Caudoviricetes (von lateinisch cauda ‚Schwanz‘) ist eine Klasse von Viren, die Bakterien und Archaeen als Wirte nutzen und eine Kopf-Schwanz-Struktur besitzen, weshalb die Mitglieder der Caudoviricetes einerseits als Bakteriophagen klassifiziert, andererseits gelegentlich informell als Schwanzviren bezeichnet werden. Die Klasse umfasste bis zum März 2022 nur eine einzige vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Ordnung, Caudovirales. Diese Ordnung war 1998 von Hans-Wolfgang Ackermann aufgrund von EM-Aufnahmen der Virionen als Supergruppe aller geschwänzten Bakteriophagen vorgeschlagen worden, was in der Folge vom ICTV bestätigt wurde. Die klassische Unterteilung dieser Gruppe in Familien erfolgte ebenfalls hauptsächlich aufgrund der genauen Morphologie des am Kapsid sitzenden Schwanzstückes:
In zunehmendem Maße erlangen aber Gen- und Genom- bzw. Proteom-Vergleiche für die Taxonomie an Bedeutung. Es zeigte sich dabei, dass diese drei traditionellen morphologisch begründeten Familien nicht monophyletisch waren. Dies hatte zur Folge, dass Genomsequenzen (sog. Contigs) aus der Metagenomik im bestehenden System – mit fehlender Information über die Morphologie – nicht zugeordnet werden konnten.[5]
Um dieses Problem zu lösen, hatte das ICTV zunächst verschiedene Gruppen aus diesen herkömmlichen Familien – zunächst formell noch innerhalb der damaligen Ordnung Caudovirales – in neue geschaffene Familien verschoben, darunter die Ackermannviridae, Autographiviridae, Chaseviridae, Demerecviridae und Herelleviridae.
Im März 2021 resultierten diese Bestrebungen in dem Vorschlag einer kompletten Reorganisation der Klasse unter Abschaffung der bisherigen Ordnung Caudovirales; sowie der Auflösung der damaligen polphyletischen Familien (Myoviridae, Podoviridae und Siphoviridae), wobei diese durch neue monophyletische Familien ersetzt werden und nur noch informall als nicht-taxonomische Gruppen zur morphologischen Klassifizierung (Morphotypen) bestehen bleiben.[5]
Diesen Vorschlag hat das ICTV dann im März 2022 vollständig umgesetzt. Die Ordnung Caudovirales wurde aufgelöst. Der Klade der aus der Metagenomik identifizierten crAss-like phages wurde dabei gemäß Vorschlag der Rang einer Ordnung Crassvirales gegeben[5] und noch weitere Ordnungen eingerichtet. Neben den oben genannten bereits aus den herkömmlichen drei Familien (Morphotypen) ausgegliederten Familien wurden dabei weitere Familien definiert, etliche Unterfamilien verblieben aber zunächst noch ohne Familienzuordnung.
Das Genom der Caudoviricetes ist unsegmentiert (monopartit), d. h. es besteht aus einem einzigen Molekül einer (gewöhnlich) doppelsträngigen DNA mit einer Größe von 18 bis 500 kBp (Kilobasenpaare). Es bei den klassischen Myo-, Sipho- und Podoviren linear, kann aber (wie bei den Crassvirales, en. crAss-like phages) auch als eine ringförmig geschlossene (zirkuläre) DNA vorliegen.
Neben den üblichen Nukleotiden des genetischen Codes besitzen die Caudoviricetes auch modifizierte, z. B. glykosylierte Basen (d. h. mit angehängten zusätzlichen Zuckerresten) oder 5-Hydroxymethylcytosin an Stelle von Cytosin. Die DNA befindet sich in einem 45 bis 170 nm im Durchmesser großen ikosaedrischen Kapsid aus meist 72 Kapsomeren; das Schwanzstück kann bis zu 230 nm lang sein.
