteinen und der Lipidmembran des Wirtsbakteriums besteht. Zur Ausschleusung des DNA-Genoms wird aus dem inneren Membranbläschen eine schwanzartige Röhre von ca. 60 × 10 nm durch das Kapsid ausgestülpt (daher die Namensgebung Tecti- für die Eigenschaft dieses „verdeckten“ Injektionsapparates). Diese ungewöhnliche Struktur eines Membranbläschens innerhalb eines ikosaedrischen Kapsids teilen sich die Tevtiviridae mit der Familie Corticoviridae.[3][4]

Genom

Das Genom der Tectiviridae ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem linearem, doppelsträngigem DNA-Molekül von etwa 15 kbp (Kilobasenpaaren) Länge. Dieses ist in verdrillter (coiled) Form innerhalb des Membranbläschens verpackt und die 5'-Enden beider Teilstränge sind kovalent mit Proteinen verknüpft. Der Prototyp der Familie, der Enterobacteria-Phage PRD1, kodiert für 25 Virusproteine.

Replikationszyklus

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Details eines Virions von Enterobacteria-Phage PRD1[4]
Dito, Beginn des Eintritts in die Wirtszelle.
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Eintrittsmechanismus von Enterobacteria-Phage PRD1.[5]
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Diagramm des Replikationszyklus von Enterobakteria-Phage PRD1.[4]

Die Replikation der Tectiviridae geschieht in folgenden Schritten:[3]

  1. Infektion: Der Phage heftet sich über sein Spike-Protein P2 an die Zielzelle. Daraufhin wird ein Proteinkomplex aus P2, P5, P31 und einem Teil des Kapsids (P3) freigesetzt, der eine Öffnung im Kapsid erzeugt.
  2. Die innere Kapsidmembran verwandelt sich in eine röhrenförmige Struktur (Schwanzstruktur), die durch das Loch im Kapsid ragt und die äußere Membran und Peptidoglykanschicht des Wirts durchdringt, um mit der Plasmamembran des Wirts zu verschmelzen und die virale DNA ins Zytoplasma des Wirts freizusetzen.[Anm. 1]
  3. Transkription und Translation der ersten („frühen“) Gene.
  4. Replikation der genomischen dsDNA.
  5. Transkription und Translation der restlichen („späten“) Gene.
  6. Assemblierung: Zusammenbau der noch leeren Kapsidhüllen der Nachkommenschaft.
  7. Die neu erzeugte genomische DNA wird in Kapsidhüllen verpackt.
  8. Die nun reifen Virionen werden durch Lyse aus der Zelle freigesetzt.

Wirte

Die Wirte der Tectiviridae sind mesophile Bakterien. Lediglich die Spezies Thermus Phage p37-14 befällt thermophile Bakterien und ist in vulkanischen Quellen und Geysieren zu finden.

Systematik

Besonders der Enterobacteria-Phage PRD1 zeigt äußerst viele Ähnlichkeiten zu Mitgliedern der Adenoviridae bezüglich der Kapsidstruktur (trimere hexagonale Kapsomere, Pentone, Fibern) und der Genomorganisation (lineare dsDNA, sogenannte Inverted Terminal Repeats, terminale Proteine, DNA-Polymerase Typ B). Diese Ähnlichkeiten deuten auf eine gemeinsame Herkunft, d. h. sie beruhen auf Homologie[6] Beide Familien wurden daher vom ICTV im März 2020 in dieselbe Klasse Tectiliviricetes gestellt.[7]

Nach ICTV Master Species List 2018b.v2 vom März 2019:[8]

  • Familie Tectiviridae
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EM-Aufnahme von Virionen des Enterobakterien-Phagen PRD1. Der Inset zeigt ein Virion mit einer herausragenden schwanzartigen Struktur. Balken 100 nm.
  • Genus Gammatectivirus[20]
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Virionen von „Streptomyces phage Forthebois“, rechts mit „Nonotube“.[21]
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Virionen von „Streptomyces phage WheeHeim“, rechts mit „Nonotube“.[21]
  • Genus „Deltatectivirus“ (Vorschlag)[21]
  • Spezies „Rhodococcus phage Toil[21][22]
  • Spezies „Streptomyces phage Forthebois[21]
  • Spezies „Streptomyces phage WheeHeim[21]
  • vorgeschlagene Mitglieder der Familie ohne Gattungszuweisung:
  • Spezies „Thermus Phage P37-14“ (offizieller Status vom ICTV aberkannt, da Gensequenz fehlt)[23][12]
  • weitere Spezies siehe NCBI: nicht-klassifizierte Tectiviridae.[24]

