Choanoflagellata of Choanomonada zijn een groep van de protozoa met één flagel. Met andere woorden; het zijn eencellige micro-organismen (eukaryoten) met een staart. Deze staart is omringd door microvilli. Zij zijn cilindervormig (χοάνη, choanē is Oudgrieks voor "koker").
De choanoflagellata zijn een groep organismen die heel dicht bij de dieren staan in de evolutionaire geschiedenis, en ermee gegroepeerd zitten als Holozoa.
Stamboom van de dieren binnen de UnikontaStamboom van de dieren binnen de Unikonta