Das Genom kodiert für 27 bis über 600 Gene, deren Anordnung stark variiert. Das Genom kann von einzelsträngigen Lücken durchbrochen sein und im linearen Fall kovalent gebundene terminale Proteine besitzen. Im Bakterium können diese Caudoviricetes in das Nukleoid integrieren (Prophage) oder als lineares bzw. zirkuläres Plasmid in der Zelle verbleiben. Die Anzahl der isolierten Genome ist verhältnismäßig hoch, da die Caudoviricetes einem ständigen genetischen Austausch zwischen viralem und bakteriellem Genom wie auch dem horizontalen Austausch als Plasmid zwischen Bakterien unterliegen (siehe horizontaler Gentransfer). Es entsteht so eine Vielzahl von so genannten „Mosaiktypen“.
Die Caudoviricetes sind stammesgeschichtlich sehr alte Viren mit großen Populationsvarianten und weltweiter Verbreitung. Man schätzt, dass sich etwa 1031 Virionen der Caudoviricetes in der Biosphäre befinden, die aneinandergelegt einer Strecke von 2×108 Lichtjahren entsprächen. Die Caudoviricetes machen den überwiegenden Anteil des Virioplanktons in den Meeren und Gewässern aus.
Mit Stand Anfang April 2022 kennt das International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) die folgende Familien und Unterfamilien (ergänzt um einige Vorschläge in doppelten Anführungszeichen), wobei etliche Gattungen, Unterfamilien und Familien noch ohne Zuordnung sind:[3]
Klasse Caudoviricetes
Teseptimavirus, Autographiviridae
Pseudomonas-Virus gh1, Autographiviridae
Tequintavirus, Demerecviridae
Tunavirus, Drexlerviridae
Clostridium-Phage CPS2, Guelinviridae
Okubovirus, Herelleviridae
Twortvirus, Herelleviridae
Nodensvirus spm2 Synechococcus-Phage S-PM2, Kyanoviridae
Escherichia phage T4, Straboviridae
Phikzvirus, Myoviren
Schizotequatrovirus, Straboviridae
Lederbergvirus, Podoviren
Uetakevirus, Podoviren
Bruynoghevirus, Podoviren
Phage CSA13, Rountreeviridae
Salasvirus, Salasmaviridae
Bacillus-Virus Goe4, Salasmaviridae
Roseovarius-Virus RPP1, Schitoviridae
Staphylococcus-aureus-Phage 3A, Schitoviridae
Escherichia-Phage λ, Siphoviren
Lentibacter-Virus ICBM1, Zobellviridae
Lentibacter-Virus ICBM2, Zobellviridae
Caudoviricetes (von lateinisch cauda ‚Schwanz‘) ist eine Klasse von Viren, die Bakterien und Archaeen als Wirte nutzen und eine Kopf-Schwanz-Struktur besitzen, weshalb die Mitglieder der Caudoviricetes einerseits als Bakteriophagen klassifiziert, andererseits gelegentlich informell als Schwanzviren bezeichnet werden. Die Klasse umfasste bis zum März 2022 nur eine einzige vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigte Ordnung, Caudovirales. Diese Ordnung war 1998 von Hans-Wolfgang Ackermann aufgrund von EM-Aufnahmen der Virionen als Supergruppe aller geschwänzten Bakteriophagen vorgeschlagen worden, was in der Folge vom ICTV bestätigt wurde. Die klassische Unterteilung dieser Gruppe in Familien erfolgte ebenfalls hauptsächlich aufgrund der genauen Morphologie des am Kapsid sitzenden Schwanzstückes:
Myoviren (englisch myoviruses, ehemalige Familie Myoviridae): Morphotyp A: langes kontraktiles Schwanzstück Siphoviren (en. siphoviruses, ehemalige Familie Siphoviridae): Morphotyp B: langes nicht-kontraktiles Schwanzstück Podoviren (en. podoviruses, ehemalige Familie Podoviridae): Morphotyp C: kurzes nicht-kontraktiles Schwanzstück.In zunehmendem Maße erlangen aber Gen- und Genom- bzw. Proteom-Vergleiche für die Taxonomie an Bedeutung. Es zeigte sich dabei, dass diese drei traditionellen morphologisch begründeten Familien nicht monophyletisch waren. Dies hatte zur Folge, dass Genomsequenzen (sog. Contigs) aus der Metagenomik im bestehenden System – mit fehlender Information über die Morphologie – nicht zugeordnet werden konnten.
