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Swine Vesicular Exanthema Virus And Relatives

Caliciviridae

Caliciviridae ( Catalan; Valencian )

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Caliciviridae és una família de virus, membres de la calsse IV de la Classificació de Baltimore. Pertanyen al grup de virus d'ARN monocatenaris +. El nom deriva del llatí calyx que vol dir copa.

Els calicivirus s'han trobat en nombrosos organismes com els humans, bovins, porcins, ocells, rèptils, dofins i amfibis. Els calicivirus tenen una construcció simple i no tenen embolcall viral. La càpside és hexagonal/esfèrica amb simetria icosaèdrica amb un diàmetre de 35-39 nm.[1]

No creixen en cultius de laboratori i no es disposa d'un model animal però gràcies a les modernes tècniques genòmiques s'han pogut estudiar més.[1] S'ha seqüenciat el genoma d'aquests virus.

Gèneres

Austràlia i Nova Zelanda, tractant de controlar la seva població de conills, de manera intencionada han estès els calcivirus.

Malalties humanes

Les infeccions provoquen una gastroenteritis aguda (amb vòmits i diarrea). En general no requereixen hospitalització excepte en pacients immunodeprimits per a rehidratar-los.

Malalties en altres animals

En gats el Feline calicivirus (FCV) és un important patogen. Sapovirus, Norovirus i Vesivirus s'han detectat en porcins. En ratolins es va descobrir el 2003 (MNV-1). L'hemorràgia vírica dels conills (RHDV) és molt important.[1]

Referències

  1. 1,0 1,1 1,2 Hansman, GS (editor). Caliciviruses: Molecular and Cellular Virology. Caister Academic Press, 2010. ISBN 978-1-904455-63-9.

Enllaços externs

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Caliciviridae: Brief Summary ( Catalan; Valencian )

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Caliciviridae és una família de virus, membres de la calsse IV de la Classificació de Baltimore. Pertanyen al grup de virus d'ARN monocatenaris +. El nom deriva del llatí calyx que vol dir copa.

Els calicivirus s'han trobat en nombrosos organismes com els humans, bovins, porcins, ocells, rèptils, dofins i amfibis. Els calicivirus tenen una construcció simple i no tenen embolcall viral. La càpside és hexagonal/esfèrica amb simetria icosaèdrica amb un diàmetre de 35-39 nm.

No creixen en cultius de laboratori i no es disposa d'un model animal però gràcies a les modernes tècniques genòmiques s'han pogut estudiar més. S'ha seqüenciat el genoma d'aquests virus.

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Caliciviridae ( German )

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Caliciviridae Norwalk.jpg

Humane Noroviren im TEM nach Negativkontrastierung (Markierung entspr. 50 nm)

Systematik Klassifikation: Viren Ordnung: nicht klassifiziert Familie: Caliciviridae Taxonomische Merkmale Genom: (+)ssRNA linear Baltimore: Gruppe 4 Symmetrie: ikosaedrisch Hülle: keine Wissenschaftlicher Name Caliciviridae (engl.) Links NCBI Taxonomy: 11974 ICTVdB Virus Code: 00.012

Die Familie Caliciviridae (Caliciviren) umfasst derzeit vier Gattungen von unbehüllten Viren mit einer einzelsträngigen, linearen RNA mit positiver Polarität. Caliciviridae sind die Erreger verschiedener Erkrankungen beim Menschen und bei Tieren, darunter auch Kaninchen, Hasen, Schweine, Katzen, Mäuse, Rinder, Wale, Flossenfüßer (Robben) und Reptilien. Mit Ausnahme der Spezies der Gattung Vesivirus zeigen die jeweiligen Caliciviren ein enges Wirtsspektrum und können nur schwer von einer Wirtsspezies zu einer anderen übertragen werden.

Morphologie

Die kugelförmigen Viruspartikel der Caliciviridae erscheinen bei Negativkontrastierung im TEM etwa 27 bis 40 nm im Durchmesser groß (Bild rechts mit 50-nm-Markierung), im Kryoelektronenmikroskop 35–40 nm. Bei der Abbildung im TEM zeigen die Caliciviren eine kleine, kelchförmige Eindellung, von der sie ihren Namen erhielten (lat. calix: Becher, Pokal). Die Partikel sind unbehüllte Kapside, die aus 90 Dimeren des Haupt-Strukturproteins aufgebaut sind. Sie zeigen eine ikosaedrische T=3 Symmetrie.

Systematik

Innere Systematik

  • Familie Caliciviridae
  • Stamm NB
Vorläufige Spezies der Gattung Norovirus:
Vorläufige Spezies der Gattung Sapovirus:
  • Spezies Felines Calicivirus (en. Feline calicivirus, 2 Genotypen)
  • Spezies Vesikulärexanthem-Virus (en. Vesicular exanthema of swine virus, VEV oder VESV, Typusspezies), urspr. Erkrankung beim Schwein mit bislang 9 Stämmen (Subspezies):
  • Vorläufige Spezies der Gattung Vesivirus:
Vorläufige – mit Stand November 2018 noch nicht vom ICTV bestätigte – Gattungen:
  • Spezies ‚Sewage associated calici-like virus‘ (SecaliV, gefunden im Abwasser, englisch sewage)
Weitere putative Spezies innerhalb der Familie Calciviridae ohne Gattungszuordnung (Auswahl):

Für die innere Systematik gibt es verschiedene Vorschläge. Gemeinsamkeit ist, dass sich die Calciviridae in zwei Hauptgruppen teilen:[19]

  • ‚Sapovirus-Gruppe‘: Gattungen Lagovirus, Nebovirus, Vesivirus und Sapovirus (mut typischem Aussehen der Virionen)
  • ‚Norovirus-Gruppe‘: Gattung Norovirus zusammen mit weiteren putativen Gattungen (mit kleinen, rundlichen, strukturierten Virionen)

Das folgende Kladogramm basiert auf dem Vorschlag von Siqueira et al. (2018),[20] ergänzt durch putative Gattungen nach Mikalsen et al. (2014):[21]

