Excavates

Els excavats (Excavata) són un gran clade dintre dels eucariotes. El clade conté una gran varietat de formes de vida lliure i simbiòtiques, i inclou alguns paràsits importants entre els humans. Diversos excavats estan mancats dels clàssics mitocondris - aquests organismes estan sovint referits com a "amitocondriats", tot i que la majoria retenen un orgànul mitocondrial enormement modificat. D'altres tenen mitocondris amb crestes tubulars, discoïdals o en alguns casos planes. La majoria d'excavats tenen dos, quatre o més flagels i molts tenen una ultraestructura característica mantinguda per microtúbuls que els serveix per a l'alimentació. Tanmateix, hi ha diversos grups mancats d'aquests trets que són considerats excavats degut a l'evidència genètica.

Els excavats es classifiquen en quatre grups que poden ser tractats com a fílums:

Metamònads p.ex. Giardia, Trichomonas Amitocondriats, la majoria simbionts amb animals Loukozous p.ex. Jakoba Percolozous p.ex. Naegleria, Acrasis La majoria amb formes entre flagel·lades i ameboides Euglenozous p.ex. Euglena, Trypanosoma Diversos paràsits importants, un gran grup amb cloroplasts

D'aquests, els percolozous i euglenozous semblen ser parents particularment relacionats i estan units per la presència de crestes mitocondrials discoides. La majoria de loukozous tenen crestes tubulars, com molts altres eucariotes, mentre que els metamònads són inusuals per haver perdut els clàssics mitocondris - tot i que ells tenen "hidrogenosomes", "mitosomes" o orgànuls no caracteritzats. Les relacions dels excavats encara romanen incertes; és possible que no siguin un grup monofilètic.

Certs excavats són sovint considerats entre els eucariotes més primitius, basant-se particularment en la seva posició en diversos arbres evolutius. Això podria esperonar les investigacions que proposessin que és parafilètic amb altres clades eucariotes. Tanmateix, la posició de certs excavats en "branques basals" podria ser un artefacte causat per l'atracció entre branques llargues, com ha estat vist en alguns altres grups, com per exemple els microsporidis.

Subgrups

Els excavats es classifiquen dins sis subdivisions principals a nivell de fílum/classe. Es mostren a la taula de sota. Un organisme addicional, Malawimonas, també es pot incloure dins els excavats, malgrat que l'evidència filogenètica és equívoca.

Superfílum Fílum/Classe Gèneres representatius Descripció Discoba o JEH Euglenozoa e.g. Euglena, Trypanosoma Paràsits molt importants que tenen cloroplasts Heterolobosea (Percolozoa) e.g. Naegleria, Acrasis La majoria alternen formes flagel·lades i ameboides Jakobea e.g. Jakoba, Reclinomonas De vida lliure Metamonada o POD Preaxostyla e.g. Oxymonads, Trimastix Trimastix és de vida lliure Fornicata e.g. Giardia, Carpediemonas Paràsits d'animals. Parabasalia e.g. Trichomonas En insectes, alguns són patògens en humans.

Discoba o clade JEH

Euglenozoa i Heterolobosea (Percolozoa) semblen estar estretament relacionats i estan units per la presència de cristalls discoides dins els mitocondris (Superfílum Discicristata). Més recentment s'ha trobat una relació estreta entre Discicristata i Jakobida,^[1] t

Cladograma

Eukarya Bikonta

Apusozoa

Corticata

Archaeplastida

Chromalveolata

Cabozoa

Rhizaria

Excavata

Metamonada

Euglenozoa

Percolozoa

Loukozoa

Unikonta

Amoebozoa

Opisthokonta

Referències

A Wikimedia Commons hi ha contingut multimèdia relatiu a: Excavats

• Cavalier-Smith, T. «The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 52, 2002, pàg. 297-354.
• Alastair G. B. Simpson «Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious tàxon Excavata». International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 53, 2003, pàg. 1759-1777.