Anmerkungen

  1. Vergleichbare Mechanismen findet man bei den Caudoviricetes und der Gattung Chlorovirus.

Literatur

  • C. M. Fauquet, M. A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, London, San Diego, 2004
  • David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (Hrsg.): Fields' Virology, 4. Auflage, Philadelphia 2001

Einzelnachweise

  1. a b c d e ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ICTV: Master Species List 2018b.v2 #34, März 2019
  3. a b c SIB: Tesxtiviridae, auf: Expasy ViralZone
  4. a b c ICTV: dsDNA Viruses – Textiviridae, ICTV 9th Report (2011)
  5. Sari Mäntynen, Lotta-Riina Sundberg, Hanna M. Oksanen, Minna M. Poranen: Half a Century of Research on Membrane-Containing Bacteriophages: Bringing New Concepts to Modern Virology, in: MDPI Viruses 2019, Band 11, Nr. 1, Section Bacterial Viruses, 76; doi:10.3390/v11010076, PDF
  6. Patrick Forterre: Evolution: Die wahre Natur der Viren, in: Spektrum August 2017, S. 37 (Online-Artikel vom 19. Juli 2017)
  7. a b ICTV: ICTV Taxonomy history: Pseudomonas virus PRD1, EC 51, Berlin, Germany, July 2019; Email ratification March 2020 (MSL #35)
  8. ICTV: MSL 2018b.v2, März 2019
  9. SIB: Alphatectivirus, auf: ViralZone
  10. NCBI: Alphatectivirus (genus)
  11. NCBI: Genomsequenz und Proteine des Phagen PRD1
  12. a b c Natalya Yutin, Disa Bäckström, Thijs J. G. Ettema, Mart Krupovic, Eugene V. Koonin: Vast diversity of prokaryotic virus genomes encoding double jelly-roll major capsid proteins uncovered by genomic and metagenomic sequence analysis, in: Virol Jv.15; 10. April 2018, PMC 5894146 (freier Volltext), PMID 29636073, doi:10.1186/s12985-018-0974-y
  13. a b Céline Verheust, Nadine Fornelos, Jacques Mahillon: GIL16, a New Gram-Positive Tectiviral Phage Related to the Bacillus thuringiensis GIL01 and the Bacillus cereus pBClin15 Elements, in: J Bacteriol. 187(6), März 2005, S. 1966–1973, doi:10.1128/JB.187.6.1966-1973.2005, PMC 1064052 (freier Volltext).
  14. NCBI: Enterobacteria phage PR772 (no rank)
  15. SIB: Betatectivirus, auf: ViralZone
  16. NCBI: Betatectivirus (genus)
  17. NCBI: Genomsequenz und Proteine des Bacillus Phagen Bam35
  18. NCBI: Bacillus virus Bam35 (species)
  19. NCBI: Bacillus virus Wip1 (species)
  20. NCBI: Gammatectivirus (genus)
  21. a b c d e f Steven M. Caruso, Tagide N. deCarvalho, Anthony Huynh, George Morcos, Nansen Kuo, Shabnam Parsa, Ivan Erill: A Novel Genus of Actinobacterial Tectiviridae, in: MDPI Viruses, Band 11, Nr. 12, 7. Dezember 2019, doi:10.3390/v11121134 (CC 4.0)
  22. NCBI: Rhodococcus phage Toil (species)
  23. Proposal 2017.013B
  24. NCBI: unclassified Tectiviridae (list)
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Tectiviridae: Brief Summary ( saksa )

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Die Virusfamilie Tectiviridae (lat. tectus: bedeckt) umfasst nur drei Gattungen Alphatectivirus, Betatectivirus und Gammatectivirus – die frühere Gattung Tectivirus wurde vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) inzwischen aufgespalten. Die Wirte der Tectiviridae sind Bakterien, was sie als Bakteriophagen klassifiziert.