Um dieses Problem zu lösen, hatte das ICTV zunächst verschiedene Gruppen aus diesen herkömmlichen Familien – zunächst formell noch innerhalb der damaligen Ordnung Caudovirales – in neue geschaffene Familien verschoben, darunter die Ackermannviridae, Autographiviridae, Chaseviridae, Demerecviridae und Herelleviridae.
Im März 2021 resultierten diese Bestrebungen in dem Vorschlag einer kompletten Reorganisation der Klasse unter Abschaffung der bisherigen Ordnung Caudovirales; sowie der Auflösung der damaligen polphyletischen Familien (Myoviridae, Podoviridae und Siphoviridae), wobei diese durch neue monophyletische Familien ersetzt werden und nur noch informall als nicht-taxonomische Gruppen zur morphologischen Klassifizierung (Morphotypen) bestehen bleiben.
Diesen Vorschlag hat das ICTV dann im März 2022 vollständig umgesetzt. Die Ordnung Caudovirales wurde aufgelöst. Der Klade der aus der Metagenomik identifizierten crAss-like phages wurde dabei gemäß Vorschlag der Rang einer Ordnung Crassvirales gegeben und noch weitere Ordnungen eingerichtet. Neben den oben genannten bereits aus den herkömmlichen drei Familien (Morphotypen) ausgegliederten Familien wurden dabei weitere Familien definiert, etliche Unterfamilien verblieben aber zunächst noch ohne Familienzuordnung.
Tekst üüb Öömrang Hoodkategorii: Wiiren
Order: Caudovirales
Familiae: Ackermannviridae – Myoviridae – Podoviridae – Siphoviridae
Caudovirales
Caudovirales es un ordine de Virus, Caudoviricetes.
Caudoviricetes is an class of viruses known as the tailed bacteriophages (cauda is Latin for "tail").[1] Under the Baltimore classification scheme, the Caudoviricetes are group I viruses as they have double stranded DNA (dsDNA) genomes, which can be anywhere from 18,000 base pairs to 500,000 base pairs in length.[2] The virus particles have a distinct shape; each virion has an icosahedral head that contains the viral genome, and is attached to a flexible tail by a connector protein.[2] The order encompasses a wide range of viruses, many containing genes of similar nucleotide sequence and function. However, some tailed bacteriophage genomes can vary quite significantly in nucleotide sequence, even among the same genus. Due to their characteristic structure and possession of potentially homologous genes, it is believed these bacteriophages possess a common origin.[2]
There are 4 orders, 47 families, 98 subfamilies, 1197 genera, 3601 species in the class. This makes Caudoviricetes the most populous class among viruses, accounting for approximately 30% of all recognized virus species and nearly half of all virus genera.[3]
Upon encountering a host bacterium, the tail section of the virion binds to receptors on the cell surface and delivers the DNA into the cell by use of an injectisome-like mechanism (an injectisome is a nanomachine that evolved for the delivery of proteins by type III secretion). The tail section of the virus punches a hole through the bacterial cell wall and plasma membrane and the genome passes down the tail into the cell. Once inside the genes are expressed from transcripts made by the host machinery, using host ribosomes. Typically, the genome is replicated by use of concatemers, in which overlapping segments of DNA are made, and then put together to form the whole genome.[2]
Viral capsid proteins come together to form a precursor prohead, into which the genome enters. Once this has occurred, the prohead undergoes maturation by cleavage of capsid subunits to form an icosahedral phage head with 5-fold symmetry. After the head maturation, the tail is joined in one of two ways: Either the tail is constructed separately, and joined with the connector, or the tail is constructed directly onto the phage head. The tails consist of helix based proteins with 6-fold symmetry. After maturation of virus particles, the cell is lysed by lysins, holins, or a combination of the two.[2]
For most of virological history, Caudoviricetes which was known as the order Caudovirales, had lower taxa defined via morphology and contractile ability of their "tails". The Myoviridae had long tails that were contractile; the Podoviridae had short noncontractile tails; and the Siphoviridae had long noncontractile tails.[4] Siphoviridae constitute the majority of the known tailed viruses.[2][5]
Bradley referred to what was known as the Myoviridae as type A, Siphoviridae as type B, and the Podoviridae as type C. He also divided his groups on the basis of head morphology: Within group A, A1 have small isometric heads; A2 have prolate heads; and A3 have elongated heads. Within groups B and C, numbers were similarly assigned: B1 and C1 have small isometric heads; B2 and C2 have prolate heads; and B3 and C3 have elongated heads.