Excavata (česky exkaváti) je jedna z šesti základních eukaryotických superskupin, poprvé formálně vytvořená v roce 2002 Cavalier-Smithem. Není jisté, zda je to monofyletická skupina.^[1]

Popis

Excavata jsou zpravidla jednobuněčné organismy s centrálním cytostomem (buněčná ústa) ve tvaru rýhy. V něm kmitá bičík, který svým pohybem přihání drobné organismy. Druhý bičík směřuje dopředu a slouží k pohybu. Mnozí exkaváti však tyto znaky druhotně ztratili, např. přichází o cytostóm, centrální bičík, a podobně, přesto se do této skupiny stále řadí. Za zmínku stojí mitochondrie exkavát, která je často zvláštní. Někteří exkaváti, jako krásnoočko (Euglena), jsou autotrofní, obsahují totiž plastid získaný sekundární endosymbiózou (pozřením zelené řasy).^[1]

Klasifikace

K exkavátům se řadí namátkou krásnoočko (Euglena), Naegleria fowleri a parazitická Trichomonas vaginalis, ale také mnohobuněčné acrasidní hlenky (Acrasida), které ovšem s hlenkami (Eumycetozoa) mají z genetického hlediska pramálo společného. Klasifikace skupiny Excavata prošla značným vývojem, nejjednodušší dělení rozeznává čtyři kmeny:^[1]

• Jakobida
• Metamonada
• Heterolobosea (=Percolozoa)
• Euglenozoa

Starší skupina Loukozoa dávala dohromady Jakobida s rodem Malawimonas, je to ale zcela polyfyletická skupina.^[1]

Jiné klasifikace exkavát se mohou odlišovat, někdy se například skupina Metamonada štěpí na dílčí skupiny a výsledný systém může vypadat takto:^[2]

• Fornicata
• Parabasalia - bičenkovci
• Praexostyla
• Jakobida
• Heterolobosea
• Euglenozoa - krásnoočka
• Malawimonas

Reference

1. ↑ ^{a b c d} Ivan Čepička, Jiří Neustupa, Vladimír Hampl. Protistologie: Excavata, záznam přednášek na internetu [online]. Univerzita Karlova, přírodovědná fakulta: 2009. Dostupné online.
2. ↑ Sina M. Adl, Alastair G. B. Simpson, Mark A. Farmer, Robert A. Andersen, O. Roger Anderson, John A. Barta, Samual S. Bowser, Guy Bragerolle, Robert A. Fensome, Suzanne Fredericq, Timothy Y. James, Sergei Karpov, Paul Kugrens, John Krug, Christopher E. Lane, Louise A. Lewis, Jean Lodge, Denis H. Lynn, David G. Mann, Richard M. McCourt, Leonel Mendoza, Øjvind Moestrup, Sharon E. Mozley-Standridge, Thoams A. Nerad, Carol A. Shearer, Alexey V. Smirnov, Frederick W. Spiegel, Max F. J. R. Taylor. The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists. Journal of Eukaryotic Microbiology. 2005, roč. 52, čís. 5, s. 399-451. Abstract Dostupné online.

Ekskavaatit (Excavata) on pieni aitotumaisiin kuuluva kunta, johon kuuluu yksisoluisia eliöitä. Kunta kuvattiin 2000-luvun alussa, kun oli todettu, että eräät yksisoluiset eliöt kuten silmälevät näyttivät edustavan hyvin vanhaa ja itsenäistä kehityslinjaansa. Ekskavaatteihin kuuluu erilaisia vapaana eläviä ja symbionttisia eliöitä sekä loisia. Eräät ovat hankkineet kyvyn yhteyttää ottamalla soluihinsa endosymbionttisia viherleviä, jotka ovat sittemmin surkastuneet ja muuttuneet viherhiukkasiksi. Kunnan luokittelu ei kuitenkaan vielä nykyään ole selkeä, eikä ole myöskään ole ollut aivan selvää, onko kunta monofyleettinen eli kaikki samasta kantamuodosta kehittyneet lajit sisältävä ryhmä. Vuonna 2009 julkaistut tutkimustulokset vahvistavat oletusta kunnan monofyleettisyydestä ja hyvin vanhasta kehityslinjasta.

Joillakin ekskavaateilla ei ole mitokondrioita. 1990-luvun alkuun saakka näiden uskottiin polveutuvan sellaisista muinaisista aitotumaisista, joille ei koskaan ollut syntynyt mitokondrioita endosymbioosin tuloksena. Sittemmin selvisi, että nämä ovat menettäneet mitokondriot evoluution kuluessa. Ekskavaateilla on yleensä kaksi tai useampia uintisiimoja.

