dcsimg

Finnlakeviridae

Finnlakeviridae ( allemand )

fourni par wikipedia DE
 src=
Kryo-EM-Rekonstruktion eines Virions von Flavobacterium phage FLiP.[2]
 src=
Finnlakeviridae-Partikel im Querschnitt (Schema)

Finnlakeviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren, die noch keinem höheren taxonomischen Rang zugeordnet ist. Die Familie enthält eine einzige Gattung, Finnlakevirus, und die eine einzige Spezies (Art), Flavobacterium virus FLiP. Die natürlichen Wirte sind gramnegative Bakterien, daher werden die Finnlakeviridae nicht-taxonomisch als Bakteriophage klassifiziert.[2][3]

Der Phage FLiP wurde 2010 mit seinem Wirtsbakterium aus einem borealen Süßwasserhabitat in Mittelfinnland isoliert. Phage FLiP ist das erste beschriebene einzelsträngige DNA-Virus mit einer internen Membran. Das Kapsid ist ikosaedrisch mit der Triangulationszahl pseudo T = 21 dextro. Das Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) ähnelt dabei dem von Pseudoalteromonas phage PM2 (Spezies Pseudoalteromonas virus PM2, Gattung Corticovirus).[4][3]

Genom

 src=
Genomekarte von Flavobacterium phage FLiP.[2]

Das Genom von Phage FLiP ist unsegmentiert (monopartit) und besteht aus einem zirkulären Einzelstrang-DNA-Molekül (ssDNA) mit einer Länge von etwa 9,2 kb (Kilobasen).[3]

Einzelnachweise

  1. a b c d e f ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. a b c d S. Mäntynen, E. Laanto, L. R. Sundberg, M. M. Poranen, H. M. Oksanen: ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Finnlakeviridae, in: The Journal of General Virology, Band 101, Nr. 9, September 2020, S. 894–895, doi:10.1099/jgv.0.001488, PMID 32840474, ICTV.
  3. a b c ICTV Report Finnlakeviridae.
  4. NCBI: Pseudoalteromonas virus PM2 (species)
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autoren und Herausgeber von Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia DE

Finnlakeviridae: Brief Summary ( allemand )

fourni par wikipedia DE
 src= Kryo-EM-Rekonstruktion eines Virions von Flavobacterium phage FLiP.  src= Finnlakeviridae-Partikel im Querschnitt (Schema)

Finnlakeviridae ist die Bezeichnung für eine Familie von Viren, die noch keinem höheren taxonomischen Rang zugeordnet ist. Die Familie enthält eine einzige Gattung, Finnlakevirus, und die eine einzige Spezies (Art), Flavobacterium virus FLiP. Die natürlichen Wirte sind gramnegative Bakterien, daher werden die Finnlakeviridae nicht-taxonomisch als Bakteriophage klassifiziert.

Der Phage FLiP wurde 2010 mit seinem Wirtsbakterium aus einem borealen Süßwasserhabitat in Mittelfinnland isoliert. Phage FLiP ist das erste beschriebene einzelsträngige DNA-Virus mit einer internen Membran. Das Kapsid ist ikosaedrisch mit der Triangulationszahl pseudo T = 21 dextro. Das Hauptkapsidprotein (englisch major capsid protein, MCP) ähnelt dabei dem von Pseudoalteromonas phage PM2 (Spezies Pseudoalteromonas virus PM2, Gattung Corticovirus).

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autoren und Herausgeber von Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia DE

Finnlakeviridae ( anglais )

fourni par wikipedia EN
Cryo-electron microscopic reconstruction of the Flavobacterium phage FLiP virion

Finnlakeviridae is a family of bacterial viruses that is not assigned to any higher taxonomic ranks. The family contains a single genus, Finnlakevirus, which contains a single species, Flavobacterium virus FLiP.[1][2] This virus was isolated in 2010, with its gram-negative host bacterium, from Lake Jyväsjärvi, a boreal freshwater habitat in Central Finland, and is the first described single-stranded DNA virus with an internal membrane.[2]

Genome organization of Flavobacterium phage FLiP.