Calciviridae ‚Norovirus-Gruppe‘

Salovirus



Norovirus



Tulanevirus


Recovirus





‚Sapovirus-Gruppe‘

Lagovirus



Nebovirus



Vesivirus


Sapovirus







Vorlage:Klade/Wartung/Style

Teilweise abweichende Vorschläge – ohne Berücksichtigung der puativen Gattungen – findet man in älteren Veröffentlichungen wie z. B.:

  • Ian N. Clarke et al. (2017)[22]
  • Ian N. Clarke et al. (2012)[23]
  • Scipioni et al. (2008)[1]
  • Espinosa et al. (2004)[24] – keine Abweichung zu Siqueira et al. (2018)

Äußere Systematik

Koonin et al haben 2015 die Caliciviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Picornavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[25] Der Stammbaum dieser Supergruppe ist nach den Autoren wie folgt:[26]


Picornavirus-like superfamily‘


Picobirnaviridae (dsRNA)



Amalgaviridae (dsRNA)


Partitiviridae (dsRNA)




Megabirnaviridae (dsRNA)


Chrysoviridae (dsRNA)




Quadriviridae (dsRNA)


Totiviridae (dsRNA)






Caliciviridae





Picornavirales




Potyviridae


Hypoviridae (dsRNA)



Astroviridae





Luteoviridae


Barnaviridae





Vorlage:Klade/Wartung/Style

Die Mitglieder dieser putativen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch − wie die Totiviridae und Quadriviviridae − viele doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

Literatur

  • K.Y. Green, R.M. Chancock und A.Z. Kapikian: Human caliciviruses. In: David M. Knipe, Peter M. Howley et al. (eds.): Fields´ Virology, 4. Auflage, Philadelphia 2001
  • C.M. Fauquet, M.A. Mayo et al.: Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, Family Caliciviridae S. 843–851, London, San Diego, 2005

Weblinks

Einzelnachweise

  1. a b A. Scipioni, Axel Mauroy, Jan Vinjé, E. Thiry: Review of Animal Noroviruses, in: Veterinary Journal 178 (Januar 2008), S. 32–45, Public Health Resources, University of Nebraska – Lincoln
  2. Turhan Turan et al.: Detection and Molecular Analysis of Bovine Enteric Norovirus and Nebovirus in Turkey, in: J Vet Res. 2018 Jun; 62(2): 129–135. , doi:10.2478/jvetres-2018-0021
  3. J. R. Smiley, K. O. Chang, J. Hayes, J. Vinjé, L. J. Saif: Characterization of an Enteropathogenic Bovine Calicivirus Representing a Potentially New Calicivirus Genus, in: J Virol. 2002 Oct; 76(20): S. 10089–10098. doi:10.1128/JVI.76.20.10089-10098.2002
  4. Feray Alkan et al.: Identification of a Bovine Enteric Calicivirus, Kırklareli Virus, Distantly Related to Neboviruses, in Calves with Enteritis in Turkey, in: J Clin Microbiol. 2015 Nov; 53(11): S. 3614–3617. doi:10.1128/JCM.01736-15
  5. Farkas T, Sestak K, Wei C, Jiang X (2008) Characterization of a rhesus monkey calicivirus representing a new genus of Caliciviridae. J Virol 82, S. 5408–5416. doi:10.1128/JVI.00070-08
  6. Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages: Recovirus
  7. Najoua Drouaz, Julien Schaeffer, Tibor Farkas, Jacques Le Pendu, Françoise S. Le Guyader; K. E. Wommack, Editor (Hrsg.): Tulane Virus as a Potential Surrogate To Mimic Norovirus Behavior in Oysters, in: Appl Environ Microbiol 81: S. 5249–5256. American Society for Microbiology, 7. Juli 2015, PubMed 26025893, doi:10.1128/AEM.01067-15
  8. L'Homme, Y., Sansregret, R., Plante-Fortier, E., Lamontagne, A.M., Ouardani, M., Lacroix, G. and Simard, C..: Genomic characterization of swine caliciviruses representing a new genus of Caliciviridae, in: Virus Genes 39: S. 66-75. Epub 2009 Apr 26.
  9. Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages: Valovirus
  10. Di Martino B., Martella V., Di Profio F., Ceci C., Marsilio F.: Detection of St-Valerien-like viruses in swine, Italy, in: Vet Microbiol. 2011 Apr 21;149(1-2): S. 221-224. doi:10.1016/j.vetmic.2010.10.008. Epub 16. Oktober 2010
  11. Go Sato, Hisayuki Ido, Masahiro Kiuchi, Michiyo Kataoka, Kazuhiko Katayama, Yukinobu Tohya: Characterization of St-Valerien-Like Virus Genome Detected in Japan, in: J Vet Med Sci. 2014 Jul; 76(7): S. 1045–1050. doi:10.1292/jvms.13-0468, PMC 4143647 (freier Volltext), PMID 24662519
  12. Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages: Bavovirus
  13. Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages: Minovirus
  14. Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages: Nacovirus
  15. Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages: Sanovirus
  16. Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages: Salovirus
  17. Ian N. Clarke et al.: The Calcivirus Pages: Secalivirus
  18. Jacob F. Kocher, Lisa C. Lindesmith, Kari Debbink, Anne Beall, Michael L. Mallory, Boyd L. Yount, Rachel L. Graham, Jeremy Huynh, J. Edward Gates, Eric F. Donaldson, Ralph S. Baric'; W. Ian Lipkin (Hrsg.): Bat Caliciviruses and Human Noroviruses Are Antigenically Similar and Have Overlapping Histo-Blood Group Antigen Binding Profiles, in: mBio Mai 2018, 9 (3) e00869-18; doi:10.1128/mBio.00869-18
  19. Malak M. El-Hazmi; Julius Chambers (Hrsg.): Viral Gastroenteritis, GI T Block, Microbiology: 2013, Slide 24
  20. Juliana D. Siqueira, Maria Gloria Dominguez-Bello, Monica Contreras, Orlana Lander, Eric Delwart: Complex virome in feces from Amerindian children in isolated Amazonian villages, in:  Nature Communications 9(1), Dezember 2018, doi:10.1038/s41467-018-06502-9
  21. Aase B Mikalsen, Pål Nilsen, Marianne Frøystad-Saugen, Karine Lindmo, Trygve M Eliassen, Marit Rode, Øystein Evensen: Characterization of a Novel Calicivirus Causing Systemic Infection in Atlantic Salmon (Salmo salar L.): Proposal for a New Genus of Caliciviridae, in: PLoS ONE 9(9):e107132, September 2014, doi:10.1371/journal.pone.0107132
  22. Ian N. Clarke et al.: The Calicivirus Pages: Calciviridae, auf: The Pirbright Institute, UK (2006-2017)
  23. Ian N. Clarke, M. K. Estes, Kim Y. Green, G. S. Hansman, Nick Knowles, Marion Koopmans, D. O. Matson, G. Meyers, John Neill, A. Radford, A. W. Smith, Michael Studdert, H.-J. Thiel, Jan Vinjé: Caliciviridae, Virus taxonomy: the classification and nomenclature of viruses, in: The ninth report of the International Committee on Taxonomy of Viruses, Januar 2012, S. 977-986.
  24. Moreno Espinosa, Sarbelio & Farkas, Tibor & Jiang, Xi: [1], in: Seminars in Pediatric Infections Diseases 15(4), S. 237-245, November 2004, DOI: 10.1053/j.spid.2004.07.004
  25. Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Picornavirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  26. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology vom Mai 2015; 479-480. 2–25, Epub 12. März 2015, PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806
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Caliciviridae: Brief Summary ( German )

