O grupo PVC na clasificación máis común das bacterias é un clado con nivel de superfilo, que comprende os filos Planctomycetes, Verrucomicrobia e Chlamydiae (de onde se orixinan as súas siglas), xunto con Lentisphaerae e o filo candidato OP3 e as Poribacteria (estas últimas discutidas). Na clasificación de Cavalier-Smith o grupo denomínase Planctobacteria, con algunha diferenza na súa composición.
Para Cavalier-Smith as Planctobacteria son unha división (equivalente a filo).[1] Esta clasificación de Cavalier-Smith non é moi seguida pola xeneralidade da comunidade científica.[2] Cavalier-Smith postulou que as Planctobacteria probablemente perderan ou reduciran as súas paredes celulares de peptidoglicano dúas veces.[3] Na megaclasificación de Cavalier-Smith, as Planctobacteria están dentro do infrarreino Gracilicutes e comprenden as clases: Chlamydiae, Lentisphaerae, Planctomycetes e Verrucomicrobia.[3][4] Estas clases nas outras clasificacións teñen categoría de filo.[5]
Velaquí un cladograma do superfilo PVC:[5][6][7]
Grupo PVC Poribacteria
Planctomycetes
Omnitrophica (OP3)
Chlamydiae‑Verrucomicrobia Chlamydiae
Lentisphaerae
Verrucomicrobia
Probas moleculares
O establecemento do superfilo PVC apóiase nos exames da proteína ARN polimerase RpoB das bacterias dos distintos grupos.[8] Esta proteína ten 3 aminoácidos característicos inseridos na polimerase de todas as especies secuenciadas de Chlamydiae, Lentisphaerae e Verrucomicrobia. Ademais, unha proteína conservada de función descoñecida está presente en todas as especies secuenciadas dos filos Chlamydiae, Lentisphaerae, Planctomycetes e Verrucomicrobia, pero está ausente en Poribacteria.
Atopáronse outras probas adicionais da existencia deste clado.[5][9] Entre elas a presenza de proteínas de tipo de recubrimento de membrana, de tubulina, síntese de esterol e a presenza de ADN condensado.
Estudos de proteínas adicionais deste superfilo proposto suxiren que as Poribacteria poderían estar separadas deste clado.[8] As Planctomycetes poden ser basais con respecto ao clado Chlamydiae-Verrucomicrobia-Lentisphaerae.
Notas
-
↑ Historicamente as bacterias foron ao primeiro consideradas plantas e en consecuencia usábase a categoría taxonómica "división" como en Botánica. Modernamente, o código bacteriolóxico determina que se debe utilizar para ese nivel taxonómico "filo" en lugar de división. Aínda así, Cavalier-Smith adoptou o termo división.
-
↑ Krieg, N.R.; Ludwig, W.; Whitman, W.B.; Hedlund, B.P.; Paster, B.J.; Staley, J.T.; Ward, N.; Brown, D.; Parte, A. (November 24, 2010) [1984(Williams & Wilkins)]. George M. Garrity, ed. The Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Planctomycetes. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 4 (2nd ed.). New York: Springer. p. 908. ISBN 978-0-387-95042-6. British Library no. GBA561951.
-
↑ 3,0 3,1 Cavalier-Smith, T (2002). "The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification". International journal of systematic and evolutionary microbiology 52 (Pt 1): 7–76. PMID 11837318.
-
↑ Cavalier-Smith T (2006). "Rooting the tree of life by transition analyses". Biol. Direct 1 (1): 19. PMC 1586193. PMID 16834776. doi:10.1186/1745-6150-1-19.
-
↑ 5,0 5,1 5,2 Wagner, M.; Horn, M. (2006). "The Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae and sister phyla comprise a superphylum with biotechnological and medical relevance". Current Opinion in Biotechnology 17 (3): 241–249. doi:10.1016/j.copbio.2006.05.005. PMID 16704931.
-
↑ Rappe, M. S.; Giovannoni, S. J. (2003). "The Uncultured Microbial Majority". Annual Review of Microbiology 57: 369–394. doi:10.1146/annurev.micro.57.030502.090759. PMID 14527284.
-
↑ Woese, C. R. (1987). "Bacterial evolution". Microbiological reviews 51 (2): 221–271. PMC 373105. PMID 2439888.
-
↑ 8,0 8,1 Gupta RS, Bhandari V, Naushad HS (2012) Molecular signatures for the PVC Clade (Planctomycetes, Verrucomicrobia, Chlamydiae, and Lentisphaerae) of bacteria provide insights into their evolutionary relationships. Front Microbiol 3:327. doi: 10.3389/fmicb.2012.00327
-
↑ Kamneva OK, Liberles DA, Ward NL (2010) Genome-wide influence of indel substitutions on evolution of bacteria of the PVC superphylum, revealed using a novel computational method. Genome Biol Evol 2: 870–886
Véxase tamén
Outros artigos