Because the "families" Myoviridae, Podoviridae and Siphoviridae were abolished for being polyphyletic, there are now many free-floating families, subfamilies, and genera in the class without any preceding taxa before Caudoviricetes. There are currently 7 orders, 63 families, 109 subfamilies, 1360 genera, and 4079 species in the class. This article lists all official and proposed taxa of Caudoviricetes. (Note: Quotes means that the taxon is proposed and has not yet been ratified by the ICTV.)
Crassvirales infects bacteria and is named after the computer program crAss, which was used to identify the first member of the Crassvirales order.[6][7]
The rest (including the proposed orders) infect archaea. Kirjokansivirales, Thumleimavirales, and Nakonvirales are named after mythological objects or deities; Methanobavirales and Magrovirales are named after archaic synonyms of the archaea they infect.
Bacteriophages occur in over 1100 bacterial or archaeal genera.[3] Over 6300 bacteriophages have been examined in the electron microscope since 1959. Of these, more than 96 percent have tails. Of the tailed phages, about 57 percent have long, noncontractile tails ("Siphoviridae"). Tailed phages appear to be monophyletic and are the oldest known virus group.[5][8]
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Tailed bacteriophage structure: (1) head, (2) tail, (3) DNA, (4) capsid, (5) collar, (6) sheath, (7) tail fibres, (8) spikes, (9) base plate Transmission electron micrograph of Gamma-Phage 
Illustrations of various Caudovirales. Not to scale. Caudoviricetes is an class of viruses known as the tailed bacteriophages (cauda is Latin for "tail"). Under the Baltimore classification scheme, the Caudoviricetes are group I viruses as they have double stranded DNA (dsDNA) genomes, which can be anywhere from 18,000 base pairs to 500,000 base pairs in length. The virus particles have a distinct shape; each virion has an icosahedral head that contains the viral genome, and is attached to a flexible tail by a connector protein. The order encompasses a wide range of viruses, many containing genes of similar nucleotide sequence and function. However, some tailed bacteriophage genomes can vary quite significantly in nucleotide sequence, even among the same genus. Due to their characteristic structure and possession of potentially homologous genes, it is believed these bacteriophages possess a common origin.
There are 4 orders, 47 families, 98 subfamilies, 1197 genera, 3601 species in the class. This makes Caudoviricetes the most populous class among viruses, accounting for approximately 30% of all recognized virus species and nearly half of all virus genera.
Caudoviricetes es una extensa clase de virus que infectan procariotas (bacterias y arqueas). Son llamados "caudovirus" o "bacteriófagos de cola".