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Die Familie Caliciviridae (Caliciviren) umfasst derzeit vier Gattungen von unbehüllten Viren mit einer einzelsträngigen, linearen RNA mit positiver Polarität. Caliciviridae sind die Erreger verschiedener Erkrankungen beim Menschen und bei Tieren, darunter auch Kaninchen, Hasen, Schweine, Katzen, Mäuse, Rinder, Wale, Flossenfüßer (Robben) und Reptilien. Mit Ausnahme der Spezies der Gattung Vesivirus zeigen die jeweiligen Caliciviren ein enges Wirtsspektrum und können nur schwer von einer Wirtsspezies zu einer anderen übertragen werden.

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Caliciviridae

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The Caliciviridae are a family of viruses, members of Class IV of the Baltimore scheme. They are positive-sense, single-stranded RNA which is not segmented[1]. Thirteen species are placed in this family, divided among eleven genera.[2] Diseases associated with this family include feline calicivirus (respiratory disease), rabbit hemorrhagic disease virus (often-fatal hemorrhages), and Norwalk group of viruses (gastroenteritis).[2][3] Caliciviruses naturally infect vertebrates, and have been found in a number of organisms such as humans, cattle, pigs, cats, chickens, reptiles, dolphins and amphibians. The caliciviruses have a simple construction and are not enveloped. The capsid appears hexagonal/spherical and has icosahedral symmetry (T=1 or T=3[3]) with a diameter of 35–39 nm.[4]

Caliciviruses are not very well studied because until recently, they could not be grown in culture, and no suitable animal model has been found. However, the recent application of modern genomic technologies has led to an increased understanding of the virus family.[4] A recent isolate from rhesus monkeysTulane virus—can be grown in culture, and this system promises to increase understanding of these viruses.[5]

The name calicivirus is derived from the Greek word calyx meaning cup or goblet, due to many strains having visible cup-shaped depressions.

Taxonomy[2]

Group: ssRNA(+)

Two additional genera have been proposed: Recovirus for a novel calicivirus detected in stool specimens (Tulane virus) from rhesus monkeys[6] and Valovirus for a novel group of swine caliciviruses known as the St-Valérien-like viruses. These genera have yet to be officially approved. A number of other caliciviruses remain unclassified, including the chicken calicivirus.

Virology

All viruses in this family possess a nonsegmented, polyadenylated, positive-sense, single-strand RNA genome around 7.5–8.5 kilobases in length, enclosed in an icosahedral capsid of 27–40 nanometers in diameter.

Life cycle

Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by attachment to host receptors, which mediate endocytosis. Replication follows the positive-stranded RNA virus replication model. Positive-stranded RNA virus transcription is the method of transcription. Translation takes place by leaky scanning, and RNA termination-reinitiation. Vertebrates serve as the natural host. Transmission routes are fecal-oral.[3]

Human disease

Calicivirus infections commonly cause acute gastroenteritis, which is the inflammation of the stomach and intestines (e.g. the Norwalk virus). Symptoms can include vomiting and diarrhea. These symptoms emerge after an incubation time of 2 days and the symptoms only generally last for 3 days. Most calicivirus infections do not call for medical attention, but those who are immunocompromised may need to be hospitalized for rehydration therapy.

Animal viruses

Feline calicivirus (FCV)—a member of the Vesivirus—represents an important pathogen of cats.

Sapovirus, Norovirus, and Vesivirus have been detected in pigs, making this animal species of particular interest in the study of calicivirus pathogenesis and host range.

The first mouse norovirus, murine norovirus 1 (MNV-1), was discovered in 2003. Since then, numerous murine norovirus strains have been identified and they were assigned a new genogroup in the genus Norovirus.

Rabbit hemorrhagic disease virus is a pathogen of rabbits that causes major problems throughout the world where rabbits are reared for food and clothing, make a significant contribution to ecosystem ecology, and where they support valued wildlife as a food source.[4]

Note

Australia and New Zealand, in an effort to control their rabbit populations, have intentionally spread calicivirus.