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Tectivirus ( englanti )

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Tectiviridae is a family of viruses with 10 species in five genera. Bacteria serve as natural hosts.[2][3] Tectiviruses have no head-tail structure, but are capable of producing tail-like tubes of ~ 60×10 nm upon adsorption or after chloroform treatment. The name is derived from Latin tectus (meaning 'covered').[4]

Virology

Entry mechanism Enterobacteria phage PRD1

The virions of Tectiviridae species are non-enveloped, icosahedral and display a pseudo T=25 symmetry.[2] The capsid has two layers. The outer layer is a protein structure of 240 capsid proteins trimers, and the inner one is a proteinaceous lipid membrane which envelopes the virus genome. Apical spikes extending about 20 nanometers (nm) protrude from the icosahedrons vertices.

The genome is a single molecule of linear double-stranded DNA of 15 kilobases in length, and has 30 open reading frames.[2] It forms a tightly packed coil and encodes several structural proteins. It encodes about 30 proteins that are transcribed in operons. At least 9 structural proteins are present in the viron. The genome is about 66 megaDaltons in weight and constitutes 14–15% of the virion by weight. Lipids constitute a further 15% by weight. Carbohydrates are not present.

Life cycle

Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by adsorption into the host cell.[2] After adsorption to the host cell surface the virion extrudes a tail-tube structure through a vertex for genome delivery into the host. Replication follows the DNA strand displacement model. DNA-templated transcription is the method of transcription.[2] Capsid proteins polymerize around a lipoprotein vesicle translocated in the cytoplasm by virion assembly factors.

Mature virons are released by lysis, which, in the case of PRD1, is achieved with the aid of virus-encoded lysis machinery consisting of four proteins: P15 (endolysin),[5] P35 (holin),[6] P36 and P37 (homologues of the Rz/Rz1 proteins of phage lambda).[7]

Taxonomy

Tectiviridae contains the following genera and species:[3]

Other unassigned phages:[8]

References

  1. ^ San Martín, C; Huiskonen, JT; Bamford, JK; Butcher, SJ; Fuller, SD; Bamford, DH; Burnett, RM (2002). "Minor proteins, mobile arms and membrane-capsid interactions in the bacteriophage PRD1 capsid". Nature Structural Biology. 9 (10): 756–63. doi:10.1038/nsb837. PMID 12219080.
  2. ^ a b c d e "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  3. ^ a b "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 22 May 2021.
  4. ^ "ICTV Ninth Report; 2009 Taxonomy Release: Tectiviridae". ICTV. ICTV. Archived from the original on 24 April 2019. Retrieved 18 September 2020.
  5. ^ Caldentey J, Hänninen AL, Bamford DH (1994). "Gene XV of bacteriophage PRD1 encodes a lytic enzyme with muramidase activity". Eur J Biochem. 225 (1): 341–346. doi:10.1111/j.1432-1033.1994.00341.x. PMID 7925454.
  6. ^ Rydman PS, Bamford DH (2003). "Identification and mutational analysis of bacteriophage PRD1 holin protein P35". J Bacteriol. 185 (13): 3795–3803. doi:10.1128/JB.185.13.3795-3803.2003. PMC 161566. PMID 12813073.
  7. ^ Krupovic M, Cvirkaite-Krupovic V, Bamford DH (2008). "Identification and functional analysis of the Rz/Rz1-like accessory lysis genes in the membrane-containing bacteriophage PRD1". Mol Microbiol. 68 (2): 492–503. doi:10.1111/j.1365-2958.2008.06165.x. PMID 18366440.
  8. ^ Unclassified Tectiviridae. NCBI Taxonomy.
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Tectiviridae is a family of viruses with 10 species in five genera. Bacteria serve as natural hosts. Tectiviruses have no head-tail structure, but are capable of producing tail-like tubes of ~ 60×10 nm upon adsorption or after chloroform treatment. The name is derived from Latin tectus (meaning 'covered').

