Les Amalgaviridae sont une famille de virus de l'ordre des Durnavirales qui comprend deux genres et dix espèces. Ce sont des virus à ARN à double brin, rattachés au groupe III de la classification Baltimore, qui infectent principalement les plantes (phytovirus), une espèce infectant des champignons (mycovirus).
Étymologie
Le nom de famille « Amalgaviridae » dérive du terme « amalgame », en référence au mélange d'homologies avec les Totiviridae et les Partitiviridae qui caractérise la famille des Amalgaviridae[3], suivi du suffixe -viridae qui caractérise les noms de familles de virus.
Génome
Les virus de la famille des Amalgaviridae ont un génome monopartite d'environ 3,5 kilobases[4],[5]. Il présente deux cadres de lecture ouverts qui se chevauchent partiellement et codent l' ARN polymérase ARN-dépendante (RdRp) et une protéine de capside supposée[4],[6].
Liste des genres et espèces
Selon ICTV[7] :
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Amalgavirus
- Allium cepa amalgavirus 1
- Allium cepa amalgavirus 2
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Blueberry latent virus[8]
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Rhododendron virus A[5]
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Southern tomato virus (espèce-type)[4]
- Spinach amalgavirus 1
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Vicia cryptic virus M[6]
- Zoostera marina amalgavirus 1
- Zoostera marina amalgavirus 2
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Zybavirus
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Zygosaccharomyces bailii virus Z (espèce-type)
Notes et références
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↑ ICTV. International Committee on Taxonomy of Viruses. Taxonomy history. Published on the Internet https://talk.ictvonline.org/., consulté le 24 janvier 2021
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↑ NCBI, consulté le 21 décembre 2020
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↑ (en) « Amalgavirus », sur ViralZone (consulté le 20 décembre 2020).
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↑ a b et c (en) S Sabanadzovic, R. A. Valverde, J. K. Brown, R. R. Martin et I. E. Tzanetakis, « Southern tomato virus: The link between the families Totiviridae and Partitiviridae », Virus Research, vol. 140, nos 1–2, 2009, p. 130–7 (DOI ).
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↑ a et b (en) S Sabanadzovic, N Abou Ghanem-Sabanadzovic et R. A. Valverde, « A novel monopartite dsRNA virus from rhododendron », Archives of Virology, vol. 155, no 11, 2010, p. 1859–63 (DOI ).
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↑ a et b (en) W Liu et J Chen, « A double-stranded RNA as the genome of a potential virus infecting Vicia faba », Virus Genes, vol. 39, no 1, 2009, p. 126–31 (DOI ).
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↑ (en) « Virus Taxonomy: 2019 Release », sur ICTV, juillet 2019 (consulté le 21 décembre 2020).
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↑ (en) R. R. Martin, J Zhou et I. E. Tzanetakis, « Blueberry latent virus: An amalgam of the Partitiviridae and Totiviridae », Virus Research, vol. 155, no 1, 2011, p. 175–80 (DOI ).