References

  1. ^ Vinjé, J; Estes, MK; Esteves, P; Green, KY; Katayama, K; Knowles, NJ; L'Homme, Y; Martella, V; Vennema, H; White, PA; ICTV Report Consortium (November 2019). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Caliciviridae". The Journal of General Virology. 100 (11): 1469–1470. doi:10.1099/jgv.0.001332. PMID 31573467.
  2. ^ a b c "ICTV Report Caliciviridae".
  3. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  4. ^ a b c Hansman, GS (editor) (2010). Caliciviruses: Molecular and Cellular Virology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-63-9.CS1 maint: extra text: authors list (link)
  5. ^ Yu G, Zhang D, Guo F, Tan M, Jiang X, Jiang W (2013) Cryo-EM structure of a novel calicivirus, Tulane Virus. PLoS One 8(3):e59817. doi: 10.1371/journal.pone.0059817
  6. ^ Farkas T, Sestak K, Wei C, Jiang X (2008) Characterization of a rhesus monkey calicivirus representing a new genus of Caliciviridae. J Virol 82: 5408–5416. doi: 10.1128/JVI.00070-08

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Caliciviridae: Brief Summary

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The Caliciviridae are a family of viruses, members of Class IV of the Baltimore scheme. They are positive-sense, single-stranded RNA which is not segmented. Thirteen species are placed in this family, divided among eleven genera. Diseases associated with this family include feline calicivirus (respiratory disease), rabbit hemorrhagic disease virus (often-fatal hemorrhages), and Norwalk group of viruses (gastroenteritis). Caliciviruses naturally infect vertebrates, and have been found in a number of organisms such as humans, cattle, pigs, cats, chickens, reptiles, dolphins and amphibians. The caliciviruses have a simple construction and are not enveloped. The capsid appears hexagonal/spherical and has icosahedral symmetry (T=1 or T=3) with a diameter of 35–39 nm.

Caliciviruses are not very well studied because until recently, they could not be grown in culture, and no suitable animal model has been found. However, the recent application of modern genomic technologies has led to an increased understanding of the virus family. A recent isolate from rhesus monkeysTulane virus—can be grown in culture, and this system promises to increase understanding of these viruses.

The name calicivirus is derived from the Greek word calyx meaning cup or goblet, due to many strains having visible cup-shaped depressions.

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Caliciviridae ( Spanish; Castilian )

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Caliciviridae (del latín calix, "cáliz") es una familia de virus infectivos para animales. Los calicivirus han sido encontrados en la mayoría de los animales domésticos y muchos silvestres, como cerdos, conejos, gallinas y anfibios. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore.

Debido a su difícil cultivo y a la inexistencia de un modelo animal apropiado, los calicivirus no han sido bien estudiados. Recientemente los avances en biología molecular están permitiendo conocer el genoma vírico.

Características

Poseen un genoma con ARN de cadena sencilla de sentido positivo como ácido nucleico. Albergan dicha información genética en una cápside carente de envoltura viral y estructuralmente definida por una simetría icosaédrica, de un tamaño de 35 a 40 nm. Los viriones se acumulan como partículas aisladas en disposiciones para-cristalinas en el citoplasma, formando microfibrillas en estructuras membranosas.

Géneros

Sus géneros representativos son:

Síntomas de la enfermedad en humanos

Las infecciones en humanos por el virus de Norwalk y Virus Sapporo usualmente causan gastroenteritis aguda. Los síntomas pueden incluir vómito y diarrea. Estos síntomas surgen después de un periodo de incubación de 2 días y suelen durar sólo 3 días. La mayoría de las infecciones por calicivirus no precisan de atención médica, pero los pacientes inmunocomprometidos pueden necesitar hospitalización para una terapia de rehidratación.

Referencias

  • Prescott, L.M. (199). Microbiología. McGraw-Hill Interamericana de España, S.A.U. ISBN 84-486-0261-7.

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Caliciviridae: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

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Caliciviridae (del latín calix, "cáliz") es una familia de virus infectivos para animales. Los calicivirus han sido encontrados en la mayoría de los animales domésticos y muchos silvestres, como cerdos, conejos, gallinas y anfibios. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore.

Debido a su difícil cultivo y a la inexistencia de un modelo animal apropiado, los calicivirus no han sido bien estudiados. Recientemente los avances en biología molecular están permitiendo conocer el genoma vírico.

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Caliciviridae ( French )

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La famille des Caliciviridae appartient au groupe IV des virus à ARN simple brin (à polarité positive). Ils sont retrouvés chez un grand nombre d'organismes tels que l'être humain, les primates, le chat, le porc, le poulet, les reptiles, les dauphins, et les amphibiens.

Les calicivirus ont été peu étudiés du fait des difficultés de leur culture et qu'il n'existe pas de modèle animal convenable. Les avancées en biologie moléculaire ont permis l'étude de son génome.

Le nom de calicivirus vient du mot latin calyx qui signifie « calice », la surface de certains virus présentant, en microscopie électronique, des dépressions en forme de calices.

Structure

Ce sont des virus non enveloppés, icosaédriques, mesurant 35 à 39 nm. Leur génome est de type ARN simple brin et code des protéines structurales (capside) et non structurales (polymérase, protéase).

Genres

Les Caliciviridae sont divisés en 4 genres :

  • le genre Vesivirus, qui n’infecte que l’animal,
  • le genre Lagovirus, qui n’infecte que l’animal,
  • le genre Norovirus ou Norwalk-Like Virus (NLV), dont l'exemple est le virus de Norwalk,
  • et le genre Sapovirus ou Sapporo-Like Virus (SLV), qui infectent l’homme.

Pathogénécité

Leur transmission est oro-fécale, soit par contact inter-humain, soit par ingestion d’un aliment contaminé. L’hypothèse d’une transmission par voie aérienne a aussi été avancée.

Les Calcivirus ont un tropisme entérique et affectent les entérocytes matures.

La durée d'excrétion virale est de trois jours. La concentration virale par gramme de selles est supérieure à 10⁶.

Pathologies

Les pathologies liées à cette famille de virus peuvent toucher la peau, ils peuvent être responsables de pneumonie, d'avortement, d'encéphalite, de myocardite, d'hépatites, de troubles de la coagulation.

