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Fuselloviridae

Fuselloviridae ( Catalan; Valencian )

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Els Fuselloviridae són una família de virus del tipus ADN bicatenari que infecten el gènere Sulfolobus dels organismes Archaea. Espècie tipus: Sulfolobus virus 1 (Sinònim: Sulfolobus shibatae bacteriophage SSV1. ICTV acrònim aprovat: SSV-1.)

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Fuselloviridae: Brief Summary ( Catalan; Valencian )

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Els Fuselloviridae són una família de virus del tipus ADN bicatenari que infecten el gènere Sulfolobus dels organismes Archaea. Espècie tipus: Sulfolobus virus 1 (Sinònim: Sulfolobus shibatae bacteriophage SSV1. ICTV acrònim aprovat: SSV-1.)

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Fuselloviridae ( German )

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Fuselloviridae ist die Bezeichnung einer Familie von Viren. Als natürliche Wirte dienen Spezies (Arten) der Archaeen-Gattung Sulfolobus [en] (Familie Sulfolobaceae [en] im Phylum Crenarchaeota), insbesondere die Spezies S. shibatae, S. solfataricus und S. islandicus (davon wurden S. shibatae und S. solfataricus innerhalb dieser Familie reklassifiziert zur Gattung Saccharolobus [en])[2][3][4] Es gibt derzeit (Stand Mitte März 2021) vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigt neun Spezies (Arten) in dieser Familie, die sich auf zwei Gattungen (Alpha- und Betafusellovirus) verteilen.[1][5] Die Fuselloviridae sind in Thermalquellen mit Temperaturen ab 70 °C und saurem pH-Wert (kleiner gleich 4) auf der ganzen Welt allgegenwärtig.

Aufbau

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Schematischer Querschnitt durch ein Betafusellovirus-Virion.

Die Virionen der Fuselloviridae sind umhüllt und haben eine zitronenförmige oder pleomorphe Gestalt. Der Durchmesser beträgt etwa 60 nm, bei einer Länge von etwa 100–250 nm (ca. 100 nm bei α-Fusellovirus). Das Genom ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem Doppelstrang-DNA-Molekül mit einer Länge von etwa 17,3 kbp (Kilobasenpaare). Es kodiert 31 bis 37 Gene bei α- und 33 bis 38 Gene bei β-Fusellovirus.[5]

Die biochemische Charakterisierung von Sulfolobus spindle-shaped virus 1 (SSV1), dem Prototyp der Fuselloviridae, zeigte, dass die Virionen aus vier viruskodierten Strukturproteinen, VP1 bis VP4, sowie einem DNA-bindenden Chromatinprotein zellulären Ursprungs bestehen. Die Virusproteine VP1, VP3 und VP4 werden nach der Translation (Biologie) durch Glykosylierung modifiziert, offenbar an mehreren Stellen. VP1 wird außerdem proteolytisch prozessiert. SSV1-Virionen enthalten Lipide der Art Glycerin-Dibiphytanyl-Glycerin-Tetraether (GDGT, englisch glycerol dibiphytanyl glycerol tetraether),[6][7][8] die das Virus anscheinend selektiv von der Zellmembran des Wirts erwirbt.[9]

Reproduktionszyklus

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Schnitt durch ein Tomogramm während der Freisetzung von SSV1-Virionen aus einer Wirtszelle von S. shibatae. Maßstab 50 nm.[10][Anm. 1]

Die Virus-Replikation erfolgt in Zytoplasma der Wirtszelle. Der Eintritt in die Wirtszelle (Infektion) erfolgt durch Adsorption in diese. Die Transkription benutzt das dsDNA-Genom des Virus als Vorlage. Als natürlicher Wirt dienen Arten der Archaeen-Gattungen Sulfolobus/Saccharolobus: S. shibatae, S. solfataricus und S. islandicus, Familie Sulfolobaceae im Phylum Crenarchaeota.[5][3][4]

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Verschiedene Stadien der Knos­pung von SSV1-Virionen. Tomo­gramme (links) und Volumen­seg­men­tierungen (rechts) zeigen die gleich­zeitige Assemblierung (Zusammen­bau) und Frei­setzung (Knos­pung) von SSV1-Virionen. Die weiße Pfeil­spitze markiert eine offenbar ringartige Struktur. Balken 50 nm.[10][Anm. 1]
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Ausgerichtete und gemittelte (fette Linie) 2D-Konturen von 7 SSV1-Virionen (ii) und deren Knospungshälsen (iii).[10][Anm. 1]