Ekskavaatit näyttävät jakautuvan neljään eri ryhmään. Silmälevät ja harvasiimaeliöt eli kinetoplastidit muodostavat monofyleettisen pääjaksonsa Euglenozoa (Silmäeliöt), jonka edustajilla on tyypillisenä rakennepiirteenä mitokondrioiden sisäkalvojen kiekkomaiset kristat eli kalvopoimut. Silmälevät ovat vedessä eläviä yleensä yhteyttäviä levämäisiä yksisoluisia eliöitä. Kinetoplastideihin kuuluu unitautia aiheuttava Trypanosoma-loisio. Metamonada-pääjaksoon kuuluvilla eilöillä ei ole mitokondrioita, ja niihin lukeutuu mm. vatsatautia aiheuttava Giardia-loinen. Ameboflagellaatit ovat eliöitä, jotka kykenevät vaihtelemaan elomuotoaan amebamaisen ja uintisiimallisen välillä.

Lähteet

• Campbell, N. & Reece, B: Biology., s. 580-581. Pearson Benjamin Cummings, 2008. ISBN 978-0-321-53616-7. (englanniksi)
• Hampl, V. et al.: Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic “supergroups”. Proc Natl Acad Sci USA, 2009, 106. vsk, nro 10, s. 3859–3864. Artikkelin verkkoversio. (englanniksi)

Excavata zijn in de taxonomie een groep (in moderne opvattingen een supergroep^[1]) eencellige eukaryotische organismen die alle meerdere flagella hebben. De groep Excavata bevat zowel zelfstandig als in symbiose levende soorten, waaronder ook veel bekende parasieten bij de mens.

Eigenschappen

Veel Excavata hebben sterk aangepaste mitochondriën, om die reden worden dit wel amitochondriaten genoemd. Anderen hebben mitochondriën met buisvormige, schijfvormige of langwerpige cristae. De meeste Excavata hebben twee, vier of meer flagella^[2] en de meeste hebben een karakteristieke ventrale celmond (cytostoom) om voedsel door middel van fagocytose in de cel op te nemen. De celmond wordt ondersteund door microtubuli.^[3]

Veel groepen die tot de Excavata gerekend worden missen al deze eigenschappen echter volkomen. De clade is samengesteld op grond van genetische overeenkomsten die zijn ontdekt door bepaling van de nucleotidensequenties.^[4]

Sommige Excavata van de stam Euglenozoa hebben chloroplasten en bedrijven fotosynthese. Bij een aantal parasitaire soorten is deze eigenschap weer gereduceerd.

Onderverdeling

De volgende taxa worden in de door veel biologen aangehouden indeling^[5] tot de Excavata gerekend:

Superphylum Phylum Representatieve genera Beschrijving Discoba Euglenozoa Euglena, Trypanosoma Veel parasieten, één grote groep met plastiden (chloroplasten) Percolozoa (Heterolobosea) Naegleria, Acrasis Meeste hebben een wortelpotige en/of een flagellate vorm Loukozoa (Jakobida) Jakoba, Reclinomonas Vrij levend, soms flagellaten. Sommigen zijn amitochondriaten Metamonada Preaxostyla Oxymonads, Trimastix mitochontriate flagellaten, vrij levend (Trimastix) of levend in de darmen van insecten Fornicata Giardia, Carpediemonas Amitochondriaten, meestal symbionten of parasieten van dieren Parabasalia Trichomonas Amitochondriate flagellaten, meestal commensalisten in de darmen van insecten. Sommigen zijn pathogeen voor mensen

Uit verschillende recente studies is gebleken dat het voorheen nog niet geclassificeerde geslacht Stephanopogon een zustergroep is van Percolomonas. De aldus gevormde clade wordt gezien als zustergroep van de Heterolobosea, waarmee het samen een groep vormt waarvoor de naam Percolozoa is voorgesteld en die op gelijke hoogte staat met de Euglenozoa.^[6]

Cladogram Excavata

Onderstaand cladogram toont de positie van de supergroep van de Excavata en van de afstammende rijken.^[7] De Excavata vormen hierin een supergroep met deelgroepen van de Discicristata en de Euexcavata worden onderscheiden op het niveau van rijk.