Chez l'homme, ils sont fréquemment à l’origine d’épidémies de gastro-entérite, particulièrement ceux du genre NLV. La période d'incubation est de 12 à 24 heures ; la durée des signes cliniques, de 24 à 48 heures.

Méthodes de diagnostic

Références

  • (en) Cet article est partiellement issu d’une traduction de l’article en anglais : "Caliciviridae".
  • Van der Poel W. Vinjé J. Van der Heide R. Herrera M.I. Vivo A. Koopmans M. Norwalk-Like Calicivirus genes in farm animals. Emerging Infectious Diseases 2000 ; 6 (1) : 36-41.

Voir

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Caliciviridae: Brief Summary ( French )

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La famille des Caliciviridae appartient au groupe IV des virus à ARN simple brin (à polarité positive). Ils sont retrouvés chez un grand nombre d'organismes tels que l'être humain, les primates, le chat, le porc, le poulet, les reptiles, les dauphins, et les amphibiens.

Les calicivirus ont été peu étudiés du fait des difficultés de leur culture et qu'il n'existe pas de modèle animal convenable. Les avancées en biologie moléculaire ont permis l'étude de son génome.

Le nom de calicivirus vient du mot latin calyx qui signifie « calice », la surface de certains virus présentant, en microscopie électronique, des dépressions en forme de calices.

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Caliciviridae ( Italian )

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Quella dei Caliciviridae è una famiglia di virus. Essi devono il nome alla struttura a calice formata dai 32 capsomeri (composti per il 98% dalla proteina strutturale principale) che formano il capside icosaedrico, che raggiunge generalmente un diametro di 35-40 nm.

Il genoma è rappresentato da RNA a polarità positiva e non segmentato; sono inoltre sprovvisti di pericapside. Il virus entra nell'organismo ospite (a seconda della specie, questi virus infettano anfibi, conigli, delfini, gatti, suini, bovini ed anche l'uomo) mediante la via oro-fecale, o anche attraverso le vie respiratorie: una volta giunto all'interno dell'ospite, esso si replica nel citoplasma delle sue cellule e ne fuoriesce attraverso la lisi della cellula infettata.

Questi virus non sono stati ancora studiati approfonditamente: ciò è dovuto al fatto che essi non crescono in coltura, né alcun organismo modello è in grado di ospitarli. A causa di ciò, il genoma del virus è stato decifrato solo piuttosto recentemente.

Nell'uomo, i calicivirus più diffusi sono quello che causa la gastroenterite, i virus di Norwalk, ed il virus dell'epatite E: i governi di Australia e Nuova Zelanda, per arginare la piaga dei conigli selvatici che si moltiplicavano a dismisura, autorizzarono la diffusione deliberata di RHDV, calicivirus del genere Lagovirus.

Nei gatti l'infezione può dare serie conseguenze soprattutto negli individui giovani non vaccinati e soggetti a malattie. Segni e sintomi della malattia comprendono ulcere al palato duro e alla lingua, spesso associate a stomatite, ma anche sintomi respiratori, e se non curata porta facilmente alla morte.

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Caliciviridae: Brief Summary ( Italian )

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Quella dei Caliciviridae è una famiglia di virus. Essi devono il nome alla struttura a calice formata dai 32 capsomeri (composti per il 98% dalla proteina strutturale principale) che formano il capside icosaedrico, che raggiunge generalmente un diametro di 35-40 nm.

Il genoma è rappresentato da RNA a polarità positiva e non segmentato; sono inoltre sprovvisti di pericapside. Il virus entra nell'organismo ospite (a seconda della specie, questi virus infettano anfibi, conigli, delfini, gatti, suini, bovini ed anche l'uomo) mediante la via oro-fecale, o anche attraverso le vie respiratorie: una volta giunto all'interno dell'ospite, esso si replica nel citoplasma delle sue cellule e ne fuoriesce attraverso la lisi della cellula infettata.

Questi virus non sono stati ancora studiati approfonditamente: ciò è dovuto al fatto che essi non crescono in coltura, né alcun organismo modello è in grado di ospitarli. A causa di ciò, il genoma del virus è stato decifrato solo piuttosto recentemente.

Nell'uomo, i calicivirus più diffusi sono quello che causa la gastroenterite, i virus di Norwalk, ed il virus dell'epatite E: i governi di Australia e Nuova Zelanda, per arginare la piaga dei conigli selvatici che si moltiplicavano a dismisura, autorizzarono la diffusione deliberata di RHDV, calicivirus del genere Lagovirus.

Nei gatti l'infezione può dare serie conseguenze soprattutto negli individui giovani non vaccinati e soggetti a malattie. Segni e sintomi della malattia comprendono ulcere al palato duro e alla lingua, spesso associate a stomatite, ma anche sintomi respiratori, e se non curata porta facilmente alla morte.

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Caliciviridae ( Malay )

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Caliciviridae merupakan sebuah famili virus, iaitu ahli-ahli Kelas IV skema Baltimore, yang lebih dikenali sebagai kalisivirus. Kalisivirus merupakan RNA bebenang tunggal yang berderia positif dan tidak bersegmen. Kalisivirus ditemui dalam sebilangan jenis hidupan seperti manusia, lembu, babi, kucing, ayam, dolfin, reptilia, dan amfibia. Kalisivirus mempunyai binaan yang ringkas dan tidak bersampul. Kapsidnya kelihatan berbentuk segienam/sfera dan bersimetri ikosahedral dengan diameter 35-39 nm.[1]

Kalisivirus tidak begitu dikaji dengan menyeluruh kerana ia tidak boleh tumbuh dalam kultur, apalagi tiadanya contoh haiwan yang sesuai. Namun begitu, penggunaan teknologi genom terkini telah membolehkan peningkatan pemahaman terhadap famili virus ini.[1] Genom virusnya telah pun ditentukan jujukannya.