Fuselloviren werden durch einen Knospung, ähnlich dem behüllter eukaryotischen Viren, aus dem Wirt freigesetzt, ohne Zelllyse zu verursachen.[10]


Systematik

Nach ICTV und NCBI ist mit Stand 29. März 2021 die Systematik der Fuselloviridae wie folgt (Vorschläge in doppelten Anführungszeichen):[1][11]

Gruppe: dsDNA
Ordnung: nicht zugewiesen

  • Familie: Fuselloviridae
  • Gattung: Alphafusellovirus
  • Spezies: Sulfolobus spindle-shaped virus 1 (SSV1 oder SSV-1, Typus)[12]
  • Spezies: Sulfolobus spindle-shaped virus 2 (SSV2)
  • Spezies: Sulfolobus spindle-shaped virus 4 (SSV4)
  • Spezies: Sulfolobus spindle-shaped virus 5 (SSV5)
  • Spezies: Sulfolobus spindle-shaped virus 7 (SSV7)
  • Spezies: Sulfolobus spindle-shaped virus 8 (SSV8) mit Sulfolobus virus Ragged Hills
  • Spezies: Sulfolobus spindle-shaped virus 9 (SSV9) mit Sulfolobus virus Kamchatka 1
  • Spezies: „Nitrosopumilus spindle-shaped virus“ (NSV)
  • Spezies: „Sulfolobus spindle-shaped virus 3“ (SSV3)
  • Spezies: „Sulfolobus spindle-shaped virus Lassen
  • Spezies: „Sulfolobus spindle-shaped virus 20“ (SSV20)[13]
  • Spezies: „Sulfolobus spindle-shaped virus 21“ (SSV21) with S21-like virus (aus Koinfektion SSV20+SSV22, vermutliche Rekombinante)[13]
  • Spezies: „Sulfolobus spindle-shaped virus 22“ (SSV22)[13]
  • Gattung: Betafusellovirus
  • Spezies: Acidianus spindle-shaped virus 1 (ASV1)
  • Spezies: Sulfolobus spindle-shaped virus 6 (SSV6)
  • Spezies: „Sulfolobus spindle-shaped virus 19“ (SSV19)[13]
  • ohne Gattungszuordnung:
  • Spezies: „Sulfolobales Mexican fusellovirus 1
  • Spezies: „Sulfolobus super-elliptical virus
  • Spezies: „Sulfolobus spindle-shaped virus 10“ (SSV10)[13]
  • weitere Kandidaten-Spezies SSV11-15 und SSV17-18 nach Pauly MD, Bautista MA, Black JA, Whitaker RJ (2019)[13]

Man beachte:

  1. Die Abkürzung SSV findet auch Verwendung für Simian sarcoma virus (ein Synonym für die offizielle Bezeichnung Woolly monkey sarcoma virus, WMSV), Gattung Gammaretrovirus.
  2. SSV1 und SSV2 sind zu unterscheiden von den beiden vorgeschlagenen Spezies „Sulfolobus-Virus STSV1“ und „STSV2“ (alias „Sulfolobus tengchongensis spindle-shaped virus 1“ respektive „2“) aus der vorgeschlagenen Gattung „Betabicaudavirus“ der Familie Bicaudaviridae.[14]

Anmerkungen

  1. a b c Das Material wurde von dieser Quelle kopiert, die unter einer Creative Commons Attribution 4.0 International License verfügbar ist.