Voetnoten

Literatuur

• (en) Adl, S.M. et al.; 2005: The New Higher Level Classification of Eukaryotes with Emphasis on the Taxonomy of Protists, The Journal of Eukaryotic Microbiology 52(5), pp 399-451.
• (en) Cavalier-Smith, T.; 2002: The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa, International Journal of Systematic & Evolutionary Microbiology 52(2): pp 297–354.
• (en) Cavalier-Smith, T. & Nikolaev, S.; 2008: The Zooflagellates Stephanopogon and Percolomonas are a Clade (Class Percolatea: Phylum Percolozoa), Journal of Eukaryotic Microbiology, 55(6), pp. 501–509.
• (en) Hampl, V.; Hug, L.; Leigh, J.W.; Dacks, J.B.; Lang, B.F.; Simpson, A.G.B. & Roger, A.J.; 2009: Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups", Proceedings of the National Academy of Sciences of the U.S.A. 106(10): pp. 3859–64.
• (en) Holt, J.R. and C.A. Iudica; 2012, Description of the Supergroup Excavata (Cavalier-Smith 2002).^{[dode link]}
• (en) Simpson, A.G.; 2003: Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota), International Journal of Systmatic & Evolutionary Microbiology 53(6): pp. 1759–1777.
• (en) Yubuki, N. & Leander, B.S.; 2008: Ultrastructure and molecular phylogeny of Stephanopogon minuta: An enigmatic microeukaryote from marine interstitial environments, European Journal of Protistology 44, pp. 241–253.

Systematyka Domena Eukarionty Supergrupa Excavata Nazwa systematyczna Excavata Cavalier-Smith, 2002, przywrócony przez Simpson, 2003^[1]

Excavata – takson eukariotów o kategorii supergrupy^[2]. Obejmuje wyłącznie jednokomórkowe protisty, w większości heterotroficzne wiciowce, wśród nich chorobotwórcze. Niektórzy jej przedstawiciele drogą wtórnej endosymbiozy zdobyli chloroplasty. Inni mają silnie zmodyfikowane mitochondria i żyją w środowiskach beztlenowych, np. wewnątrz jelit. Niektóre tworzą agregacje komórek przypominające śluzowce.

Jako cechę wyróżniającą tę grupę przyjęto szczegóły budowy aparatu wiciowego, jednak różne cechy wspólne dla pewnych taksonów nie występują w innych^[3].

Systematyka

Według Adla należą tutaj następujące klady^[1]:

• Discoba Simpson w Hampl i inni, 2009
• Malawimonas O’Kelly i Nerad, 1999
• Metamonada Cavalier-Smith, 1987 przywrócony przez Cavalier-Smith, 2003

Historia taksonu

Według system Cavalier-Smitha z 2003 roku^[3] dzielony był na cztery typy:

• Loukozoa (Jakobida)
• Metamonada – m.in. Parabasalia (w tym rzęsistki), diplomonady (w tym ogoniastek jelitowy)
• Euglenozoa – m.in. eugleniny, kinetoplastydy (w tym świdrowce)
• Percolozoa (Heterolobosea) – w mykologii znane jako Acrasiomycota czyli łańcuszkorośla lub akrazje – gromada śluzowców.

Pokrewieństwo organizmów zaliczanych do tej supergrupy jest wciąż wątpliwe. Może ona nie być monofiletyczna^[3] i wyróżniana jest w zasadzie jako zbiór taksonów nienależących do żadnej z dwóch głównych linii eukariontów (Amorphea i Diaphoretickes), przez co wyróżnianie tej supergrupy jest podawane w wątpliwość^[4].

Przypisy

Excavata är en grupp encelliga eukaryota organismer, som numera brukar räknas som ett rike, och som tidigare ingick i riket protozoer. Många av dem lever som parasiter, till exempel Giardia.^[1] Många s.k. ögondjur (stammen Euglenozoa/divisionen Euglenophyta) är fotosyntetiserande tack vare sekundär endosymbios med grönalger. Nedanstående kladogram visar de ingående gruppernas troliga släktskap.^[1]

Excavata

Malawimonader

Jakobida

Euglenozoa (inkl. Euglena och Trypanosomer)

Heterolobosea

Preaxostyla

Fornicata (inkl. Diplomonader)

Parabasalider

Galleri

• Ögondjuret Euglena

• Naegleria

• Giardia en diplonomad

Referenser

1. ^ [a b] Tree of life http://www.tolweb.org/Eukaryotes/3

Екскавати (Excavata) — царство одноклітинних джгутикових організмів. Можуть бути як авто- так і гетеротрофами; деякі можуть змінювати свій тип живлення. Вважається, що їх хлоропласти сформувались внаслідок ендосимбіозу з зеленими водоростями. Найвідомішими представниками є евглени.