Nama kalisivirus adalah bersempena perkataan Latin calyx yang bererti cawan atau piala. Nama ini sesuai kerana kebanyakan strain virus ini nyata mempunyai lekukan seakan cawan.

Famili Caliciviridae merangkumi genus-genus berikut:

Di Australia dan New Zealand, kalisivirus disebarkan secara sengaja untuk mengawal bilangan arnab di negara masing-masing.

Penjangkitan

Pada umumnya, kalisivirus dijangkitkan menerusi laluan tinja mulut, tetapi boleh juga dijangkitkan menerusi laluan pernafasan.

Penyakit manusia

Jangkitan kalisivirus biasanya menyebabkan gastroenteritis akut, iaitu keradangan perut dan usus. Simptom-simptomnya termasuk muntah dan cirit-birit. Simptom-simptom ini timbul selepas masa mengeram selama dua hari, dan biasanya hanya bertahan selama tiga hari. Kebanyakan kejadian jangkitan kalisivirus tidak memerlukan perhatian perubatan, tetapi bagi sesiapa yang terimunokompromi, mereka wajar dikejarkan ke hospital untuk terapi penghidratan semula.

Virus haiwan

Kalisivirus felin (FCV) merupakan salah sejenis patogen terpenting yang boleh menjangkiti kucing. Sapovirus, Norovirus dan Vesivirus pernah dikesan dalam babi, oleh itu babi menarik perhatian khusus dalam kajian patogenesis dan taburan perumah kalisivirus. Norovirus tikus yang pertama, iaitu novovirus murin 1 (MNV-1), ditemui pada tahun 2003. Semenjak itu, berbilang strain novovirus murin telah dikenal pasti lalu diberikan kumpulan gen baru dalam genus Norovirus. Virus penyakit berdarah arnab (rabbit haemorrhagic disease virus, RHDV) merupakan patogen arnab yang menyebabkan masalah besar di seluruh dunia di mana arnab diternak untuk makanan dan bulunya, memberikan sumbangan besar kepada ekologi ekosistem, dan menyokong hidupan liar berharga sebagai sumber makanan.[1]

Lihat juga

Rujukan

  1. ^ a b c Hansman, GS (editor) (2010). Caliciviruses: Molecular and Cellular Virology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-63-9.Selenggaraan CS1: Extra text: senarai pengarang (link)

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Caliciviridae: Brief Summary ( Malay )

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Caliciviridae merupakan sebuah famili virus, iaitu ahli-ahli Kelas IV skema Baltimore, yang lebih dikenali sebagai kalisivirus. Kalisivirus merupakan RNA bebenang tunggal yang berderia positif dan tidak bersegmen. Kalisivirus ditemui dalam sebilangan jenis hidupan seperti manusia, lembu, babi, kucing, ayam, dolfin, reptilia, dan amfibia. Kalisivirus mempunyai binaan yang ringkas dan tidak bersampul. Kapsidnya kelihatan berbentuk segienam/sfera dan bersimetri ikosahedral dengan diameter 35-39 nm.

Kalisivirus tidak begitu dikaji dengan menyeluruh kerana ia tidak boleh tumbuh dalam kultur, apalagi tiadanya contoh haiwan yang sesuai. Namun begitu, penggunaan teknologi genom terkini telah membolehkan peningkatan pemahaman terhadap famili virus ini. Genom virusnya telah pun ditentukan jujukannya.

Nama kalisivirus adalah bersempena perkataan Latin calyx yang bererti cawan atau piala. Nama ini sesuai kerana kebanyakan strain virus ini nyata mempunyai lekukan seakan cawan.

Famili Caliciviridae merangkumi genus-genus berikut:

Genus Vesivirus; spesies jenis: Virus eksantema vesikel babi Genus Lagovirus; spesies jenis: Virus penyakit berdarah arnab Genus Norovirus; spesies jenis: Virus Norwalk Genus Sapovirus; spesies jenis: Virus Sapporo

Di Australia dan New Zealand, kalisivirus disebarkan secara sengaja untuk mengawal bilangan arnab di negara masing-masing.

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Kaliciwirusy ( Polish )

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Norovirus z rodziny kaliciwirusów

Kaliciwirusy (łac. Caliciviruses, z łac. calix - kielich) − rodzina wirusów, charakteryzujących się następującymi cechami:

  • Symetria: ikosaedralna, kształt wirionu zbliżony do kulistego, jednak na powierzchni występują 32 wgłębienia o profilu kielicha (stąd nazwa rodziny wywodząca się od łacińskiego słowa "calyx", czyli kielich), które powodują, że kształt kaliciwirusów jest dosyć charakterystyczny. Spotykane są jednak również nieliczne gatunki nie posiadające wspomnianych wgłębień
  • Otoczka lipidowa: brak
  • Kwas nukleinowy: ssRNA(+)
  • Replikacja: zachodzi w cytoplazmie zakażonej komórki
  • Wielkość: 35-39 nm średnicy
  • Gospodarz: kręgowce
  • Cechy dodatkowe: znane głównie jako wirusy zwierzęce, jednak wiadomo już, że mogą powodować także choroby u ludzi

Kalicywirusy występują w takich organizmach jak: człowiek, bydło, świnie, delfiny, kury, gady, płazy. W Australii wprowadzono kalicywirusy do populacji królików dla ograniczenia ich liczebności.

Systematyka rodziny kaliciwirusów przedstawia się następująco:

  • Rodzina: Caliciviridae (Kaliciwirusy)
    • Rodzaj: Vesivirus (dwa gatunki)
    • Rodzaj: Lagovirus
    • Rodzaj: Norovirus
    • Rodzaj: Nebovirus (jeden gatunek)
    • Rodzaj: Saporovirus

Przenoszenie

Kalicywirusy przenoszą się najczęściej drogą fekalno-oralną, ale mogą też przenosić się drogą kropelkową.