Comprenden la mayor parte de los bacteriófagos. En el marco del esquema de la Clasificación de Baltimore se integran en el Grupo I, ya que tienen un genoma ADN bicatenario. El tamaño del genoma está comprendido entre 18 y 500 kbp. Las partículas virales tienen una forma distintiva con una cabeza icosaedral que contiene el genoma y conectada a una cola. El orden abarca una amplia gama de virus, muchos de los cuales tienen los mismos o similares genes, mientras que la secuencia de nucleótidos puede variar considerablemente, incluso entre el mismo género. Debido a su característica estructural, se cree que comparten un origen común y que fueron los ancestros de los herpesvirus según análisis filogenéticos y estructurales.
Los caudovirus infectan bacterias y arqueas de casi todos los filos según el gran incremento por metagenómica y la abundancia de elementos virales endógenos. Aunque la mayoría de los filos bacterianos y arqueanos permanecen sin cultivarse, se ha descrito como un elemento viral endógeno en los genomas de muchos de estos filos candidatos o los huéspedes se determinaron por técnicas de metagenómica. También infectaron al último antepasado común universal según investigaciones recientes.[1] Los caudovirus desde su origen aparentemente fueron los virus que le ganaron la competencia a los restantes tipos de virus procariotas y por ello son muy abundantes, se hallan con más frecuencia en los cultivos, muestras metagenómicas, endogenizados y su forma de virion es la popularmente concebida para todos los bacteriófagos a pesar de que los bacteriófagos pueden tener diferentes formas de virion al igual que los virus eucariotas.
Al encuentro con una bacteria o arquea huésped, la cola del virus se une a los receptores de la superficie celular procariota y el virus introduce su ADN en la célula mediante el uso de un mecanismo de inyección. La cola hace un agujero a través de la pared celular y de la membrana plasmática de la bacteria o arquea y el genoma pasa por la cola a la célula. Una vez dentro, los genes se expresan mediante la transcripción hecha por la maquinaria huésped, haciendo uso de los ribosomas. Típicamente, el genoma se replica haciendo uso de concatémeros.
Las proteínas de la cápside se reúnen para formar una protocabeza, en el que se introduce el genoma. Una vez que esto ha ocurrido, la maduración de la protocabeza se realiza por la división de las unidades de la cápside para formar una cabeza icosaedral con simetría 5. Después de la maduración, la cola se añade por una de dos maneras: o bien la cola se construye por separado y se une con la cabeza, o bien se construye directamente sobre la cabeza del fago. La cola consiste en una hélice de proteínas con simetría 6. Después de la maduración de las partículas virales, la célula es lisada usando lisinas, holinas o una combinación de ambas.
Los caudovirus son un grupo que está creciendo fuertemente en número de especies y géneros descubiertos por metagenómica, pero también en la identificación en cultivos de nuevos procariotas, por lo que se ha propuesto muchas familias adicionales. Se ha sugerido abolir las familias tradicionales Podoviridae, Siphoviridae y Myoviridae elevando sus subfamilias a rango de familia y abolir el orden Caudovirales para crear nuevos órdenes con nuevas familias descubiertas o elevadas de rango debido al gran incremento para acomodar taxones, la gran divergencia evolutiva y porque dichas familias no parecen ser monofiléticas.[2][3]
Los caudovirus se clasifican bajo los siguientes órdenes y familias según el ICTV:[4]
Los caudovirus junto con los virus gigantes son los únicos virus que codifican genes necesarios y tienen algunos elementos para los análisis filogenéticos del árbol de la vida, lo que les permite poderlos incluir en el árbol de la vida. En los análisis filogenéticos basados en genes de polimerasas y traducción los caudovirus aparecen como un linaje basal del árbol filogenético, mientras que los virus gigantes suelen aparecer dentro los eucariotas, por la transferencia horizontal de genes.[5] Por otra parte, en los análisis del proteoma incluido todos los virus emergen como un grupo parafilético, siendo los virus de ARN parafiléticos de los virus de ADN y los virus gigantes los más cercanos a los organismos celulares. También los análisis filogenéticos y estructurales han revelado que los herpesvirus que infectan animales son descendientes de los cuadovirus y ambos comparten una proteína única denominada HK97-MCP, por ello se clasifican en el dominio Duplodnaviria. Los análisis filogenéticos han dado la siguiente filogenia entre los caudovirus con respecto a los herpesvirus y los organismos celulares:[6]
Duplodnaviria Herpesvirales CytotaArchaea (P)
Esto es consistente con que los caudovirus y otros virus se originaron antes que el último antepasado común universal (LUCA).