Будова

Типовий представник цієї групи має одне ядро ​​і два джгутики. Один з джгутиків спрямований назад і лежить у вентральній борозні, яка і дала назву всій групі. У ній же і розташований клітинний рот. Один з джгутиків, як правило, довший за інший (основний), при розподілі кожної дочірньої клітини відходить по одному жгутику. У тій клітини, якої відійшов короткий джгутик, він стає основним.

Систематика

• Discoba
  • тип Euglenozoa
  • тип Percolozoa
  • тип Loukozoa
• Metamonada
  • тип Preaxostyla
  • тип Fornicata
  • тип Parabasalia

Посилання

• Царства живої природи (рос.)
• Tree of Life Eukaryotes
• Tree of Life: Jakobida
• Tree of Life: Fornicata

Це незавершена стаття про найпростіших.
Ви можете допомогти проекту, виправивши або дописавши її.

Excavata là một nhóm supergroup chính của các sinh vật đơn bào thuộc miền Eukaryota^[1][2][3].Được Thomas Cavalier-Smith giới thiệu vào năm 2002 như là một thể loại phát sinh mới,nó chứa đựng nhiều dạng sống tự do và cộng sinh,và cũng bao gồm một số ký sinh trùng quan trọng của con người^[4][5][6].Các cuộc khai quật trước đây được coi là đã được đưa vào vương quốc Protista đã quá cũ kỹ^[7][8][9].Chúng được phân loại dựa trên cấu trúc chồi của chúng,và chúng được coi là các thành viên lâu đời nhất (dòng dõi cơ bản) của các sinh vật bôi trơn.^{[10][11][12][12][13][14]}

Phân loại

Xem thêm: Eukaryote#Phylogeny và wikispecies:Excavata

Superphylum Phân loại / lớp học Các giống đại diện (ví dụ) Sự miêu tả Discoba hoặc JEH Tsukubea T. globosa Cây bạch đàn Euglena , Trypanosoma Nhiều ký sinh trùng quan trọng, một nhóm lớn với plastid (lục lạp) Heterolobosea (Percolozoa) Naegleria ,Acrasis Hầu hết các luân phiên giữa các hình thức phản bội và amip Jakobea Jakoba ,Reclinomonas Các genome ăn mòn tự do, đôi khi có loricate, với bộ gen ti thể rất gien giàu gen Metamonada hoặc POD Preaxostyla Oxymonads ,Trimastix Các chất phóng xạ amitochondriate, hoặc tự do sống ( Trimastix ,Paratrimastix ) hoặc sống trong cùi chùi của côn trùng Fornicata Giardia ,Carpediemonas Amitochondriate, chủ yếu là symbiotes và ký sinh trùng của động vật. Parabasalia Trichomonas Các chất phóng xạ amitochondriate, thường là các chất diệt côn trùng ở ruột . Một số mầm bệnh của con người.

Cladogram

Asgard Archaea

Odinarchaeota

Lokiarchaeota

Thorarchaeota

Heimdallarchaeota

Eukaryota

Euglenozoa

Percolozoa

Tsukubea

Jakobea

Neozoa

Metamonada

Malawimonas

Opimoda

Varisulca paraphyletic

Amorphea

Amoebozoa

Obazoa

Breviata

Apusomonadida

Opisthokonta

Diphoda

Archaeplastida

Cryptomonadida

Haptophyta

SAR

Hình ảnh

• Euglena (Euglenozoa: Euglenoida)

• Trypanosoma brucei (Euglenozoa: Kinetoplastida)

• Bodo sp. (Euglenozoa: Kinetoplastida)

• Percolomonas sp. (Percolozoa)

• Stephanopogon sp. (Percolozoa)

• Các giai đoạn của Naegleria sp. (Percolozoa: Heterolobosea)