Choroby u ludzi

Choroby wywoływane przez kaliciwirusy u ludzi to przede wszystkim ostre zapalenie żołądka i jelit z objawami takimi jak wymioty i biegunka. Objawy mogą się pojawić po okresie 2 dni inkubacji i występują najczęściej przez 3 dni. Choroby biegunkowe są wywoływane przez wirusa Norwalk oraz wirusa Sapporo. Większość infekcji kalicywirusami nie wymaga szczególnej opieki medycznej, ale pacjenci z immunosupresją mogą wymagać hospitalizacji i nawodnienia.

Zobacz też

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Kaliciwirusy: Brief Summary ( Polish )

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Kaliciwirusy (łac. Caliciviruses, z łac. calix - kielich) − rodzina wirusów, charakteryzujących się następującymi cechami:

Symetria: ikosaedralna, kształt wirionu zbliżony do kulistego, jednak na powierzchni występują 32 wgłębienia o profilu kielicha (stąd nazwa rodziny wywodząca się od łacińskiego słowa "calyx", czyli kielich), które powodują, że kształt kaliciwirusów jest dosyć charakterystyczny. Spotykane są jednak również nieliczne gatunki nie posiadające wspomnianych wgłębień Otoczka lipidowa: brak Kwas nukleinowy: ssRNA(+) Replikacja: zachodzi w cytoplazmie zakażonej komórki Wielkość: 35-39 nm średnicy Gospodarz: kręgowce Cechy dodatkowe: znane głównie jako wirusy zwierzęce, jednak wiadomo już, że mogą powodować także choroby u ludzi

Kalicywirusy występują w takich organizmach jak: człowiek, bydło, świnie, delfiny, kury, gady, płazy. W Australii wprowadzono kalicywirusy do populacji królików dla ograniczenia ich liczebności.

Systematyka rodziny kaliciwirusów przedstawia się następująco:

Rodzina: Caliciviridae (Kaliciwirusy) Rodzaj: Vesivirus (dwa gatunki) Rodzaj: Lagovirus Rodzaj: Norovirus Norwalk virus (NV), zwyczajowo wirus Norwalk Rodzaj: Nebovirus (jeden gatunek) Rodzaj: Saporovirus Sapporo virus (SV), zwyczajowo wirus Sapporo
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Caliciviridae ( Portuguese )

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Gêneros Vesivirus

Lagovirus
Norovirus
Sapovirus

Os calicivírus, membros da família Caliciviridae, são um grupo de vírus de genoma de RNA simples de sentido positivo (usado directamente na síntese das proteínas). Não possuem envelope bilípidico e são extremamente resistentes. Causam gastroenterites limitadas com diarreia, vómitos, dor abdominal e nauseas, após transmissão em comida, objectos ou água infectada com vírus proveniente de fezes. O tratamento é pela administração de muita água com um pouco de sal e açucar, para restabelecer os liquidos e electrólitos perdidos na diarreia. Prevenção pelas medidas de higiene, no entanto em crianças é comum mesmo em ambientes higiénicos. Há também os calicivirus animais que podem causar doença hemorrágica, vesicular ou respiratória, e podem infectar coelhos e lebres, suínos e mamíferos marinhos e felinos respectivamente.

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Caliciviridae: Brief Summary ( Portuguese )

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Os calicivírus, membros da família Caliciviridae, são um grupo de vírus de genoma de RNA simples de sentido positivo (usado directamente na síntese das proteínas). Não possuem envelope bilípidico e são extremamente resistentes. Causam gastroenterites limitadas com diarreia, vómitos, dor abdominal e nauseas, após transmissão em comida, objectos ou água infectada com vírus proveniente de fezes. O tratamento é pela administração de muita água com um pouco de sal e açucar, para restabelecer os liquidos e electrólitos perdidos na diarreia. Prevenção pelas medidas de higiene, no entanto em crianças é comum mesmo em ambientes higiénicos. Há também os calicivirus animais que podem causar doença hemorrágica, vesicular ou respiratória, e podem infectar coelhos e lebres, suínos e mamíferos marinhos e felinos respectivamente.

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Calicivirus ( Swedish )

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Calicivirus är en familj av enkelsträngade RNA-virus som orsakar vinterkräksjukan. Här är särskilt norovirus och sapovirus inblandade, men båda orsakar magsjuka hos människan. De ger likartade symtom: hastigt påkommen kräkning och/eller diarré, ofta kombinerat med magont och feber. Symtomen kan vara i ett till flera dygn. Sjukdomen förekommer vanligast under vinterhalvåret från november till april.

Sjukdomen är mycket smittsam. Det behövs endast en liten smittdos för att ge upphov till sjukdom. Inkubationstiden är kort, 12-48 timmar. Den smittar genom kontaktsmitta via förorenade händer, ytor och föremål. Den smittar även genom droppsmitta, framför allt i samband med kräkningar, och genom förorenade livsmedel[1]. Handsprit hjälper inte mot viruset, utan bara god hygien, med mekanisk rengöring med tvål och vatten, efter toalettbesök.[2]

Referenser

  1. ^ http://www.vardhandboken.se/Texter/Personalinfektioner-inom-halso--och-sjukvard/Calicivirus/
  2. ^ Robert Holender (30 januari 2014). ”600 drabbade av vinterkräksjuka”. DN. http://www.dn.se/ekonomi/600-drabbade-av-vinterkraksjuka/. Läst 31 januari 2014.
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Calicivirus: Brief Summary ( Swedish )

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Calicivirus är en familj av enkelsträngade RNA-virus som orsakar vinterkräksjukan. Här är särskilt norovirus och sapovirus inblandade, men båda orsakar magsjuka hos människan. De ger likartade symtom: hastigt påkommen kräkning och/eller diarré, ofta kombinerat med magont och feber. Symtomen kan vara i ett till flera dygn. Sjukdomen förekommer vanligast under vinterhalvåret från november till april.