Datos: Q6521
Multimedia:
Especies: Caudovirales
Caudoviricetes es una extensa clase de virus que infectan procariotas (bacterias y arqueas). Son llamados "caudovirus" o "bacteriófagos de cola".
Comprenden la mayor parte de los bacteriófagos. En el marco del esquema de la Clasificación de Baltimore se integran en el Grupo I, ya que tienen un genoma ADN bicatenario. El tamaño del genoma está comprendido entre 18 y 500 kbp. Las partículas virales tienen una forma distintiva con una cabeza icosaedral que contiene el genoma y conectada a una cola. El orden abarca una amplia gama de virus, muchos de los cuales tienen los mismos o similares genes, mientras que la secuencia de nucleótidos puede variar considerablemente, incluso entre el mismo género. Debido a su característica estructural, se cree que comparten un origen común y que fueron los ancestros de los herpesvirus según análisis filogenéticos y estructurales.
Los caudovirus infectan bacterias y arqueas de casi todos los filos según el gran incremento por metagenómica y la abundancia de elementos virales endógenos. Aunque la mayoría de los filos bacterianos y arqueanos permanecen sin cultivarse, se ha descrito como un elemento viral endógeno en los genomas de muchos de estos filos candidatos o los huéspedes se determinaron por técnicas de metagenómica. También infectaron al último antepasado común universal según investigaciones recientes. Los caudovirus desde su origen aparentemente fueron los virus que le ganaron la competencia a los restantes tipos de virus procariotas y por ello son muy abundantes, se hallan con más frecuencia en los cultivos, muestras metagenómicas, endogenizados y su forma de virion es la popularmente concebida para todos los bacteriófagos a pesar de que los bacteriófagos pueden tener diferentes formas de virion al igual que los virus eucariotas.
Caudovirales est un ordre de virus connus sous le nom de bactériophages à queue (cauda signifie en latin « queue »)[1]. Selon la classification de Baltimore , Caudovirales est un ordre de virus du groupe I, leur génomes étant à ADN double brin (ADNds), qui peuvent avoir une longueur comprise entre 18 000 paires de bases et 500 000 paires de bases.[2] Les virions ont une forme distincte, chacun possédant une tête icosaédrique qui contient le génome viral et qui est attaché à une queue flexible à l'aide d'une protéine connectrice[2]. L'ordre englobe un large éventail de virus, dont la plupart contiennent des gènes de séquences nucléotidiques et de fonctions similaires. Cependant, certains génomes de bactériophages à queue peuvent varier de manière assez significative dans la séquence nucléotidique, et ce même au sein du même genre. En raison de leur structure caractéristique et de la possession de gènes potentiellement homologues, on pense que ces bactériophages possèdent une origine commune[2].
Cette ordre contient 14 familles, 73 sous-familles, 927 genres et 2 814 espèces. Cela fait des Caudovirales l'ordre le plus peuplé parmi les virus, représentant environ 30% de toutes les espèces de virus reconnues et près de la moitié de tous les genres de virus.[3]
En rencontrant une bactérie hôte, la queue du virion s'attache aux récepteurs présents à la surface cellulaire et délivre l'ADN dans la bactérie. La queue du virus perce un trou dans la paroi cellulaire bactérienne et la membrane plasmique, le génome passe par la queue et rentre dans la bactérie. Une fois à l'intérieur, les gènes sont exprimés à partir de la machinerie génomique de l'hôte, en utilisant les ribosomes de ce dernier[2].