• Acrasis rosea (Percolozoa: Heterolobosea)

• Jakobids (Jakobida)

• Trichomonas vaginalis (Metamonada: Parabasalia)

• Retortamonas sp., left (Metamonada: Fornicata: Retortamonadida)

• Giardia sp. (Metamonada: Fornicata: Diplomonadida)

Tham khảo

Liên kết ngoài

• Mở Cây Sự Sống
• Taxonomicon
• Cây Sự sống (Eukaryotes)
• Cây sự sống: Jakobida
• Cây sự sống: Fornicata

Группа: Экскаваты

• Discoba
• Metamonada

Информация должна быть проверяема, иначе она может быть поставлена под сомнение и удалена.
Вы можете отредактировать эту статью, добавив ссылки на авторитетные источники.
Эта отметка установлена 15 января 2016 года.

Вы можете помочь проекту, расширив текущую статью с помощью перевода.
При этом, для соблюдения правил атрибуции, следует установить шаблон {{переведённая статья}} на страницу обсуждения, либо указать ссылку на статью-источник в комментарии к правке.

古虫界（学名：Excavata）是单细胞真核生物的一个大的界^[1][2]。古虫界包含了许多自由生存或共生的原生生物，以及一些重要的人体寄生虫。命名为「古虫」，是因为在真核生物的系统发生树处于底部位置，与古菌等外群关系较近，线粒体可能缺失或功能原始。

特性

许多古虫界的物种缺乏典型的线粒体，被称作「无线粒体原生生物」（amitochondriate），虽然大多数可能包含了功能上类似于线粒体、形态有很大变化的细胞器。其它的古虫界的生物有线粒体，线粒体嵴呈管状、盘状、薄片状。大多数古虫界物种有两个、四个甚至更多的鞭毛^[3]，很多物种有显著的腹部摄食沟（feeding groove）超微结构，内部由微管支撑。^[4]如果有系统发生的基因证据，其它缺乏这一特征的物种也可以归属于古虫界。

分类

古虫界在门/纲的级别上分为六类。

总门 门/纲 有代表性的属 描述 盘嵴亚界 Discoba或JEH 眼虫门 Euglenozoa 眼虫（Euglena）、锥虫（Trypanosoma） 很多是重要的寄生虫，很多含有色素体（叶绿体） 透色门 Percolozoa或渗养门 Heterolobosea 耐格里原虫（Naegleria）、集胞黏菌（Acrasis） 大多数的形态在鞭毛虫与似变形虫之间 雅各巴虫纲 Jakobea 雅各巴虫（Jakoba）、异养鞭毛虫（Reclinomonas） 自由生活，有的具鞭毛，有基因丰富的线粒体 后滴门 Metamonada或POD 纲 Preaxostyla 銳滴虫 (Oxymonads)、三鞭毛虫（Trimastix） 无线粒体，有鞭毛，或者自由生活（三鞭毛虫）或者寄生于昆虫的后肠（hindgut） 多鞭毛虫纲 Trichozoa或Fornicata 贾第虫（Giardia）、Carpediemonas 无线粒体，大多数共生或寄生在动物体内。 副基体纲 Parabasalia 毛滴虫属（Trichomonas） 无线粒体有鞭毛，一般共生在昆虫肠内。某些是人体寄生虫。

Discoba或JEH亚界

眼虫门（Euglenozoa）与透色门（Percolozoa, Heterolobosea）是特别接近的亲缘关系，都具有盘状的线粒体嵴，因此被归纳为盘嵴总门（Discicristata）。2007年，一项研究表明盘嵴总门与Jakobida目具有基因亲缘关系^[5] Jakobida目具有类似于其它原生生物的管状线粒体嵴，因此与盘嵴总门合称为Discoba亚界或三者首字母缩写——JEH总界。^[2]

后滴门

后滴门（Metamonad）不寻常地缺少了典型的线粒体——代替线粒体，这些生物具有氢化酶体（hydrogenosome），纺锤剩体（mitosome）或其它未识别的细胞器。共同特点是都没有线粒体。基因分析表明，这些生物的细胞核中有线粒体的基因标志。这些生物都是寄生生活的，能够从其它来源获得ATP。源真核生物的一个例子是毛滴虫（Trichomonas Vaginalis），是常见的尿路感染，通过性接触传播。