The genome is circular single-stranded DNA of about 9200 nucleotides in length.[2]

References

  1. ^ Mäntynen, S; Laanto, E; Sundberg, LR; Poranen, MM; Oksanen, HM; ICTV Report Consortium (September 2020). "ICTV Virus Taxonomy Profile: Finnlakeviridae". The Journal of General Virology. 101 (9): 894–895. doi:10.1099/jgv.0.001488. hdl:10138/320459. PMC 7654751. PMID 32840474.
  2. ^ a b c "ICTV Report Finnlakeviridae".

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia authors and editors
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia EN

Finnlakeviridae: Brief Summary ( anglais )

fourni par wikipedia EN
Cryo-electron microscopic reconstruction of the Flavobacterium phage FLiP virion

Finnlakeviridae is a family of bacterial viruses that is not assigned to any higher taxonomic ranks. The family contains a single genus, Finnlakevirus, which contains a single species, Flavobacterium virus FLiP. This virus was isolated in 2010, with its gram-negative host bacterium, from Lake Jyväsjärvi, a boreal freshwater habitat in Central Finland, and is the first described single-stranded DNA virus with an internal membrane.

Genome organization of Flavobacterium phage FLiP.

The genome is circular single-stranded DNA of about 9200 nucleotides in length.

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Wikipedia authors and editors
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia EN

Finnlakeviridae ( espagnol ; castillan )

fourni par wikipedia ES

Finnlakeviridae es una familia de virus que infectan bacterias (bacteriófagos). Contienen un genoma ADN monocatenario y por lo tanto pertenecen al Grupo II de la Clasificación de Baltimore.

Es la única familia de Varidnaviria que tiene un genoma de ADN monocatenario, ya que todas las restantes lo tienen de ADN bicatenario. La familia más cercana a Finnlakeviridae es Corticoviridae.[1]

Descripción

Los virus de la familia Finnlakeviridae tienen cápsides con geometrías icosaédricas y redondas, y simetría T = 21. La cápside esta rodeada de una envoltura vírica. El diámetro ronda los 59 nm. El genoma es circular y de ADN monocatenario que está compuesto por 9.174 secuencias de nucleótidos y un tamaño de 9.2 kb. El contenido GC del genoma es del 34%. El genoma viral contiene 16 secuencias codificantes predichas (CDS), cinco de las cuales se ha demostrado que codifican proteínas estructurales.[2][3]

La replicación viral se produce en el citoplasma. La entrada en la célula huésped se logra mediante absorción en la célula huésped. La replicación sigue el modelo de replicación en círculo rodante. Después de la infección en una célula huésped, las pequeñas moléculas de ADN actúan como iniciadores. Se unen a las regiones complementarias y ayudan a la iniciación de la síntesis de ADN utilizando las polimerasas del huésped. Al término de la síntesis, habrá una cadena bicatenaria intermedia que se transcribe unidireccionalmente. La transcripción con plantilla de ADN monocatenario es el método de transcripción. Las bacterias sirven como huéspedes naturales. Las rutas de transmisión son por difusión pasiva o contacto.[2][3]

Referencias

  1. Mart Krupovic, Valerian V. Dolja, Eugene V. Koonin (2020). The LUCA and its complex virome. Nature.
  2. a b Mäntynen, S; Laanto, E; Sundberg, LR; Poranen, MM; Oksanen, HM; ICTV Report Consortium (September 2020). «ICTV Virus Taxonomy Profile: Finnlakeviridae.». The Journal of General Virology 101 (9): 894-895. PMID 32840474. doi:10.1099/jgv.0.001488.
  3. a b «ICTV Report Finnlakeviridae».
 title=
licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autores y editores de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia ES

Finnlakeviridae: Brief Summary ( espagnol ; castillan )

fourni par wikipedia ES

Finnlakeviridae es una familia de virus que infectan bacterias (bacteriófagos). Contienen un genoma ADN monocatenario y por lo tanto pertenecen al Grupo II de la Clasificación de Baltimore.

Es la única familia de Varidnaviria que tiene un genoma de ADN monocatenario, ya que todas las restantes lo tienen de ADN bicatenario. La familia más cercana a Finnlakeviridae es Corticoviridae.​

licence
cc-by-sa-3.0
droit d’auteur
Autores y editores de Wikipedia
original
visiter la source
site partenaire
wikipedia ES