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Tectiviridae ( kastilia )

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Tectiviridae es una familia de virus que infectan bacterias (bacteriófagos). Tienen un genoma ADN bicatenario y por lo tanto pertenecen al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. Es una única molécula de ADN lineal no segmentada de 15.000 nucleótidos de longitud y con una proteína, denominada proteína terminal (TP), covalentemente unida a ambos extremos, formando una bobina altamente empaquetada que codifica las proteínas estructurales. Dentro de los tectivirus se pueden encontrar dos grupos, que si bien tienen morfologías muy similares,[1]​ tienen características genéticas y modos de vida diferentes. El primer grupo está formado por virus líticos que infectan bacterias Gram-negativas que portan plásmidos con resistencia antibiótica. Un segundo grupo está formado por virus atemperados que infectan bacterias Gram-positivas, siendo este grupo el mejor estudiado. Un tercer grupo, descubierto recientemente infecta a bacterias termófilas. La familia contiene cinco géneros.

Tectiviridae al igual que otros bacteriófagos no tiene la estructura típica cabeza-cola de los Caudovirales, pero son capaces de producir tubos similares a colas de aproximadamente 60 x 10 nm durante la absorción o después de un tratamiento con cloroformo. Se caracterizan por poseer una cápside carente de envoltura viral, con un diámetro de 63 nm y estructuralmente definida por una simetría compleja icosaédrica, con capa doble característica, una interna y otra externa. La capa interior consiste en una película flexible de 5-6 nm hecha de una vesícula de lipoproteína, mientras que la capa exterior se compone de una fina película de proteína lisa, rígida y de 3 nm de espesor. La cápside presenta espigas apicales de 20 nm de longitud y una inusual capa lipídica en torno a la nucleoproteína.

Referencias

  1. . doi:10.1016/S0042-6822(03)00295-2. Falta el |título= (ayuda)

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Tectiviridae: Brief Summary ( kastilia )

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Tectiviridae es una familia de virus que infectan bacterias (bacteriófagos). Tienen un genoma ADN bicatenario y por lo tanto pertenecen al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. Es una única molécula de ADN lineal no segmentada de 15.000 nucleótidos de longitud y con una proteína, denominada proteína terminal (TP), covalentemente unida a ambos extremos, formando una bobina altamente empaquetada que codifica las proteínas estructurales. Dentro de los tectivirus se pueden encontrar dos grupos, que si bien tienen morfologías muy similares,​ tienen características genéticas y modos de vida diferentes. El primer grupo está formado por virus líticos que infectan bacterias Gram-negativas que portan plásmidos con resistencia antibiótica. Un segundo grupo está formado por virus atemperados que infectan bacterias Gram-positivas, siendo este grupo el mejor estudiado. Un tercer grupo, descubierto recientemente infecta a bacterias termófilas. La familia contiene cinco géneros.

Tectiviridae al igual que otros bacteriófagos no tiene la estructura típica cabeza-cola de los Caudovirales, pero son capaces de producir tubos similares a colas de aproximadamente 60 x 10 nm durante la absorción o después de un tratamiento con cloroformo. Se caracterizan por poseer una cápside carente de envoltura viral, con un diámetro de 63 nm y estructuralmente definida por una simetría compleja icosaédrica, con capa doble característica, una interna y otra externa. La capa interior consiste en una película flexible de 5-6 nm hecha de una vesícula de lipoproteína, mientras que la capa exterior se compone de una fina película de proteína lisa, rígida y de 3 nm de espesor. La cápside presenta espigas apicales de 20 nm de longitud y una inusual capa lipídica en torno a la nucleoproteína.

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復層噬菌體科 ( kiina )

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復層噬菌體科 病毒分类 族: 族 I (dsDNA) 分類
  • 復層噬菌體屬(Tectivirus)

代表種:

    • 腸桿菌PRD1噬菌體(Enterobacteria phage PRD1)
    • 嗜熱菌P37-14噬菌體(Thermus phage P37-14)
Marburg virus.jpg 這是與病毒相關的小作品。你可以通过编辑或修订扩充其内容。
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復層噬菌體科: Brief Summary ( kiina )

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復層噬菌體科(Tectiviridae),也譯作復層病毒科,tecti來自拉丁文的tectus,有有蓋的之意。主要宿主為細菌。

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