单系起源

古虫界是否为单系群（monophyletic group），仍然缺乏基因证据。可能是几个并行的进化分支。^[6]

某些古虫界的物种被认为是非常原始的真核生物，位于进化树的底部。这示意古虫界可能是多系群，包含着其它原生生物的祖先。但这也可能是由于长枝吸引（long branch attraction），这已经在微孢子虫（microsporidia）中有过前例。

马拉维单胞虫

除上述类群外马拉维单胞虫纲（Malawimonas）由于其分子系统学证据被认为可能是古虫中的一种，但其在其中的系统位置待定。^[7]

参見

• 源真核生物界
• 真核生物
• 原生生物

参考文献

1. ^ Simpson, Ag; Inagaki, Y; Roger, Aj. Comprehensive multigene phylogenies of excavate protists reveal the evolutionary positions of "primitive" eukaryotes (Free full text). Molecular Biology and Evolution. Mar 2006, 23 (3): 615–25. PMID 16308337. doi:10.1093/molbev/msj068.
2. ^ ^{2.0 2.1} Hampl V, Hug L, Leigh JW; 等. Phylogenomic analyses support the monophyly of Excavata and resolve relationships among eukaryotic "supergroups". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. March 2009, 106 (10): 3859–64. Bibcode:2009PNAS..106.3859H. PMC 2656170. PMID 19237557. doi:10.1073/pnas.0807880106. 引文格式1维护：显式使用等标签 (link)
3. ^ Simpson AG. Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata (Eukaryota). Int. J. Syst. Evol. Microbiol. November 2003, 53 (Pt 6): 1759–77. PMID 14657103. doi:10.1099/ijs.0.02578-0.^{[永久失效連結]}
4. ^ Cavalier-Smith T. The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. March 2002, 52 (Pt 2): 297–354. PMID 11931142.
5. ^ Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Henner Brinkmann, Gertraud Burger, Andrew J. Roger, Michael W. Gray, Hervé Philippe, and B. Franz Lang. Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans. Curr. Biol. August 2007, 17 (16): 1420–1425. PMID 17689961. doi:10.1016/j.cub.2007.07.036.
6. ^ Laura Wegener Parfrey, Erika Barbero, Elyse Lasser, Micah Dunthorn, Debashish Bhattacharya, David J Patterson, and Laura A Katz. Evaluating Support for the Current Classification of Eukaryotic Diversity. PLoS Genet. December 2006, 2 (12): e220. PMC 1713255. PMID 17194223. doi:10.1371/journal.pgen.0020220.
7. ^ Cavalier-Smith T. The excavate protozoan phyla Metamonada Grassé emend. (Anaeromonadea, Parabasalia, Carpediemonas, Eopharyngia) and Loukozoa emend. (Jakobea, Malawimonas): their evolutionary affinities and new higher taxa. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. November 2003, 53 (Pt 6): 1741–58. PMID 14657102. doi:10.1099/ijs.0.02548-0.

外部链接

• Tree of Life Eukaryotes
• Tree of Life: Jakobida
• Tree of Life: Fornicata

双鞭毛生物多貌生物AH原始色素体生物(A)，或广义植物 定鞭/隐藻生物(H)（有争议） SAR不等鞭毛/囊泡生物不等鞭毛类(S) 囊泡虫类(A) 有孔虫界(R) 古虫界 无根虫门（英语：Apusozoa） 单鞭毛生物变形虫界 后鞭毛生物动物总界Mesomycetozoea（英语：Mesomycetozoea） 蜷丝生物（英语：Filozoa）蜷丝球虫纲（英语：Filasterea） 领鞭毛虫纲 动物界或
“后生动物” 菌物总界真菌界 核形虫类 盘嵴亚界
(JEH亚界)盘嵴总门（英语：Discicristata）眼虫门 透色门异叶足纲 透色纲（英语：Percolatea） 槽虫门（英语：Loukozoa）Andaluciida 雅各巴虫纲（英语：Jakobea）M+M后滴门（英语：Metamonad）Trichozoa副基体纲（英语：Parabasalid） FornicataEopharingia其它 Anaeromonadea其它 物種識別信息

取自“https://zh.wikipedia.org/w/index.php?title=古虫界&oldid=52201842”

