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Closteroviridae ( Catalan; Valencian )

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Closteroviridae és una família de virus del tipus virus d'ARN monocatenari + que afecta algunes plantes.

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Closteroviridae: Brief Summary ( Catalan; Valencian )

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Closteroviridae és una família de virus del tipus virus d'ARN monocatenari + que afecta algunes plantes.

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Closteroviridae ( German )

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Die Closteroviridae (nicht zu verwechseln mit den Klosneuviren, gefunden in Klosterneuburg) sind eine Familie von RNA-Viren, die Pflanzen infizieren.[3][4]

Aufbau

Virion

Die Virionen (Viruspartikel) der Closteroviridae besitzen ein helikal-filamentöses Kapsid (gewunden fadenförmig) mit einer variablen Länge von etwa 650 nm bis über 2200 nm und einem Durchmesser von 10–13 nm. Das virale Genom ist einzelsträngig mit positiver Polarität bei einer Länge von etwa 13 bis 19 Kilobasen, mit unterschiedlicher Segmentierung des Genoms. Das Genom ist in einem Kapsid verpackt, das aus dem Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) aufgebaut ist und beidseitig vom Nebenkapsidprotein (engl. minor capsid protein, mCP) gedeckelt wird.

Genom

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Voraussichtliche Sekundärstruktur des 3'-Pseudoknotens im Sweet Potato Chlorotic Stunt Virus

Das Genom der Closteroviridae gehört zu den größten RNA-Genomen von Pflanzenviren. Es enthält linear angeordnete Duplikate kodierender Sequenzen wie auch zum Teil nicht-virale Abschnitte (z. B. für Proteasen und das HSP70), die durch RNA-Rekombination flexibel integriert werden können. Einige Spezies bilden subvirale, kleine Partikel, die nur Teile des Genoms oder subgenomische virale RNA enthalten. Das Genom des Beet yellows virus (BYT) kodiert für die Proteine ORF1a (enthält die RNA-Polymerase), ORF1ab (enthält ebenfalls die RNA-Polymerase), p6, MP/Hsp70h, p64, CPm, Cp, p20 und p21.

Systematik

Innere Systematik

Die Gattungen der Familie unterscheiden sich in der Segmentierung des Genoms und in der Art der Übertragung. Die Genome der Ampeloviren sind einteilig segmentiert aufgebaut und werden durch Schmierläuse und andere Schildläuse übertragen, während das Genom der Closteroviren einteilig ist und durch Blattläuse weitergegeben wird und das Genom der Criniviren zwei- oder dreiteilig ist und durch die weiße Fliege übertragen wird.[5] Die folgende Gliederung der Closteroviridae in Genera folgt den Vorgaben des International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) mit Stand November 2018,[6]

  • Familie Closteroviridae

Daneben gibt es noch etliche Spezies, die keinem Genus zugeordnet sind, z. B. das Blueberry virus A

Äußere Systematik

Koonin et al haben 2015 die Closteroviridae taxonomisch (aufgrund ihrer Verwandtschaft) der von ihnen postulierten Supergruppe ‚Alphavirus-like superfamily‘ zugeordnet.[10] Schwestergruppe ist danach die Familie Virgaviridae.[11] Die Mitglieder dieser vorgeschlagenen Supergruppe gehören verschiedenen Gruppen der Baltimore-Klassifikation an, in der Regel handelt es sich um einzelsträngige RNA-Viren positiver Polarität ((+)ssRNA, Baltimore-Gruppe 4), es sind aber auch doppelsträngige Vertreter (mit dsRNA gekennzeichnet, Baltimore-Gruppe 3) zu finden.

Dieser Vorschlag ist inzwischen abgelöst durch die Master species List #35 des ICTV vom März 2020.[1] Eine Gegenüberstellung der Kladogramme findet sich bei Tymovirales §ICTV Master Species List #35.