Un total de 14 familles ainsi qu'un genre incertae sedis ont été attribués à l'ordre[3] :
)Caudovirales est un ordre de virus connus sous le nom de bactériophages à queue (cauda signifie en latin « queue »). Selon la classification de Baltimore , Caudovirales est un ordre de virus du groupe I, leur génomes étant à ADN double brin (ADNds), qui peuvent avoir une longueur comprise entre 18 000 paires de bases et 500 000 paires de bases. Les virions ont une forme distincte, chacun possédant une tête icosaédrique qui contient le génome viral et qui est attaché à une queue flexible à l'aide d'une protéine connectrice. L'ordre englobe un large éventail de virus, dont la plupart contiennent des gènes de séquences nucléotidiques et de fonctions similaires. Cependant, certains génomes de bactériophages à queue peuvent varier de manière assez significative dans la séquence nucléotidique, et ce même au sein du même genre. En raison de leur structure caractéristique et de la possession de gènes potentiellement homologues, on pense que ces bactériophages possèdent une origine commune.
Cette ordre contient 14 familles, 73 sous-familles, 927 genres et 2 814 espèces. Cela fait des Caudovirales l'ordre le plus peuplé parmi les virus, représentant environ 30% de toutes les espèces de virus reconnues et près de la moitié de tous les genres de virus.
I Caudovirales sono un ordine di virus noti anche come batteriofagi caudati. Sono dotati di genoma a DNA a doppio filamento, pertanto nella classificazione di Baltimore sono inseriti nel gruppo I (virus a dsDNA). Il genoma può avere dimensioni che variano da 18 a 500 kbp di lunghezza. La struttura dei virioni è composta da una "coda" tubolare e da una "testa" icosaedrica che contiene il DNA. L'ordine caudovirales comprende una grande varietà di virus molti dei quali possiedono diversi geni simili o identici, anche se le sequenze nucleotidiche possono variare notevolmente. Per via della loro struttura peculiare, si ritiene che questi virus abbiano un'origine comune.
In seguito all'incontro con il batterio ospite, la coda del batteriofago si lega ai recettori posti sulla superficie cellulare. Il genoma virale viene inserito nella cellula attraverso la coda, la quale si inserisce attraverso la membrana plasmatica, bucandola. Il genoma entra nella cellula, mentre il capside rimane all'esterno.
Una volta all'interno della cellula il genoma virale deve essere trascritto dai meccanismi di trascrizione dell'ospite, e successivamente tradotto da ribosomi al fine di produrre le proteine virali. Anche la duplicazione del genoma dipende dai meccanismi dell'ospite, di conseguenza è necessario che la cellula sia in attiva replicazione affinché il ciclo infettivo vada a buon fine.
Le proteine del capside sono assemblate sotto forma di precursori. Una volta assemblata la testa il nuovo genoma virale vi viene inserito e le proteine vanno incontro a maturazione tramite tagli proteolitici. La coda, a seconda della specie, può essere assemblata separatamente e successivamente connessa alla testa o assemblata direttamente sulla testa. Al termine dell'assemblaggio e della maturazione i virioni si accumulano all'interno del citoplasma. Una volta raggiunto un numero sufficiente, la cellula viene portata a lisi e i fagi diffondono nell'ambiente circostante.
L'ordine Caudovirales è suddiviso in nove famiglie più un genere incertae sedis:[1]
I Caudovirales sono un ordine di virus noti anche come batteriofagi caudati. Sono dotati di genoma a DNA a doppio filamento, pertanto nella classificazione di Baltimore sono inseriti nel gruppo I (virus a dsDNA). Il genoma può avere dimensioni che variano da 18 a 500 kbp di lunghezza. La struttura dei virioni è composta da una "coda" tubolare e da una "testa" icosaedrica che contiene il DNA. L'ordine caudovirales comprende una grande varietà di virus molti dei quali possiedono diversi geni simili o identici, anche se le sequenze nucleotidiche possono variare notevolmente. Per via della loro struttura peculiare, si ritiene che questi virus abbiano un'origine comune.