Einzelnachweise

  1. a b c d e f g h ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. Anh Le-Cook, James Musser: Sulfolobus/Saccharolobus, Extreme Viruses Lab (Stedman Lab)
  3. a b LPSN: Saccharolobus, Sulfolobus, S. shibatae, S. solfataricus
  4. a b Hiroyuki D. Sakai, Norio Kurosawa: Saccharolobus caldissimus gen. nov., sp. nov., a facultatively anaerobic iron-reducing hyperthermophilic archaeon isolated from an acidic terrestrial hot spring, and reclassification of Sulfolobus solfataricus as Saccharolobus solfataricus comb. nov. and Sulfolobus shibatae as Saccharolobus shibatae comb. nov, in: Int J Syst Evol Microbiol 68(4), April 2018, S. 1271-1278, Epub 27. Februar 2018, doi:10.1099/ijsem.0.002665, PMID 29485400
  5. a b c Viral Zone. ExPASy. Abgerufen am 19. März 2021.
  6. Konrad Engelhardt: Herstellung und Charakterisierung tetraetherlipidhaltiger Lipoplexe und Lipopolyplexe als neuartige Vehikel für die orale Gentherapie, Dissertation im Fachbereich Pharmazie der Philipps-Universität Marburg, 2017
  7. Christine Moissl: Molekularbiologische und strukturelle Untersuchungen zur Biologie des neuartigen, kälteliebenden SM1 Euryarchaeons und seiner verschiedenen Lebensgemeinschaften, Dissertation an der Naturwissenschaftlichen Fakultät III - Biologie und Vorklinische Medizin der Universität Regensburg, 2004
  8. Ulrike Jahn: Aspekte der Zellbiologie des archaeellen Wirt-Parasit-Systems Ignicoccus hospitalis und Nanoarchaeum equitans: Zentrale Stoffwechselwege, Lipide, Histone, Dissertation an der Naturwissenschaftlichen Fakultät III – Biologie und vorklinische Medizin der Universität Regensburg, 2007
  9. Emmanuelle R. J. Quemin, Maija K. Pietilä, Hanna M. Oksanen, Patrick Forterre, W. Irene C. Rijpstra, Stefan Schouten, Dennis H. Bamford, David Prangishvili, Mart Krupovic: Sulfolobus spindle-shaped virus 1 contains glycosylated capsid proteins, a cellular chromatin protein, and host-derived lipids. In: J Virol. 89, Nr. 22, 2015, S. 11681–11691. doi:10.1128/JVI.02270-15. PMID 26355093. PMC 4645638 (freier Volltext).
  10. a b c d Emmanuelle R. J. Quemin, Petr Chlanda, Martin Sachse, Patrick Forterre, David Prangishvili, Mart Krupovic: Eukaryotic-Like Virus Budding in Archaea. In: mBio. 7, Nr. 5, 13. September 2016, S. e01439-16. doi:10.1128/mBio.01439-16. PMID 27624130. PMC 5021807 (freier Volltext). Siehe insbes. Fig. 1.
  11. NCBI: unclassified Alphafusellovirus (list)
  12. Nicole Procter, James Musser, Zephyr Kelly: Sulfolobus Spindle Shaped Viruses, Extreme Virus Lab (Stedman Lab)
  13. a b c d e f Junxia Zhang, Xiaowei Zheng, Haina Wang, Hongchen Jiang, Hailiang Dong, Li Huang: Novel Sulfolobus Fuselloviruses with Extensive Genomic Variations, in: J Virol Band 94, Nr. 4, e01624-19, doi:10.1128/JVI.01624-19, Erratum
  14. Mart Krupovic, Emmanuelle R. J. Quemin, Dennis H. Bamford, Patrick Forterre, David Prangishvili: Unification of the globally distributed spindle-shaped viruses of the Archaea. In: Journal of Virology. 88, Nr. 4, 2014, S. 2354–8. doi:10.1128/JVI.02941-13. PMID 24335300. PMC 3911535 (freier Volltext).
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Fuselloviridae: Brief Summary ( German )

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Fuselloviridae ist die Bezeichnung einer Familie von Viren. Als natürliche Wirte dienen Spezies (Arten) der Archaeen-Gattung Sulfolobus [en] (Familie Sulfolobaceae [en] im Phylum Crenarchaeota), insbesondere die Spezies S. shibatae, S. solfataricus und S. islandicus (davon wurden S. shibatae und S. solfataricus innerhalb dieser Familie reklassifiziert zur Gattung Saccharolobus [en]) Es gibt derzeit (Stand Mitte März 2021) vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) bestätigt neun Spezies (Arten) in dieser Familie, die sich auf zwei Gattungen (Alpha- und Betafusellovirus) verteilen. Die Fuselloviridae sind in Thermalquellen mit Temperaturen ab 70 °C und saurem pH-Wert (kleiner gleich 4) auf der ganzen Welt allgegenwärtig.

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Fuselloviridae

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Fuselloviridae is a family of viruses. Sulfolobus species, specifically shibatae, solfataricus, and islandicus, serve as natural hosts. There are two genera and nine species in the family.[1][2] The Fuselloviridae are ubiquitous in high-temperature (≥70 °C), acidic (pH ≤4) hot springs around the world.