Literatur

  • G. P. Martelli et al.: Family Closteroviridae. In: A. M. Q. King, M. J. Adams, E. B. Carstens, E. J. Lefkowitz (eds.): Virus Taxonomy. Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses. Amsterdam 2012 S. 987ff, ISBN 978-0-12-384684-6
  • D. M. Knipe, Peter M. Howley, D. E. Griffin, (Hrsg.): Fields Virology. 5. Auflage, Lippincott Williams & Wilkins, Philadelphia 2007, ISBN 978-0-7817-6060-7.

Einzelnachweise

  1. a b c d e ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ICTV Master Species List 2018b v1 MSL #34, Feb. 2019
  3. R. Flores, P. Moreno, B. Falk, G. P. Martelli, W. O. Dawson: e-Book on Closteroviridae. In: Frontiers in microbiology. Band 4, 2013, S. 411, . doi:10.3389/fmicb.2013.00411. PMID 24409172. PMC 3873501 (freier Volltext).
  4. G. P. Martelli, A. A. Agranovsky, M. Bar-Joseph, D. Boscia, T. Candresse, R. H. Coutts, V. V. Dolja, B. W. Falk, D. Gonsalves, W. Jelkmann, A. V. Karasev, A. Minafra, S. Namba, H. J. Vetten, G. C. Wisler, N. Yoshikawa: The family Closteroviridae revised. In: Archives of virology. Band 147, Nummer 10, Oktober 2002, S. 2039–2044, . doi:10.1007/s007050200048. PMID 12376765.
  5. L. Rubio, J. Guerri, P. Moreno: Genetic variability and evolutionary dynamics of viruses of the family Closteroviridae. In: Frontiers in microbiology. Band 4, 2013, S. 151, . doi:10.3389/fmicb.2013.00151. PMID 23805130. PMC 3693128 (freier Volltext).
  6. ICTV: Master Species List 2018a v1, MSL (#33) including all taxa updates since the 2017 release. Herbst 2018
  7. SIB: Ampelovirus, auf: ViralZone
  8. SIB: Closterovirus, auf: ViralZone
  9. SIB: Crinivirus, auf: ViralZone
  10. Da diese Gruppe (von den Autoren als englisch superfamily bezeichnet) mit den Tymovirales eine Ordnung enthält, muss ihr Rang höher sein als dieser und ist nicht etwa als Überfamilie zu verstehen. Ränge höher als Ordnung waren zum Zeitpunkt der Arbeit vom ICTV aber noch gar nicht vorgegeben.
  11. Eugene V. Koonin, Valerian V. Dolja, Mart Krupovic: Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity, in: Virology vom Mai 2015; 479-480. 2–25, Epub 12. März 2015, PMC 5898234 (freier Volltext), PMID 25771806
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Closteroviridae: Brief Summary ( German )

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Die Closteroviridae (nicht zu verwechseln mit den Klosneuviren, gefunden in Klosterneuburg) sind eine Familie von RNA-Viren, die Pflanzen infizieren.

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Closteroviridae

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Closteroviridae is a family of viruses.[1] Plants serve as natural hosts. There are four genera and 59 species in this family, seven of which are unassigned to a genus.[2][3] Diseases associated with this family include: yellowing and necrosis, particularly affecting the phloem.[3][4]

Taxonomy

Schematic diagrams of the genome structure of the representative viruses in the four genera of the family Closteroviridae.

Genome type and transmission vector are two of the most important traits used for classification. Ampeloviruses and Closteroviruses have monopartite genomes and are transmitted by pseudococcid mealybugs (and soft scale insects) and aphids respectively. While Criniviruses are bipartite and transmitted by whiteflies.[3]

Genera:[2]

Unassigned species:[2]

Structure

Viruses in the family Closteroviridae are non-enveloped, with flexuous and filamentous geometries. The diameter is around 10–13 nm, with a length of 950–2200 nm. Genomes are linear and non-segmented, bipartite, around 20kb in length. [3] [4]