エクスカバータ 分類 ドメ
イン : 真核生物 Eukaryota 界 : エクスカバータ Excavata 学名 Excavata Cavalier-Smith, 2002, emend. Simpson, 2003^[1] First rank

• メタモナス類 Metamonada
• マラウィモナス Malawimonas
• Discoba

エクスカバータ (Excavata) は、真核生物の主要な系統の1つである。

特徴[編集]

系統分類上のエクスカバータには自由生活性や共生性の、ミトコンドリアを持っているかいないか（つまり、無ミトコンドリア生物か盤状クリステ生物か）というほど幅広い微生物が含まれている。

エクスカベート類 (excavates) は通常、2、4、ないしそれ以上の鞭毛を持ち、細胞口前方が微小管で裏打ちされているという独特の微細構造で特徴づけられる。しかしこれらの特徴を2次的に喪失した様々なグループも遺伝学的証拠からエクスカベート類に含めることがある。

系統位置[編集]

エクスカバータの系統関係はまだ流動的で、単系統でないという可能性もある。しかし近年の分子系統では単系統性が支持される^[1]。

エクスカベート類は、しばしば最も原始的な真核生物だと考えられ、他の真核生物に対して側系統的とされることもある。しかしこうした位置付けは、他の無ミトコンドリア生物について見られるのと同様のロングブランチアトラクションによるアーティファクトの可能性があるし、エクスカベート類が後生的な位置に現れる系統解析もある。

分類[編集]

Adl et al. (2012)^[1]より。

• メタモナス類 Metamonada - ほとんどが無ミトコンドリア生物で、動物の共生体。
  • フォルニカータ Fornicata
    • ディプロモナス類 Diplomonadida
      • ヘキサミタ亜科 Hexamitinae
      • ジアルジア亜科 Giardiinae - ランブル鞭毛虫 Giardia lamblia など。
    • レトルタモナス類 Retortamonadida
    • ‘Carpediemonas-like organisms’ - 側系統。
  • パラバサリア Parabasalia
    • トリコモナス綱 Trichomonadea - トリコモナス類 Trichomonadida など。
    • Hypotrichomonadea
    • Tritrichomonadea
    • Cristamonadea
    • Trichonymphea
    • Spirotrichonymphea
  • プレアクソスティラ Preaxostyla
    • オキシモナス類 Oxymonadida
    • トリマスティクス Trimastix
• マラウィモナス Malawimonas
• Discoba
  • ジャコバ類 Jakobida - 他のほとんどの原生生物と同様に管状クリステを持つ。
    • ジャコバ Jakoba
    • ヒスチオナ科 Histionidae
    • アンダルシア Andalucia
  • 盤状クリステ類 Discicristata - ミトコンドリアに盤状のクリステがある。
    • ヘテロロボサ Heterolobosea - 大部分が鞭毛虫になったりアメーバ状になったりする。
      • Pharyngomonadidae
      • Tetramitia - ネグレリア Naegleria など。
    • ユーグレノゾア Euglenozoa - 重要な寄生虫がいる。
      • ユーグレナ類 Euglenida
        • Heteronematina - 側系統。
        • ユーグレナ藻 Euglenophyceae - 葉緑体を持つものが多い。
          • ラパザ Rapaza
          • Eutreptiales
          • Euglenea
            • ウチワヒゲムシ科 Phacaceae
            • ミドリムシ科 Euglenaceae
        • Aphagea
      • ディプロネマ類 Diplonemea
      • Symbiontida
      • キネトプラスト類 Kinetoplastea
        • Prokinetoplastina
        • Metakinetoplastina
          • Neobodonida
          • Parabodonida
          • Eubodonida
          • トリパノソーマ類 Trypanosomatida
  • ツクバモナス Tsukubamonas

出典[編集]

参考文献[編集]

• Cavalier-Smith, T. (2002). “The phagotrophic origin of eukaryotes and phylogenetic classification of Protozoa”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 52: 297-354.
• Alastair G. B. Simpson (2003). “Cytoskeletal organization, phylogenetic affinities and systematics in the contentious taxon Excavata”. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology 53: 1759-1777.

「https://ja.wikipedia.org/w/index.php?title=エクスカバータ&oldid=61326692」から取得