Taxonomy

The family contains the following genera and species:[2]

Structure

Three slices through tomo­grams showing an SSV1 virion attacheing to S. shibatae host cell surface. Scale bars, 20 nm.[3]

Viruses in Fuselloviridae are enveloped, with lemon-shaped geometries. The diameter is around 60 nm, with a length of 100 nm. Genomes are circular, around 17.3 kb in length.[1] Biochemical characterization of SSV1, a prototypical fusellovirus, showed that virions are composed of four virus-encoded structural proteins, VP1 to VP4, as well as one DNA-binding chromatin protein of cellular origin. The virion proteins VP1, VP3, and VP4 undergo posttranslational modification by glycosylation, seemingly at multiple sites. VP1 is also proteolytically processed. SSV1 virions contain glycerol dibiphytanyl glycerol tetraether (GDGT) lipids, which appear to be acquired by the virus in a selective manner from the host cytoplasmic membrane.[4]

Life cycle

Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by adsorption into the host cell. DNA templated transcription is the method of transcription. Sulfolobus shibatae, S. solfataricus, and S. islandicus serve as the natural host.[1] Fuselloviruses are released from the host without causing cell lysis by a budding mechanism, similar to that employed by enveloped eukaryotic viruses.[3]

References

  1. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.
  2. ^ a b "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 24 May 2021.
  3. ^ a b Quemin ER, Chlanda P, Sachse M, Forterre P, Prangishvili D, Krupovic M (2016). "Eukaryotic-Like Virus Budding in Archaea". mBio. 7 (5): e01439-16. doi:10.1128/mBio.01439-16. PMC 5021807. PMID 27624130. CC BY icon.svg
  4. ^ Quemin ER, Pietilä MK, Oksanen HM, Forterre P, Rijpstra WI, Schouten S, Bamford DH, Prangishvili D, Krupovic M (2015). "Sulfolobus spindle-shaped virus 1 contains glycosylated capsid proteins, a cellular chromatin protein, and host-derived lipids". J Virol. 89 (22): 11681–11691. doi:10.1128/JVI.02270-15. PMC 4645638. PMID 26355093.

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Fuselloviridae: Brief Summary

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Fuselloviridae is a family of viruses. Sulfolobus species, specifically shibatae, solfataricus, and islandicus, serve as natural hosts. There are two genera and nine species in the family. The Fuselloviridae are ubiquitous in high-temperature (≥70 °C), acidic (pH ≤4) hot springs around the world.

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Fuselloviridae ( Spanish; Castilian )

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Fuselloviridae es una familia de virus de ADN que infectan arqueas. Tienen un genoma ADN bicatenario y por lo tanto pertenece al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. La especie tipo es Sulfolobus virus 1 (sinónimo: Sulfolobus shibatae bacteriophage SSV1, acrónimo: SSV-1.).

Los fusellovirus son ubicuos en aguas termales ácidas (pH ≤4) de alta temperatura (≥70 ° C) en todo el mundo.[1][2]

Géneros

Contiene los siguientes géneros:[3]

Descripción

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Imagen microscópica de fusellovirus.

Los virus de Fuselloviridae tienen cápsides con geometrías en forma de limón y poseen envoltura vírica. El diámetro ronda los 60 nm, con una longitud de 100 nm. Los genomas son circulares, de alrededor de 17,3 kb de longitud. La caracterización bioquímica de SSV1, un fusellovirus prototípico, mostró que los viriones están compuestos de cuatro proteínas estructurales codificadas por virus, VP1 a VP4, así como una proteína de cromatina de origen viral que se une al ADN. Las proteínas de virión VP1, VP3 y VP4 sufren una modificación postraduccional por glicosilación, aparentemente en múltiples sitios. VP1 también se procesa proteolíticamente. Los viriones SSV1 contienen lípidos de glicerol dibifitanil glicerol tetraéter (GDGT), que parecen ser adquiridos por el virus de manera selectiva a partir de la membrana citoplasmática del huésped.[4]

La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante adsorción en la célula huésped. La transcripción con plantilla de ADN es el método de transcripción. Los fusellovirus se liberan del huésped sin causar lisis celular mediante un mecanismo de gemación, similar al empleado por los virus eucariotas con envoltura.[5]

Evolución e interacción con plásmidos

En cuanto a la relación con otros virus, Fuselloviridae muestra una relación muy estrecha con otros virus que infectan arqueas como Thaspiviridae, Halspiviridae y Bicaudaviridae con quienes comparte la misma morfología del virión, el ensamblaje, una proteína de cápside homóloga la SSV1 de cuatro hélices y ATPasas de la superfamilia AAA, estos últimos se les conoce como "virus en forma de huso o fusiformes". La proteína homóloga de estos virus también se encuentra en la familia de virus arqueanos filamentosos Clavaviridae, por lo que se ha sugerido que los virus fusiformes evolucionaron de virus filamentosos emparentados con Clavaviridae para almacenar un genoma más grande por lo que conformarían un dominio o linaje viral, la misma ruta se ha propuesto para los otros virus inusuales de arqueas.[6]