Caudovirales (do latim: caudo, cauda + virus, veneno + ales, relativo a ordem) é uma ordem de vírus segundo a classificação taxonômica da ICTV.[1] Na classificação de Baltimore as famílias desta ordem pertencem a classe I: dsDNA virus. Os vírus desta ordem compreendem bacteriófagos com cauda, que infectam bactérias e arqueias.[2]
Caudovirales (do latim: caudo, cauda + virus, veneno + ales, relativo a ordem) é uma ordem de vírus segundo a classificação taxonômica da ICTV. Na classificação de Baltimore as famílias desta ordem pertencem a classe I: dsDNA virus. Os vírus desta ordem compreendem bacteriófagos com cauda, que infectam bactérias e arqueias.
Caudovirales
Группа по БалтиморуI: дцДНК-вирусы
Caudovirales (лат., от cauda — хвост) — порядок ДНК-содержащих вирусов-бактериофагов, вирионы которых имеют икосаэдрическую форму головки и спиральный хвост.
Геном представлен одной несегментированной линейной двухцепочечной молекулой ДНК. Линейная молекула иногда может приобретать кольцевую форму; также в двухцепочечной структуре могут встречаться одноцепочечные промежутки. Концы молекулы ковалентно связаны с терминальными белками. Геном может содержать от 18 до 500 тысяч пар нуклеотидов и кодирует как структурные, так и не структурные белки[2].
Порядок включает в себя большое количество вирусов[3], многие из которых имеют похожие гены, но их последовательность может существенно варьироваться даже среди одного рода. Об общем происхождении судят по характерной структуре вирусных частиц.
В 2016 году с подачи подкомитета по бактериальным и архейным вирусам Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV) были изменены научные названия представителей порядка и других бактериофагов:
На апрель 2018 года в порядок включают следующие семейства и подсемейства[3]:
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Caudovirales (лат., от cauda — хвост) — порядок ДНК-содержащих вирусов-бактериофагов, вирионы которых имеют икосаэдрическую форму головки и спиральный хвост.
Геном представлен одной несегментированной линейной двухцепочечной молекулой ДНК. Линейная молекула иногда может приобретать кольцевую форму; также в двухцепочечной структуре могут встречаться одноцепочечные промежутки. Концы молекулы ковалентно связаны с терминальными белками. Геном может содержать от 18 до 500 тысяч пар нуклеотидов и кодирует как структурные, так и не структурные белки.
Порядок включает в себя большое количество вирусов, многие из которых имеют похожие гены, но их последовательность может существенно варьироваться даже среди одного рода. Об общем происхождении судят по характерной структуре вирусных частиц.
В 2016 году с подачи подкомитета по бактериальным и архейным вирусам Международного комитета по таксономии вирусов (ICTV) были изменены научные названия представителей порядка и других бактериофагов:
в названиях родов удалили сочетания like и phi; в названиях видов заменили слово phage на virus в знак признания того, что бактериофаги являются обычными вирусами; уточнили инфицируемые организмы до названия рода, убрали видовые названия прокариотов и дефисы; удалили сочетание phi там, где нет никаких исторических причин для его присутствия.有尾噬菌體目（学名：Caudovirales），caudo由拉丁文的cauda而來，有“尾狀”的意思。本目的病毒主要的宿主為細菌和古細菌，感染宿主時會利用尾狀的結構，將DNA注入宿主中。在生物技術方面，有些種類的尾狀噬菌體能作為病毒（例如：疱疹病毒科）的載體，用於基因複製和建立基因庫的功能上。
有尾噬菌體目（学名：Caudovirales），caudo由拉丁文的cauda而來，有“尾狀”的意思。本目的病毒主要的宿主為細菌和古細菌，感染宿主時會利用尾狀的結構，將DNA注入宿主中。在生物技術方面，有些種類的尾狀噬菌體能作為病毒（例如：疱疹病毒科）的載體，用於基因複製和建立基因庫的功能上。
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