Life cycle

Viral replication is cytoplasmic. Entry into the host cell is achieved by penetration into the host cell. Replication follows the positive stranded RNA virus replication model. Positive stranded rna virus transcription is the method of transcription. The virus exits the host cell by tubule-guided viral movement. Plants serve as the natural host. Transmission routes are mechanical.[3][4]

References

  1. ^ Fuchs, M; Bar-Joseph, M; Candresse, T; Maree, HJ; Martelli, GP; Melzer, MJ; Menzel, W; Minafra, A; Sabanadzovic, S; ICTV Report Consortium (April 2020). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Closteroviridae". The Journal of General Virology. 101 (4): 364–365. doi:10.1099/jgv.0.001397. PMC 7414439. PMID 32134375.
  2. ^ a b c "Virus Taxonomy: 2020 Release". International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). March 2021. Retrieved 14 May 2021.
  3. ^ a b c d e "ICTV Report Closteroviridae".
  4. ^ a b c "Viral Zone". ExPASy. Retrieved 15 June 2015.

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Closteroviridae: Brief Summary

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Closteroviridae is a family of viruses. Plants serve as natural hosts. There are four genera and 59 species in this family, seven of which are unassigned to a genus. Diseases associated with this family include: yellowing and necrosis, particularly affecting the phloem.

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Closteroviridae ( Spanish; Castilian )

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Closteroviridae es una familia de virus que infectan plantas. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. La familia incluye cuatro géneros.[1]

Géneros

Se han descrito los siguientes géneros:[1]

Descripción

Los virus de la familia Closteroviridae tienen una cápside filamentosa helicoidal (en forma de hilo retorcido) con una longitud variable de aproximadamente 650 nm a más de 2200 nm y un diámetro de 10-13 nm. El genoma viral es monocatenario de polaridad positiva, con una longitud de alrededor de 13 a 19 kilobases, con diferentes segmentación del genoma. El genoma está empaquetado en una cápside compuesta por la proteína de la cápside principal llamada MCP y ambos lados de la proteína de la cápside menor están cubiertos.[2]

El genoma de los Closteroviridae es uno de los genomas de ARN más grandes entre los virus de plantas. Es lineal y con secuencias codificantes, así como secciones parcialmente no virales (por ejemplo, proteasas y HSP70), que pueden integrarse de manera flexible mediante recombinación del ARN. Algunas especies forman pequeñas partículas subvirales que contienen solo partes del genoma o ARN viral subgenómico. El genoma contiene dos ORF. La replicación viral se produce en el citoplasma.[3]

Véase también

Referencias

  1. a b ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. R. Flores, P. Moreno, B. Falk, G. P. Martelli, W. O. Dawson: e-Book on Closteroviridae. In: Frontiers in microbiology. Band 4, 2013, S. 411, . doi 10.3389/fmicb.2013.00411. PMID 24409172. PMC 3873501.
  3. G. P. Martelli, A. A. Agranovsky, M. Bar-Joseph, D. Boscia, T. Candresse, R. H. Coutts, V. V. Dolja, B. W. Falk, D. Gonsalves, W. Jelkmann, A. V. Karasev, A. Minafra, S. Namba, H. J. Vetten, G. C. Wisler, N. Yoshikawa: The family Closteroviridae revised. In: Archives of virology. Band 147, Nummer 10, Oktober 2002, S. 2039–2044, . doi 10.1007/s007050200048. PMID 12376765.
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Closteroviridae: Brief Summary ( Spanish; Castilian )

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Closteroviridae es una familia de virus que infectan plantas. Contienen un genoma ARN monocatenario positivo y por lo tanto se incluyen en el Grupo IV de la Clasificación de Baltimore. La familia incluye cuatro géneros.​

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Closteroviridae ( French )

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Les Closteroviridae sont une famille de virus de l'ordre des Martellivirales qui comprend quatre genres acceptés par l'ICTV et 56 espèces, dont sept non affectées à un genre. Ce sont des virus à ARN linéaire à simple brin à polarité positive, qui infectent des plantes, principalement des dicotylédones (phytovirus). La famille est rattachée au groupe IV de la classification Baltimore .