También se ha demostrado que los fusellovirus interactúan con plásmidos de los huéspedes que infectan. Los plásmidos de los huéspedes suelen integrarse dentro los viriones de los fusellovirus para desplazarse entre sus huéspedes, de manera similar a los virusoides que son moléculas de ARN que se integran en viriones para desplazarse entre sus huéspedes. Es posible que la integración de plásmidos en los viriones de los fusellovirus hayan llevado a la substitución del genoma original de los viriones, remplazandolo por uno de tipo plásmido.[7][8]

Referencias

  1. «Viral Zone». ExPASy. Consultado el 15 de junio de 2015.
  2. ICTV. «Virus Taxonomy: 2014 Release». Consultado el 15 de junio de 2015.
  3. Krupovic, M; Quemin, ER; Bamford, DH; Forterre, P; Prangishvili, D (2014). «Unification of the globally distributed spindle-shaped viruses of the Archaea». Journal of Virology 88 (4): 2354-8. PMC 3911535. PMID 24335300. doi:10.1128/JVI.02941-13.
  4. Quemin ER, Pietilä MK, Oksanen HM, Forterre P, Rijpstra WI, Schouten S, Bamford DH, Prangishvili D, Krupovic M (2015). «Sulfolobus spindle-shaped virus 1 contains glycosylated capsid proteins, a cellular chromatin protein, and host-derived lipids». J Virol 89 (22): 11681-11691. PMC 4645638. PMID 26355093. doi:10.1128/JVI.02270-15.
  5. Quemin ER, Chlanda P, Sachse M, Forterre P, Prangishvili D, Krupovic M (2016). «Eukaryotic-Like Virus Budding in Archaea». mBio 7 (5): e01439-16. PMC 5021807. PMID 27624130. doi:10.1128/mBio.01439-16.
  6. Fengbin Wang, Virginija Cvirkaite-Krupovic, Matthijn Vos, Leticia C Beltran, Mark A B Kreutzberger, Jean-Marie Winter, Zhangli Su, Jun Liu, Stefan Schouten, Mart Krupovic, Edward H Egelman (2022) Spindle-shaped archaeal viruses evolved from rod-shaped ancestors to package a larger genome. Sciences Direct.
  7. Hans Peter Arnold, Qunxin She, Hien Phan, Kenneth Stedman, David Prangishvili, Ingelore Holz, Jakob K. Kristjansson, Roger Garrett, Wolfram Zillig (1999). The genetic element pSSVx of the extremely thermophilic crenarchaeon Sulfolobus is a hybrid between a plasmid and a virus. Online library.
  8. Ying Wanga, Zhenhong Duana, Haojun Zhub, Xin Guoa, Ziyi Wangav, Ju Zhoua, Qunxin Sheb, Li Huanga (2007). A novel Sulfolobus non-conjugative extrachromosomal genetic element capable of integration into the host genome and spreading in the presence of a fusellovirus. Science Direct.
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Fuselloviridae: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

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Fuselloviridae es una familia de virus de ADN que infectan arqueas. Tienen un genoma ADN bicatenario y por lo tanto pertenece al Grupo I de la Clasificación de Baltimore. La especie tipo es Sulfolobus virus 1 (sinónimo: Sulfolobus shibatae bacteriophage SSV1, acrónimo: SSV-1.).

Los fusellovirus son ubicuos en aguas termales ácidas (pH ≤4) de alta temperatura (≥70 ° C) en todo el mundo.​​

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微小紡錘形噬菌體科 ( Chinese )

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微小紡錘形噬菌體科(Fuselloviridae)是雙鏈DNA病毒中的一個,該類病毒外觀呈紡錘狀,主要感染於古細菌

下有一

  • 微小紡錘形噬菌體屬(Fusellovirus)

代表種:

    • 硫化裂葉噬菌體(Sulfolobus virus SSV1)
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微小紡錘形噬菌體科: Brief Summary ( Chinese )

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微小紡錘形噬菌體科(Fuselloviridae)是雙鏈DNA病毒中的一個,該類病毒外觀呈紡錘狀,主要感染於古細菌

下有一

微小紡錘形噬菌體屬(Fusellovirus)

代表種:

硫化裂葉噬菌體(Sulfolobus virus SSV1) Marburg virus.jpg 這是與病毒相關的小作品。你可以通过编辑或修订扩充其内容。  title= 取自“https://zh.wikipedia.org/w/index.php?title=微小紡錘形噬菌體科&oldid=49602429分类DNA病毒隐藏分类:自2016年4月扩充中的条目自2016年4月缺少来源的条目病毒小作品
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