Sjukdomen är mycket smittsam. Det behövs endast en liten smittdos för att ge upphov till sjukdom. Inkubationstiden är kort, 12-48 timmar. Den smittar genom kontaktsmitta via förorenade händer, ytor och föremål. Den smittar även genom droppsmitta, framför allt i samband med kräkningar, och genom förorenade livsmedel. Handsprit hjälper inte mot viruset, utan bara god hygien, med mekanisk rengöring med tvål och vatten, efter toalettbesök.

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杯狀病毒科 ( Chinese )

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杯狀病毒科Caliciviridae),又称嵌杯病毒科,是巴爾的摩分類法(Baltimore classification)第四綱病毒,它們具有正股不分節RNA,它門不具有套膜蛋白殼體為正20面體,它們十分的難培養,故沒有許多的研究,Caliciviridae的名字是源自於拉丁文「calyx」意思為杯狀,常見的病源體為諾瓦克病毒(Norwalk virus),杯狀病毒科主要是藉由糞口傳染,但也可以藉由飛沫傳染,杯狀病毒主要造成腸胃炎及嘔吐及腹瀉。

分類

  • 囊泡狀病毒屬(Vesivirus),或稱水泡病毒屬 - 代表種:豬小囊泡疹病病毒(Swine vesicular exanthema virus)
  • 兔類病毒屬(Lagovirus) - 代表種:兔出血疾病病毒(Rabbit hemorrhagic disease virus)
  • 諾瓦克病毒屬(Norovirus; Norwalk-like viruses 類諾瓦克病毒群)- 代表種:諾瓦克病毒(Norwalk virus)
  • 札幌病毒屬(Sapovirus; Sapporo-like viruses 類札幌病毒群)- 代表種:札幌病毒(Sapovirus)

外部連結

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杯狀病毒科: Brief Summary ( Chinese )

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杯狀病毒科(Caliciviridae),又称嵌杯病毒科,是巴爾的摩分類法(Baltimore classification)第四綱病毒,它們具有正股不分節RNA,它門不具有套膜蛋白殼體為正20面體,它們十分的難培養,故沒有許多的研究,Caliciviridae的名字是源自於拉丁文「calyx」意思為杯狀,常見的病源體為諾瓦克病毒(Norwalk virus),杯狀病毒科主要是藉由糞口傳染,但也可以藉由飛沫傳染,杯狀病毒主要造成腸胃炎及嘔吐及腹瀉。

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カリシウイルス科 ( Japanese )

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カリシウイルス科 Calicivirus.jpg
カリシウイルスの電子顕微鏡像
分類(ウイルス) : 第4群(1本鎖RNA +鎖) : カリシウイルス科
Caliciviridae

カリシウイルス科(Family Caliciviridae)とはウイルスの分類における一科で、5属7種に分類されている。[1]。カリシウイルス科に属するウイルスは直径30~38nmの正二十面体構造のビリオンを形成し、単一のプラス鎖一本鎖RNAゲノムに持ち、2-3種類のORFが存在する。エンベロープを持たない[2]ためクロロホルムエーテルに対する耐性を持つ。酸(pH3-5)によって不活化される。ネガティブ染色による電子顕微鏡観察ではビリオンは「ダビデの星」と呼ばれる特徴的な形態を示す。

宿主は脊椎動物で、ヒトウシブタネコイルカニワトリ爬虫類両生類などが知られている。代表的な種としては、ヒトなどの感染性胃腸炎の原因となるノーウォークウイルス、ネコの呼吸器疾患を引き起こす猫カリシウイルス、ウサギに出血病を起こす兎出血病ウイルスが挙げられる。

分類[編集]

参考文献[編集]

  1. ^ Virus Taxonomy: 2014 Release”. 2015年6月15日閲覧。
  2. ^ 牛島廣治、沖津祥子、Pattara KHAMRIN「カリシウイルス」、『ウイルス』第61巻第2号、日本ウイルス学会、doi:10.2222/jsv.61.193
  • 鹿江雅光、新城敏晴、高橋英司、田淵清、原澤亮編 『最新家畜微生物学』 朝倉書店 1998年 ISBN 4254460198
  • 原澤亮 「動物ウイルスの新しい分類(2005)」 『獣医畜産新報』 58号 921-931頁 2005年

関連項目[編集]

ウイルスの分類(ボルティモア分類) DNA
I: 2本鎖DNAウイルス (dsDNA) カウドウイルス目 ヘルペスウイルス目 Ligamenvirales 未分類
II: 1本鎖DNAウイルス (ssDNA) RNA
III: 2本鎖RNAウイルス (dsRNA)
IV: 1本鎖RNA+鎖 ((+)ssRNA) ニドウイルス目 ピコルナウイルス目 ティモウイルス目 未分類
V:1本鎖RNA-鎖 ((−)ssRNA) モノネガウイルス目 未分類 逆転写
VI: 1本鎖RNA逆転写ウイルス(ssRNA-RT)
VII: 2本鎖DNA逆転写ウイルス (dsDNA-RT) 執筆の途中です この項目は、生物学に関連した書きかけの項目です。この項目を加筆・訂正などしてくださる協力者を求めていますプロジェクト:生命科学Portal:生物学)。
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カリシウイルス科: Brief Summary ( Japanese )

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カリシウイルス科(Family Caliciviridae)とはウイルスの分類における一科で、5属7種に分類されている。。カリシウイルス科に属するウイルスは直径30~38nmの正二十面体構造のビリオンを形成し、単一のプラス鎖一本鎖RNAゲノムに持ち、2-3種類のORFが存在する。エンベロープを持たないためクロロホルムエーテルに対する耐性を持つ。酸(pH3-5)によって不活化される。ネガティブ染色による電子顕微鏡観察ではビリオンは「ダビデの星」と呼ばれる特徴的な形態を示す。

宿主は脊椎動物で、ヒトウシブタネコイルカニワトリ爬虫類両生類などが知られている。代表的な種としては、ヒトなどの感染性胃腸炎の原因となるノーウォークウイルス、ネコの呼吸器疾患を引き起こす猫カリシウイルス、ウサギに出血病を起こす兎出血病ウイルスが挙げられる。

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