Cette famille de virus se distingue par ses particules, ou virions, très longs et très flexueux, à symétrie hélicoïdale, de 950 à 2000 nm de long et de 10 à 13 nm de diamètre. Le génome, qui est l'un des plus importants parmi les virus de la classe IV (jusqu'à 20 kb), est monopartite (Ampelovirus, Closterovirus et Velarivirus) ou bipartite (Crinivirus), ou tripartite (Potato yellow vein crinivirus, PYVV).

Les virus de la famille des Closteroviridae sont généralement limités au phloème et induisent des agrégats cytoplasmiques spécifiques de particules virales entremêlés avec des vésicules membraneuses dérivées du réticulum endoplasmique et éventuellement des mitochondries[2].

La transmission de ces virus se fait par des insectes vecteurs : pucerons, aleurodes, cochenilles farineuses (Pseudococcidae) ou cochenilles molles (Coccidae), selon un mode semi-persistant. La transmission expérimentale par inoculation mécanique est très difficile, voire impossible, et la transmission par graines est inconnue[2].

Caractéristiques

Les virions sont des particules filamenteuses non enveloppées, flexueuses et exceptionnellement longues d'environ 950 à 2200 nm de longueur et 10 à 13 nm de diamètre. Le corps du virion est assemblé par la protéine de capside majeure (CP) et la queue par la protéine de capside mineure (CPm)[3].

Liste des genres et espèces non classées

Selon NCBI (19 janvier 2021)[4] :

Notes et références

Références biologiques

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Closteroviridae: Brief Summary ( French )

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Les Closteroviridae sont une famille de virus de l'ordre des Martellivirales qui comprend quatre genres acceptés par l'ICTV et 56 espèces, dont sept non affectées à un genre. Ce sont des virus à ARN linéaire à simple brin à polarité positive, qui infectent des plantes, principalement des dicotylédones (phytovirus). La famille est rattachée au groupe IV de la classification Baltimore .

Cette famille de virus se distingue par ses particules, ou virions, très longs et très flexueux, à symétrie hélicoïdale, de 950 à 2000 nm de long et de 10 à 13 nm de diamètre. Le génome, qui est l'un des plus importants parmi les virus de la classe IV (jusqu'à 20 kb), est monopartite (Ampelovirus, Closterovirus et Velarivirus) ou bipartite (Crinivirus), ou tripartite (Potato yellow vein crinivirus, PYVV).

Les virus de la famille des Closteroviridae sont généralement limités au phloème et induisent des agrégats cytoplasmiques spécifiques de particules virales entremêlés avec des vésicules membraneuses dérivées du réticulum endoplasmique et éventuellement des mitochondries.

La transmission de ces virus se fait par des insectes vecteurs : pucerons, aleurodes, cochenilles farineuses (Pseudococcidae) ou cochenilles molles (Coccidae), selon un mode semi-persistant. La transmission expérimentale par inoculation mécanique est très difficile, voire impossible, et la transmission par graines est inconnue.

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修道院病毒科 ( Chinese )

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修道院病毒科 病毒分类 族: Group IV (+) ssRNA : 修道院病毒屬(Closterovirus)
  • 長線狀病毒屬(Crinivirus)
  • 蛇葡萄病毒屬(Ampelovirus)
  • 修道院病毒科是一种由粉介壳虫和蚜虫传播的植物病毒。修道院病毒包括甜菜枯黃病毒萵苣傳染性枯黃病毒葡萄藤捲葉關聯病毒3

    名稱來源

    從希臘字「修道院」、「寺」、「廟」(kloster),「紡錘」(spindle),「線狀」(thread)來。

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    修道院病毒科: Brief Summary ( Chinese )

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    修道院病毒科是一种由粉介壳虫和蚜虫传播的植物病毒。修道院病毒包括甜菜枯黃病毒萵苣傳染性枯黃病毒葡萄藤捲葉關聯病毒3

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